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武定鸡FOXO3基因的分子特征、功能分析及多组织差异表达
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作者 刘冰汇 高瑞霞 +2 位作者 范新阳 张永云 苗永旺 《饲料研究》 北大核心 2025年第12期92-98,共7页
试验旨在探究武定鸡叉头盒蛋白O3(FOXO3)基因的分子特征、功能分析及组织表达差异。采用RT-PCR技术克隆了FOXO3基因的完整编码序列(CDS),结合生物信息学工具分析其分子特征、结构和功能。检测并比较了不同日龄武定鸡心肌、肝脏、脾脏、... 试验旨在探究武定鸡叉头盒蛋白O3(FOXO3)基因的分子特征、功能分析及组织表达差异。采用RT-PCR技术克隆了FOXO3基因的完整编码序列(CDS),结合生物信息学工具分析其分子特征、结构和功能。检测并比较了不同日龄武定鸡心肌、肝脏、脾脏、肺、肾脏、腿肌和胸肌中FOXO3基因表达差异。结果显示,武定鸡FOXO3基因CDS长度为1983 bp,编码一个由660个氨基酸组成的亲水性非分泌蛋白,不含信号肽和跨膜结构域。该蛋白包含叉头结构域(FH_FOXO3)、KIX结构域(FOXO_KIX_bdg)和转录激活结构域(FOXO_TAD)。FOXO3主要作为RNA聚合酶Ⅱ近端启动子序列特异性DNA结合转录因子,参与FOXO信号通路、线粒体自噬、细胞衰老、蛋白质合成与降解等生物学过程。比较分析表明,鸡的FOXO3在结构和功能上与其他物种具有高度相似性,特别是雉科动物。FOXO3基因在武定鸡所检测的7个组织中均有表达,在50日龄时,武定鸡腿肌和胸肌的FOXO3表达量极显著高于其他日龄(P<0.01)。研究表明,FOXO3基因与武定鸡肌肉发育密切相关。 展开更多
关键词 武定鸡 FOXO3基因 克隆 生物信息学分析 组织差异表达
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抗大肠癌组织差异表达蛋白(SCAP47)抗体的制备及初步应用
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作者 王志红 曹建彪 李世荣 《科学技术与工程》 2004年第7期562-565,570,共5页
制备一种新的大肠癌组织差异表达蛋白质抗体(抗SCAP47),用于检测大肠癌相关肿瘤抗原SCAP47。采用本室制备的大肠癌组织差异表达蛋白质(SCAP47)免疫新西兰纯种兔,制备兔抗SCAP47抗体,用双向免疫扩散法和ELISA法测定抗体效价;并用ELISA法... 制备一种新的大肠癌组织差异表达蛋白质抗体(抗SCAP47),用于检测大肠癌相关肿瘤抗原SCAP47。采用本室制备的大肠癌组织差异表达蛋白质(SCAP47)免疫新西兰纯种兔,制备兔抗SCAP47抗体,用双向免疫扩散法和ELISA法测定抗体效价;并用ELISA法检测129例患者的胃肠道肿瘤和疾病及正常对照组织的可溶性SCAP47抗原。用SCAP47抗原免疫新西兰纯种兔,获得抗SCAP47抗体,经检测其最高效价:双向免疫扩散法为1∶32;ELISA法为1∶6400。129例患者的胃肠道肿瘤和疾病及正常对照组织可溶性SCAP47抗原ELISA法检测结果显示:诊断大肠癌的敏感性52.4%,特异性95.4%,阳性预示值84.6%,阴性预示值80.6%,似然比11.4,约登指数0.47。本实验制备的抗SCAP47抗体是一种新的大肠癌相关抗原SCAP47抗体。由于SCAP47不同于CEA、P^(27)、CCA等大肠癌肿瘤标志物,且在大肠癌中呈现高度表达,推测其可能是一种新的大肠癌相关抗原。因此,制备抗SCAP47抗体为用于多种指标联合检测早期大肠肿瘤提供了一种新的检测工具。 展开更多
关键词 大肠癌 抗大肠癌组织差异表达蛋白质抗体 大肠癌早期诊断
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槟榔江水牛FEZL基因分离鉴定、分子特征及泌乳期多组织差异表达分析 被引量:2
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作者 张广乐 吉丽 +3 位作者 王昌全 李成伟 保志鹏 苗永旺 《家畜生态学报》 北大核心 2020年第12期13-19,共7页
前脑锌指蛋白(FEZL)参与神经元发育的转录调控,已证实FEZL基因是奶牛乳房炎抗性相关基因之一。该研究采用RT-PCR直接测序技术对FEZL编码区进行了分离鉴定,进一步采用生物信息学和半定量RT-PCR技术对FEZL基因进行了功能和泌乳期多组织差... 前脑锌指蛋白(FEZL)参与神经元发育的转录调控,已证实FEZL基因是奶牛乳房炎抗性相关基因之一。该研究采用RT-PCR直接测序技术对FEZL编码区进行了分离鉴定,进一步采用生物信息学和半定量RT-PCR技术对FEZL基因进行了功能和泌乳期多组织差异表达分析。水牛FEZL基因编码区序列长1380 bp,编码459个氨基酸,分子量和等电点分别为16.34 kDa和6.80。水牛的FEZL是在核内发挥生物学功能的亲水性蛋白,含有一个COG5048保守的锌指结构域,无信号肽序列及跨膜结构域。水牛中FEZL蛋白的氨基乙酸重复区均为13G/13G型。多组织差异表达分析表明,FEZL基因在水牛大脑中表达水平最高,在心、脾、肺、肾、小脑、垂体组织中表达水平次之,在乳腺、小肠、肌肉、十二指肠组织中少量表达,在瘤胃组织中微量表达。在基于FEZL氨基酸序列构建的系统树上,槟榔江水牛与13G型普通牛聚在一起,支持率为99%。结果揭示水牛FEZL可能在细胞核内作为转录因子参与了基因的表达和机体免疫调控过程。 展开更多
