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甘薯IbNRT2基因家族全基因组鉴定和表达分析: 1; 作者王芳乔帅 +4 位作者宋伟崔鹏娟廖安忠谭文芳杨松涛《生物技术通报》北大核心 2025年第7期193-204,共12页; 【目的】鉴定甘薯高亲和硝酸盐转运体NRT2家族成员,分析其理化性质、基因结构和不同胁迫下表达分析,为甘薯NRT2家族成员功能鉴定提供理论支持。【方法】利用NCBI和甘薯基因组数据库,采用生物信息学、转录组分析和低氮表型筛选等方法,系... 展开更多; 关键词甘薯 NRT2基因组织表达模式盐胁迫表达模式低氮表型; 在线阅读下载PDF 职称材料

紫花苜蓿MsNF-YB5基因的克隆及表达特性分析: 2; 作者王之杰张万军《草地学报》北大核心 2025年第3期686-695,共10页; 研究发现异源表达拟南芥(Arabidopsis thaliana)QQS基因可显著提高紫花苜蓿的抗逆性,而MsNF-YB5是其发挥功能的关键内源基因。为探究MsNF-YB5在紫花苜蓿(Medicago sativa L.)胁迫响应过程中的功能,本研究克隆并完成了MsNF-YB5的生物信... 展开更多; 关键词紫花苜蓿 MsNF-YB5 亚细胞定位自激活活性胁迫表达模式; 在线阅读下载PDF 职称材料

甘蓝型油菜BnAR基因家族全基因组鉴定与响应低温胁迫的表达分析被引量：1: 3; 作者郭志婷秦梦凡 +7 位作者李浩东赵飞雪李心茹杜媛媛包顺君李鸿洋徐佳丽黄镇《干旱地区农业研究》 CSCD 北大核心 2024年第6期27-37,共11页; 为了解甘蓝型油菜(Brassica napus L.)中BnAR基因的基本信息、进化关系及其在低温胁迫下的表达模式,对甘蓝型油菜BnAR基因家族成员进行全基因组鉴定,并探究低温胁迫下家族成员的表达情况。结果表明:甘蓝型油菜参考基因组中共鉴定出14个B... 展开更多; 关键词甘蓝型油菜 BnAR基因家族生物信息学表达模式:低温胁迫; 在线阅读下载PDF 职称材料

拟南芥AtNHX2启动子的克隆及表达模式分析(英文) 被引量：1: 4; 作者李金耀徐莉 +2 位作者马纪周洁张富春《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2004年第12期1114-1118,共5页; AtNHX2基因是拟南芥NHX基因家族的一员 ,编码了一种液泡膜中的Na+ /H+ 反向运输体并对拟南芥的耐盐能力起着重要的作用 .采用PCR扩增的方法克隆了拟南芥AtNHX2基因启始密码子上游约 2 8kb的DNA片段 ,并将其克隆到植物表达载体pCAMBIA13... 展开更多; 关键词 AtNHX2启动子瞬时表达表达模式分析盐胁迫; 在线阅读下载PDF 职称材料

中国南瓜bHLH转录因子家族的鉴定与生物信息学分析被引量：1: 5; 作者李彩霞李艺 +4 位作者穆宏秀林俊轩白龙强孙美华苗妍秀《生物技术通报》北大核心 2025年第1期186-197,共12页; 【目的】基于中国南瓜全基因组数据,鉴定中国南瓜bHLH转录因子家族成员并分析其理化性质和结构等,为中国南瓜bHLH转录因子家族的生物学功能研究提供理论支撑。【方法】利用NCBI和中国南瓜基因组数据库等对中国南瓜bHLH基因家族进行鉴定... 展开更多; 关键词中国南瓜 BHLH 理化性质系统进化树组织表达模式盐胁迫表达模式; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名甘薯IbNRT2基因家族全基因组鉴定和表达分析: 1; 作者王芳乔帅宋伟崔鹏娟廖安忠谭文芳杨松涛; 机构四川省农业科学院作物研究所(四川省种质资源中心) 粮油作物绿色种质创新与遗传改良四川省重点实验室河南省种业发展中心; 出处《生物技术通报》北大核心 2025年第7期193-204,共12页; 基金四川省青年基金(2024NSFSC1329) 国家甘薯现代农业产业技术体系(CARS-10) +2 种基金优质高效薯豆关键技术研究与应用(51000024Y000010717763)。