Dof(DNA binding with one finger)基因家族在植物的生长发育和响应逆境胁迫过程中发挥着重要作用。为了解番木瓜中Dof基因家族成员信息,通过生物信息学手段对番木瓜全基因组中Dof基因家族进行鉴定,分析其理化性质、基因结构、保守基序...Dof(DNA binding with one finger)基因家族在植物的生长发育和响应逆境胁迫过程中发挥着重要作用。为了解番木瓜中Dof基因家族成员信息,通过生物信息学手段对番木瓜全基因组中Dof基因家族进行鉴定,分析其理化性质、基因结构、保守基序、系统发育、顺式作用元件以及在乙烯处理下的转录谱,并利用实时荧光定量PCR技术(RT-qPCR)分析Dof基因在番木瓜幼苗中响应红蓝光的表达模式。结果表明,番木瓜基因组中共鉴定出CpDofs 20个,它们分布在18条染色体上,氨基酸数230~499个,蛋白理论分子量23.88~53.56 kD,且均位于细胞核中。系统进化分析表明,20个CpDofs蛋白被分为3个亚家族,即ClassⅠ含2个,ClassⅡ含6个,ClassⅡ含12个。MEME分析发现所有CpDofs蛋白都含有Motif 1,推测Motif 1是CpDofs家族成员的重要组成部分。顺式作用元件分析发现,CpDofs的启动子区域存在大量光响应元件,而qRT-PCR分析发现,红光和蓝光能够诱导CpDofs基因表达。以上结果对研究CpDofs功能及响应红光和蓝光调控机制奠定了基础。展开更多
以转rolABC基因枳橙B、D、E系及野生植株为材料,制备标准品,采用SYBR Green I染料,构建rol基因和β-actin基因的双标准曲线,校正引物扩增效率后,用2-△△Ct法对rol基因在嫩茎、嫩叶、功能叶、树皮和根中的mRNA水平进行相对定量,建立适合...以转rolABC基因枳橙B、D、E系及野生植株为材料,制备标准品,采用SYBR Green I染料,构建rol基因和β-actin基因的双标准曲线,校正引物扩增效率后,用2-△△Ct法对rol基因在嫩茎、嫩叶、功能叶、树皮和根中的mRNA水平进行相对定量,建立适合于rolA、rolB、rolC基因实时荧光定量RT-PCR分析方法.初步认为rolC基因在嫩茎、嫩叶、功能叶和树皮中表达量最高;其次是rolA基因,主要在嫩茎中表达;rolB基因表达量最低,主要在根系中表达.展开更多
为了探讨母体补充苏氨酸锌对子代生长性能、金属硫蛋白（metallothionein,MT1）m RNA表达的影响,实验以苏氨酸锌为受试物,将90只受孕SD大鼠随机分成5组,并于妊娠期第6~15天进行灌胃补充不同剂量苏氨酸锌。母鼠分娩后将仔鼠进行常规饲养...为了探讨母体补充苏氨酸锌对子代生长性能、金属硫蛋白（metallothionein,MT1）m RNA表达的影响,实验以苏氨酸锌为受试物,将90只受孕SD大鼠随机分成5组,并于妊娠期第6~15天进行灌胃补充不同剂量苏氨酸锌。母鼠分娩后将仔鼠进行常规饲养至1月龄,测量仔鼠的体质量、身长和尾长,将各组仔鼠断颈处死后取肝脏、肾脏、脾脏和胸骨等组织进行RNA的提取并测定MT1基因相对表达量。结果表明：与空白对照组相比,苏氨酸锌各剂量组仔鼠体质量有显著增加（P〈0.05）。与溶媒对照组和空白对照组相比较,苏氨酸锌各剂量组仔鼠的MT1 m RNA表达量高,且差异显著（P〈0.05）,并且1 000 mg/kg苏氨酸锌处理组各组织中MT1的基因表达量要高于其他组。本结果表明：妊娠期补充苏氨酸锌能显著提高仔鼠MT1 m RNA表达水平,并能在一定程度上增加仔鼠体质量。展开更多
