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基于LightGBM的蛋白质类泛素化修饰位点预测
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作者 陈焕超 魏志森 +2 位作者 於东军 杨敬民 杨静宇 《南京理工大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第2期156-163,共8页
蛋白质类泛素化修饰位点的准确识别对基础研究和药物开发都具有重要意义。该文提出了一种基于蛋白质序列特征的类泛素化修饰位点预测模型。该模型结合氨基酸的物理化学属性统计特征和氨基酸序列二元语法模式特征,训练一种轻量型梯度提升... 蛋白质类泛素化修饰位点的准确识别对基础研究和药物开发都具有重要意义。该文提出了一种基于蛋白质序列特征的类泛素化修饰位点预测模型。该模型结合氨基酸的物理化学属性统计特征和氨基酸序列二元语法模式特征,训练一种轻量型梯度提升机(Light gradient boosting machine,LightGBM)分类器预测某个蛋白质序列的类泛素化修饰位点。该文对比了不同特征的鉴别性,以及不同分类模型的预测性能。在基准数据集上的试验结果证明了该文所提方法的有效性,相比于现有方法在性能上取得了明显的提升,马修斯相关系数为91.64%。 展开更多
关键词 蛋白质翻译后修饰 蛋白质类泛素化修饰位点 基于序列的预测 轻量型梯度提升机 二元语法模式
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肺癌中蛋白质翻译后修饰的研究进展
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作者 柳卓 贺佐梅 刘雨 《中国药理学通报》 北大核心 2025年第6期1016-1020,共5页
肺癌在中国的发病率和死亡人数居癌症之首。目前肺癌的治疗有放化疗、免疫治疗、靶向治疗等,但目前可用的治疗策略仍无法治愈,放化疗的毒副作用限制了效果和应用,手术切除或联合放化疗是首选的治疗方式,但总体效率低。蛋白质翻译后修饰... 肺癌在中国的发病率和死亡人数居癌症之首。目前肺癌的治疗有放化疗、免疫治疗、靶向治疗等,但目前可用的治疗策略仍无法治愈,放化疗的毒副作用限制了效果和应用,手术切除或联合放化疗是首选的治疗方式,但总体效率低。蛋白质翻译后修饰是肿瘤研究领域的热点,在乳腺癌、淋巴瘤等多种疾病的诊断和治疗方面开展了大量研究,在临床取得了较好的效果。已经有相关文献表明蛋白翻译后修饰的异常与肺癌发生发展有关。因此,该文就近几年肺癌与蛋白质翻译后修饰的相关研究进行综述,以期为肺癌的诊断和治疗提供参考。 展开更多
关键词 肺癌 蛋白质翻译后修饰 泛素泛素 甲基 磷酸 综述
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蛋白质棕榈酰化修饰调控蛋白质功能的研究进展
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作者 管翔雨 杨晓柯 +4 位作者 李树稳 张新 赵小天 仇华吉 李永锋 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第5期546-552,共7页
蛋白质是生命的物质基础,也是基因功能的执行者。蛋白质需要经过基因转录、转录后加工、翻译、翻译后加工及转运等多个复杂过程后才具有生理功能。蛋白质翻译后加工修饰形式包括磷酸化、糖基化、甲基化、羟基化、泛素化及脂质化等[1],... 蛋白质是生命的物质基础,也是基因功能的执行者。蛋白质需要经过基因转录、转录后加工、翻译、翻译后加工及转运等多个复杂过程后才具有生理功能。蛋白质翻译后加工修饰形式包括磷酸化、糖基化、甲基化、羟基化、泛素化及脂质化等[1],其中脂质化修饰是一种重要的翻译后加工修饰形式。 展开更多
关键词 翻译后加工 转录后加工 蛋白质功能 蛋白质需要 基因转录 棕榈酰修饰 泛素 羟基