关键词 槟榔江水牛 FEZL基因 生物信息学分析 基因功能 组织差异表达
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德宏奶水牛PRL基因克隆、分子特征及组织差异表达分析 被引量:1
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作者 谷丽娇 黄丽鸽 +2 位作者 盛丹 范新阳 苗永旺 《云南农业大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2022年第5期780-789,共10页
【目的】分离鉴定德宏奶水牛催乳素(prolactin,PRL)基因,并分析其分子特征和组织mRNA表达差异。【方法】采用PCR技术对德宏奶水牛PRL基因完整编码序列(CDS)进行分离鉴定,并利用生物信息学方法和半定量RT-PCR技术分别对水牛PRL进行分子... 【目的】分离鉴定德宏奶水牛催乳素(prolactin,PRL)基因,并分析其分子特征和组织mRNA表达差异。【方法】采用PCR技术对德宏奶水牛PRL基因完整编码序列(CDS)进行分离鉴定,并利用生物信息学方法和半定量RT-PCR技术分别对水牛PRL进行分子特征以及泌乳期和非泌乳期的组织差异表达分析。【结果】水牛PRL基因CDS长690 bp,编码229个氨基酸。水牛PRL蛋白为亲水性分泌蛋白,无跨膜结构域,含有1个信号肽序列(AA1~30)、5种功能修饰位点和1个prolactin_like结构域(AA32~229),且参与了JAK-STAT和PI3K-AKT-mTOR信号通路。PRL的转录区结构及其编码蛋白的结构和保守结构域在牛科物种中高度相似。水牛PRL基因在所检测的11个组织中均有表达,其中,在乳腺中的表达量呈泌乳期极显著高于非泌乳期(P<0.001)。【结论】水牛PRL与其他牛科物种的PRL功能一致。PRL参与JAK-STAT和PI3K-AKT-mTOR乳蛋白合成信号通路,且水牛PRL在乳腺和肺脏等多种组织中均发挥功能,推测其参与水牛乳蛋白和乳脂合成。 展开更多
关键词 德宏奶水牛 PRL基因 分子特征 组织差异表达 基因功能
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虹鳟HMGCR基因克隆及组织差异表达分析
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作者 陈路斯 王震 +4 位作者 张剑伟 张新党 王恒志 林贝贝 邓君明 《安徽农业科学》 CAS 2019年第18期95-99,共5页
[目的]阐述虹鳟β-羟-β-甲基戊二酰辅酶A还原酶(HMGCR)基因的mRNA序列,并比较其在虹鳟不同组织器官中的表达差异。[方法]通过PCR技术扩增虹鳟 HMGCR 基因的mRNA序列,采用荧光定量PCR技术,比较 HMGCR 基因在虹鳟肝脏、肠道、胃、心脏、... [目的]阐述虹鳟β-羟-β-甲基戊二酰辅酶A还原酶(HMGCR)基因的mRNA序列,并比较其在虹鳟不同组织器官中的表达差异。[方法]通过PCR技术扩增虹鳟 HMGCR 基因的mRNA序列,采用荧光定量PCR技术,比较 HMGCR 基因在虹鳟肝脏、肠道、胃、心脏、鳃、脾脏、肾脏、肌肉8种组织器官中的表达差异。[结果]虹鳟 HMGCR 基因的mRNA序列与大西洋鲑的同源性达97%,其蛋白序列与脊椎动物的同源性都在70%以上,表明该基因在物种进化过程中比较保守;该基因在虹鳟肝脏、肠道、胃、心脏、鳃、脾脏、肾脏、肌肉8种组织器官中均有表达;其中,该基因在肝脏和心脏中的表达量较高,而在胃中的表达量最低。[结论]该研究克隆出虹鳟胆固醇合成关键限速酶 HMGCR 的部分mRNA序列,分析了该基因在不同组织中的表达情况,为该酶的深入研究奠定基础。 展开更多
关键词 虹鳟 HMG-COA还原酶 基因克隆 组织差异表达 荧光定量PCR
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广西巴马小型猪PPARγ基因克隆及组织表达差异分析 被引量:5
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作者 申玉建 方程 +6 位作者 邱庆庆 司景磊 吴延军 杨祝良 杨秀荣 郭亚芬 蒋和生 《南方农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第10期1884-1890,共7页
