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基于蛋白质组学分析过氧化物还原酶6的非钙依赖型磷脂酶A2活性调控牛肉嫩化机制
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作者 刘际通 王新怡 +3 位作者 张一敏 朱立贤 梁荣蓉 毛衍伟 《食品科学》 北大核心 2025年第11期20-28,共9页
为揭示宰后成熟过程中过氧化物还原酶6(peroxiredoxin 6,Prdx6)的非钙依赖型磷脂酶A2活性(calciumindependentphospholipase A2,iPLA2)对牛肉嫩化的影响及其内在作用机制,进一步探究Prdx6作为生物标志物在牛肉嫩化中的具体作用。测定宰... 为揭示宰后成熟过程中过氧化物还原酶6(peroxiredoxin 6,Prdx6)的非钙依赖型磷脂酶A2活性(calciumindependentphospholipase A2,iPLA2)对牛肉嫩化的影响及其内在作用机制,进一步探究Prdx6作为生物标志物在牛肉嫩化中的具体作用。测定宰后成熟过程中肌原纤维蛋白粒径以观察肌原纤维蛋白的降解情况,并通过串联质量标签标记定量蛋白质组学技术探究其内在差异蛋白质的变化。结果表明,使用Prdx6的iPLA2活性抑制剂MJ33孵育牛肉24 h可促进肌原纤维蛋白的降解。通过蛋白质组学分析在Con vs G0组(0 h未经孵育)、MJ33 vs G0组和MJ33 vs Con组中共鉴定出336个差异蛋白质,其中表达差异核心蛋白质为PRDX6、SOD1、GPX1和PARK7,差异蛋白质主要富集在糖酵解、细胞凋亡信号通路和细胞骨架蛋白质上,且主要位于细胞质中,但是抑制Prdx6的iPLA2活性的处理组与对照组相比,差异蛋白质主要集中在细胞质和细胞膜上。差异蛋白质之间存在互作机制,互作差异蛋白质主要富集在细胞抗氧化、核糖体调节蛋白质合成和磷脂功能上。表明抑制Prdx6的iPLA2活性可能通过介导膜功能、能量代谢和细胞凋亡对肌原纤维蛋白的降解产生影响,最终加速牛肉的嫩化。 展开更多
关键词 牛肉 嫩化 过氧化物还原酶6 非钙依赖型磷脂酶A2活性 肌原纤维蛋白 蛋白质
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青海血蜱唾液腺组织蛋白质组学分析
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作者 蒋硕 李增魁 +10 位作者 康明 胡晓宇 何永彩 陈炳华 张连生 陈强 徐璐瑶 马景花 张枭 邰喜妹 李英 《动物医学进展》 北大核心 2025年第2期140-144,共5页
探索青海血蜱雌、雄成蜱唾液腺中蛋白的调控和变化规律,用非标记定量蛋白组学分析,联合液相色谱-质谱(LC-MS/MS)技术,鉴定分析青海血蜱雌、雄成蜱唾液腺组织中的蛋白质,筛选出差异表达蛋白,对差异表达蛋白进行基因本体论(GO)、京都基因... 探索青海血蜱雌、雄成蜱唾液腺中蛋白的调控和变化规律,用非标记定量蛋白组学分析,联合液相色谱-质谱(LC-MS/MS)技术,鉴定分析青海血蜱雌、雄成蜱唾液腺组织中的蛋白质,筛选出差异表达蛋白,对差异表达蛋白进行基因本体论(GO)、京都基因和基因组百科全书(KEGG)和结构域(IPR)相关功能富集分析,亚细胞定位以及蛋白互作网络(PPI)分析。结果显示,在青海血蜱雌、雄成蜱唾液腺组织中有506个上调蛋白和447个下调蛋白。GO富集分析表明,差异表达蛋白主要富集在对刺激的反应,KEGG通路主要富集在嘌呤代谢,结构域主要涉及神经递质门控离子通道等结构域,差异表达蛋白主要定位于细胞核。PPI分析发现关联度最高的蛋白被注释为细胞色素P450(CYP450)。揭示了青海血蜱雌、雄成蜱唾液腺蛋白表达的差异,有助于更深入了解蜱的生理功能和调控机制,为抗蜱疫苗的研发提供新思路。 展开更多
关键词 青海血蜱 唾液腺 蛋白质 非标记定量蛋白分析
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基于组织渗出液的蛋白质组学分析揭示日粮和排酸时间对牛肉品质的影响
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作者 刘旺景 谢耀弟 +11 位作者 高会霞 何瑊瑊 孙晨旭 于爱缓 姚海博 徐磊 陶文亮 杨瑞鑫 胡晋升 王贺 段月岩 雷赵民 《食品科学》 北大核心 2025年第21期90-101,共12页
研究基于组织渗出液的蛋白质组学分析揭示日粮和排酸时间对牛肉品质的影响。选取12头(14±2)月龄健康、体质量((271.17±17.6)kg)相近的安格斯肉牛,随机分为CON组和AMRP组,其中CON组饲喂基础日粮,AMRP组在基础日粮中每头牛每天... 研究基于组织渗出液的蛋白质组学分析揭示日粮和排酸时间对牛肉品质的影响。选取12头(14±2)月龄健康、体质量((271.17±17.6)kg)相近的安格斯肉牛,随机分为CON组和AMRP组,其中CON组饲喂基础日粮,AMRP组在基础日粮中每头牛每天添加沙葱粉20 g,实验持续135 d,育肥结束后全部屠宰,取背最长肌样品进行肉品质指标分析,采集组织渗出液进行蛋白质组学分析。结果表明:日粮中添加20 g沙葱粉可以改善牛肉肉色、有利于脂肪的沉积。随着排酸时间的延长,脂肪和蛋白含量显著升高。渗出液中共筛选出34个差异蛋白质作为牛肉品质性状指标的潜在生物标志物,其中,肌球蛋白1(Q9BE40)、肌球蛋白结合蛋白C1(A6QP89)与b^(*)呈高度显著正相关;异柠檬酸脱氢酶(Q04467)与水分含量呈高度显著正相关;异柠檬酸脱氢酶(Q04467)与滴水损失、脂肪、粗蛋白、丙二醛呈高度显著负相关;热休克蛋白90(Q76LV1)与丙二醛呈极显著负相关。综上所述,沙葱中的活性成分能够调控差异蛋白的表达并进一步通过糖酵解/糖异生、肌肉细胞中的细胞骨架通路影响排酸期牛肉品质变化。 展开更多
