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桑树四跨膜蛋白(TET)基因家族的克隆及功能分析
1
作者 黄笑利 胡佳悦 +1 位作者 刘伟富 刘吉平 《植物资源与环境学报》 北大核心 2025年第3期12-23,34,共13页
为探究桑树(Morus alba Linn.)四跨膜蛋白(TET)基因家族的功能,从桑树全基因组中筛选并克隆了9个MaTET基因(MaTET 2、MaTET 3、MaTET 6、MaTET 8、MaTET 10、MaTET 11、MaTET 18、MaTET 19 A和MaTET 19 B),通过生物信息学和分子生物学... 为探究桑树(Morus alba Linn.)四跨膜蛋白(TET)基因家族的功能,从桑树全基因组中筛选并克隆了9个MaTET基因(MaTET 2、MaTET 3、MaTET 6、MaTET 8、MaTET 10、MaTET 11、MaTET 18、MaTET 19 A和MaTET 19 B),通过生物信息学和分子生物学技术分析了其理化性质、保守基序、结构域、系统进化及顺式作用元件,利用实时荧光定量PCR技术检测了这9个基因在低温胁迫、脱落酸和茉莉酸甲酯处理及茄科劳尔氏菌(Ralstonia solanacearum)侵染下的表达模式,并结合原核表达和十二烷基硫酸钠-聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS-PAGE)进行了检测验证。结果显示:桑树MaTET基因家族9个成员的碱基长度为813~1520 bp;除MaTET18、MaTET19A和MaTET19B外,其他6个MaTET蛋白的理论等电点高于pI 7.0;MaTET蛋白均为疏水蛋白,且均具有跨膜结构域,共有12个保守基序,且保守结构域基本一致。系统进化分析表明:MaTET 2、MaTET 3、MaTET 6、MaTET 8、MaTET 10和MaTET 11与拟南芥〔Arabidopsis thaliana(Linn.)Heynh.〕同源蛋白亲缘关系较近。9个MaTET基因启动子共有15种与非生物胁迫、激素响应和生长发育相关的顺式作用元件。基因表达分析结果显示:低温胁迫下MaTET 3、MaTET 6、MaTET 8、MaTET 10和MaTET 18的相对表达量显著(P<0.05)变化;脱落酸处理1 h,MaTET 2、MaTET 3、MaTET 11、MaTET 19 A和MaTET 19 B的相对表达量显著上调;茉莉酸甲酯处理1 h,9个MaTET基因的相对表达量均显著升高;茄科劳尔氏菌侵染72 h,除MaTET 2和MaTET 18外,其他7个MaTET的相对表达量不同程度地升高。原核表达及SDS-PAGE检测结果显示:桑树MaTET基因家族的9个成员中7个成员编码蛋白在相对分子质量处检测到条带,而MaTET3和MaTET6在更换表达条件后均未成功表达。综上所述,桑树MaTET基因家族在响应非生物胁迫、激素响应和病原菌侵染中发挥重要作用。 展开更多
关键词 桑树 四跨膜蛋白(tet) 基因家族 生物信息学 原核表达
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四跨膜蛋白超家族tetraspanins的免疫功能研究进展 被引量：10
2
作者 桂朗 王兵 +1 位作者 李富花 相建海 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2008年第11期1231-1238,共8页
Tetraspanins属于四跨膜蛋白超家族(transmembrane 4 superfamily,TM4SF),能跨膜连接蛋白,促进细胞间及细胞内信号转导,参与某些病毒的细胞识别和侵染.Tetraspanins成员之间相互关联,并与其他蛋白质形成一个巨大的tetraspanins网络,在... Tetraspanins属于四跨膜蛋白超家族(transmembrane 4 superfamily,TM4SF),能跨膜连接蛋白,促进细胞间及细胞内信号转导,参与某些病毒的细胞识别和侵染.Tetraspanins成员之间相互关联,并与其他蛋白质形成一个巨大的tetraspanins网络,在免疫反应中发挥着重要作用.作为一大类进化上保守的细胞膜蛋白,它们在无脊椎动物中也行使复杂多样的功能.将重点阐述在tetraspanins的结构、识别病毒的机制、在免疫系统中的作用研究方面取得的进展,并对无脊椎动物tetraspanins在先天性免疫系统中的重要意义进行讨论. 展开更多
