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木豆响应低温胁迫的差异表达蛋白分析
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作者 唐军 王文强 +3 位作者 陈志坚 马向丽 毕玉芬 郭凤根 《中国草地学报》 CSCD 北大核心 2024年第12期12-23,共12页
木豆为热带及部分亚热带地区重要的食饲兼用作物,南方低温会导致木豆的减产,开展木豆的耐寒性研究可为耐寒木豆新品种培育提供数据支撑。为探究不同耐寒性木豆的蛋白表达差异特性,本试验以耐低温的缅甸木豆(MD)和低温敏感型的琼中木豆(... 木豆为热带及部分亚热带地区重要的食饲兼用作物,南方低温会导致木豆的减产,开展木豆的耐寒性研究可为耐寒木豆新品种培育提供数据支撑。为探究不同耐寒性木豆的蛋白表达差异特性,本试验以耐低温的缅甸木豆(MD)和低温敏感型的琼中木豆(QZ)种质为材料,4℃低温胁迫96 h后,进行蛋白组测序和DIA分析,结果表明:MD和QZ材料中差异表达蛋白(DEPs)分别为56个和57个;GO分析发现DEPs主要涉及催化活性、结合、细胞过程和代谢过程等,MD中显著富集在氧化还原酶活性、应激反应、信号转导等功能,QZ中显著富集在水解酶活性、水解O-糖基化合物和蓝光光感受体活性等;KEGG分析显示,DEPs涉及代谢通路、次级代谢物生物合成等途径,在MD中显著富集在苯丙烷类生物合成、内质网蛋白加工过程和RNA聚合酶途径,而在QZ中显著富集在氨基糖和核糖代谢、植物昼夜节律和次级代谢物生物合成途径。大部分DEPs亚细胞定位于细胞质、叶绿体和细胞核中。蛋白组学分析表明,过氧化物酶是参与提高木豆耐寒能力的关键蛋白,氧化还原酶活性、应激反应、信号转导、苯丙烷类生物合成、内质网蛋白加工过程等生物学途径参与木豆响应低温胁迫过程。 展开更多
关键词 木豆 低温胁迫 蛋白组学 差异表达蛋白
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大理野茄M239响应黄萎病病菌侵染的差异表达蛋白分析
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作者 蔚亚楠 黎志彬 +5 位作者 龚亚菊 鲍锐 桂敏 杜光辉 刘家迅 吴丽艳 《华北农学报》 CSCD 北大核心 2024年第1期165-174,共10页
为了探索植物响应黄萎病病原菌侵染的作用机制,以黄萎病高感野茄材料大理野茄(M239)为研究对象,通过人工接种黄萎病病原菌大丽轮枝菌的方法,首先测定M239在接种大丽轮枝菌后0,6,12,24,48 h的根部4个关键生理指标,即过氧化物酶(POD)、过... 为了探索植物响应黄萎病病原菌侵染的作用机制,以黄萎病高感野茄材料大理野茄(M239)为研究对象,通过人工接种黄萎病病原菌大丽轮枝菌的方法,首先测定M239在接种大丽轮枝菌后0,6,12,24,48 h的根部4个关键生理指标,即过氧化物酶(POD)、过氧化氢酶(CAT)、苯丙氨酸解氨酶(PAL)的活性和可溶性蛋白(SP)含量的变化。结果确定接种大丽轮枝菌后12,24 h为蛋白组分析取样的关键时间点;在此基础上,利用iTRAQ技术分析M239在接种大丽轮枝菌后根部蛋白的变化。结果发现,与清水接种(CK)相比,M239接种大丽轮枝菌后12 h有463个差异表达蛋白(DEPs),其中305个下调,158个上调;接种后24 h,有456个DEPs被病原菌诱导表达,包括296个下调,160个上调。这些蛋白主要富集在碳代谢、乙醛酸和二羧酸代谢、次生代谢物的生物合成、丙酮酸代谢、新陈代谢等途径。通过与已报道的黄萎病抗性材料的研究结果进行对比分析发现,M239在响应大丽轮枝菌的侵染过程中,参与防御响应的蛋白数量和代谢通路较少,未能形成有效的防御网络,最终表现为感病。 展开更多
关键词 野茄 黄萎病 大丽轮枝菌 iTRAQ技术 差异表达蛋白
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原料乳冷藏过程中差异表达蛋白的表征与比较分析
3
作者 庄姣 剧柠 +6 位作者 朱晓雪 李亚凤 丁雨红 高岩 陈彦辉 齐瑾 杨秉坤 《食品科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2024年第5期225-232,共8页