关键词 织渗出液 蛋白质 排酸 牛肉品质 植物活性成分
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雷公藤多苷片对雌性大鼠生殖毒性的蛋白质组学研究
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作者 任晓丹 代彦林 +4 位作者 丁樱 韩姗姗 孙昭恒 孙利辉 徐闪闪 《世界中医药》 北大核心 2025年第15期2611-2618,共8页
目的:应用蛋白质组学探索雷公藤多苷片(TG)对雌性大鼠的生殖毒性和分子机制。方法:16只无特定病原体(SPF)级8周龄雌性斯泼累格·多雷(SD)大鼠按照随机数字表法分为雷公藤多苷组和空白组各8只,分别灌胃50 mg/(kg·d)的TG与生理盐... 目的:应用蛋白质组学探索雷公藤多苷片(TG)对雌性大鼠的生殖毒性和分子机制。方法:16只无特定病原体(SPF)级8周龄雌性斯泼累格·多雷(SD)大鼠按照随机数字表法分为雷公藤多苷组和空白组各8只,分别灌胃50 mg/(kg·d)的TG与生理盐水,灌胃期间检测动情周期。连续灌胃14 d后统计大鼠体质量、脏器指数,酶联免疫吸附试验测定血清性激素水平,苏木精-伊红(HE)染色观察卵巢、子宫病理变化。对2组大鼠卵巢组织进行Label Free定量蛋白质组学分析,并采用蛋白质印迹法验证2组差异表达蛋白(Deps)富集通路上的蛋白表达情况。结果:TG可以显著延长雌性大鼠动情周期(P<0.0001),升高血清中黄体生成素(LH)(P<0.0001)、卵泡刺激素(FSH)(P<0.0001)水平以及降低雌二醇(E_(2))(P<0.01)、孕酮(P)(P<0.0001)、睾酮(T)(P<0.01)水平,造成卵巢萎缩,闭锁卵泡率显著升高(P<0.0001)。蛋白质组学共筛选出203个Deps,涉及代谢途径、胰岛素信号通路、P53信号通路等,蛋白质印迹法验证结果表明,TG可使P53信号通路上的肿瘤蛋白P53(P53)、细胞色素C、线粒体凋亡相关基因Bcl2相关X蛋白(Bax)、胱天蛋白酶-3(Caspase-3)、细胞凋亡诱导因子线粒体相关2(Aifm2)表达上调以及B淋巴细胞瘤-2基因(Bcl-2)的表达下调。结论:TG能够诱导雌性大鼠生殖毒性,其作用机制可能与调节P53信号通路有关。 展开更多
关键词 雷公藤多苷片 生殖毒性 雌性 蛋白质 生信分析 差异表达蛋白 P53信号通路 分子机制
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基于转录组和蛋白质组等多组学的遗传推断探究肺癌潜在治疗靶点
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作者 杨健乐 李廷洋 +3 位作者 勾文峰 张冰啸 李祎亮 侯文彬 《中国药理学通报》 北大核心 2025年第6期1064-1071,共8页
目的通过多组学等方法来推断与肺癌治疗相关的新型治疗靶点和药理靶点,为开发更加个性化和有效的治疗策略提供新的方向。方法采用全基因组关联研究(GWAS)数据分析、泛癌、单细胞、转录组学和蛋白质相互作用等进行分析。我们分析了与肺... 目的通过多组学等方法来推断与肺癌治疗相关的新型治疗靶点和药理靶点,为开发更加个性化和有效的治疗策略提供新的方向。方法采用全基因组关联研究(GWAS)数据分析、泛癌、单细胞、转录组学和蛋白质相互作用等进行分析。我们分析了与肺癌相关的生物标志物和治疗靶点。本研究识别了与肺癌进展密切相关的关键生物标志物,并探讨了这些生物标志物与病毒感染之间的相互关系。结果根据KEGG通路注释,代谢过程相关基因的数量显著增加。研究结果表明,免疫细胞、肠道菌群及代谢中间产物在肺癌的发展中发挥着至关重要的作用。具体而言,代谢产物中丙氨酸、异亮氨酸成为治疗的核心因素。IgD^(+)CD24^(+)和IgD^(+)CD24^(-)B细胞亚群已成为免疫逃逸与治疗反应的核心因素。同时,拟杆菌属和罗氏菌属通过调节短链脂肪酸的水平,改变宿主的免疫反应和肿瘤微环境,为癌症治疗开辟了新的研究路径。结论通过多组学分析方法结合转录组学和蛋白质组学分析技术,识别出了几个肺癌潜在治疗靶点,为开发新型治疗策略提供了关键见解。 展开更多
关键词 肺癌 孟德尔随机化(MR) 治疗靶点 蛋白质 泛癌分析
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OSAHS儿童与非OSAHS儿童唾液差异蛋白质组学研究
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作者 祖丽胡马尔·努尔艾合买提 麦克丽亚·帕力哈提 古力巴哈·买买提力 《口腔医学研究》 北大核心 2025年第4期306-313,共8页
