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岩石类材料直接拉伸破坏的FDEM数值模拟 被引量:1
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作者 徐浩然 刘平 +4 位作者 刘泉声 曹学 黄兴 罗鑫 邓鹏海 《中南大学学报(自然科学版)》 EI CAS CSCD 北大核心 2024年第9期3416-3425,共10页
有限元-离散元耦合算法(FDEM)在岩石裂纹扩展模拟中广泛应用,尤其在直接拉伸模拟中用于参数校核。然而,模拟结果通常受到拉伸速率和网格尺寸的影响。本文首先阐述FDEM基本原理;然后,建立直接拉伸数值计算模型,探究拉伸速率、网格尺寸及... 有限元-离散元耦合算法(FDEM)在岩石裂纹扩展模拟中广泛应用,尤其在直接拉伸模拟中用于参数校核。然而,模拟结果通常受到拉伸速率和网格尺寸的影响。本文首先阐述FDEM基本原理;然后,建立直接拉伸数值计算模型,探究拉伸速率、网格尺寸及高径比对破坏模式和力学参数的影响;最后,给出直接拉伸模拟中建议采用的拉伸速率和网格尺寸。研究结果表明:随着拉伸速率增加,试样抗拉强度、破坏程度和峰值应变率增加,而平均弹性模量减小;在较低拉伸速率下(v≤0.01 m/s),试样仅产生1条主拉伸裂缝;当拉伸速率较高时,有分支裂缝出现在主拉伸裂缝上侧。网格尺寸对抗拉强度、峰值应变率和平均弹性模量的影响较小,但对破坏模式和破坏程度的影响较显著。随着高径比增加,试样的抗拉强度、破坏程度和峰值应变率增大,但平均弹性模量呈相反趋势,并且高径比对破坏程度的影响较为显著。建议在直接拉伸模拟中使用0.01 m/s的拉伸速率,并将网格尺寸限制在1.5 mm以内。 展开更多
关键词 直接拉伸模拟 有限元-离散元耦合算法 速率 网格尺寸 高径比
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原胶原分子间的交联结构拉伸力学特性的量子化学计算模拟 被引量:1
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作者 钟红刚 马晓慧 +1 位作者 袁小龙 王存新 《医用生物力学》 EI CAS CSCD 2006年第2期120-124,共5页
目的了解成骨过程胶原分子组装结构的力学特性;方法采用量子化学计算软件模拟骨I型胶原中的赖氨酸残基-羟赖氨酸残基醛缩交联结构的拉伸力-位移关系。结果模拟结果显示:拉伸力-位移曲线为非线性;初始能量优化后,连接结构分子体系两α碳... 目的了解成骨过程胶原分子组装结构的力学特性;方法采用量子化学计算软件模拟骨I型胶原中的赖氨酸残基-羟赖氨酸残基醛缩交联结构的拉伸力-位移关系。结果模拟结果显示:拉伸力-位移曲线为非线性;初始能量优化后,连接结构分子体系两α碳原子间的起始距离(两端无约束)为10.05?,伸长率达到约130%后,有一个较明显的转折,之后曲线斜率明显高于其前半段;断裂时长度为16.05?;断裂时力值达到最大,为5622pN;断裂发生在羟赖氨酸残基α碳原子和β碳原子间的单键;结论该研究结果为I型胶原分子二元交联结构(bivalentcross-link)的拉伸力学特性提供了一种理论预测,有待实验确证。 展开更多
关键词 胶原分子交联 量子化学计算 模拟断裂
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拉伸、碰撞情景下布料撕裂的实时仿真模拟 被引量:1
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作者 刘宇涵 贾江凯 +3 位作者 唐勇 陶建新 张金钟 任小霞 《小型微型计算机系统》 CSCD 北大核心 2019年第11期2471-2474,共4页
针对布料撕裂模拟实时性差、需要规定撕裂轨迹的问题,本文提出一种加快并提高布料撕裂真实感模拟的方法.首先,使用基于位置动力学方法建立的布料模型,该模型使用约束方程直接操控布料质点的位置,在时间复杂度相同的情况下,布料撕裂模拟... 针对布料撕裂模拟实时性差、需要规定撕裂轨迹的问题,本文提出一种加快并提高布料撕裂真实感模拟的方法.首先,使用基于位置动力学方法建立的布料模型,该模型使用约束方程直接操控布料质点的位置,在时间复杂度相同的情况下,布料撕裂模拟更加自然;其次,引入并优化Half-edge查找算法,抽取融合线与面的结构体,减少资源消耗,加快计算布料撕裂模拟的速度;最后,计算撕裂率,以几何方法预测布料受损部位最可能被撕裂的质点,并减小该质点的抗撕裂值,解决预先规定撕裂轨迹的问题,提升撕裂模拟效果的真实性.实验数据表明,本文方法在拉伸、碰撞过程中能够模拟逼真自然的撕裂效果. 展开更多
关键词 基于位置动力学 、碰撞撕裂模拟 Half-edge数据结构 撕裂率
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基于拉伸分子动力学模拟的黄嘌呤氧化酶抑制剂解离途径的理论研究
4
作者 齐人睿 李明昊 +5 位作者 常浩 付学奇 高波 韩葳葳 韩璐 李婉南 《高等学校化学学报》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 2021年第3期758-766,共9页
