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5-甲基胞嘧啶RNA甲基化在非肿瘤性肾脏疾病中的研究进展
1
作者 张晨 赵自霞 +2 位作者 吴私 栾军军 周华 《中国医学科学院学报》 北大核心 2025年第1期86-94,共9页
RNA甲基化修饰是基因表达转录后水平表观遗传学调控的关键过程。5-甲基胞嘧啶(m^(5)C)是RNA甲基化修饰的一种类型,是真核生物mRNA和其他非编码RNA中常见的转录后修饰,主要调控转运RNA稳定性,核糖体RNA组装和mRNA成熟、稳定性与翻译等生... RNA甲基化修饰是基因表达转录后水平表观遗传学调控的关键过程。5-甲基胞嘧啶(m^(5)C)是RNA甲基化修饰的一种类型,是真核生物mRNA和其他非编码RNA中常见的转录后修饰,主要调控转运RNA稳定性,核糖体RNA组装和mRNA成熟、稳定性与翻译等生物学过程。m^(5)C RNA甲基化修饰是动态可逆的,受甲基转移酶、去甲基化酶和甲基化识别蛋白的调控。研究证实,m^(5)C RNA甲基化修饰异常与非肿瘤性肾脏疾病的发生相关。本文总结了m^(5)C RNA甲基化相关酶与非肿瘤性急慢性肾脏疾病之间的研究进展,有望为这类疾病的诊断和治疗提供潜在的靶点。 展开更多
关键词 表观遗传学 RNA甲基化修饰 RNA 5-甲基胞嘧啶 肾脏疾病
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高效毛细管电泳法测定酱油中5′-单磷酸核苷酸 被引量：7
2
作者 李佳 李芸 +3 位作者 宋宝花 丁晓静 赵珊 王志 《食品科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2011年第22期264-267,共4页
建立高效毛细管电泳同时分离测定酱油中两种核苷酸鸟嘌呤-5′-单磷酸(GMP)和次黄嘌呤-5′-单磷酸(IMP)的方法。电泳条件:以50μm×60.2cm(有效长度50cm)未涂敷石英毛细管为分离柱,30mmol/L硼砂+30mmol/L碳酸钠+60mmol/L羟丙基-β-... 建立高效毛细管电泳同时分离测定酱油中两种核苷酸鸟嘌呤-5′-单磷酸(GMP)和次黄嘌呤-5′-单磷酸(IMP)的方法。电泳条件:以50μm×60.2cm(有效长度50cm)未涂敷石英毛细管为分离柱,30mmol/L硼砂+30mmol/L碳酸钠+60mmol/L羟丙基-β-环糊精为分离缓冲溶液,50mmol/L醋酸溶液为样品介质,检测波长为254nm。GMP及IMP的校正峰面积与质量浓度在5～100mg/L范围内具有良好线性关系,线性相关系数分别为0.9998和0.9997,检出限均为2mg/L,定量限均为5mg/L。用该法测定了9种酱油,并与文献报道的高效液相色谱法的结果进行比较,结果满意。 展开更多
关键词 高效毛细管电泳 核苷酸 鸟嘌呤-5′-单磷酸 次黄嘌呤-5′-单磷酸 酱油
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胞外囊泡DNA中5-羟甲基胞嘧啶分子标志物对突发性聋的疗效预判研究 被引量：1
3
作者 李新建 时晰 +4 位作者 郭维维 林坚 陈航宇 陈伟 杨仕明 《中华耳科学杂志》 CSCD 北大核心 2024年第2期221-226,共6页
目的 突发性聋(sudden sensorineural hearing loss, SSNHL)是一种急性感音神经性聋,部分患者治疗效果较差,目前无有效疗效预测指标。5-羟甲基胞嘧啶(5hmC)是一种稳定的表观遗传标志,因其在不同身体状态下富集含量不同的特点可作为预测... 目的 突发性聋(sudden sensorineural hearing loss, SSNHL)是一种急性感音神经性聋,部分患者治疗效果较差,目前无有效疗效预测指标。5-羟甲基胞嘧啶(5hmC)是一种稳定的表观遗传标志,因其在不同身体状态下富集含量不同的特点可作为预测疗效的生物标志物,本研究通过寻找5hmC标志物,探索其对SSNHL疗效进行预测的可能性。方法 选取2021年7月—2023年6月中国人民解放军总医院海南医院耳鼻咽喉头颈外科收治的SSNHL患者57例,其中男性26例、女性31例;根据治疗前后的听力结果将患者分为有效组27例和无效组30例。使用队列研究方法,寻找5hmC富集水平与SSNHL疗效之间的相关性。利用5hmC-Seal技术在患者治疗前的血浆胞外囊泡DNA中生成全基因组5hmC谱,比较两组不同治疗效果的5hmC谱,筛选出有价值的5hmC标志物,并进行相关功能和传导通路的初步探索。结果 共鉴定出11个5hmC标志物来预测治疗结果(曲线下面积为0.998),预测准确性较高。GO功能分析表明,调节GTPase活性、神经元投射发育、神经细胞发育等信号通路可能与内耳疾病的发病机制有关。结论 SSNHL治疗有效组和无效组的5hmC谱存在明显差异,胞外囊泡DNA来源的5hmC有可能作为有效的表观遗传生物标志物,用于SSNHL的微创疗效预测。 展开更多
