生物信息技术的知识产权保护初探 被引量：5

1

作者 朱雪忠 常俊丽 何光源 《知识产权》 CSSCI 2006年第1期27-32,共6页

生物信息学是伴随着人类基因组计划(HGP)的开展而得以迅速发展起来的新兴交叉学科。由于其所带来的巨大社会经济效益,对生物信息技术的知识产权保护越来越引起人们的关注。本文据此对生物信息技术中涉及的知识产权保护客体,即基因和蛋... 生物信息学是伴随着人类基因组计划(HGP)的开展而得以迅速发展起来的新兴交叉学科。由于其所带来的巨大社会经济效益,对生物信息技术的知识产权保护越来越引起人们的关注。本文据此对生物信息技术中涉及的知识产权保护客体,即基因和蛋白质序列和结构、生物信息数据库、生物信息技术软件和硬件的知识产权保护国内外现状及目前存在的若干问题进行了初步的探讨。 展开更多

关键词 生物信息技术 知识产权 基因 蛋白质 数据库 计算机软件

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生物信息技术在药物相互作用风险研究中的应用进展 被引量：1

2

作者 王磊 冯伟兴 +4 位作者 赵媛媛 华丽妍 王雪莹 陈多娇 李浪 《中国药理学与毒理学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2017年第7期772-778,共7页

药物相互作用诱发的不良反应严重威胁患者的生命健康并导致巨大的经济损失,随着联用药物数目的增加,不良反应发生率显著上升采用传统方法评估联合用药风险效率低、成本高,而生物信息学研究方法可采用低成本和高通量的方式对海量生物学... 药物相互作用诱发的不良反应严重威胁患者的生命健康并导致巨大的经济损失,随着联用药物数目的增加,不良反应发生率显著上升采用传统方法评估联合用药风险效率低、成本高,而生物信息学研究方法可采用低成本和高通量的方式对海量生物学和医学大数据进行分析和挖掘,获取与药物不良反应相关的有价值的信息。本文从文献挖掘、数据挖掘和生理药物代谢动力学模型等方面系统综述了利用药物生物信息学挖掘潜在药物相互作用的方法。 展开更多

关键词 生物信息技术 药物相互作用 不良反应 数据挖掘

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实用生物信息技术课程教学实例 被引量：4

3

作者 罗静初 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第11期102-111,共10页

介绍"实用生物信息技术"研究生课程的5个教学实例。以血红蛋白序列和结构为例,介绍常用生物信息技术和分析方法,包括蛋白质和核酸序列相似性比对、蛋白质和核酸序列数据库检索、Blast数据库相似性搜索、分子系统发生树构建,... 介绍"实用生物信息技术"研究生课程的5个教学实例。以血红蛋白序列和结构为例,介绍常用生物信息技术和分析方法,包括蛋白质和核酸序列相似性比对、蛋白质和核酸序列数据库检索、Blast数据库相似性搜索、分子系统发生树构建,以及蛋白质结构比较分析等。 展开更多

关键词 生物信息技术 血红蛋白 序列比对 数据库检索 Blast数据库搜索 系统发生树构建 蛋白质结构比较分析

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CGAP:构建肿瘤研究领域的生物信息技术平台

4

作者 张晔 袁媛 《中国癌症杂志》 CAS CSCD 2006年第3期235-239,共5页

美国癌症研究所在1996年发起了癌肿基因组解剖计划(CGAP),其目的在于创建一系列工具以获知与肿瘤相关的基因、蛋白质及其它生物标记物。近年来,生物信息技术的发展为其计划的实施提供了丰富的生物信息资源。常用的生物信息技术有:表达... 美国癌症研究所在1996年发起了癌肿基因组解剖计划(CGAP),其目的在于创建一系列工具以获知与肿瘤相关的基因、蛋白质及其它生物标记物。近年来,生物信息技术的发展为其计划的实施提供了丰富的生物信息资源。常用的生物信息技术有:表达序列标签(EST)、Un igene、基因表达系列分析(SAGE)和数字化差异表达(DDD),四种方法各有其优势,共同成为生物信息技术的组成部分。本文综述了上述生物信息技术在CGAP中的应用,并预测了其未来的发展趋势。 展开更多