采用拉伸分子动力学模拟的方法研究了黄嘌呤氧化酶(Xanthine oxidase,XO)抑制剂别嘌呤醇(Allopuri⁃nol)和葛根素(Puerarin)从XO离去通道解离的动态过程.分子对接结果表明,别嘌呤醇和葛根素均结合在XO的钼蝶呤中心(Molybdopterin,Mo-pt)... 采用拉伸分子动力学模拟的方法研究了黄嘌呤氧化酶(Xanthine oxidase,XO)抑制剂别嘌呤醇(Allopuri⁃nol)和葛根素(Puerarin)从XO离去通道解离的动态过程.分子对接结果表明,别嘌呤醇和葛根素均结合在XO的钼蝶呤中心(Molybdopterin,Mo-pt);丙氨酸扫描的结果显示,Val789,Arg880,Phe911,Phe914和Val1081在XO与抑制剂的结合中起到非常重要的作用.拉伸分子动力学模拟结果显示,相比于葛根素,别嘌呤醇需要更大的外力和更长的时间才能从XO中解离,拉伸过程中Arg880,Phe1009,Thr1010,Val1011和Ala1079均对维持2种复合物的结构稳定起到重要作用,Phe649和Phe1013在抑制剂解离过程中起到门控的作用,His875起到阻碍抑制剂解离的作用. 展开更多
关键词 黄嘌呤氧化酶 别嘌呤醇 葛根素 痛风 分子动力学模拟
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合金元素比例对铜铅合金纳米拉伸力学特性的影响 被引量:2
5
作者 赵鹏越 郭永博 +2 位作者 王子云 白清顺 张飞虎 《哈尔滨工业大学学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2019年第11期27-34,共8页
铜铅合金由于铜的高塑性、高强度以及铅的自润滑功能,是经过实践检验证明的优良减磨材料,广泛应用于精密机械和航空航天领域中.为研究元素比例在铜铅合金材料纳米拉伸过程中对其力学特性的影响,采用Poisson-Voronoi和Monte Carlo方法建... 铜铅合金由于铜的高塑性、高强度以及铅的自润滑功能,是经过实践检验证明的优良减磨材料,广泛应用于精密机械和航空航天领域中.为研究元素比例在铜铅合金材料纳米拉伸过程中对其力学特性的影响,采用Poisson-Voronoi和Monte Carlo方法建立大规模多晶铜分子动力学模型,在此基础上,采用混合蒙特卡洛/分子动力学方法(hybrid Monte Carlo/molecular dynamics, MC/MD)建立铜铅合金模型.根据真实铜铅合金比例成分建立具有不同铅原子比例的铜铅合金模型并与多晶铜纳米拉伸模型对比,模拟计算多晶体及铜铅合金的纳米拉伸过程,计算各模型的缺陷结构的配位数、内应力、原子势能等参数.结果表明:具有不同元素比例的铜铅合金纳米拉伸过程存在显著的规律性,铜铅合金和多晶铜的静水压力及势能分布相似,铅原子能够抑制铜铅合金晶界处位错的形核与扩展从而使合金材料结构更稳定,合金材料塑性变形过程中晶粒和晶界的势能变化特点相反,铅原子的加入主要影响晶界状态,晶界结构组成在合金塑性变形过程中具有主要作用.因而,通过改变铜铅合金中的元素比例,可改变合金材料各方面性能,本文的研究结果为制备高性能铜铅合金材料提供一定的理论指导. 展开更多
关键词 拉伸模拟 多晶铜 铜铅合金 微观结构 变形机理 分子动力学
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再生骨料的分布对再生混凝土抗拉性能的影响 被引量:13
6
作者 周静海 边晨 +1 位作者 王凤池 曹志伟 《沈阳建筑大学学报(自然科学版)》 CAS 北大核心 2015年第2期267-275,共9页
目的研究再生骨料分布这一细观特征对再生混凝土作用机理及宏观力学性能的影响,丰富再生混凝土的相关理论.方法针对再生骨料取代率为50%、设计强度为C30的再生混凝土,在CAD中建立20个不同的二维再生混凝土细观骨料分布模型,定义再生骨... 目的研究再生骨料分布这一细观特征对再生混凝土作用机理及宏观力学性能的影响,丰富再生混凝土的相关理论.方法针对再生骨料取代率为50%、设计强度为C30的再生混凝土,在CAD中建立20个不同的二维再生混凝土细观骨料分布模型,定义再生骨料分布均匀性系数α,将模型导入ABAQUS对其进行单轴拉伸数值模拟.结果当再生骨料分布过于均匀或分散,即当α<0.338或α>0.483时,再生混凝土抗拉强度较低;当再生骨料分布均匀性适中,即α∈[0.338,0.483]时,抗拉强度较高.结论不同α的再生混凝土受拉破坏机理相同,α仅影响裂缝位置及裂缝穿过再生骨料的数量,且抗拉强度及变形能力随着α的改变而呈规律性变化. 展开更多
关键词 再生混凝土 细观骨料分布模型 再生骨料分布均匀性系数α 单轴数值模拟
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废弃纤维再生混凝土中纤维二维分布的模拟研究 被引量:6
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作者 周静海 李泽 康天蓓 《混凝土》 CAS 北大核心 2016年第8期99-102,106,共5页
