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老年住院患者肺炎克雷伯菌临床分离株多位点可变数目串联重复序列基因分型特征分析 被引量:6
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作者 张媛媛 徐雅萍 +5 位作者 杜鹏程 强裕俊 张雯 陈晨 于季红 郭军 《中国医学科学院学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第4期434-437,共4页
目的探讨老年住院患者肺炎克雷伯菌分离株多位点可变数目串联重复序列分析的基因分型特点。方法收集解放军总医院南楼临床部老年住院患者肺炎克雷伯菌临床分离菌株184株,提取基因组DNA,采用多重PCR和毛细管电泳对7个位点进行分析,利用Bi... 目的探讨老年住院患者肺炎克雷伯菌分离株多位点可变数目串联重复序列分析的基因分型特点。方法收集解放军总医院南楼临床部老年住院患者肺炎克雷伯菌临床分离菌株184株,提取基因组DNA,采用多重PCR和毛细管电泳对7个位点进行分析,利用Bio Numerics 5.1软件进行聚类分析。结果 184株肺炎克雷伯菌临床分离株共产生139种基因型,呈现明显的基因多态性;聚类分析结果显示,全部菌株可分为3个基因群,其中Ⅰ群包含93.06%的菌株。结论本医疗中心老年住院患者的肺炎克雷伯菌临床分离株具有明显的优势菌群,其感染来源仍以院内感染为主。 展开更多
关键词 老年住院患者 感染 肺炎克雷伯菌 多位点可变数目串联重复序列分析
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数目可变串联重复序列用于江苏省168株结核分枝杆菌菌株的基因分型研究 被引量:8
2
作者 许卫国 虞浩 +2 位作者 杨丹丹 吕华坤 周扬 《南京医科大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2007年第12期1509-1512,1516,共5页
目的:初步了解江苏省结核分枝杆菌临床分离菌株的数目可变串联重复序列(Variable number of tandem repeats,VNTR)的基因型及VNTR基因分布特征。方法:在苏南、苏中、苏北三个地区13个结核病定点诊疗单位收集临床分离菌株。选取结核分枝... 目的:初步了解江苏省结核分枝杆菌临床分离菌株的数目可变串联重复序列(Variable number of tandem repeats,VNTR)的基因型及VNTR基因分布特征。方法:在苏南、苏中、苏北三个地区13个结核病定点诊疗单位收集临床分离菌株。选取结核分枝杆菌基因组中11个具有明显多态性特征的VNTR位点,通过PCR扩增,2%琼脂糖凝胶电泳和Bio Numerics(Version 3.0)软件进行结核菌株VNTR的多态性和聚类分析。结果:共收集到168株结核分枝杆菌。不同的菌株在同一位点上具有多态性。共分为10个基因型(Ⅰ,Ⅱ~Ⅹ型),其中以Ⅷ型为主要基因型,占75.0%、其次为Ⅱ型5.4%、Ⅳ型4.2%、Ⅶ型9.5%。不同地区之间,苏南、苏中、苏北三个地区也都以Ⅷ型为主要基因型,分别占各地区的83.5%,57.1%,76.6%;但是苏南、苏中、苏北三地的Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ、Ⅶ型菌株分布在各地菌株中的比例有差异显著性((2=54.710,P<0.0001),Ⅱ型以苏中为主(11.9%)、Ⅲ型以苏南为主(3.8%)、Ⅳ型以苏南、苏北为主(5.1%与6.4%)、Ⅶ型以苏中为主(31.0%)。结论:江苏省的结核分枝杆菌具有明显的多态性,以Ⅷ型为主要流行型,不同地区间同样以Ⅷ型为主要流行型,但菌型分布存在一定的差异。 展开更多
关键词 结核分枝杆菌 多位点数目可变串联重复序列分析 基因分型
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中国汉族人vWF基因内可变数目串联重复序列的研究 被引量:4
3