采用数据独立采集蛋白质组学技术分析4℃冷藏6 d的原料乳差异蛋白质组成及其生物学功能。冷藏过程中,共鉴定到902种蛋白质。其中,冷藏前期(d 0 vs d 3)和冷藏后期(d 3 vs d 6)分别筛选出70种和71种差异表达蛋白。生物信息学分析发现冷... 采用数据独立采集蛋白质组学技术分析4℃冷藏6 d的原料乳差异蛋白质组成及其生物学功能。冷藏过程中,共鉴定到902种蛋白质。其中,冷藏前期(d 0 vs d 3)和冷藏后期(d 3 vs d 6)分别筛选出70种和71种差异表达蛋白。生物信息学分析发现冷藏前期差异蛋白具有对神经生长因子的刺激反应和细胞组织的调控等功能,主要参与了细胞的生物学过程;冷藏后期差异蛋白具有碳水化合物代谢过程和RNA代谢过程的调节等功能,主要参与了糖代谢途径。蛋白-蛋白互作网络分析表明,细胞分裂控制蛋白42同源物(CDC42)是两个冷藏阶段共有的关键节点蛋白,该蛋白与细胞的吞噬作用密切相关。上述结果揭示了冷藏过程中的蛋白质组成差异和功能的多样性,为原料乳的冷藏提供了理论依据,对原料乳的质量控制具有重要意义。 展开更多
关键词 原料乳 冷藏 蛋白组学 差异表达蛋白 生物信息学
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筛选差异表达基因和蛋白质的方法进展 被引量:19
4
作者 王吉村 药立波 赵忠良 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2001年第1期33-36,共4页
分离和鉴定差异表达基因和蛋白质不仅有助于发现基因和蛋白质的功能 ,更有助于揭示某些疾病的发生机理 .目前筛选差异表达基因的方法主要有差异显示PCR方法 (differentialdisplayRT PCR ,DDRT PCR)、消减杂交法 (subtractivehybridizati... 分离和鉴定差异表达基因和蛋白质不仅有助于发现基因和蛋白质的功能 ,更有助于揭示某些疾病的发生机理 .目前筛选差异表达基因的方法主要有差异显示PCR方法 (differentialdisplayRT PCR ,DDRT PCR)、消减杂交法 (subtractivehybridization ,SH )、基因芯片技术 (DNAchiptechnique)和基因表达的系统分析 (serialanalysisofgeneexpression ,SAGE)等 ,其中消减杂交法中又先后建立了代表性差异分析技术 (representationaldifferenceanalysis ,RDA)、抑制消减杂交法 (suppressionsubtractivehybridization ,SSH)和获得全长基因的消减杂交法 (full length gene obtainablesubtractivehybridization) .筛选差异表达蛋白质的方法主要有双向电泳技术(two dimentionalgelelectrophoresis)和噬菌体全套抗体库技术 (phagedisplayantibodyrepertoirelibrarytechnique) .这些方法各有特点 ,各有利弊 ,研究者可根据自己的需要选择适合于自己的方法 . 展开更多
关键词 筛选 差异表达基因 差异表达蛋白
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不同配穴针刺预防应激性胃溃疡的效应比较及差异表达蛋白的筛选 被引量:9
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作者 王朝辉 单纯筱 +2 位作者 周丹 严兴科 王富春 《吉林大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2013年第3期441-447,F0002,共8页
目的:观察不同配穴的预防性针刺对应激性胃溃疡大鼠胃组织损伤情况及蛋白质谱的影响,阐明不同配穴针刺预防应激性胃溃疡效果,获得相关差异表达蛋白。方法:120只雄性Wistar大鼠随机分为正常对照组、捆绑对照组、应激性胃溃疡模型组、募... 目的:观察不同配穴的预防性针刺对应激性胃溃疡大鼠胃组织损伤情况及蛋白质谱的影响,阐明不同配穴针刺预防应激性胃溃疡效果,获得相关差异表达蛋白。方法:120只雄性Wistar大鼠随机分为正常对照组、捆绑对照组、应激性胃溃疡模型组、募穴组、下合穴组、合募配穴组、背俞穴组和俞募配穴组,每组15只。各组大鼠针刺后采用水浸-束缚法制备应激性胃溃疡模型,观察各组大鼠胃黏膜损伤形态学表现,计算溃疡指数;提取胃组织蛋白,应用SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳方法对胃组织匀浆上清液中的蛋白进行梯度分离,采用纳升级电喷雾高效液相仪联合LTQ线性离子阱质谱仪(Eksigent-Thermo LTQ-MS)检测蛋白表达水平。