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磷胁迫下油菜幼苗叶片差异蛋白表达的初步分析 被引量:8
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作者 余永芳 赵丹丹 +3 位作者 李玉琴 牛银银 田保明 臧新 《河南农业科学》 CSCD 北大核心 2011年第8期89-91,112,共4页
以油菜品种中油821为材料,利用双向电泳技术研究足磷和缺磷条件下油菜幼苗叶片差异表达的蛋白质,进而为揭示油菜耐低磷胁迫的分子机制奠定基础。结果表明:经电泳、PDQuest分析后,缺磷处理下差异显著的蛋白质点有38个,19个表达量显著上调... 以油菜品种中油821为材料,利用双向电泳技术研究足磷和缺磷条件下油菜幼苗叶片差异表达的蛋白质,进而为揭示油菜耐低磷胁迫的分子机制奠定基础。结果表明:经电泳、PDQuest分析后,缺磷处理下差异显著的蛋白质点有38个,19个表达量显著上调,19个显著下调。磷胁迫下蛋白表达量的差异说明逆境下植物体可通过多种蛋白的协调作用来适应外界环境的变化。 展开更多
关键词 油菜 磷胁迫 双向电泳 蛋白质组学 差异蛋白表达
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婴儿眼分泌物屎肠球菌的分离及差异蛋白表达分析
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作者 路航 崔璟琳 +1 位作者 秦玲玲 曹书杰 《眼科新进展》 CAS 北大核心 2011年第11期1036-1038,共3页
目的分析屎肠球菌对抗菌素的耐药状况,从蛋白质水平探索耐药现象出现的分子生物学基础。方法对本院眼科、儿科门诊近3a来就诊的出现眼部感染的147例婴儿眼分泌物进行细菌培养及药物敏感实验,从中分离、鉴定屎肠球菌。应用比较蛋白质组... 目的分析屎肠球菌对抗菌素的耐药状况,从蛋白质水平探索耐药现象出现的分子生物学基础。方法对本院眼科、儿科门诊近3a来就诊的出现眼部感染的147例婴儿眼分泌物进行细菌培养及药物敏感实验,从中分离、鉴定屎肠球菌。应用比较蛋白质组学技术寻找临床分离屎肠球菌的差异表达蛋白。结果 147例标本中分离、鉴定出2株屎肠球菌。临床分离菌株的原始耐药程度普遍高于标准菌株,其中对青霉素、红霉素类药物的耐药程度远高于对照菌。通过比较蛋白质组学技术找到临床分离的屎肠球菌菌株与标准菌株存在的5个差异蛋白,质谱分析鉴定出3个蛋白:1-磷酸果糖激酶、NAD合成酶、Dps蛋白。结论成功分离出临床屎肠球菌的差异表达蛋白,为加强控制医院感染管理,有效预防和控制新生儿眼疾,增加小儿用药安全性,减少耐药性的产生等提供分子生物学基础资料。 展开更多
关键词 眼部感染 屎肠球菌 耐药性 差异表达蛋白
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木豆响应低温胁迫的差异表达蛋白分析
3
作者 唐军 王文强 +3 位作者 陈志坚 马向丽 毕玉芬 郭凤根 《中国草地学报》 CSCD 北大核心 2024年第12期12-23,共12页
木豆为热带及部分亚热带地区重要的食饲兼用作物,南方低温会导致木豆的减产,开展木豆的耐寒性研究可为耐寒木豆新品种培育提供数据支撑。为探究不同耐寒性木豆的蛋白表达差异特性,本试验以耐低温的缅甸木豆(MD)和低温敏感型的琼中木豆(... 木豆为热带及部分亚热带地区重要的食饲兼用作物,南方低温会导致木豆的减产,开展木豆的耐寒性研究可为耐寒木豆新品种培育提供数据支撑。为探究不同耐寒性木豆的蛋白表达差异特性,本试验以耐低温的缅甸木豆(MD)和低温敏感型的琼中木豆(QZ)种质为材料,4℃低温胁迫96 h后,进行蛋白组测序和DIA分析,结果表明:MD和QZ材料中差异表达蛋白(DEPs)分别为56个和57个;GO分析发现DEPs主要涉及催化活性、结合、细胞过程和代谢过程等,MD中显著富集在氧化还原酶活性、应激反应、信号转导等功能,QZ中显著富集在水解酶活性、水解O-糖基化合物和蓝光光感受体活性等;KEGG分析显示,DEPs涉及代谢通路、次级代谢物生物合成等途径,在MD中显著富集在苯丙烷类生物合成、内质网蛋白加工过程和RNA聚合酶途径,而在QZ中显著富集在氨基糖和核糖代谢、植物昼夜节律和次级代谢物生物合成途径。大部分DEPs亚细胞定位于细胞质、叶绿体和细胞核中。蛋白组学分析表明,过氧化物酶是参与提高木豆耐寒能力的关键蛋白,氧化还原酶活性、应激反应、信号转导、苯丙烷类生物合成、内质网蛋白加工过程等生物学途径参与木豆响应低温胁迫过程。 展开更多
关键词 木豆 低温胁迫 蛋白组学 差异表达蛋白
