竞争性内源性RNA在牙周炎中的作用及机制的研究进展

1

作者 范兴丽 潘乐 +2 位作者 赵家园 项秋猛 陈启林 《国际口腔医学杂志》 北大核心 2025年第3期317-322,共6页

竞争性内源性RNA (ceRNA)可以通过转录调节炎症相关介质的反应进而调控牙周炎的进展。ceRNA,包括长链非编码RNA、环状RNA、信使RNA等,可与微小RNA结合,构成ceRNA网络,调控下游靶基因的表达,影响牙周炎的发生、发展。本文总结了已经通过... 竞争性内源性RNA (ceRNA)可以通过转录调节炎症相关介质的反应进而调控牙周炎的进展。ceRNA,包括长链非编码RNA、环状RNA、信使RNA等,可与微小RNA结合,构成ceRNA网络,调控下游靶基因的表达,影响牙周炎的发生、发展。本文总结了已经通过实验验证的ceRNA在调控牙周炎发生发展中的作用及机制,对包括抑制和促进牙周炎发生发展两个方面的研究进展进行综述,为未来牙周炎的研究提供新思路。 展开更多

关键词 竞争性内源性RNA 牙周炎 微小RNA 长链非编码RNA 环状RNA

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长链非编码核糖核酸及其介导的竞争内源性核糖核酸与卒中发病机制研究进展 被引量：2

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作者 陆小燕 范存秀 +2 位作者 杜冰滢 刘振宇 毕晓莹 《中国卒中杂志》 2019年第1期63-68,共6页

长链非编码核糖核酸(long noncoding RNA,lncRNA)是长度大于200碱基的非编码RNA,为竞争内源性RNA(competing endogenous RNA,ceRNA)的关键组成分子,具有重要的生物学功能。近期研究表明,lncRNA及其介导的ceRNA与卒中的发病、炎症反应及... 长链非编码核糖核酸(long noncoding RNA,lncRNA)是长度大于200碱基的非编码RNA,为竞争内源性RNA(competing endogenous RNA,ceRNA)的关键组成分子,具有重要的生物学功能。近期研究表明,lncRNA及其介导的ceRNA与卒中的发病、炎症反应及血管生成密切相关,为卒中的诊治提供了新的方向。本文对lncRNA及其介导的ceRNA与卒中关系的研究进展进行综述。 展开更多

关键词 卒中 长链非编码核糖核酸 竞争内源性核糖核酸

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肺缺血-再灌注核心基因介导的竞争性内源性RNA网络的构建 被引量：1

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作者 李晓凤 唐明政 +4 位作者 刘禧禧 宋子晴 张国欣 杨开银 张凌云 《器官移植》 CSCD 北大核心 2024年第1期70-81,共12页

目的分析肺缺血-再灌注损伤发生的核心基因并构建竞争性内源性RNA(ceRNA)网络。方法从基因表达综合(GEO)数据库下载GSE145989的原始数据当作训练集,GSE172222和GSE9634数据集作为验证集,并鉴定差异表达基因(DEG)。进行基因本体(GO)、京... 目的分析肺缺血-再灌注损伤发生的核心基因并构建竞争性内源性RNA(ceRNA)网络。方法从基因表达综合(GEO)数据库下载GSE145989的原始数据当作训练集,GSE172222和GSE9634数据集作为验证集,并鉴定差异表达基因(DEG)。进行基因本体(GO)、京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析。构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络,筛选核心基因并分析核心基因的诊断价值、免疫细胞的免疫浸润水平。构建并验证ceRNA网络。分析基于ceRNA网络的靶向药物。结果共检测到179个DEG,其中61个下调基因,118个上调基因。GO分析结果显示,DEG与细胞迁移、分化和调节等生物学过程有关;与内吞囊泡膜、浆膜和膜筏等细胞成分有关;与趋化因子受体、G蛋白偶联受体、免疫受体活性和抗原结合等分子功能有关。KEGG分析显示DEG参与肿瘤坏死因子(TNF)、Wnt、白细胞介素(IL)-17和核因子(NF)-κB等信号通路。PPI网络提示CD8A、IL2RG、STAT1、CD3G和SYK是肺缺血-再灌注损伤的核心基因。ceRNA网络提示miR-146a-3p、miR-28-5p和miR-593-3p与CD3G的表达相关;miR-149-3p、miR-342-5p、miR-873-5p和miR-491-5p与IL2RG表达相关;miR-194-3p、miR-512-3p、miR-377-3p和miR-590-3p与SYK表达相关;miR-590-3p和miR-875-3p与CD8A表达相关;miR-143-5p、miR-1231、miR-590-3p、miR-875-3p与STAT1表达相关。CD3G有13种靶向药物,IL2RG有4种靶向药物,SYK有28种靶向药物,lncRNA MUC2有3种靶向药物,未发现CD8A、STAT1和其他ceRNA网络基因的靶向药物。结论CD8A、IL2RG、STAT1、CD3G和SYK是肺缺血-再灌注损伤的核心基因,对核心基因进行研究分析可能有助于肺缺血-再灌注损伤的诊断,并提供新的研究思路和治疗靶点。 展开更多