作者 王迎春 李震宇 +4 位作者 王泳 万海英 顾建明 台虹 阮长耿 《中国实验血液学杂志》 CAS CSCD 1998年第4期293-296,共4页
用聚合酶链反应(PCR)和聚丙烯酰胶凝胶电泳(PAGE)的方法,研究了71名中国汉族人142条染色体的vWF基因40号内含子的可变数目串联重复序列(VNTR)。中国人群vWF基因内存在ATCT的串联重复序列,其VNTR存在14,13,12,11,10,9,8和7等八种等位基因... 用聚合酶链反应(PCR)和聚丙烯酰胶凝胶电泳(PAGE)的方法,研究了71名中国汉族人142条染色体的vWF基因40号内含子的可变数目串联重复序列(VNTR)。中国人群vWF基因内存在ATCT的串联重复序列,其VNTR存在14,13,12,11,10,9,8和7等八种等位基因,总的理论杂合率为79.4%。该VNTR携带遗传信息量大,作为血管性血友病的遗传指标之一对vWD的遗传咨询和产前诊断具有应用价值。 展开更多
关键词 血管性血友病 von WILLEBRAND因子 VWF基因 可变数目串联重复序列 遗传咨询 遗传性出血性疾病
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儿童结核病101例临床分离结核分枝杆菌多位点串联重复序列分型 被引量:6
4
作者 王均 黄延风 +1 位作者 张爱华 许红梅 《第三军医大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第13期1408-1410,共3页
目的了解重庆地区儿童结核病中结核分枝杆菌临床分离株的数目可变串联重复序列(variable numbertandem repeats,VNTR)的分布特征,寻找适合的VNTR位点组合。方法采用多位点串联重复序列(multiple locus VNTRanalysis,MLVA)分型方法,选择... 目的了解重庆地区儿童结核病中结核分枝杆菌临床分离株的数目可变串联重复序列(variable numbertandem repeats,VNTR)的分布特征,寻找适合的VNTR位点组合。方法采用多位点串联重复序列(multiple locus VNTRanalysis,MLVA)分型方法,选择标化的24个VNTR位点,对101例结核分枝杆菌临床分离株DNA进行检测,结果采用BioNumerics 6.1数据库软件进行聚类分析和单位点Hunter-Gaston分辨率指数(Hunter-Gaston index,HGI)分析,并比较分析国际推荐的分组(12、15、24位点)的基因分型鉴定能力。结果 MLVA分析结果显示24个VNTR位点在不同菌株中存在明显的多态性,101例结核分枝杆菌临床分离株可分为1个基因群83种基因型,其中69种基因型只有1个菌株,占68.32%(69/101),另有32株临床分离株表现出14种基因型,占31.68%(32/101),成簇率为17.82%;24个VNTR位点的HGI具有较大差异(0.168~0.829),HGI能达到0.5以上的VNTR位点数有16个;24个VNTR位点进行不同的位点组合:12、15个和24个位点组合的HGI分别为0.995、0.996、0.996。结论 重庆地区儿童结核病中结核分枝杆菌存在基因多态性,国际推荐的15个VNTR位点组合的MLVA分型方法适用于其流行病学的研究。 展开更多
关键词 结核分枝杆菌 多位点可变数目串联重复序列 基因分型
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DNA数目可变串联重复序列用于结核分枝杆菌分型研究 被引量:8
5
作者 阚晓宏 万康林 +7 位作者 金玉莲 刘敬华 杨建安 刘志广 丁虹 赵秀琴 王庆 唐婧 《中国防痨杂志》 CAS 2005年第2期77-81,共5页