建立废弃纤维再生混凝土分布模型,取再生骨料取代率为50%的C30基体再生混凝土,加入体积取代率为0.12%,长度为15 mm的废弃纤维,在ABAQUS中建立14个二维分布模型,对其进行单轴拉伸数值模拟,定义三个废弃纤维分布系数:分布均匀性系数β、... 建立废弃纤维再生混凝土分布模型,取再生骨料取代率为50%的C30基体再生混凝土,加入体积取代率为0.12%,长度为15 mm的废弃纤维,在ABAQUS中建立14个二维分布模型,对其进行单轴拉伸数值模拟,定义三个废弃纤维分布系数:分布均匀性系数β、分布聚拢性系数γ、分布角度系数λ,得出β、γ、λ对废弃纤维再生混凝土性能的影响规律。研究表明:废弃纤维再生混凝土的破坏机理都是裂缝始于混凝土界面,纤维在裂缝开展过程中起到阻裂作用;纤维角度分布情况对基体混凝土抗拉承载力影响很大,而纤维的个数分布均匀性、聚拢程度对承载力影响不大;纤维角度分布情况对基体混凝土变形能力影响很小,但个数分布均匀性、聚拢程度对变形能力影响显著。 展开更多
关键词 废弃纤维再生混凝土 分布模型 单轴数值模拟 分布均匀性系数 分步聚拢型性系数 分布角度系数
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Atomic-scale understanding of martensitic transformation and transition-induced twinning in deformed Fe-Mn alloys
8
作者 ZHANG Hong-bo LI Hong-kui +2 位作者 OU Xiao-qin SHEN Jie SONG Min 《Journal of Central South University》 2025年第4期1211-1222,共12页
In the present study,molecular dynamic simulation(MD)was used to investigate the plastic deformation process of the Fe-Mn alloys with different Mn contents.The influences of Mn contents ranging from 10%to 30%(at%)on t... In the present study,molecular dynamic simulation(MD)was used to investigate the plastic deformation process of the Fe-Mn alloys with different Mn contents.The influences of Mn contents ranging from 10%to 30%(at%)on the deformation behavior and the controlling mechanism of the Fe-base alloys were analyzed.The results show that phase transformations and{112}<111>_(BCC)deformation twinning occur in all Fe-Mn alloys but follow different deformation paths.In the Fe-10%Mn alloy the deformation twinning mechanism obeys the FCC-related path,the Fe-20%Mn alloy involves both the FCC-and HCP-related paths,and the deformation of the Fe-30%Mn alloy is dominated by the HCP-related twinning path.The addition of Mn can increase the stacking fault energy and retard the activation of slip systems as well as the formation of stacking faults.Thus,a higher content of Mn can delay the FCC®ε-martensite and the subsequentε-martensite®BCC phase transition at the intersection of twoε-martensitic bands.Therefore,the addition of Mn alloying element increases the yield strength and reduces the elastic modulus of the Fe-Mn alloys.The formation of deformation twins will contribute to the work-hardening effect and delay the necking and fracture of alloys.It is expected that the results in the present study will provide theoretical reference for the design and optimization of high-performance steels. 展开更多
