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平颏海蛇毒腺cDNA表达文库的构建 被引量:13
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作者 钟肖芬 卫剑文 +2 位作者 赵贵军 吴文言 徐安龙 《中山大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2001年第3期66-69,共4页
以真核表达载体质粒pcDNA3为载体 ,成功构建了一个高质量的平颏海蛇毒腺cDNA表达文库 ,这是国内首个海蛇cDNA文库 .通过对亚文库克隆的大规模序列测定和分析 ,发现了 38个海蛇新基因序列 ,其中包括神经毒素基因、磷酸脂酶A2 基因和半胱... 以真核表达载体质粒pcDNA3为载体 ,成功构建了一个高质量的平颏海蛇毒腺cDNA表达文库 ,这是国内首个海蛇cDNA文库 .通过对亚文库克隆的大规模序列测定和分析 ,发现了 38个海蛇新基因序列 ,其中包括神经毒素基因、磷酸脂酶A2 基因和半胱氨酸丰富毒蛋白基因共 10个编码海蛇毒素蛋白的新基因 . 展开更多
关键词 平颏海蛇 毒腺 cdna表达文库
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‘红阳’猕猴桃cDNA文库构建及F3H基因的表达初探 被引量:27
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作者 杨红丽 王彦昌 +1 位作者 姜正旺 黄宏文 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2009年第12期1265-1272,共8页
利用SMART(switching mechanism at 5’end of the RNA transcript)技术构建了红肉猕猴桃品种‘红阳’(Actinidia chinesis cv‘Hongyang’)内果皮组织的全长cDNA文库,此文库的构建有助于克隆与次生代谢相关的基因,特别是红肉猕... 利用SMART(switching mechanism at 5’end of the RNA transcript)技术构建了红肉猕猴桃品种‘红阳’(Actinidia chinesis cv‘Hongyang’)内果皮组织的全长cDNA文库,此文库的构建有助于克隆与次生代谢相关的基因,特别是红肉猕猴桃花青素特异合成代谢的基因。文库滴度为6.7×10^4cfu/mL,库容为2.72×10^8cfu/mL,文库重组率99.8%,插入片段多数分布在700~1000bp。随机挑选1014个克隆进行测序,测序成功963个,经过序列拼接去除低质量序列后获得632个unigenes,包括92个contigs和540个singletons,获得已知功能unigenes共441个。从所测克隆中得到一个花青素途径的结构基因AcF3H,其cDNA序列长1369bp(GenBank登录号:FJ542819),CDS区为1101bp,编码366个氨基酸的多肽。与拟南芥、葡萄及龙胆已知乃日氨基酸序列比对,发现该基因十分保守。通过RT—PCR技术对苍溪栽培的不同发育时期‘红阳’猕猴桃果实AcF3H基因的表达进行了分析。结果表明,果肉转色前AcF3H基因表达量较高,而转色初期表达量降低,此后随着果实着色加深表达量维持在较高水平。 展开更多
关键词 '红阳’猕猴桃 cdna文库 F3H 表达
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金钱鱼毒腺cDNA表达文库的构建及EST序列分析 被引量:9
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作者 陈慧萍 姜孝玉 +4 位作者 涂洪斌 杜晶春 卫剑文 杨文利 徐安龙 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2004年第2期166-170,共5页
