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固有无序蛋白质无序区和有序区氨基酸组成偏好性分析
被引量:
4
1
作者
王红梅
武恩斯
朱玉风
《江苏农业科学》
北大核心
2014年第4期38-39,共2页
以固有无序蛋白质为研究对象,通过CD-HIT对数据进行去冗余处理,然后利用编程软件对数据进行统计而得到新的数据。对所有无序区及有序区的氨基酸含量进行对比,认为氨基酸Val、Ile、Leu、Phe、Trp、Asn、Tyr、His具有形成有序结构的偏好性...
以固有无序蛋白质为研究对象,通过CD-HIT对数据进行去冗余处理,然后利用编程软件对数据进行统计而得到新的数据。对所有无序区及有序区的氨基酸含量进行对比,认为氨基酸Val、Ile、Leu、Phe、Trp、Asn、Tyr、His具有形成有序结构的偏好性;氨基酸Pro、Ser、Gln、Asp、Lys具有形成无序结构的偏好性。研究结论有助于进一步挖掘固有无序蛋白质的序列特征,并为固有无序蛋白质的预测提供一些借鉴。
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关键词
固有无序蛋白质
功能位点
无序
区
序列分析
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职称材料
固有无序蛋白质及逆境胁迫下的分子功能
被引量:
3
2
作者
王东艳
崔继哲
张隽
《中国生物化学与分子生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2015年第9期921-929,共9页
固有无序蛋白质是一类在生理条件下缺乏稳定三维结构而具有正常功能,参与信号转导、转录调控、胁迫应答等多种生物学过程的蛋白质.植物中许多逆境响应蛋白是固有无序蛋白质,通过其结构无序或部分无序区域在蛋白质-蛋白质、蛋白质-膜脂...
固有无序蛋白质是一类在生理条件下缺乏稳定三维结构而具有正常功能,参与信号转导、转录调控、胁迫应答等多种生物学过程的蛋白质.植物中许多逆境响应蛋白是固有无序蛋白质,通过其结构无序或部分无序区域在蛋白质-蛋白质、蛋白质-膜脂、蛋白质-核酸的互作中发挥重要作用.本文主要对固有无序蛋白质的类别、氨基酸组成和结构特点以及在逆境胁迫下其稳定细胞膜、保护核酸和蛋白质、调控基因表达等分子功能进行综述,以拓展对逆境胁迫下蛋白质作用分子机制的认识.
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关键词
固有无序蛋白质
胁迫应答
分子功能
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职称材料
毛果杨固有无序蛋白质基因克隆及胁迫响应分析
3
作者
董实伟
杨宇宁
+2 位作者
王乃锐
张含国
李淑娟
《植物研究》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第4期575-582,共8页
为了解毛果杨中固有无序蛋白PtrIDP1(Potri.010G161200.1)基因的相关信息,探究该基因在毛果杨的不同组织、不同逆境胁迫下的表达特性,本研究根据Phytozome数据库中得到的基因全长序列设计引物,克隆得到该基因的目的片段。该基因完整的CD...
为了解毛果杨中固有无序蛋白PtrIDP1(Potri.010G161200.1)基因的相关信息,探究该基因在毛果杨的不同组织、不同逆境胁迫下的表达特性,本研究根据Phytozome数据库中得到的基因全长序列设计引物,克隆得到该基因的目的片段。该基因完整的CDs区序列长度为423 bp,共编码140个氨基酸。构建亚细胞定位表达载体,瞬时转化洋葱表皮细胞,在激光共聚焦显微镜下观察显示,PtrIDP1定位在细胞核内。利用实时定量RT-PCR技术分析了PtrIDP1基因在毛果杨不同组织中的表达特异性和应对非生物胁迫的表达特性。结果表明:PtrIDP1基因在毛果杨的根、茎、叶中均有表达,其中在根部表达量最低,在茎和叶中相对表达量较高。[JP2]PtrIDP1基因在高盐和干旱胁迫诱导时其表达量的变化模式不同,初步分析认为PtrIDP1基因参与了毛果杨非生物逆境胁迫的响应过程。[JP]
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关键词
毛果杨
基因克隆
逆境胁迫响应
固有无序蛋白质
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职称材料
无序蛋白质的判定及其结构、功能和进化特征
被引量:
6
4
作者
马冲
杨冬
+2 位作者
姜颖
钟儒刚
贺福初
《生物化学与生物物理进展》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2015年第1期16-24,共9页
固有无序蛋白质(intrinsically disordered proteins,IDPs)是天然条件下自身不能折叠为明确唯一的空间结构,却具有生物学功能的一类新发现的蛋白质.这类蛋白质的发现是对传统的"结构-功能"关系认识模式的挑战.本文首先总结了...
