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胶质瘤细胞组蛋白去甲基化酶JMJD3表达降低 被引量:5
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作者 李彦伟 王哲 《细胞与分子免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2014年第5期525-526,529,共3页
目的检测和分析组蛋白去甲基化酶含十字形结构域蛋白3(JMJD3)在胶质瘤及瘤旁脑组织中的表达。方法用组织芯片筛选出JMJD3表达阳性的胶质瘤组织,选取50例相关胶质瘤患者的石蜡标本,采用免疫组化SP法检测JMJD3在相关胶质瘤组织中的表达与... 目的检测和分析组蛋白去甲基化酶含十字形结构域蛋白3(JMJD3)在胶质瘤及瘤旁脑组织中的表达。方法用组织芯片筛选出JMJD3表达阳性的胶质瘤组织,选取50例相关胶质瘤患者的石蜡标本,采用免疫组化SP法检测JMJD3在相关胶质瘤组织中的表达与定位以及与瘤旁组织中表达的差异,分析JMJD3与胶质瘤的相关性。结果通过组织芯片筛选,发现JMJD3在正常少突胶质细胞中有表达。在50例胶质瘤患者的石蜡标本中,15例标本肿瘤组织为阳性,35例瘤旁组织为阳性。结论与瘤旁脑组织相比,胶质瘤JMJD3的表达降低。 展开更多
关键词 胶质瘤 JMJD3 组蛋白去甲基化
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水稻组蛋白去甲基化酶基因OsJMJ719的克隆及表达分析 被引量:3
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作者 贾俊婷 陈兵先 +5 位作者 吴柔贤 戴彰言 钟明生 解昊 刘双幸 刘军 《广东农业科学》 CAS 2022年第11期152-161,共10页
【目的】克隆水稻组蛋白去甲基化酶OsJMJ719基因,分析其在非生物胁迫下的表达模式,为探究OsJMJ719在非生物胁迫响应中的功能提供理论依据。【方法】以水稻品种中花11为材料,克隆获得完整的OsJMJ719基因,对其进行生物信息学分析,构建OsJM... 【目的】克隆水稻组蛋白去甲基化酶OsJMJ719基因,分析其在非生物胁迫下的表达模式,为探究OsJMJ719在非生物胁迫响应中的功能提供理论依据。【方法】以水稻品种中花11为材料,克隆获得完整的OsJMJ719基因,对其进行生物信息学分析,构建OsJMJ719与绿色荧光蛋白(GFP)融合表达载体35S::OsJMJ719-GFP,利用烟草瞬时转化体系和水稻原生质体转化的方法来观察蛋白的亚细胞定位,并应用实时荧光定量PCR技术分析OsJMJ719基因在水稻不同组织中的表达情况以及在非生物胁迫处理下的表达模式。【结果】OsJMJ719基因(LOC_Os02g01940)编码区长度为2994 bp,编码997个氨基酸,OsJMJ719启动子区域含有10个植物激素响应元件和3个环境胁迫调控相关元件。系统进化分析结果显示,OsJMJ719与沼生菰、粗山羊草、小麦和大麦中的JMJ蛋白有较高的同源性。亚细胞定位结果显示,OsJMJ719蛋白定位于细胞核内。荧光定量结果显示,OsJMJ719在种子中表达量较高,且该基因的表达受ABA、NaCl和PEG6000的诱导,推测其在非生物胁迫过程中起重要作用。【结论】本研究展示了OsJMJ719基因的表达蛋白在进化树中的位置及其同源性物种,揭示了其表达蛋白定位于细胞中的具体位置、蛋白的结构及特征,以及该基因主要受到哪些外界因素调控,为进一步研究OsJMJ719基因的功能提供基础资料。 展开更多
关键词 水稻 OsJMJ719 组蛋白去甲基化 基因克隆 表达分析
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组蛋白赖氨酸甲基化在表观遗传调控中的作用 被引量:12
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作者 杜婷婷 黄秋花 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2007年第4期387-392,共6页