目的 采用数目可变串联重复序列 (VNTR)分型方法对安徽省的 5 2株结核分枝杆菌进行分子分型研究 ,探讨该方法用于结核分枝杆菌分型的作用。方法 设计引物 ,采用PCR和琼脂糖凝胶电泳技术对结核分枝杆菌 13个VNTR位点进行检测 ,并通过Bi... 目的 采用数目可变串联重复序列 (VNTR)分型方法对安徽省的 5 2株结核分枝杆菌进行分子分型研究 ,探讨该方法用于结核分枝杆菌分型的作用。方法 设计引物 ,采用PCR和琼脂糖凝胶电泳技术对结核分枝杆菌 13个VNTR位点进行检测 ,并通过BioNumerics 3 0软件进行DNA指纹图谱多态性分析。结果  5 2株结核分枝杆菌可分 4个类别 ,其中 88. 5 %菌株属于一个型 ,其他 3个型所占比例很小 ,分别为 5 . 8%、3 .8%和 1 .9%。结论 来自安徽的结核分枝杆菌存在主要的流行型 ,VNTR分型技术简便、快速 ,是较好的结核分枝杆菌分型方法。 展开更多
关键词 结核分枝杆菌 数目可变串联重复序列 基因分型 琼脂糖凝胶电泳技术
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中国炭疽芽胞杆菌中11个串联重复序列位点的特征和分布 被引量:4
6
作者 魏建春 张恩民 +1 位作者 张慧娟 张建华 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第8期765-768,共4页
目的检测炭疽芽胞杆菌中可变数量串联重复序列(VNTR)的变化,分析我国菌株中VNTR的特征和分布规律。方法 PCR扩增,琼脂糖电泳和毛细管电泳,测序验证,BLAST比对等。结果 11个VNTR位点中有4个在所有菌株中没有差别,另外7个位点只在个别菌... 目的检测炭疽芽胞杆菌中可变数量串联重复序列(VNTR)的变化,分析我国菌株中VNTR的特征和分布规律。方法 PCR扩增,琼脂糖电泳和毛细管电泳,测序验证,BLAST比对等。结果 11个VNTR位点中有4个在所有菌株中没有差别,另外7个位点只在个别菌株中检测到差别,有差别的菌株多分布在新疆;11个VNTR位点均位于基因编码区内,编码对细菌生存重要的蛋白和一些功能不明蛋白。结论结果提示新疆的菌株类型较复杂;本研究中的VNTR位点比较保守,可能不能用于区别不同的炭疽芽胞杆菌,但对于了解炭疽芽胞杆菌的基因组特征以及鉴定炭疽芽胞杆菌具有一定的作用。 展开更多
关键词 炭疽芽胞杆菌 可变数量串联重复序列 特征 分布
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内蒙古炭疽芽胞杆菌多位点串联重复序列分型分析 被引量:4
7
作者 海岩 王文瑞 +5 位作者 郭卫东 李昕 跃华 张慧娟 魏建春 武利涛 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第9期975-977,共3页
炭疽芽胞杆菌是引起人和动物炭疽的病原菌,牛、羊等食草动物为主要传染源,人类主要通过接触炭疽病畜毛皮和食肉而感染,也可以通过吸入含有炭疽芽孢的粉尘或气溶胶而感染.我国炭疽自然疫源地分布广泛,炭疽病例时有发生.内蒙古地区是主要... 炭疽芽胞杆菌是引起人和动物炭疽的病原菌,牛、羊等食草动物为主要传染源,人类主要通过接触炭疽病畜毛皮和食肉而感染,也可以通过吸入含有炭疽芽孢的粉尘或气溶胶而感染.我国炭疽自然疫源地分布广泛,炭疽病例时有发生.内蒙古地区是主要的炭疽自然疫源地,每年都有病例发生.炭疽杆菌是一种相对保守的细菌,很多基因分型方法都不能对其分型,Keim等[1]首次将MLVA8方法用于炭疽芽抱杆菌基因分子分型中,其选择6个染色体上VNTR多态性位点和2个质粒上VNTR多态性位点联合建立了MLVA8分析方法,是比较有效的区别不同炭疽芽胞杆菌的方法. 展开更多
关键词 炭疽芽胞杆菌 内蒙古地区 分型分析 串联重复序列 基因分型方法 自然疫源地 多态性位点 VNTR
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毛细管电泳-短小串联重复序列多态性方法及对人凝血因子BSTR位点的检测 被引量:1
8
作者 裴黎 邓华 +4 位作者 张丽君 姜成涛 赵兴春 常彩琴 王俭 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2002年第3期460-463,共4页
