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柞蚕性信息素合成相关基因的表达研究
1
作者
侯洋
张芳
+3 位作者
王郡
胡飞
刘彦群
魏兆军
《安徽农业科学》
CAS
2015年第16期49-52,共4页
[目的]明确与性信息素合成相关基因的组织分布及其在性腺中的发育表达。[方法]利用荧光定量PCR方法,对柞蚕乙酰辅酶A羧化酶、超长链脂肪酸、醇脱氢酶、酯酶、脂肪酶基因在不同组织分布及性腺中的发育表达进行分析。[结果]乙酰辅酶A羧化...
[目的]明确与性信息素合成相关基因的组织分布及其在性腺中的发育表达。[方法]利用荧光定量PCR方法,对柞蚕乙酰辅酶A羧化酶、超长链脂肪酸、醇脱氢酶、酯酶、脂肪酶基因在不同组织分布及性腺中的发育表达进行分析。[结果]乙酰辅酶A羧化酶、超长链脂肪酸2个基因在性腺中的表达量显著高于其他组织;醇脱氢酶、酯酶和脂肪酶3个基因在中肠或脂肪体等组织中表达量高于性腺。乙酰辅酶A羧化酶、超长链脂肪酸、醇脱氢酶、脂肪酶4个基因在羽化后2 d性腺中的表达量显著高于羽化前2 d。酯酶基因在羽化后2 d性腺中的表达量显著低于于羽化前2 d。[结论]明确了柞蚕性信息素合成相关的5个基因的组织分布和发育表达,为进一步研究这些性信息素合成相关基因的功能奠定基础。
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关键词
柞蚕
性信息素合成相关基因
表达
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职称材料
生物信息学一致性相关系数法预测非小细胞肺癌的NP化疗方案药物敏感性基因
被引量:
2
2
作者
王卓智
陈秋月
+10 位作者
韩勇
陈永孜
黄怡菲
龚卫静
徐双兵
李居怡
邓艾平
刘亚妮
曾芳
吕永宁
张玉
《医药导报》
CAS
北大核心
2021年第2期153-157,共5页
目的用生物信息学一致性相关系数(CCC)法预测非小细胞肺癌一线化疗方案NP方案(长春瑞滨+顺铂)药物敏感性基因。方法使用5种统计学方法:Pearson相关分析、Spearman相关分析、Welch's t-test、ANCOVA和rank-based ANCOVA,从NCI 60数...
目的用生物信息学一致性相关系数(CCC)法预测非小细胞肺癌一线化疗方案NP方案(长春瑞滨+顺铂)药物敏感性基因。方法使用5种统计学方法:Pearson相关分析、Spearman相关分析、Welch's t-test、ANCOVA和rank-based ANCOVA,从NCI 60数据库筛选药物敏感性基因,通过CCC筛选非小细胞肺癌患者化疗药物敏感性基因。利用在线数据库DAVID进行KEGG通路富集分析。结果筛选出可能应用于预测非小细胞肺癌化疗药物敏感性基因:顺铂的药物敏感性基因主要富集在蛋白聚糖、细菌侵袭上皮细胞通路中;长春瑞滨的药物敏感性基因主要与癌症信号通路、蛋白聚糖有关。结论生物信息学CCC法可应用于筛选出预测非小细胞肺癌化疗药物敏感性的基因,可能为将来构建NP方案精准化疗模型提供研究基础。
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关键词
药物敏感
性
基因
NP方案
非小细胞肺癌
生物
信息
学
一致
性
相关
系数(CCC)
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职称材料
糖尿病性高血压大鼠肾损害相关基因cDNA片段的克隆与初步鉴定
被引量:
4
3
作者
张芳林
李果
+6 位作者
叶传忠
丁伟
刘优萍
谢超
张迪
孙卫华
罗敏
《生物化学与生物物理进展》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2002年第1期94-99,共6页
为筛选大鼠糖尿病性高血压病所致的肾损害相关基因 ,自发性高血压大鼠以STZ 5 0mg/kg一次性尾静脉注射 ,建立糖尿病性高血压大鼠模型 ,4周后该模型大鼠尿蛋白持续阳性 ,电镜观察到肾小球基质增生、足突融合或扁平 .应用荧光标记的差异...