关键词 tetRASPANINS 免疫 病毒 四跨膜蛋白超家族(TM4SF) 无脊椎动物
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四跨膜蛋白在肝癌中的作用 被引量：8
3
作者 何磊 柯爱武 郭传勇 《中国肿瘤临床》 CAS CSCD 北大核心 2011年第18期1175-1178,共4页
四跨膜蛋白是一组具有四个高度疏水的跨膜结构域的低分子量细胞膜表面蛋白,可广泛参与细胞生长、粘附、迁移等多种生命活动。四跨膜蛋白超家族(TM4SF)可与包括四跨膜蛋白、整合素、生长因子及其受体、HLA家族、主要组织相容复合物(MHC)... 四跨膜蛋白是一组具有四个高度疏水的跨膜结构域的低分子量细胞膜表面蛋白,可广泛参与细胞生长、粘附、迁移等多种生命活动。四跨膜蛋白超家族(TM4SF)可与包括四跨膜蛋白、整合素、生长因子及其受体、HLA家族、主要组织相容复合物(MHC)等在内的多种细胞表面分子相连接,形成以TM4SF为核心的四跨膜蛋白网络。四跨膜蛋白网络可通过直接或间接作用于细胞信号通道从而影响肿瘤细胞的粘附、分化、迁移及侵袭。目前研究表明四跨膜蛋白CD151、CD82、Tspan8及Tspan1与肝癌密切相关,可参与调控肝癌细胞的粘附、增殖、分化、迁移及侵袭等过程来影响肝癌的发生发展。KAI1/CD82为肝癌的抑制基因,上调其表达可以抑制肝癌细胞的迁移和侵袭;CD151在肝癌组织中大量表达,提示CD151或联合CD151/c-Met是可能预测肝癌的进展新指标,并且CD151可能用于肝癌的靶向治疗;而Tspan8(CO-029)及Tspan1(NET-1)则可用于预测肝癌的进展及预后。 展开更多
关键词 四跨膜蛋白 肝癌CD151 CD82 Tspan8(CO-029)Tspan1(NET-1)
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香蕉MaTET基因的克隆与表达分析
4
作者 姜成东 刘菊华 +3 位作者 徐碧玉 贾彩虹 苗红霞 金志强 《热带作物学报》 CSCD 北大核心 2015年第6期1092-1098,共7页
采用RACE技术克隆香蕉果实采后成熟相关基因Ma TET的全长c DNA,利用生物信息学方法分析Ma TET基因及推导蛋白的序列,再利用RT-PCR技术对该基因的组织器官表达特性和在果实采后成熟过程中的表达特性进行分析。结果表明,Ma TET的c DNA序... 采用RACE技术克隆香蕉果实采后成熟相关基因Ma TET的全长c DNA,利用生物信息学方法分析Ma TET基因及推导蛋白的序列,再利用RT-PCR技术对该基因的组织器官表达特性和在果实采后成熟过程中的表达特性进行分析。结果表明,Ma TET的c DNA序列全长为1 234 bp,包含一个852 bp的完整开放阅读框,编码283个氨基酸残基,5′端非编码区222 bp,3′端非编码区160 bp,起始密码子为ATG,终止密码子为TAG。Ma TET蛋白具4个跨膜区域,属于四跨膜蛋白(Tetraspanins),拥有多个与信号传导有关的修饰位点,在系统发生上更接近鹰嘴豆、野草莓和番茄等双子叶植物。Ma TET可在香蕉根、茎、叶、花以及果实中表达,在根和叶中的表达量高于其它器官;Ma TET在自然成熟香蕉果实中的微黄(TY)阶段开始上调表达,在黄多于绿(MY)阶段表达量急遽升高,随后降低,乙烯可增强Ma TET表达且表达高峰提前至绿多于黄(MG)阶段,1-MCP抑制Ma TET的表达。 展开更多
关键词 香蕉 四跨膜蛋白 克隆 生物信息学 表达分析
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Tspan8在结肠癌细胞中的表达及小干扰RNA干扰后对SW620细胞功能的影响 被引量：2
5
作者 任宇鹏 宋纯 孟庆凯 《中国医科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第1期34-37,共4页