为开展高效毛细管电泳技术对STR位点的检测 ,通过建立毛细管电泳 短小串联重复序列 (STRs)多态性的检测方法 ,实现了利用毛细管电泳快速检测人凝血因子B (F13B)STR位点PCR产物的长度多态性 ,结果F13B STR基因型分型正确 ,图谱清晰 .... 为开展高效毛细管电泳技术对STR位点的检测 ,通过建立毛细管电泳 短小串联重复序列 (STRs)多态性的检测方法 ,实现了利用毛细管电泳快速检测人凝血因子B (F13B)STR位点PCR产物的长度多态性 ,结果F13B STR基因型分型正确 ,图谱清晰 .方法的建立可简化常规多态性检测 ,实现快速。 展开更多
关键词 毛细管电泳-短小串联重复序列多态性方法 人凝血因子Ⅻ BSTR位点 检测
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单胺氧化酶A启动子可变数目重复序列多态性与中国北方汉族人群重性抑郁症的关联分析 被引量:7
9
作者 张洁旭 陈彦博 +2 位作者 张克让 许琪 沈岩 《中国医学科学院学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第6期728-734,共7页
目的探讨单胺氧化酶A(MAOA)基因启动子可变数目重复序列(VNTR)多态性与重性抑郁症易感性的关系。方法采用PCR技术检测512例重性抑郁症患者与566名对照VNTR重复序列分布频率是否具有差异,并使用汉密顿焦虑量表对重性抑郁症患者进行评估... 目的探讨单胺氧化酶A(MAOA)基因启动子可变数目重复序列(VNTR)多态性与重性抑郁症易感性的关系。方法采用PCR技术检测512例重性抑郁症患者与566名对照VNTR重复序列分布频率是否具有差异,并使用汉密顿焦虑量表对重性抑郁症患者进行评估。结果男性及女性重性抑郁症患者MAOA VNTR等位基因频率与对照相比差异无显著性;基因型分析显示,女性重性抑郁症患者与对照相比,L等位基因携带者频率显著升高(P=0.002),男性患者与对照相比分布频率差异无显著性(P=0.17)。表型分析显示,女性患者携带L等位基因的基因型(P=0.0056)与汉密顿焦虑量表"害怕"表型的发生显著相关。结论MAOA VNTR多态性可能与女性中国北方汉族人群重性抑郁症发病相关,且可提高抑郁症表型的发生。 展开更多
关键词 重性抑郁症 单胺氧化酶A基因 可变数目重复序列多态性 汉密顿焦虑量表
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短串联重复序列联合检测在亲子鉴定中的应用 被引量:1
10
作者 甘建一 《海南医学院学报》 CAS 2004年第2期104-105,共2页
目的:客观评价15个短串联重复序列(STR)位点联合检测在亲子鉴定中的准确性。方法:28例南方无关汉族家系血样74份,PCR扩增,ABI-310DNA分析仪测序分型,依据中国南方汉族人群基因频率资料,计算非父排除率和亲子关系概率。结果:15个STR位点... 目的:客观评价15个短串联重复序列(STR)位点联合检测在亲子鉴定中的准确性。方法:28例南方无关汉族家系血样74份,PCR扩增,ABI-310DNA分析仪测序分型,依据中国南方汉族人群基因频率资料,计算非父排除率和亲子关系概率。结果:15个STR位点联合检测,累积非父排除率为0.999999,亲子关系概率均大于或等于99.73%。结论:亲子鉴定中,15个STR位点联合检测灵敏、可靠。 展开更多
关键词 串联重复序列 联合检测 亲子鉴定 亲子关系 STR位点 核酸 法医学
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甘肃省肃北蒙古族自治县喜马拉雅旱獭疫源地鼠疫耶尔森菌分子流行病学特征研究
11
作者 郭丽民 张晓玲 +3 位作者 黄燕妍 赵存寿 张成鑫 付国明 《中国人兽共患病学报》 北大核心 2025年第2期158-163,170,共7页