目的:通过蛋白质组学检测技术分析阻塞性睡眠呼吸暂停低通气综合征(obstructive sleep apnea hypopnea syndrome,OSAHS)儿童和非OSAHS儿童唾液差异蛋白的相关信息,为深入研究OSAHS发病机制,探寻OSAHS生物标志物及关键治疗靶点提供研究... 目的:通过蛋白质组学检测技术分析阻塞性睡眠呼吸暂停低通气综合征(obstructive sleep apnea hypopnea syndrome,OSAHS)儿童和非OSAHS儿童唾液差异蛋白的相关信息,为深入研究OSAHS发病机制,探寻OSAHS生物标志物及关键治疗靶点提供研究基础。方法:收集6例OSAHS儿童[男5例、女1例,平均年龄(12.00±2.71)岁]及6例非OSAHS健康儿童[男3例、女3例,平均年龄(10.22±2.05)岁]唾液样本,进行总蛋白质提取,采用数据非依赖采集(data-independent acquisition,DIA)质谱分析和对差异蛋白行蛋白质鉴定,最后对被筛选的差异蛋白进行生物信息学分析。结果:非OSAHS组中有5636个蛋白、OSAHS组中有5608个蛋白被鉴定,其中5582个蛋白在所有组中都存在。筛选出两组之间的显著差异蛋白,303个蛋白上调表达和185个蛋白下调表达,其中筛选了KRT80、CXCL10、KRT19、SAA2等差异显著的蛋白。结论:OSAHS儿童和非OSAHS儿童唾液蛋白表达存在差异,相关分子标志物可能与OSAHS发生、发展、发病机制密切相关。 展开更多
关键词 阻塞性睡眠呼吸暂停低通气综合征 唾液蛋白 蛋白质 生物信息学分析 DIA技术 差异蛋白 整夜多导睡眠监测 张口呼吸
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基于蛋白质组学和代谢组学分析初步探讨苯并(k)荧蒽致小鼠生殖损伤的作用机制 被引量:4
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作者 李雅文 王丹丹 +3 位作者 王芙蓉 周妮娅 王大朋 曹佳 《陆军军医大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第13期1523-1534,共12页
目的通过蛋白质组学和代谢组学探究苯并(k)荧蒽[Benzo(k)fluoranthene,BkF]对雄性小鼠生殖损伤潜在的作用机制。方法选取20只健康清洁级6周龄雄性昆明小鼠[体质量(18±2)g],按完全随机分组分为对照组、低剂量BkF组(7.5 mg/kg)、中剂... 目的通过蛋白质组学和代谢组学探究苯并(k)荧蒽[Benzo(k)fluoranthene,BkF]对雄性小鼠生殖损伤潜在的作用机制。方法选取20只健康清洁级6周龄雄性昆明小鼠[体质量(18±2)g],按完全随机分组分为对照组、低剂量BkF组(7.5 mg/kg)、中剂量BkF组(15 mg/kg)、高剂量BkF组(30 mg/kg),每组5只。对照组灌胃给予玉米油,低、中、高剂量BkF组分别给予7.5、15.0、30.0 mg/(kg/d)剂量的BkF,按照10 mL/kg的体积,经口连续灌胃35 d生精周期。每周5 d进行灌胃,连续5周。建模完成后,轻断食10 h进行取材。采用计算机辅助精子分析(computer-assisted sperm analysis,CASA)软件检测分析精液参数;HE染色分析睾丸组织病理结构;采用生物信息学技术分析差异蛋白通路;采用火山图分析高剂量BkF组和对照组差异表达前10的蛋白质;液相色谱-串联质谱法(LC-MS/MS)非靶向代谢组学技术,筛选出差异代谢物;通过KEGG及KEGG信号通路注释分析和GO富集分析差异代谢物。结果与对照组比较,BkF处理的小鼠精子数量和活力有下降趋势,差异具有统计学意义(P<0.05)。病理切片结果显示,与对照组比较,BkF处理的小鼠生精小管管腔扩张,生精细胞排列紊乱。蛋白质组学检测睾丸组织蛋白水平,发现Spata46、Rab5b等蛋白水平降低,Zscan21、Aifm2等蛋白水平升高(P<0.01)。蛋白质组学京都基因和基因组百科全书(Kyoto Encyclopeclia of Genes and Genomes,KEGG)富集分析显示,其主要涉及吞噬体、蛋白质输出、核糖体等通路。基因本体(Gene Ontology,GO)富集分析显示其主要涉及雄性减数分裂Ⅰ、组蛋白乙酰化、p53信号通路的调控、细胞周期的正向调节、细胞死亡的正向调节等信号通路。代谢组学KEGG显示发现氨基糖和核苷酸糖代谢与其他代谢途径联系最为密切。结论蛋白质组学和代谢组学分析结果表明BkF暴露与精子生成、细胞凋亡和周期、DNA损伤、氨基糖和核苷酸糖代谢等相关。 展开更多
关键词 苯并(k)荧蒽 雄性生殖损伤 精子生成 蛋白质分析 代谢分析
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剥脱综合征患者房水蛋白质组学分析 被引量:1
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作者 徐钊 王礼明 +6 位作者 冯强 张丹丹 阿依古再丽 郭如如 东莉洁 魏瑞华 刘爱华 《中华实验眼科杂志》 CAS CSCD 北大核心 2024年第6期512-519,共8页
