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结构特异性核酸酶FEN-1的功能和结构 被引量:2
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作者 石斌山 余应年 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2000年第2期143-146,共4页
FEN 1(flapendo/exonuclease)是一种结构特异性核酸酶 ,它能识别特定的DNA分叉结构 ,并切除含有游离 5′端的单链核酸 .在DNA复制过程中 ,FEN 1通过其外切酶、内切酶活力去除了冈崎片段前端RNA引物的最后一个核糖核苷 .在DNA修复中 ,FE... FEN 1(flapendo/exonuclease)是一种结构特异性核酸酶 ,它能识别特定的DNA分叉结构 ,并切除含有游离 5′端的单链核酸 .在DNA复制过程中 ,FEN 1通过其外切酶、内切酶活力去除了冈崎片段前端RNA引物的最后一个核糖核苷 .在DNA修复中 ,FEN 1以其内切酶活力参与了损伤碱基的修复过程 .FEN 1基因含有两个保守区和一个PCNA结合区 . 展开更多
关键词 结构特异性核酸酶 DNA复制 DNA修复 遗传稳定性
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转基因玉米MIR604结构特异片段实时荧光定量检测方法的建立 被引量:4
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作者 常丽娟 宋君 +4 位作者 雷绍荣 尹全 王东 刘文娟 张富丽 《江苏农业学报》 CSCD 北大核心 2015年第5期971-974,共4页
根据转基因玉米MIR604外源载体序列,设计引物和探针,并优化反应体系和热循环条件,建立了MIR604结构特异片断实时荧光定量PCR检测方法。采用该方法对6种非转基因作物、MIR604及其他非目标转基因作物进行检测,除MIR604外,其余样品均未检测... 根据转基因玉米MIR604外源载体序列,设计引物和探针,并优化反应体系和热循环条件,建立了MIR604结构特异片断实时荧光定量PCR检测方法。采用该方法对6种非转基因作物、MIR604及其他非目标转基因作物进行检测,除MIR604外,其余样品均未检测到MIR604分子片段的扩增信号;对含量为1%的MIR604标准品进行定量检测,测试样品平均含量为1.05%;灵敏度测试结果显示该方法能检测到仅5个拷贝的MIR604分子片段。因此,本研究建立的方法具有较高的特异性、准确度及灵敏度,能为中国转基因生物安全监管提供技术支持。 展开更多
关键词 转基因玉米 结构特异性 实时荧光定量PCR 灵敏度 准确度
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肝脏特异性含ZP结构域蛋白在肥胖小鼠模型中的表达
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作者 袁叶青 张明亮 +1 位作者 王彦苏 包玉倩 《上海交通大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2019年第1期11-15,共5页
目的·研究肝脏特异性含ZP结构域蛋白(liver-specific ZP domain-containing protein,LZP)在肥胖小鼠模型中的表达。方法·检测C57BL/6J小鼠各组织LZP的基因和蛋白表达水平。通过高脂饮食诱导C57BL/6J小鼠肥胖模型,以高脂饲料喂... 目的·研究肝脏特异性含ZP结构域蛋白(liver-specific ZP domain-containing protein,LZP)在肥胖小鼠模型中的表达。方法·检测C57BL/6J小鼠各组织LZP的基因和蛋白表达水平。通过高脂饮食诱导C57BL/6J小鼠肥胖模型,以高脂饲料喂养ob/ob小鼠,在实验期间监测体质量和血糖,实验结束后检测肝质量和体脂,进行肝脏组织学检查。应用realtime-PCR检测肝脏组织LZP基因表达水平,Western blotting检测肝脏组织LZP蛋白表达水平。结果·Realtime-PCR结果表明LZP基因主要在C57BL/6J小鼠的肝脏表达,在脾脏和睾丸等部位表达量少;Western blotting结果表明仅在肝脏组织中检测到LZP蛋白表达。与普通饮食喂养的C57BL/6J小鼠相比,高脂饮食喂养的小鼠体质量、体脂和血糖增加(均P<0.05);肝质量增加(P<0.05),肝脏脂肪变明显;肝脏LZP在基因和蛋白表达水平均显著下降(均P<0.05)。与同窝野生型小鼠相比,ob/ob小鼠体质量和血糖均明显增高,但LZP在基因和蛋白水平均明显下降(均P<0.05)。结论·LZP在肥胖小鼠模型中表达明显下降,提示其可能参与机体的能量代谢。 展开更多