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鲟鱼子酱4℃冷藏期间品质变化及蛋白质组学差异解析
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作者 李骏 相欢 +4 位作者 郝淑贤 黄卉 魏涯 岑剑伟 赵永强 《南方水产科学》 北大核心 2025年第5期174-185,共12页
鲟(Acipenser gueldenstaedti)鱼子酱在冷藏过程中因蛋白质降解而极易变质。系统评估鲟鱼子酱冷藏过程中的蛋白质降解和质量损失,是优化其储存条件的关键。为提高鲟鱼子酱在冷藏过程中的品质稳定性,本研究通过理化分析和蛋白质组学方法... 鲟(Acipenser gueldenstaedti)鱼子酱在冷藏过程中因蛋白质降解而极易变质。系统评估鲟鱼子酱冷藏过程中的蛋白质降解和质量损失,是优化其储存条件的关键。为提高鲟鱼子酱在冷藏过程中的品质稳定性,本研究通过理化分析和蛋白质组学方法,探究了鲟鱼子酱在4℃下贮藏120 d后品质的动态变化。结果显示,挥发性盐基氮(TVB-N)值随着贮藏时间的延长呈上升趋势,第60天时为20.28 mg·100 g^(-1),第120天增至28.11 mg·100 g^(-1),显著超出了鲟鱼子酱TVB-N值限量标准(15.00 mg·100 g^(-1)),表明样品已完全不可食用。聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS-PAGE)分析表明,卵黄高磷蛋白条带随着贮藏时间的延长而减弱。为揭示蛋白质降解的机制,通过液相色谱-串联质谱(LC-MS/MS)和串联质量标签(Tandem mass tag,TMT)定量蛋白质组学分析,共鉴定到蛋白质2718个,其中定量蛋白质2672个,并筛选出1375个差异表达蛋白(Differentially expressed proteins,DEPs;685个上调,690个下调)。结合基因注释(GO)、京都基因与基因组百科全书(KEGG)和蛋白互作网络(PPI)分析,DEPs划分为25类功能,主要包括翻译后修饰、蛋白质周转和伴侣蛋白,信号传导机制,以及通用功能预测等,其中,卵黄高磷蛋白和胶原蛋白表达上调,磷酸甘油酸激酶、磷酸甘油酸变位酶和6-磷酸果糖激酶表达下调。研究表明,长时间4℃贮藏可加速这些DEPs的变化。根据KEGG分析,氧化磷酸化通路上调导致了鲟鱼子酱低温下蛋白质降解和品质下降。 展开更多
关键词 鲟鱼子酱 蛋白质组学 4℃冷藏 蛋白质降解 差异表达蛋白
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基于定量蛋白质组技术解析不同酿酒稻米品种的成分差异
5
作者 郭小蛟 田新惠 +5 位作者 刘瑶 刘成元 唐玉明 秦俭 冯军 刘茂柯 《中国酿造》 北大核心 2025年第8期69-74,共6页
采用定量蛋白质组技术分析两种酿酒稻米(PXY、JKY)的蛋白质组成差异及其与白酒酿造的潜在关系。结果表明,从稻米样品中检测到蛋白质5153个,其中差异表达蛋白质223个,在PXY中上调117个,下调106个。基于基因本体论(GO)、京都基因和基因组... 采用定量蛋白质组技术分析两种酿酒稻米(PXY、JKY)的蛋白质组成差异及其与白酒酿造的潜在关系。结果表明,从稻米样品中检测到蛋白质5153个,其中差异表达蛋白质223个,在PXY中上调117个,下调106个。基于基因本体论(GO)、京都基因和基因组百科全书(KEGG)的富集分析结果显示,差异表达蛋白质参与白酒发酵的多种生物学过程和代谢通路,包括糖酵解/糖异生、淀粉生物合成、淀粉和蔗糖代谢、多糖分解代谢过程、蛋白水解作用、丁香烯氧化生成丁香酸等,表明原料蛋白质组成对白酒生产具有重要影响。研究结果初步从蛋白组水平揭示原料与白酒酿造的关系,可为优质原料的选择提供依据。 展开更多
关键词 蛋白质组学 代谢途径 酿酒水稻 差异表达蛋白
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大理野茄M239响应黄萎病病菌侵染的差异表达蛋白分析
6
作者 蔚亚楠 黎志彬 +5 位作者 龚亚菊 鲍锐 桂敏 杜光辉 刘家迅 吴丽艳 《华北农学报》 CSCD 北大核心 2024年第1期165-174,共10页