目的分析剥脱综合征(XFS)患者房水蛋白质的表达差异。方法收集2020年6月至2021年1月在和田地区人民医院拟行手术治疗的维吾尔族年龄相关性白内障患者和XFS伴白内障患者各10例,分别作为白内障组和XFS组。术中借助超声乳化手术通道吸取前... 目的分析剥脱综合征(XFS)患者房水蛋白质的表达差异。方法收集2020年6月至2021年1月在和田地区人民医院拟行手术治疗的维吾尔族年龄相关性白内障患者和XFS伴白内障患者各10例,分别作为白内障组和XFS组。术中借助超声乳化手术通道吸取前房中部50~100μl房水。通过非标记定量蛋白质组学质谱分析技术对房水中提取的蛋白进行分析,以白内障组作为对照组,并根据P<0.05、差异倍数>1.5的标准筛选得到XFS组的差异表达蛋白。通过基因本体论(GO)功能分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)信号通路分析来探讨XFS组差异表达蛋白的功能及调控信号通路。结果与白内障组相比,XFS组共鉴定出25个差异表达蛋白,这些蛋白主要涉及细胞黏附、受体、水解酶、分子运输等。表达下调的蛋白有14个,包括补体H因子相关蛋白1(CFHR1)、内质网分子伴侣BiP(HSPA5)、双糖链蛋白多糖(BGN)、FRAS1相关的细胞外基质蛋白2(FREM2)、血红蛋白亚基δ(HBD)、血红蛋白亚单位γ1(HBG1)、棕榈酰蛋白水解酶2(PPT2)等。表达上调的蛋白有11个,包括转化生长因子结合蛋白2(LTBP2)、极低密度脂蛋白受体、层粘连蛋白亚基α2(LAMA2)、凝血因子Ⅸ(F9)等。其中,FREM2为XFS组差异表达最显著的蛋白,其在XFS组个体样本中表达水平基本一致。GO分析显示,这些差异蛋白主要定位于胶原蛋白的细胞外基质、结合珠蛋白-血红蛋白复合物、血浆脂蛋白颗粒和溶酶体腔;分子功能和生物学过程显示,HBD和HBG1参与细胞解毒过程,PPT2参与水解酶活性,BGN和LTBP2参与糖胺聚糖结合。KEGG信号通路分析显示,CFHR1和F9参与补体和凝血级联通路;FREM2和LAMA2参与细胞外基质相互作用通路。结论XFS的进展可能与细胞外基质蛋白的改变、血-房水屏障破坏以及潜在的炎症反应有关。显著下调的FREM2可能作为XFS潜在的生物学标志物。 展开更多
关键词 剥脱综合征 房水 蛋白质 FRAS1相关的细胞外基质蛋白2 生物学信息分析
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微生物宏蛋白质组从样品处理、数据采集到数据分析
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作者 吴恩慧 乔亮 《色谱》 CAS CSCD 北大核心 2024年第7期658-668,共11页
微生物与人体疾病、健康密切相关,如何理解微生物群落的组成及其发挥的功能是一大亟需研究的问题。近年来,宏蛋白质组学已经成为研究微生物组成与功能的重要技术手段。然而,由于微生物群落样本的复杂性与高度异质性,样品处理、质谱数据... 微生物与人体疾病、健康密切相关,如何理解微生物群落的组成及其发挥的功能是一大亟需研究的问题。近年来,宏蛋白质组学已经成为研究微生物组成与功能的重要技术手段。然而,由于微生物群落样本的复杂性与高度异质性,样品处理、质谱数据采集与数据分析成为宏蛋白质组目前面临的三大挑战。在宏蛋白质组分析中往往需要针对不同类型的样品进行前处理优化,采取不同的微生物分离富集、提取和裂解方案。与单一物种蛋白质组相类似,宏蛋白质组学中的质谱数据采集模式有数据依赖性采集(data-dependent acquisition,DDA)模式和数据非依赖性采集(data-independent acquisition,DIA)模式。DIA数据采集模式可以完整地采集样品的肽段信息,具有很强的发展潜力。但是由于宏蛋白质组样品的复杂性,其DIA数据解析已成为阻碍宏蛋白质组深度覆盖的一大难题。在数据解析方面,最重要的步骤在于蛋白质序列数据库的构建。数据库的大小和完整性不仅对鉴定数量有很大影响,还会影响物种和功能水平上的分析。目前宏蛋白质组数据库构建的金标准是基于宏基因组的蛋白质序列数据库。同时,基于迭代搜库的公共数据库过滤方法也已被证明具有很强的实用价值。从具体的数据解析策略角度,以肽段为中心的DIA数据解析方法占据了绝对的主流。随着深度学习和人工智能的发展,其会极大地推动宏蛋白质组数据解析的准确度、覆盖度与分析速度。在下游生物信息学分析方面,近年来开发了一系列注释工具,可以在蛋白水平、肽段水平、基因水平上进行物种注释来获得微生物群落组成。与其他组学方法相比,微生物群落的功能分析是宏蛋白质组学的一个独特特征。宏蛋白质组已经成为微生物群落多组学分析中的重要组成部分,并且仍在覆盖深度、检测灵敏度、数据解析完整度等方面具有很大的发展潜力。 展开更多
关键词 蛋白质 样品前处理 数据库 数据分析策略
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一种热蛋白质组学分析数据的归一化方法
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作者 甄雪妍 周宝津 +1 位作者 刘静雯 任艳 《高等学校化学学报》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 2024年第12期40-46,共7页