目的 研究肃北县鼠疫菌差异区段(DFR)、规律成簇的间隔短回文重复序列(CRISPR)及可变数目串联重复序列(VNTR)的基因多态性特征,指导突发鼠疫疫情的溯源。方法 对1973-2017年间肃北县鼠疫疫源地不同动物宿主分离的89株鼠疫菌进行培养,提... 目的 研究肃北县鼠疫菌差异区段(DFR)、规律成簇的间隔短回文重复序列(CRISPR)及可变数目串联重复序列(VNTR)的基因多态性特征,指导突发鼠疫疫情的溯源。方法 对1973-2017年间肃北县鼠疫疫源地不同动物宿主分离的89株鼠疫菌进行培养,提取DNA。分别利用DFR、CRISPR和MLVA基因分型的引物进行PCR反应,通过琼脂糖电泳观察扩增产物有无,与中国鼠疫菌DFR数据库比较确定鼠疫菌DFR基因型;通过PCR产物测序,与在线鼠疫菌CRISPR数据库比对确定CRISPR基因型;通过毛细管电泳计算每株鼠疫菌VNTR的重复数,基于肃北县89株与11株青海省喜马拉雅旱獭疫源地的鼠疫菌VNTR重复数应用BioNumerics7.6构建最小生成树。结果 肃北县89株鼠疫菌可分为6个DFR基因型,分别为8型、7型、1b型、5型、32型和44型,其中8型为肃北县鼠疫疫源地主要基因组型。肃北县89株鼠疫菌经CRISPR分型,可分为3个基因簇和3个基因型,其中Ca35′为肃北县鼠疫疫源地的主要基因簇,基因型为26′,主要分布在肃北蒙古族自治县党城湾镇、鱼儿红乡和石包城乡;Ca7和CaΔ5′为肃北县鼠疫疫源地的次要基因簇,基因型为22和24型,分布在党城湾镇、鱼儿红乡和石包城乡。MLVA聚类分析,肃北县鼠疫菌主要分为3个簇,分别为党城湾镇马场簇、鱼儿红乡簇和党城湾镇簇。结论 DFR、CRISPR和MLVA基因分型方法均能将肃北县鼠疫菌分为主要基因型和次要基因型,具有显著的地区分布特征,基因型多样性较高,种群特征复杂,尤其在鼠疫疫情溯源时给予重视。 展开更多
关键词 肃北县 差异区段 规律成簇的间隔短回文重复序列 多位点可变数目串联重复序列
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广州地区汉族人群Y染色体多个STR位点的研究 被引量:14
12
作者 唐双柏 郭景元 +2 位作者 刘超 梁赏猷 王穗保 《法医学杂志》 CAS CSCD 1999年第2期86-88,共3页
为建立一套高度多态且实用性强的Y-STRs标记系统,本文用PCR结合银染显色技术研究了111例广州汉族男性DYS19、DYS389Ⅰ/Ⅱ、DYS390等位基因及单倍型分布状况。结果显示:广州地区汉族男性DYS19位点... 为建立一套高度多态且实用性强的Y-STRs标记系统,本文用PCR结合银染显色技术研究了111例广州汉族男性DYS19、DYS389Ⅰ/Ⅱ、DYS390等位基因及单倍型分布状况。结果显示:广州地区汉族男性DYS19位点有A1、A2、A3、A4、A5五种等位基因,出现频率分别为18.9%、36.0%、36.0%、7.2%、1.8%;DYS389Ⅰ位点有B1、B2、B3、B4四种等位基因,出现频率分别为6.3%、52.2%、17.1%、24.3%;DYS389Ⅱ位点有C1、C2、C3、C4、C5五种等位基因,出现频率分别为11.7%、38.7%、22.5%、17.1%、9.9%,DYS390位点有D1、D2、D3、D4、D5五种等位基因,出现频率分别为2.7%、9.9%、46.8%、27.9%、12.6%;χ2检验表明上述各等位基因分布存在明显的地域差异。此外,还观察到72种由上述座位共同构成的单倍型,单倍型多样性达0.980。 展开更多
关键词 Y染色体 串联重复序列 遗传多态性 STR位点
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3个STR位点在中国7个民族遗传距离中的研究 被引量:5
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作者 黄辰 王全丽 +5 位作者 宋土生 司履生 胡晓岩 倪磊 陈雪玲 许健 《西北农林科技大学学报(自然科学版)》 CSCD 北大核心 2004年第1期81-84,共4页
 应用PCR技术、质量分数4%变性聚丙烯酰胺凝胶电泳及银染技术,研究了D16S539,D7S820和D13S7133个STR位点在新疆锡伯族和哈萨克族中的遗传结构,结合汉族、黎族、朝鲜族、藏族和维吾尔族相同位点的相关遗传资料,应用亲缘系数和遗传距离...  应用PCR技术、质量分数4%变性聚丙烯酰胺凝胶电泳及银染技术,研究了D16S539,D7S820和D13S7133个STR位点在新疆锡伯族和哈萨克族中的遗传结构,结合汉族、黎族、朝鲜族、藏族和维吾尔族相同位点的相关遗传资料,应用亲缘系数和遗传距离研究了7个民族间的遗传关系,并根据遗传距离绘制遗传系统树。结果显示,汉族、朝鲜族、黎族、藏族和锡伯族为一群,而新疆哈萨克族和维吾尔族为一群。其中,汉族与朝鲜族遗传距离最近,其他依次为黎族、藏族和锡伯族。 展开更多