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应用IP-2D nano-HPLC-MALDI-TOF-TOF鉴定蛋白质泛素化修饰 被引量:2
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作者 毛建华 张群业 +3 位作者 黄秋花 陈竺 陈俭 陈赛娟 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2008年第7期839-847,共9页
近年来,在蛋白质研究中,特别是在蛋白质翻译后修饰(PTM)的研究中,生物质谱技术的应用越来越广泛,与纳升级HPLC的联合应用,使这一技术手段更加有效.针对泛素化在细胞功能调控中发挥关键作用的PTM的特点,将免疫沉淀、2Dnano-HPLC和基质辅... 近年来,在蛋白质研究中,特别是在蛋白质翻译后修饰(PTM)的研究中,生物质谱技术的应用越来越广泛,与纳升级HPLC的联合应用,使这一技术手段更加有效.针对泛素化在细胞功能调控中发挥关键作用的PTM的特点,将免疫沉淀、2Dnano-HPLC和基质辅助激光解吸/电离串联飞行时间质谱(IP-2D nano-HPLC-MALDI-TOF-TOF)有机整合,建立了天然状态下蛋白质泛素化位点的鉴定方法,并应用这一方法确定出K562细胞内具有酪氨酸激酶活性的蛋白c-ABL的泛素化位点.为定性鉴定生理和病理状态下内源性蛋白的泛素化修饰提供了借鉴. 展开更多
关键词 泛素 蛋白质翻译后修饰 IP-2D nano-HPLC-MALDI-TOF-TOF
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去泛素化修饰在衰老相关疾病中的研究进展
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作者 徐林慧 李鹏飞 +4 位作者 吴苗苗 康丽华 季敏 俞莹 管怀进 《中国全科医学》 北大核心 2025年第9期1143-1155,共13页
去泛素化修饰是由去泛素化酶(DUBs)介导的一类重要的蛋白质翻译后修饰,其主要机制是DUBs与泛素化靶蛋白相互作用,切割或去除靶蛋白的泛素链,进而恢复蛋白的表达水平和功能活性。本文系统性地综述了去泛素化修饰在衰老相关疾病中的最新... 去泛素化修饰是由去泛素化酶(DUBs)介导的一类重要的蛋白质翻译后修饰,其主要机制是DUBs与泛素化靶蛋白相互作用,切割或去除靶蛋白的泛素链,进而恢复蛋白的表达水平和功能活性。本文系统性地综述了去泛素化修饰在衰老相关疾病中的最新研究进展,涵盖了DUBs的种类、DUBs在细胞衰老中的作用,以及不同机制对衰老相关疾病的调控,并总结了针对DUBs小分子药物开发以及相关机制的研究进展。本文表明,随着机体的衰老,蛋白更新功能减慢、氧化损伤等因素导致泛素化蛋白累积等,进而细胞出现功能障碍。DUBs通过调节衰老细胞的蛋白质稳态、线粒体功能、细胞周期等机制,在衰老相关疾病中发挥重要且复杂的调控作用。 展开更多
关键词 衰老 衰老相关疾病 泛素修饰 泛素 蛋白质质量控制 线粒体功能
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类泛素修饰蛋白质ISG15及其修饰酶系的功能 被引量:3
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作者 万新星 ZHANG Dian-Zheng 陈汉春 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第4期295-300,共6页
