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基因标志物评分预测骨质疏松性髋部骨折患者术后谵妄
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作者 刘颖 汪文华 赖尚树 《中国骨质疏松杂志》 北大核心 2025年第9期1322-1329,1404,共9页
目的构建基因标志物评分预测骨质疏松性髋部骨折(OHF)患者术后谵妄(POD)风险。方法选择我院2022年1月至2024年1月收治的121例OHF患者为研究对象。对9例POD和9例无POD的OHF患者血浆mRNAs进行微阵列分析。使用Cytoscape构建蛋白质-蛋白质... 目的构建基因标志物评分预测骨质疏松性髋部骨折(OHF)患者术后谵妄(POD)风险。方法选择我院2022年1月至2024年1月收治的121例OHF患者为研究对象。对9例POD和9例无POD的OHF患者血浆mRNAs进行微阵列分析。使用Cytoscape构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络,基于度中心性(DC)值筛选前25%的核心基因并利用酶联免疫吸附法(ELISA)验证基因表达。通过最小绝对收缩和选择算子(LASSO)回归筛选并计算特征基因回归系数构建基因标志物评分,将其与临床数据结合构建预测OHF患者POD风险列线图。结果POD和无POD患者微阵列数据识别出161个基因在POD患者血浆中表达上调,63个基因在POD患者血浆中表达下调。PPI网络中基于DC值发现前25%核心基因有16个。ELISA验证表达后通过LASSO回归筛选并构建基因标志物评分:0.205×H3簇状组蛋白12(H3C12)表达量+0.055×整合素αX亚基(ITGAX)表达量-0.457×核糖体蛋白S4 Y-linked 1(RPS4Y1)表达量。基于基因标志物评分结合体质量指数(BMI)和血红蛋白(Hb)构建的列线图可有效预测OHF患者POD风险。结论包含H3C12、ITGAX和RPS4Y1的基因标志物评分和BMI和Hb的列线图可高效预测OHF患者POD风险,为患者术后早期预防和干预提供新的指导思路。 展开更多
关键词 骨质疏松性髋部骨折 术后谵妄 基因标志物 列线图 微阵列分析
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子宫内膜癌与VEGF、PTEN、CD44、P27基因标志物的研究 被引量:4
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作者 于秀 谢阳桂 史锦云 《实用医学杂志》 CAS 2006年第17期2066-2067,共2页
关键词 子宫内膜癌 基因标志物 VEGF PTEN CD44 P27 重组DNA技术 抑癌基因 妇科恶性肿瘤 分子生
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基于WGCNA和SVM-RFE算法挖掘肺腺癌诊断和预后基因标志物 被引量:1
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作者 王美 王可心 +1 位作者 谭建军 王京京 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2022年第2期381-394,共14页
目的肺癌是世界上最常见的癌症之一,在众多肺癌患者中,肺腺癌(lung adenocarcinoma,LUAD)的死亡率最高。基因表达谱的变化与肿瘤的发生和发展过程有关,通过识别与LUAD患者相关的诊断和预后基因标志物,可以为肺腺癌的预防和治疗提供理论... 目的肺癌是世界上最常见的癌症之一,在众多肺癌患者中,肺腺癌(lung adenocarcinoma,LUAD)的死亡率最高。基因表达谱的变化与肿瘤的发生和发展过程有关,通过识别与LUAD患者相关的诊断和预后基因标志物,可以为肺腺癌的预防和治疗提供理论依据。方法本研究以肿瘤基因组图谱(The Cancer Gene Atlas,TCGA)数据库为基础,采用加权基因共表达网络分析(weighted gene co-expression network analysis,WGCNA)、差异基因分析、cox回归分析、蛋白质互作网络(protein-protein interaction,PPI)分析等方法筛选与LUAD形成过程高度相关的hub基因。