为了探索植物响应黄萎病病原菌侵染的作用机制,以黄萎病高感野茄材料大理野茄(M239)为研究对象,通过人工接种黄萎病病原菌大丽轮枝菌的方法,首先测定M239在接种大丽轮枝菌后0,6,12,24,48 h的根部4个关键生理指标,即过氧化物酶(POD)、过... 为了探索植物响应黄萎病病原菌侵染的作用机制,以黄萎病高感野茄材料大理野茄(M239)为研究对象,通过人工接种黄萎病病原菌大丽轮枝菌的方法,首先测定M239在接种大丽轮枝菌后0,6,12,24,48 h的根部4个关键生理指标,即过氧化物酶(POD)、过氧化氢酶(CAT)、苯丙氨酸解氨酶(PAL)的活性和可溶性蛋白(SP)含量的变化。结果确定接种大丽轮枝菌后12,24 h为蛋白组分析取样的关键时间点;在此基础上,利用iTRAQ技术分析M239在接种大丽轮枝菌后根部蛋白的变化。结果发现,与清水接种(CK)相比,M239接种大丽轮枝菌后12 h有463个差异表达蛋白(DEPs),其中305个下调,158个上调;接种后24 h,有456个DEPs被病原菌诱导表达,包括296个下调,160个上调。这些蛋白主要富集在碳代谢、乙醛酸和二羧酸代谢、次生代谢物的生物合成、丙酮酸代谢、新陈代谢等途径。通过与已报道的黄萎病抗性材料的研究结果进行对比分析发现,M239在响应大丽轮枝菌的侵染过程中,参与防御响应的蛋白数量和代谢通路较少,未能形成有效的防御网络,最终表现为感病。 展开更多
关键词 野茄 黄萎病 大丽轮枝菌 iTRAQ技术 差异表达蛋白
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原料乳冷藏过程中差异表达蛋白的表征与比较分析
7
作者 庄姣 剧柠 +6 位作者 朱晓雪 李亚凤 丁雨红 高岩 陈彦辉 齐瑾 杨秉坤 《食品科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2024年第5期225-232,共8页
采用数据独立采集蛋白质组学技术分析4℃冷藏6 d的原料乳差异蛋白质组成及其生物学功能。冷藏过程中,共鉴定到902种蛋白质。其中,冷藏前期(d 0 vs d 3)和冷藏后期(d 3 vs d 6)分别筛选出70种和71种差异表达蛋白。生物信息学分析发现冷... 采用数据独立采集蛋白质组学技术分析4℃冷藏6 d的原料乳差异蛋白质组成及其生物学功能。冷藏过程中,共鉴定到902种蛋白质。其中,冷藏前期(d 0 vs d 3)和冷藏后期(d 3 vs d 6)分别筛选出70种和71种差异表达蛋白。生物信息学分析发现冷藏前期差异蛋白具有对神经生长因子的刺激反应和细胞组织的调控等功能,主要参与了细胞的生物学过程;冷藏后期差异蛋白具有碳水化合物代谢过程和RNA代谢过程的调节等功能,主要参与了糖代谢途径。蛋白-蛋白互作网络分析表明,细胞分裂控制蛋白42同源物(CDC42)是两个冷藏阶段共有的关键节点蛋白,该蛋白与细胞的吞噬作用密切相关。上述结果揭示了冷藏过程中的蛋白质组成差异和功能的多样性,为原料乳的冷藏提供了理论依据,对原料乳的质量控制具有重要意义。 展开更多
关键词 原料乳 冷藏 蛋白组学 差异表达蛋白 生物信息学
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基于液体芯片-飞行时间质谱分析的肺结核患者血清差异表达蛋白
8
作者 杨娟 杨拴盈 +3 位作者 倪磊 宋土生 于林 黄辰 《西安交通大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2011年第6期728-732,共5页
目的应用液体芯片-飞行时间质谱技术分析肺结核患者和正常对照人群的血清蛋白多肽图谱,找出组间具有统计学意义的差异表达蛋白多肽,从而筛选出肺结核的标志蛋白多肽峰图(m/z)。方法应用2种液体蛋白芯片技术(MB-WCX和MB-IMAC-CU)结合飞... 目的应用液体芯片-飞行时间质谱技术分析肺结核患者和正常对照人群的血清蛋白多肽图谱,找出组间具有统计学意义的差异表达蛋白多肽,从而筛选出肺结核的标志蛋白多肽峰图(m/z)。方法应用2种液体蛋白芯片技术(MB-WCX和MB-IMAC-CU)结合飞行时间质谱(MALDI-TOF-MS)对14例病理确诊的肺结核患者和32例正常对照人群进行血清蛋白多肽图谱分析;采用ClinProTools软件分析肺结核患者和正常对照组的组间差异表达蛋白。结果 MB-WCX型液体蛋白芯片处理后共获得74个蛋白多肽峰图,其中42个蛋白多肽峰图呈组间极显著差异(P<0.001)表达。MB-IMAC-CU型液体蛋白芯片处理后共获得68个蛋白多肽峰图,有11个蛋白多肽呈组间极显著差异(P<0.001)表达,且其中的8个峰图与MB-WCX型液体芯片检出的组间极显著差异峰图完全相同。经MB-WCX处理所获的42个差异蛋白多肽峰图中有17个蛋白多肽在肺结核患者组中表达上调,其余25个蛋白多肽在肺结核患者组中表达下调。结论利用液体芯片-飞行时间质谱技术可以从肺结核患者的血清中获得稳定丰富的蛋白多肽图谱,并且能够筛选出潜在的疾病标志物。 展开更多
