通过RT-PCR扩增得到了黄瓜绿斑驳花叶病毒(Cucumber Green Mottle Mosaic Virus,CGMMV)山东泰安南瓜分离物(CGMMV-TANG)的外壳蛋白基因,经过序列分析,该分离物外壳蛋白(CP)基因全长486个核苷酸,由161个氨基酸组成。对CP基因核苷酸序列...通过RT-PCR扩增得到了黄瓜绿斑驳花叶病毒(Cucumber Green Mottle Mosaic Virus,CGMMV)山东泰安南瓜分离物(CGMMV-TANG)的外壳蛋白基因,经过序列分析,该分离物外壳蛋白(CP)基因全长486个核苷酸,由161个氨基酸组成。对CP基因核苷酸序列进行同源性比较和构建系统进化树,并结合寄主来源及地域来源进行分析,结果表明该病毒的不同分离物在分组上与地域有一定的关系。展开更多
文摘通过RT-PCR扩增得到了黄瓜绿斑驳花叶病毒(Cucumber Green Mottle Mosaic Virus,CGMMV)山东泰安南瓜分离物(CGMMV-TANG)的外壳蛋白基因,经过序列分析,该分离物外壳蛋白(CP)基因全长486个核苷酸,由161个氨基酸组成。对CP基因核苷酸序列进行同源性比较和构建系统进化树,并结合寄主来源及地域来源进行分析,结果表明该病毒的不同分离物在分组上与地域有一定的关系。
基金Major Science and Technology Project of Guangxi Province(Guike AA17202042-12)Basic Research Project of Guangxi Academy of Agricultural Sciences(2015YT42)。
文摘【目的】建立甘蔗线条花叶病毒(Sugarcane streak mosaic virus,SCSMV)的RT-LAMP检测方法,为SCSMV的检测提供技术支持。【方法】根据甘蔗线条花叶病毒外壳蛋白基因的保守序列设计特异引物,优化RT-LAMP的反应条件,对比分析RT-LAMP的检测灵敏度和特异性;并在RT-LAMP反应产物中加入SYBR GREEN I进行可视化检测,方便快速判定结果。【结果】成功建立了一种用于检测SCSMV的RT-LAMP方法,可在60~63℃下60 min完成对SCSMV的检测,且具有较高的灵敏度,比传统RT-PCR高100倍,最低检测RNA浓度为167.9×10-5 ng。此外,该方法具有较高的特异性,可特异检测SCSMV。【结论】建立了一种灵敏、简便、快速的SCSMV RT-LAMP检测方法并用于田间甘蔗样品的检测。