组蛋白赖氨酸的甲基化在表观遗传调控中起着关键作用。组蛋白H3的K4、K9、K27、K36、K79和H4的K20均可被甲基化。组蛋白H3第9位赖氨酸的甲基化与基因的失活相关连;组蛋白H3第4位赖氨酸和第36位赖氨酸的甲基化与基因的激活相关连;组蛋白H... 组蛋白赖氨酸的甲基化在表观遗传调控中起着关键作用。组蛋白H3的K4、K9、K27、K36、K79和H4的K20均可被甲基化。组蛋白H3第9位赖氨酸的甲基化与基因的失活相关连;组蛋白H3第4位赖氨酸和第36位赖氨酸的甲基化与基因的激活相关连;组蛋白H3第27位赖氨酸的甲基化与同源盒基因沉默、X染色体失活、基因印记等基因沉默现象有关;组蛋白H3第79位赖氨酸的甲基化与防止基因失活和DNA修复有关。与此同时,组蛋白的去甲基化也受到更为广泛的关注。 展开更多
关键词 组蛋白赖氨酸甲基转移酶 组蛋白赖氨酸甲基 组蛋白去甲基化
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拟南芥和水稻JMJC蛋白的研究进展 被引量:3
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作者 秦巧 张海文 黄荣峰 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第10期1-5,共5页
表观遗传学是研究在基因的DNA序列没有改变的情况下,但功能发生了可遗传性变化的遗传学分支学科。JMJC蛋白是表观遗传学调控中的一类关键酶,其功能是催化组蛋白赖氨酸的去甲基化,通过染色质重塑或基因组印迹等途径调控基因的表达,影响... 表观遗传学是研究在基因的DNA序列没有改变的情况下,但功能发生了可遗传性变化的遗传学分支学科。JMJC蛋白是表观遗传学调控中的一类关键酶,其功能是催化组蛋白赖氨酸的去甲基化,通过染色质重塑或基因组印迹等途径调控基因的表达,影响植物的生长发育。综述拟南芥和水稻JMJC蛋白家族的近期研究进展,以期探讨JMJC组蛋白去甲基化酶对拟南芥和水稻生长发育的影响及其调控的分子基础。 展开更多
关键词 表现遗传学 组蛋白去甲基化 水稻 拟南芥 JMJC蛋白
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KDM4A通过下调BMP9促进乳腺癌细胞MDA-MB-231的迁移和侵袭
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作者 陈远香 余涛 +3 位作者 杨诗雨 曾涛 魏兰 张彦 《中国癌症杂志》 CAS CSCD 北大核心 2024年第2期176-184,共9页
背景与目的:外源性骨形态发生蛋白9(bone morphogenetic protein 9,BMP9)能抑制人乳腺癌的恶性进展,但其在乳腺癌中常异常低表达。本研究拟探索表观遗传修饰的组蛋白赖氨酸特异性去甲基化酶4A(lysine specific demethylase 4A,KDM4A)在... 背景与目的:外源性骨形态发生蛋白9(bone morphogenetic protein 9,BMP9)能抑制人乳腺癌的恶性进展,但其在乳腺癌中常异常低表达。本研究拟探索表观遗传修饰的组蛋白赖氨酸特异性去甲基化酶4A(lysine specific demethylase 4A,KDM4A)在乳腺癌中的表达及作用,探究KDM4A与BMP9之间的关系及其可能的调节机制。方法:通过生物信息学方法分析KDM4A在乳腺癌中的表达及其与BMP9之间的关系,采用实时荧光定量聚合酶链反应(real-time fluorescence quantitative polymerase chain reaction,RTFQ-PCR)和蛋白质印迹法(Western blot)进行验证;采用染色质免疫沉淀(chromatin immunoprecipitation,ChIP)验证KDM4A对BMP9的调控作用,采用RNA稳定性实验及CHX蛋白稳定性实验验证KDM4A对BMP9表达的影响。