受干扰素诱导表达的干扰素刺激基因15编码蛋白质(ISG15)是第1个被鉴定的类泛素修饰蛋白质.目前已在病毒感染细胞和肿瘤细胞中发现了多种ISG15的作用靶蛋白,提示ISG15可能在免疫调节和肿瘤发生等方面发挥重要作用.本文介绍ISG15的结构与... 受干扰素诱导表达的干扰素刺激基因15编码蛋白质(ISG15)是第1个被鉴定的类泛素修饰蛋白质.目前已在病毒感染细胞和肿瘤细胞中发现了多种ISG15的作用靶蛋白,提示ISG15可能在免疫调节和肿瘤发生等方面发挥重要作用.本文介绍ISG15的结构与生化特点,探讨ISG15在相关酶系作用下修饰目标蛋白质的机制,总结ISG15及其修饰酶系的抗病毒和抗肿瘤作用及其相关机制. 展开更多
关键词 泛素修饰蛋白质干扰素刺激基因15 泛素 修饰酶系 抗病毒活性 抗肿瘤
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布鲁菌16M感染后宿主免疫相关蛋白质泛素化修饰的差异分析 被引量:3
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作者 周玉成 郭梦楠 +4 位作者 程世鹏 张海威 周曼莉 乔连江 杨艳玲 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第11期2290-2301,共12页
为探究布鲁菌感染宿主细胞早期泛素化修饰蛋白质组表达变化并筛选出影响免疫应答的关键调控蛋白,通过Label-free和泛素化富集技术以及高分辨率LC-MS/MS联用的定量蛋白质组学研究策略,对布鲁菌16M感染11 h (感染5 h,胞内复制6 h)后的巨... 为探究布鲁菌感染宿主细胞早期泛素化修饰蛋白质组表达变化并筛选出影响免疫应答的关键调控蛋白,通过Label-free和泛素化富集技术以及高分辨率LC-MS/MS联用的定量蛋白质组学研究策略,对布鲁菌16M感染11 h (感染5 h,胞内复制6 h)后的巨噬细胞和未感染布鲁菌16M的巨噬细胞进行了泛素化蛋白质组学定量研究,数据库检索分析了16M感染后的巨噬细胞和未感染的巨噬细胞差异表达的泛素化位点对应的蛋白质,并应用生物信息学方法筛选出16M感染巨噬细胞后可造成宿主免疫抑制的关键蛋白质。结果显示,共鉴定出349个蛋白质上580个泛素化位点。布鲁菌16M感染组相对于未感染组167个蛋白质上259个位点泛素化修饰水平发生上调,212个蛋白质上321个位点泛素化修饰水平发生下调(差异倍数>1.5,P<0.05);35个泛素化修饰差异表达的蛋白质可能与布鲁菌感染后宿主的免疫应答有关,其中27个泛素化修饰的下调蛋白质(如Bcap31、Btk、Faf1和Akap31等),1个泛素化修饰上调蛋白质Ubqln1可能是布鲁菌感染宿主后造成免疫抑制的关键蛋白。本研究筛选获得了布鲁菌16M感染宿主细胞免疫相关差异表达的泛素化修饰蛋白质,初步揭示布鲁菌能够调控宿主免疫信号通路、自噬和凋亡等免疫应答过程中相关蛋白质的泛素化修饰,为进一步研究布鲁菌感染后调节宿主泛素化修饰进而形成免疫逃逸的分子机制提供理论基础。 展开更多
关键词 布鲁菌16M 泛素修饰蛋白质组学 免疫抑制 免疫逃逸
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弓形虫类泛素蛋白的研究进展及其潜在应用
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作者 许鑫鑫 李泰峰 +3 位作者 黄丰立 德珍 赵宁宁 张晓 《山东畜牧兽医》 2025年第3期98-101,共4页
弓形虫是一种能够入侵几乎所有温血动物有核细胞的机会性病原体,其复杂的生命周期和精准的基因表达调控机制涉及多种蛋白质翻译后修饰,其中类泛素化修饰尤为重要。本文综述了弓形虫类泛素蛋白的研究进展,包括SUMO、URM1、NEDD8、UFM1和A... 弓形虫是一种能够入侵几乎所有温血动物有核细胞的机会性病原体,其复杂的生命周期和精准的基因表达调控机制涉及多种蛋白质翻译后修饰,其中类泛素化修饰尤为重要。本文综述了弓形虫类泛素蛋白的研究进展,包括SUMO、URM1、NEDD8、UFM1和ATG8等关键类泛素蛋白在弓形虫感染、应激响应、生长发育、抗氧化应激等方面的作用,以及在弓形虫疫苗研发中的潜在应用。本文旨在丰富对弓形虫类泛素蛋白的认识,为弓形虫病的防治提供新的策略和方法,并为相关研究人员提供新的思路和参考依据。 展开更多