关键词 突发性聋 DNA去甲基化 5-羟甲基胞嘧啶 治疗预测
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香菇乳清酸核苷-5’-单磷酸脱羧酶编码基因le-pyrG的克隆 被引量：2
4
作者 鲍大鹏 冯爱萍 +4 位作者 张美彦 谭琦 陈明杰 牛丽英 潘迎捷 《食用菌学报》 北大核心 2009年第2期13-16,共4页
通过巢式简并PCR和基因组步行技术从香菇(Lentinula edodes)单核体中克隆到乳清酸核苷-5′-单磷酸脱羧酶(orotidine-5’-monophosphate decarboxylase,OMPDC)的编码基因le-pyrG,长度为946bp。经生物信息学分析,香菇le-pyrG基因含有2个... 通过巢式简并PCR和基因组步行技术从香菇(Lentinula edodes)单核体中克隆到乳清酸核苷-5′-单磷酸脱羧酶(orotidine-5’-monophosphate decarboxylase,OMPDC)的编码基因le-pyrG,长度为946bp。经生物信息学分析,香菇le-pyrG基因含有2个长度分别为67bp和51bp的内含子,该基因可以编码1个含有275个氨基酸残基的蛋白质序列,该序列经比对分析显示与裂褶菌(Schizophyllum commne)和灰盖鬼伞(Coprinus cinereus)OMPDC序列的相同性分别为73%和70%,相似性分别为84%和83%。这是首次报道从栽培食用真菌中克隆出乳清酸核苷-5′-单磷酸脱羧酶编码基因的全序列。 展开更多
关键词 香菇 乳清酸核苷-5′-单磷酸脱羧酶 le-pyrG基因
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三孢布拉氏霉乳清酸核苷-5’-单磷酸脱羧酶基因的PCR扩增与序列分析
5
作者 高建峰 宋冬林 《华中农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2003年第5期419-423,共5页
根据对卷枝毛霉Mucor circinelloides、布氏须霉PPhycomyces blakesleeanu、雪白根霉Rhizopus niveu、少根根霉Rhizo pus arrhizus和微小根毛霉Rhizomucor pusillus的乳清酸核苷-5'-单磷酸脱羧酶基因核酸序列的同源性分析,在第3个... 根据对卷枝毛霉Mucor circinelloides、布氏须霉PPhycomyces blakesleeanu、雪白根霉Rhizopus niveu、少根根霉Rhizo pus arrhizus和微小根毛霉Rhizomucor pusillus的乳清酸核苷-5'-单磷酸脱羧酶基因核酸序列的同源性分析,在第3个外显子内根据卷枝毛霉基因序列设计1对引物,以三孢布拉氏霉Blakeslea trispora基因组DNA为模板进行PCR扩增,得到1个长度约为500 bp的产物。经过同源性分析证明该产物为三孢布拉氏霉乳清酸核苷-5'-单磷酸脱羧酶基因片段。在此基础上,采用抑制性PCR扩增技术,进行染色体步行,分别克隆染色体上相邻的DNA片段,测定了基因的全序列,并对该序列进行了分析。结果表明:在外显子区域核酸序列与卷枝毛霉、少根根霉和微小根毛霉的同源率分别为82％,81％和79％。 展开更多
关键词 三孢布拉氏霉 乳清酸核苷-5’-单磷酸脱羧酶 基因 PCR 核酸 同源性 染色体 DNA 类胡萝卜素
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DNA修饰碱基5-甲基胞嘧啶和8-羟基鸟嘌呤的毛细管气相色谱分析及质谱鉴定 被引量：7
6
作者 宋元宗 祝其锋 +1 位作者 庄海旗 莫丽儿 《色谱》 CAS CSCD 北大核心 2000年第4期295-299,共5页