关键词 STR位点 中国 民族 遗传距离 遗传关系 PCR扩增产物 电泳分离 统计学 串联重复序列
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四川省高海拔地区结核分枝杆菌耐药及传播特征分析
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作者 高媛 雷卉 +4 位作者 何璐 于子涵 陈闯 何金戈 夏岚 《中国防痨杂志》 北大核心 2025年第11期1459-1464,共6页
目的:分析四川省高海拔地区(石渠县,4520m)结核分枝杆菌耐药情况及遗传多样性,为我国高海拔高寒地区制定结核病精准防控策略、建立分枝杆菌菌种库、探索高海拔对分枝杆菌进化的影响提供科学数据。方法:采用前瞻性研究方法,按照标准流程... 目的:分析四川省高海拔地区(石渠县,4520m)结核分枝杆菌耐药情况及遗传多样性,为我国高海拔高寒地区制定结核病精准防控策略、建立分枝杆菌菌种库、探索高海拔对分枝杆菌进化的影响提供科学数据。方法:采用前瞻性研究方法,按照标准流程采集2023年6月至2024年4月期间四川省石渠县结核病定点医疗机构收集的189例肺结核患者痰液样本(每例1份)进行罗氏固体培养,再经上级机构基因芯片技术和基因测序,最终纳入75株有效菌株。再使用结核分枝杆菌序列分析平台对所有菌株的菌型、耐药及基因突变、谱系及成簇情况等进行分析。结果:75株菌株中,33株菌株对9种抗结核药物耐药,总耐药率为44.00%,包含33个耐药突变位点和35种突变耐药类型。33株耐药菌株中,10株(13.33%)为耐多药菌株,2株(2.67%)为准广泛耐药菌株,21株(28.00%)为其他耐药菌株;14株(42.42%)为单一突变耐药,12株(36.36%)为2种突变耐药,7株(21.21%)为3种及以上突变耐药。在耐药的9种药物中,异烟肼的耐药率最高[42.42%(14/33)],利福平次之[39.39%(13/33)]。谱系分型中,东亚型(L2型)占89.33%(67/75),且以东亚系北京型为主[94.03%(63/67)],余8株(10.67%)为欧美谱系型(L4型)。51株为成簇菌株,成簇率为68.00%,共鉴定出12个簇,成簇菌株数介于2~12株,以2株为最多[50.00%(6/12)]。结论:四川省高海拔高寒地区石渠县肺结核耐药比例明显高于其他地区,主要流行谱系为L2型,且成簇率较高,肺结核近期传播风险较严重。该地区应进一步加强结核病防治工作,以减少结核分枝杆菌传播和耐药产生。 展开更多
关键词 分枝杆菌 结核 序列标记位点 串联重复序列 结核 抗多种药物性 流行病学研究特征(主题) 高海拔
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CODIS位点在排除亲权中的应用价值 被引量:15
15
作者 方建新 刘锡杰 程大霖 《法医学杂志》 CAS CSCD 2001年第2期86-88,共3页
目的 对 CODIS位点 (FGA、 vWA、 CSF1PO、 TH01、 TPOX、 D3S1358、 D5S818、 D7S820、 D8S1179、 D13S317、 D16S539、 D18S51和 D21S11共 13个 STR位点 )在 100例排除亲权的亲子鉴定中的应用价值进行研究。方法 采用 Profiler Plus及... 目的 对 CODIS位点 (FGA、 vWA、 CSF1PO、 TH01、 TPOX、 D3S1358、 D5S818、 D7S820、 D8S1179、 D13S317、 D16S539、 D18S51和 D21S11共 13个 STR位点 )在 100例排除亲权的亲子鉴定中的应用价值进行研究。方法 采用 Profiler Plus及 Cofiler荧光标记复合扩增系统,通过 310遗传分析仪对上述二个检测体系扩增产物的基因型进行分析。结果 在排除亲权的母亲-孩子-假设父亲三联体组中,所有观察案例其出现的排除指标数都在 3个以上,平均排除指标数为 6.63个;在假设父亲-孩子二联体组中, 94.0%的观察案例其排除指标数均在 3个以上,平均排除指标数为 5.01个。结论 CODIS位点在排除亲权的二联体和三联体组合亲子鉴定中,都符合鉴定应用要求 ;选择多态性较高的位点与增加排除指标存在直接的联系,以 DP、 H、 PE作为衡量 DNA位点应用价值的指标在具体鉴定实践中是可靠和可行的。 展开更多