结果:合募配穴组大鼠溃疡指数低于募穴组、下合穴组、背俞穴组和俞募配穴组(P<0.05)。筛选出的感兴趣差异表达蛋白有以下几种:①酶类,包括甘油醛-3-磷酸脱氢酶(GAPDH)、碳酸酐酶1(Car1)、碳酸酐酶3(Car3)、乌头合酶(Aco2)、α-烯醇化酶(Eno1)、β烯醇化酶(Eno3)和γ烯醇化酶;②运动(骨架)蛋白质,包括alpha 1肌动蛋白(Actc1)、β肌动蛋白(Actb)、α肌动蛋白(Acta1)和相对分子质量为43 000的蛋白质(Actg2);③运输蛋白质,包括血清铁传递蛋白(TF亚型1)和钙网蛋白(Calr);④热休克蛋白,包括相对分子质量为10 000的热休克蛋白(Hspe1)。结论:合募配穴预防应激性胃溃疡效果优于单穴组及俞募配穴组,机制可能与多种蛋白的表达变化有关。 展开更多
关键词 合募配穴 针刺 应激性胃溃疡 差异表达蛋白
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正常精子和圆头精子差异表达蛋白的分离与鉴定 被引量:12
6
作者 罗克莉 范立青 +1 位作者 朱文兵 卢光 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2003年第5期792-797,共6页
圆头精子症是一种表现为顶体缺失的男性不育症.为了研究正常精子和圆头精子的蛋白质组成差异,用固相pH梯度双向凝胶电泳和质谱分析等蛋白质组学方法,分离了 30份正常和 3份圆头精子标本的蛋白质.对其中16个在正常精子中有高丰度表达而... 圆头精子症是一种表现为顶体缺失的男性不育症.为了研究正常精子和圆头精子的蛋白质组成差异,用固相pH梯度双向凝胶电泳和质谱分析等蛋白质组学方法,分离了 30份正常和 3份圆头精子标本的蛋白质.对其中16个在正常精子中有高丰度表达而在圆头精子中缺失,和 1个在圆头精子中表达明显下调的蛋白质点,以及在圆头精子中存在而在正常精子中缺失的蛋白质簇W和点X,进行了肽质指纹分析和蛋白质鉴定,获得 8个点的肽质量指纹图,经MS Fit软件搜索SWISS PROT数据库来鉴定其身分.发现其中 3个点与高尔基体相关、2个点与蛋白酶体相关、2个点为锌指蛋白。 展开更多
关键词 正常精子 圆头精子 差异表达 蛋白 分离 蛋白质组学
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低温胁迫下苦瓜幼苗差异蛋白的表达与分析 被引量:5
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作者 黄玉辉 梁家作 +6 位作者 黄熊娟 冯诚诚 黄如葵 陈小凤 刘杏连 陈振东 秦健 《南方农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第4期594-600,共7页
【目的】寻找与苦瓜苗期耐低温表达调控相关的蛋白,深入了解苦瓜抗低温机理,为下一步开展苦瓜耐低温分子基础研究及苦瓜耐低温育种打下基础。【方法】以耐冷型MC108和冷敏型MC6苦瓜品种为材料,运用双向电泳技术分析低温胁迫(8℃低温胁迫... 【目的】寻找与苦瓜苗期耐低温表达调控相关的蛋白,深入了解苦瓜抗低温机理,为下一步开展苦瓜耐低温分子基础研究及苦瓜耐低温育种打下基础。【方法】以耐冷型MC108和冷敏型MC6苦瓜品种为材料,运用双向电泳技术分析低温胁迫(8℃低温胁迫72 h)下苦瓜苗期叶片蛋白质差异变化。【结果】对2-DE图谱分析发现,冷敏型MC6和耐冷型MC108苦瓜品种间共存在82个差异蛋白点,其中,39个蛋白点上调,36个蛋白点下调,2个新增蛋白点,5个消失蛋白点;对其中24个表达量变化明显的蛋白质点进行MALDI-TOF-TOF/MS分析,经数据库搜索匹配,鉴定出5个未知蛋白和14个功能蛋白,这些蛋白涉及细胞防御、自由基清除、光合作用、基础代谢、蛋白降解等多个功能类别。【结论】在逆境胁迫下苦瓜可通过调节多种蛋白表达来适应外界温度的变化。 展开更多
关键词 苦瓜 低温胁迫 差异蛋白 表达
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钝顶螺旋藻Spirulina platensis两种不同形态藻丝体的光合作用和蛋白质差异表达分析 被引量:8
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作者 林重阳 沈晓文 +2 位作者 赵振坤 吴韩志 徐虹 《高等学校化学学报》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 2009年第6期1152-1157,共6页
