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蛋白质结构型的定义和识别
被引量：
5
1
作者
李晓琴
罗辽复
《生物化学与生物物理进展》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2002年第1期124-127,共4页
提出紧结构域的概念 ,由二级结构序列中一段或几段连续的α螺旋和 β折叠构成的空间紧密堆集的最大折叠体称为紧结构域 .利用 3种紧结构域 (α域 ,β域和α/β域 )定义球蛋白的 5种结构型 :α型蛋白 ,β型蛋白 ,α/β型蛋白 ,多域蛋白和...
提出紧结构域的概念 ,由二级结构序列中一段或几段连续的α螺旋和 β折叠构成的空间紧密堆集的最大折叠体称为紧结构域 .利用 3种紧结构域 (α域 ,β域和α/β域 )定义球蛋白的 5种结构型 :α型蛋白 ,β型蛋白 ,α/β型蛋白 ,多域蛋白和 ζ型蛋白 .将 12 6 1个代表性的蛋白质 (10 2 2家族 )进行分类 ,并和SCOP库的分类做了比较 .进行了删去序列冗余的分析 .在此基础上提出结构型的预测方案 ,成功率在 82 %～ 85 %.
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关键词
蛋白
质
结构型
二级
结构
序列
紧
结构
域
序列冗余
预测
识别
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职称材料
蛋白质结构型的识别方法
被引量：
1
2
作者
李晓琴
罗辽复
《生物化学与生物物理进展》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2002年第6期938-941,共4页
给出了α型、β型、α/ β型、多域型蛋白质二级结构主序列六联体的分布规律 .提出了根据蛋白质二级结构主序列对蛋白质结构型进行识别 (分类 )的方法 .以蛋白质二级结构主序列三联体为参数 ,利用Mahalanobis距离方法对上述 4种结构型...
给出了α型、β型、α/ β型、多域型蛋白质二级结构主序列六联体的分布规律 .提出了根据蛋白质二级结构主序列对蛋白质结构型进行识别 (分类 )的方法 .以蛋白质二级结构主序列三联体为参数 ,利用Mahalanobis距离方法对上述 4种结构型的蛋白质进行识别 ,分类的总体准确率为 81% ;以二级结构主序列中六联体的频数构成蛋白质结构的多样性源 ,利用多样性增量极小化对上述 4种结构型进行识别 ,分类的总体准确率为 83% .
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关键词
蛋白
质
结构型
识别方法
二级
结构
序列
多样性指标
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职称材料
部分小麦低分子量谷蛋白亚基二级结构的预测与分析
被引量：
3
3
作者
路洁霏
伍碧华
+1 位作者
郑雯
郑有良
《四川农业大学学报》
CSCD
2006年第1期7-12,共6页
为了从蛋白质高级结构的水平上研究小麦低分子量谷蛋白结构与功能的关系,利用互联网上开放的预测软件和蛋白质序列分析软件对已获得全序列,并明确其染色体定位的19个LMW-GS基因的推导氨基酸序列进行二级结构的预测和分析。结果表明,在整...
为了从蛋白质高级结构的水平上研究小麦低分子量谷蛋白结构与功能的关系,利用互联网上开放的预测软件和蛋白质序列分析软件对已获得全序列,并明确其染色体定位的19个LMW-GS基因的推导氨基酸序列进行二级结构的预测和分析。结果表明,在整个LMW-GS二级结构中,无规则卷曲最多,达69.51%,α-螺旋(28.97%)较β-折叠(1.36%)占有绝对优势,因而归属于α结构型蛋白。其中,信号肽由大量α-螺旋和微量无规则卷曲组成,N-端和重复区均由无规则卷曲占据,而C-末端除富含α-螺旋和无规则卷曲外,还是β-折叠的唯一分布区。同时,两个分子间二硫键存在于无规则卷曲中,而另有6个分子内二硫键分布于α-螺旋内或其附近,由此推导出小麦LMW-GS二级结构的平面模式图。这种特异的LMW-GS二级结构不仅进一步证明了“蛋白质一级结构决定高级结构”,以及信号肽引导新合成的LMW-GS顺利进入相应细胞器等经典理论,而且从空间结构的水平上阐释了LMW-GS多肽链致密化及其互聚体形成、富集,并与HMW-GS一起影响面粉加工品质的结构基础。
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关键词
小麦
低分子量谷
蛋白
亚基
二级
结构
结构型蛋白
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职称材料
题名
蛋白质结构型的定义和识别
被引量：
5
1
作者
李晓琴
罗辽复
机构
内蒙古大学理工学院
出处
《生物化学与生物物理进展》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2002年第1期124-127,共4页
基金
国家自然科学基金资助项目 (39960 0 23)~~
文摘
提出紧结构域的概念 ,由二级结构序列中一段或几段连续的α螺旋和 β折叠构成的空间紧密堆集的最大折叠体称为紧结构域 .利用 3种紧结构域 (α域 ,β域和α/β域 )定义球蛋白的 5种结构型 :α型蛋白 ,β型蛋白 ,α/β型蛋白 ,多域蛋白和 ζ型蛋白 .将 12 6 1个代表性的蛋白质 (10 2 2家族 )进行分类 ,并和SCOP库的分类做了比较 .进行了删去序列冗余的分析 .在此基础上提出结构型的预测方案 ,成功率在 82 %～ 85 %.