建立了一种小分子靶标蛋白的鉴定方法,即引入索引保留时间(Indexed retention time,iRT)肽段作为非标记热蛋白质组学(Thermal proteome profiling,TPP)分析定量归一化内标,实现对小分子靶标的准确挖掘.将iRT肽段加入到表征良好的模型药... 建立了一种小分子靶标蛋白的鉴定方法,即引入索引保留时间(Indexed retention time,iRT)肽段作为非标记热蛋白质组学(Thermal proteome profiling,TPP)分析定量归一化内标,实现对小分子靶标的准确挖掘.将iRT肽段加入到表征良好的模型药物甲氨蝶呤(Methotrexate,MTX)处理的293T细胞提取液中,在不同温度加热处理时它们稳定存在,因此可作为定量归一化的标准.实验结果表明,以iRT作为定量校正,不仅对总蛋白含量有良好的校正效果,同时对MTX的靶标蛋白二氢叶酸还原酶(Dihydrofolate reductase,DHFR)热熔解拟合曲线也有一定改善.该方法简单方便、经济高效,具有较强实用性和推广性,为非标记TPP技术的实施及定量准确性提供了重要的实验依据. 展开更多
关键词 非标记定量蛋白质 蛋白质分析 索引保留时间 数据归一化
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大豆分离蛋白的序列组成特性分析与多肽挖掘
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作者 查澳 蒋立文 +6 位作者 刘小辰 刘洋 刘鑫梦 李辰 蔡树龙 范丽琪 徐巨才 《中国酿造》 北大核心 2025年第8期114-119,共6页
该研究通过蛋白质组学与十二烷基硫酸钠-聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS-PAGE)分析明确大豆分离蛋白(SPI)的序列组成,基于多肽组学分析SPI中的高丰度多肽序列,并结合多肽数据库和预测模型挖掘SPI中的生物活性肽和鲜味肽。结果表明,SPI主要由8... 该研究通过蛋白质组学与十二烷基硫酸钠-聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS-PAGE)分析明确大豆分离蛋白(SPI)的序列组成,基于多肽组学分析SPI中的高丰度多肽序列,并结合多肽数据库和预测模型挖掘SPI中的生物活性肽和鲜味肽。结果表明,SPI主要由8条蛋白序列组成,其中P11827、P0DO16和P25974序列分别对应β-伴大豆球蛋白(β-conglycinin)中的α、α'以及β亚基,累计占比42.49%,而序列P04776、P04005、P11828、P04347和P02858则来源于大豆球蛋白(glycinin)中的5个亚基(G1~G5),累计占比57.51%。经统计发现,SPI序列中谷氨酸-谷氨酸(EE)、谷氨酰胺-谷氨酰(QQ)和天冬氨酸-谷氨酸(DE)等二肽相对含量较高,分别为3.74%、3.07%、2.84%。对应序列中以E或Q开头和结尾的二肽重复特征突出,理论最大含量均>16%,且具备较高的潜在鲜味特性或降血糖活性,充分展示了SPI在功能型鲜味剂中广泛应用前景。 展开更多
关键词 大豆分离蛋白 蛋白质 多肽 活性 鲜味肽
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温敏核不育水稻花药蛋白质组初步分析 被引量:49
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作者 谢锦云 李小兰 +3 位作者 陈平 曹梦林 陈良碧 梁宋平 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2003年第2期215-221,共7页
采用固相pH梯度 SDS聚丙烯酰胺双向凝胶电泳对温敏核不育水稻 96 4 2S可育与不育条件下减数分裂期花药总蛋白进行了分离 ,通过银染显色 ,获得了分辨率和重复性较好的双向电泳图谱 .PDQuest 2DE图像分析软件可识别约 10 0 0个蛋白质点 ... 采用固相pH梯度 SDS聚丙烯酰胺双向凝胶电泳对温敏核不育水稻 96 4 2S可育与不育条件下减数分裂期花药总蛋白进行了分离 ,通过银染显色 ,获得了分辨率和重复性较好的双向电泳图谱 .PDQuest 2DE图像分析软件可识别约 10 0 0个蛋白质点 .蛋白质点在 2D胶上的重复性为 :沿等电聚焦方向偏差为 1 4 5± 0 2 3mm(n =8) ,沿SDS PAGE方向偏差为 :1 15± 0 17mm(n =8) .对两种育性不同样品的 2D胶上部分共有的蛋白质点 ,采用基质辅助激光解析电离飞行时间质谱 (matrixassistedlaserdesorption ionizationtimeofflightmassspctrometry ,MALDI TOF MS)进行了肽质谱指纹图分析 .通过采用PeptIdent软件对SWISS PROT数据库的查询 ,有 5 0个蛋白质点在数据库得到归属鉴定 .对育性不同的2种样品 2D较上明显差异的蛋白质点进行了分析鉴定 .在不育变化为可育的过程中 ,明显表达上调的蛋白质点包括几丁质酶 ,酸性磷酸酶 ,胞浆激酶 ,谷蛋白前体 ,以及ESTSC72 61蛋白 ,明显下调的蛋白质包括β expansin前体 ,谷氨酸氨甲酰转移酶和 展开更多
关键词 水稻 温敏核不育 花药 蛋白质 蛋白质 育性 MALDI-TOF质谱分析
