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从氨基酸序列预测蛋白质折叠速率被引量：3: 1; 作者郭建秀饶妮妮 +2 位作者刘广雄李杰王云鹤《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2010年第12期1331-1338,共8页; 蛋白质折叠速率预测是当今生物物理学最具挑战性的课题之一.近年来,许多科研工作者开展了大量的研究工作来探索折叠速率的决定因素,许多参数和方法被相继提出.但氨基酸残基间的相互作用、氨基酸的序列顺序等信息对折叠速率的影响从未被... 展开更多; 关键词蛋白质折叠折叠速率预测伪氨基酸组成蒙特卡罗方法; 在线阅读下载PDF 职称材料

基于序列特征筛选与支持向量回归预测蛋白质折叠速率被引量：1: 2; 作者李咏周玮 +3 位作者代志军陈渊王志明袁哲明《物理化学学报》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2014年第6期1091-1098,共8页; 折叠速率预测对阐明蛋白质折叠机理意义重大.本文收集了115条目前已知折叠速率的蛋白质样本(包括二态、多态和混态蛋白),为了较全面地表征蛋白质分子的一级结构信息,提取序列长度、氨基酸残基多尺度组分、成对残基k-space特征与基于残... 展开更多; 关键词蛋白质折叠折叠速率预测高维特征特征筛选支持向量回归; 在线阅读下载PDF 职称材料

基于遗传算法的蛋白质折叠模拟系统被引量：10: 3; 作者倪红春王翼飞《上海大学学报（自然科学版）》 CAS CSCD 2001年第4期359-364,共6页; 在模拟蛋白质折叠的遗传算法基础上 ,采用晶格模型 ,设计了一个用于蛋白质折叠模拟的软件系统 ,并举例说明该系统的用法 .该蛋白质折叠模拟系统可用于蛋白质折叠预测和蛋白质进化研究。; 关键词蛋白质折叠模拟遗传算法晶格模型折叠预测分子设计进化; 在线阅读下载PDF 职称材料