固有无序蛋白质(intrinsically disordered proteins,IDPs)是天然条件下自身不能折叠为明确唯一的空间结构,却具有生物学功能的一类新发现的蛋白质.这类蛋白质的发现是对传统的"结构-功能"关系认识模式的挑战.本文首先总结了无序蛋白质的实验鉴定手段、预测方法、数据库;并介绍了无序蛋白质结构(包括一级结构、二级结构、结构域无序性及变构效应)和功能特征;然后重点总结了无序蛋白质在进化角度研究的进展,包括无序区域产生的进化机制、进化速率,蛋白无序性的进化在蛋白质功能进化及生物学复杂性增加等方面的重要作用;最后展望了无序蛋白质在医药方面的应用前景.本文对于深入认识无序蛋白质的形成机制、结构和功能特征及其潜在的临床应用前景具有重要意义.
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关键词
固有无序蛋白质
序列
结构
功能
进化
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职称材料
题名
固有无序蛋白质无序区和有序区氨基酸组成偏好性分析
被引量:
4
1
作者
王红梅
武恩斯
朱玉风
机构
德州学院物理与电子信息学院/山东省功能大分子生物物理重点实验室
山东师范大学
出处
《江苏农业科学》
北大核心
2014年第4期38-39,共2页
基金
山东省自然科学基金(编号:ZR2010CQ041)
文摘
以固有无序蛋白质为研究对象,通过CD-HIT对数据进行去冗余处理,然后利用编程软件对数据进行统计而得到新的数据。对所有无序区及有序区的氨基酸含量进行对比,认为氨基酸Val、Ile、Leu、Phe、Trp、Asn、Tyr、His具有形成有序结构的偏好性;氨基酸Pro、Ser、Gln、Asp、Lys具有形成无序结构的偏好性。研究结论有助于进一步挖掘固有无序蛋白质的序列特征,并为固有无序蛋白质的预测提供一些借鉴。
关键词
固有无序蛋白质
功能位点
无序
区
序列分析
分类号
Q516 [生物学—生物化学]
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职称材料
题名
固有无序蛋白质及逆境胁迫下的分子功能
被引量:
3
2
作者
王东艳
崔继哲
张隽
机构
哈尔滨师范大学生命科学与技术学院
出处
《中国生物化学与分子生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2015年第9期921-929,共9页
基金
国家留学基金委项目(No.2011823160)
黑龙江省自然科学基金项目(No.C201309)资助~~
文摘
固有无序蛋白质是一类在生理条件下缺乏稳定三维结构而具有正常功能,参与信号转导、转录调控、胁迫应答等多种生物学过程的蛋白质.植物中许多逆境响应蛋白是固有无序蛋白质,通过其结构无序或部分无序区域在蛋白质-蛋白质、蛋白质-膜脂、蛋白质-核酸的互作中发挥重要作用.本文主要对固有无序蛋白质的类别、氨基酸组成和结构特点以及在逆境胁迫下其稳定细胞膜、保护核酸和蛋白质、调控基因表达等分子功能进行综述,以拓展对逆境胁迫下蛋白质作用分子机制的认识.