关键词 肺移植 缺血-再灌注损伤 核心基因 竞争性内源性RNA(ceRNA) 微小RNA 长链非编码RNA 环状RNA 信号通路

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基于基因芯片技术构建与非小细胞肺癌患者预后相关的内源性竞争性RNA网络 被引量：3

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作者 李新洋 连相尧 +6 位作者 白璐 员文静 赵如涵 钮淋 刘镭 王阳 朱翠敏 《医学研究生学报》 CAS 北大核心 2022年第3期283-290,共8页

目的高通量测序技术的发展使得大量miRNA被发现。文中构建非小细胞肺癌(NSCLC)预后相关的内源性竞争性RNA(ceRNA)调控网络,探讨NSCLC中分子调控机制。方法通过miRNA芯片技术筛选NSCLC组织及其配对癌旁组织中差异表达的miRNA(DEmiRNA),应... 目的高通量测序技术的发展使得大量miRNA被发现。文中构建非小细胞肺癌(NSCLC)预后相关的内源性竞争性RNA(ceRNA)调控网络,探讨NSCLC中分子调控机制。方法通过miRNA芯片技术筛选NSCLC组织及其配对癌旁组织中差异表达的miRNA(DEmiRNA),应用targetScan、miRtarBase、miRDB、miRCode和lncBase数据库预测DEmiRNA的靶mRNA和与之作用的lncRNA,整合miRNA-mRNA和miRNA-lncRNA作用对,构建NSCLC的ceRNA网络。进一步,将靶mRNA基因导入DAVID数据库进行基因本体论(GO)注释和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,同时导入STRING数据库构建蛋白-蛋白相互作用(PPI)网络并筛选关键模块和基因。应用Kaplan-Meier Plotter在线数据库对关键基因进行生存分析,基于生存分析结果进一步提取与NSCLC患者预后相关的亚ceRNA网络。结果筛选在NSCLC组织及其配对癌旁组织中差异最显著的20个miRNA,根据数据库预测结果成功构建了包含有3个miRNA、130个mRNA和6个lncRNA的ceRNA网络。GO和KEGG分析结果显示共富集出有意义的861个生物过程、66个细胞组分、107个分子功能、32个KEGG条目。通过分析PPI网络结果,得到了3个关键模块和11个关键基因,其中8个关键基因与NSCLC患者预后有关。基于这8个基因,提取了包含有2个miRNA、5个lncRNA和8个mRNA预后相关的亚ceRNA网络。结论成功构建NSCLC预后相关的ceRNA网络,为NSCLC的机制研究提供了新的参考依据。 展开更多

关键词 基因芯片 非小细胞肺癌 预后 内源性竞争性RNA

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长链非编码RNA及竞争性内源RNA网络在银屑病中调控机制的研究进展

5

作者 何月 段妍 +1 位作者 李睿亚 莎娜 《临床皮肤科杂志》 CAS CSCD 北大核心 2024年第6期382-384,共3页

银屑病是一种慢性炎症性皮肤病,发病机制复杂。该文通过综述长链非编码RNA(Long non-coding RNA,lncRNA)及竞争性内源RNA(Competitive endogenous RNA,ceRNA)网络在银屑病中调控机制的进展,寻找银屑病的发病机制及相关调控通路,对控制... 银屑病是一种慢性炎症性皮肤病,发病机制复杂。该文通过综述长链非编码RNA(Long non-coding RNA,lncRNA)及竞争性内源RNA(Competitive endogenous RNA,ceRNA)网络在银屑病中调控机制的进展,寻找银屑病的发病机制及相关调控通路,对控制病情和改善预后具有重要意义,为进一步阐明该疾病的遗传学发病机制、基因诊断以及下一步的基因治疗等奠定理论基础。 展开更多