文摘Dof(DNA binding with one finger)基因家族在植物的生长发育和响应逆境胁迫过程中发挥着重要作用。为了解番木瓜中Dof基因家族成员信息,通过生物信息学手段对番木瓜全基因组中Dof基因家族进行鉴定,分析其理化性质、基因结构、保守基序、系统发育、顺式作用元件以及在乙烯处理下的转录谱,并利用实时荧光定量PCR技术(RT-qPCR)分析Dof基因在番木瓜幼苗中响应红蓝光的表达模式。结果表明,番木瓜基因组中共鉴定出CpDofs 20个,它们分布在18条染色体上,氨基酸数230~499个,蛋白理论分子量23.88~53.56 kD,且均位于细胞核中。系统进化分析表明,20个CpDofs蛋白被分为3个亚家族,即ClassⅠ含2个,ClassⅡ含6个,ClassⅡ含12个。MEME分析发现所有CpDofs蛋白都含有Motif 1,推测Motif 1是CpDofs家族成员的重要组成部分。顺式作用元件分析发现,CpDofs的启动子区域存在大量光响应元件,而qRT-PCR分析发现,红光和蓝光能够诱导CpDofs基因表达。以上结果对研究CpDofs功能及响应红光和蓝光调控机制奠定了基础。
文摘以转rolABC基因枳橙B、D、E系及野生植株为材料,制备标准品,采用SYBR Green I染料,构建rol基因和β-actin基因的双标准曲线,校正引物扩增效率后,用2-△△Ct法对rol基因在嫩茎、嫩叶、功能叶、树皮和根中的mRNA水平进行相对定量,建立适合于rolA、rolB、rolC基因实时荧光定量RT-PCR分析方法.初步认为rolC基因在嫩茎、嫩叶、功能叶和树皮中表达量最高;其次是rolA基因,主要在嫩茎中表达;rolB基因表达量最低,主要在根系中表达.
文摘试验旨在研究不同Toll样受体(Toll-like receptor,TLR)在鸭不同组织中的表达情况,选取300日龄雄性金定鸭10只,解剖后采集其血液及脾脏、肝脏、睾丸、肺脏、下丘脑、垂体、皮肤、腿肌、心脏、肾脏、胸肌、盲肠、小肠、胸腺,采用Primer Premier 5.0软件设计特异性引物,并用实时荧光定量PCR法检测TLR1、TLR2、TLR4、TLR5在不同组织中的相对表达情况。结果显示,各基因扩增产物的熔解曲线均有一特异性的单峰,无其他杂峰,说明引物的特异性较强,可以准确定量。4种目的基因与内参基因的扩增效率在101.4%~105.0%之间,均接近100%,相关系数(R2)为0.98~1.000。TLR1、TLR2、TLR4、TLR5 4种TLRs在金定鸭不同组织和血液中均有表达,但每种TLR受体在各组织中表达水平略有差异,其中TLR1在下丘脑中表达量最低,在胸肌中最高;TLR2在小肠中的表达量最低,在肺脏中最高;TLR4、TLR5在睾丸中的表达量最低,在皮肤中最高。以上结果说明,鸭TLRs在多种组织中能够广泛表达,本试验结果可为TLRs在鸭源感染过程中的作用机理研究提供科学依据。
文摘为了探讨母体补充苏氨酸锌对子代生长性能、金属硫蛋白（metallothionein,MT1）m RNA表达的影响,实验以苏氨酸锌为受试物,将90只受孕SD大鼠随机分成5组,并于妊娠期第6~15天进行灌胃补充不同剂量苏氨酸锌。母鼠分娩后将仔鼠进行常规饲养至1月龄,测量仔鼠的体质量、身长和尾长,将各组仔鼠断颈处死后取肝脏、肾脏、脾脏和胸骨等组织进行RNA的提取并测定MT1基因相对表达量。结果表明：与空白对照组相比,苏氨酸锌各剂量组仔鼠体质量有显著增加（P〈0.05）。与溶媒对照组和空白对照组相比较,苏氨酸锌各剂量组仔鼠的MT1 m RNA表达量高,且差异显著（P〈0.05）,并且1 000 mg/kg苏氨酸锌处理组各组织中MT1的基因表达量要高于其他组。本结果表明：妊娠期补充苏氨酸锌能显著提高仔鼠MT1 m RNA表达水平,并能在一定程度上增加仔鼠体质量。