从钝顶螺旋藻Spirulina platensis中分离纯化获得了螺旋形和直线形两种不同形态的藻丝体.通过对二者光合作用的研究发现,螺旋形藻丝体具有较高的光饱和光合作用速率(PmChla)和光饱和点,比直线形藻丝体更能适应较高光强的环境;而直线形... 从钝顶螺旋藻Spirulina platensis中分离纯化获得了螺旋形和直线形两种不同形态的藻丝体.通过对二者光合作用的研究发现,螺旋形藻丝体具有较高的光饱和光合作用速率(PmChla)和光饱和点,比直线形藻丝体更能适应较高光强的环境;而直线形藻丝体具有较低的光补偿点,能在更低的光强下进行光合作用.通过双向凝胶电泳对两种不同形态藻丝体的总蛋白进行比较分析,从中找出了9个差异表达的蛋白点.应用基质辅助激光解吸电离质谱对差异表达的蛋白质点进行鉴定和数据库检索,结果表明,3个蛋白与肽聚糖代谢有关,2个蛋白与光合作用有关,1个蛋白与细胞分裂调控相关,1个蛋白为外膜通道蛋白,2个蛋白为功能未知的假想蛋白. 展开更多
关键词 钝顶螺旋藻 形态差异 光合作用 双向电泳 差异表达蛋白
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磷胁迫下油菜幼苗叶片差异蛋白表达的初步分析 被引量:8
9
作者 余永芳 赵丹丹 +3 位作者 李玉琴 牛银银 田保明 臧新 《河南农业科学》 CSCD 北大核心 2011年第8期89-91,112,共4页
以油菜品种中油821为材料,利用双向电泳技术研究足磷和缺磷条件下油菜幼苗叶片差异表达的蛋白质,进而为揭示油菜耐低磷胁迫的分子机制奠定基础。结果表明:经电泳、PDQuest分析后,缺磷处理下差异显著的蛋白质点有38个,19个表达量显著上调... 以油菜品种中油821为材料,利用双向电泳技术研究足磷和缺磷条件下油菜幼苗叶片差异表达的蛋白质,进而为揭示油菜耐低磷胁迫的分子机制奠定基础。结果表明:经电泳、PDQuest分析后,缺磷处理下差异显著的蛋白质点有38个,19个表达量显著上调,19个显著下调。磷胁迫下蛋白表达量的差异说明逆境下植物体可通过多种蛋白的协调作用来适应外界环境的变化。 展开更多
关键词 油菜 磷胁迫 双向电泳 蛋白质组学 差异蛋白表达
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乳腺癌中着丝粒蛋白CenpG的差异表达 被引量:5
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作者 梁前进 鲁香凤 +3 位作者 程晓蕾 张焕相 何大澄 王永潮 《高技术通讯》 EI CAS CSCD 2002年第1期30-33,共4页
用间接免疫荧光 (IIF)验证了着丝粒蛋白CenpG的一种抗血清 ;通过对 31例乳腺癌组织块及每一例病人的癌旁正常 (非癌性 )组织块蛋白提取物进行免疫印迹 (Westernblot)分析 ,发现多数情况下 (71% )癌组织中着丝粒蛋白CenpG(95kD)过表达 ;... 用间接免疫荧光 (IIF)验证了着丝粒蛋白CenpG的一种抗血清 ;通过对 31例乳腺癌组织块及每一例病人的癌旁正常 (非癌性 )组织块蛋白提取物进行免疫印迹 (Westernblot)分析 ,发现多数情况下 (71% )癌组织中着丝粒蛋白CenpG(95kD)过表达 ;在两例乳腺癌组织中还发现了一种能被CenpG抗血清识别的 4 3kD蛋白质成分。结果表明 ,新近发现和命名的CenpG(或者还有其他相关成分 ) 展开更多
关键词 CenpG 差异表达 乳腺癌 着丝粒蛋白 细胞增殖 抗血清
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中等强度运动对大鼠心室肌蛋白质组差异表达的影响 被引量:8
11
作者 史绍蓉 袁爱国 +3 位作者 王娟 刘建荣 刘田 李颂 《体育科学》 CSSCI 北大核心 2008年第12期56-61,共6页