以金钱鱼 (Scatophagusargus)毒腺为出发材料 ,构建以真核表达载体pcDNA3 0为基础的金钱鱼毒腺cDNA表达文库 .应用SMARTTM cDNALibraryConstruction技术和生物信息学分析等方法 ,通过对文库克隆的序列测定和初步生物信息学分析 ,获得了 ... 以金钱鱼 (Scatophagusargus)毒腺为出发材料 ,构建以真核表达载体pcDNA3 0为基础的金钱鱼毒腺cDNA表达文库 .应用SMARTTM cDNALibraryConstruction技术和生物信息学分析等方法 ,通过对文库克隆的序列测定和初步生物信息学分析 ,获得了 2 0 1个金钱鱼新表达序列标签 (ESTs) ,其中已确定全长cDNA的克隆有 2 7个 ,包括多个核糖体大小亚基蛋白 (ribosomalprotein)、细胞凋亡相关蛋白 (programmedcelldeath 10 ) ,G蛋白信号调控子 (Gproteinsignalingregulator)、胸腺素(thymosinbeta 4 )、延伸因子 (translationelongationfactor 1 alpha)和泛素 (ubiquitin)等 .金钱鱼毒腺cDNA表达文库的成功构建 ,为研究金钱鱼毒腺的活性组分及其作用机制奠定了基础 。 展开更多
关键词 金钱鱼 毒腺 cdna 表达文库 EST 序列分析 功能基因
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日本鬼鲉毒腺cDNA表达文库的构建和初步分析 被引量:8
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作者 姜孝玉 涂洪斌 +4 位作者 陈慧萍 卫剑文 杨文利 吴文言 徐安龙 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2002年第3期424-428,共5页
以海洋生物日本鬼鲉毒腺为材料 ,应用SMARTTM cDNALibraryConstruction技术 ,构建以真核表达载体pcDNA3 0为基础的日本鬼鲉毒腺cDNA表达文库 .通过对文库克隆的序列测定和初步生物信息学分析 ,获得 94个日本鬼鲉毒腺新表达序列标签 (EST... 以海洋生物日本鬼鲉毒腺为材料 ,应用SMARTTM cDNALibraryConstruction技术 ,构建以真核表达载体pcDNA3 0为基础的日本鬼鲉毒腺cDNA表达文库 .通过对文库克隆的序列测定和初步生物信息学分析 ,获得 94个日本鬼鲉毒腺新表达序列标签 (ESTs) ,其中已确定全长cDNA的克隆有 35个 ,包括溶细胞素基因、类短链神经毒素蛋白、C型凝集素、巨噬细胞迁移抑制因子、致病相关基因等 ,这些基因在日本鬼鲉中绝大多数为首次发现 .日本鬼鲉毒腺cDNA表达文库的成功构建 ,为深入研究日本鬼鲉毒腺的组分及其分子作用机理奠定了基础 . 展开更多
关键词 日本鬼Yuo 毒腺 cdna表达文库 刺毒鱼类
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猪囊尾蚴cDNA表达文库构建及抗原基因筛选 被引量:12
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作者 沈斌 高荣 +2 位作者 朱锦 魏竹波 刘世贵 《中国人兽共患病杂志》 CAS CSCD 北大核心 1999年第6期57-59,共3页
采用Quick Prep m RNA Purification 试剂盒提取猪囊尾蚴m RNA;Tim e- Saver cDNA Synthesis试剂盒反转录合成双链cDNA,并在末端加上EcoRI/NotIadaptor,... 采用Quick Prep m RNA Purification 试剂盒提取猪囊尾蚴m RNA;Tim e- Saver cDNA Synthesis试剂盒反转录合成双链cDNA,并在末端加上EcoRI/NotIadaptor,修饰后的cDNA 与λgtllEcoRI臂连接,体外包装为λ噬菌体颗粒;感染E.coliY1090 构建成功库容量为2×106、重组率为80% 的cDNA表达文库。利用兔抗猪囊尾蚴虫体抗原和囊液抗原血清分别对一部分文库进行免疫印迹筛选,分别获得8 个阳性克隆。提取阳性克隆DNA,利用PCR法从重组噬菌体DNA中扩增出cDNA片段,长度自400—900bp。本文工作为研制猪囊尾蚴核酸疫苗打下了基础。 展开更多
关键词 猪囊尾蚴 cdna表达文库 抗原基因 筛选
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新疆雪莲全长cDNA文库构建及表达序列标签(ESTs)特性分析 被引量:7