关键词 CODIS位点 串联重复序列 亲子鉴定 排除亲权 法医鉴定学
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成都地区汉族人群D2S441位点的遗传多态性研究 被引量:2
16
作者 黄代新 张林 +2 位作者 吴梅筠 陈国弟 陈于波 《法医学杂志》 CAS CSCD 2001年第1期15-16,共2页
为研究 STR位点 D2S441的遗传多态性,为法医学应用提供基础数据,应用 PCR及 PAG电泳技术对 260名成都地区汉族无关个体进行了调查,共检出 9个等位基因及 26种基因型,首次获得汉族群体频率分布 ,其等位基因片段大小范围为 131~ 155b... 为研究 STR位点 D2S441的遗传多态性,为法医学应用提供基础数据,应用 PCR及 PAG电泳技术对 260名成都地区汉族无关个体进行了调查,共检出 9个等位基因及 26种基因型,首次获得汉族群体频率分布 ,其等位基因片段大小范围为 131~ 155bp。该位点基因型频率分布符合 Hardy- Weinberg平衡。家系调查证实了等位基因的传递遵循孟德尔遗传规律。其个人识别能力( Dp)、杂合度( H)、多态性信息含量( PIC)和非父排除率( PE)分别为 0.9084、 0.7885、 0.7390和 0.5778,表明该位点在法医学个人识别及亲子鉴定中具有较高的实用价值。 展开更多
关键词 串联重复序列 聚合酶链反应 D2S441位点 多态性 遗传多态性
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用基因扫描技术对新疆维吾尔族4个STR位点遗传多态性的分析 被引量:1
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作者 袁俐 袁育康 +3 位作者 冯继东 王红英 邢建新 李生斌 《石河子大学学报(自然科学版)》 CAS 2001年第4期262-266,共5页
研究了新疆维吾尔族群体 4个STR基因位点D5S818、D13S317、D7S82 0和D16S5 39的基因及基因型分布 ,获得 4个基因座的群体遗传学数据。采用PCR扩增技术和基因扫描技术进行样本STR遗传结构分析 ,并与其他种族、人群的等位基因频率进行比... 研究了新疆维吾尔族群体 4个STR基因位点D5S818、D13S317、D7S82 0和D16S5 39的基因及基因型分布 ,获得 4个基因座的群体遗传学数据。采用PCR扩增技术和基因扫描技术进行样本STR遗传结构分析 ,并与其他种族、人群的等位基因频率进行比较。结果表明 ,4个基因位点在新疆维吾尔族人群中均具有遗传多态性 ,4个基因座的基因型分布均符合Hardy Weinberg平衡定律 (P >0 .0 5 ) 。 展开更多
关键词 维吾尔族群体 串联重复序列 基因扫描 遗传多态性 STR基因位点 遗传结构 群体遗传学
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陕西老年人群与青年人群YNZ22位点多态性分布的对比分析
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作者 舒青 张思河 +1 位作者 张素珍 李军林 《西北农林科技大学学报(自然科学版)》 CSCD 北大核心 2003年第3期198-200,204,共4页
