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微量材料系列性基因表达分析技术的研究
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作者 郑芳 周新 +2 位作者 严明 叶水清 刘芳 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2002年第3期464-474,共11页
建立了微量材料 (1μgRNA)系列性基因表达分析技术 (minimalserialanalysisofgeneexpression ,miniSAGE) ,并用miniSAGE技术对冠心病 (coronaryarterydisease ,CAD)患者和正常人成纤维细胞的基因表达谱进行了分析 ,合成了两个高质量的S... 建立了微量材料 (1μgRNA)系列性基因表达分析技术 (minimalserialanalysisofgeneexpression ,miniSAGE) ,并用miniSAGE技术对冠心病 (coronaryarterydisease ,CAD)患者和正常人成纤维细胞的基因表达谱进行了分析 ,合成了两个高质量的SAGE库 ,比较了两个库的SAGE标签 ,为CAD发病机理的研究提供了大量表达异常基因的资料 .从而为后续分离与CAD发病相关的新基因打下了基础 .miniSAGE技术是一种有力的基因表达分析方法 ,可用于微量RNA (1μg)材料的基因表达分析 。 展开更多
关键词 微量材料 系列性基因表达分析技术 冠心病 成纤维细胞 多因素复杂疾病 流行病
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应用基因表达系列分析(SAGE)技术研究高温处理前后家蚕的基因表达差异 被引量:4
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作者 鲍忠赞 张彩霞 +6 位作者 徐世清 周前凯 魏广兵 王华 刘腾 金鑫 司马杨虎 《蚕业科学》 CAS CSCD 北大核心 2012年第3期456-467,共12页
高温对家蚕的生理和免疫能力有明显影响。为从分子水平上探究家蚕抗高温机制,应用基因表达系列分析(SAGE)技术获得家蚕5龄雌蚕高温处理前后中肠、丝腺和脂肪体组织的基因表达谱,构建高温组(34℃)和常温组(26℃)2个家蚕SAGE文库。2个家蚕... 高温对家蚕的生理和免疫能力有明显影响。为从分子水平上探究家蚕抗高温机制,应用基因表达系列分析(SAGE)技术获得家蚕5龄雌蚕高温处理前后中肠、丝腺和脂肪体组织的基因表达谱,构建高温组(34℃)和常温组(26℃)2个家蚕SAGE文库。2个家蚕SAGE文库分别包含3555107和3580976个原始标签,其中的标签种类分别为113684和131 296个,清洁标签的种类分别为45972和49467。比较2个文库清洁标签获得65 535种差异标签,共注释4249个基因,其中有1 062个差异表达的基因(P<0.05,错误检测率FDR≤0.001并且拷贝数的差异在2倍以上)。经GO分析发现2个文库中基因的分布极其相似,表明这些基因在不同的环境温度下有类似的生物学功能并参与类似的生理代谢过程。KEGG pathway分析显示有732个基因涉及176个KEGG路径,其中有40个为差异表达基因显著富集的路径(P<0.05),超过一半的路径与代谢、生物合成和信号传导有关。上述结果有助于对家蚕抗高温基因的鉴定以及探究基因调控的网络关系。 展开更多
关键词 家蚕 高温 基因表达系列分析技术 差异表达基因
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猴樟CbbHLH96基因启动子克隆与表达
3
作者 张丽华 韩浩章 +4 位作者 赵荣 李素华 王芳 张楠 王晓立 《东北林业大学学报》 北大核心 2025年第4期23-29,46,共8页