关键词 液体芯片-飞行时间质谱 肺结核患者 差异蛋白表达
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不同配穴针刺预防应激性胃溃疡的效应比较及差异表达蛋白的筛选 被引量:9
9
作者 王朝辉 单纯筱 +2 位作者 周丹 严兴科 王富春 《吉林大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2013年第3期441-447,F0002,共8页
目的:观察不同配穴的预防性针刺对应激性胃溃疡大鼠胃组织损伤情况及蛋白质谱的影响,阐明不同配穴针刺预防应激性胃溃疡效果,获得相关差异表达蛋白。方法:120只雄性Wistar大鼠随机分为正常对照组、捆绑对照组、应激性胃溃疡模型组、募... 目的:观察不同配穴的预防性针刺对应激性胃溃疡大鼠胃组织损伤情况及蛋白质谱的影响,阐明不同配穴针刺预防应激性胃溃疡效果,获得相关差异表达蛋白。方法:120只雄性Wistar大鼠随机分为正常对照组、捆绑对照组、应激性胃溃疡模型组、募穴组、下合穴组、合募配穴组、背俞穴组和俞募配穴组,每组15只。各组大鼠针刺后采用水浸-束缚法制备应激性胃溃疡模型,观察各组大鼠胃黏膜损伤形态学表现,计算溃疡指数;提取胃组织蛋白,应用SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳方法对胃组织匀浆上清液中的蛋白进行梯度分离,采用纳升级电喷雾高效液相仪联合LTQ线性离子阱质谱仪(Eksigent-Thermo LTQ-MS)检测蛋白表达水平。结果:合募配穴组大鼠溃疡指数低于募穴组、下合穴组、背俞穴组和俞募配穴组(P<0.05)。筛选出的感兴趣差异表达蛋白有以下几种:①酶类,包括甘油醛-3-磷酸脱氢酶(GAPDH)、碳酸酐酶1(Car1)、碳酸酐酶3(Car3)、乌头合酶(Aco2)、α-烯醇化酶(Eno1)、β烯醇化酶(Eno3)和γ烯醇化酶;②运动(骨架)蛋白质,包括alpha 1肌动蛋白(Actc1)、β肌动蛋白(Actb)、α肌动蛋白(Acta1)和相对分子质量为43 000的蛋白质(Actg2);③运输蛋白质,包括血清铁传递蛋白(TF亚型1)和钙网蛋白(Calr);④热休克蛋白,包括相对分子质量为10 000的热休克蛋白(Hspe1)。结论:合募配穴预防应激性胃溃疡效果优于单穴组及俞募配穴组,机制可能与多种蛋白的表达变化有关。 展开更多
关键词 合募配穴 针刺 应激性胃溃疡 差异表达蛋白
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筛选差异表达基因和蛋白质的方法进展 被引量:19
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作者 王吉村 药立波 赵忠良 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2001年第1期33-36,共4页
分离和鉴定差异表达基因和蛋白质不仅有助于发现基因和蛋白质的功能 ,更有助于揭示某些疾病的发生机理 .目前筛选差异表达基因的方法主要有差异显示PCR方法 (differentialdisplayRT PCR ,DDRT PCR)、消减杂交法 (subtractivehybridizati... 分离和鉴定差异表达基因和蛋白质不仅有助于发现基因和蛋白质的功能 ,更有助于揭示某些疾病的发生机理 .目前筛选差异表达基因的方法主要有差异显示PCR方法 (differentialdisplayRT PCR ,DDRT PCR)、消减杂交法 (subtractivehybridization ,SH )、基因芯片技术 (DNAchiptechnique)和基因表达的系统分析 (serialanalysisofgeneexpression ,SAGE)等 ,其中消减杂交法中又先后建立了代表性差异分析技术 (representationaldifferenceanalysis ,RDA)、抑制消减杂交法 (suppressionsubtractivehybridization ,SSH)和获得全长基因的消减杂交法 (full length gene obtainablesubtractivehybridization) .筛选差异表达蛋白质的方法主要有双向电泳技术(two dimentionalgelelectrophoresis)和噬菌体全套抗体库技术 (phagedisplayantibodyrepertoirelibrarytechnique) .这些方法各有特点 ,各有利弊 ,研究者可根据自己的需要选择适合于自己的方法 . 展开更多
