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柞蚕性信息素合成相关基因的表达研究
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作者 侯洋 张芳 +3 位作者 王郡 胡飞 刘彦群 魏兆军 《安徽农业科学》 CAS 2015年第16期49-52,共4页
[目的]明确与性信息素合成相关基因的组织分布及其在性腺中的发育表达。[方法]利用荧光定量PCR方法,对柞蚕乙酰辅酶A羧化酶、超长链脂肪酸、醇脱氢酶、酯酶、脂肪酶基因在不同组织分布及性腺中的发育表达进行分析。[结果]乙酰辅酶A羧化... [目的]明确与性信息素合成相关基因的组织分布及其在性腺中的发育表达。[方法]利用荧光定量PCR方法,对柞蚕乙酰辅酶A羧化酶、超长链脂肪酸、醇脱氢酶、酯酶、脂肪酶基因在不同组织分布及性腺中的发育表达进行分析。[结果]乙酰辅酶A羧化酶、超长链脂肪酸2个基因在性腺中的表达量显著高于其他组织;醇脱氢酶、酯酶和脂肪酶3个基因在中肠或脂肪体等组织中表达量高于性腺。乙酰辅酶A羧化酶、超长链脂肪酸、醇脱氢酶、脂肪酶4个基因在羽化后2 d性腺中的表达量显著高于羽化前2 d。酯酶基因在羽化后2 d性腺中的表达量显著低于于羽化前2 d。[结论]明确了柞蚕性信息素合成相关的5个基因的组织分布和发育表达,为进一步研究这些性信息素合成相关基因的功能奠定基础。 展开更多
关键词 柞蚕 性信息素合成相关基因 表达
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生物信息学一致性相关系数法预测非小细胞肺癌的NP化疗方案药物敏感性基因 被引量:2
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作者 王卓智 陈秋月 +10 位作者 韩勇 陈永孜 黄怡菲 龚卫静 徐双兵 李居怡 邓艾平 刘亚妮 曾芳 吕永宁 张玉 《医药导报》 CAS 北大核心 2021年第2期153-157,共5页
目的用生物信息学一致性相关系数(CCC)法预测非小细胞肺癌一线化疗方案NP方案(长春瑞滨+顺铂)药物敏感性基因。方法使用5种统计学方法:Pearson相关分析、Spearman相关分析、Welch's t-test、ANCOVA和rank-based ANCOVA,从NCI 60数... 目的用生物信息学一致性相关系数(CCC)法预测非小细胞肺癌一线化疗方案NP方案(长春瑞滨+顺铂)药物敏感性基因。方法使用5种统计学方法:Pearson相关分析、Spearman相关分析、Welch's t-test、ANCOVA和rank-based ANCOVA,从NCI 60数据库筛选药物敏感性基因,通过CCC筛选非小细胞肺癌患者化疗药物敏感性基因。利用在线数据库DAVID进行KEGG通路富集分析。结果筛选出可能应用于预测非小细胞肺癌化疗药物敏感性基因:顺铂的药物敏感性基因主要富集在蛋白聚糖、细菌侵袭上皮细胞通路中;长春瑞滨的药物敏感性基因主要与癌症信号通路、蛋白聚糖有关。结论生物信息学CCC法可应用于筛选出预测非小细胞肺癌化疗药物敏感性的基因,可能为将来构建NP方案精准化疗模型提供研究基础。 展开更多
关键词 药物敏感基因 NP方案 非小细胞肺癌 生物信息 一致相关系数(CCC)
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糖尿病性高血压大鼠肾损害相关基因cDNA片段的克隆与初步鉴定 被引量:4
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作者 张芳林 李果 +6 位作者 叶传忠 丁伟 刘优萍 谢超 张迪 孙卫华 罗敏 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2002年第1期94-99,共6页