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作者 王博 艾秀莲 +2 位作者 王志方 李芳 罗明 《新疆农业科学》 CAS CSCD 2008年第1期56-60,共5页
以野生新疆雪莲(Saussurea involucrata Kar.et Kit)为研究材料,利用Creator SMARTTMcDNA Library Construction技术构建了雪莲全长cDNA文库,从野生雪莲中提取总RNA和mRNA,用分离到的微量mRNA合成cDNA第1链。通过长距离PCR扩增得到足够... 以野生新疆雪莲(Saussurea involucrata Kar.et Kit)为研究材料,利用Creator SMARTTMcDNA Library Construction技术构建了雪莲全长cDNA文库,从野生雪莲中提取总RNA和mRNA,用分离到的微量mRNA合成cDNA第1链。通过长距离PCR扩增得到足够量的双链cDNA。将SfiⅠ酶切后并纯化的cDNA片段连接到经SfiⅠ酶切的噬菌体λTripIEX2上,并对噬菌体进行包装,建成cDNA的全长库。经大肠杆菌XL1-Blue平板检测,原始文库滴度达4.03×107(pfu/mL)。随机挑选500个克隆进行序列测定,PCR鉴定结果显示多数插入片段均在500 bp以上。将所测序列经GenBank检索和生物信息学比较,共有56个序列为非冗余数据。其中有14个cDNA片段序列在GenBank上无明显的同源性,42个片段与已报道的基因有较高的同源性。这些EST数据为进一步筛选和克隆雪莲特异性表达基因提供了材料平台,为雪莲基因组数据增补了大量信息。 展开更多
关键词 新疆雪莲 cdna文库 λTirpLEx2 表达序列标签
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鲤鱼肝胰脏cDNA文库的表达序列标签分析及Lb-Fabp mRNA的特征(英文) 被引量:6
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作者 陈文波 刘黎黎 +1 位作者 李文笙 林浩然 《水生生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第3期376-384,共9页
本文构建了鲤鱼肝胰脏cDNA文库,共获得了1016条有效的表达序列标签。拼接组装成115个contigs和282个singletons。其中215个拼接序列在GenBank公共数据库中寻找到相对应的基因。对它们进行功能性分类和比较分析为鲤鱼肝胰脏的研究提供了... 本文构建了鲤鱼肝胰脏cDNA文库,共获得了1016条有效的表达序列标签。拼接组装成115个contigs和282个singletons。其中215个拼接序列在GenBank公共数据库中寻找到相对应的基因。对它们进行功能性分类和比较分析为鲤鱼肝胰脏的研究提供了基因表达信息的基础。文库中1016条表达序列标签有11条代表了鲤鱼肝基本型脂肪酸结合蛋白(Lb-FABP)。通过序列比较我们获得了两个具有相同开放阅读框长度的Lb-Fabp cDNAs。开放阅读框全长381bp,编码126个氨基酸。半定量RT-PCR结合Southern blot技术研究了Lb-Fabp mRNA在成鱼不同组织以及早期发育不同时期的表达图式。结果表明,Lb-FabpmRNA在肝胰脏、中肠和后肠中表达量较高。同时在精巢和皮肤中有低水平的表达。脑、肌肉、卵巢、肾脏、脾脏、鳃和心脏等组织中其表达量更低。而在脂肪和前肠中则没有检测到Lb-FabpmRNA表达。Lb-FabpmRNA最早在胚体形成期检测到有低水平表达,随后的发育阶段中表达量逐渐升高。鲤鱼Lb-Fabp基因的表达图式提示在肝脏和肠等器官开始发育后,它可能在脂肪代谢中具有重要作用。 展开更多
关键词 鲤鱼 cdna文库 表达序列标签 脂肪酸结合蛋白 mRNA表达
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甜菜M14品系花期cDNA文库的构建及特异表达基因的筛选 被引量:5
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作者 马春泉 张莹 +5 位作者 崔颖 王冰 王玉婷 刘金玲 王宏建 李海英 《植物研究》 CAS CSCD 北大核心 2008年第4期408-411,共4页