关键词 弓形虫 泛素蛋白 泛素修饰
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蛋白质翻译后修饰在不明原因复发性流产中的作用
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作者 高倩倩 任佳杰 +2 位作者 牛丁忍 郭鲁秦 冯晓玲 《中南大学学报(医学版)》 CSCD 北大核心 2024年第9期1495-1502,共8页
不明原因复发性流产(unexplained recurrent pregnancy loss,URPL)的病理机制复杂,是困扰育龄期女性的常见病。蛋白质翻译后修饰(post-translational modifications,PTMs)作为表观遗传学的主要内容之一,不仅能够调节蛋白质表达、增加其... 不明原因复发性流产(unexplained recurrent pregnancy loss,URPL)的病理机制复杂,是困扰育龄期女性的常见病。蛋白质翻译后修饰(post-translational modifications,PTMs)作为表观遗传学的主要内容之一,不仅能够调节蛋白质表达、增加其多样性,还能调控蛋白质与其他分子间相互作用。PTMs在URPL的发生、发展中发挥重要作用:如甲基化修饰可阻碍蜕膜化进程,调控滋养细胞迁移和侵袭;磷酸化修饰可调控调节性T细胞(regulatoryTcells,Treg)/辅助性T细胞17(T helper 17 cells,Th17)平衡,巨噬细胞极化,改变树突状细胞数量,促进滋养细胞凋亡;乙酰化修饰可诱发滋养细胞自噬,抑制M2型巨噬细胞极化;泛素化修饰可调控滋养细胞迁移和侵袭,干扰免疫微环境;糖基化修饰可抑制滋养层细胞迁移和侵袭;乳酸化修饰可维持子宫内膜容受性。PTMs在URPL中的作用可能使其成为URPL的研究切入点和治疗靶点。 展开更多
关键词 不明原因复发性流产 蛋白质翻译后修饰 甲基 磷酸 乙酰 泛素
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蛋白质SUMO化修饰的蛋白质组学研究述评
10
作者 熊强强 屠俊 +3 位作者 李郡如 程金科 左建宏 陈亚兰 《上海交通大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2021年第1期89-94,共6页
小分子泛素相关修饰物(small ubiquitin-related modifier,SUMO)化修饰在真核细胞中广泛存在,参与了多种信号转导和代谢途径。规模化鉴定SUMO化修饰蛋白质有助于从整体角度揭示SUMO化修饰的功能和作用机制。目前,有关SUMO化修饰位点的... 小分子泛素相关修饰物(small ubiquitin-related modifier,SUMO)化修饰在真核细胞中广泛存在,参与了多种信号转导和代谢途径。规模化鉴定SUMO化修饰蛋白质有助于从整体角度揭示SUMO化修饰的功能和作用机制。目前,有关SUMO化修饰位点的鉴定难度较大,如何规模化研究蛋白质的SUMO化修饰尚未有定论。基于此,该文系统分析了哺乳动物细胞中开展SUMO化修饰蛋白质组学的研究工作,并在总结其研究方法和成果的基础上,对SUMO的突变模式和富集方式进行详细分析,进而归纳出针对细胞和组织样品进行SUMO化修饰位点系统化鉴定的理想方法。 展开更多
关键词 小分子泛素相关修饰 泛素修饰 蛋白质组学 质谱
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蛋白质磷酸化修饰参与经典致幻剂诱导的大鼠甩头反应 被引量:3
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作者 王劭文 周亚男 +1 位作者 孙毅 苏瑞斌 《中国药理学通报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第10期1899-1904,共6页