; 文摘【目的】鉴定甘薯高亲和硝酸盐转运体NRT2家族成员,分析其理化性质、基因结构和不同胁迫下表达分析,为甘薯NRT2家族成员功能鉴定提供理论支持。【方法】利用NCBI和甘薯基因组数据库,采用生物信息学、转录组分析和低氮表型筛选等方法,系统鉴定IbNRT2基因成员,并对其基因结构、保守基序和表达特性等进行分析。【结果】在甘薯全基因组中鉴定到7个IbNRT2高亲和硝酸盐转运体基因。理化性质分析结果显示,IbNRT2家族成员编码氨基酸残基数为462-536,理论等电点均大于7,且所有编码蛋白为疏水蛋白。7个甘薯IbNRT2和9个近缘野生二倍体甘薯(Ipomoea trifida)ItfNRT2基因均分布在5条染色体上。系统进化树分析显示,7个IbNRT2家族成员分成3个亚组,甘薯与野生二倍体的亲缘关系最近。顺式作用元件分析表明,IbNRT2基因启动子区域存在大量环境及激素类响应元件,其中光信号响应元件最多。甘薯种内共线性关系显示,7个IbNRT2基因存在2对共线性关系;种间共线性关系结果显示,甘薯与野生二倍体ItfNRT2基因之间形成7对共线性关系,与拟南芥AtNRT2形成4对共线性关系。不同部位组织和盐胁迫表达分析结果揭示IbNRT2.7具有较为广泛的表达,在种子和叶片中表达最高且受盐胁迫诱导表达上调;IbNRT2.1、IbNRT2.2主要在根部表达且受盐胁迫诱导表达下调。在不同氮处理甘薯品种中进行RT-qPCR分析,结果揭示IbNRT2.1和IbNRT2.2受低硝酸盐诱导最明显,且在氮高效甘薯品种中(川薯221、川薯228、西成薯007)的诱导表达倍数高于氮低效甘薯品种(普薯32、绵紫薯9)。【结论】甘薯中鉴定出7个IbNRT2基因,在不同部位、盐胁迫和低氮胁迫下的表达模式存在差异,为进一步研究IbNRT2在不同部位的功能奠定基础。; 关键词甘薯 NRT2基因组织表达模式盐胁迫表达模式低氮表型; Keywords sweet potato NRT2 gene tissue-expression pattern expression pattern under salt stress phenotype at low nitrogen; 分类号 S531 [农业科学—作物学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名紫花苜蓿MsNF-YB5基因的克隆及表达特性分析: 2; 作者王之杰张万军; 机构中国农业大学草业科学与技术学院; 出处《草地学报》北大核心 2025年第3期686-695,共10页; 基金国家自然科学青年基金项目(32201454) 国家草业技术创新中心(筹)项目(CCPTZX2023B01)资助。; 文摘研究发现异源表达拟南芥(Arabidopsis thaliana)QQS基因可显著提高紫花苜蓿的抗逆性,而MsNF-YB5是其发挥功能的关键内源基因。为探究MsNF-YB5在紫花苜蓿(Medicago sativa L.)胁迫响应过程中的功能,本研究克隆并完成了MsNF-YB5的生物信息学分析、亚细胞定位、转录自激活检测及胁迫下的表达模式分析。结果显示,克隆获得的MsNF-YB5 cDNA编码156个氨基酸,与蒺藜苜蓿(Medicago truncatula)MtNF-YB5相似度最高,该基因启动子区域含有参与茉莉酸甲酯、脱落酸、防御与胁迫反应的顺式作用元件;亚细胞定位结果显示其具有细胞核定位,截短N端后具有酵母转录自激活活性。MsNF-YB5受盐胁迫、渗透胁迫、低氮胁迫、冷胁迫及脱落酸处理诱导表达。本研究为进一步研究MsNF-YB5功能以提高紫花苜蓿抗逆性提供了基础。