探索了GC/FID定量分析DNA修饰碱基 5 甲基胞嘧啶和 8 羟基鸟嘌呤的实验条件 ,用GC/MS鉴定各有关成分。结果表明 ,DNA水解物中不同成分可被成功地衍生和分离 ;5 甲基胞嘧啶和 8 羟基鸟嘌呤的相对摩尔反应因子分别为 3 0和 1 3;灵敏度分... 探索了GC/FID定量分析DNA修饰碱基 5 甲基胞嘧啶和 8 羟基鸟嘌呤的实验条件 ,用GC/MS鉴定各有关成分。结果表明 ,DNA水解物中不同成分可被成功地衍生和分离 ;5 甲基胞嘧啶和 8 羟基鸟嘌呤的相对摩尔反应因子分别为 3 0和 1 3;灵敏度分别为 5 50× 1 0 9mV·s/ g和 7 59× 1 0 1 0 mV·s/ g ;检测限可分别达 36 4pg/s和 1 5 8pg/s ;整个分析流程的相对标准偏差小于 2 0 %。 展开更多
关键词 5-甲基胞嘧啶 8-羟基鸟嘌呤 GC/FID 分析鉴定
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5-氟胞嘧啶气相及水助质子转移异构化的理论研究 被引量：5
7
作者 任宏江 晏志军 +1 位作者 杨晓慧 王渭娜 《化学研究与应用》 CAS CSCD 北大核心 2009年第8期1129-1135,共7页
采用密度泛函B3LYP/6-311G**方法,对6种5-氟胞嘧啶异构体孤立分子的稳定性及质子转移引起的酮式-烯醇式、氨基式-亚胺式互变异构反应机理进行了计算研究,获得了零点能、吉布斯自由能及质子转移过程的反应焓、活化能、活化吉布斯自由能... 采用密度泛函B3LYP/6-311G**方法,对6种5-氟胞嘧啶异构体孤立分子的稳定性及质子转移引起的酮式-烯醇式、氨基式-亚胺式互变异构反应机理进行了计算研究,获得了零点能、吉布斯自由能及质子转移过程的反应焓、活化能、活化吉布斯自由能和速率常数等参数。计算结果表明,气相中烯醇-氨基式FC4是最稳定的异构体。分子内质子转移设计了FC1→FC2和FC1→FC6两条通道,分别标记为P(1)和P(2),各通道速控步骤的活化能和速率常数分别为155.9 kJ.mol-1,4.70×10-15s-1和173.1 kJ.mo-l1,1.41×10-18s-1。水助催化时,相应通道P(3)和P(4)速控步骤的活化能和速率常数分别为51.0 kJ.mol-1,1.41×103s-1和88.2 kJ.mo-l1,4.53×10-3s-1。可见,水分子的加入极大地降低了质子转移的活化能垒。另外发现,水分子参与形成协同的双质子转移机理比水助单质子转移机理更利于降低活化能垒。 展开更多
关键词 5-氟胞嘧啶 质子转移 互变异构 密度泛函理论 活化能垒
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5-羟甲基胞嘧啶及其TET氧合酶在神经系统发育和相关疾病中的研究进展 被引量：4
8
作者 王建 张凯翔 +1 位作者 芦国珍 赵湘辉 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2017年第12期1138-1149,共12页
神经系统的正常发育是多种因素相互协调作用的结果,一旦特定因素失衡将引起相关疾病的发生。近年来不断有研究发现,DNA去甲基化过程的一类中间产物5-羟甲基胞嘧啶(5-hydroxymethylcytosine,5hm C)作为一种新的表观遗传标记,在神经系统... 神经系统的正常发育是多种因素相互协调作用的结果,一旦特定因素失衡将引起相关疾病的发生。近年来不断有研究发现,DNA去甲基化过程的一类中间产物5-羟甲基胞嘧啶(5-hydroxymethylcytosine,5hm C)作为一种新的表观遗传标记,在神经系统中高水平分布,并参与认知、记忆等重要的神经功能。5hm C的形成由氧合酶家族分子(ten-eleven translocation protein,TET)催化,在多种神经系统相关疾病中,5hm C水平和TETs分子的表达都发生改变,提示TET-5hm C表观遗传机制在复杂的神经系统发生发展过程中发挥了重要的调控作用。此外,作为基因表达调控的DNA标记物,5hm C的基因定位与基因表达水平的关系也是重要的研究方向。本文就近年来5hm C和TET家族蛋白分子在神经系统发育和相关疾病方面的重要研究发现进行了综述总结,希望为相关领域研究人员深入开展研究提供重要的思路,并为相关疾病设计治疗策略提供理论支持。 展开更多
关键词 5-羟甲基胞嘧啶 TET氧合酶 神经发育 神经系统疾病 表观遗传调控
