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第10号染色体一个祖先信息标记区域的发现及鉴定: 1; 作者李瓅曾昭书 +1 位作者周艳梅董子明《郑州大学学报（医学版）》 CAS 北大核心 2010年第5期743-746,共4页; 目的:应用第10号染色体的HapMap单核苷酸多态性(SNP)基因分型数据及人群聚类分析技术区分人亚群。方法:从HapMap数据库(r23)获取北京汉族人、欧裔和非裔3个人群225个样本的第10号染色体共4660余万个SNPs分型结果,提取在3个群体间等位基... 展开更多; 关键词祖先信息标记单核苷酸多态性固定系数 HAPMAP; 在线阅读下载PDF 职称材料

基于AIM-InDels位点复合扩增体系检测乌鲁木齐蒙古族祖先信息被引量：1: 2; 作者沈春梅解通 +5 位作者梅书燕方雅婷兰琼刘艳芳朱波峰邰发道《法医学杂志》 CAS CSCD 2019年第5期545-552,共8页; 目的基于课题组前期构建的用于祖先信息推断的39个AIM-InDels位点复合扩增检测体系,探索乌鲁木齐地区蒙古族的遗传背景和遗传结构。方法采集乌鲁木齐市蒙古族145名健康无关个体血样进行基因分型,以千人基因组计划数据库中三个洲际(东亚... 展开更多; 关键词法医遗传学遗传学群体遗传结构祖先信息标记插入/缺失蒙古族乌鲁木齐; 在线阅读下载PDF 职称材料

SeqType■P52人类祖先识别SNP检测试剂盒性能验证: 3; 作者王颖希马原 +1 位作者李甫焦章平《法医学杂志》 CAS CSCD 2021年第3期382-387,395,共7页; 目的评估基于高通量测序平台研发的SeqType■P52人类祖先识别SNP检测试剂盒对中国5个民族的区分效能。方法基于高通量测序平台检测SeqType■P52人类祖先识别SNP检测试剂盒,对来自中国汉族、藏族、蒙古族、维吾尔族、彝族共计350份样本... 展开更多; 关键词法医遗传学单核苷酸多态性高通量测序祖先信息标记; 在线阅读下载PDF 职称材料

27重SNP复合扩增技术推断犯罪嫌疑人族群1例被引量：3: 4; 作者马咪刘京 +8 位作者江丽赵蕾王博超虎建华张涛周浩冯保强刘海渤李彩霞《法医学杂志》 CAS CSCD 2018年第6期730-732,共3页; 1案例1.1简要案情某年1月,新疆生产建设兵团某师辖区内发生一起故意杀人案,嫌疑人作案手段凶残,死者被锐器刺穿颈动脉和气管,导致失血性休克死亡。; 关键词法医遗传学多态性单核苷酸祖先信息标记复合扩增种族推断; 在线阅读下载PDF 职称材料

随机SNP在全基因组关联研究人群分层分析中的应用: 5; 作者曹宗富马传香 +1 位作者王雷蔡斌《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2010年第9期921-928,共8页; 在复杂疾病的全基因组关联研究中,人群分层现象会增加结果的假阳性率,因此考虑人群遗传结构、控制人群分层是很有必要的。而在人群分层研究中,使用随机选择的SNP的效果还有待进一步探讨。文章利用HapMap Phase2人群中无关个体的Affymetr... 展开更多; 关键词全基因组关联研究人群分层祖先信息标记随机SNP AFFYMETRIX SNP 6.0芯片; 在线阅读下载PDF 职称材料

利用AIMs分析亚洲9个绵羊群体的群体结构: 6; 作者张媛媛韩德平 +3 位作者邓卫东毛华明邓学工邓学梅《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2015年第7期674-684,共11页; 祖先信息标记(ancestry informative makers,AIMs)可用来分析群体的遗传结构.本研究利用Illumina Ovine SNP50芯片上的SNP位点,在云南乌骨绵羊和其他8个亚洲绵羊群体中以Rosenberg等定义的Informativeness统计量为筛选方法,选取Informat... 