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沼泽型与河流型水牛Y染色体性别决定基因(SRY)编码区序列的比较分析 被引量:2
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作者 霍金龙 苗永旺 +2 位作者 李大林 袁峰 刘丽仙 《云南农业大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2010年第6期802-806,共5页
采用PCR产物直接测序技术对56头沼泽型水牛和26头河流型水牛Y染色体性别决定基因(SRY)的完整编码区及部分侧翼区序列进行了测定和比较分析,结果显示所有沼泽型水牛的SRY基因编码序列一致,所有河流型水牛的SRY基因编码序列也一致;但沼泽... 采用PCR产物直接测序技术对56头沼泽型水牛和26头河流型水牛Y染色体性别决定基因(SRY)的完整编码区及部分侧翼区序列进行了测定和比较分析,结果显示所有沼泽型水牛的SRY基因编码序列一致,所有河流型水牛的SRY基因编码序列也一致;但沼泽型水牛和河流型水牛之间SRY基因编码区序列相比在c.202位点存在一个G>C替换,这个碱基差异属于错义突变,导致了p.G68R,即编码的第68位氨基酸在沼泽型水牛为甘氨酸G,而在河流型水牛为精氨酸R;经群体检测确定SRY基因c.202G>C变异为沼泽型水牛和河流型水牛之间普遍存在的现象,而其他牛科物种在此位置不存在差异。本研究使用的PCR引物可以作为水牛性别鉴定的特异性引物,而发现的差异位点也可以作为区分沼泽型与河流型水牛和水牛群体雄性介导基因流检测的分子标记。 展开更多
关键词 沼泽水牛 河流型水牛 牛科 SRY基因 编码区序列
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河流型水牛热休克蛋白70的原核表达及其对精液抗冻性的影响 被引量:4
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作者 李芳芳 龙开旭 +7 位作者 俸祥仁 黄项生 潘堂峰 江明生 王国利 邓祝新 蒋钦扬 郭亚芬 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2018年第9期2417-2424,共8页
试验旨在克隆河流型水牛热休克蛋白70(heat shock protein 70,HSP70)基因的CDS区序列,构建HSP70原核表达载体,诱导表达HSP70融合蛋白,进一步研究HSP70蛋白对水牛精液抗冻性的影响。以摩拉水牛精子基因组DNA为模板,采用PCR方法扩增HSP70... 试验旨在克隆河流型水牛热休克蛋白70(heat shock protein 70,HSP70)基因的CDS区序列,构建HSP70原核表达载体,诱导表达HSP70融合蛋白,进一步研究HSP70蛋白对水牛精液抗冻性的影响。以摩拉水牛精子基因组DNA为模板,采用PCR方法扩增HSP70基因CDS区序列,将PCR产物与pET30a质粒连接构建重组原核表达质粒,诱导表达HSP70融合蛋白,将获得的表达蛋白作为稀释液组分添加到水牛精液中制作冷冻精液并评定其活力。结果显示,试验成功扩增获得HSP70基因CDS区长为2 155bp的片段;SDS-PAGE及Western blotting分析显示,在70ku处出现一条明显条带,且表达产物可与相应的抗体发生反应;对添加有HSP70蛋白的水牛冷冻精液活力评定结果显示,终浓度为2、4、8mg/mL的HSP70能提高冷冻精液活力,且8mg/mL HSP70组冻精活力最高,但各组间差异均不显著(P>0.05)。综上所述,本试验成功表达了水牛HSP70蛋白,获得了高纯度、有活性的HSP70融合蛋白,外源添加HSP70蛋白可提高水牛冷冻精液的活力,为进一步研究水牛HSP70蛋白的抗冻性保护机理奠定了理论基础。 展开更多
关键词 河流型水牛 热休克蛋白70(HSP) 原核表达 精子活力
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河流型与沼泽型水牛CSN3基因密码子使用特征分析 被引量:3
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作者 范新阳 邱立华 +3 位作者 罗国祥 张永云 滕晓红 苗永旺 《云南农业大学学报(自然科学版)》 CSCD 北大核心 2017年第2期238-245,共8页