目的探究经典致幻剂通过蛋白质翻译后修饰(protein post-translational modifications,PTMs)调控急性甩头反应机制。方法大鼠单次腹腔注射经典致幻剂LSD、DOM和Psilocin进行甩头反应实验,选取甩头次数最高的剂量建立甩头反应动物模型;We... 目的探究经典致幻剂通过蛋白质翻译后修饰(protein post-translational modifications,PTMs)调控急性甩头反应机制。方法大鼠单次腹腔注射经典致幻剂LSD、DOM和Psilocin进行甩头反应实验,选取甩头次数最高的剂量建立甩头反应动物模型;Western blot检测经典致幻剂给药10和30 min后大鼠前额叶皮层中蛋白质的磷酸化、乙酰化、泛素化修饰变化情况。结果LSD(0.025 mg·kg^(-1),i.p.)、DOM(3 mg·kg^(-1),i.p.)、Psilocin(8 mg·kg^(-1),i.p.)为大鼠甩头反应动物模型最佳剂量;经典致幻剂给药10 min和30 min后大鼠前额叶皮层中蛋白质磷酸化变化明显。结论蛋白质磷酸化修饰参与经典致幻剂诱导的大鼠甩头反应。 展开更多
关键词 经典致幻剂 动物模型 甩头反应 前额叶皮层 蛋白质翻译后修饰 磷酸 乙酰 泛素
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原核生物的蛋白质翻译后修饰 被引量:10
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作者 谭永聪 王启军 +1 位作者 赵国屏 姚玉峰 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2011年第3期197-203,共7页
蛋白质翻译后修饰是调节蛋白质生物学功能的关键步骤之一,是蛋白质动态反应和相互作用的一个重要分子基础,同时,它也是细胞信号网络调控的重要靶点.目前,蛋白质翻译后修饰已经成为国际上蛋白质研究的一个极其重要的热点.在原核生物生命... 蛋白质翻译后修饰是调节蛋白质生物学功能的关键步骤之一,是蛋白质动态反应和相互作用的一个重要分子基础,同时,它也是细胞信号网络调控的重要靶点.目前,蛋白质翻译后修饰已经成为国际上蛋白质研究的一个极其重要的热点.在原核生物生命活动中,蛋白质的翻译后修饰具有十分重要的作用,如参与细胞信号传导、物质的代谢、蛋白质的降解、致病微生物的致病过程等.综述了经典原核生物蛋白质翻译后修饰的种类、机制和功能,同时介绍了最近发现的原核生物的全局性乙酰化修饰以及结核分枝杆菌中类泛素化修饰. 展开更多
关键词 原核生物 蛋白质翻译后修饰 糖基 磷酸 脂质 乙酰 泛素 甲基
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蛋白质翻译后修饰及其生物学功能研究进展 被引量:6
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作者 孙琪 张辉 +3 位作者 马语曼 张鑫 唐子人 王雯 《中华老年心脑血管病杂志》 CAS 北大核心 2014年第9期989-991,共3页
后基因组时代的到来意味着生命科学研究重心转向功能基因组学及功能蛋白质组学等新领域。蛋白质翻译后修饰是蛋白质组学的重要组成部分。蛋白质经翻译后修饰改变自身的空间构象、活性、稳定性及其与其他分子相互作用等方面的性能,从而... 后基因组时代的到来意味着生命科学研究重心转向功能基因组学及功能蛋白质组学等新领域。蛋白质翻译后修饰是蛋白质组学的重要组成部分。蛋白质经翻译后修饰改变自身的空间构象、活性、稳定性及其与其他分子相互作用等方面的性能,从而参与调节机体多样化的生命活动。多数蛋白质存在翻译后修饰,目前已知的蛋白质共价修饰方式多达200余种,主要包括磷酸化、亚硝基化、硝基化、泛素化和小泛素相关修饰物化(SUMO)等。 展开更多
关键词 蛋白质组学 蛋白质加工 转译后 泛素相关修饰蛋白质 半胱氨酸