【目的】克隆广西巴马小型猪过氧化物酶增殖物激活受体γ基因(PPARγ),并确定其在不同组织中的表达情况,为后续研究该基因在猪支原体肺炎(MPS)中的作用机制打下基础。【方法】利用RT-PCR克隆广西巴马小型猪PPARγ基因,并进行BLAST比对... 【目的】克隆广西巴马小型猪过氧化物酶增殖物激活受体γ基因(PPARγ),并确定其在不同组织中的表达情况,为后续研究该基因在猪支原体肺炎(MPS)中的作用机制打下基础。【方法】利用RT-PCR克隆广西巴马小型猪PPARγ基因,并进行BLAST比对分析及其推导蛋白的生物信息学分析;以实时荧光定量PCR检测PPARγ基因在18月龄广西巴马小型猪心脏、脾脏、肺脏、肾脏、大肠、小肠、肌肉和脂肪中的表达情况。【结果】广西巴马小型猪PPARγ基因开放阅读框序列1515 bp,编码504个氨基酸。广西巴马小型猪PPARγ基因推导氨基酸序列与Gen Bank已发表的猪PPARγ基因(FJ436399.1)推导氨基酸序列同源性最高,达100.0%;而与牛(NM_181024.2)、人类(NM_005037.5)、猕猴(NM_001032860.1)、鼠(NM_001308354.1)和鸿雁(KJ019822.1)的同源性分别为92.9%、91.8%、91.5%、90.5%和83.5%,表明PPARγ基因高度保守。PPARγ蛋白分子量为57380.91 Da,理论等电点(p I)为6.88,不稳定系数49.26,脂肪指数为88.21,亲水性平均水平为-0.293,为亲水性蛋白,其二级结构主要是α-螺旋,占总数的39.09%。PPARγ基因在广西巴马小型猪大肠组织中的表达量最高,极显著高于其他组织(P<0.01),而在肾脏、心脏和肌肉组织中的表达量极低。【结论】PPARγ基因在18月龄广西巴马小型猪的各组织中均有表达,但不同组织中的表达水平存在明显差异,可能与其在不同组织中的功能差异有关。 展开更多
关键词 广西巴马小型猪 PPARΓ基因 猪肺炎支原体 克隆 组织表达差异 炎症调控
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决明不同组织莽草酸激酶基因的表达模式与蒽醌含量分析 被引量:3
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作者 李洋洋 李卓彬 +4 位作者 俞继华 李娟娟 王万军 周嘉裕 廖海 《生物学杂志》 CAS CSCD 2016年第3期30-33,共4页
分析莽草酸激酶基因在决明(Cassia obtusifolia L.)不同组织中的表达模式,同时测定不同组织中总蒽醌的含量,为研究莽草酸激酶在决明蒽醌生物合成中的作用提供理论依据。提取决明种子、愈伤组织与成熟叶等10个不同组织的总RNA,反转录合成... 分析莽草酸激酶基因在决明(Cassia obtusifolia L.)不同组织中的表达模式,同时测定不同组织中总蒽醌的含量,为研究莽草酸激酶在决明蒽醌生物合成中的作用提供理论依据。提取决明种子、愈伤组织与成熟叶等10个不同组织的总RNA,反转录合成c DNA,采用荧光定量PCR检测莽草酸激酶基因在不同组织的表达情况。同时,采用超声波强化法提取决明不同组织的总蒽醌,通过分光光度法测定其含量。莽草酸激酶基因在决明的根、愈伤组织与子叶中的表达量较高,在种子、果荚与茎中表达量较低。决明的种子、果荚、花及根中蒽醌类化合物含量较高,而成熟叶和胚轴则不含。决明中蒽醌的生物合成涉及多个组织,其生物合成的早期阶段(包括莽草酸激酶催化的反应)主要发生在根与子叶等组织,形成的中间产物运输到种子等组织中,完成生物合成的后期阶段并积累蒽醌终产物,为合理利用决明不同药用部位提供理论依据。 展开更多
关键词 决明 莽草酸激酶 组织差异表达 总蒽醌 含量测定
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香鱼RBP基因的克隆、组织表达特征及其与盐度应激相关的表达分析 被引量:1
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作者 陈强 赵桐 +1 位作者 史雨红 陈炯 《生物学杂志》 CAS CSCD 2013年第3期1-4,23,共5页
血浆视黄醇结合蛋白(Retinol binding protein,RBP)是体内将视黄醇从肝脏转运至靶组织的特异载体蛋白。最近研究发现在盐度升高时肾脏RBP蛋白表达量下降。为了进一步研究香鱼RBP基因mRNA和蛋白表达与盐度应激相关性,从香鱼、肝脏cDNA文... 血浆视黄醇结合蛋白(Retinol binding protein,RBP)是体内将视黄醇从肝脏转运至靶组织的特异载体蛋白。最近研究发现在盐度升高时肾脏RBP蛋白表达量下降。为了进一步研究香鱼RBP基因mRNA和蛋白表达与盐度应激相关性,从香鱼、肝脏cDNA文库中获得RBP基因cDNA序列。香鱼RBP基因mRNA在肝脏中表达量最高,肾、肠、脑和鳃中表达次之。实时荧光定量RT-PCR结果显示,盐度升高时,RBP基因mRNA表达在不同组织中呈不同下降趋势,其中渗透压调节相关组织鳃、肾中,表达量下降最显著。Western blot实验证实,盐度升高时,香鱼血清RBP蛋白表达量也显著下降。揭示了RBP可能在香鱼盐度适应中有重要作用。 展开更多