; 关键词紫花苜蓿 MsNF-YB5 亚细胞定位自激活活性胁迫表达模式; Keywords Alfalfa MsNF-YB5 Subcellular localization Self-activation activity Stress expression; 分类号 S541.9 [农业科学—作物学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名甘蓝型油菜BnAR基因家族全基因组鉴定与响应低温胁迫的表达分析被引量：1: 3; 作者郭志婷秦梦凡李浩东赵飞雪李心茹杜媛媛包顺君李鸿洋徐佳丽黄镇; 机构西北农林科技大学农学院; 出处《干旱地区农业研究》 CSCD 北大核心 2024年第6期27-37,共11页; 基金国家重点研发计划项目(2022YFD1200400) 拉萨市重点科技计划项目(LSKJ202430)。; 文摘为了解甘蓝型油菜(Brassica napus L.)中BnAR基因的基本信息、进化关系及其在低温胁迫下的表达模式,对甘蓝型油菜BnAR基因家族成员进行全基因组鉴定,并探究低温胁迫下家族成员的表达情况。结果表明:甘蓝型油菜参考基因组中共鉴定出14个BnAR基因家族成员,分布在8条染色体上,将其命名为BnAR-1~BnAR-14,可分为ADC和DapDC两个亚家族;启动子顺式作用元件分析发现,BnAR基因家族成员的启动子区含有多种与激素和胁迫响应相关的元件;甘蓝型油菜组内共线性分析发现11对基因具有共线性关系,Ka/Ks分析发现所有同源基因的比值均小于0.5,说明BnAR基因家族在进化过程中受到严格的纯化选择;转录组数据分析表明,14个BnAR基因均响应低温胁迫,其中BnAR-4、BnAR-5、BnAR-11和BnAR-13受低温胁迫程度最为强烈,荧光定量PCR验证结果与转录组数据高度一致,因此可将这4个基因作为候选基因进行后续的功能验证。; 关键词甘蓝型油菜 BnAR基因家族生物信息学表达模式:低温胁迫; Keywords Brassica napus L. BnAR gene family bioinformatics expression pattern low temperature stress; 分类号 S565.4 [农业科学—作物学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名拟南芥AtNHX2启动子的克隆及表达模式分析(英文) 被引量：1: 4; 作者李金耀徐莉马纪周洁张富春; 机构新疆大学生命科学与技术学院分子生物学重点实验室浙江大学生命科学院; 出处《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2004年第12期1114-1118,共5页; 基金国家科技攻关西部科技行动项目资助 ( 2 0 0 1BA90 1A3 2 )~~; 文摘 AtNHX2基因是拟南芥NHX基因家族的一员 ,编码了一种液泡膜中的Na+ /H+ 反向运输体并对拟南芥的耐盐能力起着重要的作用 .采用PCR扩增的方法克隆了拟南芥AtNHX2基因启始密码子上游约 2 8kb的DNA片段 ,并将其克隆到植物表达载体pCAMBIA130 1 1中 ,通过基因枪轰击洋葱表皮瞬时表达的方法 ,初步检测启动子的活性 .将重组质粒pCAMBIA130 1 1/AtNHX2promoter转化拟南芥并筛选纯合子 .AtNHX2promoter GUS分析显示AtNHX2在所有的组织中均有表达 ,包括根尖 .在保卫细胞中检测到了强烈的GUS表达 ,这一结果表明 ,AtNHX2对特殊细胞的pH调控和K+ 自身稳定方面起着重要的作用 .AtNHX2启动子的活性可被NaCl抑制 ,并且抑制的强度和NaCl的浓度成正相关 .30 0mmol/LKCl处理可增强启动子的活性 ,说明NaCl和KCl是在转录水平上调控AtNHX2的表达 .在老叶中GUS活性比在新叶中GUS活性强 ,这说明了AtNHX2优先将有毒的离子积累在老叶中 ,从而有利于植物的正常发育 .