展开更多; 关键词祖先信息标记绵羊群体结构主成分分析祖先成分推断遗传分化系数; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名第10号染色体一个祖先信息标记区域的发现及鉴定: 1; 作者李瓅曾昭书周艳梅董子明; 机构郑州市中心医院妇产科郑州大学基础医学院法医学教研室郑州大学基础医学院病理生理学教研室; 出处《郑州大学学报（医学版）》 CAS 北大核心 2010年第5期743-746,共4页; 基金国家自然科学基金资助项目30700966 31071100; 文摘目的:应用第10号染色体的HapMap单核苷酸多态性(SNP)基因分型数据及人群聚类分析技术区分人亚群。方法:从HapMap数据库(r23)获取北京汉族人、欧裔和非裔3个人群225个样本的第10号染色体共4660余万个SNPs分型结果,提取在3个群体间等位基因频率差值大于0.3的SNPs,以Genepop4.0软件计算固定系数(Fst),以Structure2.3软件进行聚类分析。结果:在3个群体间得到等位基因频率差值大于0.3的SNPs共2910个,位于该染色体长臂末端118000000bp处的rs10510019、rs10787669、rs713252与rs919613的Fst均大于0.660,平均Fst为0.674,该4个SNPs处于强连锁不平衡状态,形成一个跨度为13455bp的区域。结论:包含4个SNPs的祖先信息标记区域的发现,可以有效提示某个人是否归属于欧裔、非裔或北京汉族人群,并为组建复合PCR体系提供了备选SNPs。; 关键词祖先信息标记单核苷酸多态性固定系数 HAPMAP; Keywords ancestry informative marker single nucleotide polymorphism fixation index HapMap; 分类号 R394.5 [医药卫生—医学遗传学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名基于AIM-InDels位点复合扩增体系检测乌鲁木齐蒙古族祖先信息被引量：1: 2; 作者沈春梅解通梅书燕方雅婷兰琼刘艳芳朱波峰邰发道; 机构陕西师范大学生命科学学院南方医科大学法医学院西安交通大学口腔医院陕西省颅颌面精准医学研究重点实验室; 出处《法医学杂志》 CAS CSCD 2019年第5期545-552,共8页; 基金国家自然科学基金资助项目(81471824); 文摘目的基于课题组前期构建的用于祖先信息推断的39个AIM-InDels位点复合扩增检测体系,探索乌鲁木齐地区蒙古族的遗传背景和遗传结构。方法采集乌鲁木齐市蒙古族145名健康无关个体血样进行基因分型,以千人基因组计划数据库中三个洲际(东亚、欧洲和非洲)的17个群体作为参考人群,研究乌鲁木齐蒙古族的祖先信息构成。应用多种群体遗传学和生物信息学分析方法,进行配对群体间的Fst值与DA值比较分析、PCA分析、系统发育树的构建。应用Strucutre等软件分析乌鲁木齐蒙古族的祖先信息成分比例。结果乌鲁木齐蒙古族在不同洲际群体的祖先信息成分占比为89∶7∶3(东亚∶欧洲∶非洲)。相对于其他洲际群体,乌鲁木齐蒙古族与东亚群体有较小的Fst值与DA值,PCA分析中其与东亚群体形成聚类,系统发育树中亦与东亚群体在同一个分支。结论乌鲁木齐蒙古族与东亚人群有着较近的遗传关系,其东亚祖先成分比例约为89%。; 关键词法医遗传学遗传学群体遗传结构祖先信息标记插入/缺失蒙古族乌鲁木齐; Keywords forensic genetics genetics,population genetic structures ancestry informative marker insertion/deletion Mongolian Urumqi; 分类号 DF775.2 [政治法律—诉讼法学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名SeqType■P52人类祖先识别SNP检测试剂盒性能验证: 3; 作者王颖希马原李甫焦章平; 机构北京市公安司法鉴定中心; 出处《法医学杂志》 CAS CSCD 2021年第3期382-387,395,共7页; 基金公安部应用创新资助项目(2017YYCXBJSJ037)。