将TCGA和基因型组织表达(GTEx genotype tissue expression,GTEx)数据库中的RNA数据合并划分为训练集和内部验证集,利用基于支持向量机的递归特征消除算法(support vector machine recursive feature elimination feature,SVM-RFE)构建诊断模型并进行验证。GSE32863和GSE31210数据集分别用于验证诊断模型的准确性和基因标志物的预后价值。结果SVM-RFE算法得到的5个基因标志物(anln、cenpa、plk1、tpx2、cdca3)模型在LUAD患者分类中具有显著的诊断能力。功能富集分析表明,这5个基因与肿瘤发生发展的生物学过程密切相关。此外,这5个基因高表达的LUAD患者的预后表现不良,死亡率显著高于低表达的患者。结论我们的研究为LUAD的诊断和预后提供了具有5个基因特征的模型,这对于开发用于精确治疗的新靶点具有重要意义。 展开更多
关键词 肺腺癌 基因标志物 加权基因共表达网络分析 递归特征消除算法
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结直肠癌早期检测的基因标志物
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作者 李鹏 朱运峰 《第二军医大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第8期903-905,共3页
研究表明,肿瘤的发生和发展与癌基因和抑癌基因有着密不可分的关系。随着分子生物学理论和技术的发展,对癌基因和抑癌基因的检测已成为肿瘤临床预警和诊断的重要途径。自Fearon和Vogelstein 1990年提出结直肠癌发生的分子模型以来,结直... 研究表明,肿瘤的发生和发展与癌基因和抑癌基因有着密不可分的关系。随着分子生物学理论和技术的发展,对癌基因和抑癌基因的检测已成为肿瘤临床预警和诊断的重要途径。自Fearon和Vogelstein 1990年提出结直肠癌发生的分子模型以来,结直肠癌发病的分子机制不断被阐明,通过对与结直肠癌相关的基因改变的检测可以为结直肠癌早期预警提供帮助。尤其是对具有家族病史的人进行相关基因改变的检测,检出率已经达到相当高的水平。本文对近年来被认为与结直肠癌相关的基因作一综述。 展开更多
关键词 结直肠肿瘤 基因 突变 基因标志物
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基于空心海胆状金纳米粒子和银/氧化锌纳米结构SERS特性的基因类肿瘤标志物高灵敏检测 被引量:4
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作者 彭乐 周露 +4 位作者 卿艳平 佟丽莹 梁照恒 洑颢 周骏 《光子学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2020年第8期97-106,共10页
基因类肿瘤标记物microRNA(miRNA)的痕量检测对于癌症早期诊断具有重要应用价值.根据空心海胆状金纳米粒子和银/氧化锌(Ag/ZnO)纳米结构的表面增强拉曼散射特性,并基于碱基互补配对原理构建探针-核酸-基底组成的"三明治"结构... 基因类肿瘤标记物microRNA(miRNA)的痕量检测对于癌症早期诊断具有重要应用价值.根据空心海胆状金纳米粒子和银/氧化锌(Ag/ZnO)纳米结构的表面增强拉曼散射特性,并基于碱基互补配对原理构建探针-核酸-基底组成的"三明治"结构,提出了一种基因类肿瘤标志物miRNA的高灵敏定量检测方案.首先将捕获DNA与修饰4-巯基苯甲酸(4-MBA)的空心海胆状金纳米粒子链接作为探针,同时在Ag/ZnO纳米结构上修饰靶DNA,经与miRNA-106a互补杂交后进行SERS信号检测,获得相应的剂量-响应曲线.实验结果表明,在1 fmol·L-1至1 nmol·L-1的检测范围内,对miRNA-106a的检测限达到1.84 fmol·L-1.同时,采用实时荧光定量多聚核苷酸链式反应方法验证了基于空心海胆状金纳米粒子和Ag/ZnO纳米结构SERS特性的miRNA检测方案的可靠性. 展开更多
关键词 表面增强拉曼散射 Ag/ZnO纳米结构 空心海胆状金纳米粒子 基因类肿瘤标志 MicroRNA