关键词 银屑病 长链非编码RNA 竞争性内源性RNA

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竞争性内源RNA在肝癌中的研究进展 被引量：6

6

作者 张德元 曹金玉 刘繁荣 《临床与实验病理学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2016年第10期1145-1148,共4页

肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)是常见的消化系统恶性肿瘤之一,肝癌发生、发展机制不清是制约肝癌诊疗的重要原因。近年研究发现,RNA在肝癌的调控机制中发挥重要作用,某些长链非编码RNA(lncRNA)、环状RNA(circRNA)、假基因以及... 肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)是常见的消化系统恶性肿瘤之一,肝癌发生、发展机制不清是制约肝癌诊疗的重要原因。近年研究发现,RNA在肝癌的调控机制中发挥重要作用,某些长链非编码RNA(lncRNA)、环状RNA(circRNA)、假基因以及mRNA拥有microRNA应答元件(microRNA response element,MRE),通过竞争性结合microRNA,发挥相互调控作用。这类RNA称为竞争性内源性RNA(competing endogenous RNA,ceRNA)。该文将按照ceRNA分类,对其在肝癌发生、发展机制中的生物学功能及临床意义进行系统综述。 展开更多

关键词 竞争性内源性RNA MICRORNA lncRNA circRNA MRNA 文献综述

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子宫颈癌淋巴结转移相关环状RNA的表达谱分析

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作者 李瑞 郭依琳 +4 位作者 王璐 许星月 卢富华 李梦琦 赵虎 《实用妇产科杂志》 北大核心 2025年第3期223-229,共7页

目的:筛选子宫颈癌淋巴结转移相关环状RNA(circRNA)的差异表达谱,分析其功能和作用机制。方法:收集40例子宫颈癌患者[有淋巴结转移20例(转移组)、无淋巴结转移20例(未转移组)]的癌组织标本。在两组中随机各选取3例标本,采用高通量测序... 目的:筛选子宫颈癌淋巴结转移相关环状RNA(circRNA)的差异表达谱,分析其功能和作用机制。方法:收集40例子宫颈癌患者[有淋巴结转移20例(转移组)、无淋巴结转移20例(未转移组)]的癌组织标本。在两组中随机各选取3例标本,采用高通量测序技术分析circRNA表达谱,并对差异表达circRNA来源的母基因进行京都基因与基因组百科全书(KEGG)和基因本体(GO)富集分析。采用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)技术验证差异倍数较高的4个显著上调的circRNA,行数据库预测构建竞争性内源性RNA(ceRNA)网络。对差异表达最显著的circRNA分析其与临床病理特征的关系,行子宫颈癌细胞系转染circRNA小干扰RNA(siRNA),分为circ RNA敲低组和阴性对照(si-NC)组,并采用活细胞计数(CCK-8)方法检测子宫颈癌SiHa细胞和HeLa细胞的增殖情况。结果:①共检测到2039个差异表达circRNA,差异表达circRNA来源的母基因主要富集在泛素介导的蛋白质水解、MAPK信号通路、内吞作用、细胞凋亡等信号通路。②筛选出转移组中差异倍数较高的4个显著上调的circRNA,即hsa_circ_0067492、hsa_circ_0004904、hsa_circ_0085465、hsa_circ_0007718。qRT-PCR技术验证显示,hsa_circ_0004904、hsa_circ_0085465、hsa_circ_0007718在淋巴结转移的子宫颈癌组织中均高表达(P<0.01)。hsa_circ_0004904可与hsa-miR-3916等微小RNA(miRNA)相互作用、hsa_circ_0085465可与hsa-miR-4659b-3p等miRNA相互作用、hsa_circ_0007718可与hsa-miR-127-5p等miRNA相互作用。③hsa_circ_0004904的高表达与低表达在有无淋巴结转移和脉管癌栓中差异有统计学意义(P<0.05)。与si-NC组相比,沉默hsa_circ_0004904转染24、48、72 h后,SiHa细胞和HeLa细胞的增殖能力均明显降低(P<0.05)。结论:伴有淋巴结转移的子宫颈癌中存在差异表达的circRNA,沉默后可显著抑制子宫颈癌细胞的增殖,其可能参与了淋巴结转移的发生发展,有望成为淋巴结转移的特异性生物标志物。 展开更多