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烤烟烟叶胞嘧啶和5-甲基胞嘧啶分离条件的优化 被引量：3
9
作者 贾峰 魏庆华 +3 位作者 杜铮 王彩霞 黄晓书 刘卫群 《山东农业科学》 2010年第6期94-97,共4页
通过不同流动相、测定温度、流速的对比，优化了分离烟叶总DNA中胞嘧啶和5-甲基胞嘧啶的高效液相色谱法。烤烟烟叶DNA采用CTAB法提取，高氯酸水解，用KOH调节pH到3—5，取上清液测定。色谱柱为NucleosilC18（250mm×4．6mm，5um）... 通过不同流动相、测定温度、流速的对比，优化了分离烟叶总DNA中胞嘧啶和5-甲基胞嘧啶的高效液相色谱法。烤烟烟叶DNA采用CTAB法提取，高氯酸水解，用KOH调节pH到3—5，取上清液测定。色谱柱为NucleosilC18（250mm×4．6mm，5um）。优化后测定条件为：流动相采用甲醇：5mmol／L戊烷磺酸钠（10：90，V／V），流速0．7ml／min，柱温30℃，检测波长273nm，进样量20山。该方法简化了流动相的配制，缩短了分离时间，胞嘧啶和5-甲基胞嘧啶的加标回收率分别为103．50％和96．67％，相对标准偏差为2．35％和2．80％。用该方法研究烤烟烟叶发育过程中总DNA胞嘧啶和5-甲基胞嘧啶的含量，效果良好，符合烟叶生长发育规律。 展开更多
关键词 反相高效液相色谱 烤烟烟叶 5-甲基胞嘧啶 胞嘧啶
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5-甲基胞嘧啶及胞嘧啶无辐射失活的半经典动力学模拟和CASSCF计算 被引量：1
10
作者 袁帅 马静 +2 位作者 张文英 舒坤贤 豆育升 《物理化学学报》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2012年第12期2803-2808,共6页
采用半经典动力学方法模拟了5-甲基胞嘧啶(5m-Cyt)和胞嘧啶(Cyt)在267nm紫外光辐射下的光物理失活过程.模拟发现,5m-Cyt和Cyt的激发态通过C5-C6键的扭曲以及甲基(或H5)和H6原子平面外振动失活.失活时,甲基(或H5)和H6原子几乎与环面垂直... 采用半经典动力学方法模拟了5-甲基胞嘧啶(5m-Cyt)和胞嘧啶(Cyt)在267nm紫外光辐射下的光物理失活过程.模拟发现,5m-Cyt和Cyt的激发态通过C5-C6键的扭曲以及甲基(或H5)和H6原子平面外振动失活.失活时,甲基(或H5)和H6原子几乎与环面垂直并指向不同方向,形成"双自由基态".由于甲基的体积比H原子的大,振动频率较小,使得C5原子的变形受到抑制,导致5m-Cyt的激发态寿命比胞嘧啶更长.完全活性空间自洽场(CASSCF)计算显示,5m-Cyt的圆锥交叉(CI)点能量比Cyt高0.3eV,这也证明5m-Cyt演化至CI需要克服更大的能垒,因此激发态寿命长于胞嘧啶. 展开更多
关键词 5-甲基胞嘧啶 胞嘧啶 半经典动力学模拟 CASSCF 激发态寿命
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5-氮杂-2’-脱氧胞嘧啶对乳腺癌细胞CDH4启动子去甲基化的作用 被引量：1
11
作者 黄正接 易文城 +3 位作者 尤俊 罗维远 曾岳岳 罗琪 《中国癌症杂志》 CAS CSCD 北大核心 2012年第8期578-582,共5页
背景与目的:钙黏素(cadherin,CDH)是一类重要的细胞黏附分子,CDH4在恶性肿瘤中表达下降的重要机制之一是基因启动子区的异常甲基化。本研究旨在探讨5-氮杂-2’-脱氧胞嘧啶(5-aza-2’-deoxycytidine,5-Aza-CdR)诱导人乳腺癌细胞株MCF-7中... 背景与目的:钙黏素(cadherin,CDH)是一类重要的细胞黏附分子,CDH4在恶性肿瘤中表达下降的重要机制之一是基因启动子区的异常甲基化。本研究旨在探讨5-氮杂-2’-脱氧胞嘧啶(5-aza-2’-deoxycytidine,5-Aza-CdR)诱导人乳腺癌细胞株MCF-7中CDH4基因启动子去甲基化后该基因恢复表达情况及功能状态。方法:5-Aza-CdR作用MCF-7细胞后,甲基化特异性PCR(methylation-specific PCR,MSP)法检测5-Aza-CdR对MCF-7细胞CDH4启动子甲基化的影响,RT-PCR检测5-Aza-CdR作用前后MCF-7细胞中CDH4的表达,MTT法检测MCF-7细胞的存活率,并通过划痕试验检测5-Aza-CdR处理前后MCF-7细胞迁移力的变化。