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控制水稻柱头外露率的数量性状基因座初步分析 被引量:6
1
作者 邓应德 应杰政 +2 位作者 石媛媛 肖层林 张海清 《湖南农业大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2010年第4期373-376,共4页
为研究柱头外露率的遗传机理,用柱头外露率低的粳稻品种糯5号与柱头外露率高的籼稻品种优ⅠB构建包含190株的F2群体.在长沙对各单株进行柱头外露率调查,并用均匀覆盖水稻整个基因组的92个SSR标记构建连锁遗传图谱,进行控制柱头外露率的... 为研究柱头外露率的遗传机理,用柱头外露率低的粳稻品种糯5号与柱头外露率高的籼稻品种优ⅠB构建包含190株的F2群体.在长沙对各单株进行柱头外露率调查,并用均匀覆盖水稻整个基因组的92个SSR标记构建连锁遗传图谱,进行控制柱头外露率的数量性状基因座QTL分析.结果表明,控制柱头外露率的3个QTL为qPES-2、qPES-5、qSPES-8,分别位于第2染色体的RM1285~RM12595、第5染色体的RM17952~RM18114、第8染色体的RM8020~RM7080,QTL的LOD峰值分别为3.54、4.79、3.85,解释的表型变异分别为10.1%、11.1%、9.0%,增效基因皆来源于高柱头外露率的亲本优ⅠB.研究并发现控制单边柱头外露率的QTL与总外露率的完全一致,第5染色体检测到的QTL是1个新的座位. 展开更多
关键词 水稻 柱头外露率 数量性状基因
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运用混合线性模型定位复杂数量性状基因的方法 被引量:76
2
作者 朱军 《浙江大学学报(自然科学版)》 CSCD 1999年第3期327-335,共9页
运用混合线性模型分析原理,提出了复杂数量性状基因定位的方法,可以分析QTL复杂的遗传效应及QTL×环境互作效应.采用混合线性模型随机效应的无偏预测方法,可以预测基因型值和基因型×环境互作效应值,再运用区间作图... 运用混合线性模型分析原理,提出了复杂数量性状基因定位的方法,可以分析QTL复杂的遗传效应及QTL×环境互作效应.采用混合线性模型随机效应的无偏预测方法,可以预测基因型值和基因型×环境互作效应值,再运用区间作图法或复合区间作图法间接分析QTL的加性、显性遗传主效应及其与环境的互作效应,还能定位在特定发育阶段表达的QTL.基于混合模型的复合区间作图法(MCIM法)可以分析多环境的遗传实验资料,直接分析包括上位性效应的遗传主效应及其与环境的互作效应.Markov链蒙特卡罗(MCMC)分析方法可用于推断QTL的统计特征. 展开更多
关键词 数量性状基因 混合线性模型 数量遗传 基因定位
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候选基因法检测家畜数量性状基因位点的研究与应用 被引量:10
3
作者 徐宁迎 《浙江农业学报》 CSCD 1999年第5期266-270,共5页
对候选基因法的研究过程作了详细介绍,并讨论了其优缺点,指出候选基因法是检测家畜数量性状基因位点的主要方法之一。
关键词 候选基因 数量性状基因位点 家畜基因组分析
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甜菜重要农艺性状的数量性状基因座(QTL)研究进展
4
作者 张子义 田自华 《中国糖料》 2004年第1期39-41,共3页
阐述了农作物数量性状基因座(QTL)在遗传育种中的地位和意义,介绍了作物QTL的基本原理和方法及在甜菜上的研究进展。
关键词 甜菜 数量性状基因座(QTL) 分子标记
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数量性状基因座定位与家蚕育种
5
作者 吴萍 李奕仁 沈兴家 《中国蚕业》 2004年第4期4-7,共4页