关键词 子宫颈癌 环状RNA 淋巴结转移 竞争性内源性RNA 非编码RNA

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circRNA-miRNA-mRNA调控网络的挖掘以筛选缺血性脑卒中的潜在治疗药物 被引量：1

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作者 吴玉敏 王钟兴 于瑜 《中山大学学报(医学科学版)》 北大核心 2025年第3期456-465,共10页

【目的】挖掘缺血性脑卒中潜在的circRNA-miRNA-mRNA调控网络及其相应的治疗药物。【方法】利用GEO数据库发布的数据并选择研究大脑中动脉栓塞(MCAO)小鼠RNA表达水平的3个数据集GSE115697、GSE51586和GSE137482,使用R中的Limma包来筛选... 【目的】挖掘缺血性脑卒中潜在的circRNA-miRNA-mRNA调控网络及其相应的治疗药物。【方法】利用GEO数据库发布的数据并选择研究大脑中动脉栓塞(MCAO)小鼠RNA表达水平的3个数据集GSE115697、GSE51586和GSE137482,使用R中的Limma包来筛选差异表达的mRNA(DEmRNA)、DEcircRNA和DEmiRNA。采用MiRWalk、StarBase等多种生物信息学方法结合的综合策略来挖掘与脑卒中相关的circRNA-miRNA-mRNA网络,由Cytoscape软件完成核心子网络的筛选和可视化输出。通过基因本体(GO)富集分析及京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路分析研究ceRNA网络的功能,以富集超过10个基因且假发现率(FDR)<0.05的通路认为具有统计学意义。最后使用药物基因组学数据库connectivity map(CMap)筛选潜在的脑卒中治疗药物,并对野生型小鼠构建MCAO模型验证药物治疗效果。【结果】共筛选得出1249个DEmRNA、294个DEmiRNA和70个DEcircRNA,并发现3个circRNA-miRNA-mRNA调控网络可能与缺血性脑卒中密切相关。根据上述结果筛选得出Austricine、Metyrapone和Desoxypeganine这3种最有可能逆转由脑卒中相关ceRNA网络引起的改变的药物,并以Metyrapone为例验证所筛选药物对缺血性脑卒中确实可以改善术后第一(P=0.0014)、二天(P=0.0161)的神经功能损伤和减少脑梗死体积(P=0.0049),发挥脑保护作用。【结论】本研究从circRNA-miRNA-mRNA网络视角为缺血性脑卒中的发病机制提供了新的见解,本文预测得出的3种药物为缺血性脑卒中的治疗方法提供了新的线索。 展开更多

关键词 缺血性脑卒中 circRNA MRNA 竞争性内源性RNA CMap数据库

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基于高通量测序研究清润方改善2型糖尿病大鼠肝脏胰岛素抵抗的作用机制 被引量：5

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作者 卜祥伟 郝晓晖 +6 位作者 张美珍 王泽 王皓朔 史佩玉 张润云 倪青 林兰 《世界中医药》 CAS 北大核心 2024年第11期1599-1607,1613,共10页

目的:基于高通量转录组测序(RNA-seq)研究清润方改善2型糖尿病(T2DM)大鼠肝脏胰岛素抵抗的作用机制。方法:采用高脂饲料喂养联合链脲佐菌素腹腔注射构建T2DM大鼠模型,将成模大鼠采用随机数字表随机分为模型组,二甲双胍组(150 mg/kg),清... 目的:基于高通量转录组测序(RNA-seq)研究清润方改善2型糖尿病(T2DM)大鼠肝脏胰岛素抵抗的作用机制。方法:采用高脂饲料喂养联合链脲佐菌素腹腔注射构建T2DM大鼠模型,将成模大鼠采用随机数字表随机分为模型组,二甲双胍组(150 mg/kg),清润方大(11.2 g/kg)、中(5.6 g/kg)、小(2.8 g/kg)剂量组,另设正常组,灌胃干预8周。观察空腹血糖(FBG)、胰岛素抵抗指数(IRI)、胰岛素敏感指数(ISI)变化,利用RNA-seq结合生物信息学分析筛选差异表达的长链非编码RNA(lncRNA)、微RNA(miRNA)、信使RNA(mRNA),对差异基因进行基因本体(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析及qPCR验证,构建竞争性内源性RNA(ceRNA)调控网络。结果:与模型组比较,干预第6、8周清润方大剂量组FBG明显降低(P<0.05);第8周清润方各剂量组IRI降低(P<0.01),清润方大、小剂量组ISI升高(P<0.01,P<0.05)。通过差异表达筛选得到85个关键mRNA、12个miRNA、37个lncRNA,通过蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络得到12个核心基因,并构建lncRNA-miRNA-mRNA网络。KEGG富集分析显示,差异基因主要涉及Janus激酶/信号转导及转录活化因子(JAK-STAT)、过氧化物酶体增殖物激活受体(PPAR)、氨基酸代谢、脂质代谢等通路。结论:清润方可能通过lncRNA-miRNA-mRNA网络调控CYP2、Acer2等基因,并影响Lpin1、Insig1等基因和PPAR、JAK-STAT、氨基酸代谢、脂质代谢等信号通路,改善2型糖尿病大鼠肝脏胰岛素抵抗。 展开更多