本研究以54头河流型水牛和70头沼泽型水牛为研究对象,并以从NCBI数据库中下载的普通牛、野牦牛、野牛、绵羊、小鼠和人的序列作对照,对乳成分中重要的κ-酪蛋白(kappa casein)编码基因CSN3的密码子使用偏好性及水牛与其他物种间CSN3基... 本研究以54头河流型水牛和70头沼泽型水牛为研究对象,并以从NCBI数据库中下载的普通牛、野牦牛、野牛、绵羊、小鼠和人的序列作对照,对乳成分中重要的κ-酪蛋白(kappa casein)编码基因CSN3的密码子使用偏好性及水牛与其他物种间CSN3基因密码子使用的差异和进化关系进行了深入分析。结果表明:两种类型水牛CSN3基因密码子使用特征相似,河流型水牛CSN3基因共有26个偏好使用的密码子,而沼泽型水牛共有27个;其中,两类水牛偏好性较强的密码子均为GUU、UCA、AGU、CCA、AGG、GGU和GGA(RSCU≥2),河流型水牛对Asp的两种密码子GAU、GAC没有使用偏好性,而沼泽型水牛偏好使用GAC;河流型水牛编码Asp和Cys的同义密码子RSCU值为1,而沼泽型水牛只有编码Cys的同义密码子RSCU值为1。研究发现,所有物种CSN3基因均偏好使用以A/U结尾的密码子,但不同物种之间偏好使用密码子种类和数目均有差异。在密码子使用频率上,水牛CSN3基因与其他牛科物种的差异小于与小鼠、人的差异。密码子使用偏好聚类分析表明,河流型与沼泽型水牛亲缘关系最近,聚为一类,然后依次与其他牛、绵羊、小鼠和人等物种相聚。 展开更多
关键词 河流型水牛 沼泽水牛 牛科物种 CSN3基因 密码子偏好性 聚类分析
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水牛催乳素基因第3外显子群体遗传特征分析 被引量:2
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作者 袁峰 苗永旺 +4 位作者 李大林 刘丽仙 熊飞 刘伟 贡潘偏抽 《云南农业大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2011年第3期312-316,共5页
催乳素基因(PRL)第3外显子(exon 3)对奶牛产奶量、乳脂产量和乳蛋白产量有显著影响,但在水牛中该基因的遗传特征及其与产奶性状是否有遗传关联目前还不清楚。本研究采用PCR-SSCP并结合PCR产物直接测序技术,分析了沼泽型水牛和河流型水牛... 催乳素基因(PRL)第3外显子(exon 3)对奶牛产奶量、乳脂产量和乳蛋白产量有显著影响,但在水牛中该基因的遗传特征及其与产奶性状是否有遗传关联目前还不清楚。本研究采用PCR-SSCP并结合PCR产物直接测序技术,分析了沼泽型水牛和河流型水牛共12个群体275个个体PRL exon 3的遗传变异,结果表明:水牛PRL exon 3由108个核苷酸组成,编码36个氨基酸,在水牛群体中未检测到单核苷酸多态性位点(SNPs),PRL exon 3与水牛产奶量之间没有直接相关性。通过序列比对发现在不同物种中PRL exon 3具有高度保守性。但在PRL第2内含子(intron 2)的2 265 nt和2 335 nt分别检测到G>A突变和C>T突变,其中2 335 nt位点突变仅在2头槟榔江水牛中检测到。 展开更多
关键词 河流型水牛 沼泽水牛 催乳素 EXON 3 PCR—SSCP
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水牛ABCG2基因第9外显子群体遗传特征分析 被引量:2
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作者 李卓然 李卫真 +5 位作者 苗永旺 李大林 袁跃云 袁峰 刘丽仙 章纯熙 《云南农业大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2012年第2期188-192,197,共6页
三磷酸腺苷结合转运蛋白G超家族成员2(ABCG2)对普通奶牛泌乳性状有直接影响。水牛中该基因的遗传特征与产奶性状间是否有遗传关联目前还不十分清楚。本文采用PCR-SSCP和PCR产物直接测序相结合的技术,对4个河流型水牛群体和9个沼泽型水... 三磷酸腺苷结合转运蛋白G超家族成员2(ABCG2)对普通奶牛泌乳性状有直接影响。水牛中该基因的遗传特征与产奶性状间是否有遗传关联目前还不十分清楚。本文采用PCR-SSCP和PCR产物直接测序相结合的技术,对4个河流型水牛群体和9个沼泽型水牛群体共计466个个体的ABCG2基因第9外显子进行了变异检测。结果表明,水牛ABCG2基因第9外显子由251个核苷酸组成,所有的河流型和沼泽型水牛序列相同,未发现SNP位点,但在第9内含子内检测到1个T>C替换(g.SNP44769 T>C)。与GenBank数据库中已发表的牛科物种同源序列比对后发现,数据库中一条河流型水牛序列该外显子第66位核苷酸处有1个G>A替换(c.SNP1018 G>A),导致所编码的氨基酸发生p.V340I的改变;与普通牛、山羊和绵羊该基因第9外显子序列的核苷酸差异位点个数分别为5,8和11个,表明水牛与其他牛科物种间具有较大的遗传差异。本文结果提示ABCG2基因第9外显子在水牛中已纯化固定,且与水牛产奶量性状间无直接关联性。 展开更多