传统的育种方法一般根据数量遗传学的原理和方法,对育种亲本及后代进行适当的选种选配,以提高育种群的优良基因频率,降低不良基因频率,从而达到改良经济性状的目的.数量性状基因座(Quantity Trait Locus QTL)一改传统数量遗传学将控制... 传统的育种方法一般根据数量遗传学的原理和方法,对育种亲本及后代进行适当的选种选配,以提高育种群的优良基因频率,降低不良基因频率,从而达到改良经济性状的目的.数量性状基因座(Quantity Trait Locus QTL)一改传统数量遗传学将控制某个数量性状的多个基因作为一个整体来研究的方法,直接将研究目标指向各个基因座,借助各种遗传标记,通过统计学处理,将影响数量性状的多个基因剖分开来,使其定位于特定的染色体上,确定它们与其它基因的关系,最终还将分析出其DNA序列.这样,就可以充分利用先进的分子生物学技术对数量性状进行遗传操纵.QTL一经提出即受到育种家们的高度重视并成为研究热点,目前在植物和畜禽中的研究较为广泛并取得可喜的进展,但在蚕的研究中尚处于萌芽阶段.本文就QTL有关的原理、定位方法及在家蚕中的研究情况作一概述. 展开更多
关键词 育种方法 数量遗传学 数量性状基因 家蚕 选种 QTL 经济性状 基因频率 统计学处理 改良
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拷贝数变异全基因组关联分析及数量性状基因座定位联合鉴定猪体高性状候选基因 被引量:2
6
作者 欧阳峰正 王立刚 +5 位作者 岳静伟 颜华 张龙超 侯欣华 刘欣 王立贤 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第7期1515-1524,共10页
旨在利用全基因组拷贝数变异区域(copy number variation regions,CNVRs)关联分析以及全基因组数量性状基因座(quantitative trait locus,QTLs)定位联合筛选出影响猪体高性状的候选基因。本研究利用快速检测基因组拷贝数变异软件CNVcal... 旨在利用全基因组拷贝数变异区域(copy number variation regions,CNVRs)关联分析以及全基因组数量性状基因座(quantitative trait locus,QTLs)定位联合筛选出影响猪体高性状的候选基因。本研究利用快速检测基因组拷贝数变异软件CNVcaller对本实验室构建的大白×民猪F2代资源群体的重测序数据进行拷贝数变异检测。利用混合线性模型(mixed-linear model,MLM)将性别和胎次作为固定效应对体高性状进行拷贝数变异全基因组关联分析(CNVR-GWAS)。采用软件R/qtl进行QTL分析,并使用置换检验(permutation test,PT)进行检验。将CNVR-GWAS与QTL结果进行联合注释,结合GO富集和KEGG通路分析,对影响猪体高的位点和基因进行挖掘。利用实时荧光定量PCR(qPCR)方法验证候选基因。结果表明,本群体在全基因组范围内共有3099个CNVRs,其中有两个CNVRs与体高性状在全基因组范围内显著相关,分别位于7号染色体的25358001~26696400 bp处(CNVR1)和54087201~54090000 bp处(CNVR2)。在混合线性模型分析的结果中发现,CNVR1拷贝数增加(P<0.01)和CNVR2拷贝数缺失(P<0.01)对猪的体高性状具有显著影响。基因组显著水平可找到2个显著影响猪体高的QTLs,分别为BH-1和BH-2,其中BH-2对体高性状的影响较大。CNVR1和BH-2重叠区存在1个嗅觉受体基因OR12D3和18个未被注释的基因。qPCR验证OR12D3的拷贝数变异与利用混合线性模型统计推断出的结果一致。初步推测,OR12D3基因的拷贝数变异可能与猪体高性状相关。 展开更多
关键词 大白×民猪F2代猪群体 拷贝数变异 数量性状基因 体高 基因组关联分析
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影响衰老的基因:采用AFLPs定位黑腹果蝇的数量性状基因座
7
作者 LuckinbillLS 储明星 邓学梅 《中国畜牧兽医》 CAS 2003年第6期23-23,共1页
本研究检验了扩增片段长度多态性(AFLPs)在定位寿命的数量性状基因座(QTL)中的应用。用来自黑腹果蝇中选种群的长寿和短寿近交系回交,寿命的度量被绘制成一种分布。从该分布的极端中筛选出与长寿相关的AFLP标记。为了检验它们与进一步... 本研究检验了扩增片段长度多态性(AFLPs)在定位寿命的数量性状基因座(QTL)中的应用。用来自黑腹果蝇中选种群的长寿和短寿近交系回交,寿命的度量被绘制成一种分布。从该分布的极端中筛选出与长寿相关的AFLP标记。为了检验它们与进一步重组的相关,第2个F1代又回交了3个世代并进行了度量。 展开更多
关键词 AFLP标记 回交 数量性状基因 选种 QTL 世代 分布 长寿 黑腹果蝇 衰老