结果:5-Aza-CdR逆转了MCF-7细胞CDH4的甲基化状态,CDH4 mRNA表达恢复,且恢复表达程度与5-Aza-CdR药物浓度呈正比,经不同浓度(10、20和40μmol/L)处理后,MCF-7细胞的增殖速度明显减慢,与5-Aza-CdR浓度为0μmol/L的对照组比较,各处理组细胞存活率差异有统计学意义(P<0.05),明显抑制了MCF-7细胞的迁移力。结论:CDH4启动子甲基化导致细胞株MCF-7中CDH4表达沉默,5-Aza-CdR能重新激活乳腺癌细胞株MCF-7细胞中CDH4的表达,抑制MCF-7细胞增殖和迁移,这可能是其引起乳腺癌细胞株MCF-7生物学行为改变的机制之一。 展开更多
关键词 乳腺癌 CDH4启动子 5-氮杂-2'-脱氧胞嘧啶 去甲基化
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胞嘧啶与3,3’,5,5’-四溴间甲酚磺酞反应体系研究 被引量：1
12
作者 迟燕华 白进伟 庄稼 《光谱学与光谱分析》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 2005年第11期1839-1842,共4页
采用UV-Vis法对胞嘧啶(Cy)与3,3',5,5'-四溴间甲酚磺酞(XJFL)反应体系进行了研究.研究了在酸性条件下温度、时间、离子强度等对反应体系的影响;测得反应的线性范围为0～32μg·mL-1,最大结合数n=16,摩尔吸光系数ε=1.32... 采用UV-Vis法对胞嘧啶(Cy)与3,3',5,5'-四溴间甲酚磺酞(XJFL)反应体系进行了研究.研究了在酸性条件下温度、时间、离子强度等对反应体系的影响;测得反应的线性范围为0～32μg·mL-1,最大结合数n=16,摩尔吸光系数ε=1.32×103 L·cm-1·mol-1等;并对反应机理进行了研究.同时测定了无机物,生物物质,表面活性剂对反应体系的干扰情况. 展开更多
关键词 胞嘧啶 3 3’ 5 5’-四溴间甲酚磺酞 UV—Vis法 Tris-HCl缓冲溶液
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酵母菌胞嘧啶脱氨酶/5-氟胞嘧啶基因治疗系统对K562B细胞杀伤效应的初步研究 被引量：1
13
作者 张雨生 王健民 翟勇平 《第二军医大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2002年第2期166-169,共4页
目的 :克隆酵母菌胞嘧啶脱氨酶 (YCD)基因 ,观察 YCD/ 5氟胞嘧啶 (YCD/ 5 - FC)系统对转基因肿瘤细胞的杀伤效应。 方法 :扩增 YCD基因并构建 YCD基因重组逆转录病毒载体 ;载体转染包装细胞获得高滴度病毒并转染高致瘤细胞K5 6 2 B,筛... 目的 :克隆酵母菌胞嘧啶脱氨酶 (YCD)基因 ,观察 YCD/ 5氟胞嘧啶 (YCD/ 5 - FC)系统对转基因肿瘤细胞的杀伤效应。 方法 :扩增 YCD基因并构建 YCD基因重组逆转录病毒载体 ;载体转染包装细胞获得高滴度病毒并转染高致瘤细胞K5 6 2 B,筛选并鉴定阳性转基因克隆 ;以 MTT法检测 5 - FC对 YCD转基因细胞的杀伤效应 ,测定转基因细胞裂解产物对5 - FC→ 5 - FU的转化。结果 :PCR法扩增出全长 YCD基因 ,经测序证实序列正确 ;构建了 MSCV - YCD- IRES- EGFP逆转录病毒载体 ,载体转染包装细胞Ф NX- A,获得滴度为 3.5× 10 6 CFU / m l的逆转录病毒 ;病毒转染 K5 6 2 B,转染率为 30 % ,经筛选获得转基因阳性克隆 YCD- K 5 6 2 B,RT- PCR检测显示 YCD- K5 6 2 B有 YCD基因的 m RNA表达 ,其细胞裂解产物可使 5 - FC转化为 5 - FU,表明其有 CD酶活性 ;MTT法检测低浓度 5 - FC(15μmol/ L )作用 96 h对 YCD- K5 6 2 B有明显的杀伤效应。 结论 :YCD/ 5 - FC系统对转基因肿瘤细胞有明显的杀伤效应。 展开更多
关键词 酵母菌胞嘧啶脱氨酶 5-氟胞嘧啶 白血病 杀伤效应 逆转录病毒载体 基因治疗 K562B细胞
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N^6-(6-氨基己基)-5′-磷酸腺苷的合成(英文) 被引量：1
