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猪2、7和8号染色体上影响血常规指标的数量性状基因座(QTL)检测
被引量:
5
1
作者
巩元芳
卢昕
+3 位作者
王志鹏
李珊
邱小田
张勤
《生物化学与生物物理进展》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2008年第11期1291-1297,共7页
以3个品种(长白猪、大白猪、松辽黑猪)16个公猪家系共计368头仔猪组成资源群体,在猪2、7和8号染色体上共选取35个微卫星标记,采用基于线性混合模型的方差组分分析方法,对影响与猪白细胞、红细胞和血小板相关的共计18项血常规指标的数量...
以3个品种(长白猪、大白猪、松辽黑猪)16个公猪家系共计368头仔猪组成资源群体,在猪2、7和8号染色体上共选取35个微卫星标记,采用基于线性混合模型的方差组分分析方法,对影响与猪白细胞、红细胞和血小板相关的共计18项血常规指标的数量性状基因座(quantitative trait loci,QTL)进行了检测.通过似然比检验,并以自由度为2的卡方分布作为检验统计量的分布,共发现22个在P<5%水平下显著的QTL,其中在2号染色体上有9个,分别影响白细胞总数、中性粒细胞数、平均红细胞体积、血红蛋白含量、平均红细胞血红蛋白浓度、血小板总数、平均血小板体积、血小板分布宽度和血小板压积,在7号染色体有7个,分别影响白细胞总数、中性粒细胞数、平均红细胞血红蛋白浓度、血红蛋白含量、血小板总数、平均红细胞体积和红细胞分布宽度变异,在8号染色体上有6个,分别影响中性粒细胞百分比、淋巴细胞百分比、平均红细胞血红蛋白浓度、血小板总数、血小板压积和平均红细胞体积.为尽可能地避免由于多重检验所造成的假阳性率的升高,我们采用了控制假检出率(false discovery rate,FDR)的方法来对这22个QTL进行进一步检验,发现有14个达到FDR<5%显著水平,其中又有9个达到FDR<1%显著水平.
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关键词
猪
血常规指标
数量性状基因座(QTL)
方差组分分析
假检出率(FDR)
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职称材料
题名
猪2、7和8号染色体上影响血常规指标的数量性状基因座(QTL)检测
被引量:
5
1
作者
巩元芳
卢昕
王志鹏
李珊
邱小田
张勤
机构
农业生物技术国家重点实验室
河北科技师范学院动物科学系
出处
《生物化学与生物物理进展》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2008年第11期1291-1297,共7页
基金
国家重点基础研究发展计划资助项目(2006CB102104)~~
文摘
以3个品种(长白猪、大白猪、松辽黑猪)16个公猪家系共计368头仔猪组成资源群体,在猪2、7和8号染色体上共选取35个微卫星标记,采用基于线性混合模型的方差组分分析方法,对影响与猪白细胞、红细胞和血小板相关的共计18项血常规指标的数量性状基因座(quantitative trait loci,QTL)进行了检测.通过似然比检验,并以自由度为2的卡方分布作为检验统计量的分布,共发现22个在P<5%水平下显著的QTL,其中在2号染色体上有9个,分别影响白细胞总数、中性粒细胞数、平均红细胞体积、血红蛋白含量、平均红细胞血红蛋白浓度、血小板总数、平均血小板体积、血小板分布宽度和血小板压积,在7号染色体有7个,分别影响白细胞总数、中性粒细胞数、平均红细胞血红蛋白浓度、血红蛋白含量、血小板总数、平均红细胞体积和红细胞分布宽度变异,在8号染色体上有6个,分别影响中性粒细胞百分比、淋巴细胞百分比、平均红细胞血红蛋白浓度、血小板总数、血小板压积和平均红细胞体积.为尽可能地避免由于多重检验所造成的假阳性率的升高,我们采用了控制假检出率(false discovery rate,FDR)的方法来对这22个QTL进行进一步检验,发现有14个达到FDR<5%显著水平,其中又有9个达到FDR<1%显著水平.
关键词
猪
血常规指标
数量性状基因座(QTL)
方差组分分析
假检出率(FDR)
Keywords
pig, haematological traits, QTL, variance components analysis, FDR
分类号
Q348 [生物学—遗传学]
S828.2 [农业科学—畜牧学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
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1
猪2、7和8号染色体上影响血常规指标的数量性状基因座(QTL)检测
巩元芳
卢昕
王志鹏
李珊
邱小田
张勤
《生物化学与生物物理进展》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2008
5
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参考文献
引证文献
统计分析
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