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嗜肺军团菌效应蛋白质介导的新型泛素化过程
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作者 解永超 冯越 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第4期393-400,共8页
泛素化是真核细胞特有的蛋白质翻译后修饰方式,调节真核细胞内多种重要生理过程,例如蛋白质稳态、细胞周期、免疫反应、DNA修复以及囊泡转运等。鉴于泛素化对于生命活动的重要性,病原菌在与宿主细胞的长期进化过程中衍生出一系列针对宿... 泛素化是真核细胞特有的蛋白质翻译后修饰方式,调节真核细胞内多种重要生理过程,例如蛋白质稳态、细胞周期、免疫反应、DNA修复以及囊泡转运等。鉴于泛素化对于生命活动的重要性,病原菌在与宿主细胞的长期进化过程中衍生出一系列针对宿主泛素化过程的效应蛋白质,调控宿主体内泛素化过程,从而构建有利于病原菌自身生长繁殖的内环境。嗜肺军团菌是一种革兰氏阴性菌,是军团菌肺炎的致病菌,能够引起发热和肺部感染,重型病死率高达15%~30%。Dot/IcmⅣ型分泌系统是嗜肺军团菌侵染过程中最主要的毒力系统。在侵染宿主细胞的过程中,嗜肺军团菌利用该分泌系统,分泌超过330种效应蛋白质,协助细菌在宿主胞内生存、增殖和逃逸。多种嗜肺军团菌效应蛋白质通过直接或者间接的方式对宿主泛素化过程进行调控。近年的研究发现,多种效应蛋白质可以介导不同于真核生物经典泛素化的新型泛素化过程。本文介绍了嗜肺军团菌效应蛋白质介导的新型泛素化过程的最新研究进展,为理解泛素化过程在嗜肺军团菌致病过程中的重要作用提供参考依据。 展开更多
关键词 泛素 效应蛋白质 翻译后修饰 嗜肺军团菌
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蛋白质翻译后修饰研究进展 被引量:10
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作者 郭会灿 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第7期18-21,共4页
翻译后修饰在蛋白质加工、成熟的过程中发挥着重要的作用,它可以改变蛋白质的物理、化学性质,影响蛋白质的空间构象、立体位阻及其稳定性,进而对蛋白质的生物学活性产生作用,引起蛋白质的功能改变。修饰基团自身的结构特性对蛋白质的性... 翻译后修饰在蛋白质加工、成熟的过程中发挥着重要的作用,它可以改变蛋白质的物理、化学性质,影响蛋白质的空间构象、立体位阻及其稳定性,进而对蛋白质的生物学活性产生作用,引起蛋白质的功能改变。修饰基团自身的结构特性对蛋白质的性质、功能也会产生深远的影响。在已有的研究基础上,综述蛋白质翻译后修饰的主要类型以及各修饰作用潜在的生物学功能。 展开更多
关键词 蛋白质翻译后修饰 糖基 乙酰 泛素 磷酸
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壮观霉素B1抑制过氧化物增殖激活受体共激活子类泛素修饰促高糖内皮细胞自愈
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作者 李艳霞 张春艳 +5 位作者 马晓芳 边希云 肖晓琳 郑全 张琳 刘晓智 《中华老年心脑血管病杂志》 CAS 北大核心 2020年第4期410-413,共4页