应用 PCR- Am p- FL P技术对 75例陕西正常老年人群、94例老年动脉粥样硬化 (AS)患者与 71例陕西正常青年人群的 YNZ2 2 - VNTR(可变数目串联重复序列 variable num ber tandem repeats)位点进行多态性分析。结果显示 ,在正常青年人群中... 应用 PCR- Am p- FL P技术对 75例陕西正常老年人群、94例老年动脉粥样硬化 (AS)患者与 71例陕西正常青年人群的 YNZ2 2 - VNTR(可变数目串联重复序列 variable num ber tandem repeats)位点进行多态性分析。结果显示 ,在正常青年人群中 YNZ2 2位点共检测出 2 9种基因型 ,1 0个等位基因 ,其片段大小在 1 6 8~ 938bp,杂合度为 70 .4 % ,多态信息量 (polym orphism inform ation content,PIC)为 0 .84 ;老年人群中 YNZ2 2基因点共检测出 2 0种基因型 ,9个等位基因 ,其片段大小在 1 6 8~ 798bp,杂合度为 2 4 % ,多态信息量 (PIC)为 0 .84 ,与青年群体的基因频率分布有显著差异 ;动脉粥样硬化 (AS)人群中 YNZ2 2基因点共检测出 2 3种基因型 ,9个等位基因 ,其片段大小在 1 6 8~ 72 8bp,杂合度为 2 4 .4 7% ,多态信息量为 0 .81。表明老年群体杂合度显著降低 ,最主要的是在基因型数目与大基因片段上老年群体与青年群体差异显著。 YNZ2 2位点多态性改变或不稳定可能是引起衰老的原因之一。 展开更多
关键词 陕西 老年人群 青年人群 YNZ22基因 多态性分布 衰老 PCR-Amp-FLP技术 基因型数目 大基因片段 数目可变串联重复序列
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广东汉族人基因组D17S5位点遗传多态性
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作者 杨英浩 伍新尧 +2 位作者 罗超权 郭俊明 刘煦文 《中山大学学报(医学科学版)》 CAS CSCD 1993年第4期285-285,共1页
本文介绍用二步法PCR检测广东汉族人基因组D17S5 VNTR(数量可变的串联重复序列)遗传多态性的结果。共发现有12个等位基因。这些等位基因片段的大小在100bp至870bp之间(每一重复单位为70bp),等位基因的频率分布在0.00.5至0.19之间。
关键词 人基因组 等位基因频率 广东汉族人 遗传多态性 统计学分析 人群 串联重复序列 VNTR 位点 片段
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中国畲族、锡伯族、壮族和藏族Penta E位点的遗传多态性 被引量:1
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作者 孔铭华 王春雨 +3 位作者 裴黎 涂政 马贵富 叶健 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2006年第1期17-20,共4页
应用复合PCR扩增技术和荧光毛细管DNA自动电泳分型的方法,使用国产试剂盒,检测PentaE位点在中国畲族、锡伯族、壮族和藏族中的基因频率分布情况。获得了4个民族各约100名无关个体的Penta E位点的等位片段及基因型频率,共发现20个等... 应用复合PCR扩增技术和荧光毛细管DNA自动电泳分型的方法,使用国产试剂盒,检测PentaE位点在中国畲族、锡伯族、壮族和藏族中的基因频率分布情况。获得了4个民族各约100名无关个体的Penta E位点的等位片段及基因型频率,共发现20个等位片段,其频率分布在0.0048—0.2396之间。各民族的平均杂合度为0.8838,平均个体识别力0.9748,平均非父排除率0.7635,平均多态信息总量0.8950。研究表明Penta E位点属高杂合度、高识别能力的遗传标记,是法庭科学亲子鉴定和个体识别的理想位点。 展开更多
关键词 Penta E位点 串联重复序列 基因频率 Hardy-Weinberg平衡 精确检验
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