关键词 Fe-Mn steel tensile deformation molecular dynamics simulation phase transformation
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基于分子动力学模拟提高嗜热磷酸三酯酶样内酯酶非特异性底物活力的理论研究 被引量:1
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作者 朱镜璇 于正飞 +4 位作者 刘野 詹冬玲 韩佳睿 田晓翩 韩葳葳 《高等学校化学学报》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 2019年第1期138-146,共9页
采用分子动力学模拟和拉伸分子动力学模拟方法,结合分子力学-广义玻恩表面积(MM-GB/SA)方法进行自由能计算和结构交互指纹分析,研究了模拟过程中非特异性底物(对氧磷/内酯)分别与嗜热磷酸三酯酶样内酯酶(SsoPox)野生型和突变体(W263F/W2... 采用分子动力学模拟和拉伸分子动力学模拟方法,结合分子力学-广义玻恩表面积(MM-GB/SA)方法进行自由能计算和结构交互指纹分析,研究了模拟过程中非特异性底物(对氧磷/内酯)分别与嗜热磷酸三酯酶样内酯酶(SsoPox)野生型和突变体(W263F/W263T)结合的构象变化,分析了Loop8中重要残基Trp263的突变提高SsoPox非特异性底物活力的原因,发现其能够影响门控残基Phe229的构象变化,导致活性口袋入口变宽(Phe229与Tyr99之间的距离变大),使对氧磷和内酯更容易结合到蛋白质的活性位点上; Asp256和Arg223形成盐桥的几率高于野生型(WT) SsoPox,在Arg223(位于Loop7)的协助下质子更加高效地从活性中心的Asp256(位于Loop8)传递到溶剂中去,因而能够提高SsoPox水解底物的效率.通过比较2个野生型复合物的结构稳定性和结合自由能差异,发现在模拟过程中SsoPox与内酯的复合物体系更加稳定并且具有更低的结合自由能,有利于SsoPox识别底物并使其埋在活性部位的疏水环境中,促进氢氧化物亲核进攻底物的亲电中心.因此,底物与酶稳定的相互作用可能是SsoPox具有天然内酯酶活性的原因之一. 展开更多
关键词 嗜热类磷酸三酯酶样内酯酶 分子动力学模拟 分子动力学模拟 分子力学-广义玻恩表面积 结构交互指纹分析
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单克隆抗体依那西普融合蛋白的活性结构保护 被引量:3
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作者 潘琦 李代禧 +2 位作者 郭柏松 杨春生 杨智 《高等学校化学学报》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 2016年第2期274-280,共7页
采用拉伸模拟和伞状采样的方法,利用Gromacs软件和Amber99sb-ildn分子力场研究了不同浓度的海藻糖体系和海藻糖-甘露醇复合体系中单克隆依那西普融合蛋白二聚体的解离过程.结果表明,海藻糖能显著增强依那西普二聚体活性结构的稳定性,且... 采用拉伸模拟和伞状采样的方法,利用Gromacs软件和Amber99sb-ildn分子力场研究了不同浓度的海藻糖体系和海藻糖-甘露醇复合体系中单克隆依那西普融合蛋白二聚体的解离过程.结果表明,海藻糖能显著增强依那西普二聚体活性结构的稳定性,且海藻糖-甘露醇的复合保护优于海藻糖的单一保护;保护剂的种类及其选择性吸附保护的特定位置对依那西普蛋白二聚体活性结构保护效果的影响显著. 展开更多
关键词 依那西普 拉伸模拟 伞状采样 海藻糖
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力经PSGL-1介导ERM蛋白ITAM-like序列上磷酸化位点的暴露 被引量:1
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作者 吴建华 邝晓敏 +1 位作者 刘文平 方颖 《华南理工大学学报(自然科学版)》 EI CAS CSCD 北大核心 2016年第3期128-135,共8页
炎症反应阶段,P-选择素糖蛋白配体1(PSGL-1)与埃兹蛋白/根蛋白/膜突蛋白(ERM)的结合在招募脾酪氨酸激酶(Syk)并促进白细胞激活中发挥了重要作用.文中通过晶体结构分析发现,位于ERM蛋白非传统的免疫受体酪氨酸活化基序(ITAM-like)上的两... 炎症反应阶段,P-选择素糖蛋白配体1(PSGL-1)与埃兹蛋白/根蛋白/膜突蛋白(ERM)的结合在招募脾酪氨酸激酶(Syk)并促进白细胞激活中发挥了重要作用.文中通过晶体结构分析发现,位于ERM蛋白非传统的免疫受体酪氨酸活化基序(ITAM-like)上的两个磷酸化位点(Y191和Y205)周围存在较大的空间位阻,这将阻碍其被Src家族激酶酪氨酸磷酸化继而招募Syk的过程.文中用拉伸分子动力学模拟的方法模拟力学环境下PSGL-1与根蛋白FERM结构域的相互作用,构象分析和残基溶剂可及表面积的变化都表明,经由PSGL-1传导的力学信号可以介导根蛋白ITAM-like序列上磷酸化位点Y205的暴露.文中结果揭示了一条经由PSGL-1胞内域激活Syk的力学信号通路,并且在原子层面上对PSGL-1/ERM/Syk之间的相互作用给予了阐释. 展开更多