为筛选大鼠糖尿病性高血压病所致的肾损害相关基因 ,自发性高血压大鼠以STZ 5 0mg/kg一次性尾静脉注射 ,建立糖尿病性高血压大鼠模型 ,4周后该模型大鼠尿蛋白持续阳性 ,电镜观察到肾小球基质增生、足突融合或扁平 .应用荧光标记的差异... 为筛选大鼠糖尿病性高血压病所致的肾损害相关基因 ,自发性高血压大鼠以STZ 5 0mg/kg一次性尾静脉注射 ,建立糖尿病性高血压大鼠模型 ,4周后该模型大鼠尿蛋白持续阳性 ,电镜观察到肾小球基质增生、足突融合或扁平 .应用荧光标记的差异显示反转录聚合酶链反应 (DDRT PCR)及RNA印迹技术 ,比较两种模型大鼠肾皮质的基因表达差异 ,并进行差异条带的cDNA序列生物信息学分析 .其中 4个差异条带与Genbank数据库比较 ,2个为未知基因 ,2个为已知基因 ,即成淀粉样糖蛋白 (amyloidogenicglycoprotein ,AGG)、CDK10 9,两者可能与糖尿病性高血压肾损害的发生相关 ,对它们的进一步研究将为肾损害发病机理的发现提供思路 . 展开更多
关键词 差异显示 糖尿病高血压 肾损害 生物信息 相关基因 CDNA片段 克隆
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甘草NRAMP基因家族的鉴定和生物信息学分析 被引量:7
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作者 卢婷婷 李艳玲 +1 位作者 李存法 李利红 《河南农业科学》 北大核心 2019年第2期40-47,共8页
为研究甘草自然抗性相关巨噬细胞蛋白(NRAMP)家族成员的结构和功能,利用生物信息学方法,从甘草全基因组数据库中筛选并鉴定甘草NRAMP家族基因序列,并对该家族成员做进化分析、基因结构分析、保守结构域和保守基序分析、二级结构和三维... 为研究甘草自然抗性相关巨噬细胞蛋白(NRAMP)家族成员的结构和功能,利用生物信息学方法,从甘草全基因组数据库中筛选并鉴定甘草NRAMP家族基因序列,并对该家族成员做进化分析、基因结构分析、保守结构域和保守基序分析、二级结构和三维结构分析。结果显示,从甘草基因组中共鉴定出11个NRAMP基因家族成员,通过进化分析发现,亲缘关系近的NRAMP家族成员基因结构和保守基序都更为相似,甘草和大豆的NRAMP家族成员间亲缘关系更接近。甘草大部分NRAMP家族成员的氨基酸数量差异不大,介于300~549个,且亚细胞定位在细胞膜上,而2个分子质量较大的成员GurNRAMP7和GurNRAMP8亚细胞定位在叶绿体上,各个成员的跨膜结构数量不尽相同。各个基因在染色体上的分布较为分散,只有NRAMP9、NRAMP10、NRAMP11定位在同一条染色体上。α-螺旋是甘草NRAMP家族成员中最主要的二级结构,但各个成员含有的α-螺旋数量不完全一样。 展开更多
关键词 甘草 自然抗相关巨噬细胞蛋白基因家族 生物信息学分析
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中国野桑蚕DH-PBAN基因克隆研究初报
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作者 徐春媛 刘彦群 鲁成 《西南农业大学学报(自然科学版)》 CSCD 北大核心 2003年第4期327-330,共4页
根据家蚕(Bombyxmori)滞育激素-性信息素合成激活肽(DH-PBAN)基因的DNA序列设计引物,以中国野桑蚕(BombyxmandarinaChina)基因组DNA为模板进行PCR扩增。试验首先确立了比较稳定的从基因组扩增目的片段的扩增体系及程序,并用该扩增体系... 根据家蚕(Bombyxmori)滞育激素-性信息素合成激活肽(DH-PBAN)基因的DNA序列设计引物,以中国野桑蚕(BombyxmandarinaChina)基因组DNA为模板进行PCR扩增。试验首先确立了比较稳定的从基因组扩增目的片段的扩增体系及程序,并用该扩增体系及程序克隆到中国野桑蚕DH,PBAN及DH-PBAN基因的第5内含子序列。试验还发现该基因第3内含子在家蚕和野桑蚕之间表现出多态性。 展开更多
关键词 中国野桑蚕 滞育激素-信息素合成激活肽 多态 基因克隆
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