关键词 生物信息技术 肿瘤 癌肿基因组解剖计划

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岩溶地下水环境微生物信息技术应用研究进展 被引量：1

5

作者 刘丹 陈学群 +2 位作者 田婵娟 张文静 管清花 《中国岩溶》 CAS CSCD 北大核心 2023年第2期185-192,共8页

岩溶含水层特有的非均质性使其微生物群落具有多样性,微生物信息技术研究对岩溶地下水资源开发利用和保护具有重要意义。在总结国内外微生物信息技术应用研究现状基础上,分析岩溶地下水环境中微生物来源,重点讨论微生物示踪技术、微生... 岩溶含水层特有的非均质性使其微生物群落具有多样性,微生物信息技术研究对岩溶地下水资源开发利用和保护具有重要意义。在总结国内外微生物信息技术应用研究现状基础上,分析岩溶地下水环境中微生物来源,重点讨论微生物示踪技术、微生物监测技术在岩溶地下水环境中的应用。认为,由于岩溶含水层的复杂性和微生物的易变异性,微生物信息技术应用过程中对岩溶地下水环境造成的污染风险还需进一步探讨,提出推进微生物信息技术在岩溶地下水资源合理开发利用中的研究展望。 展开更多

关键词 岩溶地下水 微生物示踪技术 微生物监测技术 微生物信息技术 指示作用

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863计划生物信息技术取得了显著进展

6

《农业科技通讯》 2005年第2期42-42,共1页

863计划生物信息技术主题2004年度在生物信息的获取与开发、加工与利用方面取得了较大的进展：

关键词 生物信息技术 863计划 获取 年度 开发 加工

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生物信息技术在微生物研究中的应用

7

作者 刘睿鑫 《广东蚕业》 2019年第7期41-42,共2页

生物信息技术以计算机学和信息技术学为基础,通过计算机的运用、储存、检查和搜索等生物系统信息,建立微生物的系统模型,从新的视角揭示生命的起源、进化、形成和演示.生物信息技术为建立微生物的信息库提供了条件,更为生物的研究、基... 生物信息技术以计算机学和信息技术学为基础,通过计算机的运用、储存、检查和搜索等生物系统信息,建立微生物的系统模型,从新的视角揭示生命的起源、进化、形成和演示.生物信息技术为建立微生物的信息库提供了条件,更为生物的研究、基因的储存提供了保障. 展开更多

关键词 生物信息技术 微生物研究 应用

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基于专利共类的信息与生物技术融合趋势分析 被引量：19

8

作者 黄鲁成 黄斌 +1 位作者 吴菲菲 苗红 《情报杂志》 CSSCI 北大核心 2014年第8期59-63,共5页

以德温特专利数据库(DII)里收集的中国信息与生物技术融合的专利为研究对象,运用数据挖掘的关联分析方法,利用SPSS Modeler 14.1软件进行数据分析,对信息与生物技术融合趋势进行探讨。研究结果表明:在一定的支持度和置信度下,可以产生... 以德温特专利数据库(DII)里收集的中国信息与生物技术融合的专利为研究对象,运用数据挖掘的关联分析方法,利用SPSS Modeler 14.1软件进行数据分析,对信息与生物技术融合趋势进行探讨。研究结果表明:在一定的支持度和置信度下,可以产生判断信息与生物技术融合趋势的有效规则。研究结论可以为技术管理实践提供理论参考依据。 展开更多

关键词 专利共类 国际专利分类号 信息与生物技术 技术融合 关联规则

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生物技术风险不披露行为的刑法规制

9

作者 刘强 《法治研究》 CSSCI 北大核心 2024年第1期101-111,共11页

掩饰、隐瞒生物技术风险的行为,致生物安全“不设防”地陷于危险境地,刑法却难以有效应对。在前置法已就生物技术风险披露做出明确规定的背景下,刑法应当基于预警原则指引而采取行动。当然,生物技术创新发展与生物安全保障不可偏废。鉴... 掩饰、隐瞒生物技术风险的行为,致生物安全“不设防”地陷于危险境地,刑法却难以有效应对。在前置法已就生物技术风险披露做出明确规定的背景下,刑法应当基于预警原则指引而采取行动。当然,生物技术创新发展与生物安全保障不可偏废。鉴于生物技术风险不披露行为的行政犯和不作为犯属性,刑法赋予利益主体生物技术风险披露义务,并宣示“应当为之”的诫命,应当以违反前置法的生物技术风险不披露行为,达到刑事违法性程度为前提,以避免刑法肆意扩展。 展开更多