在根毛细胞中也观测到了强烈的GUS活性 ,这就暗示了AtNHX2在扩大的液泡中储存Na+ .; 关键词 AtNHX2启动子瞬时表达表达模式分析盐胁迫; Keywords AtNHX2 promoter transient expression expression analysis salt stress; 分类号 Q943.2 [生物学—植物学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名中国南瓜bHLH转录因子家族的鉴定与生物信息学分析被引量：1: 5; 作者李彩霞李艺穆宏秀林俊轩白龙强孙美华苗妍秀; 机构山西农业大学园艺学院山西省设施蔬菜提质增效协同创新中心; 出处《生物技术通报》北大核心 2025年第1期186-197,共12页; 基金山西省重点研发计划项目(202102140601013) 山西省基础研究计划青年科学研究项目(20210302124242)。; 文摘【目的】基于中国南瓜全基因组数据,鉴定中国南瓜bHLH转录因子家族成员并分析其理化性质和结构等,为中国南瓜bHLH转录因子家族的生物学功能研究提供理论支撑。【方法】利用NCBI和中国南瓜基因组数据库等对中国南瓜bHLH基因家族进行鉴定,利用ExPASy ProtParam tool、DNAMAN和MAGA5.1等软件进行基本理化性质、系统进化、保守基序、启动子作用元件和表达模式等生物信息学分析。【结果】在中国南瓜全基因组中共鉴定出153个CmobHLHs基因,不均等地分布在20条染色体上。CmobHLH蛋白质含有91-897个氨基酸,理论等电点介于4.77-10.33;亚细胞定位预测表明有139个CmobHLH蛋白位于细胞核;系统进化分析将CmobHLH蛋白分为8个亚家族;保守基序(motif)预测结果表明,中国南瓜共含10条motif,其中motif1和motif2普遍存在于153个bHLH蛋白中。CmobHLHs在中国南瓜的各个部位均有表达,CmobHLH41、CmobHLH5、CmobHLH36和CmobHLH88分别在果实、叶片、茎和根中表达量最高;盐胁迫下,100个CmobHLHs基因表达量上调,49个CmobHLHs基因表达量下调。RT-q PCR结果表明盐胁迫下CmobHLH52和CmobHLH148基因表达量显著上调,而CmobHLH8、CmobHLH83、CmobHLH93和CmobHLH115基因表达量显著下调,与转录组结果基本一致。【结论】鉴定出153个CmobHLHs基因,家族成员在不同部位和盐胁迫下的表达模式存在差异,为挖掘南瓜bHLH转录因子在抗盐等方面的功能提供理论基础。; 关键词中国南瓜 BHLH 理化性质系统进化树组织表达模式盐胁迫表达模式; Keywords Cucurbita moschata bHLH physical and chemical properties systematic evolutionary tree organizational expression pattern expression pattern under salt stress; 分类号 Q943.2 [生物学—植物学] S642.1 [农业科学—蔬菜学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

	题名	作者	出处	发文年	被引量	操作
1	甘薯IbNRT2基因家族全基因组鉴定和表达分析	王芳乔帅宋伟崔鹏娟廖安忠谭文芳杨松涛	《生物技术通报》北大核心	2025	0	在线阅读下载PDF 职称材料
2	紫花苜蓿MsNF-YB5基因的克隆及表达特性分析	王之杰张万军	《草地学报》北大核心	2025	0	在线阅读下载PDF 职称材料
3	甘蓝型油菜BnAR基因家族全基因组鉴定与响应低温胁迫的表达分析	郭志婷秦梦凡李浩东赵飞雪李心茹杜媛媛包顺君李鸿洋徐佳丽黄镇	《干旱地区农业研究》 CSCD 北大核心	2024	1	在线阅读下载PDF 职称材料
4	拟南芥AtNHX2启动子的克隆及表达模式分析(英文)	李金耀徐莉马纪周洁张富春	《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心	2004	1	在线阅读下载PDF 职称材料
5	中国南瓜bHLH转录因子家族的鉴定与生物信息学分析	李彩霞李艺穆宏秀林俊轩白龙强孙美华苗妍秀	《生物技术通报》北大核心	2025	1	在线阅读下载PDF 职称材料