关键词 清润方 2型糖尿病 胰岛素抵抗 转录组测序 竞争性内源性RNA网络 差异基因 信号通路 作用机制

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环状RNA Circ HIPK3在非小细胞肺癌中的研究进展 被引量：1

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作者 王宇恒 陈亮 《中国肺癌杂志》 CAS CSCD 北大核心 2024年第8期629-636,共8页

肺癌是全世界发病率和致死率最高的恶性肿瘤之一,虽然针对肺癌的靶向、免疫治疗等新兴治疗手段取得了显著进展,但如何治愈肺癌仍是一项备受瞩目的话题。其中环状RNA(circular RNA,circRNA)作为最近发现的一类具有共价闭合结构的环状RNA... 肺癌是全世界发病率和致死率最高的恶性肿瘤之一,虽然针对肺癌的靶向、免疫治疗等新兴治疗手段取得了显著进展,但如何治愈肺癌仍是一项备受瞩目的话题。其中环状RNA(circular RNA,circRNA)作为最近发现的一类具有共价闭合结构的环状RNA,具有结构稳定、序列保守及疾病特异性表达等特点。当前医学前沿揭示了circRNA的失调与多种癌症的发展过程有关。其中,研究热点之一的环状RNA HIPK3(circular RNA HIPK3,circ HIPK3)是一种致癌基因,主要起源于基因HIPK3的第二个外显子。越来越多的证据表明circ HIPK3参与了非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)等多种恶性肿瘤的发展,并且circ HIPK3的异常表达与NSCLC的疾病机制、诊断、治疗以及预后密切相关。本文旨在对circ HIPK3在NSCLC中的最新研究进展进行综述,以推动肺癌的精准诊疗。 展开更多

关键词 环状RNA HIPK3 肺肿瘤 竞争性内源性RNA 生物标志物

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环状RNA:潜在的新型miRNA活性调控分子 被引量：7

11

作者 张燕燕 任国诚 张晾 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第11期1158-1163,共6页

环状RNA(circular RNA,circRNA)是近年来RNA领域最新的研究热点.它是一类由特殊的选择性剪切产生且在真核细胞中广泛表达的环形内源性RNA分子.研究发现,circRNA富含microRNA(miRNA)结合位点,可以发挥竞争性内源RNA作用,作为miRNA"... 环状RNA(circular RNA,circRNA)是近年来RNA领域最新的研究热点.它是一类由特殊的选择性剪切产生且在真核细胞中广泛表达的环形内源性RNA分子.研究发现,circRNA富含microRNA(miRNA)结合位点,可以发挥竞争性内源RNA作用,作为miRNA"海绵"来解除对其靶基因的抑制效应.近年来,circRNA作为一种新型调控分子调控miRNA功能的发挥,受到众多研究者的青睐.本文综述circRNA的产生机制,及其调控miRNA的最新研究进展与研究方法等. 展开更多

关键词 环状RNA 竞争性内源性RNA 微RNA

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消化系统恶性肿瘤中ceRNA的研究进展 被引量：1

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作者 曹金玉 张德元 刘繁荣 《临床与实验病理学杂志》 CSCD 北大核心 2017年第11期1238-1240,共3页