关键词 河流型水牛 沼泽水牛 三磷酸腺苷结合转运蛋白 第9外显子 PCR-SSCP
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水牛瘦素受体基因密码子使用偏好性分析 被引量:1
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作者 范新阳 欧阳依娜 +3 位作者 王鹏武 张永云 滕晓红 苗永旺 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2017年第4期1069-1078,共10页
试验选取27头河流型水牛和41头沼泽型水牛,以从NCBI数据库中下载的家牛、野牦牛、野牛、绵羊、山羊、小鼠和人的序列作对照,对编码瘦素受体(leptin receptor,LEPR)基因的密码子偏好性及水牛与其他物种间密码子使用的差异和进化关系进行... 试验选取27头河流型水牛和41头沼泽型水牛,以从NCBI数据库中下载的家牛、野牦牛、野牛、绵羊、山羊、小鼠和人的序列作对照,对编码瘦素受体(leptin receptor,LEPR)基因的密码子偏好性及水牛与其他物种间密码子使用的差异和进化关系进行了深入分析。结果发现,所有的密码子在河流型水牛和沼泽型水牛LEPR基因中均有使用,两种类型水牛偏好使用的密码子有28个,其中使用偏好性较强的密码子为AGA(RSCU≥2),表明河流型水牛和沼泽型水牛LEPR基因密码子使用特征相似。水牛及参考物种LEPR基因均偏好使用以A/U结尾的密码子,但水牛与其他参考物种间偏好使用密码子的种类和数目有差异。密码子使用偏好聚类分析表明,河流型水牛与沼泽型水牛亲缘关系最近,先聚为一类,然后与家牛、野牦牛和野牛聚为一类,再与绵羊、山羊、小鼠和人等物种聚为一类。在密码子使用频率上,河流型水牛LEPR基因与酵母密码子偏好性差异小于与大肠杆菌和小鼠密码子偏好性差异,从而揭示酵母更适合作为水牛LEPR基因的外源表达系统。 展开更多
关键词 河流型水牛 沼泽水牛 LEPR基因 密码子使用偏好性
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水牛β-LG基因3,4外显子遗传特征分析
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作者 祁宏 李卫真 +4 位作者 袁峰 李大林 刘丽仙 钱坤 苗永旺 《云南农业大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2011年第1期34-40,共7页
本文通过PCR产物直接测序法得到水牛β-LG基因第3,4外显子及其旁侧序列后,采用PCR-RFLP和PCR-SSCP方法对属于10个群体的224头水牛该基因第4外显子进行了多态性检测,又从中随机抽取属于9个群体的69头水牛采用PCR-SSCP结合测序的方法检测... 本文通过PCR产物直接测序法得到水牛β-LG基因第3,4外显子及其旁侧序列后,采用PCR-RFLP和PCR-SSCP方法对属于10个群体的224头水牛该基因第4外显子进行了多态性检测,又从中随机抽取属于9个群体的69头水牛采用PCR-SSCP结合测序的方法检测了其第3外显子的遗传多态性。结果显示:河流型水牛和沼泽型水牛β-LG基因的第3外显子均为74 bp;它们的第4外显子均为111 bp;在所研究群体中,两类水牛第3,4外显子序列完全相同,并未发现具有多态现象。与牛科物种同源序列比较显示:水牛β-LG基因3,4外显子在进化上比较保守,相应于普通牛的B等位基因。由于产奶量有明显差异的河流型水牛与沼泽型水牛的β-LG基因第3,4外显子序列间无差异,提示它们对水牛产奶量无直接影响。 展开更多
关键词 河流型水牛 沼泽水牛 β-LG基因 PCR-RFLP PCR-SSCP
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科学家培育亚种间克隆水牛出生半月情况良好
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《北方牧业》 2008年第2期12-12,共1页
记者1月16日从广西水牛研究所获悉,1月1日出生的首例亚种间克隆水牛,目前状况良好。 广西水牛研究所的科学家利用水牛的两个亚种,即河流型水牛和沼泽型水牛,克隆出发育正常、健康的亚种间水牛。
关键词 沼泽水牛 亚种间 科学家 克隆 培育 河流型水牛 研究所 广西
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