构建了甜菜M14品系在花期的ZAP表达载体的cDNA文库,利用抑制消减杂交方法所获得的M14品系特异表达的2个EST片段为探针筛选cDNA文库,获得了M14品系特异表达cDNA片段Me-86和Me-84;进一步利用RACE技术获得了基因M14-86 cDNA片段的全长序列... 构建了甜菜M14品系在花期的ZAP表达载体的cDNA文库,利用抑制消减杂交方法所获得的M14品系特异表达的2个EST片段为探针筛选cDNA文库,获得了M14品系特异表达cDNA片段Me-86和Me-84;进一步利用RACE技术获得了基因M14-86 cDNA片段的全长序列。生物信息学分析表明M14品系特异表达基因M14-86的cDNA片段与cDNA片段Me-84分别与大花马齿苋(Portulaca grandiflora)及瓶子草(Sarracenia purpurea)的26S核糖体RNA具有很高的同源性。 展开更多
关键词 cdna文库 EST 表达载体 噬菌斑原位杂交 RACE技术
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花鳗鲡脑cDNA文库的构建及GnRH基因克隆与表达分析 被引量:5
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作者 黄海 张勇 +5 位作者 刘晓春 尹绍武 杨丽萍 朱培 齐兴柱 林浩然 《水生生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第2期214-221,共8页
以花鳗鲡脑组织为材料,提取总RNA,应用CloneminerTM文库构建试剂盒构建cDNA文库。经检测,文库的滴度为4.3×106cfu/mL,总容量为5.16×107cfu/mL,阳性克隆率为99.6%,插入片段0.43—3.2kb之间,平均插入片段大小为1532bp。以文库... 以花鳗鲡脑组织为材料,提取总RNA,应用CloneminerTM文库构建试剂盒构建cDNA文库。经检测,文库的滴度为4.3×106cfu/mL,总容量为5.16×107cfu/mL,阳性克隆率为99.6%,插入片段0.43—3.2kb之间,平均插入片段大小为1532bp。以文库为模板,克隆获得花鳗鲡两种类型的促性腺激素释放激素(mGnRH和cGnRH-II)cDNA序列。序列分析表明,花鳗鲡mGnRHcDNA开放阅读框(ORF)包含276个碱基,编码91个氨基酸,其中包括22个氨基酸的蛋白质前体信号肽(1—22位氨基酸)、mGnRH十肽(23—32位氨基酸)、一个三肽裂解位点(33—35位氨基酸)和56个氨基酸的GnRH相关肽(36—91位氨基酸);花鳗鲡cGnRH-IIcDNA开放阅读框包含264个碱基,编码87个氨基酸,其中包括24个氨基酸的蛋白质前体信号肽(1—24位氨基酸)、cGnRH-II十肽(25—34位氨基酸)、一个三肽裂解位点(34—36位氨基酸)和50个氨基酸的GnRH相关肽(37—87位氨基酸)。序列同源性分析表明,花鳗鲡mGnRH、cGnRH-IIcDNA与日本鳗鲡之间的相似性率高达98%;与鲑形目、鲈形目、鲽形目鱼类的相似率为73%—78%;而与鲤形目鱼类的相似性相对较低(63%—67%)。采用RT-PCR方法分析了两种GnRH基因在花鳗鲡雌雄个体中的表达,结果表明两基因在雌雄个体的组织表达模式无明显差异;但mGnRH基因在雌雄个体内表达部位多于cGnRH-II的。 展开更多
关键词 花鳗鲡 cdna文库 促性腺激素释放激素 克隆 基因表达
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从大肠癌组织cDNA表达文库筛选肿瘤抗原基因 被引量:6
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作者 何敬东 周高速 +4 位作者 肖冰 李旭 刘宇虎 张振书 南清振 《解放军医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2005年第5期382-384,共3页