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鸡抗球虫病数量性状基因座的精确定位
8
作者 袁峥嵘 E-S.Kim +2 位作者 Y.H.Hong W.Min H.S.Lillehoj 《国外畜牧学(猪与禽)》 2007年第5期29-30,共2页
利用两个对球虫病具有不同易感性的纯系商品肉鸡,对与先前研究中已被识别的LEI0101标记(位于1号染色体的259cM处)有关的QTL进行精确定位。结果表明,该QTL遗传位点与抗病性显著相关。利用另外8个与LEI0101标记连锁的微卫星遗传标记对F1... 利用两个对球虫病具有不同易感性的纯系商品肉鸡,对与先前研究中已被识别的LEI0101标记(位于1号染色体的259cM处)有关的QTL进行精确定位。结果表明,该QTL遗传位点与抗病性显著相关。利用另外8个与LEI0101标记连锁的微卫星遗传标记对F1代亲本和F2代雏鸡(n=314)进行基因分型,然后在实验性感染巨型艾美耳球虫的鸡群中,测定它们与球虫卵囊排出的关系(作为抗病性的一个标记)。对4个家系的单点分析后表明,除了位于242cM处的LEI0101标记(LOD值为2.45)之外,其余所有标记基因座的LOD值均大于0.5。多点分析证明最大LOD值(3.74)在标记LEZ0071和标记LEI0101(位于245cM处)之间。通过连锁分析将LEI0071标记定位于LEI0101标记附近,但是其物理定位仍没有确定。为确定这些标记或其它标记的物理定位而采取的进一步研究将允许采用借助单核苷酸多态性标记的联合定位技术。 展开更多
关键词 精确定位 数量性状基因座(QTL) 疾病抗性 球虫病
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自然储存条件下水稻种子耐储藏性状QTL的定位
9
作者 陈文凤 黄浩 +9 位作者 丁晓雯 林晋军 姚威 陈倩茹 黄希来 刘雄伦 吴俊 陈哲红 程计华 刘金灵 《湖南农业大学学报(自然科学版)》 北大核心 2025年第2期1-5,35,共6页
为了筛选出新的水稻耐储藏种质,以在自然条件下储存4年的由粳稻‘魔王谷’(MWG)和籼稻‘CO39’杂交后代衍生的重组自交系群体种子为材料,对群体种子发芽表型进行分析,并利用复合区间作图法对该群体种子耐储藏性状QTL进行定位。结果表明:... 为了筛选出新的水稻耐储藏种质,以在自然条件下储存4年的由粳稻‘魔王谷’(MWG)和籼稻‘CO39’杂交后代衍生的重组自交系群体种子为材料,对群体种子发芽表型进行分析,并利用复合区间作图法对该群体种子耐储藏性状QTL进行定位。结果表明:101份重组自交系中,67%的株系种子的发芽率、发芽势和发芽指数为0,其余株系3个发芽性状指标分别为0~82.67%、0~46.00%和0~6.48;鉴定到1个发芽率达82.67%的高耐储株系;QTL分析定位到3个控制发芽性状(发芽率、发芽势、发芽指数)的QTL,分别为qGR7、q GP7和qGI7,其中qGR7位于SSR标记RM6344与RM5720区间18.43c M的区域,qGP7和qGI7均位于标记RM5672与RM8261区间35.74 cM的区域,3个QTL的LOD值为2.52~2.56,表型贡献率为12.02%~12.22%。 展开更多
关键词 水稻 耐储藏性 重组自交系群体 数量性状基因位点 基因定位
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猪重要性状全基因组关联分析的研究进展 被引量:9
10
作者 赵谦 浦亚斌 +2 位作者 关伟军 赵倩君 马月辉 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第6期873-881,共9页
全基因组关联分析(Genome-wide association study,GWAS)是在关联分析的基础上对全基因组范围内的遗传标记进行检测,以研究复杂疾病和性状遗传的一种有效方法。国内外许多研究人员针对猪重要性状展开GWAS,鉴定出大量单核苷酸多态性(Sing... 全基因组关联分析(Genome-wide association study,GWAS)是在关联分析的基础上对全基因组范围内的遗传标记进行检测,以研究复杂疾病和性状遗传的一种有效方法。国内外许多研究人员针对猪重要性状展开GWAS,鉴定出大量单核苷酸多态性(Single nucleotide polymorphism,SNP)标记、数量性状基因座(Quantitative trait locus,QTL)和候选基因为猪育种提供必要的分子基础,同时有助于后续相关功能基因的研究和数量性状核苷酸(Quantitative trait nucleotide,QTN)的鉴定。本文主要对GWAS在猪重要性状上的研究进展进行综述,同时简单介绍猪重要性状QTN的研究进展。 展开更多