转录因子CbbHLH96参与猴樟响应碱胁迫过程,为弄清CbbHLH96参与植物耐碱胁迫的工作模式和信号传递途径,采用PCR技术克隆获得CbbHLH96基因5’端缺失型启动子片段,采用双荧光素酶报告基因技术分析外源茉莉酸甲酯、水杨酸和ABA处理后的启动... 转录因子CbbHLH96参与猴樟响应碱胁迫过程,为弄清CbbHLH96参与植物耐碱胁迫的工作模式和信号传递途径,采用PCR技术克隆获得CbbHLH96基因5’端缺失型启动子片段,采用双荧光素酶报告基因技术分析外源茉莉酸甲酯、水杨酸和ABA处理后的启动子片段表达活性。研究表明:获得的CbbHLH96基因启动子片段长为1976 bp;顺式作用元件分析发现CbbHLH96基因启动子片段中包含光响应调控元件、茉莉酸甲酯响应调控元件、ABA响应元件、乙烯响应元件、干旱诱导响应元件、赤霉素响应元件、防御和应激反应元件、水杨酸响应元件;采用双荧光素酶报告基因技术分析发现,bHLH96-Luc3、bHLH96-Luc4片段具备最高的启动子活性;BDGP在线软件的分析发现,CbbHLH96基因启动子序列的转录起始位点及可能的核心启动子区域应该在bHLH96-Luc4片段的1593~1643 bp位置;水杨酸和茉莉酸甲酯处理均抑制启动子片段bHLH96-Luc3、bHLH96-Luc4的表达活性,ABA处理则增加了启动子片段bHLH96-Luc3的表达活性,抑制了bHLH96-Luc4的表达活性。CbbHLH96基因启动子序列的活性区域在bHLH96-Luc3、bHLH96-Luc4片段,转录因子CbbHLH96功能受水杨酸和茉莉酸甲酯代谢的负向调控,受ABA代谢途径的正向调控。 展开更多
关键词 CbbHLH96基因启动子 表达分析 双荧光素酶报告基因技术 猴樟
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大豆脂肪酶SDP1生物信息学分析和基因编辑
4
作者 谷心如 刘新宇 +5 位作者 韩旭达 赵长江 费志宏 魏金鹏 徐晶宇 李佐同 《大豆科学》 北大核心 2025年第2期53-63,共11页
三酰甘油脂肪酶(Suger-dependent1,SDP1)是一种脂解酶,在植物发育过程中发挥重要作用。为发掘大豆SDP1基因的生物学功能,利用生物信息学分析方法对大豆GmSDP1基因的进化关系、保守基序和启动子区域的顺式作用元件等进行分析。利用基因... 三酰甘油脂肪酶(Suger-dependent1,SDP1)是一种脂解酶,在植物发育过程中发挥重要作用。为发掘大豆SDP1基因的生物学功能,利用生物信息学分析方法对大豆GmSDP1基因的进化关系、保守基序和启动子区域的顺式作用元件等进行分析。利用基因编辑技术创制大豆gmsdp1-1^(CR)突变体,对其编辑事件、含油量以及脂肪酸含量进行分析。结果表明:4个大豆GmSDP 1基因与双子叶植物亲缘关系较近,保守结构域和蛋白二级结构高度相似,启动子区域含有抗逆境胁迫以及激素相关的调控元件。对GmSDP1在不同组织部位的表达量分析发现,GmSDP1在子叶、叶片和花等部位表达较高。运用CRISPR-Cas9基因编辑技术创制大豆Willimas 82品种的gmsdp1-1^(CR)突变体,设计1条靶向目的基因GmSDP1-1的特异靶点,构建pGES201-GmSDP1-1敲除载体。毛根转化试验的阳性大豆毛状根编辑效率达到56.52%。大豆稳定转化的T_(1)代基因编辑阳性植株编辑效率为1.5%,选取gmsdp1-1^(CR)突变体做进一步表型分析表明,油酸含量极显著降低,亚麻酸含量极显著升高。研究结果为深入研究GmSDP1基因的功能和调控机制提供了参考依据。 展开更多
关键词 大豆 SDP1基因 CRISPR/Cas9技术 生物信息学分析 组织特异性表达
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基因表达聚类分析技术的现状与发展 被引量:7
5
作者 杨春梅 万柏坤 高晓峰 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2003年第6期974-979,共6页