关键词 视黄醇结合蛋白 克隆 组织差异表达 盐度 香鱼
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草鱼PAX7基因的克隆、序列分析及组织表达 被引量:2
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作者 甘甜 冷向军 +3 位作者 郭婷 胡静 魏静 李小勤 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第11期152-158,共7页
配对盒基因7(Paired box 7 gene,PAX7)在神经嵴发育及原肠胚形成、肌肉自主更新与再生中扮演着重要角色,对细胞更新、分化、凋亡等起着十分重要的调控作用。参照Gen Bank中斑马鱼、线鳍电鳗和虹鳟等物种PAX7序列的保守区域设计简并引物... 配对盒基因7(Paired box 7 gene,PAX7)在神经嵴发育及原肠胚形成、肌肉自主更新与再生中扮演着重要角色,对细胞更新、分化、凋亡等起着十分重要的调控作用。参照Gen Bank中斑马鱼、线鳍电鳗和虹鳟等物种PAX7序列的保守区域设计简并引物,进行反转录PCR扩增,获得草鱼PAX7基因的部分序列,长645 bp,编码214个氨基酸,包含编码128个氨基酸的PAX7蛋白配对框(PD)。氨基酸序列比对结果发现,草鱼PAX7基因与其他物种具有高度的相似性,与斑马鱼、线鳍电鳗、日本青鳉、金头鲷、虹鳟、大西洋鲑、北极嘉鱼、人、野牦牛、褐家鼠和小鼠的PAX7氨基酸序列同源性可达90%-97%;各物种PAX7部分氨基酸序列的系统进化树结果显示,草鱼与斑马鱼、日本青鳉、北极嘉鱼、大西洋鲑、虹鳟、线鳍电鳗和金头鲷聚为一大支,小鼠、褐家鼠,野牦牛与人类另聚一支,所得结果符合物种传统分类进化地位。运用实时荧光定量PCR检测草鱼PAX7基因在各组织中的差异表达,结果显示PAX7基因在肌肉中表达量最高;其次是前肠和皮肤,在心、脑、肾和肝中仅少量表达,所得结果与该基因的功能相一致。 展开更多
关键词 PAX7基因 草鱼 序列分析 组织差异表达
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cDNA芯片研发及其在肥胖患者脂肪基因差异表达研究中的应用 被引量:3
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作者 赵萸 骆天红 +8 位作者 王侃侃 张济 郑培烝 赵春军 刘优萍 郑升 顾燕云 李果 罗敏 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2004年第12期1067-1078,共12页
为了加快基因功能的研究 ,利用已有的来源于不同组织的cDNA克隆 ,并通过交换和购买补充了低丰度和染色体覆盖不完全的部分cDNA ,研制开发出具有相当代表性、覆盖较完全的高密度cDNA表达型基因芯片 ,每张芯片上含有 384个质控DNA和 12 6... 为了加快基因功能的研究 ,利用已有的来源于不同组织的cDNA克隆 ,并通过交换和购买补充了低丰度和染色体覆盖不完全的部分cDNA ,研制开发出具有相当代表性、覆盖较完全的高密度cDNA表达型基因芯片 ,每张芯片上含有 384个质控DNA和 12 6 30个cDNA探针 ,其中包括 12 5 0 8个Unigene和 12 2个表达序列标签 (EST) .利用这些芯片 ,对肥胖患者及正常人内脏脂肪组织基因表达谱进行了初步研究 ,并发现在肥胖患者内脏脂肪组织差异表达的基因 ,其中上调的有与凋亡相关的基因、与免疫有关的基因以及与能量代谢有关的基因等 ,而下调的主要是与脂肪酸及胆固醇合成有关的基因 。 展开更多
关键词 cDNA芯片 肥胖 脂肪组织 差异表达
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猪ifitm基因克隆及其序列和组织表达分析 被引量:3
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作者 张玉娟 赵婷 +5 位作者 徐朝 于琨 马倩 李超燕 郑文明 许君 《河南农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第3期359-363,388,共6页