14
作者 周乐 史远刚 +1 位作者 李键 王建辰 《西北农业大学学报》 CSCD 1996年第2期17-20,共4页
由肌苷开始经五步合成出Ｎ６－（６－氮基己基）－５’－磷酸腺苷。对６－氯－９β－Ｄ－呋喃核糖嘌呤的合成进行了改进。１，６－己二胺同６－氯－９β－Ｄ呋喃核糖嘌呤－５’－磷酸发生取代反应，合成出Ｎ６－（６－氮基己基）－５′... 由肌苷开始经五步合成出Ｎ６－（６－氮基己基）－５’－磷酸腺苷。对６－氯－９β－Ｄ－呋喃核糖嘌呤的合成进行了改进。１，６－己二胺同６－氯－９β－Ｄ呋喃核糖嘌呤－５’－磷酸发生取代反应，合成出Ｎ６－（６－氮基己基）－５′－磷酸腺苷，基于核苷的总产率约７０％。 展开更多
关键词 肌苷 核苷 5′-单磷酸腺苷 酶免疫测定 亲和层析
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5-羟甲基胞嘧啶在膀胱尿路上皮癌中的水平及临床意义
15
作者 李洁 徐玉乔 +4 位作者 张志文 章铭 张哲恺 张丰 李青 《细胞与分子免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2016年第2期232-235,共4页
目的探讨5-羟甲基胞嘧啶(5hm C)在膀胱尿路上皮癌(UC)的表达情况以及临床意义。方法采用免疫组织化学染色检测21例手术切除UC组织及癌旁尿路上皮组织中5hm C的表达情况。随后检测92例临床资料完善的手术切除UC组织中5hm C的表达情况,采... 目的探讨5-羟甲基胞嘧啶(5hm C)在膀胱尿路上皮癌(UC)的表达情况以及临床意义。方法采用免疫组织化学染色检测21例手术切除UC组织及癌旁尿路上皮组织中5hm C的表达情况。随后检测92例临床资料完善的手术切除UC组织中5hm C的表达情况,采用非参数Mann-Whitney U检验分析5hm C的表达和临床资料间的相关性,采用Kaplan-Meier检验进行单因素生存分析。结果 5hm C在癌旁尿路上皮组织和UC组织中的表达具有显著性差异,而5hm C在低级别和高级别的UC组织中,以及在TNM分级中的表达无明显差别。Kaplan-Meier单因素生存分析结果表明,5hm C表达水平分别与UC患者的生存率及无复发率无显著相关性。结论 UC组织中5hm C的表达水平明显下调,5hm C与UC的进展、预后和复发无相关性。 展开更多
关键词 5-羟甲基胞嘧啶 膀胱 尿路上皮癌 免疫组织化学技术 生存预后 复发预后
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表观遗传学新标记—5-羟甲基胞嘧啶检测方法的研究进展 被引量：4
16
作者 方科 张凯翔 +2 位作者 王建 付志猛 赵湘辉 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2016年第3期206-216,共11页
被称为"第六种碱基"的5-羟甲基胞嘧啶(5-hydroxymethylcytosine,5hm C),广泛分布于多种哺乳动物的组织和细胞中,与胚胎发育、神经系统功能以及肿瘤研究高度相关。与5-甲基胞嘧啶(5-methylcytosine,5m C)相比,5hm C在组织中含... 被称为"第六种碱基"的5-羟甲基胞嘧啶(5-hydroxymethylcytosine,5hm C),广泛分布于多种哺乳动物的组织和细胞中,与胚胎发育、神经系统功能以及肿瘤研究高度相关。与5-甲基胞嘧啶(5-methylcytosine,5m C)相比,5hm C在组织中含量更低,难以精确的检测。随着研究的深入,5hm C参与的重要生物学作用逐渐被人们发现,同时也促使着5hm C的检测和定量方法不断发展。为了区分5hm C与其他胞嘧啶衍生物,很多利用化学或者酶学修饰实现靶向检测或非靶向富集5hm C的方法应运而生。因此,选择并发展灵敏、准确、可靠的5hm C检测技术对于表观遗传研究至关重要。本文重点综述了近年来发展起来的5hm C检测和测序技术,通过比较分析各种方法的优缺点,为研究人员选择特定合适的方法开展相关研究提供重要的参考。 展开更多
关键词 表观遗传学 5-羟甲基胞嘧啶 检测方法 高通量测序
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5-氮杂胞嘧啶核苷联合hepaCAM腺病毒通过抑制p-AKT诱导膀胱癌细胞T24凋亡 被引量：4