关键词 基因组关联分析(GWAS) 单核苷酸多态性(SNP) 数量性状基因座(QTL) 数量性状核苷酸(QTN)
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水稻数量性状研究进展 被引量:6
11
作者 封功能 张雪梅 +1 位作者 仇明 骆爱兰 《安徽农业科学》 CAS 2004年第6期1231-1234,共4页
分子生物技术的迅速发展和QTL定位方法的日趋完善 ,为水稻数量性状基因 (QTL)的研究提供了基础。大量研究充分地揭示了QTL的基本特征 ,剖析了重要农艺性状的遗传基础 ,从而给水稻品种的遗传改良带来了新的方法。笔者从QTL的定位群体、... 分子生物技术的迅速发展和QTL定位方法的日趋完善 ,为水稻数量性状基因 (QTL)的研究提供了基础。大量研究充分地揭示了QTL的基本特征 ,剖析了重要农艺性状的遗传基础 ,从而给水稻品种的遗传改良带来了新的方法。笔者从QTL的定位群体、定位方法、研究现状 ,以及QTL利用等方面 ,对作物数量性状基因的研究进行了综述 ,并对今后的研究提出了一些见解。 展开更多
关键词 水稻 数量性状基因 分子标记 标记辅助选择
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二倍体数量性状QTL定位方法 被引量:1
12
作者 王伟 贺杰 +1 位作者 崔秀珍 李哲 《安徽农业科学》 CAS 北大核心 2009年第13期5879-5882,共4页
论述了数量性状基因(quantitative trait locus,QTL)定位方法的产生与发展,并总结了每种方法的优缺点,特别是对区间作图方法和复合区间作图方法进行了较详细的介绍。
关键词 数量性状基因 区间作图 复合区间作图
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基于汕优63重组自交系群体的数量性状遗传剖析
13
作者 吴雯雯 陆兵 《浙江农业学报》 CSCD 北大核心 2014年第2期268-273,共6页
以水稻汕优63衍生的241个重组自交系为供试材料,构建包括221个主效应以及两两标记间221×(221-1)/2=24 310个上位性效应在内的超饱和统计遗传模型。分别采用E-BAYES,Stepwise,PENAL,LASSO和SSVS 5种超饱和模型分析方法对该群体进行... 以水稻汕优63衍生的241个重组自交系为供试材料,构建包括221个主效应以及两两标记间221×(221-1)/2=24 310个上位性效应在内的超饱和统计遗传模型。分别采用E-BAYES,Stepwise,PENAL,LASSO和SSVS 5种超饱和模型分析方法对该群体进行模拟试验,获得最优的分析方法 E-BAYES,并用该方法对该群体的10个农艺性状进行QTL分析,共检测到73个QTL,分布于水稻的12条染色体上,进一步证实该强优势籼型杂交组合的遗传构成。 展开更多
关键词 汕优63 数量性状基因 遗传构成 超饱和模型 变量选择法
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水稻数量性状定位研究进展
14
作者 谢辉 东丽 +6 位作者 肖艳云 李志彬 刘欣 蔡卓 亓娜 朱崴 刘桂林 《园艺与种苗》 CAS 2015年第6期82-87,共6页
20世纪80年代以来,DNA标记技术的诞生给数量性状的遗传研究带来了革命性的变化。分子生物学的快速发展和数量性状(QTL)定位技术的逐渐完善,为水稻的QTL研究提供了技术支撑。已有大量的研究表述和发现了QTL的特征特性,阐述了一些重要农... 20世纪80年代以来,DNA标记技术的诞生给数量性状的遗传研究带来了革命性的变化。分子生物学的快速发展和数量性状(QTL)定位技术的逐渐完善,为水稻的QTL研究提供了技术支撑。已有大量的研究表述和发现了QTL的特征特性,阐述了一些重要农艺性状的遗传理论基础,从而使水稻的育种遗传改良获得新方法、新手段。从QTL的定位群体、定位方法以及水稻QTL的研究现状和利用等方面,对水稻数量性状基因的研究进行了综述,并对今后的研究提出了一些分析。 展开更多