随着多个生物基因组测序的完成、DNA芯片技术的广泛应用 ,基因表达数据分析已成为后基因组时代的研究热点 .聚类分析能将功能相关的基因按表达谱的相似程度归纳成类 ,有助于对未知功能的基因进行研究 ,是目前基因表达分析研究的主要计... 随着多个生物基因组测序的完成、DNA芯片技术的广泛应用 ,基因表达数据分析已成为后基因组时代的研究热点 .聚类分析能将功能相关的基因按表达谱的相似程度归纳成类 ,有助于对未知功能的基因进行研究 ,是目前基因表达分析研究的主要计算技术之一 .已有多种聚类分析算法用于基因表达数据分析 ,各种算法因其着眼点、原理等方面的差异 ,而各有其优缺点 .如何对各种聚类算法的有效性进行分析、并开发新型的。 展开更多
关键词 基因表达 聚类分析技术 DNA芯片 非监督聚类 监督聚类 基于模型聚类
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基因表达系列分析的研究进展及应用 被引量:4
6
作者 黎双飞 朱作言 《高技术通讯》 EI CAS CSCD 2003年第5期100-104,共5页
简要概括了SAGE的基本原理和实验程序,侧重对该技术的程序修改和完善以及该方法最近在筛选候选新基因方面的应用进行综述报道。
关键词 基因表达系列分析 SAGE 基本原理 实验程序 标签库 基因测序技术
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基因差异表达分析技术在寄生虫学中的应用研究进展
7
作者 夏艳勋 李国清 +2 位作者 苑纯秀 赵传璧 林矫矫 《动物医学进展》 CSCD 北大核心 2009年第3期63-68,共6页
生物体表现出的各种生物学特性,主要是由于基因在不同细胞间及不同生长阶段的选择性差异表达引起的。这些基因的差异表达按特定的时间和空间顺序有序地进行着,决定了生命活动的多样性。而基因差异表达研究的各种分析技术正是在此基础上... 生物体表现出的各种生物学特性,主要是由于基因在不同细胞间及不同生长阶段的选择性差异表达引起的。这些基因的差异表达按特定的时间和空间顺序有序地进行着,决定了生命活动的多样性。而基因差异表达研究的各种分析技术正是在此基础上发展起来并在兽医寄生虫学中得到广泛应用。以mR-NA差异显示、抑制消减杂交法和DNA微列阵分析等为代表的基因差异表达分析技术,在基因表达谱的分析及基因生物学功能研究,阐述寄生虫的发病机制,寄生虫疾病诊断,筛选合适的药物靶标和疫苗候选分子有效地防病治病方面发挥着重要作用。 展开更多
关键词 基因差异表达分析技术 寄生虫学 应用
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几种基因差异表达分析技术在原核生物差异基因筛选中的应用 被引量:5
8
作者 胡烨 李影 钱爱东 《动物医学进展》 CSCD 北大核心 2010年第2期103-106,共4页
原核生物差异基因筛选方面,目前代表性差异分析方法(RDA)、消减抑制杂交法(SSH)、限制性酶切片段差异显示(RFDD-PCR)以及cDNA-AFLP等技术经改良后,可用于原核生物差异基因筛选的研究。论文对这几种方法的优缺点及应用进行了介绍。
关键词 基因差异表达分析技术 差异基因筛选 原核生物
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用改进的DDRT-PCR技术进行小麦穗和花药特异表达基因的分析
9
作者 刘秀珍 孙兰珍 +2 位作者 刘保申 宋伟 刘青 《山东农业大学学报(自然科学版)》 CSCD 北大核心 2005年第1期113-118,共6页
本研究采用改进的DDRT-PCR技术对小麦穗和花药发育的不同阶段进行了差别表达分析,以找出穗和花药的特异表达基因。用30个随机单引物进行RAPD扩增,从展示的近1000条带中找出14条差别cDNA片段,然后以cDNA为探针进行反向Northern-Blot,结... 本研究采用改进的DDRT-PCR技术对小麦穗和花药发育的不同阶段进行了差别表达分析,以找出穗和花药的特异表达基因。用30个随机单引物进行RAPD扩增,从展示的近1000条带中找出14条差别cDNA片段,然后以cDNA为探针进行反向Northern-Blot,结果得到一条在花药内特异表达增强的阳性片段,命名为S1176450。 展开更多