关键词 筛选 差异表达基因 差异表达蛋白
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钝顶螺旋藻Spirulina platensis两种不同形态藻丝体的光合作用和蛋白质差异表达分析 被引量:8
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作者 林重阳 沈晓文 +2 位作者 赵振坤 吴韩志 徐虹 《高等学校化学学报》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 2009年第6期1152-1157,共6页
从钝顶螺旋藻Spirulina platensis中分离纯化获得了螺旋形和直线形两种不同形态的藻丝体.通过对二者光合作用的研究发现,螺旋形藻丝体具有较高的光饱和光合作用速率(PmChla)和光饱和点,比直线形藻丝体更能适应较高光强的环境;而直线形... 从钝顶螺旋藻Spirulina platensis中分离纯化获得了螺旋形和直线形两种不同形态的藻丝体.通过对二者光合作用的研究发现,螺旋形藻丝体具有较高的光饱和光合作用速率(PmChla)和光饱和点,比直线形藻丝体更能适应较高光强的环境;而直线形藻丝体具有较低的光补偿点,能在更低的光强下进行光合作用.通过双向凝胶电泳对两种不同形态藻丝体的总蛋白进行比较分析,从中找出了9个差异表达的蛋白点.应用基质辅助激光解吸电离质谱对差异表达的蛋白质点进行鉴定和数据库检索,结果表明,3个蛋白与肽聚糖代谢有关,2个蛋白与光合作用有关,1个蛋白与细胞分裂调控相关,1个蛋白为外膜通道蛋白,2个蛋白为功能未知的假想蛋白. 展开更多
关键词 钝顶螺旋藻 形态差异 光合作用 双向电泳 差异表达蛋白
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家蚕中肠组织在变态发育不同时期的蛋白表达差异分析 被引量:5
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作者 黄志君 邓小娟 +5 位作者 陈芳艳 母培强 杨婉莹 钟仰进 夏庆友 曹阳 《蚕业科学》 CAS CSCD 北大核心 2007年第2期207-215,共9页
分析了家蚕在变态期不同发育时段中肠组织蛋白表达差异的信息。SDS-PAGE电泳分析显示,从家蚕吐丝前1 d到化蛹72 h的中肠蛋白分离到相对明显的16条泳带,其中分子量约为30、45、70 kD的蛋白组分含量较大,且比较稳定,分子量约为50、60、62... 分析了家蚕在变态期不同发育时段中肠组织蛋白表达差异的信息。SDS-PAGE电泳分析显示,从家蚕吐丝前1 d到化蛹72 h的中肠蛋白分离到相对明显的16条泳带,其中分子量约为30、45、70 kD的蛋白组分含量较大,且比较稳定,分子量约为50、60、62 kD的蛋白组分在不同时期存在着显著的表达差异。进而通过聚丙烯酰胺双向凝胶电泳分析,发现家蚕中肠组织蛋白的表达种类和差异蛋白数目的变化在化蛹1~3 d非常明显:蛋白表达种类的变化呈现2个高峰,分别为化蛹0 h和化蛹41 h;差异蛋白数目的变化呈现3个波峰,分别在吐丝98 h至化蛹0 h、化蛹30~41 h和化蛹41~58 h。在化蛹1~3 d,这种显著峰值变化的时期刚好与家蚕中肠组织发生旧肠壁细胞退化死亡和新生肠壁细胞分化增殖的盛期相吻合,从一个侧面反映了家蚕中肠组织在变态期活跃的发育进程。 展开更多
关键词 家蚕 变态期 中肠组织 蛋白表达差异
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晋麦47幼苗叶片水分胁迫差异表达蛋白的鉴定与分析 被引量:3
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作者 范锋贵 金秀锋 +5 位作者 叶石 任万杰 张帆 鞠丽萍 王宏礼 张晓科 《麦类作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第3期566-572,共7页