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作者 王晓荣 杨雪 +3 位作者 王胤 吴小候 唐敏 罗春丽 《重庆医科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第6期762-767,共6页
目的:研究5-氮杂胞嘧啶核苷(5-azacytidine,azac)联合肝细胞黏附分子(hepatocyte cell adhesion molecule,hepaCAM)腺病毒对膀胱癌细胞T24凋亡的影响及可能机制的探讨。方法:7种不同因素分别处理培养的膀胱癌细胞T24,hoechst 33258染色... 目的:研究5-氮杂胞嘧啶核苷(5-azacytidine,azac)联合肝细胞黏附分子(hepatocyte cell adhesion molecule,hepaCAM)腺病毒对膀胱癌细胞T24凋亡的影响及可能机制的探讨。方法:7种不同因素分别处理培养的膀胱癌细胞T24,hoechst 33258染色检测各处理组细胞凋亡率,流式细胞仪(flow cytometry,FCM)检测细胞早期凋亡率,RT-PCR检测hepaCAM及B细胞淋巴瘤/白血病-2(B cell lymphoma/lewkmia-2,bcl-2)mRNA的表达,Western blot检测hepaCAM、p-AKT、total-AKT、bcl-2蛋白的表达。结果:hoechst 33258显示,azac联合hepaCAM腺病毒组细胞凋亡率为(45.21±0.06)%,明显高于hepaCAM腺病毒组(15.60±0.02)%和azac组(26.30±0.02)%,差异有统计学意义(P=0.003,P=0.008);FCM显示,azac联合hepaCAM腺病毒组细胞早期凋亡率为(16.05±0.06)%,明显高于hepaCAM腺病毒组(3.90±0.02)%和azac组(9.67±0.02)%,差异有统计学意义(P=0.002,P=0.043);RT-PCR显示,与单独hepaCAM腺病毒组和azac组相比,azac与hepaCAM腺病毒联用可以上调hepaCAM mRNA的表达(P=0.004,P=0.000),下调bcl-2 mRNA的表达,差异有统计学意义(P=0.026,P=0.030);Western blot显示,与单独hepaCAM腺病毒组和azac组相比,azac联合hepaCAM腺病毒组可上调hepaCAM蛋白的表达(P=0.003,P=0.003),同时下调p-AKT(P=0.001,P=0.005)和bcl-2(P=0.000,P=0.002)蛋白的表达,差异有统计学意义。结论:azac联合hepaCAM腺病毒可能通过抑制p-AKT的磷酸化水平加速诱导T24细胞凋亡,可为膀胱癌的治疗提供新的思路。 展开更多
关键词 5-氮杂胞嘧啶核苷 肝细胞黏附分子 膀胱癌细胞T24 P-AKT 细胞凋亡
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TET蛋白家族与5-羟甲基胞嘧啶在干细胞及再生医学表观遗传调控中的作用 被引量：3
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作者 赵健芳 李东 安阳 《北京大学学报（医学版）》 CAS CSCD 北大核心 2021年第2期420-424,共5页
表观遗传调控是对DNA及组蛋白的修饰,决定了何时、何地、以何种方式对遗传信息进行表达[1]。DNA甲基化是目前研究最多的表观遗传调控方式之一[2],将一个甲基共价结合在DNA胞嘧啶的5-碳位置上形成5-甲基胞嘧啶(5-methylcytosine,5mC)。... 表观遗传调控是对DNA及组蛋白的修饰,决定了何时、何地、以何种方式对遗传信息进行表达[1]。DNA甲基化是目前研究最多的表观遗传调控方式之一[2],将一个甲基共价结合在DNA胞嘧啶的5-碳位置上形成5-甲基胞嘧啶(5-methylcytosine,5mC)。过去人们曾认为DNA甲基化是一个不可逆的过程,只能通过DNA复制过程来被动稀释,但近年来对TET(ten eleven translocation)蛋白的研究发现,TET蛋白家族可以催化5mC氧化生成5-羟甲基胞嘧啶(5-hydroxymethylcytosine,5hmC)、5-甲酰胞嘧啶(5-formylcytosine,5fC)和5-羧基胞嘧啶(5-carboxylcytosine,5caC),从而消除DNA甲基化印记,促进“主动”DNA去甲基化过程[3]。 展开更多