; 文摘目的评估基于高通量测序平台研发的SeqType■P52人类祖先识别SNP检测试剂盒对中国5个民族的区分效能。方法基于高通量测序平台检测SeqType■P52人类祖先识别SNP检测试剂盒,对来自中国汉族、藏族、蒙古族、维吾尔族、彝族共计350份样本进行检测和族群聚类分析。结果单个样本单个位点有效测序深度≥720×,平均检出率96%。藏族、蒙古族、维吾尔族、彝族4个民族和汉族的群体间等位基因频率差均值分别为0.20、0.05、0.24和0.11。在Structure 2.3.4 K=5模式下可以检测到汉族、藏族和维吾尔族比较独立的祖先成分,这与主成分分析(pricipal component analysis,PCA)结果相一致。对于彝族,其2/3拥有相对独立的与藏族人群接近的祖先成分,1/3成分和维吾尔族相似。蒙古族则拥有与汉族人群相似的祖先来源成分。结论本研究筛选并建立的52个祖先信息SNP位点复合检测体系能够有效地实现汉族、藏族、维吾尔族人群的成分构成和个体遗传成分的分析,对汉族、蒙古族、彝族3个民族区分能力还有待提高。SeqType■P52人类祖先识别SNP检测试剂盒可以用于法医DNA部分案件中个体祖先的来源推断。; 关键词法医遗传学单核苷酸多态性高通量测序祖先信息标记; Keywords forensic genetics single nucleotide polymorphism high-throughput sequencing ancestry informative marker; 分类号 DF795.2 [医药卫生]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名27重SNP复合扩增技术推断犯罪嫌疑人族群1例被引量：3: 4; 作者马咪刘京江丽赵蕾王博超虎建华张涛周浩冯保强刘海渤李彩霞; 机构公安部物证鉴定中心法医遗传学公安部重点实验室北京市现场物证检验工程技术研究中心现场物证溯源技术国家工程实验室新疆生产建设兵团第七师公安局新疆生产建设兵团公安局; 出处《法医学杂志》 CAS CSCD 2018年第6期730-732,共3页; 基金国家重点研发计划资助项目(2017YFC0803501) 国家科技资源共享服务平台计划资助项目(YCZYPT[2017] 01-3) +2 种基金中央公益类基本科研业务费专项资金项目(2017JB025); 文摘 1案例1.1简要案情某年1月,新疆生产建设兵团某师辖区内发生一起故意杀人案,嫌疑人作案手段凶残,死者被锐器刺穿颈动脉和气管,导致失血性休克死亡。; 关键词法医遗传学多态性单核苷酸祖先信息标记复合扩增种族推断; 分类号 DF795.2 [医药卫生—法医学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名随机SNP在全基因组关联研究人群分层分析中的应用: 5; 作者曹宗富马传香王雷蔡斌; 机构生物芯片北京国家工程研究中心博奥生物有限公司; 出处《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2010年第9期921-928,共8页; 基金国家高技术研究发展计划项目(863计划)(编号:2009AA022708)资助; 文摘在复杂疾病的全基因组关联研究中,人群分层现象会增加结果的假阳性率,因此考虑人群遗传结构、控制人群分层是很有必要的。而在人群分层研究中,使用随机选择的SNP的效果还有待进一步探讨。文章利用HapMap Phase2人群中无关个体的Affymetrix SNP6.0芯片分型数据,在全基因组上随机均匀选择不同数量的SNP,同时利用f值和Fisher精确检验方法筛选祖先信息标记(Ancestry Informative markers,AIMs)。然后利用HapMap Phase3中的无关个体的数据,以F-statistics和STRUCTURE分析两种方法评估所选出的不同SNP组合对人群的区分效果。研究发现,随机均匀分布于全基因组的SNP可用于识别人群内部存在的遗传结构。文章进一步提示,在全基因组关联研究中,当没有针对特定人群的AIMs时,可在全基因组上随机选择3000以上均匀分布的SNP来控制人群分层。