关键词 水稻 数量性状基因 分子标记 标记辅助选择
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小麦磷素利用效率的基因位点及其交互作用 被引量:24
15
作者 曹卫东 贾继增 金继运 《植物营养与肥料学报》 CAS CSCD 北大核心 2001年第3期285-292,共8页
利用小麦W7984和Opata85作亲本 ,通过一粒传而获得F7重组近交系 (RIL)群体。对该群体的 1 1 4个株系分别在正常供磷和低磷胁迫下探讨小麦地上部磷素利用效率 (SPUE)和全株磷素利用效率 (WPUE) ;并根据该群体而构建的遗传图谱包括覆盖整... 利用小麦W7984和Opata85作亲本 ,通过一粒传而获得F7重组近交系 (RIL)群体。对该群体的 1 1 4个株系分别在正常供磷和低磷胁迫下探讨小麦地上部磷素利用效率 (SPUE)和全株磷素利用效率 (WPUE) ;并根据该群体而构建的遗传图谱包括覆盖整个染色体组的 91 8个RFLP标记 ,研究 2种供磷情况下小麦磷素利用效率的基因位点及基因间互作。结果表明 ,正常供磷 ,有 2个与SPUE有关的QTL ,分别位于染色体 1B和 5A上 ,变异解释率分别为 6 55 %和 1 1 61 % ;与WPUE有关的QTL有位于染色体 2B、5A和 7A上的 3个 ;SPUE和WPUE还分别受一对互作位点的影响。在磷胁迫下 ,有 3个QTL与SPUE有关 ,分别位于染色体 2D、3B和6D上 ,变异解释率分别为 1 4 2 %、7 73%和 6 58% ;与WPUE相关的 2个QTL分别位于染色体 2D、7A上 ,变异解释率分别为 1 8 0 1 %和 1 0 73 % ;SPUE受上位效应的影响。 7A染色体对于小麦的磷素利用效率有着重要的作用 ,位于该染色体上的片段Xfba354 Xfba69在 2种供磷情况下都显著影响WPUE ,同时此片段在正常供磷下还与其它基因互作而影响WPUE。此外 ,5A染色体在正常供磷、2D染色体在低磷胁迫下分别对磷素利用效率 (PUE)有较强的作用。 展开更多
关键词 小麦 磷素利用效率 RFLP标记 数量性状基因位点 上位效应
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甜瓜PI390452霜霉病抗性基因的QTL定位 被引量:6
16
作者 张学军 宁雪飞 +3 位作者 杨永 李寐华 王贤磊 伊鸿平 《新疆农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2016年第12期2157-2165,共9页
【目的】研究甜瓜抗霜霉病资源PI390452,分析PI390452抗性遗传规律,并对抗病基因进行QTL定位分析,为甜瓜抗霜霉病分子辅助育种奠定基础。【方法】用甜瓜霜霉病病原菌[Pseudoperonospora cubensis(Berk.et Curt.)Rostov.]对PI390452×... 【目的】研究甜瓜抗霜霉病资源PI390452,分析PI390452抗性遗传规律,并对抗病基因进行QTL定位分析,为甜瓜抗霜霉病分子辅助育种奠定基础。【方法】用甜瓜霜霉病病原菌[Pseudoperonospora cubensis(Berk.et Curt.)Rostov.]对PI390452×卡拉克赛(高感霜霉病)杂交后代F2分离群体及F2∶3家系人工接种鉴定,以F2分离群体为研究对象,基于ICu GI已构建对应分子标记连锁图谱,应用BSA法和1 090对甜瓜SSR引物进行连锁遗传分析,采用QTL Ici Mapping软件定位霜霉病QTL位点。【结果】资源PI390452霜霉病抗性符合数量性状遗传的特点。共检测到3个霜霉病抗性基因的QTL位点qR1-1-1、qR1-3-1、qR2-2-1,分别位于chr-5、chr-10、chr-9上,qR2-2-1表型变异率最大为80.84%。【结论】位于chr-9上的qR2-2-1是控制甜瓜霜霉病主效QTL位点,为甜瓜抗霜霉病分子标记辅助育种、抗病基因精细定位、克隆提供了技术支持。 展开更多
关键词 甜瓜 霜霉病 数量性状基因(QTL) SSR分子标记
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不同生长环境下水稻氮、磷、钾利用相关性状的QTL定位分析 被引量:6
17