为了研究ifitm基因的功能,本研究从猪肾PK15细胞中克隆了猪的3个ifitm c DNA序列,分析了猪ifitm1、ifitm2和ifitm3基因的染色体定位及其与其他物种基因序列的同源关系,并对不同ifitm在不同组织的表达进行分析和检测。结果显示,猪ifitm... 为了研究ifitm基因的功能,本研究从猪肾PK15细胞中克隆了猪的3个ifitm c DNA序列,分析了猪ifitm1、ifitm2和ifitm3基因的染色体定位及其与其他物种基因序列的同源关系,并对不同ifitm在不同组织的表达进行分析和检测。结果显示,猪ifitm和人、鼠ifitm具有相同的基因和蛋白结构,进化上与牛ifitm高度同源,ifitm1和ifitm3在脾、肾、心、肝等组织中大量表达,而ifitm2只在脾和肾中检测到表达,在其他组织中的表达量相对较小。猪ifitm基因的克隆、生物信息学及组织表达分析为进一步研究其在猪细胞中的功能奠定了基础。 展开更多
关键词 干扰素刺激基因 猪干扰素诱导的跨膜蛋白 基因克隆 基因序列 组织表达差异
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滇陆猪Nramp1基因多态性对其在组织中表达的影响 被引量:3
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作者 张斌 韩敏 +5 位作者 相德才 刘韶娜 沙茜 张桂生 赵智勇 赵彦光 《南方农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第1期202-208,共7页
【目的】明确自然抵抗相关巨噬细胞蛋白1基因(Nramp1)多态性对其在滇陆猪群体各组织中表达的影响,从分子遗传学角度阐述滇陆猪不同基因型个体对疫病免疫的遗传差异,为其抗病育种选育提供参考依据。【方法】采用PCR对27头滇陆猪Nramp1基... 【目的】明确自然抵抗相关巨噬细胞蛋白1基因(Nramp1)多态性对其在滇陆猪群体各组织中表达的影响,从分子遗传学角度阐述滇陆猪不同基因型个体对疫病免疫的遗传差异,为其抗病育种选育提供参考依据。【方法】采用PCR对27头滇陆猪Nramp1基因进行扩增,以DNASTAR 5.0进行序列比对分析及多态性(SNP)位点检测;同时利用实时荧光定量PCR检测Nramp1基因在滇陆猪各组织中的相对表达量,并运用SPSS 19.0分析Nramp1基因多态性对其在滇陆猪群体各组织中表达的影响。【结果】在滇陆猪Nramp1基因第5外显子、第5内含子和第6外显子上分别发现SNP1(T→C)、SNP2(A→G)和SNP3(G→A)等3个SNPs位点,都只存在2种基因型,且SNP1位点和SNP3位点在试验猪群体中属于低度多态[多态信息含量(PIC)/杂合度(He)<0.25)],SNP2位点属于中度多态(0.25肝脏>脾脏>心脏;此外,Nramp1基因在不同基因型滇陆猪群体中表现出的组织差异表达也不同,尤其是Nramp1基因在SNP2位点纯合群体肝脏中的相对表达量显著低于在杂合群体肝脏中的相对表达量,说明Nramp1基因多态性变异对其在滇陆猪组织中的表达有显著影响。【结论】Nramp1基因SNP位点变异能影响Nramp1基因在滇陆猪各组织中的表达变化,从而影响机体的免疫应答反应,其中SNP2位点可作为滇陆猪抗病育种的分子标记。 展开更多
关键词 滇陆猪 自然抵抗相关巨噬细胞蛋白1基因(Nramp1) 多态性位点(SNPs) 基因型 组织差异表达
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罗氏沼虾谷氨酸脱氢酶基因克隆及其在MrTV感染下的组织表达分析 被引量:1
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作者 郑群艳 潘晓艺 +3 位作者 沈锦玉 陈少波 徐洋 许婷 《浙江大学学报(农业与生命科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2017年第5期639-648,共10页
本研究利用c DNA末端快速扩增技术克隆获得罗氏沼虾(Macrobrachium rosenbergii)谷氨酸脱氢酶(glutamate dehydrogenase,GDH)基因(Mr GDH)的c DNA全长序列,对其进行生物信息学分析,并检测该基因在罗氏沼虾不同组织中的表达差异;同时,利... 本研究利用c DNA末端快速扩增技术克隆获得罗氏沼虾(Macrobrachium rosenbergii)谷氨酸脱氢酶(glutamate dehydrogenase,GDH)基因(Mr GDH)的c DNA全长序列,对其进行生物信息学分析,并检测该基因在罗氏沼虾不同组织中的表达差异;同时,利用罗氏沼虾太湖病毒(Macrobrachium rosenbergii Taihu virus,Mr TV)感染沼虾,研究感染前后沼虾鳃和肝胰腺Mr GDH的转录特征。结果显示,Mr GDH基因c DNA序列全长2 257 bp,拥有一个1 662 bp长的开放阅读框,合计编码氨基酸553个,合成的蛋白质分子质量约为61.37 k Da。Mr GDH氨基酸序列与中国明对虾(Fenneropenaeus chinensis)、凡纳滨对虾(Litopenaeus vannamei)的同源性较高,达到92%,其二级结构和三维结构与黑腹果蝇(Drosophila melanogaster)以及家蚕(Bombyx mori)高度相似,说明Mr GDH氨基酸序列比较保守。实时荧光定量聚合酶链式反应(quantitative real-time polymerase chain reaction,q RT-PCR)结果显示,Mr GDH基因在与机体运动和代谢有关的组织中表达量较高,其中在肌肉中表达量最高,而在血淋巴中最低。罗氏沼虾受Mr TV病毒感染48 h,肝胰腺和鳃中Mr GDH基因的表达在统计学上均极显著高于对照组(P<0.01);感染72 h,鳃中Mr GDH基因表达显著高于对照组(P<0.05),肝胰腺中Mr GDH基因表达极显著高于对照组(P<0.01):说明Mr TV感染胁迫可以刺激罗氏沼虾Mr GDH的表达上调。 展开更多