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外源诱导提高茶树EGCG含量过程的蛋白质组差异分析(英文) 被引量:9
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作者 林金科 郑金贵 +2 位作者 袁明 张学琴 王凤 《茶叶科学》 CAS CSCD 北大核心 2005年第2期109-115,共7页
通过无公害化学诱导子的诱导可使茶树芽叶的EGCG含量提高20.15%~25.00%。为了探明诱导的分子机制,用固相pH梯度双向凝胶电泳分离诱导芽叶与正常芽叶的总蛋白质,结果获得了分辨率和重复性较好的双向电泳图谱,差异表达分析发现,诱导出现... 通过无公害化学诱导子的诱导可使茶树芽叶的EGCG含量提高20.15%~25.00%。为了探明诱导的分子机制,用固相pH梯度双向凝胶电泳分离诱导芽叶与正常芽叶的总蛋白质,结果获得了分辨率和重复性较好的双向电泳图谱,差异表达分析发现,诱导出现的特异蛋白有14种,诱导消失的特异蛋白有8种,诱导表达上调相差10倍的特异蛋白有11种,诱导表达下调相差10倍的特异蛋白有6种。选取两个差异蛋白质点进行基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF-MS)测定其酶解后的肽质指纹图谱,通过http:/www.matrixscience.com网站,利用Mascot软件检索NCBInr数据库。查询结果:一种为光合系统Ⅰ的铁硫蛋白,另一种为未知蛋白。这些结果表明,茶树诱导芽叶与正常芽叶的蛋白质组存在差异,这些特异蛋白可能在诱导过程中起着重要的作用。 展开更多
关键词 诱导 茶树 EGCG 蛋白质 差异分析
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应激心肌细胞蛋白质组双向凝胶电泳分析 被引量:12
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作者 段海峰 钱令嘉 +3 位作者 应万涛 钱小红 杨何义 陆颖 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2002年第2期234-239,共6页
采用双向凝胶电泳技术和计算机辅助的图像分析方法 ,对去甲肾上腺素诱导的应激心肌细胞与正常心肌细胞蛋白质进行分离和比较分析 .正常心肌细胞可分离 12 32± 5 6个蛋白点 ,蛋白点匹配率为 83 3%± 1 0 %.有 11种蛋白质在NE... 采用双向凝胶电泳技术和计算机辅助的图像分析方法 ,对去甲肾上腺素诱导的应激心肌细胞与正常心肌细胞蛋白质进行分离和比较分析 .正常心肌细胞可分离 12 32± 5 6个蛋白点 ,蛋白点匹配率为 83 3%± 1 0 %.有 11种蛋白质在NE应激后发生了明显和稳定的质和量的改变 (P <0 0 5 ) ,其中 6种 (Mr pI :4 9 7kD 7 8,38 3kD 5 9,37 1kD 6 6 ,2 9 3kD 7 4 ,18 7kD 6 1,18 5kD 7 7)在应激后表达降低 ,4种 (Mr pI:4 7 6kD 5 5 ,31 9kD 4 4 ,2 6 6kD 4 6 ,33 2kD 8 1)在应激后表达增高 ,1种 (Mr pI:19 4kD 6 9)只在应激后发生表达 .这些差异表达的蛋白质可能参与了心血管应激反应乃至应激损伤发生的过程 . 展开更多
关键词 应激 心肌细胞 蛋白质 双向凝胶电泳分析
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转录组与蛋白质组关联分析鉴定桑树硬枝扦插皮部生根相关功能基因 被引量:3
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作者 杜小龙 曹旭 +4 位作者 刘利 殷朝瑞 班月圆 李建龙 程嘉翎 《蚕业科学》 CAS CSCD 北大核心 2017年第3期374-381,共8页
前期以桑品种育711号硬枝扦插皮部生根的插穗为材料,对扦插生根过程起始阶段(S0)、根原基形成阶段(S1)和不定根伸长阶段(S2)的插穗基部皮层进行了转录组与蛋白质组测序。在此基础上对差异表达基因与蛋白质(差异系数>1.5,错误发现率≤... 前期以桑品种育711号硬枝扦插皮部生根的插穗为材料,对扦插生根过程起始阶段(S0)、根原基形成阶段(S1)和不定根伸长阶段(S2)的插穗基部皮层进行了转录组与蛋白质组测序。在此基础上对差异表达基因与蛋白质(差异系数>1.5,错误发现率≤0.05)做关联分析。结果显示:不同阶段插穗基部皮层的基因和蛋白质表达趋势总体上呈正相关,关联系数分别为0.470 3(S0-vs-S1)与0.113 0(S1-vs-S2);基因与蛋白质表达趋势相反的关联数量较少,关联系数分别为-0.319 9(S0-vs-S1)与-0.107 1(S1-vs-S2);基因与蛋白质表达趋势相同的关联数量相对较多,关联系数分别为0.855 4(S0-vs-S1)与0.834 6(S1-vs-S2),均呈强相关。在关联分析表达趋势相同组中筛选鉴定出21个差异表达基因,并进行功能注释与信号通路分析。其中,有5个基因在生根过程中持续上调表达,主要包括酚氧化酶(PPO)、马铃薯糖蛋白(Patatin)、生长素酰胺水解酶(ILL)、肌氨酸氧化酶(SOX)的编码基因;有13个基因在根原基形成期上调表达,在不定根伸长期下调表达,主要包括赤霉素双加氧酶(GA3OX4)、12-氧植物二烯酸还原酶(OPR)、内切葡聚糖酶(EG)和吲哚乙酸氨基化合成酶(GH3)的编码基因;有3个基因在根原基形成期下调表达,在不定根伸长期上调表达,分别为细胞膜相关钙结合蛋白(PCa P)、肌肉LIM蛋白(MLP)和膜联蛋白(ANX)的编码基因。上述关联分析的结果为深入认识桑树插穗皮部生根过程的生理机制提供了相关功能基因信息。 展开更多