关键词 DDRT-PCR技术 特异表达基因 小麦穗 RAPD扩增 CDNA片段 表达分析 花药发育 单引物 450 差别
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基因芯片技术分析斑蝥素对肝癌细胞细胞毒作用的分子机制 被引量:18
10
作者 胡和平 张俊平 +4 位作者 应康 肖振宇 吴红梅 毛裕民 吴孟超 《第二军医大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2003年第6期645-649,共5页
目的 :研究抗癌药斑蝥素对肝癌细胞细胞毒作用的分子机制。方法 :应用基因芯片技术检测 12 .5 μmol/ L 斑蝥素作用于肝癌 QGY770 3细胞 2 4 h后基因表达谱的变化。结果 :斑蝥素抑制细胞表达参与细胞周期进程基因 (如 p 2 7、ref - 1、D... 目的 :研究抗癌药斑蝥素对肝癌细胞细胞毒作用的分子机制。方法 :应用基因芯片技术检测 12 .5 μmol/ L 斑蝥素作用于肝癌 QGY770 3细胞 2 4 h后基因表达谱的变化。结果 :斑蝥素抑制细胞表达参与细胞周期进程基因 (如 p 2 7、ref - 1、DN Apolymerase delta、X RCC9等 )、能量代谢基因 (如 malate dehydrogenase、ADP/ ATP translocase等 )、致瘤活性基因 (如 c- myc、tre等 )以及肿瘤特异表达基因 (如 bladder cancer related protein等 )。相反 ,斑蝥素促进了多种细胞生长抑制基因 (如 BCRA2、BTG2、dual- specificity protein phosphatase等 )以及凋亡相关基因 (如 ATL - derived PMA- responsive peptide等 )的表达。 结论 :斑蝥素改变调控细胞周期进程、细胞增殖。 展开更多
关键词 肝癌 QGY7703细胞 斑蝥素 基因芯片技术分析 基因表达
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多发性骨髓瘤的基因表达谱分析 被引量:12
11
作者 石奕武 胡维新 +3 位作者 汤立军 田菁燕 易伟峰 谭达人 《湖南医科大学学报》 CSCD 北大核心 2003年第3期201-205,共5页
目的 :研究MM患者与正常人骨髓基因的差异表达。方法 :应用cDNA芯片技术对 1 0例初诊多发性骨髓 (MM)患者和 1 0名正常骨髓的单个核细胞的mRNA进行检测。结果 :在 2 0 4 8条基因中共发现差异表达基因5 6 6条。在MM中 2 37条表达增加 ,3... 目的 :研究MM患者与正常人骨髓基因的差异表达。方法 :应用cDNA芯片技术对 1 0例初诊多发性骨髓 (MM)患者和 1 0名正常骨髓的单个核细胞的mRNA进行检测。结果 :在 2 0 4 8条基因中共发现差异表达基因5 6 6条。在MM中 2 37条表达增加 ,32 9条表达降低。结论 :MM的发生发展涉及多基因的改变 。 展开更多
关键词 多发性骨髓瘤 基因表达 分析 cDNA芯片技术 骨髓基因
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兔植入前移核胚中发育相关基因的差异表达分析 被引量:11
12
作者 李文雍 齐冰 +3 位作者 王玉阁 郁卫东 杜淼 陈清轩 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2003年第5期813-818,共6页
与早期胚胎发育相关的一些重要基因异常表达致使克隆胚细胞核的再程序化过程受阻,是导致动物克隆失败的重要原因.为了分离鉴定再程序化相关基因,我们改进了mRNA差异显示技术,成功地建立了单胚差示技术体系.以不同发育时期的兔克隆胚(M... 与早期胚胎发育相关的一些重要基因异常表达致使克隆胚细胞核的再程序化过程受阻,是导致动物克隆失败的重要原因.为了分离鉴定再程序化相关基因,我们改进了mRNA差异显示技术,成功地建立了单胚差示技术体系.以不同发育时期的兔克隆胚(MⅡ卵、2细胞、4细胞、8~ 16细胞克隆胚胎)为材料进行单胚差示,分离了 80个差异片段.经反向RNA印迹验证、亚克隆、序列分析及NCBIGenBank数据库检索,结果表明:A0 2 8片段与CstF3基因有 93%的同源性,在早期胚胎发育过程中的表达有阶段特异性,该基因在兔克隆胚的早期发育过程中起重要作用.RNA印迹显示:该基因在所检测的组织中,只在卵巢中有表达. 展开更多