基于布谷鸟搜索算法的蛋白质能量优化被引量：3: 4; 作者王庆喜朱丽华《浙江农业学报》 CSCD 北大核心 2017年第7期1216-1220,共5页; 针对蛋白质折叠预测问题,提出了一种基于布谷鸟搜索算法的蛋白质能量优化方法。该方法首先对原始布谷鸟搜索算法从多种群、进化策略和禁忌搜索等多个角度进行改进,提升了布谷鸟搜索算法的全局搜索能力;改进了布谷鸟搜索算法求解蛋白质... 展开更多; 关键词蛋白质能量优化蛋白质折叠预测布谷鸟搜索算法多种群禁忌搜索; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名从氨基酸序列预测蛋白质折叠速率被引量：3: 1; 作者郭建秀饶妮妮刘广雄李杰王云鹤; 机构电子科技大学生命科学与技术学院; 出处《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2010年第12期1331-1338,共8页; 基金国家自然科学基金资助项目(30900318 60571047)~~; 文摘蛋白质折叠速率预测是当今生物物理学最具挑战性的课题之一.近年来,许多科研工作者开展了大量的研究工作来探索折叠速率的决定因素,许多参数和方法被相继提出.但氨基酸残基间的相互作用、氨基酸的序列顺序等信息对折叠速率的影响从未被提及.采用伪氨基酸组成的方法提取氨基酸的序列顺序信息,利用蒙特卡洛方法选择最佳特征因子,建立线性回归模型进行折叠速率预测.该方法能在不需要任何(显示)结构信息的情况下,直接从蛋白质的氨基酸序列出发对折叠速率进行预测.在Jackknife交互检验方法的验证下,对含有99个蛋白质的数据集,发现折叠速率的预测值与实验值有很好的相关性,相关系数能达到0.81,预测误差仅为2.54.这一精度明显优于其他基于序列的方法,充分说明蛋白质的序列顺序信息是影响蛋白质折叠速率的重要因素.; 关键词蛋白质折叠折叠速率预测伪氨基酸组成蒙特卡罗方法; Keywords protein folding； prediction of folding rate； pseudo-amino acid composition； Monte Carlo method; 分类号 Q612 [生物学—生物物理学] Q51 [生物学—生物化学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名基于序列特征筛选与支持向量回归预测蛋白质折叠速率被引量：1: 2; 作者李咏周玮代志军陈渊王志明袁哲明; 机构湖南农业大学湖南农业大学; 出处《物理化学学报》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2014年第6期1091-1098,共8页; 基金教育部博士点基金(20124320110002) 国家自然科学基金(31301388) 湖南省自然科学基金(14JJ3092)资助项目~~; 文摘折叠速率预测对阐明蛋白质折叠机理意义重大.本文收集了115条目前已知折叠速率的蛋白质样本(包括二态、多态和混态蛋白),为了较全面地表征蛋白质分子的一级结构信息,提取序列长度、氨基酸残基多尺度组分、成对残基k-space特征与基于残基物理化学性质的地统计学关联总共9357维特征.经改进的二元矩阵重排过滤器和多轮末尾淘汰非线性筛选,获得23个物理化学意义明确的保留特征,建立的非线性支持向量回归模型Jackknife交叉验证的相关系数R=0.95,优于文献报道及其他参比特征选择方法.支持向量回归解释体系表明折叠速率与保留描述符的非线性回归极显著,分析了各保留描述符对折叠速率的影响,结果表明蛋白质折叠速率与序列长度、中短程关联特征、三联体残基组份特征等密切相关.; 关键词蛋白质折叠折叠速率预测高维特征特征筛选支持向量回归; Keywords Protein folding Folding rate prediction High-dimensional feature Feature screening Support vector regression; 分类号 O629.73 [理学—有机化学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名基于遗传算法的蛋白质折叠模拟系统被引量：10: 3; 作者倪红春王翼飞; 机构上海大学理学院; 出处《上海大学学报（自然科学版）》 CAS CSCD 2001年第4期359-364,共6页; 文摘在模拟蛋白质折叠的遗传算法基础上 ,采用晶格模型 ,设计了一个用于蛋白质折叠模拟的软件系统 ,并举例说明该系统的用法 .该蛋白质折叠模拟系统可用于蛋白质折叠预测和蛋白质进化研究。; 关键词蛋白质折叠模拟遗传算法晶格模型折叠预测分子设计进化; Keywords protein folding simulation genetic algorithm lattice model; 分类号 Q51 [生物学—生物化学] O242.23 [理学—计算数学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名基于布谷鸟搜索算法的蛋白质能量优化被引量：3: 4; 作者王庆喜朱丽华; 机构安阳工学院计算机科学与信息工程学院; 出处《浙江农业学报》 CSCD 北大核心 2017年第7期1216-1220,共5页; 基金河南省科技攻关项目(162102210130) 安阳工学院科研基金项目(YJJ2016004); 文摘针对蛋白质折叠预测问题,提出了一种基于布谷鸟搜索算法的蛋白质能量优化方法。该方法首先对原始布谷鸟搜索算法从多种群、进化策略和禁忌搜索等多个角度进行改进,提升了布谷鸟搜索算法的全局搜索能力;改进了布谷鸟搜索算法求解蛋白质能量问题;取得了蛋白质能量的最小值或是可行值。对算法的仿真测试以及与其他算法的数据进行对比,证明本文蛋白质能量优化方法的可行性和优越性。; 关键词蛋白质能量优化蛋白质折叠预测布谷鸟搜索算法多种群禁忌搜索; Keywords protein energy optimization protein folding prediction cuckoo search algorithm multi swarm tabu search; 分类号 S13 [农业科学—农业基础科学] TP18 [自动化与计算机技术—控制理论与控制工程]; 在线阅读下载PDF 职称材料

	题名	作者	出处	发文年	被引量	操作
1	从氨基酸序列预测蛋白质折叠速率	郭建秀饶妮妮刘广雄李杰王云鹤	《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心	2010	3	在线阅读下载PDF 职称材料
2	基于序列特征筛选与支持向量回归预测蛋白质折叠速率	李咏周玮代志军陈渊王志明袁哲明	《物理化学学报》 SCIE CAS CSCD 北大核心	2014	1	在线阅读下载PDF 职称材料
3	基于遗传算法的蛋白质折叠模拟系统	倪红春王翼飞	《上海大学学报（自然科学版）》 CAS CSCD	2001	10	在线阅读下载PDF 职称材料
4	基于布谷鸟搜索算法的蛋白质能量优化	王庆喜朱丽华	《浙江农业学报》 CSCD 北大核心	2017	3	在线阅读下载PDF 职称材料