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应用Bhas42细胞实验检测佛波酯对22个肿瘤促长基因表达的影响 被引量:1
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作者 宋征 韩峻松 +1 位作者 汪溪洁 马璟 《中国药理学与毒理学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2014年第2期274-278,共5页
目的探索目标基因与Bhas42细胞转化试验结合成为检测化合物致癌促长活性新的筛选方法的可能性。方法取促癌化合物佛波酯(TPA)作为阳性物,采用Bhas42转化细胞作为实验体系。接种当日为第0天(d 0),d 4将培养基换成含有TPA 0.05 mg·L-... 目的探索目标基因与Bhas42细胞转化试验结合成为检测化合物致癌促长活性新的筛选方法的可能性。方法取促癌化合物佛波酯(TPA)作为阳性物,采用Bhas42转化细胞作为实验体系。接种当日为第0天(d 0),d 4将培养基换成含有TPA 0.05 mg·L-1或0.5%DMSO的DF5F培养基,在加入相应受试化合物的24,48及72 h后取样。样品经过预处理后对抽提的RNA进行质量评价,采用RT-PCR方法检测Ccnb1,Rif1,Mcm3,Chek1,Jun,Fosl1,Hells,Vegfa,Stmn1,Prl2c3,Scarb1,Phex,Orm1,Orm2,Nup54,Slc2a1,Il1rl1,Rad51ap1,Tfrc,Ab1,Car13和Pik3r5在不同时间点的表达。结果与阴性对照组相比,TPA组加样后24 h有3个基因出现上调,分别为Vegfa,Il1rl1和Pik3r5;加样后48 h有11个基因出现上调,分别为Chek1,Hells,Mcm3,Rad51ap1,Vegfa,Il1rl1,Prl2c3,Slc2a1,Tfrc,Stmn1和Rif1;加样后72 h有10个基因出现上调,分别是Chek1,Hells,Rad51ap1,Vegfa,Il1rl1,Prl2c3,Slc2a1,Tfrc,Stmn1和Ccnb1。结论 TPA处理后所选取的22个促长阶段相关基因的表达在不同时间点呈现出不同的敏感性,说明22个肿瘤促长基因与Bhas42细胞体系结合,有望成为一种更快捷高速的致癌性筛选方法。 展开更多
关键词 Bhas42细胞 致癌 基因标志物
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大连典型浴场海水中粪源指示细菌和土著病原弧菌的流行分布 被引量:1
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作者 明红霞 张颖雪 +3 位作者 金媛 苏洁 石岩 樊景凤 《生物学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2020年第2期52-56,共5页
粪便污染指示细菌可能不能反映海洋土著病原细菌的污染,因此,在游泳高峰期选取肠球菌、副溶血弧菌、创伤弧菌和霍乱弧菌为研究对象,分析了大连付家庄浴场和星海浴场细菌学指标的分布特征。结果表明,肠球菌的超标率为58.2%(n=134),副溶... 粪便污染指示细菌可能不能反映海洋土著病原细菌的污染,因此,在游泳高峰期选取肠球菌、副溶血弧菌、创伤弧菌和霍乱弧菌为研究对象,分析了大连付家庄浴场和星海浴场细菌学指标的分布特征。结果表明,肠球菌的超标率为58.2%(n=134),副溶血弧菌、创伤弧菌和霍乱弧菌的毒力基因标志物检出率分别为24.6%、10.4%和4.5%(n=134),两个浴场不但受到了比较严重的粪便污染,而且均存在病原性副溶血弧菌和创伤弧菌,此外,付家庄浴场还存在病原性霍乱弧菌,对游客健康造成潜在威胁。风速、浪高、降雨对肠球菌影响较大,水温、气温、盐度、透明度是病原性创伤弧菌分布的主要影响因子,pH值、浪高对副溶血弧菌的分布影响较大。因肠球菌与弧菌的生态学特征差异较大,建议在现行浴场水质监测的基础上,增加常见病原弧菌的监测。 展开更多
关键词 肠球菌 副溶血弧菌 创伤弧菌 霍乱弧菌 浴场海水 毒力基因标志物
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