目的检测Tspan8在结肠癌细胞中的表达,采用siTspan8下调Tspan8的表达,观察其对SW620细胞转移、浸润及增殖功能的影响。方法采用Westernblot和实时定量聚合酶链反应(qRT-PCR)检测4种结肠癌细胞系中Tspan8蛋白和mRNA表达水平,以siTspan8对... 目的检测Tspan8在结肠癌细胞中的表达,采用siTspan8下调Tspan8的表达,观察其对SW620细胞转移、浸润及增殖功能的影响。方法采用Westernblot和实时定量聚合酶链反应(qRT-PCR)检测4种结肠癌细胞系中Tspan8蛋白和mRNA表达水平,以siTspan8对SW620细胞中Tspan8进行干扰,干扰后采用MTT及Transwell对增殖、转移及浸润进行检测。结果4种结肠癌细胞系中Tspan8在蛋白水平及mRNA水平均有表达,Westernblot显示来自转移灶的人结肠癌细胞系SW620中Tspa8表达水平高于来自原发灶的Colo-205、HCT-116及HT-29,差异有统计学意义(均P<0.05),qRT-PCR显示SW620中Tspan8mRNA表达高于Colo-205、HCT-116及HT-29,差异有统计学意义(均P<0.05)。MTT及Transwell显示siTspan8对SW620中Tspan8进行干扰后,结肠癌细胞增殖没有改变,转移及浸润能力减弱。结论Tspan8在结肠癌细胞中有表达,下调Tspan8表达对结肠癌细胞的转移及浸润有抑制作用。 展开更多
关键词 结肠癌 Tspan8 小干扰RNA 四跨膜蛋白
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草鱼CD81基因的克隆及功能分析 被引量：1
6
作者 李华英 黄容 +3 位作者 杜富宽 廖兰杰 李勇明 汪亚平 《水生生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第3期468-474,共7页
为研究白细胞表面分化抗原81(CD81)的功能,对草鱼CD81进行了克隆,CD81全长共1376 bp,其中5′非翻译区87 bp,3′非翻译区581 bp,开放阅读框为708 bp,包括8个外显子,7个内含子,编码235个氨基酸。实验采用实时荧光定量PCR的方法检测了CD81... 为研究白细胞表面分化抗原81(CD81)的功能,对草鱼CD81进行了克隆,CD81全长共1376 bp,其中5′非翻译区87 bp,3′非翻译区581 bp,开放阅读框为708 bp,包括8个外显子,7个内含子,编码235个氨基酸。实验采用实时荧光定量PCR的方法检测了CD81在健康草鱼不同组织中的表达情况及草鱼出血病病毒(GCRV)攻毒前后的表达变化情况。结果显示草鱼CD81在所有被检测组织中均有表达,在头肾中表达量最高。在GCRV攻毒前后草鱼鳃、脾、肝、肠及头肾5个组织中的CD81表达量均有明显变化。同时,采用绿色荧光蛋白(GFP)来示踪CD81的亚细胞表达部位,激光共聚焦显微镜显示,同人类一样,草鱼CD81定位于细胞膜上。 展开更多
关键词 草鱼 CD81 四跨膜蛋白家族 基因克隆 组织表达 亚细胞定位
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胎盘绒毛CD81、HIF-1α、VEGF在早孕期复发性流产中的表达 被引量：17
7
作者 余艳茹 许雅娟 +6 位作者 翟闪闪 班彦杰 孙宗宗 张婧喆 张淼 洪腾 柳蕊 《安徽医科大学学报》 CAS 北大核心 2019年第4期611-616,共6页