为了从蛋白质水平进一步揭示小麦抗旱机理,以旱地小麦品种晋麦47为试验材料,采用蛋白质双向电泳技术,结合质谱鉴定技术,研究幼苗在正常供水与水分胁迫(-0.5 MPa的PEG-6000溶液处理48h)后叶片蛋白质组表达谱间的差异,分析水分胁迫差异表... 为了从蛋白质水平进一步揭示小麦抗旱机理,以旱地小麦品种晋麦47为试验材料,采用蛋白质双向电泳技术,结合质谱鉴定技术,研究幼苗在正常供水与水分胁迫(-0.5 MPa的PEG-6000溶液处理48h)后叶片蛋白质组表达谱间的差异,分析水分胁迫差异表达的蛋白种类及其功能。研究发现,在正常供水和水分胁迫处理两种条件下,幼苗叶片蛋白的双向电泳图谱均可重复检测到850个蛋白点;31个蛋白点在两种供水水平间表达量存在显著差异,其中17个蛋白点在水分胁迫处理下表达量明显增加,14个蛋白点表达量明显减少。对这些蛋白点进行肽指纹图谱分析,并利用Mascot软件在NCBInr数据库搜索,最终有26个蛋白点被成功鉴定;其中,未知功能蛋白7个;已知功能蛋白19个,主要涉及能量、代谢、抗病与防御、细胞结构、转录与翻译以及信号转导等功能类别。结果表明,小麦体内的多个代谢及调控途径参与了对干旱的应激反应。最后,本文还对鉴定到的差异蛋白点与水分胁迫的关系进行了分析和讨论。 展开更多
关键词 普通小麦 水分胁迫 双向电泳 差异表达蛋白
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基于iTraq技术的加拿大一枝黄花提取物作用下铜绿微囊藻细胞差异表达蛋白 被引量:6
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作者 黄莹莹 白羽 +1 位作者 王艳 孔海南 《中国环境科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2015年第6期1822-1830,共9页
为研究加拿大一枝黄花提取物对藻类生长抑制作用的分子机理,应用iTraq技术结合LC-MS-MS,分析了铜绿微囊藻细胞蛋白质的差异表达.共鉴定出261种差异蛋白(变化倍数≥1.5),其中表达上调的220种,表达下调的41种.GO功能分类显示,加拿大一枝... 为研究加拿大一枝黄花提取物对藻类生长抑制作用的分子机理,应用iTraq技术结合LC-MS-MS,分析了铜绿微囊藻细胞蛋白质的差异表达.共鉴定出261种差异蛋白(变化倍数≥1.5),其中表达上调的220种,表达下调的41种.GO功能分类显示,加拿大一枝黄花提取物通过影响细胞代谢过程、蛋白质催化和结合功能等方式抑制藻细胞生长.KEGG通路分析表明,通路大类中富集程度位于前3位的均是代谢通路,包括能量代谢、碳水化合物代谢和氨基酸代谢,通路中富集程度最高的是糖酵解/糖异生通路.本研究发现了加拿大一枝黄花提取物对藻细胞生长抑制作用的分子靶点,为从分子层面阐明其抑藻作用提供参考,也为研究植物化感物质的抑藻机理提供了新方法. 展开更多
关键词 iTraq标记 化感作用 差异表达蛋白 抑藻机理
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玉米杂交种与亲本雌穗花器官形成期蛋白差异表达谱分析 被引量:2
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作者 郭宝健 宋方威 +3 位作者 冯万军 隋志鹏 孙其信 倪中福 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第5期845-854,共10页
为探讨玉米穗粒数杂种优势形成的分子机制,以玉米强优势杂交种豫玉22及其亲本综3和87-1的花器官形成期雌穗为材料,采用高通量的2-DE和MALDI TOF MS技术,建立蛋白差异表达谱,并对差异蛋白进行了质谱鉴定。结果显示,在检测到的1290个蛋白... 为探讨玉米穗粒数杂种优势形成的分子机制,以玉米强优势杂交种豫玉22及其亲本综3和87-1的花器官形成期雌穗为材料,采用高通量的2-DE和MALDI TOF MS技术,建立蛋白差异表达谱,并对差异蛋白进行了质谱鉴定。结果显示,在检测到的1290个蛋白点中,有114个(8.84%)在杂交种与亲本之间的表达差异达到显著水平,其中表现单亲沉默、偏高亲、中亲表达、偏低亲、杂种上调、杂种下调、亲本特异和杂种特异表达模式的蛋白点分别为27、25、15、13、11、11、10和2个。另外,成功鉴定出其中的104个差异表达蛋白点,涉及代谢、信号转导、能量、转录、蛋白质合成、蛋白运输与储藏、细胞生长与分裂、细胞结构、抗病防御、次生代谢、转座子及功能未知和假定蛋白等12个功能类别。玉米杂交种与亲本蛋白在丰度上的明显差异及涉及多个功能类别,可能与玉米穗粒数杂种优势的形成有关。 展开更多
关键词 玉米 雌穗 杂种优势 蛋白差异表达
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脊髓全横断损伤后差异表达蛋白的蛋白质组学分析 被引量:6
