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基于RAD重测序技术开发烟草品种SNP位点被引量：6: 1; 作者任民程立锐 +2 位作者刘旦蒋彩虹杨爱国《中国烟草科学》 CSCD 北大核心 2018年第3期10-17,共8页; 利用限制性内切酶位点标签(RAD)技术,通过对10份供试烟草材料的基因组简化重测序,发掘了烟草高通量SNP位点,为烟草基因组学提供标记信息。结果表明,本研究共获得了44.33 Gb的Clean data数据,平均覆盖度1.01 X,共鉴定到291 770个SNP位点,... 展开更多; 关键词烟草限制性内切酶位点标签重测序单核苷酸多态性; 在线阅读下载PDF 职称材料

AMSS-PCR在肺癌突变基因检测中的价值研究被引量：1: 2; 作者金柯谢绚 +6 位作者潘越江王科喜陈柏深吴多光沈卓坚王铭辉张惠忠《中国肺癌杂志》 CAS CSCD 北大核心 2018年第11期815-820,共6页; 背景与目的肺癌驱动基因检测具有重要意义,目前检测方法多样,临床适用性有差异。本研究旨在比较基于扩增阻碍突变系统-聚合酶链反应(Amplification Refractory Mutation System-polymerase chain reaction,ARMS-PCR)技术的试剂盒与一代... 展开更多; 关键词一代测序突变位点特异扩增法扩增阻碍突变系统实时定量聚合酶链式反应肺癌突变基因检测; 在线阅读下载PDF 职称材料

西藏绒山羊KAP6.2基因SNPs位点的检测及分析: 3; 作者周群旦巴 +7 位作者富国文王绍卿吴玉江索朗达巴贵次仁德吉德吉樊月圆《家畜生态学报》北大核心 2019年第7期18-21,共4页; 旨在研究绒毛品质相关基因KAP6.2在西藏绒山羊群体中的多态性,分析KAP6.2在不同山羊中的差异。采用聚合酶链反应-单链构象多态性和DNA测序等技术对随机选取的127只西藏绒山羊的 KAP6.2 基因进行突变位点检测及多态性指标分析。结果表明... 展开更多; 关键词西藏绒山羊 KAP6.2基因 SNPs位点聚合酶链反应-单链构象多态性 DNA测序; 在线阅读下载PDF 职称材料

染色质可及性分析的研究进展被引量：4: 4; 作者许兰任立成《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2022年第8期1462-1470,共9页; 在细胞核内,染色质可及性模式会随着外部刺激和发育线索的改变而发生动态变化。染色质可及性重构对于基因表达调控至关重要,在建立和维持细胞特性等方面发挥着重要作用。因此开展染色质可及性的研究对染色质功能上的三维解析具有十分重... 展开更多; 关键词染色质可及脱氧核糖核酸酶i超敏位点测序微球菌核酸酶测序甲醛辅助分离调控元件测序转座酶可及性测序; 在线阅读下载PDF 职称材料