目的利用肿瘤患者血清筛选大肠癌cDNA噬菌体表达文库,寻找肿瘤特异性抗原基因。方法采用SMART技术构建中国人大肠癌cDNA噬菌体表达文库。用SEREX方法筛选中国人大肠癌组织cDNA噬菌体表达文库。对获得的阳性克隆片段进行测序、鉴定和BLAS... 目的利用肿瘤患者血清筛选大肠癌cDNA噬菌体表达文库,寻找肿瘤特异性抗原基因。方法采用SMART技术构建中国人大肠癌cDNA噬菌体表达文库。用SEREX方法筛选中国人大肠癌组织cDNA噬菌体表达文库。对获得的阳性克隆片段进行测序、鉴定和BLAST同源性比较,并对其生物信息进行分析。结果成功地构建了大肠癌cDNA噬菌体表达文库,原始文库含2.39×106个重组子,重组率达到97.5%,文库扩增后滴度达到4.1×1010pfu/ml。插入外源性cDNA片段的大小为0.5~4.0kb。SEREX筛选共获得16个阳性克隆,代表12个不同抗原基因,其中10个基因片段为已知抗原基因,如IFITM1、CD24、Survivin、KLK6等,2个为未知EST片段。根据序列分析,筛选出的抗原基因有结构基因、调节基因、代谢相关基因等。结论利用SEREX方法筛选出大肠肿瘤相关抗原基因并获得2个肿瘤抗原候选基因。 展开更多
关键词 结直肠肿瘤 SEREX抗原基因 cdna表达文库
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桑树幼叶cDNA文库的构建及部分表达序列标签分析 被引量:6
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作者 方荣俊 戚金亮 +8 位作者 扈冬青 赵卫国 汪伟 张林 刘利 潘刚 沈兴家 潘一乐 杨永华 《蚕业科学》 CAS CSCD 北大核心 2008年第4期581-586,共6页
基于为鉴定和克隆桑树功能基因提供基础信息的目的,采用RNA转录5′末端转换(SMART)法构建了桑树幼叶全长cDNA文库。该文库容量为1.02×106pfu/mL,重组率95%,符合构建基因文库的质量要求。从构建的桑树幼叶cDNA文库中随机挑取48个克... 基于为鉴定和克隆桑树功能基因提供基础信息的目的,采用RNA转录5′末端转换(SMART)法构建了桑树幼叶全长cDNA文库。该文库容量为1.02×106pfu/mL,重组率95%,符合构建基因文库的质量要求。从构建的桑树幼叶cDNA文库中随机挑取48个克隆进行表达序列标签(EST)测序,有效序列为32条,经UniGene数据库归并后为32条,UniGene比率为100%;与NCBI核酸数据库进行比对、查询和注释,在32条序列中有29条序列具有同源性,其中16条为全长序列,完整性比率为55.2%;初步发现具有已知功能基因的ESTs 6个,具有推测功能基因的ESTs 5个,未命名或未知功能基因的ESTs 21个。 展开更多
关键词 桑树 cdna文库 RNA转录5′末端转换 表达序列标签
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青海血蜱cDNA表达文库的构建 被引量:4
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作者 高金亮 关贵全 +7 位作者 马米玲 刘志杰 党志胜 刘爱红 李文卉 任巧云 罗建勋 殷宏 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第11期1187-1191,共5页
在无RNA酶污染的环境下摘取半饱血青海血蜱唾液腺、马氏管和卵巢等器官,从中提取RNA,进而纯化mRNA,采用oligo(dT)引物合成双链cDNA,并在其两端加EcoRⅠ/HindⅢ定向接头。将所产生的cDNA分子定向克隆到具有EcoRⅠ/HindⅢ黏性末端的λSCR... 在无RNA酶污染的环境下摘取半饱血青海血蜱唾液腺、马氏管和卵巢等器官,从中提取RNA,进而纯化mRNA,采用oligo(dT)引物合成双链cDNA,并在其两端加EcoRⅠ/HindⅢ定向接头。将所产生的cDNA分子定向克隆到具有EcoRⅠ/HindⅢ黏性末端的λSCREEN载体的两臂之间。用PhageMaker extract对以上连接产物进行体外包装以形成完整的噬菌体,并用之转染大肠杆菌ER1647,从而构建成青海血蜱的cDNA表达文库。经测定,所构建青海血蜱cDNA文库的库容量约为2×106PFU/mL,重组率为100%,扩增后文库的滴度为8×109PFU/mL。通过对该文库的免疫学筛选,获得一个编码青海血蜱肌球蛋白碱性轻链的全长cDNA序列。所有结果显示,青海血蜱cDNA表达文库已成功构建。 展开更多
关键词 青海血蜱 cdna表达文库 构建
