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蛋白质组学数据揭示可变剪接蛋白质变体被引量：2: 1; 作者吴怡颖张炜孔德志《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2024年第12期3151-3162,共12页; 可变剪接使同一个基因产生多种不同的转录本和蛋白质,增加蛋白质多样性和功能复杂性。转录组学和蛋白质组学是鉴定可变剪接的两种主要途径,分别通过分析RNA测序数据和蛋白质测序数据来鉴定可变剪接事件和相应蛋白质产物。尽管RNA水平的... 展开更多; 关键词可变剪接质谱数据分析蛋白质鉴定算法蛋白质序列数据库; 在线阅读下载PDF 职称材料

nr数据库分析及其本地化被引量：119: 2; 作者邓泱泱荔建琦 +3 位作者吴松锋朱云平陈耀文贺福初《计算机工程》 CAS CSCD 北大核心 2006年第5期71-73,76,共4页; 通过用NCBI的blastp程序对nr数据库与IPI数据库中属于人类的蛋白质序列进行比较,论证了nr数据库整合到蛋白质注释系统中的必要性。并在此基础上,设计方案实现了nr数据库的本地化,对nr数据库的记录进行了统计分析,提供了数据库的内部访问... 展开更多; 关键词蛋白质序列数据库序列比对蛋白质注释本地化; 在线阅读下载PDF 职称材料

生物序列的语义分析与第二密码规则的探索(续): 3; 作者沈世镒余涛 +1 位作者开波阮吉寿《工程数学学报》 CSCD 北大核心 2004年第6期862-870,共9页; 本文继续讨论蛋白质一级结构序列的语义结构,利用组合分析与图论方法讨论 Swiss - Prot 数据库的组合结构,给出 Swiss - Prot 数据库中蛋白质一级结构序列的关键词与核心词的定义、搜索算法与特性参数。并由此给出蛋白质一级结... 展开更多; 关键词生物序列结构的语义分析第二密码规则蛋白质一级序列结构数据库的组合图论分析非线性复杂与核心词词典; 在线阅读下载PDF 职称材料

生物序列的语义分析与第二密码规则的探索: 4; 作者沈世镒《工程数学学报》 CSCD 北大核心 2004年第5期665-674,679,共11页; 生物序列(如DNA、RNA与蛋白质一级结构序列等)都是由一系列小分子团(如核苷酸、氨基酸等)排列组成,如把这些小分子团作为符号单元,那么这些生物序列就是生物序列就是生物学的语言文字,对这些语言文字的结构分析为生物序列的语义分析。... 展开更多; 关键词生物序列结构的语义分析第二密码规则蛋白质~级序列结构数据库的信息、统计分析稳定性度量与原理; 在线阅读下载PDF 职称材料