目的:探讨4周中等强度运动后大鼠左、右室肌蛋白质组的差异性表达,初步筛选出心脏在运动反应与适应过程中的目标蛋白质;方法:将18只雄性SD大鼠随机分为实验组和平行对照组(n=9)。实验组经4周中等负荷强度(70%V.O2max~80%V.O2max)跑台... 目的:探讨4周中等强度运动后大鼠左、右室肌蛋白质组的差异性表达,初步筛选出心脏在运动反应与适应过程中的目标蛋白质;方法:将18只雄性SD大鼠随机分为实验组和平行对照组(n=9)。实验组经4周中等负荷强度(70%V.O2max~80%V.O2max)跑台训练后,与对照组一起,提取左、右室肌组织的全蛋白样品。进行2-DE蛋白样品分离,采用PD-Quest软件进行图像分析和数据采集。选择运动后差异表达量≥10倍的备选目标蛋白点,进行胶內原位酶解与一、二级质谱鉴定;结果:运动后左、右心室差异表达量≥10倍的蛋白质点共24个,取其中9个点,经一、二级质谱鉴定出ATP合酶偶合因子6、葡萄糖调节蛋白78、烯酰辅酶A水合酶、ATP合酶α亚基、丙酮酸脱氢酶E1α1、硒联蛋白1、类似信号增殖关联蛋白1和丝氨酸精氨酸前体-mRNA拼接因子SR-A1以及一个分子量为116kDa的未知蛋白;结论:1)实验大鼠在心脏重塑过程中,左、右室肌蛋白质组发生了显著的变化。2)成功筛选出在运动医学领域中尚未涉足的8种目标蛋白,其表达量发生的适应性变化表明,在中等强度运动下,会引起心肌能量代谢水平的提高、心肌应激反应与适应能力的增强、血压调节能力的改善等一系列有益变化。 展开更多
关键词 运动心脏 左室肌 右室肌 中等强度运动 蛋白质组 差异表达
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脊髓全横断损伤后差异表达蛋白的蛋白质组学分析 被引量:6
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作者 杨明理 刘新宇 +3 位作者 杨金亮 王黎明 张勇刚 胡火珍 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第3期212-220,共9页
对脊髓全横断损伤前后的大鼠脊髓全蛋白质进行双向凝胶电泳,借助PDQuest软件从中找出差异表达蛋白质点.应用基质辅助激光解吸电离串联质谱,对差异表达的蛋白质点进行鉴定,成功鉴定出18种蛋白质.脊髓损伤3d后表达上调的蛋白质有巨噬细胞... 对脊髓全横断损伤前后的大鼠脊髓全蛋白质进行双向凝胶电泳,借助PDQuest软件从中找出差异表达蛋白质点.应用基质辅助激光解吸电离串联质谱,对差异表达的蛋白质点进行鉴定,成功鉴定出18种蛋白质.脊髓损伤3d后表达上调的蛋白质有巨噬细胞游走抑制因子、S期激酶相关蛋白1、热休克蛋白27、多配体蛋白聚糖3、T细胞受体β链可变区、膜联蛋白Ⅲ、腺苷酸激酶1、半乳凝素3、丙酮酸脱氢酶、磷脂酶B、嗜铬粒蛋白A、热休克蛋白70凝结蛋白1;同时表达下调的蛋白质有磷酸丙糖异构酶、神经鞘氨醇磷酸化受体、热休克蛋白10、肽酰-脯氨酰-顺反式异构酶A.多数差异蛋白质涉及到神经细胞的增殖、凋亡、应激反应等过程,为进一步阐明中枢神经系统的损伤和修复机制提供了理论依据. 展开更多
关键词 脊髓损伤 差异表达蛋白 双向电泳 蛋白质组学 质谱
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家蚕中肠组织在变态发育不同时期的蛋白表达差异分析 被引量:5
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作者 黄志君 邓小娟 +5 位作者 陈芳艳 母培强 杨婉莹 钟仰进 夏庆友 曹阳 《蚕业科学》 CAS CSCD 北大核心 2007年第2期207-215,共9页
分析了家蚕在变态期不同发育时段中肠组织蛋白表达差异的信息。SDS-PAGE电泳分析显示,从家蚕吐丝前1 d到化蛹72 h的中肠蛋白分离到相对明显的16条泳带,其中分子量约为30、45、70 kD的蛋白组分含量较大,且比较稳定,分子量约为50、60、62... 分析了家蚕在变态期不同发育时段中肠组织蛋白表达差异的信息。SDS-PAGE电泳分析显示,从家蚕吐丝前1 d到化蛹72 h的中肠蛋白分离到相对明显的16条泳带,其中分子量约为30、45、70 kD的蛋白组分含量较大,且比较稳定,分子量约为50、60、62 kD的蛋白组分在不同时期存在着显著的表达差异。进而通过聚丙烯酰胺双向凝胶电泳分析,发现家蚕中肠组织蛋白的表达种类和差异蛋白数目的变化在化蛹1~3 d非常明显:蛋白表达种类的变化呈现2个高峰,分别为化蛹0 h和化蛹41 h;差异蛋白数目的变化呈现3个波峰,分别在吐丝98 h至化蛹0 h、化蛹30~41 h和化蛹41~58 h。在化蛹1~3 d,这种显著峰值变化的时期刚好与家蚕中肠组织发生旧肠壁细胞退化死亡和新生肠壁细胞分化增殖的盛期相吻合,从一个侧面反映了家蚕中肠组织在变态期活跃的发育进程。 展开更多
关键词 家蚕 变态期 中肠组织 蛋白表达差异
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基于iTraq技术的加拿大一枝黄花提取物作用下铜绿微囊藻细胞差异表达蛋白 被引量:6
