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采用蛋白质组学技术筛选鼻咽癌细胞的甲基化沉默基因
被引量:
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作者
张文静
易斌
+7 位作者
易红
张鹏飞
李茂玉
李萃
阮林
陈主初
李建玲
肖志强
《生物化学与生物物理进展》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2008年第4期410-417,共8页
为筛选鼻咽癌的甲基化沉默基因,采用二维凝胶电泳(2-DE)技术分离甲基转移酶抑制剂5-杂氮-2′-脱氧胞苷(5-aza-2-dC)处理与未处理鼻咽癌细胞5-8F的蛋白质,PDquest图像分析软件识别差异蛋白质点,基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-T...
为筛选鼻咽癌的甲基化沉默基因,采用二维凝胶电泳(2-DE)技术分离甲基转移酶抑制剂5-杂氮-2′-脱氧胞苷(5-aza-2-dC)处理与未处理鼻咽癌细胞5-8F的蛋白质,PDquest图像分析软件识别差异蛋白质点,基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF-MS)鉴定差异蛋白质.然后采用Westernblotting和RT-PCR检测差异蛋白质nm23-H1在药物处理与未处理5-8F细胞中的表达水平,采用甲基化特异性PCR(MS-PCR)检测nm23-H1基因在药物处理与未处理5-8F细胞中的甲基化水平.建立了5-aza-2-dC处理与未处理5-8F细胞蛋白质的2-DE图谱,识别了49个差异表达的蛋白质点,鉴定了33个差异表达的蛋白质,其中包括nm23-H1在内的15个蛋白质在5-aza-2-dC处理后的5-8F细胞中表达上调,而18个蛋白质表达下调.Westernblotting和RT-PCR结果显示,nm23-H1在5-aza-2-dC处理5-8F细胞后表达上调,MS-PCR结果显示,在5-aza-2-dC处理5-8F细胞后nm23-H1基因甲基化水平下降,结果证实,nm23-H1基因是5-8F细胞中的甲基化沉默基因.15个5-aza-2-dC处理后表达上调的基因可能是5-8F细胞中的甲基化沉默基因,为筛选鼻咽癌甲基化失活基因提供了科学依据.
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关键词
鼻咽癌
甲基化沉默基因
蛋白质组学
甲基
化
特异PCR
NM23-H1
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采用蛋白质组学技术筛选鼻咽癌细胞的甲基化沉默基因
被引量:
1
1
作者
张文静
易斌
易红
张鹏飞
李茂玉
李萃
阮林
陈主初
李建玲
肖志强
机构
中南大学湘雅医院卫生部肿瘤蛋白质组学重点实验室
出处
《生物化学与生物物理进展》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2008年第4期410-417,共8页
基金
国家重点基础研究发展计划(973)(2001CB5120)
芙蓉学者特聘教授科研奖励基金(湘教通[2007]362号)
+1 种基金
教育部跨世纪优秀人才培养计划基金(教计函[2002]48)
湖南省科技厅重大科技专项(06SK2004)资助项目~~
文摘
为筛选鼻咽癌的甲基化沉默基因,采用二维凝胶电泳(2-DE)技术分离甲基转移酶抑制剂5-杂氮-2′-脱氧胞苷(5-aza-2-dC)处理与未处理鼻咽癌细胞5-8F的蛋白质,PDquest图像分析软件识别差异蛋白质点,基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF-MS)鉴定差异蛋白质.然后采用Westernblotting和RT-PCR检测差异蛋白质nm23-H1在药物处理与未处理5-8F细胞中的表达水平,采用甲基化特异性PCR(MS-PCR)检测nm23-H1基因在药物处理与未处理5-8F细胞中的甲基化水平.建立了5-aza-2-dC处理与未处理5-8F细胞蛋白质的2-DE图谱,识别了49个差异表达的蛋白质点,鉴定了33个差异表达的蛋白质,其中包括nm23-H1在内的15个蛋白质在5-aza-2-dC处理后的5-8F细胞中表达上调,而18个蛋白质表达下调.Westernblotting和RT-PCR结果显示,nm23-H1在5-aza-2-dC处理5-8F细胞后表达上调,MS-PCR结果显示,在5-aza-2-dC处理5-8F细胞后nm23-H1基因甲基化水平下降,结果证实,nm23-H1基因是5-8F细胞中的甲基化沉默基因.15个5-aza-2-dC处理后表达上调的基因可能是5-8F细胞中的甲基化沉默基因,为筛选鼻咽癌甲基化失活基因提供了科学依据.
关键词
鼻咽癌
甲基化沉默基因
蛋白质组学
甲基
化
特异PCR
NM23-H1
Keywords
nasopharyngeal carcinoma, methylation silenced genes, proteomics, methylation-specific PCR, nm23-H1
分类号
R318.0 [医药卫生—生物医学工程]
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出处
发文年
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1
采用蛋白质组学技术筛选鼻咽癌细胞的甲基化沉默基因
张文静
易斌
易红
张鹏飞
李茂玉
李萃
阮林
陈主初
李建玲
肖志强
《生物化学与生物物理进展》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2008
1
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