为筛选大鼠糖尿病性高血压病所致的肾损害相关基因 ,自发性高血压大鼠以STZ 5 0mg/kg一次性尾静脉注射 ,建立糖尿病性高血压大鼠模型 ,4周后该模型大鼠尿蛋白持续阳性 ,电镜观察到肾小球基质增生、足突融合或扁平 .应用荧光标记的差异显示反转录聚合酶链反应 (DDRT PCR)及RNA印迹技术 ,比较两种模型大鼠肾皮质的基因表达差异 ,并进行差异条带的cDNA序列生物信息学分析 .其中 4个差异条带与Genbank数据库比较 ,2个为未知基因 ,2个为已知基因 ,即成淀粉样糖蛋白 (amyloidogenicglycoprotein ,AGG)、CDK10 9,两者可能与糖尿病性高血压肾损害的发生相关 ,对它们的进一步研究将为肾损害发病机理的发现提供思路 .
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关键词
差异显示
糖尿病
性
高血压
肾损害
生物
信息
学
相关
基因
CDNA片段
克隆
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职称材料
甘草NRAMP基因家族的鉴定和生物信息学分析
被引量:
7
4
作者
卢婷婷
李艳玲
+1 位作者
李存法
李利红
《河南农业科学》
北大核心
2019年第2期40-47,共8页
为研究甘草自然抗性相关巨噬细胞蛋白(NRAMP)家族成员的结构和功能,利用生物信息学方法,从甘草全基因组数据库中筛选并鉴定甘草NRAMP家族基因序列,并对该家族成员做进化分析、基因结构分析、保守结构域和保守基序分析、二级结构和三维...
为研究甘草自然抗性相关巨噬细胞蛋白(NRAMP)家族成员的结构和功能,利用生物信息学方法,从甘草全基因组数据库中筛选并鉴定甘草NRAMP家族基因序列,并对该家族成员做进化分析、基因结构分析、保守结构域和保守基序分析、二级结构和三维结构分析。结果显示,从甘草基因组中共鉴定出11个NRAMP基因家族成员,通过进化分析发现,亲缘关系近的NRAMP家族成员基因结构和保守基序都更为相似,甘草和大豆的NRAMP家族成员间亲缘关系更接近。甘草大部分NRAMP家族成员的氨基酸数量差异不大,介于300~549个,且亚细胞定位在细胞膜上,而2个分子质量较大的成员GurNRAMP7和GurNRAMP8亚细胞定位在叶绿体上,各个成员的跨膜结构数量不尽相同。各个基因在染色体上的分布较为分散,只有NRAMP9、NRAMP10、NRAMP11定位在同一条染色体上。α-螺旋是甘草NRAMP家族成员中最主要的二级结构,但各个成员含有的α-螺旋数量不完全一样。
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关键词
甘草
自然抗
性
相关
巨噬细胞蛋白
基因
家族
生物
信息
学分析
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职称材料
中国野桑蚕DH-PBAN基因克隆研究初报
5
作者
徐春媛
刘彦群
鲁成
《西南农业大学学报(自然科学版)》
CSCD
北大核心
2003年第4期327-330,共4页
根据家蚕(Bombyxmori)滞育激素-性信息素合成激活肽(DH-PBAN)基因的DNA序列设计引物,以中国野桑蚕(BombyxmandarinaChina)基因组DNA为模板进行PCR扩增。试验首先确立了比较稳定的从基因组扩增目的片段的扩增体系及程序,并用该扩增体系...
根据家蚕(Bombyxmori)滞育激素-性信息素合成激活肽(DH-PBAN)基因的DNA序列设计引物,以中国野桑蚕(BombyxmandarinaChina)基因组DNA为模板进行PCR扩增。试验首先确立了比较稳定的从基因组扩增目的片段的扩增体系及程序,并用该扩增体系及程序克隆到中国野桑蚕DH,PBAN及DH-PBAN基因的第5内含子序列。试验还发现该基因第3内含子在家蚕和野桑蚕之间表现出多态性。
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关键词
中国野桑蚕
滞育激素-
性
信息
素合成
激活肽
多态
性
基因
克隆
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职称材料
题名
柞蚕性信息素合成相关基因的表达研究
1
作者
侯洋
张芳
王郡
胡飞
刘彦群
魏兆军
机构
合肥工业大学生物与食品工程学院
沈阳农业大学生命科学技术学院
出处
《安徽农业科学》
CAS
2015年第16期49-52,共4页
基金
国家自然科学基金项目(31072091