关键词 生物安全管理 生物技术风险信息 风险披露 行政犯 不作为犯

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利用生物信息学技术探索人卵巢癌细胞株A2780对顺铂耐药基因的研究

10

作者 张丽 董冰莹 +1 位作者 袁小丽 陈小斌 《实用妇产科杂志》 CAS CSCD 北大核心 2023年第6期465-469,共5页

目的:利用生物信息学技术探索人卵巢癌细胞株A2780对顺铂耐药基因的可能机制,为临床化疗提供有效的依据。方法:①通过GEO在线GEO2R工具从两组数据库(GSE15372和GSE33482)中,分别比较对顺铂耐药的A2780与对顺铂敏感的A2780中的基因表达差... 目的:利用生物信息学技术探索人卵巢癌细胞株A2780对顺铂耐药基因的可能机制,为临床化疗提供有效的依据。方法:①通过GEO在线GEO2R工具从两组数据库(GSE15372和GSE33482)中,分别比较对顺铂耐药的A2780与对顺铂敏感的A2780中的基因表达差异,并筛选出高表达基因和低表达基因;使用维恩图确定两组数据库中耐药的高表达共同差异基因和低表达的共同差异基因。②利用GO分析和KEGG通路富集分析耐药基因的生物学功能。③利用蛋白质-蛋白质互作(PPI)网络及Cytoscape软件筛选出A2780对顺铂耐药核心靶基因。④利用Kaplan-Meier Plotter工具对Hub基因进行总生存期分析。结果:①两组数据集的高表达共同耐药基因共37个,低表达共同耐药基因共2个。②GO分析结果显示:生物学过程(BP)分析结果表明,耐药基因主要参与着细胞间信号传导、趋化作用等;细胞组成(CC)分析表明,耐药基因主要位于细胞外区域、细胞间隙、细胞表面;分子功能(MF)分析表明,耐药基因参与着趋化因子相结合等作用。KEGG通路富集分析显示,耐药基因主要在细胞因子与细胞因子受体相互作用的信号通路、趋化因子信号通路上发挥作用。③PPI网络及Hub基因筛选结果显示:CCR5、POSTN、LOX、DACT1、RTN1、CCR1、CXCL6、PITX2、SNCA、AREG是核心耐药基因。④Hub基因中POSTN、LOX、DACT1、RTN1、PITX2的高表达与卵巢癌的不良预后有关(P<0.05)。结论:人卵巢癌细胞株A2780中顺铂耐药基因的异常表达,在卵巢癌化疗耐药中发挥着重要的作用,需要进一步的体外实验研究来证实其在临床化疗耐药中的作用。 展开更多

关键词 卵巢癌 细胞株A2780 顺铂 耐药基因 生物学信息技术

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小鼠糖皮质激素诱导的肿瘤坏死因子受体相关蛋白生物信息学分析 被引量：1

11

作者 沈培 苏兆亮 +1 位作者 王胜军 许化溪 《细胞与分子免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2014年第11期1205-1208,共4页

目的获取小鼠糖皮质激素诱导的肿瘤坏死因子受体相关蛋白（GITR）氨基酸序列,并预测其结构和功能。方法利用网络平台及相关生物学软件对小鼠GITR氨基酸序列进行生物信息学分析。结果小鼠GITR氨基酸序列与人等其他物种具有56%的同源性,... 目的获取小鼠糖皮质激素诱导的肿瘤坏死因子受体相关蛋白（GITR）氨基酸序列,并预测其结构和功能。方法利用网络平台及相关生物学软件对小鼠GITR氨基酸序列进行生物信息学分析。结果小鼠GITR氨基酸序列与人等其他物种具有56%的同源性,具有信号肽、胞外区、跨膜区及胞内区等结构;小鼠GITR蛋白胞外区位于第22-153号氨基酸序列区间;可能含有4个N-糖基化位点、4个丝氨酸磷酸化位点、1个苏氨酸磷酸化位点以及1个酪氨酸磷酸化位点。结论小鼠GITR氨基酸序列的生物信息学分析为进一步表达该蛋白及其相关功能研究奠定了基础。 展开更多