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葎草花粉cDNA表达文库的构建和初步鉴定 被引量:5
13
作者 刘昀 孙秀珍 +1 位作者 张王刚 冯向莉 《西安交通大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2006年第4期327-329,348,共4页
目的构建葎草花粉cDNA表达文库,为进一步筛选葎草花粉的主要致敏蛋白组分、制备重组变应原奠定基础。方法采集新鲜葎草花粉,过筛后液氮保存,利用Trizol法抽提葎草花粉总RNA,纯化后PCR法反转录合成cDNA。经SfiⅠ酶切,过凝胶柱层析,去除小... 目的构建葎草花粉cDNA表达文库,为进一步筛选葎草花粉的主要致敏蛋白组分、制备重组变应原奠定基础。方法采集新鲜葎草花粉,过筛后液氮保存,利用Trizol法抽提葎草花粉总RNA,纯化后PCR法反转录合成cDNA。经SfiⅠ酶切,过凝胶柱层析,去除小于400 bp的片断,收集大于400 bp的cDNA片段,加工后与λTripIEx2连接,文库体外包装,取出一小部分感染宿主菌XL1-Blue MRF,检测文库容量;PCR分析插入的cDNA片段的大小及多样性。结果成功构建一个含有5×105重组子的葎草花粉表达文库,重组率为90%,平均插入片段长度约为1.02 kb。结论所建文库容量及插入片段大小合适,适用于筛选克隆的目的cDNA。 展开更多
关键词 葎草花粉 cdna 表达文库
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长角血蜱雌蜱唾液腺cDNA表达文库的构建 被引量:6
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作者 谢俊仁 刘光远 +2 位作者 田占成 李知新 贾宁 《甘肃农业大学学报》 CAS CSCD 2007年第6期13-17,共5页
为了克隆和研究具有免疫原性的长角血蜱基因。应用建库试剂盒成功构建了长角血蜱雌蜱唾液腺cDNA表达文库.在无Rnase污染的环境下摘取半饱血长角血蜱雌蜱唾液腺。并从中提取RNA,进而纯化mRNA。利用oligo(dT)引物反转录合成双链cDNA... 为了克隆和研究具有免疫原性的长角血蜱基因。应用建库试剂盒成功构建了长角血蜱雌蜱唾液腺cDNA表达文库.在无Rnase污染的环境下摘取半饱血长角血蜱雌蜱唾液腺。并从中提取RNA,进而纯化mRNA。利用oligo(dT)引物反转录合成双链cDNA,并在其两端加EcoRⅠ/HindⅢ定向接头并酶切,过柱分级分离后。将cDNA分子定向连接到具有EcoRⅠ/HindⅢ粘性末端的λSCREEN载体中.经体外包装转染E.coliERl647宿主菌,进行文库容量测定和扩增.以扩增文库的DNA为模板。利用载体通用引物检测cDNA文库中插入片断的大小和质量.经检测。所构建长角血蜱cDNA文库的基础库容量约为4.2×10^6pfu/mL,插入片段主要集中在300~2000bp之间.说明文库质量高、代表性强。 展开更多
关键词 长角血蜱 cdna表达文库 构建
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利用gateway技术构建巨型艾美耳球虫孢子化卵囊cDNA表达文库 被引量:4
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作者 李梦辉 刘连瑞 +6 位作者 涂浩 黄经纬 张振超 徐立新 严若峰 李祥瑞 宋小凯 《南京农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第4期630-635,共6页
[目的]为了寻找可用于研制高效重组疫苗的抗原基因,利用gateway技术构建巨型艾美耳球虫孢子化卵囊cDNA表达文库。[方法]首先从新鲜分离的巨型艾美耳球虫孢子化卵囊中提取总RNA并分离纯化mRNA,用Clone MinerTMⅡcDNA文库构建试剂盒构建... [目的]为了寻找可用于研制高效重组疫苗的抗原基因,利用gateway技术构建巨型艾美耳球虫孢子化卵囊cDNA表达文库。[方法]首先从新鲜分离的巨型艾美耳球虫孢子化卵囊中提取总RNA并分离纯化mRNA,用Clone MinerTMⅡcDNA文库构建试剂盒构建巨型艾美耳球虫孢子化卵囊cDNA初级文库,然后将cDNA从初级文库重组到p VAX1.0上,构建巨型艾美耳球虫孢子化卵囊cDNA表达文库,最后用7个已知巨型艾美耳球虫基因的引物鉴定文库。[结果]构建的巨型艾美耳球虫孢子化卵囊cDNA初级文库总容量为0.92×107CFU,插入片段平均大小为1.63 kb;表达文库总容量为2.32×107CFU,插入片段平均大小为1.64 kb。两种文库的阳性重组率均为100%。能用特异性引物从该表达文库扩增出7个已知的巨型艾美耳球虫基因。[结论]该文库质量高,代表性强,为进一步筛选免疫保护性抗原基因奠定了坚实基础。 展开更多