31272111)
文摘
[目的]明确与性信息素合成相关基因的组织分布及其在性腺中的发育表达。[方法]利用荧光定量PCR方法,对柞蚕乙酰辅酶A羧化酶、超长链脂肪酸、醇脱氢酶、酯酶、脂肪酶基因在不同组织分布及性腺中的发育表达进行分析。[结果]乙酰辅酶A羧化酶、超长链脂肪酸2个基因在性腺中的表达量显著高于其他组织;醇脱氢酶、酯酶和脂肪酶3个基因在中肠或脂肪体等组织中表达量高于性腺。乙酰辅酶A羧化酶、超长链脂肪酸、醇脱氢酶、脂肪酶4个基因在羽化后2 d性腺中的表达量显著高于羽化前2 d。酯酶基因在羽化后2 d性腺中的表达量显著低于于羽化前2 d。[结论]明确了柞蚕性信息素合成相关的5个基因的组织分布和发育表达,为进一步研究这些性信息素合成相关基因的功能奠定基础。
关键词
柞蚕
性信息素合成相关基因
表达
Keywords
Antheraea pernyi
Genes related to pheromone biosynthesis
Expression
分类号
S188 [农业科学—农业基础科学]
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职称材料
题名
生物信息学一致性相关系数法预测非小细胞肺癌的NP化疗方案药物敏感性基因
被引量:
2
2
作者
王卓智
陈秋月
韩勇
陈永孜
黄怡菲
龚卫静
徐双兵
李居怡
邓艾平
刘亚妮
曾芳
吕永宁
张玉
机构
天津医科大学生物医学工程与技术学院
华中科技大学同济医学院附属协和医院药学部
天津医科大学肿瘤医院肿瘤细胞生物学实验室
华中科技大学同济医学院附属协和医院肿瘤科
武汉市中心医院
出处
《医药导报》
CAS
北大核心
2021年第2期153-157,共5页
基金
国家重点研发计划资助项目(2017YFC0909900)
国家自然科学基金资助项目(81673456)
武汉市卫健委重大项目(WX18M02)。
文摘
目的用生物信息学一致性相关系数(CCC)法预测非小细胞肺癌一线化疗方案NP方案(长春瑞滨+顺铂)药物敏感性基因。方法使用5种统计学方法:Pearson相关分析、Spearman相关分析、Welch's t-test、ANCOVA和rank-based ANCOVA,从NCI 60数据库筛选药物敏感性基因,通过CCC筛选非小细胞肺癌患者化疗药物敏感性基因。利用在线数据库DAVID进行KEGG通路富集分析。结果筛选出可能应用于预测非小细胞肺癌化疗药物敏感性基因:顺铂的药物敏感性基因主要富集在蛋白聚糖、细菌侵袭上皮细胞通路中;长春瑞滨的药物敏感性基因主要与癌症信号通路、蛋白聚糖有关。结论生物信息学CCC法可应用于筛选出预测非小细胞肺癌化疗药物敏感性的基因,可能为将来构建NP方案精准化疗模型提供研究基础。
关键词
药物敏感
性
基因
NP方案
非小细胞肺癌
生物
信息
学
一致
性
相关
系数(CCC)
Keywords
Drug sensitivity genes
NP scheme
Non-small cell lung cancer
Bioinformatics
Concordance correlation coefficient(CCC)
分类号
R979.1 [医药卫生—药品]
R734.2 [医药卫生—肿瘤]
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职称材料
题名
糖尿病性高血压大鼠肾损害相关基因cDNA片段的克隆与初步鉴定
被引量:
4
3
作者
张芳林
李果
叶传忠
丁伟
刘优萍
谢超
张迪
孙卫华
罗敏
机构
上海第二医科大学附属瑞金医院
复旦大学附属中山医院泌尿外科
出处
《生物化学与生物物理进展》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2002年第1期94-99,共6页
文摘
为筛选大鼠糖尿病性高血压病所致的肾损害相关基因 ,自发性高血压大鼠以STZ 5 0mg/kg一次性尾静脉注射 ,建立糖尿病性高血压大鼠模型 ,4周后该模型大鼠尿蛋白持续阳性 ,电镜观察到肾小球基质增生、足突融合或扁平 .应用荧光标记的差异显示反转录聚合酶链反应 (DDRT PCR)及RNA印迹技术 ,比较两种模型大鼠肾皮质的基因表达差异 ,并进行差异条带的cDNA序列生物信息学分析 .其中 4个差异条带与Genbank数据库比较 ,2个为未知基因 ,2个为已知基因 ,即成淀粉样糖蛋白 (amyloidogenicglycoprotein ,AGG)、CDK10 9,两者可能与糖尿病性高血压肾损害的发生相关 ,对它们的进一步研究将为肾损害发病机理的发现提供思路 .