关键词 罗氏沼虾 罗氏沼虾太湖病毒 谷氨酸脱氢酶 基因克隆 组织表达差异
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武定鸡催乳素基因的分子特征及其与就巢性的关联
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作者 韩春柳 刀文彬 +3 位作者 黄丽鸽 范新阳 滕晓红 苗永旺 《云南农业大学学报(自然科学版)》 北大核心 2025年第4期18-29,共12页
【目的】探究武定鸡催乳素(prolactin,PRL)基因的分子特征、组织表达模式、启动子区24 bp插入/缺失多态性,并分析其与就巢性状的关联性。【方法】以武定鸡的垂体为研究材料,通过逆转录PCR技术克隆获得武定鸡PRL基因的编码序列(coding se... 【目的】探究武定鸡催乳素(prolactin,PRL)基因的分子特征、组织表达模式、启动子区24 bp插入/缺失多态性,并分析其与就巢性状的关联性。【方法】以武定鸡的垂体为研究材料,通过逆转录PCR技术克隆获得武定鸡PRL基因的编码序列(coding sequence,CDS),并采用生物信息学方法分析其编码产物的结构与功能。利用实时荧光定量PCR技术检测PRL基因在产蛋期和就巢期的武定鸡垂体和卵巢组织中的表达差异。以京粉2号蛋鸡为对照,检测武定鸡PRL基因启动子区24 bp插入/缺失多态性,并将检测结果与就巢性状进行关联分析。【结果】武定鸡PRL基因的CDS全长690 bp,编码229个氨基酸。PRL蛋白属于亲水性蛋白,含有1个保守的prolactin-like蛋白家族结构域,无跨膜结构,但存在信号肽,主要在细胞外发挥作用。GO与蛋白互作分析显示:PRL蛋白通过与催乳素受体结合,激活下游信号通路,参与细胞增殖等生物学过程,并可能通过抑制促性腺激素释放激素间接影响黄体生成素的分泌。组织表达分析表明:PRL基因在垂体和卵巢中均有表达,且在就巢期的表达量极显著高于产蛋期。多态性检测结果显示:武定鸡PRL基因启动子区24 bp插入/缺失的基因型频率分别为:Ⅱ型0.00%,ID型15.63%,DD型84.37%。关联分析结果显示:PRL基因启动子区24 bp插入/缺失多态性与武定鸡的就巢性状存在极显著关联,该变异可能通过影响PRL基因的表达水平进而影响武定鸡的就巢性。【结论】PRL基因在武定鸡垂体和卵巢中发挥重要作用,并可能通过启动子区24 bp插入/缺失多态性影响其就巢性。 展开更多
关键词 武定鸡 催乳素基因 分子特征 组织差异表达 启动子区多态性 就巢性
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半滑舌鳎HIRA基因部分cDNA序列克隆及表达分析
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作者 刘姗姗 张静 陈松林 《渔业科学进展》 CSCD 北大核心 2013年第6期24-30,共7页
为研究HIRA基因在半滑舌鳎胚胎发育中的作用及其组织差异表达,以半滑舌鳎为研究对象,采用同源克隆策略从其精巢中分离了长度为764bp的HIRA部分cDNA序列,该片段编码254个氨基酸,具有5个WD结构域。对氨基酸进行比较发现,半滑舌鳎HIRA与比... 为研究HIRA基因在半滑舌鳎胚胎发育中的作用及其组织差异表达,以半滑舌鳎为研究对象,采用同源克隆策略从其精巢中分离了长度为764bp的HIRA部分cDNA序列,该片段编码254个氨基酸,具有5个WD结构域。对氨基酸进行比较发现,半滑舌鳎HIRA与比较物种的氨基酸序列具有很高的同源性,与红鳍东方鲀亲缘关系最近。实时定量PCR分析发现,HIRA mRNA在多细胞期到原肠胚期的表达量较高,表明HIRA对胚胎发育起重要作用;HIRA在不同组织中表达差异显著,其中在性腺中表达最高,推测HIRA在维持性腺的功能方面有一定作用。 展开更多
关键词 HIRA 克隆 组织差异表达 胚胎发育 半滑舌鳎
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棉花植物同源结构域(PHD)转录因子在非生物胁迫中的表达分析 被引量:3