关键词 肝脏异性含ZP结构域蛋白 肥胖 肝脏因子
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卵巢肿瘤结构域特异性去线性泛素化酶负向调控炎症和自身免疫
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作者 李天亮 韩超峰 +2 位作者 DAMGAARD R B WALKER J A MARCO-CASANOVA P 《中国肿瘤生物治疗杂志》 CAS CSCD 北大核心 2016年第6期857-857,共1页
线性泛素化在调节免疫系统中发挥着重要作用,可以通过调节核因子κB(nuclear factorκB,NF-κB)调节免疫反应。线性泛素化链由线性泛素链组装复合体(linear ubiquitin chain assembly complex,LUBAC)合成,这个复合体包括氧化血红素I... 线性泛素化在调节免疫系统中发挥着重要作用,可以通过调节核因子κB(nuclear factorκB,NF-κB)调节免疫反应。线性泛素化链由线性泛素链组装复合体(linear ubiquitin chain assembly complex,LUBAC)合成,这个复合体包括氧化血红素IRP2泛素连接酶1(heme-oxidized IRP2 ubiquitin ligase-1,HOIL-1)、HOIL-1相互作用蛋白(HOIL-1 interacting protein,HOIP), 展开更多
关键词 泛素化 UBIQUITIN 相互作用蛋白 结构异性 卵巢肿瘤 interacting 自身免疫 免疫反应 泛素连接酶 复合体
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结构特异N-糖蛋白质组学研究进展
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作者 毕明 田志新 《质谱学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2021年第5期897-913,I0009,共18页
N-连接糖基化修饰是蛋白质上常见的翻译后修饰,发生在特征氨基酸序列N-X-T/S/C(X≠P)中的天冬酰胺上。N-连接糖具有五糖核心结构,包括高甘露糖型、杂合型和复杂型等3种主要类型。N-糖基化在修饰位点上具有微观和宏观不均一性,其功能与... N-连接糖基化修饰是蛋白质上常见的翻译后修饰,发生在特征氨基酸序列N-X-T/S/C(X≠P)中的天冬酰胺上。N-连接糖具有五糖核心结构,包括高甘露糖型、杂合型和复杂型等3种主要类型。N-糖基化在修饰位点上具有微观和宏观不均一性,其功能与修饰位点和N-连接糖结构对应。对蛋白质N-糖基化位点和结构特异性的精准鉴定和定量,是基于质谱的N-糖蛋白质组学发现N-糖蛋白相关疾病诊断和预后标志物、药物靶点,以及研发高效靶向大分子药物的主要任务。随着高效富集材料、液相色谱分离技术、串联质谱和检测技术以及生物信息学数据库搜索方法的逐步发展和成熟,目前N-糖蛋白质组学已能够对体系中的N-糖基化进行高通量位点和结构特异性鉴定和定量。本文主要介绍N-糖蛋白质组学的样本制备、高效液相色谱-质谱联用分析、生物信息学数据处理等基本步骤,以及由这些步骤组成的完整分析流程的代表性应用研究。 展开更多
关键词 N-糖蛋白质组学 LC-MS/MS GPSeeker 结构特异性 鉴定 定量
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气管和肺干细胞定位及其分子调控机制
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作者 金鑫 石穆穆 +1 位作者 李欣 贾心善 《中国肺癌杂志》 CAS 2010年第6期648-651,共4页
1气管干细胞的概念及特性 干细胞均有3个特性:干细胞长时期具有分裂和自我更新的能力;干细胞没有特化功能,即无法特化任何组织特异性结构而能够行使特定功能;能够产生特化细胞,这个过程被称为分化。此外干细胞在组织中为数甚少。而且... 1气管干细胞的概念及特性 干细胞均有3个特性:干细胞长时期具有分裂和自我更新的能力;干细胞没有特化功能,即无法特化任何组织特异性结构而能够行使特定功能;能够产生特化细胞,这个过程被称为分化。此外干细胞在组织中为数甚少。而且绝大多数在静态G0期。有关气管干细胞有两种观点: 展开更多
关键词 气管干细胞 分子调控机制 细胞定位 异性结构 自我更新 化细胞 组织
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利用生物信息学分析人ZUP1基因在乳腺癌中的表达及机制
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作者 张光君 涂刚 《第二军医大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第12期1338-1345,共8页
