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一个新硝基还原酶基因NOR1编码区单核苷酸多态及与鼻咽癌的关联分析
被引量：
17
1
作者
熊炜
曾朝阳
+9 位作者
肖炳燚
熊芳
聂新民
范松青
彭聪
李伟芳
王蓉
沈守荣
李小玲
李桂源
《生物化学与生物物理进展》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2003年第3期401-405,共5页
NOR1基因是中南大学湘雅医学院肿瘤研究所克隆的一个鼻咽癌表达下调新基因 ,生物信息学预测NOR1基因含有硝基还原酶结构域 ,该基因可能参与亚硝胺类化学致癌物在体内的代谢过程 ,从而与鼻咽癌的发生密切相关 .通过采用病例 对照的研究方...
NOR1基因是中南大学湘雅医学院肿瘤研究所克隆的一个鼻咽癌表达下调新基因 ,生物信息学预测NOR1基因含有硝基还原酶结构域 ,该基因可能参与亚硝胺类化学致癌物在体内的代谢过程 ,从而与鼻咽癌的发生密切相关 .通过采用病例 对照的研究方法 ,利用测序技术对 144名鼻咽癌患者和匹配的 144名正常人NOR1基因编码区单核苷酸多态 (codingregionsinglenucleotidepolymorphisms ,cSNPs)进行基因分型 ,关联分析结果显示所检测到的两个cSNPs之间存在连锁不平衡 ,且均与鼻咽癌发病相关 ,两个cSNPs及它们所组成的单倍型相对危险度分别为 1 3 6、 1 64和 1 3 7.两个cSNPs的多态性改变均使NOR1基因编码蛋白一级结构发生了变化 ,这种改变可能影响NOR1基因编码蛋白的结构和功能 .
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关键词
硝基还原酶基因
NORl编码区
单核苷酸多态
鼻咽癌
关联分析
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职称材料
脓肿分枝杆菌硝基还原酶基因的克隆表达及生物信息学分析(英文)
被引量：
1
2
作者
丁朋举
惠明
+5 位作者
姜广路
戴广明
赵立平
付育红
李卫民
黄海荣
《中国人兽共患病学报》
CAS
CSCD
北大核心
2013年第2期148-153,共6页
目的克隆表达脓肿分枝杆菌中的硝基还原酶(nitroreductase,Nrd)基因,并对其对应的蛋白质进行生物信息学分析。方法利用PCR技术从脓肿分枝杆菌中扩增Nrd的全基因序列,采用原核表达系统进行体外表达。采用生物信息学方法对Nrd蛋白的理化...
目的克隆表达脓肿分枝杆菌中的硝基还原酶(nitroreductase,Nrd)基因,并对其对应的蛋白质进行生物信息学分析。方法利用PCR技术从脓肿分枝杆菌中扩增Nrd的全基因序列,采用原核表达系统进行体外表达。采用生物信息学方法对Nrd蛋白的理化性质、结构和功能等重要参数进行了预测和分析,对其三级结构进行了同源建模。结果从脓肿分枝杆菌中扩增出660bp的目的片段,体外表达获得了大小约为30kDa的带有His标签的重组蛋白。生物信息学分析显示Nrd蛋白有219个氨基酸组成,理论分子量和等电点分别为24.38kDa和6.52,是一种不稳定的亲水性蛋白质(不稳定系数为54.52,总平均亲水性为-0.244);二级结构以α-螺旋、β-折叠和无规卷曲为主要构件;该蛋白的氨基酸序列与蛋白质结构数据库中3gr3蛋白A链的相似性最高为60%,以3gr3蛋白A链为模板构建了Nrd蛋白的三维结构分子模型。结论成功表达并纯化了脓肿分枝杆菌中的Nrd蛋白。预测结果显示该蛋白是硝基还原酶家族成员之一,这提示Nrd蛋白在脓肿分枝杆菌中可能执行还原对硝基苯甲酸的功能。
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关键词
脓肿分枝杆菌
硝基还原酶基因
克隆表达
分离纯化
生物信息学分析
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职称材料
题名
一个新硝基还原酶基因NOR1编码区单核苷酸多态及与鼻咽癌的关联分析
被引量：
17
1
作者
熊炜
曾朝阳
肖炳燚
熊芳
聂新民
范松青
彭聪
李伟芳
王蓉
沈守荣
李小玲
李桂源
机构
中南大学湘雅医学院肿瘤研究所
中南大学湘雅医院网络信息科
中南大学湘雅三医院消化内科
出处
《生物化学与生物物理进展》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2003年第3期401-405,共5页
基金
国家重点基础研究发展规划项目 ( 973) (G19980 5 10 0 8)
国家高技术"863"计划资助项目 ( 2 0 0 1AA2 2 10 31)
国家自然科学基金资助项目 ( 30 10 0 0 2 7)~~
文摘
NOR1基因是中南大学湘雅医学院肿瘤研究所克隆的一个鼻咽癌表达下调新基因 ,生物信息学预测NOR1基因含有硝基还原酶结构域 ,该基因可能参与亚硝胺类化学致癌物在体内的代谢过程 ,从而与鼻咽癌的发生密切相关 .通过采用病例 对照的研究方法 ,利用测序技术对 144名鼻咽癌患者和匹配的 144名正常人NOR1基因编码区单核苷酸多态 (codingregionsinglenucleotidepolymorphisms ,cSNPs)进行基因分型 ,关联分析结果显示所检测到的两个cSNPs之间存在连锁不平衡 ,且均与鼻咽癌发病相关 ,两个cSNPs及它们所组成的单倍型相对危险度分别为 1 3 6、 1 64和 1 3 7.两个cSNPs的多态性改变均使NOR1基因编码蛋白一级结构发生了变化 ,这种改变可能影响NOR1基因编码蛋白的结构和功能 .