关键词 PSGL-1 ERM蛋白 SYK ITAM-like序列 分子动力学模拟
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Crack branching mechanism of rock-like quasi-brittle materials under dynamic stress 被引量:12
12
作者 唐春安 杨岳峰 《Journal of Central South University》 SCIE EI CAS 2012年第11期3273-3284,共12页
The cracking patterns of a thin sheet with a pre-existing crack subjected to dynamic loading are numerically simulated to investigate the mechanism of crack branching by using the FEM method.Six numerical models were ... The cracking patterns of a thin sheet with a pre-existing crack subjected to dynamic loading are numerically simulated to investigate the mechanism of crack branching by using the FEM method.Six numerical models were set up to study the effects of load,tensile strength and heterogeneity on crack branching.The crack propagation is affected by the applied loads,tensile strength and heterogeneity.Before crack branching,the crack propagates by some distance along the direction of the pre-existing crack.For the materials with low heterogeneity,the higher the applied stress level is and the lower the tensile strength of the material is,the shorter the propagation distance is.Moreover,the branching angle becomes larger and the number of branching cracks increases.In the case of the materials with high heterogeneity,a lot of disordered voids and microcracks randomly occur along the main crack,so the former law is not obvious.The numerical results not only are in good agreement with the experimental observations in laboratory,but also can be extended to heterogeneity media.The work can provide a good approach to model the cracking and fracturing of heterogeneous quasi-brittle materials,such as rock,under dynamic loading. 展开更多
关键词 crack propagation branching HETEROGENEITY Weibull distribution MICROCRACK ROCK
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TCR-CD3复合物跨膜区自组装的分子机制
13
作者 王凤丽 陈佳林 +1 位作者 何程智 罗施中 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2022年第6期1094-1102,共9页