Windows应用软件LocalBLAST的设计: 5; 作者刘旭光胡建平 +1 位作者朱建国张新会《安徽农业科学》 CAS 北大核心 2006年第22期6044-6046,6050,共4页; 使用WinSDK编程,在C++环境下编译通过的可视化BLAST接口程序软件LocalBLAST,可运行在多种Windows操作系统下。该软件能构建本地核酸和蛋白序列数据库。经比较发现,该程序操作简便,并可根据实际需要随意定制相关数据库。; 关键词 WinSDK 软件本地核酸蛋白质序列数据库本地BLAST; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名蛋白质组学数据揭示可变剪接蛋白质变体被引量：2: 1; 作者吴怡颖张炜孔德志; 机构河北医科大学中西医结合研究所; 出处《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2024年第12期3151-3162,共12页; 基金国家自然科学基金(82174004) 河北省自然科学基金(H2022206211,H2022206387)资助项目。; 文摘可变剪接使同一个基因产生多种不同的转录本和蛋白质,增加蛋白质多样性和功能复杂性。转录组学和蛋白质组学是鉴定可变剪接的两种主要途径,分别通过分析RNA测序数据和蛋白质测序数据来鉴定可变剪接事件和相应蛋白质产物。尽管RNA水平的可变剪接研究已经取得了一定的进展,但是对于剪接蛋白亚型的检测和区分仍然不足。本文综述了近年来对可变剪接及其生物功能,可变剪接在不同水平检测的研究进展,详细介绍利用“自下而上”的蛋白质组学数据鉴定可变剪接蛋白质变体的两种主要方法,序列数据库构建和蛋白质鉴定算法开发。鉴定不同的可变剪接蛋白质有利于认识更全面的蛋白质功能,对发现相关生物标志物和关键药物靶点具有重要意义。; 关键词可变剪接质谱数据分析蛋白质鉴定算法蛋白质序列数据库; Keywords alternative splicing mass spectrometry data analysis protein identification algorithm protein sequence database; 分类号 Q51 [生物学—生物化学] R917 [医药卫生—药物分析学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名nr数据库分析及其本地化被引量：119: 2; 作者邓泱泱荔建琦吴松锋朱云平陈耀文贺福初; 机构汕头大学人工智能与模式识别实验室北京放射医学研究所系统生物学实验室; 出处《计算机工程》 CAS CSCD 北大核心 2006年第5期71-73,76,共4页; 基金国家"863"计划基金资助项目(2002-BA711A11) 国家"973"计划基金资助项目(2001CB510209) +1 种基金国家自然科学基金委员会资助项目"创新研究群体科学基金"(321003); 文摘通过用NCBI的blastp程序对nr数据库与IPI数据库中属于人类的蛋白质序列进行比较,论证了nr数据库整合到蛋白质注释系统中的必要性。并在此基础上,设计方案实现了nr数据库的本地化,对nr数据库的记录进行了统计分析,提供了数据库的内部访问,为蛋白质注释系统整合nr数据库做好了第一步工作。; 关键词蛋白质序列数据库序列比对蛋白质注释本地化; Keywords Protein sequence database Sequence alignment Protein annotation Localization; 分类号 TP311 [自动化与计算机技术—计算机软件与理论]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名生物序列的语义分析与第二密码规则的探索(续): 3; 作者沈世镒余涛开波阮吉寿; 机构南开大学数学科学学院与LPMC; 出处《工程数学学报》 CSCD 北大核心 2004年第6期862-870,共9页; 基金天津市南开大学数学科学学院与 LPMC 本文获天津大学 +2 种基金南开大学联合研究项目 90208022)资助.; 文摘本文继续讨论蛋白质一级结构序列的语义结构,利用组合分析与图论方法讨论 Swiss - Prot 数据库的组合结构,给出 Swiss - Prot 数据库中蛋白质一级结构序列的关键词与核心词的定义、搜索算法与特性参数。并由此给出蛋白质一级结构序列的核心词词典,并由此讨论数据库的复杂性问题、同源蛋白质的分类、预测与比对等问题。; 关键词生物序列结构的语义分析第二密码规则蛋白质一级序列结构数据库的组合图论分析非线性复杂与核心词词典; Keywords semantics analysis of biological sequences second cipher rules combinatorial analysis of primary structure database of proteins nolinear complexity and dictionary of kernel word; 分类号 O157.1 [理学—基础数学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名生物序列的语义分析与第二密码规则的探索: 4; 作者沈世镒; 机构南开大学数学科学学院与LPMC; 出处《工程数学学报》 CSCD 北大核心 2004年第5期665-674,679,共11页; 基金国家自然科学基金(10271061 90208022) +2 种基金天津大学南开大学联合研究项目刘徽应用数学研究中心资助.; 文摘生物序列(如DNA、RNA与蛋白质一级结构序列等)都是由一系列小分子团(如核苷酸、氨基酸等)排列组成,如把这些小分子团作为符号单元,那么这些生物序列就是生物序列就是生物学的语言文字,对这些语言文字的结构分析为生物序列的语义分析。生物序列语义分析的内容包括词法与语法的分析,它们是在分子水平基础上的生物语言分析,有关的变化规则我们称之为生物序列中的第二密码规则。本文以Swiss-Prot数据库为基础,利用频率统计、组合分析与信息的度量关系等数学工具,分析蛋白质一级结构序列中的词法规则,给出了关于蛋白质一级结构序列的几种稳定性的度量指标及其相应的稳定性理论,并探讨了它们在蛋白质演变与蛋白质工程中可能产生的应用。; 关键词生物序列结构的语义分析第二密码规则蛋白质~级序列结构数据库的信息、统计分析稳定性度量与原理; Keywords semantics analysis of biological sequences second cipher rules information and statistics analysis of primary structure database of proteins stability measurement and principle; 分类号 O236 [理学—运筹学与控制论]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名Windows应用软件LocalBLAST的设计: 5; 作者刘旭光胡建平朱建国张新会; 机构连云港师范高等专科学校初教系连云港市应用生物技术重点实验室连云港师范高等专科学校计算机系; 出处《安徽农业科学》 CAS 北大核心 2006年第22期6044-6046,6050,共4页; 基金连云港师范高等专科学校重点课题资助; 文摘使用WinSDK编程,在C++环境下编译通过的可视化BLAST接口程序软件LocalBLAST,可运行在多种Windows操作系统下。该软件能构建本地核酸和蛋白序列数据库。经比较发现,该程序操作简便,并可根据实际需要随意定制相关数据库。; 关键词 WinSDK 软件本地核酸蛋白质序列数据库本地BLAST; Keywords WintSDK Software Local nucleotide and protein database LocalBLAST; 分类号 S126 [农业科学—农业基础科学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

	题名	作者	出处	发文年	被引量	操作
1	蛋白质组学数据揭示可变剪接蛋白质变体	吴怡颖张炜孔德志	《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心	2024	2	在线阅读下载PDF 职称材料
2	nr数据库分析及其本地化	邓泱泱荔建琦吴松锋朱云平陈耀文贺福初	《计算机工程》 CAS CSCD 北大核心	2006	119	在线阅读下载PDF 职称材料
3	生物序列的语义分析与第二密码规则的探索(续)	沈世镒余涛开波阮吉寿	《工程数学学报》 CSCD 北大核心	2004	0	在线阅读下载PDF 职称材料
4	生物序列的语义分析与第二密码规则的探索	沈世镒	《工程数学学报》 CSCD 北大核心	2004	0	在线阅读下载PDF 职称材料
5	Windows应用软件LocalBLAST的设计	刘旭光胡建平朱建国张新会	《安徽农业科学》 CAS 北大核心	2006	0	在线阅读下载PDF 职称材料