关键词
蛋白
质
结构型
二级
结构
序列
紧
结构
域
序列冗余
预测
识别
Keywords
protein structural class
secondary structure sequence
compact structural domain
sequence redundancy
prediction
分类号
Q51 [生物学—生物化学]
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职称材料
题名
蛋白质结构型的识别方法
被引量：
1
2
作者
李晓琴
罗辽复
机构
内蒙古大学物理系
出处
《生物化学与生物物理进展》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2002年第6期938-941,共4页
基金
国家自然科学基金资助项目 (3 9960 0 2 390 10 3 0 3 0 )~~
文摘
给出了α型、β型、α/ β型、多域型蛋白质二级结构主序列六联体的分布规律 .提出了根据蛋白质二级结构主序列对蛋白质结构型进行识别 (分类 )的方法 .以蛋白质二级结构主序列三联体为参数 ,利用Mahalanobis距离方法对上述 4种结构型的蛋白质进行识别 ,分类的总体准确率为 81% ;以二级结构主序列中六联体的频数构成蛋白质结构的多样性源 ,利用多样性增量极小化对上述 4种结构型进行识别 ,分类的总体准确率为 83% .
关键词
蛋白
质
结构型
识别方法
二级
结构
序列
多样性指标
Keywords
protein structural class, secondary structure sequence, diversity measure
分类号
Q518.1 [生物学—生物化学]
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职称材料
题名
部分小麦低分子量谷蛋白亚基二级结构的预测与分析
被引量：
3
3
作者
路洁霏
伍碧华
郑雯
郑有良
机构
四川农业大学小麦研究所
出处
《四川农业大学学报》
CSCD
2006年第1期7-12,共6页
基金
国家自然科学基金(30571139)
'教育部长江学者和创新团队发展计划(IRT0453)
+1 种基金
四川省教育厅重点项目
四川省学术和技术带头人培养基金。
文摘
为了从蛋白质高级结构的水平上研究小麦低分子量谷蛋白结构与功能的关系,利用互联网上开放的预测软件和蛋白质序列分析软件对已获得全序列,并明确其染色体定位的19个LMW-GS基因的推导氨基酸序列进行二级结构的预测和分析。结果表明,在整个LMW-GS二级结构中,无规则卷曲最多,达69.51%,α-螺旋(28.97%)较β-折叠(1.36%)占有绝对优势,因而归属于α结构型蛋白。其中,信号肽由大量α-螺旋和微量无规则卷曲组成,N-端和重复区均由无规则卷曲占据,而C-末端除富含α-螺旋和无规则卷曲外,还是β-折叠的唯一分布区。同时,两个分子间二硫键存在于无规则卷曲中,而另有6个分子内二硫键分布于α-螺旋内或其附近,由此推导出小麦LMW-GS二级结构的平面模式图。这种特异的LMW-GS二级结构不仅进一步证明了“蛋白质一级结构决定高级结构”,以及信号肽引导新合成的LMW-GS顺利进入相应细胞器等经典理论,而且从空间结构的水平上阐释了LMW-GS多肽链致密化及其互聚体形成、富集,并与HMW-GS一起影响面粉加工品质的结构基础。
关键词
小麦
低分子量谷
蛋白
亚基
二级
结构
结构型蛋白
Keywords
wheat
low molecular weight glutenin
secondary structure
分类号
S512.1 [农业科学—作物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
蛋白质结构型的定义和识别
李晓琴
罗辽复
《生物化学与生物物理进展》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2002
5
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
蛋白质结构型的识别方法
李晓琴
罗辽复
《生物化学与生物物理进展》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2002
1
在线阅读
下载PDF
职称材料
3
部分小麦低分子量谷蛋白亚基二级结构的预测与分析
路洁霏
伍碧华
郑雯
郑有良
《四川农业大学学报》
CSCD
2006
3
在线阅读
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职称材料
已选择
0
条
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