目的T细胞受体-共受体复合物(TCR-CD3)在适应性免疫应答中起着重要作用,其亚基间的相互作用一直是研究热点。由于传统实验的局限性,对于跨膜蛋白TCR-CD3复合物的研究不能深入到微观层面。方法利用分子动力学模拟方法(包括粗粒化模拟、... 目的T细胞受体-共受体复合物(TCR-CD3)在适应性免疫应答中起着重要作用,其亚基间的相互作用一直是研究热点。由于传统实验的局限性,对于跨膜蛋白TCR-CD3复合物的研究不能深入到微观层面。方法利用分子动力学模拟方法(包括粗粒化模拟、拉伸动力学、全原子模拟)分析TCR-CD3复合物的自组装机制。结果通过粗粒化模拟(CGMD)发现,TCR-CD3复合物在组装过程中存在着αβ依次结合δε’、γε、ζζ’的组装顺序,并阐述了α;突变会降低α;与δε’的相互作用。结论本文论证了仅存在TCR-CD3复合物的跨膜区不足以介导TCR-CD3复合物亚基间的特异性相互作用。拉伸动力学(SMD)和全原子模拟(AAMD)的结果说明,ζζ’与TCR-CD3其余部分之间的胞外区相互作用强于跨膜区,同时ζζ’的缺失对αβδε’γε的稳定性影响最小,而δε’的缺失对αβγεζζ’的稳定性影响最大。 展开更多
关键词 TCR-CD3复合物 粗粒化模拟 全原子模拟 动力学模拟 跨膜蛋白
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Improved parameter selection method for mesoscopic numerical simulation test of direct tensile failure of rock and concrete 被引量:1
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作者 刘智光 陈健云 +1 位作者 白卫峰 徐强 《Journal of Central South University》 SCIE EI CAS 2010年第5期1079-1086,共8页
In order to numerically simulate the failure process of rock and concrete under uniaxial tension,an improved method of selecting the mechanical properties of materials was presented for the random mechanic parameter m... In order to numerically simulate the failure process of rock and concrete under uniaxial tension,an improved method of selecting the mechanical properties of materials was presented for the random mechanic parameter model based on the mesoscopic damage mechanics.The product of strength and elastic modulus of mesoscale representative volume element was considered to be one of the mechanical property parameters of materials and assumed to conform to specified probability distributions to reflect the heterogeneity of mechanical property in materials.With the improved property parameter selection method,a numerical program was developed and the simulation of the failure process of the rock and concrete specimens under static tensile loading condition was carried out.The failure process and complete stress-strain curves of a class of rock and concrete in stable fracture propagation manner under uniaxial tension were obtained.The simulated macroscopic mechanical behavior was compared with the available laboratory experimental observation,and a reasonable agreement was obtained.Verification shows that the improved parameter selection method is suitable for mesoscopic numerical simulation in the failure process of rock and concrete. 展开更多
关键词 ROCK CONCRETE stable fracture propagation product of strength and elastic modulus HETEROGENEITY numerical simulation uniaxial tension
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