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LMP/TAP基因多态性与甲状腺癌易感的相关性研究
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作者 蒋洁 王丹妹 +3 位作者 牛海艳 蔡仁桑 谭蓉 黄用豪 《中国实用医药》 2020年第13期95-98,共4页
目的为探讨低相对分子质量蛋白酶体(LMP)和抗原处理相关载体(TAP)基因单核苷酸多态性(SNP)与甲状腺癌易感性的关系,为我国人类基因组多样性的研究提供理论依据。方法124例甲状腺癌患者设为病例组,另选取111例健康人群设为对照组,采用聚... 目的为探讨低相对分子质量蛋白酶体(LMP)和抗原处理相关载体(TAP)基因单核苷酸多态性(SNP)与甲状腺癌易感性的关系,为我国人类基因组多样性的研究提供理论依据。方法124例甲状腺癌患者设为病例组,另选取111例健康人群设为对照组,采用聚合酶链式反应(PCR)酶切片段长度多态性(RFLP)对LMP2/LMP7/TAP1-1/TAP1-2基因中研究最多的四个多态性位点片段(Codon60/Codon145/Codon333/Codon637)进行检测,并对其易感性进行分析。结果遗传多态性分析和单倍型联合分析结果均表明,四种多态性位点与甲状腺癌的发生无显著相关性(P>0.05)。结论说明选择分析的Codon60/Codon145/Codon333/Codon637这四种多态性位点片段与甲状腺癌的发生可能不存在关联性。 展开更多
关键词 低相对分子质量蛋白酶体 抗原处理相关载体 基因单核苷酸多态性 甲状腺癌
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vIL-10对鼻咽癌细胞株MHC-1类分子抗原加工提呈“操纵子”表达的影响 被引量:1
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作者 任艳鑫 杨洁 +7 位作者 孙瑞梅 赵留芳 李磊 张世文 费继敏 尚艺泰 李舟蕾 李晓江 《西安交通大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2016年第4期525-530,共6页
目的研究病毒白介素-10(vIL-10)对鼻咽癌细胞株MHC-1类分子抗原加工提呈"操纵子"表达的影响。方法收集不同时间段vIL-10处理的鼻咽癌细胞(CNE-1和CNE-2),采用RT-PCR、Western blot方法检测vIL-10处理的鼻咽癌细胞中MHC-1类分... 目的研究病毒白介素-10(vIL-10)对鼻咽癌细胞株MHC-1类分子抗原加工提呈"操纵子"表达的影响。方法收集不同时间段vIL-10处理的鼻咽癌细胞(CNE-1和CNE-2),采用RT-PCR、Western blot方法检测vIL-10处理的鼻咽癌细胞中MHC-1类分子抗原加工提呈"操纵子"(TAP-1、2,LMP-2、7及HLA-I)表达的变化。结果1mRNA水平:CNE-1和CNE-2的TAP-1水平在不同时间点均未表现出显著差异;vIL-10作用1、4、6、12h时,CNE-1和CNE-2的TAP-2、LMP-2均未出现变化,24h时,两者均出现显著下降甚至消失;CNE-1在vIL-10作用后4h即出现LMP-7下降,而CNE-2在vIL-10作用后6h出现下降;在vIL-10作用24h时CNE-1和CNE-2的HLA-I出现显著下降。2蛋白水平:vIL-10作用后24h时,两种细胞的TAP-1均出现显著下降,TAP-2则在vIL-10作用后1、6、12、24h出现逐渐下降;CNE-2的LMP-2、LMP-7在vIL-10作用后随时间逐渐下降,而CNE-1的两种蛋白仅在作用后12h出现显著下降;HLA-I在vIL-10作用后出现下降趋势,但在CNE-1中各时间段变化无统计学差异,CNE-2在24h显著下降。结论 vIL-10可明显抑制鼻咽癌MHC-I类分子抗原加工和提呈的"操纵子"的表达,并且呈一定的时间依赖性。 展开更多
关键词 鼻咽肿瘤 病毒白介素-10 抗原处理相关转运体蛋白(tap) 低分子量多肽复合物(LMP) 人类白细胞抗原-I(HLA-I)
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TAP-1、TAP-2及HLA-I在鼻咽癌中的表达及临床意义 被引量:1
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作者 任艳鑫 李晓江 +4 位作者 张丽娟 杨洁 孙瑞梅 张世文 张吉 《西安交通大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2014年第4期527-532,546,共7页