消化系统肿瘤是最常见的恶性肿瘤之一,其发生、发展机制尚不清楚是影响肿瘤治疗的重要原因。研究表明RNA在消化系统肿瘤的转录后调控机制中发挥重要的作用,lncRNA、mRNA、假基因转录物、环状RNA等各类RNA分子,仅需相同的miRNA应答元件,... 消化系统肿瘤是最常见的恶性肿瘤之一,其发生、发展机制尚不清楚是影响肿瘤治疗的重要原因。研究表明RNA在消化系统肿瘤的转录后调控机制中发挥重要的作用,lncRNA、mRNA、假基因转录物、环状RNA等各类RNA分子,仅需相同的miRNA应答元件,就可竞争性结合相同的miRNA调控靶基因,从而调节各自的表达。这些RNA分子互为竞争性内源性RNA(competing endogenous RNA,ceRNA)。该文着重探讨ceRNA假说及其在消化系统恶性肿瘤中的研究进展,并展望其研究前景。 展开更多

关键词 食管肿瘤 胃肿瘤 肝细胞肿瘤 结肠直肠肿瘤 竞争性内源性RNA ceRNA假说 文献综述

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长链非编码RNA通过ceRNA在乳腺癌中的调控机制 被引量：4

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作者 翟博雅 龚予希 +2 位作者 杨野梵 张响 张智弘 《临床与实验病理学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2021年第3期309-312,共4页

长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)是一种长度大于200 nt的不具有编码蛋白质功能的RNA。lncRNA在多种肿瘤中存在差异性表达,通过转录调控、转录后调控等方式影响肿瘤的增殖、侵袭、转移、耐药等。多项研究表明,lncRNA可通过竞... 长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)是一种长度大于200 nt的不具有编码蛋白质功能的RNA。lncRNA在多种肿瘤中存在差异性表达,通过转录调控、转录后调控等方式影响肿瘤的增殖、侵袭、转移、耐药等。多项研究表明,lncRNA可通过竞争性内源性RNA(competing endogenous RNA,ceRNA)机制与miRNA相互作用,并影响其它RNA、蛋白的表达,影响疾病进程;提示lncRNA可能是一种肿瘤标志物和潜在的治疗靶点。该文现就lncRNA通过ceRNA调控乳腺癌的研究进展进行综述。 展开更多

关键词 乳腺肿瘤 长链非编码RNA 竞争性内源性RNA 文献综述

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长链非编码RNA LINC01106在胶质瘤组织中低表达并抑制细胞增殖与侵袭

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作者 张寅 胡大玲 +3 位作者 贾俊丽 唐恬 郭金凤 刘宏毅 《南京医科大学学报（自然科学版）》 CAS CSCD 北大核心 2020年第10期1465-1471,共7页

目的:分析长链非编码RNA LINC01106在胶质瘤组织以及细胞中的表达水平,探索LINC01106抑制胶质瘤细胞增殖与侵袭能力的潜在作用机制。方法:通过肿瘤基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)数据库分析LINC01106在胶质瘤中的表达;采用... 目的:分析长链非编码RNA LINC01106在胶质瘤组织以及细胞中的表达水平,探索LINC01106抑制胶质瘤细胞增殖与侵袭能力的潜在作用机制。方法:通过肿瘤基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)数据库分析LINC01106在胶质瘤中的表达;采用实时荧光定量PCR(q RT-PCR)法检测胶质瘤细胞系中LINC01106的表达水平。通过转染LINC01106小干扰RNA或者过表达质粒抑制或增高胶质瘤细胞U87中LINC01106的表达水平后,采用CCK-8实验以及EdU实验检测细胞增殖能力,Transwell实验检测细胞侵袭能力。通过生物信息学以及体外细胞实验对LINC01106潜在的分子机制进行分析。结果:分析TCGA数据库发现LINC01106在胶质瘤肿瘤组织的表达显著降低,同时qRT-PCR结果显示,LINC01106在胶质瘤细胞系(LN229、LN308、U87以及U251)中的表达均显著低于正常对照细胞HEB;体外细胞实验表明,在U87细胞中抑制LINC01106的表达可以显著提高细胞的增殖与侵袭能力,而过表达LINC01106的效果相反。通过生物信息学分析和双荧光素酶报告基因实验发现LINC01106能够结合miR-3167并抑制其表达,而miR-3167可能靶向CBFA2T3,这可能是LINC01106胶质瘤进展的潜在机制。结论:LINC01106在胶质瘤组织中低表达,抑制LINC01106可促进胶质瘤细胞的增殖与侵袭能力,LINC01106可能通过与CBFA2T3竞争性结合miR-3167在胶质瘤中发挥其抑癌基因的作用。 展开更多