; 关键词全基因组关联研究人群分层祖先信息标记随机SNP AFFYMETRIX SNP 6.0芯片; Keywords genome-wide association study population stratification ancestry informative markers random SNP Af-fymetrix SNP 6.0 array; 分类号 Q987 [生物学—遗传学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名利用AIMs分析亚洲9个绵羊群体的群体结构: 6; 作者张媛媛韩德平邓卫东毛华明邓学工邓学梅; 机构中国农业大学畜禽育种国家工程实验室; 出处《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2015年第7期674-684,共11页; 基金国家自然科学基金(U1136605) 教育部博士点基金(20120008110049) 国家转基因重大专项(2011ZX08009-001)资助项目~~; 文摘祖先信息标记(ancestry informative makers,AIMs)可用来分析群体的遗传结构.本研究利用Illumina Ovine SNP50芯片上的SNP位点,在云南乌骨绵羊和其他8个亚洲绵羊群体中以Rosenberg等定义的Informativeness统计量为筛选方法,选取Informativeness值最高的前20、50、100、500个SNP位点与相应数目的随机SNP位点分别用来推断群体的遗传结构.通过主成分分析和用fast STRUCURE推断祖先成分的方法,评价AIMs在推断亚洲绵羊群体遗传结构中的作用.研究显示,利用筛选到的高信息含量标记AIMs,可减少群体结构研究中需要的SNP位点数目.前50个AIMs可有效地将绵羊群体分为4个大类,这与利用全基因组SNPs分析得到的群体结构是一致的,即乌骨绵羊群体blackbone单独为一类、西藏群体changthangi和tibetan归为一类,孟加拉的banglandeshi、banglandeshi Garole群体和印度的Indian Garole群体归为一个类群,其余三个群体(印度尼西亚sumatran、garut群体和印度的deccani群体)近似归为一类.这4大类群在AIMs上存在显著的分化,利用这些位点信息可以为研究群体特征和进化关系提供线索.; 关键词祖先信息标记绵羊群体结构主成分分析祖先成分推断遗传分化系数; Keywords AIMs sheep population structure principal component anlysis ancestry inference Fst; 分类号 Q38 [生物学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

	题名	作者	出处	发文年	被引量	操作
1	第10号染色体一个祖先信息标记区域的发现及鉴定	李瓅曾昭书周艳梅董子明	《郑州大学学报（医学版）》 CAS 北大核心	2010	0	在线阅读下载PDF 职称材料
2	基于AIM-InDels位点复合扩增体系检测乌鲁木齐蒙古族祖先信息	沈春梅解通梅书燕方雅婷兰琼刘艳芳朱波峰邰发道	《法医学杂志》 CAS CSCD	2019	1	在线阅读下载PDF 职称材料
3	SeqType■P52人类祖先识别SNP检测试剂盒性能验证	王颖希马原李甫焦章平	《法医学杂志》 CAS CSCD	2021		在线阅读下载PDF 职称材料
4	27重SNP复合扩增技术推断犯罪嫌疑人族群1例	马咪刘京江丽赵蕾王博超虎建华张涛周浩冯保强刘海渤李彩霞	《法医学杂志》 CAS CSCD	2018	3	在线阅读下载PDF 职称材料
5	随机SNP在全基因组关联研究人群分层分析中的应用	曹宗富马传香王雷蔡斌	《遗传》 CAS CSCD 北大核心	2010	0	在线阅读下载PDF 职称材料
6	利用AIMs分析亚洲9个绵羊群体的群体结构	张媛媛韩德平邓卫东毛华明邓学工邓学梅	《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心	2015		在线阅读下载PDF 职称材料