关键词 差异表达分析 发育相关基因 兔克隆胚胎 再程序化 单胚差异显示技术
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龙血树DCDPK2基因的克隆及表达分析 被引量:4
13
作者 张浩 蔡文伟 +3 位作者 张树珍 杨学 刘琳 杨本鹏 《热带作物学报》 CSCD 2010年第7期1130-1136,共7页
通过RACE技术克隆龙血树CDPK基因的全长cDNA,并对基因序列进行相关分析与基因表达分析。结果表明:该基因全长为1 810 bp,编码区长度为1 587 bp,编码528个氨基酸,其氨基酸序列具有CDPK基因编码氨基酸的所有典型结构特征;经序列比对发现... 通过RACE技术克隆龙血树CDPK基因的全长cDNA,并对基因序列进行相关分析与基因表达分析。结果表明:该基因全长为1 810 bp,编码区长度为1 587 bp,编码528个氨基酸,其氨基酸序列具有CDPK基因编码氨基酸的所有典型结构特征;经序列比对发现其核酸序列与玉米CDPK基因的同源性高达81%,氨基酸序列与其它植物中的CDPK氨基酸序列同源性很高。该基因命名为DCDPK2基因。对未经血竭诱导和诱导的龙血树组培苗进行半定量RT-PCR表达分析,发现在添加了诱导物的组培苗中DCDPK2基因的表达显著增强。 展开更多
关键词 龙血树 CDPK基因 克隆 RACE技术 表达分析
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表达基因分析方法 被引量:4
14
作者 许杨 阮琼芳 李燕萍 《食品与生物技术学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第1期122-126,共5页
了解不同细胞或同类细胞在不同发育阶段,不同生理状态下的基因表达状况,可以为研究生命活动过程提供重要的信息。表达基因分析方法不断完善,包括抑制消减杂交技术,基因表达序列分析,基因表达谱芯片,电子克隆等。作者主要介绍了这些技术... 了解不同细胞或同类细胞在不同发育阶段,不同生理状态下的基因表达状况,可以为研究生命活动过程提供重要的信息。表达基因分析方法不断完善,包括抑制消减杂交技术,基因表达序列分析,基因表达谱芯片,电子克隆等。作者主要介绍了这些技术的原理、方法、特点及其应用情况。 展开更多
关键词 表达基因 抑制消减杂交技术 基因表达序列分析 基因表达谱芯片 电子克隆
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表达谱基因芯片技术及其在兽医学上的应用 被引量:4
15
作者 邹丰才 吴绍强 +1 位作者 李明伟 朱兴全 《中国人兽共患病杂志》 CAS CSCD 北大核心 2005年第4期346-349,共4页
关键词 基因芯片技术 表达 20世纪90年代 功能基因组学研究 人类基因组计划 医学 基因时代 1989年 基因组测序 基因表达 研究重点 平行检测 国际专利 功能分析 高通量
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萼脊兰AGAMOUS(AG)基因的克隆与表达分析 被引量:6
16
作者 蒋素华 邓祖丽颖 +3 位作者 郝平安 王默霏 袁秀云 崔波 《河南农业大学学报》 CSCD 北大核心 2017年第6期801-807,共7页