关键词 巨型艾美耳球虫 孢子化卵囊 GATEWAY技术 cdna表达文库
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黄鳝肠道cDNA文库构建及营养相关表达序列标签分析 被引量:5
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作者 唐勇 刘旭 周定刚 《动物营养学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第4期992-999,共8页
本研究旨在构建黄鳝肠道未剪切cDNA文库,对黄鳝肠道营养相关基因表达进行初步分析。以黄鳝全肠为试验材料,采用Invitrogen公司的Gateway技术构建了黄鳝肠道未剪切cDNA文库,并进行规模表达序列标签(expressed sequence tag,EST)测序和分... 本研究旨在构建黄鳝肠道未剪切cDNA文库,对黄鳝肠道营养相关基因表达进行初步分析。以黄鳝全肠为试验材料,采用Invitrogen公司的Gateway技术构建了黄鳝肠道未剪切cDNA文库,并进行规模表达序列标签(expressed sequence tag,EST)测序和分析。结果表明:文库的库容量为1.46×107CFU,重组率达96.88%,平均插入片段长度2.11kb。随机挑取1056个cDNA阳性克隆进行测序,共获得906条有效的EST,其中886条的长度大于400bp,拼接组装得到762个单基因簇(unigene),包括61个重叠群(contig),701个单拷贝EST(singleton);与营养相关的EST共有5类59种,其中:蛋白质/氨基酸代谢类25种,碳水化合物代谢类13种,脂类代谢类5种,能量代谢类12种,无机离子代谢类4种。本文成功构建了黄鳝肠道未剪切cDNA文库,并进行了EST序列测定和分析,筛选出营养相关EST,为后续研究提供了基础数据。 展开更多
关键词 黄鳝 肠道 cdna文库 表达序列标签 营养
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霜天蛾cDNA表达文库的构建和初步鉴定 被引量:11
17
作者 孙秀珍 刘昀 《西安交通大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2005年第3期244-246,279,共4页
目的构建霜天蛾cDNA表达文库,为进一步筛选霜天蛾主要变应原、制备重组变应原奠定基础。方法利用Trizol法抽提霜天蛾RNA,经过Oligo(dT)纤维素柱纯化后得到mRNA,反转录合成dscDNA,连接EcoRⅠ接头,末端磷酸化,XhoⅠ消化,将双末端黏性化的... 目的构建霜天蛾cDNA表达文库,为进一步筛选霜天蛾主要变应原、制备重组变应原奠定基础。方法利用Trizol法抽提霜天蛾RNA,经过Oligo(dT)纤维素柱纯化后得到mRNA,反转录合成dscDNA,连接EcoRⅠ接头,末端磷酸化,XhoⅠ消化,将双末端黏性化的双链dscDNA经过凝胶柱层析,收集大于400bp的cDNA片段,加工后与UniZAPXRVector连接,经过体外包装,感染宿主菌,构建cDNA文库,检测文库容量和重组效率,并采用PCR方法对插入的cDNA片段大小进行分析。结果成功构建了一个含有5×105重组子的霜天蛾表达文库,重组率为67%,平均插入片段长度约为1.49kb。结论所建文库容量及插入片段大小合适,适用于筛选目的cDNA克隆。 展开更多
关键词 霜天蛾 cdna表达文库 鉴定
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应用LD-PCR法构建大片吸虫成虫cDNA表达文库 被引量:3
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作者 罗洪林 张为宇 +1 位作者 郑小龙 黄维义 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第11期1183-1186,共4页