关键词 TET蛋白 5-羟甲基胞嘧啶 脂肪干细胞 再生医学
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5-羟甲基胞嘧啶的研究进展 被引量：5
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作者 张燕霞 高可润 禹顺英 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2012年第5期509-518,共10页
CpG二核苷酸中胞嘧啶的甲基化形式5-甲基胞嘧啶(5-methylcytosine,5mC)在哺乳动物中是一种常见的表观遗传修饰,在基因表达调控、发育调节、基因组印迹等方面发挥重要作用。近3年来研究发现,除了5mC外,胞嘧啶碱基的另一种修饰—5-羟甲基... CpG二核苷酸中胞嘧啶的甲基化形式5-甲基胞嘧啶(5-methylcytosine,5mC)在哺乳动物中是一种常见的表观遗传修饰,在基因表达调控、发育调节、基因组印迹等方面发挥重要作用。近3年来研究发现,除了5mC外,胞嘧啶碱基的另一种修饰—5-羟甲基胞嘧啶(5-hydroxymethylcytosine,5hmC)在哺乳动物的多种组织中有着丰富的表达,它可能与5mC有着不同的生物学功能。文章就近年来5hmC的研究进展进行了综述。 展开更多
关键词 5-羟甲基胞嘧啶 TET蛋白 表观遗传
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基于高通量测序技术探究糖尿病足与健康人组织DNA中的5-羟甲基胞嘧啶变化 被引量：1
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作者 马睿瑶 赵景会 +3 位作者 储金林 铁璐 李念东 李琳琳 《医学研究生学报》 CAS 北大核心 2022年第12期1268-1273,共6页
目的 5-羟甲基胞嘧啶(5hmC)作为表观遗传物质被广泛研究,但在糖尿病足的研究中较少。文中旨在研究糖尿病足患者(DFU)和健康志愿者组织基因组DNA中的5hmC的差异变化。方法 收集2021年1~12月就诊于北京大学第三附属医院确诊为DFU患者组织6... 目的 5-羟甲基胞嘧啶(5hmC)作为表观遗传物质被广泛研究,但在糖尿病足的研究中较少。文中旨在研究糖尿病足患者(DFU)和健康志愿者组织基因组DNA中的5hmC的差异变化。方法 收集2021年1~12月就诊于北京大学第三附属医院确诊为DFU患者组织6例(DFU组)和Normal组织3例(对照组)。提取组织DNA,使用5hmC-Seal技术建立文库和Illumina高通量测序技术测序,筛选差异羟甲基化修饰基因(DhMGs)。采用STRING数据库构建蛋白互作网络,通过Cytoscape3.9.0软件绘制DhMGs的调控网络,并通过CytoHubba功能筛选出关键枢纽基因(Hub基因),采用DAVID数据库对Hub基因进行GO及KEGG富集分析,最后使用qRT-PCR和免疫组化进行验证。结果 共有166个上调基因和262个下调基因,其中包括NDUFB6、GALR1、GDAP1等已知的与糖尿病并发症相关的基因。DhMGs主要分布在内含子、基因间和启动子区域。通过CytoHubba分析可得到10个Hub DhMGs,分别是MAPK14、MAPK11、CDC42、MAP3K1、NCOA1、RAP1B、AGO4、RUNX1、HIF1A、PHC3。对10个Hub基因进行富集分析,在生物过程中涉及到VEGFR信号通路、Ras蛋白信号转导、肌细胞分化的正向调节以及与免疫相关的白细胞介素12分泌的正向调节等;在细胞成分中主要与细胞质、胞液等相关;在分子功能中主要有细分化调控、血管内皮生长因子受体信号通路、髓样细胞分化调控等功能。KEGG分析显示Hub基因主要富集于白细胞跨内皮细胞迁移、有丝分裂原活化蛋白激酶信号通路等。最后通过qRT-PCR和免疫组化实验得出MAPK11和CDC42在DFU组织中的表达水平均明显升高(P<0.05)。结论 糖尿病足和健康人组织DNA的5hmC修饰具有差异,MAPK11和CDC42可能成为DFU潜在的治疗靶点。 展开更多
关键词 糖尿病足 5-羟甲基胞嘧啶 有丝分裂原活化蛋白激酶14 有丝分裂原活化蛋白激酶11 细胞分裂周期因子42
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