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作者 杨明理 刘新宇 +3 位作者 杨金亮 王黎明 张勇刚 胡火珍 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第3期212-220,共9页
对脊髓全横断损伤前后的大鼠脊髓全蛋白质进行双向凝胶电泳,借助PDQuest软件从中找出差异表达蛋白质点.应用基质辅助激光解吸电离串联质谱,对差异表达的蛋白质点进行鉴定,成功鉴定出18种蛋白质.脊髓损伤3d后表达上调的蛋白质有巨噬细胞... 对脊髓全横断损伤前后的大鼠脊髓全蛋白质进行双向凝胶电泳,借助PDQuest软件从中找出差异表达蛋白质点.应用基质辅助激光解吸电离串联质谱,对差异表达的蛋白质点进行鉴定,成功鉴定出18种蛋白质.脊髓损伤3d后表达上调的蛋白质有巨噬细胞游走抑制因子、S期激酶相关蛋白1、热休克蛋白27、多配体蛋白聚糖3、T细胞受体β链可变区、膜联蛋白Ⅲ、腺苷酸激酶1、半乳凝素3、丙酮酸脱氢酶、磷脂酶B、嗜铬粒蛋白A、热休克蛋白70凝结蛋白1;同时表达下调的蛋白质有磷酸丙糖异构酶、神经鞘氨醇磷酸化受体、热休克蛋白10、肽酰-脯氨酰-顺反式异构酶A.多数差异蛋白质涉及到神经细胞的增殖、凋亡、应激反应等过程,为进一步阐明中枢神经系统的损伤和修复机制提供了理论依据. 展开更多
关键词 脊髓损伤 差异表达蛋白 双向电泳 蛋白质组学 质谱
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感染约氏疟原虫前后大劣按蚊血淋巴的差异表达蛋白分析 被引量:2
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作者 王英 张锡林 +4 位作者 段建华 许颖 张艳玲 张健 黄复生 《第三军医大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第17期1735-1738,共4页
目的获得并分析感染约氏疟原虫前后大劣按蚊血淋巴的差异表达蛋白。方法利用二维电泳方法分别分离感染约氏疟原虫前后的大劣按蚊血淋巴蛋白,进行考马斯亮蓝染色,并利用PDQuest 2D E lite软件分析和比较凝胶结果;对感染约氏疟原虫前后的... 目的获得并分析感染约氏疟原虫前后大劣按蚊血淋巴的差异表达蛋白。方法利用二维电泳方法分别分离感染约氏疟原虫前后的大劣按蚊血淋巴蛋白,进行考马斯亮蓝染色,并利用PDQuest 2D E lite软件分析和比较凝胶结果;对感染约氏疟原虫前后的差异表达蛋白进行质谱分析,获得肽质量指纹图谱;利用M ascot软件系统,在Sw iss-Prot等数据库中检索和分析所获得的肽质量指纹图谱。预测差异表达蛋白的生物学特性和在卵囊黑化中的功能。结果获得了分辨率和重复性均较好的二维电泳图,感染组凝胶可见120个蛋白点,正常组凝胶可见95个蛋白点,二者比较分析后发现有37个差异蛋白点;质谱分析获得3个肽质量指纹图谱,于蛋白数据库检索后未发现匹配分值很高的相关蛋白,其中差异蛋白点1与冈比亚按蚊一蛋白具有较高的同源性。结论获得了感染约氏疟原虫前后大劣按蚊血淋巴的差异蛋白和部分差异蛋白的相关信息,这为从蛋白水平认识蚊媒和疟原虫的相互关系和更深入地利用大劣按蚊-约氏疟原虫模型开展卵囊黑化的相关研究奠定了基础。 展开更多
关键词 二维电泳 差异表达蛋白 约氏疟原虫 大劣按蚊
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不同羊毛纤维直径细毛羊皮肤组织差异表达蛋白质研究 被引量:7
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作者 付雪峰 杨涵羽璐 +6 位作者 石刚 徐新明 张恩平 狄江 张艳花 黄锡霞 田可川 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2016年第4期879-891,共13页
试验旨在研究不同纤维直径的细毛羊皮肤组织中毛囊差异表达的蛋白质,探讨与羊毛细度相关的蛋白质功能。应用双向凝胶电泳技术建立细毛羊皮肤组织中毛囊差异表达蛋白质图谱;运用ImageMaster 2DPlatinum软件检测细毛羊毛囊组织差异表达蛋... 试验旨在研究不同纤维直径的细毛羊皮肤组织中毛囊差异表达的蛋白质,探讨与羊毛细度相关的蛋白质功能。应用双向凝胶电泳技术建立细毛羊皮肤组织中毛囊差异表达蛋白质图谱;运用ImageMaster 2DPlatinum软件检测细毛羊毛囊组织差异表达蛋白质;通过质谱鉴定技术和数据库比对等方法开展细毛羊皮肤组织毛囊特异性蛋白质分类和功能鉴定。结果成功鉴定出94个差异蛋白质,其中,相同年龄超细型细毛羊和细型细毛羊皮肤毛囊组织中有73个差异蛋白质;不同年龄的超细型细毛羊毛囊组织中有21个差异蛋白质。按功能属性划分得到了角蛋白、分子伴侣类蛋白、细胞骨架结构类蛋白、14-3-3蛋白、蛋白酶类、肌球蛋白、血清白蛋白和其他蛋白8类功能蛋白。结果提示,应用生物信息学技术分析这些差异蛋白与羊毛纤维直径的内在联系,为优质细毛羊的培育提供直接有效的基因资源信息,对提高羊毛品质具有重要的意义。 展开更多