关键词
固有无序蛋白质
胁迫应答
分子功能
Keywords
intrinsically disordered proteins
stress response
molecular functions
分类号
Q51 [生物学—生物化学]
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职称材料
题名
毛果杨固有无序蛋白质基因克隆及胁迫响应分析
3
作者
董实伟
杨宇宁
王乃锐
张含国
李淑娟
机构
林木遗传育种国家重点实验室
出处
《植物研究》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第4期575-582,共8页
基金
黑龙江省科学基金项目(C2017008)。
文摘
为了解毛果杨中固有无序蛋白PtrIDP1(Potri.010G161200.1)基因的相关信息,探究该基因在毛果杨的不同组织、不同逆境胁迫下的表达特性,本研究根据Phytozome数据库中得到的基因全长序列设计引物,克隆得到该基因的目的片段。该基因完整的CDs区序列长度为423 bp,共编码140个氨基酸。构建亚细胞定位表达载体,瞬时转化洋葱表皮细胞,在激光共聚焦显微镜下观察显示,PtrIDP1定位在细胞核内。利用实时定量RT-PCR技术分析了PtrIDP1基因在毛果杨不同组织中的表达特异性和应对非生物胁迫的表达特性。结果表明:PtrIDP1基因在毛果杨的根、茎、叶中均有表达,其中在根部表达量最低,在茎和叶中相对表达量较高。[JP2]PtrIDP1基因在高盐和干旱胁迫诱导时其表达量的变化模式不同,初步分析认为PtrIDP1基因参与了毛果杨非生物逆境胁迫的响应过程。[JP]
关键词
毛果杨
基因克隆
逆境胁迫响应
固有无序蛋白质
Keywords
Populus trichocarpa
gene cloning
stress response to adversity
intrinsically disordered proteins
分类号
Q781 [生物学—分子生物学]
S792.119 [农业科学—林木遗传育种]
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职称材料
题名
无序蛋白质的判定及其结构、功能和进化特征
被引量:
6
4
作者
马冲
杨冬
姜颖
钟儒刚
贺福初
机构
北京工业大学生命科学与生物工程学院
军事医学科学院放射与辐射医学研究所
出处
《生物化学与生物物理进展》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2015年第1期16-24,共9页
基金
国家国际科技合作专项(2014DFB30020)
国家重大科学研究计划(2014CBA02001)资助项目~~
文摘
固有无序蛋白质(intrinsically disordered proteins,IDPs)是天然条件下自身不能折叠为明确唯一的空间结构,却具有生物学功能的一类新发现的蛋白质.这类蛋白质的发现是对传统的"结构-功能"关系认识模式的挑战.本文首先总结了无序蛋白质的实验鉴定手段、预测方法、数据库;并介绍了无序蛋白质结构(包括一级结构、二级结构、结构域无序性及变构效应)和功能特征;然后重点总结了无序蛋白质在进化角度研究的进展,包括无序区域产生的进化机制、进化速率,蛋白无序性的进化在蛋白质功能进化及生物学复杂性增加等方面的重要作用;最后展望了无序蛋白质在医药方面的应用前景.本文对于深入认识无序蛋白质的形成机制、结构和功能特征及其潜在的临床应用前景具有重要意义.
关键词
固有无序蛋白质
序列
结构
功能
进化
Keywords
intrinsically disordered proteins
sequence
structure
function
evolution
分类号
Q51 [生物学—生物化学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
固有无序蛋白质无序区和有序区氨基酸组成偏好性分析
王红梅
武恩斯
朱玉风
《江苏农业科学》
北大核心
2014
4
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
固有无序蛋白质及逆境胁迫下的分子功能
王东艳
崔继哲
张隽
《中国生物化学与分子生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2015
3
在线阅读
下载PDF
职称材料
3
毛果杨固有无序蛋白质基因克隆及胁迫响应分析
董实伟
杨宇宁
王乃锐
张含国
李淑娟
《植物研究》
CAS
CSCD
北大核心
2020
0
在线阅读
下载PDF
职称材料
4
无序蛋白质的判定及其结构、功能和进化特征
马冲
杨冬
姜颖
钟儒刚
贺福初
《生物化学与生物物理进展》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2015
6
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职称材料
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