采用RNA干扰技术及敲低BMP9的腺病毒构建转染KDM4A小干扰RNA(siKDM4A)或感染siBMP9腺病毒(Ad-siBMP9)的外源性重组MDA-MB-231细胞,采用划痕愈合实验、transwell实验分别检测细胞迁移及侵袭能力。结果:生物信息学分析结果表明,KDM4A在乳腺癌中的表达明显高于正常组织,KDM4A与BMP9在乳腺癌中的表达呈负相关关系。RTFQ-PCR及Western blot结果显示,KDM4A在不同乳腺癌细胞系中均高表达,敲低KDM4A可显著上调BMP9。ChIP实验证实,KDM4A可显著富集于BMP9基因启动子区域,降低其组蛋白赖氨酸36号位而不是4号位甲基化水平,从而沉默BMP9表达。RNA稳定性实验及CHX蛋白稳定性实验证实,KDM4A对BMP9的mRNA表达无明显影响,但可影响其蛋白降解。敲低KDM4A后,乳腺癌细胞MDA-MB-231的迁移及侵袭能力均受到明显抑制,而这种作用可被敲低BMP9所部分逆转。结论:KDM4A在乳腺癌组织及乳腺癌细胞MDA-MB-231中高表达,并可通过下调BMP9基因启动子区域组蛋白甲基化水平沉默其表达,以及在蛋白水平而不是mRNA水平影响BMP9稳定性,促进乳腺癌的迁移和侵袭。 展开更多
关键词 乳腺癌 赖氨酸特异性去甲基酶4A 组蛋白去甲基化 骨形态发生蛋白9
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膀胱癌组织JARID1B表达及其慢病毒表达载体的构建及功能研究 被引量:1
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作者 黄盛松 朱子奇 +2 位作者 孙莉 余玲 吴登龙 《上海交通大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2010年第6期693-697,共5页
目的研究膀胱癌组织及人膀胱癌细胞株T24中组蛋白去甲基化酶JARID1B的表达。构建JARID1B慢病毒表达载体并进行相关鉴定;观察经包装后慢病毒感染的T24中JARID1B表达情况。方法 Western blotting检测T24和6例膀胱癌及其癌旁组织JARID1B蛋... 目的研究膀胱癌组织及人膀胱癌细胞株T24中组蛋白去甲基化酶JARID1B的表达。构建JARID1B慢病毒表达载体并进行相关鉴定;观察经包装后慢病毒感染的T24中JARID1B表达情况。方法 Western blotting检测T24和6例膀胱癌及其癌旁组织JARID1B蛋白表达。利用真核表达质粒pcDNA3.1(-)-JARID1B,将JARID1B基因连接入含增强型绿色荧光蛋白(EGFP)的慢病毒表达载体pLv-EGFP中,构建重组慢病毒表达载体pLv-EGFP-JARID1B,将经酶切和DNA测序鉴定的重组质粒通过脂质体转染至T24,荧光显微镜观察GFP表达,RT-PCT检测JARID1B mRNA表达。包装慢病毒并感染T24,Western blotting检测目的蛋白JARID1B表达。结果膀胱癌及其癌旁组织JARID1B蛋白表达阳性率分别为16.7%和66.7%,且前者表达强度较弱;T24 JARID1B蛋白表达阴性。重组质粒经酶切和DNA测序证实目的基因插入正确;pLv-EGFP-JARID1B转染T24,荧光显微镜观察发现细胞表达GFP,RT-PCR显示T24表达JARID1B mRNA。包装慢病毒再感染T24后Western blotting分析显示,细胞表达目的蛋白JARID1B。结论膀胱癌组织JARID1B表达下调。成功构建JARID1B慢病毒表达载体,包装慢病毒感染T24后细胞过表达JARID1B。 展开更多
关键词 组蛋白去甲基化 JARID1B 慢病毒 基因表达 膀胱癌
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猪Utx慢病毒过表达/干扰载体的构建和病毒包装 被引量:1
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作者 闫海龙 陈晓旭 +3 位作者 朱晋生 张鹏飞 李爽 曾文先 《家畜生态学报》 北大核心 2017年第8期7-13,共7页