目的探讨鼻咽癌组织中MHC-I类分子抗原加工提呈"操纵子"(即TAP-1、TAP-2及HLA-I)表达的变化及其与临床因素的关系。方法免疫组织化学法(IHC)检测鼻咽癌石蜡切片中TAP-1、TAP-2及HLA-I的表达,采用流式细胞仪(FCM)检测鼻咽癌患... 目的探讨鼻咽癌组织中MHC-I类分子抗原加工提呈"操纵子"(即TAP-1、TAP-2及HLA-I)表达的变化及其与临床因素的关系。方法免疫组织化学法(IHC)检测鼻咽癌石蜡切片中TAP-1、TAP-2及HLA-I的表达,采用流式细胞仪(FCM)检测鼻咽癌患者及对照组外周血中CD4+T、CD8+T细胞比例,应用酶联免疫吸附法(ELISA)检测空腹外周静脉血IL-10含量,并对以上结果进行统计分析。结果 TAP-1、TAP-2及HLA-I在鼻咽癌组织中表达分别为43.1%、46.55%、50%,均低于鼻咽正常组织中的表达90%、95%、95%(P<0.05);鼻咽癌组CD4+T细胞比例明显低于对照组[(33.41±10.04)%vs.(40.15±3.56)%](P<0.05),CD8+T细胞比例与对照组比较差异无统计学意义[(25.32±8.29)%vs.(22.89±2.24)%,P>0.05],鼻咽癌IL-10表达明显高于对照组[(13.12±1.23)ng/mL vs.(3.69±1.03)ng/mL,P<0.05];TAP-1、TAP-2及HLA-I表达与年龄、性别无相关性(P>0.05),与TNM分期、有无淋巴结转移及有无远处转移密切相关(P<0.05);CD8+T细胞比例与TAP-1、TAP-2及HLA-I表达成正比,IL-10表达与TAP-1、TAP-2及HLA-I表达成反比,而CD4+T细胞比例与TAP-1、TAP-2及HLA-I表达无明显相关性;Kaplan-Meier分析提示,临床分期、有无淋巴结转移、有无远处器官转移、病理分型、TAP-1表达、TAP-2表达、HLA-I表达与鼻咽癌患者预后相关,差异具有统计学意义(P<0.05);Logistic回归模型分析显示,有无远处器官转移及HLA-I表达为鼻咽癌患者独立预后因素(P=0.043,P=0.045)。结论鼻咽癌中TAP-1、TAP-2及HLA-I低表达,且与患者免疫功能低下相关;远处器官转移及HLA-I低表达预示鼻咽癌患者预后不良。 展开更多
关键词 鼻咽癌 抗原处理相关转运体蛋白-1 抗原处理相关转运体蛋白-2 人类白细胞抗原-I 转移
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基于VHSE结构表征的TAP亲和活性预测及选择特异性分析 被引量:1
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作者 潘显超 梅虎 +4 位作者 谢江安 吕娟 王青 张亚兰 谭文 《高等学校化学学报》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 2012年第11期2556-2562,共7页
应用氨基酸描述子VHSE(Principal component score vector of hydrophobic,steric,and electronic proper-ties)对613个抗原9肽进行结构表征,在此基础上,采用支持向量机结合逐步回归变量筛选方法,成功建立了抗原肽抗原处理相关转运蛋白(... 应用氨基酸描述子VHSE(Principal component score vector of hydrophobic,steric,and electronic proper-ties)对613个抗原9肽进行结构表征,在此基础上,采用支持向量机结合逐步回归变量筛选方法,成功建立了抗原肽抗原处理相关转运蛋白(Transporter associated with antigen processing,TAP)亲和活性预测模型,最优线性支持向量机模型的R2,Q2和R2ext分别为0.7386,0.7270和0.6057.模型结果分析表明,影响TAP亲和活性的首要因素是电性,其次是立体和疏水性质;底物9肽的P1(N端)及P2,P7和P9(C端)位氨基酸物化性质对TAP亲和活性有重要影响,而P3,P4,P5和P6位对模型贡献相对较小,P8位则与活性无关.依据最优模型对模拟点突变9肽的TAP亲和活性的预测结果,并结合变量载荷分析,对TAP底物选择特异性进行了分析和总结. 展开更多
关键词 抗原处理相关转运蛋白 抗原 氨基酸描述子VHSE 支持向量机 活性 选择特异性
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