[目的]松材线虫引发的松树萎蔫病是世界性毁灭性病害,已在我国造成严重的生态与经济损失。早期、精准的诊断是实现有效防控的关键。本研究旨在通过比较蛋白质组学分析,筛选红松在松材线虫侵染过程中表达的差异蛋白,为诊断方法开发提供...[目的]松材线虫引发的松树萎蔫病是世界性毁灭性病害,已在我国造成严重的生态与经济损失。早期、精准的诊断是实现有效防控的关键。本研究旨在通过比较蛋白质组学分析,筛选红松在松材线虫侵染过程中表达的差异蛋白,为诊断方法开发提供潜在靶标。[方法]以红松针叶为材料,设置接种松材线虫后0、1、5和20 d 4个时间点,开展定量蛋白质组学分析,结合生物信息学方法筛选上调表达的特异蛋白,并通过qRT-PCR验证其转录表达水平。[结果]共筛选出11种在侵染后持续显著上调的差异表达蛋白,进一步结合对照组无丰度、表达差异显著及功能结构域预测等标准,确定2种蛋白(DN8104_c0_g1_i1、DN14451_c0_g1_i1)具有作为早期诊断靶标的潜力。qRT-PCR验证结果与蛋白组学趋势一致。[结论]本研究鉴定的2种候选蛋白在红松受侵染后上调表达,且在未接种松材线虫的阴性对照中丰度为0,具备结构功能特征,具有作为松材线虫病早期诊断靶标的应用前景。研究为红松及其它松树树种的病害检测提供了理论基础与技术储备。展开更多
试验旨在探讨成年宁都黄鸡睾丸的蛋白质表达谱,筛选大小睾丸个体差异表达蛋白和功能通路,为繁殖性能选育提供基础数据。以6只22周龄宁都黄鸡的睾丸组织为研究对象,分为大睾丸组(H-TES)和小睾丸组(L-TES),采用串联质量标签(tandem mass t...试验旨在探讨成年宁都黄鸡睾丸的蛋白质表达谱,筛选大小睾丸个体差异表达蛋白和功能通路,为繁殖性能选育提供基础数据。以6只22周龄宁都黄鸡的睾丸组织为研究对象,分为大睾丸组(H-TES)和小睾丸组(L-TES),采用串联质量标签(tandem mass tags, TMT)技术对2组个体睾丸蛋白质进行差异表达、功能富集和基因互作分析,初步筛选候选蛋白质,分析这些蛋白质在6个个体的表达量与6个睾丸性状指标(左侧睾丸重、右侧睾丸重、总睾丸重、左侧睾丸指数、右侧睾丸指数、总睾丸指数)之间的相关性,分析候选蛋白质的功能。结果表明,宁都黄鸡睾丸中共鉴定到4 683个蛋白质,筛选到144个差异表达蛋白质。GO分析结果表明,差异蛋白质主要参与精子结构组成,具有尿蛋白-谷氨酸连接酶活性、胸腺嘧啶结合、脱氢抗坏血酸跨膜转运体活性等功能。差异蛋白质显著富集的KEGG通路为精氨酸和脯氨酸代谢、泛酸和辅酶A的生物合成、β-丙氨酸代谢等。蛋白质互作网络中有34个差异蛋白质,初步筛选出30个候选蛋白质。结合相关性分析和文献查阅,筛选出16个关键候选蛋白质,即SPAG6、TPPP2、ENKUR、ODF2、SAXO1、TCP11、DNALI1、CCDC63、TSSK3、TEKT2、TEKT3、ALDH2、DNAH5、CCDC40、CCDC39、DNAH10。结合关键候选蛋白质的功能,初步确定精氨酸和脯氨酸代谢、泛酸和辅酶A生物合成、β-丙氨酸代谢、紧密连接、间隙连接是睾丸性状调控关键KEGG通路。研究结果为地方鸡种睾丸质量性状选育提供了基础依据。展开更多
为揭示宰后成熟过程中过氧化物还原酶6(peroxiredoxin 6,Prdx6)的非钙依赖型磷脂酶A2活性(calciumindependentphospholipase A2,iPLA2)对牛肉嫩化的影响及其内在作用机制,进一步探究Prdx6作为生物标志物在牛肉嫩化中的具体作用。测定宰...为揭示宰后成熟过程中过氧化物还原酶6(peroxiredoxin 6,Prdx6)的非钙依赖型磷脂酶A2活性(calciumindependentphospholipase A2,iPLA2)对牛肉嫩化的影响及其内在作用机制,进一步探究Prdx6作为生物标志物在牛肉嫩化中的具体作用。测定宰后成熟过程中肌原纤维蛋白粒径以观察肌原纤维蛋白的降解情况,并通过串联质量标签标记定量蛋白质组学技术探究其内在差异蛋白质的变化。结果表明,使用Prdx6的iPLA2活性抑制剂MJ33孵育牛肉24 h可促进肌原纤维蛋白的降解。通过蛋白质组学分析在Con vs G0组(0 h未经孵育)、MJ33 vs G0组和MJ33 vs Con组中共鉴定出336个差异蛋白质,其中表达差异核心蛋白质为PRDX6、SOD1、GPX1和PARK7,差异蛋白质主要富集在糖酵解、细胞凋亡信号通路和细胞骨架蛋白质上,且主要位于细胞质中,但是抑制Prdx6的iPLA2活性的处理组与对照组相比,差异蛋白质主要集中在细胞质和细胞膜上。差异蛋白质之间存在互作机制,互作差异蛋白质主要富集在细胞抗氧化、核糖体调节蛋白质合成和磷脂功能上。表明抑制Prdx6的iPLA2活性可能通过介导膜功能、能量代谢和细胞凋亡对肌原纤维蛋白的降解产生影响,最终加速牛肉的嫩化。展开更多