DNA分析与扩增: 5; 《生物技术通报》 CAS CSCD 1993年第5期31-35,共5页; 关键词 DNA分析测序技术 RNA 终止密码子聚合酶人类基因组计划直接测序限制性位点 Sanger 表达克隆; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名基于RAD重测序技术开发烟草品种SNP位点被引量：6: 1; 作者任民程立锐刘旦蒋彩虹杨爱国; 机构中国农业科学院烟草研究所; 出处《中国烟草科学》 CSCD 北大核心 2018年第3期10-17,共8页; 基金中国烟草总公司重大专项"以K326为主要底盘品种的烟草全基因组模块构建"[110201601028(JY-02)] "烟草抗CMV和赤星病连锁分子标记开发及NC82 +5 种基金 K326品种抗性改良"(110201301009 JY-09) CMV 中国农业科学院基本科研业务费专项"分子标记在烤烟品种DUS测试中的应用研究"(1610232016014); 文摘利用限制性内切酶位点标签(RAD)技术,通过对10份供试烟草材料的基因组简化重测序,发掘了烟草高通量SNP位点,为烟草基因组学提供标记信息。结果表明,本研究共获得了44.33 Gb的Clean data数据,平均覆盖度1.01 X,共鉴定到291 770个SNP位点,SNP位点间的平均间距为10.066±29.801 kb。发掘到的SNP位点能够覆盖整个基因组,但在不同染色体部位上的分布密度存在一定差异,在17号染色上半臂的存在一段大范围的SNP密集区域。SNP变异类型以转换为主,通过功能注释在基因区域发现45 049处SNP位点。利用SNP分型信息,计算了供试品种间的遗传距离,平均为0.29,台烟8号的遗传背景与其他品种相对最远。该结果将为烟草QTL定位、候选基因发掘、亲本组配等研究提供科研依据。; 关键词烟草限制性内切酶位点标签重测序单核苷酸多态性; Keywords Nicotiana tabacum L. restriction-site associated DNA re-sequencing single nucleotide polymorphism; 分类号 S572.03 [农业科学—烟草工业]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名AMSS-PCR在肺癌突变基因检测中的价值研究被引量：1: 2; 作者金柯谢绚潘越江王科喜陈柏深吴多光沈卓坚王铭辉张惠忠; 机构中山大学孙逸仙纪念医院胸外科; 出处《中国肺癌杂志》 CAS CSCD 北大核心 2018年第11期815-820,共6页; 文摘背景与目的肺癌驱动基因检测具有重要意义,目前检测方法多样,临床适用性有差异。本研究旨在比较基于扩增阻碍突变系统-聚合酶链反应(Amplification Refractory Mutation System-polymerase chain reaction,ARMS-PCR)技术的试剂盒与一代测序及ARMS-qPCR检测肺癌突变基因的敏感性和特异性,探究突变位点特异扩增法(Amplification Mutation Specific System, AMSS)-PCR技术在肺癌突变基因检测中的应用价值。方法对前期已行ARMS-PCR检测的肿瘤标本进行一代测序及试剂盒检测,比较各种方法的检测结果,并对检测结果进行统计学分析。结果本研究共收集了309例肺癌标本。试剂盒与一代测序符合率97.41%,ARMS-PCR的符合率97.73%。试剂盒与一代测序、试剂盒与实时定量聚合酶链反应(quantitative real-time polymerase chain reaction, qPCR)、qPCR与一代测序一致性检验的Kappa值分别为0.946、0.953、0.913。试剂盒以一代测序为参照的受试者工作特征曲线(receiver operatingcharacteristiccurve,ROC)曲线下面积为0.976,以qPCR为参照的ROC曲线下面积为0.975。结论 AMSSqPCR技术能够有效检测肺癌突变基因,具有较好的临床应用价值。; 关键词一代测序突变位点特异扩增法扩增阻碍突变系统实时定量聚合酶链式反应肺癌突变基因检测; Keywords Sanger sequencing Amplification Mutation Specific System Amplification Refractory Mutation Sys- tem Quantitative real-time polymerase chain reaction Lung cancer gene mutation detection; 分类号 R734.2 [医药卫生—肿瘤] R730.43 [医药卫生—肿瘤]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名西藏绒山羊KAP6.2基因SNPs位点的检测及分析: 3; 作者周群旦巴富国文王绍卿吴玉江索朗达巴贵次仁德吉德吉樊月圆; 机构云南农业大学; 出处《家畜生态学报》北大核心 2019年第7期18-21,共4页; 基金现代农业产业技术体系建设专项资金资助(CARS-40-31) 西藏科技厅“十三五”重大农业专项XZ201801NA03 西藏科技厅畜禽育种项目资助; 文摘旨在研究绒毛品质相关基因KAP6.2在西藏绒山羊群体中的多态性,分析KAP6.2在不同山羊中的差异。