UTX(ubiquitously transcribed TPR gene on the X chromosome)作为H3K27me2/3的去甲基酶,能够调控动物发育过程,并有着重要的生物学作用。根据猪Utx预测序列,扩增Utx的CDS区全长序列。利用Utx的CDS区序列信息,构建pCD513B-CMV-Utx过表... UTX(ubiquitously transcribed TPR gene on the X chromosome)作为H3K27me2/3的去甲基酶,能够调控动物发育过程,并有着重要的生物学作用。根据猪Utx预测序列,扩增Utx的CDS区全长序列。利用Utx的CDS区序列信息,构建pCD513B-CMV-Utx过表达载体,设计并合成干扰shRNA和阴性对照寡核苷酸片段。其中干扰shRNA及阴性对照通过退火形成双链DNA,并插入pCD513B-U6慢病毒干扰载体。采用双酶切的方法和DNA测序鉴定重组载体。通过干扰和过表达载体质粒共转293T细胞,利用qRT-PCR筛选出最有效的干扰序列。重组质粒与其他3种慢病毒辅助包装质粒(pRsv-Rev、pGag-Pol、pVSV-G)共转染293T细胞包装慢病毒。结果表明,本试验成功扩增Utx基因的全长序列,且成功构建了Utx的过表达和干扰载体。qRT-PCR筛选出pCD513B-U6-Utx-shRNA-3干扰效率最显著,干扰效率为70%。本试验成功包装出慢病毒Lenti-Utx-shRNA、Lenti-NC和Lenti-Utx,测定的病毒滴度分别为6.1×107 TU/mL、4.8×107 TU/mL和3.9×105 TU/mL。此试验为进一步在猪源细胞中进行Utx基因的研究奠定基础。 展开更多
关键词 组蛋白去甲基化 Utx SHRNA 慢病毒 过表达载体 干扰载体
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脂代谢相关基因ABHD5在泛癌中的表达模式及其与预后和免疫浸润的相关性分析 被引量:4
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作者 陈宇涛 杨洋 +5 位作者 夏淦 许淼泓 曹霁昭 卢嘉茵 邹焱 杨霞 《中山大学学报(医学科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2022年第3期400-411,共12页
【目的】探究脂代谢相关基因ABHD5在肿瘤中的表达水平及其与临床分期、预后、免疫浸润的关系。【方法】在本研究中,使用GTEx、TCGA、TIMER2.0、CPTAC数据库及免疫组织化学法、免疫印迹法探究ABHD5在泛癌中的表达模式及其与不同临床分期... 【目的】探究脂代谢相关基因ABHD5在肿瘤中的表达水平及其与临床分期、预后、免疫浸润的关系。【方法】在本研究中,使用GTEx、TCGA、TIMER2.0、CPTAC数据库及免疫组织化学法、免疫印迹法探究ABHD5在泛癌中的表达模式及其与不同临床分期的相关性,使用Kaplan-Meier Plotter、Oncolnc、R2数据库探究ABHD5与预后的相关性,并使用TCGA、TIMER2.0数据库探究ABHD5与免疫细胞浸润之间的相关性,再用STRING、GEPIA数据库获取肿瘤中与ABHD5结合或共表达的基因,进行GO和KEGG富集分析。【结果】与正常组织相比,ABHD5在多种肿瘤中mRNA和蛋白表达水平下调,在少数肿瘤中升高。ABHD5高表达在8种肿瘤中与较好的预后相关,在2种肿瘤中与较差的预后相关,在9种肿瘤中与免疫细胞浸润水平呈正相关关系,并在泛癌中与中性粒细胞浸润及免疫检查点基因的表达具有显著正相关性。富集分析显示ABHD5与组蛋白去甲基化过程密切相关。【结论】ABHD5与中性粒细胞浸润、免疫检查点基因表达及组蛋白去甲基化过程相关,且与多种肿瘤的预后相关。 展开更多
关键词 ABHD5 泛癌 表达差异 中性粒细胞浸润 免疫检查点 组蛋白去甲基化
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