关键词 小鼠 糖皮质激素诱导的肿瘤坏死因子受体相关蛋白 氨基酸 生物信息技术

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现代生物技术在食品包装中的应用现状及发展前景 被引量：10

12

作者 温志英 《食品与机械》 CSCD 北大核心 2006年第4期119-121,共3页

对现代生物技术在食品包装中的应用作了论述,重点对生物酶工程、基因工程和生物信息技术在食品包装中的应用作了实例分析,同时对现代生物技术在食品包装中的应用前景进行展望。

关键词 酶工程 基因工程 生物信息技术 生物技术 食品包装

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生物信息数据库知识产权保护初探 被引量：1

13

作者 常俊丽 朱雪忠 何光源 《生物技术通报》 CAS CSCD 2006年第1期33-37,共5页

生物信息技术是当今生命科学乃至整个自然科学的重大前沿领域之一,生物信息数据库是生物信息技术中非常重要的部分,对生命科学的发展起着重要的推动作用。本文叙述了生物信息数据库的特点及国内外知识产权保护现状,初步讨论了生物信息... 生物信息技术是当今生命科学乃至整个自然科学的重大前沿领域之一,生物信息数据库是生物信息技术中非常重要的部分,对生命科学的发展起着重要的推动作用。本文叙述了生物信息数据库的特点及国内外知识产权保护现状,初步讨论了生物信息数据库知识产权保护中存在的问题,提出了保护我国生物信息数据库的建议。 展开更多

关键词 生物信息技术 数据库 知识产权

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生物信息数据库知识产权保护模式研究 被引量：1

14

作者 常俊丽 朱雪忠 何光源 《华中科技大学学报（社会科学版）》 CSSCI 2006年第6期43-47,共5页

生物信息技术是当今国内外生命科学研究的热点,其中作为生物信息技术重要内容的生物信息数据库对生命科学的发展起着重要的推动作用。基于对生物信息数据库自身特点的分析,结合目前数据库保护办法,探讨生物信息数据库知识产权保护应采... 生物信息技术是当今国内外生命科学研究的热点,其中作为生物信息技术重要内容的生物信息数据库对生命科学的发展起着重要的推动作用。基于对生物信息数据库自身特点的分析,结合目前数据库保护办法,探讨生物信息数据库知识产权保护应采取的方式,并提出对生物信息数据库应采取分级保护的观点,给出加强我国生物信息数据库知识产权保护的建议。 展开更多

关键词 生物信息技术 数据库 知识产权

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生物技术发展对渔业的影响

15

作者 李丽芳 朱立新 《现代渔业信息》 2004年第5期3-5,共3页

现代生物技术给渔业的发展带来了日新月异的变化,同时也引发了一系列的影响。本文就生物技术在渔业中的应用取得成果和影响进行了分析,并提出在渔业中应用生物技术应该慎重的观点。

关键词 现代生物技术 渔业 基因操作技术 基因组学技术 生物信息技术 细胞工程 组织培养 育种技术 性别控制

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生物信息学技术在病原生物学中的应用分析

16

作者 员建武 《热带农业工程》 2020年第5期25-27,共3页

从生物信息学技术以及病原生物学的角度出发,对生物信息学技术在病原生物学中的详细应用进行介绍,从教学层面提出生物信息学技术在病原生物学中的应用对策,以期为有关部门、人员提供可靠参考。

关键词 生物信息学技术 病原生物学 疫苗研发 致病机制

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基于生物信息学的乳腺癌关键基因筛选及实验验证 被引量：2