采用聚合酶链反应-单链构象多态性和DNA测序等技术对随机选取的127只西藏绒山羊的 KAP6.2 基因进行突变位点检测及多态性指标分析。结果表明,西藏绒山羊 KAP6.2 基因存在两种基因型 AA和AB,其中等位基因A 为优势等位基因,多态信息含量为0.196 (属低度多态)。经测序并与GenBank中山羊KAP 6.2(No.AY316158)基因序列比对后共发现4处变异,分别为:178nt处24个碱基的缺失导致Ser48>Gly55氨基酸的丢失;113 nt处GT>CC突变导致氨基酸P.19Ser>Trp;121 nt处A>G突变为同义突变;168nt处C>T突变导致氨基酸P.41Thr>Tyr。这些氨基酸的突变很可能导致结构蛋白功能的改变,进而对西藏绒山羊的绒毛品质产生影响。通过研究影响西藏绒山羊绒毛品质的 KAP6.2 基因的多态性,深入了解其分子遗传基础,有利于利用分子遗传标记技术进行西藏绒山羊的选育。; 关键词西藏绒山羊 KAP6.2基因 SNPs位点聚合酶链反应-单链构象多态性 DNA测序; Keywords Tibetan Cashmere Goat KAP6.2 Gene SNPs sites PCR-SSCP DNA sequencing; 分类号 S811.5 [农业科学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名染色质可及性分析的研究进展被引量：4: 4; 作者许兰任立成; 机构海南医学院生物学教研室; 出处《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2022年第8期1462-1470,共9页; 基金海南省自然科学基金(820RC638) 国家自然科学基金(31660318,31260269)资助项目。; 文摘在细胞核内,染色质可及性模式会随着外部刺激和发育线索的改变而发生动态变化。染色质可及性重构对于基因表达调控至关重要,在建立和维持细胞特性等方面发挥着重要作用。因此开展染色质可及性的研究对染色质功能上的三维解析具有十分重要的意义。近几年,随着高通量测序技术的进步以及测序成本的降低,基于高通量测序技术的染色质可及性分析方法得到了迅速发展。目前观察和分析全基因组染色质开放与否的常见技术主要有脱氧核糖核酸酶I超敏位点测序(DNase-seq)、微球菌核酸酶测序(MNase-seq)、甲醛辅助分离调控元件测序(FAIRE-seq)以及转座酶可及性测序(ATAC-seq)。本文比较了这4种染色质可及性分析技术的优缺点,详细介绍了它们的原理及主要实验流程,并简要讨论了它们的发展及相关技术的应用,期望通过这些互补的方法为染色质分析领域的未来发展提供一些借鉴和思路。; 关键词染色质可及脱氧核糖核酸酶i超敏位点测序微球菌核酸酶测序甲醛辅助分离调控元件测序转座酶可及性测序; Keywords chromatin accessibility DNase-seq MNase-seq FAIRE-seq ATAC-seq; 分类号 Q2 [生物学—细胞生物学] Q3 [生物学—遗传学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名DNA分析与扩增: 5; 出处《生物技术通报》 CAS CSCD 1993年第5期31-35,共5页; 关键词 DNA分析测序技术 RNA 终止密码子聚合酶人类基因组计划直接测序限制性位点 Sanger 表达克隆; 分类号 Q81 [生物学—生物工程]; 在线阅读下载PDF 职称材料

	题名	作者	出处	发文年	被引量	操作
1	基于RAD重测序技术开发烟草品种SNP位点	任民程立锐刘旦蒋彩虹杨爱国	《中国烟草科学》 CSCD 北大核心	2018	6	在线阅读下载PDF 职称材料
2	AMSS-PCR在肺癌突变基因检测中的价值研究	金柯谢绚潘越江王科喜陈柏深吴多光沈卓坚王铭辉张惠忠	《中国肺癌杂志》 CAS CSCD 北大核心	2018	1	在线阅读下载PDF 职称材料
3	西藏绒山羊KAP6.2基因SNPs位点的检测及分析	周群旦巴富国文王绍卿吴玉江索朗达巴贵次仁德吉德吉樊月圆	《家畜生态学报》北大核心	2019		在线阅读下载PDF 职称材料
4	染色质可及性分析的研究进展	许兰任立成	《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心	2022	4	在线阅读下载PDF 职称材料
5	DNA分析与扩增		《生物技术通报》 CAS CSCD	1993	0	在线阅读下载PDF 职称材料