关键词 桑树 插穗皮层 转录分析 蛋白质分析 关联分析 功能基因
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糖尿病性白内障和年龄相关性白内障晶状体蛋白质组学的差异分析 被引量:9
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作者 禹倩倩 姚勇 +3 位作者 储兆东 陶永辉 邵珺 黄玉政 《中华实验眼科杂志》 CAS CSCD 北大核心 2012年第6期548-552,共5页
背景目前糖尿病已成为影响人类健康的主要疾病之一,糖尿病性白内障为糖尿病患者的常见并发症之一,进行糖尿病性白内障晶状体中的蛋白质组学研究对该病的防治具有重要意义。目的研究糖尿病性白内障和年龄相关性白内障患者晶状体蛋白质... 背景目前糖尿病已成为影响人类健康的主要疾病之一,糖尿病性白内障为糖尿病患者的常见并发症之一,进行糖尿病性白内障晶状体中的蛋白质组学研究对该病的防治具有重要意义。目的研究糖尿病性白内障和年龄相关性白内障患者晶状体蛋白质组学的差异,探讨糖尿病性白内障的发病机制。方法手术采集诊断明确的糖尿病性白内障患者8例8眼及年龄相关性白内障患者12例12眼的晶状体,裂解离心提取蛋白,采用固相pH梯度(IPG)等电聚焦双向凝胶电泳法对糖尿病性白内障和年龄相关性白内障患者的晶状体蛋白质进行分离,分析电泳图像的差异,使用基质辅助激光解析离子飞行时间质谱仪(MALDI—TOF—MS)测定蛋白质斑点的肽质量指纹谱,结合蛋白质数据库检索,确定蛋白质种类。结果IPG双向凝胶电泳显示,糖尿病性白内障和年龄相关性白内障的晶状体蛋白质相似处在于大部分都分布在等电点(PI)pH值5~9、相对分子质量14000~97000的区域内;而高丰度晶状体蛋白质的相对分子质量为20000~31000。分析软件检测出3个差异的蛋白质点,经质谱鉴定得到其中2个高丰度晶状体蛋白质的种类为αB晶状体蛋白和βB1晶状体蛋白。结论双向电泳联合质谱鉴定可有效分离晶状体蛋白质,糖尿病性白内障与年龄相关性白内障晶状体蛋白质组学之间的差异表明,αB晶状体蛋白和βB1晶状体蛋白加速了糖尿病性白内障的发展。 展开更多
关键词 晶状体 蛋白质 糖尿病性白内障 双向电泳 质谱分析
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人肺巨细胞癌蛋白质组的二维电泳和计算机图象分析 被引量:8
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作者 万晶宏 罗凌 +4 位作者 钱小红 郭尧君 邱宗荫 陆应麟 贺福初 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 2000年第6期820-826,共7页
为优化用于蛋白质组研究的二维电泳技术和计算机图象分析技术 ,以及初步分析比较与肿瘤细胞转移相关的蛋白质 ,以人肺巨细胞癌 (PLA- 80 1 - D、C)高、低转移株作为研究对象 ,应用 IPG-phor进行第一向等电聚焦 ,随后 ,在 Protein IPG c... 为优化用于蛋白质组研究的二维电泳技术和计算机图象分析技术 ,以及初步分析比较与肿瘤细胞转移相关的蛋白质 ,以人肺巨细胞癌 (PLA- 80 1 - D、C)高、低转移株作为研究对象 ,应用 IPG-phor进行第一向等电聚焦 ,随后 ,在 Protein IPG conversion Kit上进行垂直 SDS- PAGE的分离 .利用光密度仪对银染的凝胶扫描 ,通过 PDQuest软件进行蛋白斑点检测和配比 .结果表明 :(1 )应用 IPGphor,采用样品直接加入重泡胀溶液的形式 ,增大了溶解性 ,缩短聚焦时间、增大样品负荷量 (分析型 ) ,提高了分辨率 .(2 )比较宽 (p H=3~ 1 0 L)、窄 (p H=4~ 7L)范围 IPG胶条 ,窄 p H范围的 IPG胶条具有较高的分辨率 .(3)比较 PLA- 80 1 - C、D细胞蛋白图谱之间的差异 ,其相关系数为 0 .7339± 0 .0 2 91 ;仅在 PLA- 80 1 - C株出现的蛋白为 1 79个 . 展开更多
关键词 蛋白质 二维电泳 图象分析 人肺巨细胞癌
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玉米杂交种先玉335及其亲本种子萌发过程中胚芽蛋白质组学分析 被引量:4
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作者 进茜宁 付志远 +3 位作者 丁冬 刘宗华 李卫华 汤继华 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第9期1689-1694,共6页