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作者 黄莹莹 白羽 +1 位作者 王艳 孔海南 《中国环境科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2015年第6期1822-1830,共9页
为研究加拿大一枝黄花提取物对藻类生长抑制作用的分子机理,应用iTraq技术结合LC-MS-MS,分析了铜绿微囊藻细胞蛋白质的差异表达.共鉴定出261种差异蛋白(变化倍数≥1.5),其中表达上调的220种,表达下调的41种.GO功能分类显示,加拿大一枝... 为研究加拿大一枝黄花提取物对藻类生长抑制作用的分子机理,应用iTraq技术结合LC-MS-MS,分析了铜绿微囊藻细胞蛋白质的差异表达.共鉴定出261种差异蛋白(变化倍数≥1.5),其中表达上调的220种,表达下调的41种.GO功能分类显示,加拿大一枝黄花提取物通过影响细胞代谢过程、蛋白质催化和结合功能等方式抑制藻细胞生长.KEGG通路分析表明,通路大类中富集程度位于前3位的均是代谢通路,包括能量代谢、碳水化合物代谢和氨基酸代谢,通路中富集程度最高的是糖酵解/糖异生通路.本研究发现了加拿大一枝黄花提取物对藻细胞生长抑制作用的分子靶点,为从分子层面阐明其抑藻作用提供参考,也为研究植物化感物质的抑藻机理提供了新方法. 展开更多
关键词 iTraq标记 化感作用 差异表达蛋白 抑藻机理
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不同羊毛纤维直径细毛羊皮肤组织差异表达蛋白质研究 被引量:7
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作者 付雪峰 杨涵羽璐 +6 位作者 石刚 徐新明 张恩平 狄江 张艳花 黄锡霞 田可川 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2016年第4期879-891,共13页
试验旨在研究不同纤维直径的细毛羊皮肤组织中毛囊差异表达的蛋白质,探讨与羊毛细度相关的蛋白质功能。应用双向凝胶电泳技术建立细毛羊皮肤组织中毛囊差异表达蛋白质图谱;运用ImageMaster 2DPlatinum软件检测细毛羊毛囊组织差异表达蛋... 试验旨在研究不同纤维直径的细毛羊皮肤组织中毛囊差异表达的蛋白质,探讨与羊毛细度相关的蛋白质功能。应用双向凝胶电泳技术建立细毛羊皮肤组织中毛囊差异表达蛋白质图谱;运用ImageMaster 2DPlatinum软件检测细毛羊毛囊组织差异表达蛋白质;通过质谱鉴定技术和数据库比对等方法开展细毛羊皮肤组织毛囊特异性蛋白质分类和功能鉴定。结果成功鉴定出94个差异蛋白质,其中,相同年龄超细型细毛羊和细型细毛羊皮肤毛囊组织中有73个差异蛋白质;不同年龄的超细型细毛羊毛囊组织中有21个差异蛋白质。按功能属性划分得到了角蛋白、分子伴侣类蛋白、细胞骨架结构类蛋白、14-3-3蛋白、蛋白酶类、肌球蛋白、血清白蛋白和其他蛋白8类功能蛋白。结果提示,应用生物信息学技术分析这些差异蛋白与羊毛纤维直径的内在联系,为优质细毛羊的培育提供直接有效的基因资源信息,对提高羊毛品质具有重要的意义。 展开更多
关键词 细毛羊 双向凝胶电泳 蛋白质组学 差异表达蛋白
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油松毛虫取食和剪叶刺激胁迫下油松的蛋白质表达差异分析 被引量:6
16
作者 王银翠 周国娜 +2 位作者 张斌 陈明叶 高宝嘉 《林业科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2016年第8期68-75,共8页
【目的】研究自然环境条件下剪叶和油松毛虫不同取食刺激程度双重诱导对油松体内蛋白质表达的影响,揭示油松诱导防御反应的蛋白质基础。【方法】在河北省平泉县的油松-山杏混交林中,选取15年生左右生长势一致的油松,进行树上套笼饲养10... 【目的】研究自然环境条件下剪叶和油松毛虫不同取食刺激程度双重诱导对油松体内蛋白质表达的影响,揭示油松诱导防御反应的蛋白质基础。【方法】在河北省平泉县的油松-山杏混交林中,选取15年生左右生长势一致的油松,进行树上套笼饲养10头、30头油松毛虫和剪叶处理,以未处理油松为对照,采用双向电泳法测定油松体内蛋白质表达差异。【结果】通过蛋白质点表达量的计算,与对照相比,油松毛虫取食及剪叶刺激后,均有特异表达蛋白点、消失蛋白点、上调蛋白点及下调蛋白点,但不同处理间蛋白点的表达差异不同。