为构建大片吸虫成虫cDNA表达文库,用Trizol试剂提取大片吸虫成虫总RNA,经反转录合成cDNA第一链,应用LD-PCR扩增方法,合成双链cDNA。用SfiⅠ内切酶修饰此双链cDNA,使形成两端分别带有SfiⅠA和SfiⅠB的黏性末端。经CHROMA SPIN-400柱纯化... 为构建大片吸虫成虫cDNA表达文库,用Trizol试剂提取大片吸虫成虫总RNA,经反转录合成cDNA第一链,应用LD-PCR扩增方法,合成双链cDNA。用SfiⅠ内切酶修饰此双链cDNA,使形成两端分别带有SfiⅠA和SfiⅠB的黏性末端。经CHROMA SPIN-400柱纯化,收集400 bp以上的双链cDNA片段,将其连接于带有SfiⅠA和SfiⅠB末端的λTriplEx2噬菌体载体,经体外包装后,以XL1-Blue为受体菌构建cDNA表达文库。经测定,库容量为1.08×106PFU/mL,重组率为96.6%。扩增后的文库滴度为2.41×109PFU/mL,插入片段平均大小约为1 000 bp。这些结果表明已成功构建大片吸虫成虫cDNA表达文库,适合进一步筛选大片吸虫新基因。 展开更多
关键词 LD-PCR 大片吸虫 cdna表达文库
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淡色库蚊对溴氰菊酯抗药性品系cDNA表达文库的构建和初步鉴定 被引量:5
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作者 田海生 李秀兰 +2 位作者 马磊 沈波 朱昌亮 《中国人兽共患病杂志》 CSCD 北大核心 2001年第4期33-35,共3页
目的 构建淡色库蚊对溴氰菊酯抗药性品系cDNA表达文库。方法 应用定向克隆技术将相应cDNA片段插入λExCell/NotⅠ /EcoRⅠ /CIP载体的NotⅠ和EcoRⅠ双酶切位点 ;并用PCR对插入片段大小进行分析。结果 获得含 4.72×10 5个重组子... 目的 构建淡色库蚊对溴氰菊酯抗药性品系cDNA表达文库。方法 应用定向克隆技术将相应cDNA片段插入λExCell/NotⅠ /EcoRⅠ /CIP载体的NotⅠ和EcoRⅠ双酶切位点 ;并用PCR对插入片段大小进行分析。结果 获得含 4.72×10 5个重组子的cDNA表达文库 ,重组率为 10 0 % ,插入片段大小平均约 1.1kb。结论 所建文库容量及插入片段大小适合进一步研究。 展开更多
关键词 淡色库蚊 抗药性 cdna表达文库 溴氰酯
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长角血蜱雌蜱唾液腺cDNA表达文库的免疫筛选与初步分析 被引量:7
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作者 刘光远 谢俊仁 +5 位作者 田占成 李知新 龚真莉 王路 柴慧萍 才学鹏 《甘肃农业大学学报》 CAS CSCD 2008年第1期18-24,共7页
蜱的免疫预防是目前国内外研究的热点,以抗血清为探针筛选cDNA表达文库是获取功能抗原基因的有效的方法之一,为了获得抗长角血蜱免疫原基因,用兔抗长角血蜱血清和兔抗长角血蜱唾液腺蛋白血清对长角血蜱雌蜱唾液腺cDNA表达文库进行了免... 蜱的免疫预防是目前国内外研究的热点,以抗血清为探针筛选cDNA表达文库是获取功能抗原基因的有效的方法之一,为了获得抗长角血蜱免疫原基因,用兔抗长角血蜱血清和兔抗长角血蜱唾液腺蛋白血清对长角血蜱雌蜱唾液腺cDNA表达文库进行了免疫筛选,经过两轮筛选共获得34个阳性克隆,所得阳性噬菌体转染宿主菌BM25.8使之亚克隆为重组质粒,用此质粒转化宿主菌JM109并进行序列测定和生物信息学分析.结果表明:在长角血蜱雌蜱唾液腺cDNA表达文库中获得26个长角血蜱免疫相关cDNA序列,其编码蛋白与长角血蜱HL35、黏附素hlim3假定蛋白、热休克蛋白、NADH脱氢酶、钙网蛋白以及杂色花蜱和肩突硬蜱的二硫异构酶等具有同源性.所获阳性克隆为长角血蜱保护性抗原基因的筛选奠定了基础. 展开更多
关键词 长角血蜱 唾液腺 cdna表达文库 免疫筛选
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