以培养84h种子的胚芽(包括胚芽鞘)为试验材料,对优良玉米杂交种先玉335与其亲本自交系的蛋白质组学差异进行了分析。结果表明,在杂交种先玉335中共检测到560个蛋白点,在亲本PH6WC和PH4CV分别检测到507个和508个蛋白点,而且先玉335胚芽... 以培养84h种子的胚芽(包括胚芽鞘)为试验材料,对优良玉米杂交种先玉335与其亲本自交系的蛋白质组学差异进行了分析。结果表明,在杂交种先玉335中共检测到560个蛋白点,在亲本PH6WC和PH4CV分别检测到507个和508个蛋白点,而且先玉335胚芽及胚芽鞘中81%的蛋白点表现非加性累积模式,其中288个蛋白点表现为超高亲的上调表达,仅15个蛋白点表现超低亲的下调表达,因此推测非加性蛋白的累积可能是杂交种先玉335胚芽萌发过程中胚芽及胚芽鞘杂种优势产生的主要原因。用于质谱分析的13个差异极显著蛋白主要涉及代谢途径、蛋白折叠、胁迫响应、细胞骨架和细胞解毒5种类型。 展开更多
关键词 玉米 胚芽(胚芽鞘) 杂种优势 蛋白质分析
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人支气管上皮癌变各阶段组织蛋白质双向电泳图谱的差异分析 被引量:10
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作者 吴晓英 肖志强 +6 位作者 陈主初 李萃 李建玲 冯雪萍 易红 梁宋平 陈平 《中国癌症杂志》 CAS CSCD 2004年第3期201-206,211,共7页
目的 :探讨肺鳞癌癌前病变恶性转化的机制。方法 :应用脱氧胆酸 三氯醋酸 (deoxycholate trichloroaeticacid ,DOC TCA)法提纯支气管上皮癌变各阶段组织总蛋白质 ,采用固相pH梯度 (immobilizedpHgradient,IPG)双向凝胶电泳 (two dimens... 目的 :探讨肺鳞癌癌前病变恶性转化的机制。方法 :应用脱氧胆酸 三氯醋酸 (deoxycholate trichloroaeticacid ,DOC TCA)法提纯支气管上皮癌变各阶段组织总蛋白质 ,采用固相pH梯度 (immobilizedpHgradient,IPG)双向凝胶电泳 (two dimensionalelectrophoresis ,2 DE)分离总蛋白质 ,凝胶经银染显色后 ,ImageMaster 2D图像分析软件进行比较分析、识别差异表达的蛋白质 ,应用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱 (matrix assistedlaserdesorption/ionizationtime of flightmassspectrometry ,MALDI TOF MS)得到相应的肽质指纹图谱 (peptidemassfingerprint,PMF) ,然后搜索数据库鉴定部分差异蛋白质点。结果 :①重复性检测表明同一例鳞状上皮化生组织的三块凝胶的平均点数为 12 16± 75,平均匹配点数为 10 82± 6 7,匹配率达 89.3% ,且 3块胶在蛋白质点位置上有较好的重复性 ,不同胶间蛋白质点在IEF方向的偏差是 (0 .86 5± 0 .2 4 7)mm ,在SDS PAGE方向上的偏差为 (0 .971± 0 .10 4 )mm ,由此获得了分辨率较高、重复性较好的人支气管上皮癌变各阶段组织的双向凝胶电泳图谱 ,正常上皮、鳞状化生、不典型增生和上皮浸润癌组织凝胶的平均蛋白质点数依次为 1190± 36、12 2 7± 39、12 72± 4 1、132 6± 5 2 ;? 展开更多
关键词 人支气管上皮 癌前病变 肺鳞癌 双向凝胶电泳 质谱分析 质量 蛋白质
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适于小麦叶片蛋白质组分析的样品提取方法研究 被引量:17
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作者 李红兵 康振生 《西北植物学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第3期632-638,共7页
以铭贤169小麦苗期叶片为材料,分别采用传统的TCA/丙酮沉淀法、酚提取-甲醇/醋酸铵沉淀法以及改进的TCA/丙酮沉淀-酚/SDS联合抽提法提取叶片总蛋白,进行双向电泳分离和胶体考染,以建立适用于小麦蛋白质组分析的样品制备方法.结果表明:T... 以铭贤169小麦苗期叶片为材料,分别采用传统的TCA/丙酮沉淀法、酚提取-甲醇/醋酸铵沉淀法以及改进的TCA/丙酮沉淀-酚/SDS联合抽提法提取叶片总蛋白,进行双向电泳分离和胶体考染,以建立适用于小麦蛋白质组分析的样品制备方法.结果表明:TCA/丙酮沉淀法较酚提取-甲醇/醋酸铵沉淀法获得的蛋白杂质较少,在二维电泳图谱中的蛋白点较酚抽提-甲醇/醋酸铵沉淀法提取的蛋白点清晰且多.相比于以上2种提取蛋白样品方法,改进的TCA/丙酮沉淀-酚/SDS联合抽提法提取的小麦叶片蛋白杂质少、二维电泳图谱上的点明显增多、分辨率较高.所选小麦的代表性蛋白点能获得成功鉴定.该方法可推广应用于水稻叶片蛋白质组分析的样品提取. 展开更多
关键词 小麦叶片 双向电泳 质谱分析 蛋白质
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