通过对萼脊兰AGAMOUS(AG)基因进行结构、功能分析、克隆和AG基因的表达调控等方面的探究,发现,萼脊兰AG的氨基酸序列属于植物特有的MIKC型MADS-box的C类基因,该基因c DNA全长1 002 bp,包含一个702 bp的开放阅读框,该基因命名为AG(登录号... 通过对萼脊兰AGAMOUS(AG)基因进行结构、功能分析、克隆和AG基因的表达调控等方面的探究,发现,萼脊兰AG的氨基酸序列属于植物特有的MIKC型MADS-box的C类基因,该基因c DNA全长1 002 bp,包含一个702 bp的开放阅读框,该基因命名为AG(登录号KY744276),共编码233个氨基酸。蛋白序列比对和进化树分析表明,AG蛋白与蝴蝶兰蛋白一致性最高,进化距离最近。二级结构分析表明,该蛋白分子属于亲水性蛋白,其中α螺旋占48.93%,延伸链占11.59%,不规则卷曲占39.48%。实时荧光定量PCR(qRT-PCR)分析表明,AG基因在花蕾和蕊柱中表达量很高,说明AG基因的表达具有组织特异性,在ABCDE模型中属于C类基因的特征非常明显,控制着雄蕊和雌蕊的发育。 展开更多
关键词 萼脊兰 AG基因克隆 RACE技术 实时荧光定量PCR 表达分析
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SVMs在基因表达谱数据分析中的应用 被引量:2
17
作者 吴骋 王志勇 贺佳 《中国卫生统计》 CSCD 北大核心 2006年第1期79-82,共4页
关键词 基因表达 数据分析 基因表达水平 基因表达数据 组织样本 微阵列技术 支持向量机 制作工艺 方法应用 数据处理
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蚜虫诱导的小麦基因cDNA的克隆及其表达特性分析 被引量:7
18
作者 刘晓东 张增艳 +1 位作者 辛志勇 刘艳 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第4期523-525,共3页
关键词 基因CDNA 小麦 特性分析 蚜虫 表达 克隆 诱导 大麦黄矮病毒 抗虫基因工程 防治虫害 化学杀虫剂 基因技术 基因作物 环境污染 农药残留 人类健康 育种周期 长期选择 推广应用 抗虫作物 研究内容 害虫 病毒病 抗药性
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花生种皮抗黄曲霉差异基因表达初步分析(英文) 被引量:4
19
作者 单世华 严海燕 +1 位作者 李春娟 万书波 《花生学报》 2005年第4期21-24,共4页
黄曲霉不同抗性花生种皮存在显著差异,本试验选择经鉴定的高抗黄曲霉花生种质J11与高感种质金花1012为研究材料,以金花1012为对照利用基因芯片技术开展了抗病差异基因表达分析研究。试验共使用61078杂交探针组,结果表明,共有417个差异... 黄曲霉不同抗性花生种皮存在显著差异,本试验选择经鉴定的高抗黄曲霉花生种质J11与高感种质金花1012为研究材料,以金花1012为对照利用基因芯片技术开展了抗病差异基因表达分析研究。试验共使用61078杂交探针组,结果表明,共有417个差异基因表达量上升,650个差异基因表达量下降。另外,获得抗Phytophathora Sojae真菌病害表达量上升差异基因4个,表达量下降差异基因49个。获得抗Heterodera Glycines Ichinohe真菌病害表达量上升差异基因4个,表达量下降差异基因25个。 展开更多
关键词 花生 差异基因表达分析 基因芯片技术
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差异表达基因克隆技术的研究进展 被引量:6
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作者 徐德全 熊远著 《中国畜牧兽医》 CAS 2004年第3期31-34,共4页
随着基因组计划的顺利实施 ,大量的生物信息被解析 ,分离并克隆差异表达基因已成为生命科学研究的热点。近些年来 ,国内外学者发展了多种分析差异表达基因的技术。现就目前主要使用的一些技术作一综述。
关键词 差异表达基因 克隆 消减杂交法 MRNA差异显示技术 代表性序列差别分析 抑制消减杂交法 基因表达系列分析 基因鉴定集成法 CDNA微阵列
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