目的探讨四跨膜蛋白CD81(CD81)、血管内皮生长因子(VEGF)及其低氧诱导因子-1α(HIF-1α)在复发性流产(RSA)患者胎盘绒毛中的表达及意义。方法以60例患者为研究对象,其中RSA早孕停育组30例,正常早孕人流要求终止者30例。采用实时荧光定量... 目的探讨四跨膜蛋白CD81(CD81)、血管内皮生长因子(VEGF)及其低氧诱导因子-1α(HIF-1α)在复发性流产(RSA)患者胎盘绒毛中的表达及意义。方法以60例患者为研究对象,其中RSA早孕停育组30例,正常早孕人流要求终止者30例。采用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)法和Western blot法对所有入组患者绒毛中CD81、 VEGF及HIF-1α水平进行检测。采用Pearson相关性分析CD81、VEGF及HIF-1α之间的相关性,ROC曲线评估CD81、VEGF及HIF-1α对RSA的预测价值。结果①RSA组妇女绒毛组织中CD81、HIF-1αmRNA水平高于正常早孕组,VEGF mRNA水平低于正常早孕组,差异均有统计学意义(P<0.05)。②RSA组妇女绒毛组织中CD81、HIF-1α蛋白水平高于正常早孕组,VEGF蛋白水平低于正常早孕组,差异均有统计学意义(P<0.05)。③Pearson相关性分析:RSA组中VEGF与CD81呈负相关性,与HIF-1α呈正相关性;正常早孕组中各指标无相关性。④ROC曲线分析CD81、HIF-1α、VEGF及三者联合对RSA的预测价值中:CD81、HIF-1α、VEGF表达量中任意两因子预测RSA的效果无明显差异性(P>0.05),任一因子与三者联合预测比较,均有统计学意义(P<0.05,NRI<0)。结论在RSA组中,VEGF表达与CD81呈负相关性,与HIF-1α呈正相关性;ROC曲线预测RSA发生中,CD81、 VEGF及HIF-1α联合预测价值优于单一因子。 展开更多
关键词 复发性流产 四跨膜蛋白CD81 血管内皮生长因子 低氧诱导因子-1Α
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TSPAN8参与小鼠非酒精性脂肪性肝病的脂质代谢 被引量：3
8
作者 张佳 薛薇 +5 位作者 章述军 朱雅莉 阳成 高月 石凌枫 黄文祥 《南方医科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第5期705-711,共7页
目的探讨四跨膜蛋白8(TSPAN8)在非酒精性脂肪性肝病(NAFLD)发生发展中的变化及其在脂质代谢中的作用。方法将30只C57BL/6J雄性小鼠随机分为普通饲料组(ND,n=15)和高脂饲料组(HFD,n=15)。Westernblot检测1、3、6月末各组小鼠肝脏组织中TS... 目的探讨四跨膜蛋白8(TSPAN8)在非酒精性脂肪性肝病(NAFLD)发生发展中的变化及其在脂质代谢中的作用。方法将30只C57BL/6J雄性小鼠随机分为普通饲料组(ND,n=15)和高脂饲料组(HFD,n=15)。Westernblot检测1、3、6月末各组小鼠肝脏组织中TSPAN8的表达水平。HepG2细胞分成6组:完全培养基培养,无其他处理的命名为对照组(CON);游离脂肪酸(FFA)处理以构建NAFLD细胞模型的命名为FFA组;TSPAN8过表达细胞命名为PCDNA-TSPAN8组,其对照为PCDNA3.1组;FFA处理后的PCDNA-TSPAN8命名为PCDNA-TSPAN8+FFA组,其对照为PCDNA3.1+FFA组;qRT-PCR及Westernblot检测CON组和FFA组细胞中TSPAN8表达水平;油红O染色法和全自动生化仪检测PCDNA-TSPAN8+FFA和PCDNA3.1+FFA组细胞内脂质蓄积情况。qRT-PCR检测与脂质代谢相关基因mRNA的表达情况。结果Westernblot显示,与同喂养时间ND组相比,HFD喂养3、6月的小鼠肝组织中TSPAN8的表达下降(P<0.05)。qRT-PCR与Westernblot显示,与CON组比较,TSPAN8在FFA组中的表达下降(P<0.01)。与PCDNA3.1+FFA组相比,PCDNA-TSPAN8+FFA组中细胞内甘油三酯(TG)水平下降(P<0.001)。qRT-PCR示,与PCDNA3.1组比较,脂肪酸转运蛋白5(FATP5)在PCDNA-TSPAN8组中表达降低(P<0.01),与CON组相比,FATP5在FFA组表达上调(P<0.001)。结论TSPAN8参与NAFLD的脂质代谢,细胞过表达TSPAN8可能通过降低FATP5的表达来抑制细胞内脂质的沉积,可能具有潜在的临床价值。 展开更多
关键词 非酒精性脂肪性肝病 四跨膜蛋白8 脂代谢
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