17

作者 梁霄 李娅兰 +2 位作者 白皓天 杨婧 王锐 《海南医学院学报》 CAS 2023年第1期51-62,71,共13页

目的:通过利用生物信息学技术,筛选乳腺细胞癌组织与正常组织间的差异表达基因,明确其潜在治疗药物,为将来临床乳腺癌的免疫靶向治疗及药物治疗提供参考。方法:利用基因表达数据库(gene expression omnibus,GEO)检索关键词“乳腺癌”,下... 目的:通过利用生物信息学技术,筛选乳腺细胞癌组织与正常组织间的差异表达基因,明确其潜在治疗药物,为将来临床乳腺癌的免疫靶向治疗及药物治疗提供参考。方法:利用基因表达数据库(gene expression omnibus,GEO)检索关键词“乳腺癌”,下载GSE79586芯片数据,通过生信技术筛选对照组及乳腺癌模型组差异表达基因并对其进行基因本体(GO)功能分析、京都基因与基因组百科全书(KEGG)分析、差异基因特征表达分析以及蛋白互作网络(PPI)分析,对分析结果进一步可视化处理。通过GEPIA、GeneMANIA、Timer2.0数据库分别进行预后分析、相关功能预测以及免疫浸润分析。最终通过Connectivity Map(CMap)明确对乳腺癌具有潜在治疗作用的化合物。采用蛋白质印迹法及实时荧光定量PCR(RT-PCR)对核心基因及相关性最高的潜在治疗药物吉非替尼进行体外验证。结果:共筛选到包括1786个上调基因和2130个下调基因在内的3916个差异表达基因;GO结果显示差异基因主要参与磷酸化的正向调节、分泌囊泡、外消旋酶和差向异构酶活性等功能;KEGG结果显示差异基因主要参与系统性红斑狼疮、酒精中毒、粘着斑、阿米巴痢疾等疾病通路与Ras信号通路等;差异基因特征表达分析显示MEK抑制剂、HSP90抑制剂以及信号转导通路激酶抑制剂等是与差异基因相似的药物;PPI结果显示H2AFJ、TFF1、GATA3、FOXA1、CDH1等是与乳腺癌相关的核心基因;进一步选取相关性最高的H2AFJ、TFF1两个核心基因进行GEPIA分析。分析结果显示,原发性乳腺癌细胞组织中H2AFJ与TFF1 mRNA表达显著高于正常组织,并且与原发性乳腺癌细胞患者的病理分期、总生存率以及无病生存率存在显著相关性(P<0.01);H2AFJ与TFF1可能是影响乳腺癌细胞患者生存的潜在预后生物标志物;差异表达的H2AFJ与TFF1功能主要分别与激素受体结合、上皮结构维持和基因表观遗传负调控、参与转录负调控的染色质组织等过程有关;免疫浸润结果显示,H2AFJ与TFF1的表达与巨噬细胞、中性粒细胞、单核细胞、CD4^(+)T、CD8^(+)T以及B淋巴细胞等免疫细胞的浸润存在着显著相关性;CMap结果显示吉非替尼、阿培利西、索拉菲尼、舒尼替尼等化合物对乳腺癌具有潜在的治疗作用。Western blot和RT-PCR结果显示,H2AFJ与TFF1在乳腺癌细胞中显著高表达,吉非替尼可明显抑制乳腺癌细胞中H2AFJ与TFF1的表达(P<0.05,P<0.01)。结论:本研究通过生物信息学手段筛选出乳腺细胞癌组织与正常组织间差异表达基因,明确在乳腺癌发病进程中的关键基因及具有潜在治疗效果的化合物,进一步通过实验验证了所筛选药物对乳腺癌的有效性。为今后临床针对乳腺癌的新药研发提供参考,以便开发更有效的治疗方案。 展开更多

关键词 乳腺癌 生物信息技术 差异表达基因 潜在药物 实验验证

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生物技术信息三则

18

作者 石玉磊 陈立新 丛林 《畜牧兽医科技信息》 1997年第9期10-10,共1页

1、新西兰鲁阿库拉研究中心的科研人员,利用克隆技术培育成功2只孪生羊,成为世界上第二个克隆成功羊的研究机构。目前已3个半月的孪生羊“托马斯”和“詹母斯”具有相同的脱氧核糖核酸。所采用的技术与“多利”羊不一样,是用取自冷冻胚... 1、新西兰鲁阿库拉研究中心的科研人员,利用克隆技术培育成功2只孪生羊,成为世界上第二个克隆成功羊的研究机构。目前已3个半月的孪生羊“托马斯”和“詹母斯”具有相同的脱氧核糖核酸。所采用的技术与“多利”羊不一样,是用取自冷冻胚胎的细胞培育成功的。 2、日本筑波研究学园都市,通过移植牛受精卵细胞的方法已繁殖出克隆牛,并于4月对外开放。1995年克隆2头雄性“孪生牛”和1996年克隆2头母牛。这4头克隆牛目前均健康成长。 展开更多