目的探讨泛素折叠修饰因子1特异性肽酶结构域蛋白(ZUP1)基因在乳腺癌中的表达情况及上下游机制。方法使用基因表达汇编(GEO)、癌症基因组图谱(TCGA)和基因型-组织表达(GTEx)数据库,检索收集乳腺癌患者的基因信息和临床病理数据,通过χ2... 目的探讨泛素折叠修饰因子1特异性肽酶结构域蛋白(ZUP1)基因在乳腺癌中的表达情况及上下游机制。方法使用基因表达汇编(GEO)、癌症基因组图谱(TCGA)和基因型-组织表达(GTEx)数据库,检索收集乳腺癌患者的基因信息和临床病理数据,通过χ2检验分析乳腺癌组织中ZUP1基因表达与临床病理因素的关系,使用Kaplan-Meier生存分析探讨乳腺癌患者生存状况与ZUP1表达的关系。用生物信息学方法预测潜在调控ZUP1的miRNA和泛素连接酶,最后进行基因集富集分析。结果ZUP1基因在乳腺癌组织中的表达高于正常对照组织。ZUP1表达水平与乳腺癌T分期、PAM50分型、雌激素受体状态、孕激素受体状态、人表皮生长因子受体2状态和组织学类型有关(P均<0.01),ZUP1高表达组患者的总生存时间低于ZUP1低表达组(P=0.031)。生物信息学预测结果显示,以ZUP1基因为靶点的差异表达最显著的10个miRNA为miRNA-10b-3p、miRNA-499a-5p、miRNA-181b-2-3p、miRNA-181b-3p、miRNA-4420、miRNA-548aw、miRNA-5680、miRNA-570-3p、miRNA-7156-5p和miRNA-8087,包括MARCH1、MARCH8、Mdm2、synoviolin和MIB1在内的E3泛素连接酶可能调节ZUP1蛋白表达。基因集富集分析结果表明ZUP1在乳腺癌中主要参与基础转录因子、泛素介导的蛋白质水解、卵母细胞减数分裂、RNA降解和极光激酶B等通路。结论ZUP1在乳腺癌中表达上调,与患者预后具有相关性。ZUP1在乳腺癌发生、发展中的上下游机制与多种miRNA和多条信号通路有关。 展开更多
关键词 泛素折叠修饰因子1异性肽酶结构域蛋白 乳腺肿瘤 存活率分析 生物标志物 生物信息学
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EOGT介导的O-GlcNAc修饰对Notch信号通路的影响及其在疾病中的作用
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作者 毛元鹏 魏红山 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第9期1284-1290,共7页
O-连接-N-乙酰氨基葡萄糖(O-linked-N-acetylglucosamine,O-GlcNAc)修饰是一种特殊的翻译后修饰,在众多细胞过程中发挥调节作用,例如转录、胞内信号转导、内吞作用和蛋白质稳定性。表皮生长因子(epidermal growth factor,EGF)结构域特异... O-连接-N-乙酰氨基葡萄糖(O-linked-N-acetylglucosamine,O-GlcNAc)修饰是一种特殊的翻译后修饰,在众多细胞过程中发挥调节作用,例如转录、胞内信号转导、内吞作用和蛋白质稳定性。表皮生长因子(epidermal growth factor,EGF)结构域特异性O-GlcNAc转移酶(EGF domain-specific O-linked-N-acetylglucosamine transferase,EOGT)是一种内质网(endoplasmic reticulum,ER)驻留蛋白质,能够对含有EGF结构域的分泌或膜(跨膜)糖蛋白丝氨酸/苏氨酸残基进行糖基化修饰。Notch信号通路是一种普遍存在的细胞间通讯过程,通过邻近细胞间的相互作用调节细胞生物过程。目前,已经在多种人类疾病中发现有EOGT介导的O-GlcNAc修饰参与,并且通常与Notch信号通路相关。然而,其中具体分子机制尚未完全阐明。本文对近年来EOGT介导的O-GlcNAc修饰,以及相关Notch信号通路在多种人类疾病中的作用研究现状进行简要回顾。 展开更多
关键词 表皮生长因子结构异性O-GlcNAc转移酶 O-连接-N-乙酰氨基葡萄糖 NOTCH信号通路 糖基化修饰 疾病
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应用塑化技术分析视神经压迫
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作者 M.-C. Sora B. Strobl +3 位作者 D. Staykov H. Traxler 李鉴轶 傅群武 《中国临床解剖学杂志》 CSCD 北大核心 2003年第4期F003-F003,共1页
关键词 应用 塑化技术 分析 视神经压迫 异性解剖结构
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