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基于冷冻电镜无倾转成像数据的新型蛋白质原位结构解析方法
1
作者
赵明洁
曹端方
章新政
《生物化学与生物物理进展》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2024年第10期2418-2429,共12页
与体外纯化的蛋白质复合物相比,细胞内处于工作状态的蛋白质复合物往往更为完整,并且其三维结构处于完全生理的构象,这对于理解蛋白质复合物在生命活动中发挥重要功能的结构基础尤为关键,也可以为药物设计等提供更精确的靶点信息。直接...
与体外纯化的蛋白质复合物相比,细胞内处于工作状态的蛋白质复合物往往更为完整,并且其三维结构处于完全生理的构象,这对于理解蛋白质复合物在生命活动中发挥重要功能的结构基础尤为关键,也可以为药物设计等提供更精确的靶点信息。直接在细胞内解析蛋白质复合物的三维结构也被称为蛋白质的细胞原位结构解析,而冷冻电镜电子断层重构技术是原位结构解析的关键技术,但是电子断层重构技术的序列倾转数据采集通量低、数据处理较为繁琐,并且达到准原子分辨率对样品有特殊要求,这些问题成为了限制原位结构解析分辨率和实际应用的瓶颈。近年来,一种基于单张无倾转数据的蛋白质原位结构解析方法发展迅速,可以高通量地对细胞中的蛋白质复合物进行高分辨率结构解析,本综述将分析这类方法的原理,讨论这个方法相较于传统断层重构方法的优缺点,并对蛋白质的细胞原位结构解析进行展望。希望可以通过这篇综述,帮助结构生物学科研人员更好地选择合适的工具。
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关键词
蛋白质原位重构
冷冻电镜
原位
结构解析
isSPA滤波
无倾转数据
高通量
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职称材料
题名
基于冷冻电镜无倾转成像数据的新型蛋白质原位结构解析方法
1
作者
赵明洁
曹端方
章新政
机构
中国科学院生物物理研究所生物大分子重点实验室
出处
《生物化学与生物物理进展》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2024年第10期2418-2429,共12页
基金
国家自然科学基金(32150010)资助项目。
文摘
与体外纯化的蛋白质复合物相比,细胞内处于工作状态的蛋白质复合物往往更为完整,并且其三维结构处于完全生理的构象,这对于理解蛋白质复合物在生命活动中发挥重要功能的结构基础尤为关键,也可以为药物设计等提供更精确的靶点信息。直接在细胞内解析蛋白质复合物的三维结构也被称为蛋白质的细胞原位结构解析,而冷冻电镜电子断层重构技术是原位结构解析的关键技术,但是电子断层重构技术的序列倾转数据采集通量低、数据处理较为繁琐,并且达到准原子分辨率对样品有特殊要求,这些问题成为了限制原位结构解析分辨率和实际应用的瓶颈。近年来,一种基于单张无倾转数据的蛋白质原位结构解析方法发展迅速,可以高通量地对细胞中的蛋白质复合物进行高分辨率结构解析,本综述将分析这类方法的原理,讨论这个方法相较于传统断层重构方法的优缺点,并对蛋白质的细胞原位结构解析进行展望。希望可以通过这篇综述,帮助结构生物学科研人员更好地选择合适的工具。
关键词
蛋白质原位重构
冷冻电镜
原位
结构解析
isSPA滤波
无倾转数据
高通量
Keywords
in situ protein reconstruction
in situ structural analysis of cryoEM
isSPA(in situ single particle like analysis)filtering
non-tilting imaging data
high throughput
分类号
Q615 [生物学—生物物理学]
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题名
作者
出处
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被引量
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1
基于冷冻电镜无倾转成像数据的新型蛋白质原位结构解析方法
赵明洁
曹端方
章新政
《生物化学与生物物理进展》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2024
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