作者 杨树明 曾亚文 +3 位作者 王荔 杜娟 普晓英 杨涛 《植物营养与肥料学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第4期823-835,共13页
【目的】鉴定影响水稻氮、磷、钾利用相关性状的QTL,为开展水稻养分高效利用分子标记辅助选择育种和肥高效基因的图位克隆提供依据。【方法】以云南强耐冷(2级)粳稻地方品种丽江新团黑谷与十和田杂交、回交获包含105个株系的孕穗期耐... 【目的】鉴定影响水稻氮、磷、钾利用相关性状的QTL,为开展水稻养分高效利用分子标记辅助选择育种和肥高效基因的图位克隆提供依据。【方法】以云南强耐冷(2级)粳稻地方品种丽江新团黑谷与十和田杂交、回交获包含105个株系的孕穗期耐冷性近等基因系BC4F8及双亲为材料,在云南白邑(冷水胁迫)、寻甸(自然低温胁迫)和玉溪(正常生长环境)3种生长环境下进行水稻氮、磷、钾养分吸收相关性状的鉴定,并利用构建的含有180个SSR标记,全长为1820.6 c M,标记间平均距离为15.67 c M的遗传图谱,用基于完备区间作图法的QTL Ici Mapping V3.2软件对16个性状进行QTL定位分析。【结果】3种环境下共检测到56个QTL,分布在第1、2、3、4、5、6、7、9和10染色体上,单个性状QTL数为1-10个,单个QTL可解释的各自性状表型贡献率为8.88%-35.30%。其中,氮、磷、钾利用效率QTLs数分别为12个、27个和17个。而q TNA-1a、q TPA-1、q PHI-1、q PHI-6、q PHI-7b和q KHI-6共6个QTL在冷害和正常环境下均能检测到,稳定性较高,其贡献率变幅为10.63%-31.57%。在第1、3、4、5、6、7和10染色体上有13个标记区域存在QTL成族分布,单个QTL位点控制的性状数为2-5个,其中共同控制磷总吸收量、磷素干物质生产效率、磷素收获指数、每100 kg籽粒需钾量和钾素收获指数等性状的位点数最多。【结论】获得56个影响氮、磷、钾利用相关性状的QTL,且发现的13个QTL富集区可作为水稻氮、磷、钾高效利用分子育种的重要候选区域。 展开更多
关键词 水稻(Oryza SATIVA L.) 近等基因 养分吸收 数量性状基因 QTL多效性
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通过条件QTL定位分析油菜不同脂肪酸组分对含油量性状的影响 被引量:6
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作者 王继变 陈洪成 +3 位作者 陈玉波 张晓玉 徐海明 赵坚义 《浙江大学学报(农业与生命科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2013年第5期504-512,共9页
利用先前构建的Sollux/Gaoyou DH群体在4种环境下的表型结果和最新遗传图谱,通过条件和非条件QTL定位剖析油菜种子4种主要脂肪酸含量与含油量之间的遗传相关.结果显示,检测到的所有主效、上位性和环境互作QTL效应值均较小,但主效QTL都... 利用先前构建的Sollux/Gaoyou DH群体在4种环境下的表型结果和最新遗传图谱,通过条件和非条件QTL定位剖析油菜种子4种主要脂肪酸含量与含油量之间的遗传相关.结果显示,检测到的所有主效、上位性和环境互作QTL效应值均较小,但主效QTL都达到极显著水平(P<0.01).分别检测到7、10、10和5个芥酸、油酸、亚油酸和亚麻酸QTL位点,其中位于A2、A7、A9和C1上的芥酸,C7和A9上的油酸和亚麻酸以及A4、A10、C6、C7和C9上的亚油酸位点为新检测出的微效QTL.条件QTL定位结果表明,OilA9、OilC2和OilC8-1受亚油酸影响较大.OilA4同时受油酸、亚麻酸和芥酸的影响,OilA1、OilA7和OilC8-2所在区间可能存在控制油酸含量的微效基因,对含油量起调控作用.另外,还检测出4个效应值更小的条件QTL新位点,进一步说明含油量性状的复杂性和难以操控性.检出的芥酸和3个18碳脂肪酸的QTL数量远多于已有在芥酸分离群体中定位到的QTL,但效应值均较小,表明在无主效芥酸等位基因分离情况下,使控制芥酸和3种18碳脂肪酸的众多微效基因得以表达.通过标志辅助聚合微效高芥酸等位基因可能对选育工业专用高芥酸油菜品种具有特殊意义,通过标志辅助选择OilA7和OilC8位点的高含油量等位基因可同步提高种子中油酸含量. 展开更多