文摘[目的]松材线虫引发的松树萎蔫病是世界性毁灭性病害,已在我国造成严重的生态与经济损失。早期、精准的诊断是实现有效防控的关键。本研究旨在通过比较蛋白质组学分析,筛选红松在松材线虫侵染过程中表达的差异蛋白,为诊断方法开发提供潜在靶标。[方法]以红松针叶为材料,设置接种松材线虫后0、1、5和20 d 4个时间点,开展定量蛋白质组学分析,结合生物信息学方法筛选上调表达的特异蛋白,并通过qRT-PCR验证其转录表达水平。[结果]共筛选出11种在侵染后持续显著上调的差异表达蛋白,进一步结合对照组无丰度、表达差异显著及功能结构域预测等标准,确定2种蛋白(DN8104_c0_g1_i1、DN14451_c0_g1_i1)具有作为早期诊断靶标的潜力。qRT-PCR验证结果与蛋白组学趋势一致。[结论]本研究鉴定的2种候选蛋白在红松受侵染后上调表达,且在未接种松材线虫的阴性对照中丰度为0,具备结构功能特征,具有作为松材线虫病早期诊断靶标的应用前景。研究为红松及其它松树树种的病害检测提供了理论基础与技术储备。
文摘试验旨在探讨成年宁都黄鸡睾丸的蛋白质表达谱,筛选大小睾丸个体差异表达蛋白和功能通路,为繁殖性能选育提供基础数据。以6只22周龄宁都黄鸡的睾丸组织为研究对象,分为大睾丸组(H-TES)和小睾丸组(L-TES),采用串联质量标签(tandem mass tags, TMT)技术对2组个体睾丸蛋白质进行差异表达、功能富集和基因互作分析,初步筛选候选蛋白质,分析这些蛋白质在6个个体的表达量与6个睾丸性状指标(左侧睾丸重、右侧睾丸重、总睾丸重、左侧睾丸指数、右侧睾丸指数、总睾丸指数)之间的相关性,分析候选蛋白质的功能。结果表明,宁都黄鸡睾丸中共鉴定到4 683个蛋白质,筛选到144个差异表达蛋白质。GO分析结果表明,差异蛋白质主要参与精子结构组成,具有尿蛋白-谷氨酸连接酶活性、胸腺嘧啶结合、脱氢抗坏血酸跨膜转运体活性等功能。差异蛋白质显著富集的KEGG通路为精氨酸和脯氨酸代谢、泛酸和辅酶A的生物合成、β-丙氨酸代谢等。蛋白质互作网络中有34个差异蛋白质,初步筛选出30个候选蛋白质。结合相关性分析和文献查阅,筛选出16个关键候选蛋白质,即SPAG6、TPPP2、ENKUR、ODF2、SAXO1、TCP11、DNALI1、CCDC63、TSSK3、TEKT2、TEKT3、ALDH2、DNAH5、CCDC40、CCDC39、DNAH10。结合关键候选蛋白质的功能,初步确定精氨酸和脯氨酸代谢、泛酸和辅酶A生物合成、β-丙氨酸代谢、紧密连接、间隙连接是睾丸性状调控关键KEGG通路。研究结果为地方鸡种睾丸质量性状选育提供了基础依据。
文摘为揭示宰后成熟过程中过氧化物还原酶6(peroxiredoxin 6,Prdx6)的非钙依赖型磷脂酶A2活性(calciumindependentphospholipase A2,iPLA2)对牛肉嫩化的影响及其内在作用机制,进一步探究Prdx6作为生物标志物在牛肉嫩化中的具体作用。测定宰后成熟过程中肌原纤维蛋白粒径以观察肌原纤维蛋白的降解情况,并通过串联质量标签标记定量蛋白质组学技术探究其内在差异蛋白质的变化。结果表明,使用Prdx6的iPLA2活性抑制剂MJ33孵育牛肉24 h可促进肌原纤维蛋白的降解。通过蛋白质组学分析在Con vs G0组(0 h未经孵育)、MJ33 vs G0组和MJ33 vs Con组中共鉴定出336个差异蛋白质,其中表达差异核心蛋白质为PRDX6、SOD1、GPX1和PARK7,差异蛋白质主要富集在糖酵解、细胞凋亡信号通路和细胞骨架蛋白质上,且主要位于细胞质中,但是抑制Prdx6的iPLA2活性的处理组与对照组相比,差异蛋白质主要集中在细胞质和细胞膜上。差异蛋白质之间存在互作机制,互作差异蛋白质主要富集在细胞抗氧化、核糖体调节蛋白质合成和磷脂功能上。表明抑制Prdx6的iPLA2活性可能通过介导膜功能、能量代谢和细胞凋亡对肌原纤维蛋白的降解产生影响,最终加速牛肉的嫩化。