关键词 生物技术信息 克隆牛 骨质疏松 科研人员 冷冻胚胎 受精卵细胞 克隆技术 降钙素 对外开放 细胞培育

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哈兽研所生物技术信息二则

19

作者 江国托 卢景良 《畜牧兽医科技信息》 1995年第8期5-5,共1页

1.以鸡胚成纤维细胞培养犬瘟热病毒（CDV）S₈毒株,经蔗糖密度梯度离心纯化,电镜观察到典型的CDV粒子。纯化病毒基因组RNA,反转录并合成病毒双链F基因,将其平端连接于PUC₁₉的smaI位点,经... 1.以鸡胚成纤维细胞培养犬瘟热病毒（CDV）S₈毒株,经蔗糖密度梯度离心纯化,电镜观察到典型的CDV粒子。纯化病毒基因组RNA,反转录并合成病毒双链F基因,将其平端连接于PUC₁₉的smaI位点,经原位杂交及斑点杂交鉴定,获得重组克隆质粒。以重组克隆质粒为模板;PCR扩增CDV F基因,并将其平端插入表达质粒PBV220的smaI位点,原位杂交筛选重组表达质粒后,转化大肠杆菌细胞DH5a,获得基因工程表达菌。温度诱导外源基因在大肠杆菌中表达,菌落免疫学试验筛选到外源基因与表达载体顺向连接的工程菌后, 展开更多

关键词 生物技术信息 原位杂交 重组克隆 大肠杆菌中表达 外源基因 离心纯化 蔗糖密度梯度 斑点杂交 基因工程表达 表达载体

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基于生物信息学分析硬皮病的发病机制 被引量：2

20

作者 郭嘉 卞华 +2 位作者 陈爽 单雨 卞博 《中国医科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第9期776-782,共7页

目的通过生物信息学技术探讨硬皮病发病的相关分子机制。方法通过基因表达图谱数据库获取GSE117928芯片数据。使用R软件,|logFC|>1,调整P<0.05为过滤条件,筛选出硬皮病差异基因,然后将差异基因进行蛋白质-蛋白质相互作用网络(PPI... 目的通过生物信息学技术探讨硬皮病发病的相关分子机制。方法通过基因表达图谱数据库获取GSE117928芯片数据。使用R软件,|logFC|>1,调整P<0.05为过滤条件,筛选出硬皮病差异基因,然后将差异基因进行蛋白质-蛋白质相互作用网络(PPI)分析及基因本体(GO)功能富集分析。GSE117928芯片数据进行基因集富集分析(GSEA)通路分析和免疫细胞浸润分析,获取富集通路和免疫细胞相对含量。结果获得硬皮病差异基因722个,其中上调基因298个,下调基因424个;核心靶点包括RPS27A、BTRC、FBXO32、ZBTB16、FBXO21、VHL、ATG7、CBLB、ANAPC1、COMMD9、CSNK1E、RPS8、MPHOSPH10、KRR1、RPL5。GO富集生物功能包括中性粒细胞活化参与免疫反应、嗜中性粒细胞脱颗粒、髓系细胞分化、对脂多糖反应、积极调节防御反应等。GSEA富集通路中硬皮病组排名前五位通路包括氨基糖和核苷酸糖代谢、溶酶体、谷胱甘肽代谢、糖酵解糖异生和半乳糖代谢通路;正常对照组排名前五位通路为自然杀伤细胞介质细胞毒性、剪接体、泛素介导的蛋白水解、小细胞肺癌、T细胞受体信号通路。免疫浸润结果显示正常对照组CD8+T细胞、幼稚CD4+T细胞相对含量明显增加,而硬皮病组单核细胞相对含量明显增加。结论硬皮病的发病机制可能是通过调节RPS27A、BTRC、FBXO32、ZBTB16、FBXO21、VHL、ATG7、CBLB、ANAPC1等基因,参与中性粒细胞活化参与免疫反应、嗜中性粒细胞脱颗粒等生物过程,上调氨基糖和核苷酸糖代谢、溶酶体、谷胱甘肽代谢、糖酵解糖异生和半乳糖代谢等通路来完成的。硬皮病发病与单核细胞增多密切相关。 展开更多

关键词 硬皮病 发病机制 生物信息学技术

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