关键词 细毛羊 双向凝胶电泳 蛋白质组学 差异表达蛋白
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家蚕追寄蝇寄生蚕体的血液蛋白质差异表达分析及质谱鉴定 被引量:2
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作者 高丽 许平震 +4 位作者 张美蓉 何庆玲 陈立华 罗旭芳 徐安英 《蚕业科学》 CAS CSCD 北大核心 2014年第4期633-638,共6页
由家蚕追寄蝇(Exorista sorbillans)寄生于家蚕幼虫体壁与肌肉间引起的多化性蚕蛆病对蚕业生产危害极大。基于家蚕血液在蚕体基础代谢、生长发育及先天免疫中的重要功能,采用双向电泳(2-DE)技术检测被家蚕追寄蝇寄生的家蚕5龄幼虫至蛹期... 由家蚕追寄蝇(Exorista sorbillans)寄生于家蚕幼虫体壁与肌肉间引起的多化性蚕蛆病对蚕业生产危害极大。基于家蚕血液在蚕体基础代谢、生长发育及先天免疫中的重要功能,采用双向电泳(2-DE)技术检测被家蚕追寄蝇寄生的家蚕5龄幼虫至蛹期第2天的血液蛋白质表达变化,并对表达水平具有显著差异的蛋白点进行质谱鉴定,明确家蚕在受到追寄蝇感染时与免疫应答以及生理、病理变化过程有关的血液蛋白质。在被追寄蝇寄生的蚕体血液中共检测到24个具有显著表达差异的蛋白点,表达上调的蛋白点有17个,包括在家蚕先天免疫系统中发挥重要作用的肽聚糖识别蛋白-S1、C-型凝集素-10和酚氧化酶-2等;表达下调的蛋白点有7个,包括与家蚕生长发育、体内物质代谢等生物学过程相关的蛋白质。血液蛋白质的表达变化提示,当蚕体受到追寄蝇感染时其先天免疫系统被激活,生长发育和体内物质代谢等也受到影响。 展开更多
关键词 家蚕 多化性蚕蛆病 血液 差异表达蛋白 双向电泳 质谱鉴定
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家蚕近等基因系感染浓核病毒(BmDNV-Z)前后中肠组织蛋白的差异表达分析 被引量:2
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作者 赵云坡 李木旺 +1 位作者 黄勇平 苗雪霞 《蚕业科学》 CAS CSCD 北大核心 2012年第3期495-506,共12页
家蚕浓核病毒(BmDNV)是危害家蚕的主要病毒之一。为鉴定与家蚕抗病毒相关的蛋白质,以对BmDNV完全不感染的家蚕品种兰10(L10)为供体亲本,将其抗性基因导入家蚕敏感品种菁松(JS)中,构建抗性近等基因系NIL(BC6F2)。对JS及其近等基因系NIL... 家蚕浓核病毒(BmDNV)是危害家蚕的主要病毒之一。为鉴定与家蚕抗病毒相关的蛋白质,以对BmDNV完全不感染的家蚕品种兰10(L10)为供体亲本,将其抗性基因导入家蚕敏感品种菁松(JS)中,构建抗性近等基因系NIL(BC6F2)。对JS及其近等基因系NIL分别用家蚕浓核病毒镇江株(BmDNV-Z)添毒,二者分别表现为高度敏感和完全不感染。对JS和NIL在病毒感染前后中肠组织蛋白双向电泳(2D-PAGE)图谱中的差异蛋白点进行串联质谱(MALDI-TOF-TOF)分析,共鉴定了41个差异表达的蛋白点,其中有35个蛋白点可能与病毒的诱导相关,有6个蛋白点可能与家蚕的组成抗性相关。鉴定的差异表达蛋白包括糖酵解酶类、能量代谢酶类、参与基因表达的蛋白质以及参与其它细胞功能的蛋白质等。选取10个差异表达蛋白点进行基因表达定量PCR分析,进一步确证了这些蛋白质在JS及其近等基因系NIL之间以及在病毒诱导前后的差异表达。例如:精氨酸激酶在NIL和JS中均可被诱导表达;V-ATP合成酶及热激蛋白HSP70只在NIL中被特异性诱导表达;烯醇化酶在NIL中的表达水平显著高于JS,且不能被病毒感染所诱导,是一个典型的组成抗性相关蛋白。鉴定出的41个差异表达蛋白点有可能参与了家蚕对BmDNV-Z的抗性。 展开更多
关键词 家蚕 近等基因系 差异表达蛋白 家蚕浓核病毒 抗性 双向电泳 串联质谱
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