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多样性指标用于基因中剪切位点的识别被引量：5: 1; 作者张利绒罗辽复《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2004年第1期77-82,共6页; 根据基因剪切位点处的碱基保守性特征 ,和附近位点的碱基组成和关联特征 ,应用多样性指标和二次判别分析 ,对几类模式生物的基因结构进行统一的分析和预测 ,能够较好地识别外显子和内含子及其边界 .计算结果表明 ,对于 4类物种 ,线虫 (C... 展开更多; 关键词剪切位点多样性增量二次判别法外显子内含子基因; 在线阅读下载PDF 职称材料

核小体定位与RNA剪接被引量：6: 2; 作者陈伟罗辽复 +1 位作者张利绒邢永强《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2009年第8期1035-1040,共6页; 根据核小体定位序列和缺失序列的碱基分布特征,应用多样性增量二次判别方法(IDQD)构建模型对这两类序列进行了区分,受试者操作特性曲线下的面积达到了0.958.应用这一模型研究了核小体在人类基因组剪接位点(GT/AG)邻近序列中的分布方式,... 展开更多; 关键词多样性增量二次判别方法核小体定位剪接位点 RNA柔性; 在线阅读下载PDF 职称材料

人类polⅡ启动子的识别被引量：26: 3; 作者吕军罗辽复《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2005年第12期1185-1191,共7页; 依据基因启动子区和非启动子区碱基分布的特征,应用基于多样性增量的二次判别分析(IDQD),对人类polⅡ启动子进行识别,识别精度达到90%以上的水平,优于其他已发表的(包括SVM分类器等)识别算法.使用IDQD算法也能对转录起始位点(TSS)进行... 展开更多; 关键词启动子多样性增量二次判别函数转录起始位点; 在线阅读下载PDF 职称材料

基于序列信息预测内含子保留型可变剪接: 4; 作者李敏李瑞彬 +1 位作者邢永强蔡禄《湖北农业科学》 2016年第1期208-213,共6页; 可变剪接是遗传信息传递与表达的重要环节,真核生物多外显子基因pre-m RNA的可变剪接现象非常普遍。可变剪接增加了蛋白质的多样性,影响诸如细胞组织特异性分化、个体发育、疾病发生等重要的生物学过程。基于内含子的k-mer(k=1…5)信息... 展开更多; 关键词可变剪接内含子保留多样性增量二次判别函数; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名多样性指标用于基因中剪切位点的识别被引量：5: 1; 作者张利绒罗辽复; 机构内蒙古大学物理系; 出处《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2004年第1期77-82,共6页; 基金国家自然科学基金资助项目 ( 90 10 3 0 3 0 )~~; 文摘根据基因剪切位点处的碱基保守性特征 ,和附近位点的碱基组成和关联特征 ,应用多样性指标和二次判别分析 ,对几类模式生物的基因结构进行统一的分析和预测 ,能够较好地识别外显子和内含子及其边界 .计算结果表明 ,对于 4类物种 ,线虫 (C .elegans) ,拟南芥 (A .thaliana ) ,果蝇 (D .melanogaster)和人类 (human) ,核苷酸水平的识别精度为 92 5 %～ 97 1 % ,外显子水平的识别敏感性为 83 7%～ 94 5 % ,特异性为 87 8%～97 1 % .; 关键词剪切位点多样性增量二次判别法外显子内含子基因; Keywords splice site, increment of diversity, quadratic discriminant analysis, exon, intron; 分类号 Q754 [生物学—分子生物学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名核小体定位与RNA剪接被引量：6: 2; 作者陈伟罗辽复张利绒邢永强; 机构内蒙古大学物理科学与技术学院; 出处《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2009年第8期1035-1040,共6页; 基金国家自然科学基金资助项目(90403010 10447003)~~; 文摘根据核小体定位序列和缺失序列的碱基分布特征,应用多样性增量二次判别方法(IDQD)构建模型对这两类序列进行了区分,受试者操作特性曲线下的面积达到了0.958.应用这一模型研究了核小体在人类基因组剪接位点(GT/AG)邻近序列中的分布方式,发现外显子所对应的DNA序列通常倾向参与核小体的形成,并且由它所转录的RNA统计上具有较强的刚性,而剪接位点及其邻近的内含子对应的DNA序列则避免参与核小体的形成,所转录的RNA统计上具有较强的柔性.进一步还发现,DNA序列的核小体定位/缺失和RNA的刚性/柔性具有统计相关性,为从机制上解释为何前体RNA剪接事件与DNA序列中的核小体定位信息有关提供了依据.; 关键词多样性增量二次判别方法核小体定位剪接位点 RNA柔性; Keywords increment of diversity with quadratic discriminant analysis, nucleosome positioning, splice sites, RNA flexibility; 分类号 Q61 [生物学—生物物理学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名人类polⅡ启动子的识别被引量：26: 3; 作者吕军罗辽复; 机构内蒙古大学物理学系内蒙古工业大学物理系; 出处《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2005年第12期1185-1191,共7页; 基金国家自然科学基金资助项目(90403010) 内蒙古自治区自然科学基金资助项目(200308020102)~~; 文摘依据基因启动子区和非启动子区碱基分布的特征,应用基于多样性增量的二次判别分析(IDQD),对人类polⅡ启动子进行识别,识别精度达到90%以上的水平,优于其他已发表的(包括SVM分类器等)识别算法.使用IDQD算法也能对转录起始位点(TSS)进行较准确的预测,10-fold交叉检验结果的敏感性和特异性分别为86%和91%.这些结果表明IDQD是一个有效的分类器.; 关键词启动子多样性增量二次判别函数转录起始位点; Keywords promoter, increment of diversity, quadratic discriminant analysis, transcription start site; 分类号 Q61 [生物学—生物物理学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名基于序列信息预测内含子保留型可变剪接: 4; 作者李敏李瑞彬邢永强蔡禄; 机构内蒙古科技大学数理与生物工程学院; 出处《湖北农业科学》 2016年第1期208-213,共6页; 基金国家自然科学基金项目(61271448) 内蒙古自然科学基金项目(2014MS0312 +2 种基金 2014MS0311 2013MS0514) 内蒙古科技大学创新基金项目(2014QDL012); 文摘可变剪接是遗传信息传递与表达的重要环节,真核生物多外显子基因pre-m RNA的可变剪接现象非常普遍。可变剪接增加了蛋白质的多样性,影响诸如细胞组织特异性分化、个体发育、疾病发生等重要的生物学过程。基于内含子的k-mer(k=1…5)信息,利用多样性增量结合二次判别的方法,对保留型内含子和组成型内含子进行了区分。五折交叉检验显示的预测总精度、敏感性和特异性均大于70%。表明内含子的序列信息可能对保留型内含子的剪接有重要调控作用。; 关键词可变剪接内含子保留多样性增量二次判别函数; Keywords alternative splicing retained intron increment of diversity quadratically integrable function; 分类号 Q61 [生物学—生物物理学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

	题名	作者	出处	发文年	被引量	操作
1	多样性指标用于基因中剪切位点的识别	张利绒罗辽复	《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心	2004	5	在线阅读下载PDF 职称材料
2	核小体定位与RNA剪接	陈伟罗辽复张利绒邢永强	《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心	2009	6	在线阅读下载PDF 职称材料
3	人类polⅡ启动子的识别	吕军罗辽复	《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心	2005	26	在线阅读下载PDF 职称材料
4	基于序列信息预测内含子保留型可变剪接	李敏李瑞彬邢永强蔡禄	《湖北农业科学》	2016	0	在线阅读下载PDF 职称材料