目的探讨过氧化物酶体增殖物激活受体γ辅激活因子1α(PGC-1α)的小泛素相关修饰蛋白(SUMO)在糖尿病患者血管内皮修复能力下降过程中的作用,并寻找新的治疗方法。方法选取人脐静脉内皮细胞(HUVEC)第3~6代细胞随机分对照组、高糖组及壮... 目的探讨过氧化物酶体增殖物激活受体γ辅激活因子1α(PGC-1α)的小泛素相关修饰蛋白(SUMO)在糖尿病患者血管内皮修复能力下降过程中的作用,并寻找新的治疗方法。方法选取人脐静脉内皮细胞(HUVEC)第3~6代细胞随机分对照组、高糖组及壮观霉素B1治疗组(治疗组)3组(n=4),分别于1.0 g/L葡萄糖、4.5 g/L葡萄糖、4.5 g/L葡萄糖+20μmol/L壮观霉素B1培养液中作用48 h,用Western blot检测SUMO2/3、PGC-1α蛋白表达,RT-PCR方法检测核呼吸因子-2α(NRF-2α)和核受体雌激素受体相关受体α(ERRα)mRNA表达,细胞划痕实验检测HUVEC损伤修复功能,模拟血管形成实验检测HUVEC血管形成能力。结果高糖组和治疗组共价态SUMO2/3蛋白表达水平明显高于对照组,NRF-2α和ERRαmRNA表达水平明显低于对照组(P<0.05,P<0.01);治疗组共价态SUMO2/3蛋白表达水平明显低于高糖组,NRF-2α和ERRαmRNA表达水平明显高于高糖组(P<0.05)。高糖组游离态SUMO2/3水平低于对照组和治疗组(P<0.05)。3组PGC-1α蛋白表达水平比较,无统计学差异(P>0.05)。细胞划痕实验显示,高糖组和治疗组细胞迁移距离明显低于对照组[(19.47±4.04)μm vs(57.35±5.59)μm,P=0.017;(31.98±6.05)μm vs(57.35±5.59)μm,P=0.032],治疗组细胞迁移距离明显高于高糖组(P=0.037)。细胞模拟血管形成实验显示,治疗组能够改善网状交联情况,形成少量类血管结构。结论壮观霉素B1能够通过抑制PGC-1α蛋白的SUMO化修饰增加血管内皮细胞在高糖环境下的自愈能力。 展开更多
关键词 PPARΓ 泛素相关修饰蛋白质 糖尿病 核呼吸因子
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植物蛋白质翻译后修饰组学研究进展 被引量:17
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作者 刘静 李亚超 +3 位作者 周梦岩 吴鹏飞 马祥庆 李明 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第1期67-76,共10页
蛋白质翻译后修饰(Protein post-translational modification,PTMs)是一种重要的细胞调控机制,通过在蛋白质的氨基酸侧链上共价结合一些化学小分子基团来调节蛋白质的活性、结构、定位和蛋白质间的互作关系,从而精细调控蛋白质生物学功... 蛋白质翻译后修饰(Protein post-translational modification,PTMs)是一种重要的细胞调控机制,通过在蛋白质的氨基酸侧链上共价结合一些化学小分子基团来调节蛋白质的活性、结构、定位和蛋白质间的互作关系,从而精细调控蛋白质生物学功能的动态变化。PTMs是植物对环境变化最快、最早的反应之一,是植物蛋白质组多样性的关键机制,在植物生长发育和对环境适应中起重要作用。主要介绍了近年来植物磷酸化、乙酰化、琥珀酰化、糖基化、泛素化、巴豆酰化、S-亚硝基化及2-羟基异丁酰化等PTMs研究进展,旨为认识植物PTMs的关键生物学功能和研究前景提供参考。 展开更多
关键词 翻译后修饰 蛋白质 磷酸 乙酰 泛素
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葛根素通过调节类泛素化修饰平衡改善心肌功能的研究 被引量:5
18
作者 边希云 肖晓琳 +5 位作者 薛娜 于田 马晓芳 李艳霞 刘晓智 杜新平 《中华老年心脑血管病杂志》 北大核心 2021年第4期417-421,共5页