关键词
差异显示
糖尿病
性
高血压
肾损害
生物
信息
学
相关
基因
CDNA片段
克隆
Keywords
differential display
diabetic hypertension
kidney
bioinformatics
分类号
R544.14 [医药卫生—心血管疾病]
R587.2 [医药卫生—内分泌]
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职称材料
题名
甘草NRAMP基因家族的鉴定和生物信息学分析
被引量:
7
4
作者
卢婷婷
李艳玲
李存法
李利红
机构
河南牧业经济学院制药工程学院
河南大学植物逆境重点实验室
出处
《河南农业科学》
北大核心
2019年第2期40-47,共8页
基金
河南省科技攻关项目(162102110033)
河南牧业经济学院重点学科项目(41000003)
+1 种基金
河南牧业经济学院骨干教师项目(84000063)
河南牧业经济学院科研创新团队项目(2018KYTD18)
文摘
为研究甘草自然抗性相关巨噬细胞蛋白(NRAMP)家族成员的结构和功能,利用生物信息学方法,从甘草全基因组数据库中筛选并鉴定甘草NRAMP家族基因序列,并对该家族成员做进化分析、基因结构分析、保守结构域和保守基序分析、二级结构和三维结构分析。结果显示,从甘草基因组中共鉴定出11个NRAMP基因家族成员,通过进化分析发现,亲缘关系近的NRAMP家族成员基因结构和保守基序都更为相似,甘草和大豆的NRAMP家族成员间亲缘关系更接近。甘草大部分NRAMP家族成员的氨基酸数量差异不大,介于300~549个,且亚细胞定位在细胞膜上,而2个分子质量较大的成员GurNRAMP7和GurNRAMP8亚细胞定位在叶绿体上,各个成员的跨膜结构数量不尽相同。各个基因在染色体上的分布较为分散,只有NRAMP9、NRAMP10、NRAMP11定位在同一条染色体上。α-螺旋是甘草NRAMP家族成员中最主要的二级结构,但各个成员含有的α-螺旋数量不完全一样。
关键词
甘草
自然抗
性
相关
巨噬细胞蛋白
基因
家族
生物
信息
学分析
Keywords
Glycyrrhiza uralensis
NRAMP gene family
Bioinformatics analysis
分类号
S567.7 [农业科学—中草药栽培]
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职称材料
题名
中国野桑蚕DH-PBAN基因克隆研究初报
5
作者
徐春媛
刘彦群
鲁成
机构
西南农业大学蚕学与生物技术学院农业部蚕学重点实验室
出处
《西南农业大学学报(自然科学版)》
CSCD
北大核心
2003年第4期327-330,共4页
基金
国家自然科学基金资助项目(30271005)
文摘
根据家蚕(Bombyxmori)滞育激素-性信息素合成激活肽(DH-PBAN)基因的DNA序列设计引物,以中国野桑蚕(BombyxmandarinaChina)基因组DNA为模板进行PCR扩增。试验首先确立了比较稳定的从基因组扩增目的片段的扩增体系及程序,并用该扩增体系及程序克隆到中国野桑蚕DH,PBAN及DH-PBAN基因的第5内含子序列。试验还发现该基因第3内含子在家蚕和野桑蚕之间表现出多态性。
关键词
中国野桑蚕
滞育激素-
性
信息
素合成
激活肽
多态
性
基因
克隆
Keywords
Chinese wild silkworm (Bombyx mandarina)
diapause hormone-pheromone biosynthesis activating neuropeptide (DH-PBAN)
polymorphism
分类号
S881.26 [农业科学—特种经济动物饲养]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
柞蚕性信息素合成相关基因的表达研究
侯洋
张芳
王郡
胡飞
刘彦群
魏兆军
《安徽农业科学》
CAS
2015
0
在线阅读
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职称材料
2
生物信息学一致性相关系数法预测非小细胞肺癌的NP化疗方案药物敏感性基因
王卓智
陈秋月
韩勇
陈永孜
黄怡菲
龚卫静
徐双兵
李居怡
邓艾平
刘亚妮
曾芳
吕永宁
张玉
《医药导报》
CAS
北大核心
2021
2
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职称材料
3
糖尿病性高血压大鼠肾损害相关基因cDNA片段的克隆与初步鉴定
张芳林
李果
叶传忠
丁伟
刘优萍
谢超
张迪
孙卫华
罗敏
《生物化学与生物物理进展》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2002
4
在线阅读
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职称材料
4
甘草NRAMP基因家族的鉴定和生物信息学分析
卢婷婷
李艳玲
李存法
李利红
《河南农业科学》
北大核心
2019
7
在线阅读
下载PDF
职称材料
5
中国野桑蚕DH-PBAN基因克隆研究初报
徐春媛
刘彦群
鲁成
《西南农业大学学报(自然科学版)》
CSCD
北大核心
2003
0
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职称材料
已选择
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