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作者 杨雷 谢宗铭 +1 位作者 司爱君 田琴 《新疆农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2013年第3期409-416,共8页
【目的】通过对陆地棉(Gossypium hirsutum L.)PHD(Plant homeodomain)转录因子在棉花不同组织和非生物胁迫条件下的表达分析,筛选棉花逆境胁迫应答基因。【方法】根据已报道的28个棉花GhPHD基因的EST序列合成了特异引物,使用半定量RT-... 【目的】通过对陆地棉(Gossypium hirsutum L.)PHD(Plant homeodomain)转录因子在棉花不同组织和非生物胁迫条件下的表达分析,筛选棉花逆境胁迫应答基因。【方法】根据已报道的28个棉花GhPHD基因的EST序列合成了特异引物,使用半定量RT-PCR方法检测GhPHD在棉花种子、根、茎、叶、纤维(15DPA)中的表达以及在干旱、高盐(150 mmol/L NaCl)、低温(4℃)非生物胁迫下的表达。【结果】棉花PHD转录因子在各组织中的表达存在差异,85.7%的基因在种子中表达,在纤维中表达的占35.7%。在干旱胁迫条件下GhPHD1、GhPHD6和GhPHD22呈上调表达,在高盐胁迫条件下GhPHD1、GhPHD16呈上调表达,低温胁迫激活GhPHD9表达,其它基因对三种非生物胁迫无明显应答。【结论】部分GhPHDs在陆地棉应答和适应非生物胁迫过程中可能发挥重要的作用。 展开更多
关键词 GhPHDs 非生物胁迫 组织差异表达 半定量RT-PCR
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长牡蛎(Crassostrea gigas)两个Dmrt家族基因的时空表达 被引量:9
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作者 张娜 黄雯 +3 位作者 许飞 李莉 张国范 郭希明 《海洋与湖沼》 CAS CSCD 北大核心 2015年第3期717-724,共8页
本文以长牡蛎27个幼虫发育阶段个体以及成体的5个组织织作为实验材料,采用实时荧光定量PCR技术对其Dmrt家族中的2个基因(CgDsx和CgDmrtA2)的表达模式以及在性别决定中的作用进行了研究。结果表明,长牡蛎CgDsx基因在胚胎发育初期有大量表... 本文以长牡蛎27个幼虫发育阶段个体以及成体的5个组织织作为实验材料,采用实时荧光定量PCR技术对其Dmrt家族中的2个基因(CgDsx和CgDmrtA2)的表达模式以及在性别决定中的作用进行了研究。结果表明,长牡蛎CgDsx基因在胚胎发育初期有大量表达,从囊胚期到担轮幼虫初期表达量最高,之后表达量开始降低,在D形幼虫后一直维持在极低的表达水平,此后仅在成体的雄性性腺中具有高度表达。由此可见,CgDsx可能也对早期胚胎发育起一定调控作用,同时参与了性别决定。CgDmrtA2在长牡蛎所有组织中均有表达,各组织间表达差异不显著,在D形幼虫至壳顶后期表达量较高,说明它参与了胚胎中后期的发育过程,可能与神经的形成相关,但是其具体功能还需要进一步研究。 展开更多
关键词 长牡蛎 Dmrt家族 幼虫发育 组织表达差异 性别决定
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杏花鸡白细胞介素10(IL--10)基因的克隆及其表达分析 被引量:2
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作者 郭利金 陈小兰 +2 位作者 曹森 梁少东 聂庆华 《中国家禽》 北大核心 2019年第4期5-11,共7页
为研究杏花鸡白细胞介素10(IL-10)基因在抵抗鸡球虫病中的作用,应用PCR、基因克隆和测序等技术获得杏花鸡完整的IL-10基因CDS序列,进行杏花鸡IL-10基因CDS序列和核苷酸序列与其他物种间的同源性分析,比较在QM-7成肌细胞、鸡肠上皮细胞IE... 为研究杏花鸡白细胞介素10(IL-10)基因在抵抗鸡球虫病中的作用,应用PCR、基因克隆和测序等技术获得杏花鸡完整的IL-10基因CDS序列,进行杏花鸡IL-10基因CDS序列和核苷酸序列与其他物种间的同源性分析,比较在QM-7成肌细胞、鸡肠上皮细胞IEC、鸡巨噬细胞HD11和鸡成纤维细胞DF-1中IL-10基因的表达差异以及在不同肠道组织中IL-10的表达量差异。结果表明,完整地扩增了IL-10基因的完整CDS序列,发现了3个同义突变(162A>G、180T>C和303C>T)。构建的发育树表明杏花鸡IL-10基因CDS序列和核苷酸序列与红色原鸡、鹌鹑、火鸡和珍珠鸡的同源性最高。IL-10在鸡肠上皮细胞的表达量最高,在盲肠扁桃体中表达量最高。球虫子孢子的入侵导致DF-1细胞和HD11细胞中的IL-10表达量升高。研究结果为IL-10基因在肠道免疫和抵抗球虫病的研究提供理论基础。 展开更多
关键词 IL-10 CDS全长 同源性 细胞表达差异 组织表达差异
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烟草HrBP的研究与应用 被引量:1