目的从小泛素样修饰蛋白(SUMO)介导SUMO化修饰平衡角度解读葛根素对心力衰竭(HF)的心功能保护作用及机制。方法通过主动脉缩窄术造成压力超负荷诱导HF,成功构建小鼠HF模型后,小鼠随机分为对照组、模型组、模型+葛根素组、葛根素组,每组6... 目的从小泛素样修饰蛋白(SUMO)介导SUMO化修饰平衡角度解读葛根素对心力衰竭(HF)的心功能保护作用及机制。方法通过主动脉缩窄术造成压力超负荷诱导HF,成功构建小鼠HF模型后,小鼠随机分为对照组、模型组、模型+葛根素组、葛根素组,每组6只;HL-1细胞构建HF模型,分为对照1组、模型1组、模型+葛根素1组、对照2组、模型2组、模型+葛根素2组,其中前3组转染Vector质粒,后3组转染HA-SENP1质粒。超声心动检测心室功能;苏木精-伊红染色检测心肌组织形态;蛋白印迹法检测半胱氨酸天冬氨酸蛋白酶3(Caspase-3)、活化型Caspase-3、Bcl2、Bax和SUMO特异性蛋白酶1(SENP1)蛋白水平;JC-1试剂检测线粒体膜电位;TUNEL检测HL-1细胞凋亡情况。结果与对照组比较,模型组小鼠线粒体内活性氧及H_(2)O_(2)均增加,线粒体膜电位下降(P<0.05),与模型组比较,模型+葛根素组可改善HF小鼠心脏功能,活性氧和H_(2)O_(2)降低,线粒体膜电位增加,活化型Caspase-3/Caspase-3比值下降、Bcl2/Bax比值增加、SENP1蛋白下降(P<0.05)。与模型1组相比,模型+葛根素1组活性氧及H_(2)O_(2)减少,线粒体膜电位升高(P<0.05)。与模型+葛根素1组比较,模型+葛根素2组细胞内H_(2)O_(2)和活性氧增加,线粒体膜电位降低,细胞凋亡率升高(P<0.05)。结论葛根素通过抑制SENP1过表达,减弱HF小鼠心肌细胞的氧化应激,减轻线粒体损伤,抑制心室重构,最终改善心脏功能。 展开更多
关键词 葛根素 泛素相关修饰蛋白质 心力衰竭 膜电位 线粒体 心室重构
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类泛素化修饰Neddylation对免疫细胞的调控作用 被引量:3
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作者 靳家扬 敬兆飞 +1 位作者 王晶 魏林 《中国免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2017年第5期777-780,共4页
NEDD8(Neural precursor cell-expressed developmentally downregulated 8)是由81个氨基酸编码的蛋白质,它和泛素蛋白(Ubiquitin)具有60%的一致性和80%的相似性。NEDD8分子在真核生物中具有十分重要的生物学功能,其序列在真核生物... NEDD8(Neural precursor cell-expressed developmentally downregulated 8)是由81个氨基酸编码的蛋白质,它和泛素蛋白(Ubiquitin)具有60%的一致性和80%的相似性。NEDD8分子在真核生物中具有十分重要的生物学功能,其序列在真核生物中高度保守。 展开更多
关键词 调控作用 免疫细胞 泛素 修饰 真核生物 生物学功能 泛素蛋白 蛋白质
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HBV及其相关蛋白泛素化修饰研究进展 被引量:2
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作者 涂文辉 刘锦 朱传武 《临床肝胆病杂志》 CAS 北大核心 2021年第9期2191-2197,共7页
蛋白质泛素化广泛存在于细胞内,是蛋白翻译后的一种修饰。HBV及其相关蛋白的泛素化研究越来越受到重视。对HBV及其相关蛋白的泛素化修饰进行了综述,为进一步了解HBV的复制调控及其蛋白的泛素化研究提供了借鉴,为治愈慢性HBV感染提供新... 蛋白质泛素化广泛存在于细胞内,是蛋白翻译后的一种修饰。HBV及其相关蛋白的泛素化研究越来越受到重视。对HBV及其相关蛋白的泛素化修饰进行了综述,为进一步了解HBV的复制调控及其蛋白的泛素化研究提供了借鉴,为治愈慢性HBV感染提供新的思路和方法。 展开更多
关键词 乙型肝炎病毒 病毒蛋白质 泛素
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