关键词 甘蓝型油菜 含油量 脂肪酸 数量性状基因 条件QTL定位
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水稻低温发芽力QTL qLTG3-1基因内分子标记的开发及其在华南籼稻中的应用评价 被引量:7
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作者 杨梯丰 张子怡 +4 位作者 董景芳 周炼 张少红 刘斌 赵均良 《广东农业科学》 CAS 2021年第10期32-41,共10页
【目的】挖掘低温发芽力优异基因并加以应用,将是水稻低温发芽力育种取得突破的关键。找到功能基因后,利用连锁或基因内的分子标记开展分子标记辅助选择,将极大提高育种过程中性状选择的效率和准确性。【方法】qLTG3-1(Os03g0103300)是... 【目的】挖掘低温发芽力优异基因并加以应用,将是水稻低温发芽力育种取得突破的关键。找到功能基因后,利用连锁或基因内的分子标记开展分子标记辅助选择,将极大提高育种过程中性状选择的效率和准确性。【方法】qLTG3-1(Os03g0103300)是最早被克隆的低温发芽力QTL,存在丰富的等位基因变异。设计合适的分子标记对该基因进行分型,并评价其基因型在华南籼稻中与低温发芽力的关系,将有利于在华南稻区利用该基因开展低温发芽力的分子育种。【结果】依据在qLTG3-1中广泛存在的18 bp变异,设计了基因内分子标记Gltg3-1,该标记能特异区分qLTG3-1等位基因之间的18 bp差异;利用该标记对111份华南籼稻进行基因型鉴定,扩增结果为D带型(有18 bp缺失)有51份,R带型(无18 bp缺失)有53份,还有7份为杂合型。依据带型将水稻品种/系分为2组,统计2组品种/系的低温发芽力差异,结果表明组间无显著差异。由于在籼稻中无法根据qLTG3-1的18 bp变异判定低温发芽力的强弱,因此在水稻品种改良中需要对不同供体来源的qLTG3-1等位基因的效应进行评价。通过对单片段代换系的低温发芽力鉴定发现,来源于南洋占的qLTG3-1能显著提高华粳籼74的低温发芽力。【结论】在qLTG3-1中广泛存在的18 bp变异与低温发芽力无对应关系;来源于南洋占的qLTG3-1可用于提高水稻低温发芽力的改良,用分子标记Gltg3-1可以在杂交后代中准确地选择目标基因。 展开更多
关键词 分子标记 数量性状基因座位 分子标记辅助选择 低温发芽力 qLTG3-1 水稻
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玉米SSR连锁图谱构建及抗纹枯病基因定位 被引量:13
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作者 赵茂俊 张志明 +3 位作者 张世煌 李晚忱 Maria Luz C.George 潘光堂 《高技术通讯》 CAS CSCD 北大核心 2005年第5期71-76,共6页
以玉米自交系R15(抗)×478(感)的F2分离群体(229个单株)为作图群体,构建了包含146个SSR标记位点的遗传连锁图谱,覆盖玉米基因组1666 cM,平均图距11.4 cM.通过麦粒嵌入法对229个F2∶4家系进行人工接种纹枯病菌,并采用相对病斑高(绝... 以玉米自交系R15(抗)×478(感)的F2分离群体(229个单株)为作图群体,构建了包含146个SSR标记位点的遗传连锁图谱,覆盖玉米基因组1666 cM,平均图距11.4 cM.通过麦粒嵌入法对229个F2∶4家系进行人工接种纹枯病菌,并采用相对病斑高(绝对病斑高除以穗位高)划分病级标准进行玉米纹枯病的抗性鉴定.应用复合区间作图法分析抗病QTL(数量性状基因座位)及遗传效应.结果共检测到6个抗性QTL,分别位于第2、6、10染色体上,与标记Umc2110、Bnlg1606、Umc2110、Bnlg1538、Umc1257和Phi054连锁,各自可解释表型变异的10.35%、4.09%、8.33%、 5.18%、5.12%和4.18%.这些抗性QTL与控制株高和穗位高的基因之间表现为独立遗传. 展开更多
关键词 SSR 基因定位 图谱构建 数量性状基因座位 复合区间作图法 遗传连锁图谱 玉米自交系 玉米纹枯病 QTL 作图群体 分离群体 标记位点 纹枯病菌 人工接种 抗性鉴定 遗传效应 表型变异 穗位高 基因 嵌入法 染色体 F2 病斑
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