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作者 陈卓 于丹丹 +7 位作者 郭勤 刘家驹 王贞超 李向阳 毕亮 胡德禹 杨松 宋宝安 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第9期59-68,共10页
旨在进一步发掘HrBP在新农药创制和抗病品种选育等方面的价值,采用BLAST和Clustal X2软件对HrBP进行序列同源性分析,发现其序列较保守;采用PSIPRED Protein Structure Prediction在线服务器进行烟草HrBP二级结构预测,采用UCLDepartment ... 旨在进一步发掘HrBP在新农药创制和抗病品种选育等方面的价值,采用BLAST和Clustal X2软件对HrBP进行序列同源性分析,发现其序列较保守;采用PSIPRED Protein Structure Prediction在线服务器进行烟草HrBP二级结构预测,采用UCLDepartment of Computer Science进行HrBP跨膜结构预测,发现两种可能存在的跨膜方式;采用SWISS-MODEL、Phyre和CPH进行HrBP空间结构预测,发现以膜蛋白为模板进行模建的蛋白具有相似的空间结构;建立基于Real-time PCR的HrBP mRNA定量分析方法,其相关系数为0.999 6;通过ProtScale方法分析HrBP抗原指数,并获得序列特异性较高的多肽,采用9-氟甲氧羰基固相合成法制备多肽,并由此制备多克隆抗体,采用Indirect-ELISA和Western blotting测定其效价和特异性,表明多克隆抗体可特异识别烟草HrBP。采用DIBA和Western blotting试验研究多克隆抗体对常见植物的抗原识别特性,发现多克隆抗体对这些植物的HrBP均有一定识别能力。此外,采用Real-time PCR和Indirect-ELISA等方法进行烟草各组织部位HrBP的表达量的研究,发现HrBP在各组织部位存在差异表达。 展开更多
关键词 Harpin结合蛋白 生物信息学分析 基因克隆表达 多克隆抗体制备 烟草组织差异表达
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线纹海马Hippocampus erectus的tlr21基因结构及其对CpG-ODN的应答特征 被引量:1
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作者 张媛 秦耿 +1 位作者 张博 林强 《热带海洋学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第1期67-75,共9页
作为先天性免疫反应中重要的模式识别受体之一,TLR(toll-likereceptor)基因家族介导的先天性免疫是脊椎动物抵御病原微生物的重要防线。研究分析了线纹海马Hippocampus erectus tlr21基因的序列特征,并基于抗原注射实验探讨了海马tlr21... 作为先天性免疫反应中重要的模式识别受体之一,TLR(toll-likereceptor)基因家族介导的先天性免疫是脊椎动物抵御病原微生物的重要防线。研究分析了线纹海马Hippocampus erectus tlr21基因的序列特征,并基于抗原注射实验探讨了海马tlr21的免疫功能。线纹海马tlr21基因的开放阅读框长度为2946bp,编码981个氨基酸,预测其编码蛋白相对分子量为246.98kDa,理论等电点为4.78。tlr21编码蛋白主要包含1个信号肽和3个功能结构域:胞外区具有14个富含亮氨酸重复序列的结构域(LRR),跨膜区具有富含半胱氨酸的结构域,胞内区则具有TIR结构域。同源性比较和系统进化分析表明,线纹海马tlr21基因与虎尾海马Hippocampuscomestlr21基因的同源性最高,其次与斜带石斑鱼Epinephelus coioides、牙鲆Paralichthys olivaceus、大菱鲆Scophthalmus maximus和红鳍东方鲀Takifugu rubripes的tlr21基因聚为一枝。tlr21基因在线纹海马的脑、鳃、肝、肠、肾、性腺、肌肉和育儿袋各组织均有分布,肾脏中表达量最高。抗原注射实验结果发现,线纹海马Tlr21对不同类型CpG寡脱氧核苷酸(CpG-ODNs)的识别能力存在差异,其中,CpG-2007和CpG-HC4040对海马肾脏tlr21的mRNA表达量具有显著的促进作用(P<0.05)。研究表明,线纹海马Tlr21能够通过识别含CpG序列的DNA发挥免疫识别作用,研究结果将有助于系统认识海马免疫系统中TLR家族基因的功能特征,为建立海马病害防治策略提供理论依据。 展开更多
关键词 tlr21 基因结构 CPG-ODN 免疫 线纹海马 组织表达差异
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