对差异蛋白点进行质谱鉴定,数据库检索结果表明,油松毛虫取食后特异表达的蛋白点是叶绿体ATP合酶CF0β亚基、抗坏血酸过氧化物酶、噻唑生物合成酶、Lhcb5蛋白、ATP合酶β亚基以及蛋白类谷胱甘肽S-转移酶,下调表达的蛋白点是蛋白酶亚基和假定蛋白CL304Contig1_01;剪叶刺激后特异表达的蛋白点是tau蛋白类谷胱甘肽S-转移酶和Rubisco加氧酶,下调表达的蛋白点是磷酸甘油酸激酶Ⅰ和核酮糖-1,5-二磷酸羧化酶/加氧酶大亚基。进一步分析表明,取食刺激处理后,胁迫和防御相关蛋白高度表达,并且30头松毛虫取食后,与蛋白合成相关的蛋白质也特异表达;剪叶处理后,胁迫和防御相关蛋白也有特异表达,而且能量代谢相关蛋白下调。说明取食和创伤刺激可明显诱导油松防御有关蛋白的表达、光合作用的增强、蛋白质的合成和能量代谢的降低等防御反应。【结论】取食和剪叶刺激可明显诱导油松防御有关蛋白的高表达、促进光合作用的增强和蛋白质的合成,降低能量代谢等,这些变化应是构成油松防御反应的蛋白质基础。 展开更多
关键词 油松 油松毛虫 诱导防御反应 取食 剪叶 蛋白表达差异
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不同面团强度小麦品种差异表达贮藏蛋白基因分析 被引量:5
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作者 晁岳恩 李文旭 +2 位作者 王沙沙 杨攀 吴政卿 《河南农业科学》 北大核心 2022年第10期17-24,共8页
以2个高分子质量麦谷蛋白亚基(HMW-GS)组合完全一致但籽粒蛋白质含量和面团强度有较大差异的小麦品种(郑麦158:低蛋白质含量、高面团强度;郑麦119:高蛋白质含量、低面团强度)为试验材料,分别在开花后14、21、28 d,对其籽粒进行转录组测... 以2个高分子质量麦谷蛋白亚基(HMW-GS)组合完全一致但籽粒蛋白质含量和面团强度有较大差异的小麦品种(郑麦158:低蛋白质含量、高面团强度;郑麦119:高蛋白质含量、低面团强度)为试验材料,分别在开花后14、21、28 d,对其籽粒进行转录组测序,分析3个时间点2个品种间差异表达的贮藏蛋白基因、面粉中硫和巯基含量及差异表达基因编码蛋白质的半胱氨酸和自由巯基含量,以探讨HMWGS组合相同情况下面粉质量差异的可能原因。结果表明,郑麦158的籽粒总蛋白质含量较低,但面筋指数、面团稳定时间较高;2个品种的HMW-GS组合完全一致,而且高、低分子质量麦谷蛋白亚基基因表达量无显著差异;筛选出28个显著差异表达的贮藏蛋白基因,其中,5个基因(3个类燕麦贮藏蛋白和2个醇溶蛋白基因)在郑麦158中表达量显著上调,23个基因(16个醇溶蛋白基因、5个类燕麦贮藏蛋白基因和2个球蛋白基因)在郑麦158中表达量显著下调;郑麦158面粉中硫元素含量较低,但自由巯基、总巯基和二硫键含量较高,且郑麦158中上调表达贮藏蛋白基因编码蛋白质的半胱氨酸、自由巯基含量均较高。综上,HMW-GS组合可能不是决定面团强度的主要因素,降低醇溶蛋白基因的表达量是提高面团强度的有效措施,个别醇溶蛋白和类燕麦贮藏蛋白可能与面团强度密切相关,高自由巯基含量是高面团强度的分子基础。 展开更多
关键词 小麦 贮藏蛋白 面团强度 自由巯基 差异表达基因
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高脂饮食诱导的肥胖与肥胖抵抗大鼠肝FAS和ACAT-2的蛋白表达差异 被引量:11
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作者 刘桂 殷亮 +2 位作者 王晓慧 娄淑杰 史仍飞 《上海体育学院学报》 CSSCI 北大核心 2014年第6期105-109,共5页
目的:研究高脂饮食饲养的肥胖与肥胖抵抗大鼠的肝脂肪酸合成酶(FAS)和酰基辅酶A:胆固醇酰基转移酶-2(ACAT-2)的蛋白表达水平的差异,以明确这2种酶是否在高脂饮食诱导肥胖的发生及肥胖抵抗中起作用。方法:健康雄性SD大鼠,体重160~... 目的:研究高脂饮食饲养的肥胖与肥胖抵抗大鼠的肝脂肪酸合成酶(FAS)和酰基辅酶A:胆固醇酰基转移酶-2(ACAT-2)的蛋白表达水平的差异,以明确这2种酶是否在高脂饮食诱导肥胖的发生及肥胖抵抗中起作用。方法:健康雄性SD大鼠,体重160~180 g,15只喂普通膳食,其余135只喂自制高脂饲料8周。随机选择5只喂普通膳食的大鼠作为对照组,以体重超过普通膳食对照组平均体重的20%作为高脂饮食诱导的肥胖大鼠标准,选择8只为肥胖组(DIO);选择体重最轻的8只为肥胖抵抗组(DIO-R)。大鼠麻醉后,采血检测血浆中TG、TCH、HDL、LDL的含量。处死大鼠后取肝脏,Western blot检测肝FAS和ACAT-2的蛋白表达水平。