关键词
硝基还原酶基因
NORl编码区
单核苷酸多态
鼻咽癌
关联分析
Keywords
single nucleotide polymorphism,NOR1 gene,nasopharyngeal carcinoma,association analysis
分类号
R739.63 [医药卫生—肿瘤]
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职称材料
题名
脓肿分枝杆菌硝基还原酶基因的克隆表达及生物信息学分析(英文)
被引量：
1
2
作者
丁朋举
惠明
姜广路
戴广明
赵立平
付育红
李卫民
黄海荣
机构
河南工业大学
首都医科大学附属北京胸科医院
北京市结核病胸部肿瘤研究所国家结核病临床实验室
出处
《中国人兽共患病学报》
CAS
CSCD
北大核心
2013年第2期148-153,共6页
基金
Supported by grants from the National Natural Science Foundation of China(Nos.81273144,31070120)~~
文摘
目的克隆表达脓肿分枝杆菌中的硝基还原酶(nitroreductase,Nrd)基因,并对其对应的蛋白质进行生物信息学分析。方法利用PCR技术从脓肿分枝杆菌中扩增Nrd的全基因序列,采用原核表达系统进行体外表达。采用生物信息学方法对Nrd蛋白的理化性质、结构和功能等重要参数进行了预测和分析,对其三级结构进行了同源建模。结果从脓肿分枝杆菌中扩增出660bp的目的片段,体外表达获得了大小约为30kDa的带有His标签的重组蛋白。生物信息学分析显示Nrd蛋白有219个氨基酸组成,理论分子量和等电点分别为24.38kDa和6.52,是一种不稳定的亲水性蛋白质(不稳定系数为54.52,总平均亲水性为-0.244);二级结构以α-螺旋、β-折叠和无规卷曲为主要构件;该蛋白的氨基酸序列与蛋白质结构数据库中3gr3蛋白A链的相似性最高为60%,以3gr3蛋白A链为模板构建了Nrd蛋白的三维结构分子模型。结论成功表达并纯化了脓肿分枝杆菌中的Nrd蛋白。预测结果显示该蛋白是硝基还原酶家族成员之一,这提示Nrd蛋白在脓肿分枝杆菌中可能执行还原对硝基苯甲酸的功能。
关键词
脓肿分枝杆菌
硝基还原酶基因
克隆表达
分离纯化
生物信息学分析
Keywords
Mycobacterium abscessus
nitroreductase gene
cloning and expression
isolation and purification
bioinformatics analysis
分类号
R378.91 [医药卫生—病原生物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
一个新硝基还原酶基因NOR1编码区单核苷酸多态及与鼻咽癌的关联分析
熊炜
曾朝阳
肖炳燚
熊芳
聂新民
范松青
彭聪
李伟芳
王蓉
沈守荣
李小玲
李桂源
《生物化学与生物物理进展》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2003
17
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
脓肿分枝杆菌硝基还原酶基因的克隆表达及生物信息学分析(英文)
丁朋举
惠明
姜广路
戴广明
赵立平
付育红
李卫民
黄海荣
《中国人兽共患病学报》
CAS
CSCD
北大核心
2013
1
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职称材料
已选择
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