关键词 LINC01106 竞争性内源性RNA 胶质瘤 增殖 侵袭

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环状RNA hsa_circ_0087893可能通过ceRNA机制参与早产儿脑室内出血的发生和发展

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作者 陈茹娟 武伟 邱银萍 《南方医科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第5期749-754,共6页

目的筛选发生脑室内出血(IVH)早产儿血清中差异表达的环状RNA(circRNA),并探讨circRNA参与早产儿IVH发生、发展的ceRNA机制。方法研究对象为2019年1月~2020年1月在我院新生儿科住院,胎龄28~34周的早产儿共50例。采用circRNA芯片技术筛选... 目的筛选发生脑室内出血(IVH)早产儿血清中差异表达的环状RNA(circRNA),并探讨circRNA参与早产儿IVH发生、发展的ceRNA机制。方法研究对象为2019年1月~2020年1月在我院新生儿科住院,胎龄28~34周的早产儿共50例。采用circRNA芯片技术筛选在IVH早产儿血清中显著差异表达的circRNA,通过基因本体论(GO)和信号通路分析circRNA的功能,荧光定量PCR验证hsa_circ_0087893在两组的实际表达水平,构建hsa_circ_0087893的circRNA-miRNA-mRNA共表达网络。结果共有121条circRNA在早产IVH组显著差异表达,包括62条上调表达circRNA及59条下调表达circRNA。GO分析及信号通路分析表明,差异circRNA参与多种生物功能及信号通路,包括细胞增殖、活化及死亡、DNA损伤及修复、维生素A代谢、鞘磷脂代谢及细胞黏附等。hsa_circ_0087893在早产儿IVH组中表达显著下调(P<0.05),41个miRNA与hsa_circ_0087893共表达,包括miR-214-3p、miR-761、miR-183-5p等。15条mRNA与hsa_circ_0087893共表达,包括AKR1B1、KRT34、PPP2CB、HPRT1等。结论hsa_circ_0087893可能通过ceRNA机制调控早产儿IVH发生、发展。 展开更多

关键词 早产儿 脑室内出血 芯片 竞争性内源性RNA 机制

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围产期奶山羊注射5-HTP后血液ceRNA网络构建分析

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作者 胡凯召 赵海瑛 +3 位作者 陈顺新 杜玮 高慧杰 郑惠玲 《家畜生态学报》 北大核心 2021年第2期19-24,共6页

处于围产期的奶山羊由于血液中钙离子迅速降低极易引发低血钙症,5-羟色胺(5-hydorxytyrptamine,5-HT)可以调节生物体内钙代谢,但具体调节机制尚不明确。该研究通过注射5-羟色氨酸(5-HTP,5-hydroxytryptophan)来增加围产期奶山羊体内的5... 处于围产期的奶山羊由于血液中钙离子迅速降低极易引发低血钙症,5-羟色胺(5-hydorxytyrptamine,5-HT)可以调节生物体内钙代谢,但具体调节机制尚不明确。该研究通过注射5-羟色氨酸(5-HTP,5-hydroxytryptophan)来增加围产期奶山羊体内的5-HT浓度,采集血液提取RNA后,采用全转录组测序技术筛选鉴定差异表达mRNA、microRNA、LncRNA和CircRNA。通过Metascape对差异表达的基因进行富集分析,发现这些差异表达基因主要参与钙代谢、脂质代谢、免疫反应、细胞凋亡等过程。通过预测转录本之间的结合情况构建LncRNA/CircRNA-microRNA-mRNA的竞争内源性RNA(Competing Endogenous RNA,ceRNA)调控网络,并对网络中的基因进行富集分析发现3个与钙代谢相关的基因,分别是Toll样受体9(Toll Like Receptor 9,TLR9)、缝隙连接蛋白γ2(Gap Junction Protein Gamma 2,GJC2)和连接素1(Junctophilin1,JPH1),LncRNA MSTRG.1354.2可与TLR9竞争性地结合microRNA NC.030825.1_6027,进而调控TLR9的表达,MSTRG.56601.1和MSTRG.101405.3都可以与GJC2、JPH1竞争性地结合NC.030814.1_19917,进而调控GJC2和JPH1的表达。该研究结果为5-HT调控山羊钙代谢提供了一种全新的分子机制。 展开更多

关键词 围产期 全转录组 竞争性内源性RNA 低血钙症

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