结果:1135只高脂饮食大鼠中有48只体重超过平均值的20%,达到肥胖标准;2与对照组相比,肥胖组大鼠的体重、肾周脂肪含量显著增加,而肥胖抵抗大鼠显著下降;3与对照组相比,肥胖组大鼠的血浆TG和LDL显著增加,而肥胖抵抗大鼠的血浆TG、TCH显著降低,LDL和LDL/HDL无显著性变化;4与对照组相比,肥胖组大鼠肝FAS和ACAT-2的蛋白水平显著升高,而肥胖抵抗大鼠显著降低。结论:1高脂饮食诱导的肥胖大鼠肝FAS和ACAT-2的蛋白水平显著升高,肥胖抵抗大鼠的肝FAS和ACAT-2的蛋白水平显著降低;2肝FAS和ACAT-2蛋白水平的表达差异可能与高脂饮食大鼠的肥胖易感性有关。 展开更多
关键词 脂肪酸合成酶 酰基辅酶A:胆固醇酰基转移酶-2 肥胖 肥胖抵抗 蛋白表达 差异
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晋麦47幼苗叶片水分胁迫差异表达蛋白的鉴定与分析 被引量:3
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作者 范锋贵 金秀锋 +5 位作者 叶石 任万杰 张帆 鞠丽萍 王宏礼 张晓科 《麦类作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第3期566-572,共7页
为了从蛋白质水平进一步揭示小麦抗旱机理,以旱地小麦品种晋麦47为试验材料,采用蛋白质双向电泳技术,结合质谱鉴定技术,研究幼苗在正常供水与水分胁迫(-0.5 MPa的PEG-6000溶液处理48h)后叶片蛋白质组表达谱间的差异,分析水分胁迫差异表... 为了从蛋白质水平进一步揭示小麦抗旱机理,以旱地小麦品种晋麦47为试验材料,采用蛋白质双向电泳技术,结合质谱鉴定技术,研究幼苗在正常供水与水分胁迫(-0.5 MPa的PEG-6000溶液处理48h)后叶片蛋白质组表达谱间的差异,分析水分胁迫差异表达的蛋白种类及其功能。研究发现,在正常供水和水分胁迫处理两种条件下,幼苗叶片蛋白的双向电泳图谱均可重复检测到850个蛋白点;31个蛋白点在两种供水水平间表达量存在显著差异,其中17个蛋白点在水分胁迫处理下表达量明显增加,14个蛋白点表达量明显减少。对这些蛋白点进行肽指纹图谱分析,并利用Mascot软件在NCBInr数据库搜索,最终有26个蛋白点被成功鉴定;其中,未知功能蛋白7个;已知功能蛋白19个,主要涉及能量、代谢、抗病与防御、细胞结构、转录与翻译以及信号转导等功能类别。结果表明,小麦体内的多个代谢及调控途径参与了对干旱的应激反应。最后,本文还对鉴定到的差异蛋白点与水分胁迫的关系进行了分析和讨论。 展开更多
关键词 普通小麦 水分胁迫 双向电泳 差异表达蛋白
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细菌攻毒杂色鲍血淋巴细胞抑制性差减杂交文库构建及巨噬细胞表达蛋白cDNA的克隆与差异表达 被引量:4
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作者 任洪林 徐丹丹 +4 位作者 乔琨 蔡灵 黄伟滨 张鼐 王克坚 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2008年第8期1043-1050,共8页
以雌性杂色鲍为对象,以大肠杆菌、副溶血弧菌、溶壁微球菌、表皮葡萄球菌、金黄色葡萄球菌的混悬液做为攻毒菌,利用抑制性差减杂交(SSH)技术构建细菌攻毒的杂色鲍血淋巴细胞SSHcDNA文库。随机挑取生长菌落110个克隆子,进行菌液PCR鉴定,... 以雌性杂色鲍为对象,以大肠杆菌、副溶血弧菌、溶壁微球菌、表皮葡萄球菌、金黄色葡萄球菌的混悬液做为攻毒菌,利用抑制性差减杂交(SSH)技术构建细菌攻毒的杂色鲍血淋巴细胞SSHcDNA文库。随机挑取生长菌落110个克隆子,进行菌液PCR鉴定,计算文库重组率为98.18%,文库容量为1.37×106pfu。将重组子测序,经BLAST一致性搜索比对分析,有一重组片段含有穿孔素(Perforin)保守结构域,为巨噬细胞表达蛋白(MEP)类穿孔素部分cDNA序列,片段大小为1551bp,连续编码517个氨基酸残基,申请GenBank登录号为EU272049。经半定量PCR和荧光定量PCR差异显示分析,发现在细菌感染状态下MEP基因在血淋巴细胞中存在明显的上调表达现象。 展开更多
关键词 杂色鲍 血淋巴细胞 细菌 抑制性差减杂交 巨噬细胞表达蛋白 类穿孔素 差异表达分析
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