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应用噬菌体展示技术筛选细胞周期素B2启动子DNA的结合蛋白 被引量:1
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作者 郭江 成军 +3 位作者 赵龙凤 高学松 张黎颖 伦永志 《解放军医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2005年第12期1049-1051,共3页
目的筛选细胞周期素B2(cyclinB2)启动子DNA结合蛋白,探索cyclinB2的表达调节机制。方法应用噬菌体展示技术,以cyclinB2启动子DNA片段作为固相筛选分子,对噬菌体人肝细胞cDNA文库进行4轮“吸附洗脱扩增”富集过程,噬斑裂解液PCR扩增后,进... 目的筛选细胞周期素B2(cyclinB2)启动子DNA结合蛋白,探索cyclinB2的表达调节机制。方法应用噬菌体展示技术,以cyclinB2启动子DNA片段作为固相筛选分子,对噬菌体人肝细胞cDNA文库进行4轮“吸附洗脱扩增”富集过程,噬斑裂解液PCR扩增后,进行DNA序列分析和同源性生物信息学搜索。结果噬菌体经富集后,筛选出20个阳性克隆,成功构建了克隆载体。序列测定后经过同源性搜索,确定了和cyclinB2启动子特异结合的肝细胞蛋白,共编码6种已知蛋白。结论用噬菌体人肝cDNA文库筛选得到cyclinB2启动子DNA结合蛋白,分析了这些蛋白的功能,为研究cyclinB2基因的转录调节机制奠定了基础。 展开更多
关键词 噬菌体展示技术 细胞周期蛋白B 启动子dna结合蛋白筛选
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噬菌体展示技术筛选诱导型NOS基因启动子DNA结合蛋白的研究 被引量:2
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作者 郭风劲 成军 +3 位作者 钟彦伟 刘妍 张黎颖 宋方洲 《解放军医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2005年第4期290-292,共3页
目的筛选诱导型一氧化氮合酶(iNOS)基因启动子DNA结合蛋白,探索iNOS基因的表达调控机制。方法应用生物信息学方法确定iNOS基因启动子序列,以PCR扩增iNOS基因启动子DNA片段,构建真核报告载体pCAT3iNOSp,并转染HepG2细胞系,用ELISA法检测... 目的筛选诱导型一氧化氮合酶(iNOS)基因启动子DNA结合蛋白,探索iNOS基因的表达调控机制。方法应用生物信息学方法确定iNOS基因启动子序列,以PCR扩增iNOS基因启动子DNA片段,构建真核报告载体pCAT3iNOSp,并转染HepG2细胞系,用ELISA法检测氯霉素乙酰转移酶(CAT)的表达活性以明确所得到的DNA片段具有启动子活性;以iNOS基因启动子片段作为固相筛选分子,对噬菌体人肝细胞cDNA文库进行4轮“吸附洗脱扩增”富集过程,噬斑裂解液PCR扩增后,进行DNA序列分析和蛋白质同源性生物信息学搜索。结果pCAT3iNOSp瞬时转染的HepG2细胞的CAT表达活性是pCAT3Basic空载体的4.2倍,说明所得到的DNA片段具有启动子活性;噬菌体经富集后,筛选出12个阳性克隆,成功获得了iNOS基因启动子的DNA结合蛋白编码序列。结论所构建的iNOS基因启动子具有顺式激活下游基因表达的作用;筛选得到的iNOS启动子DNA结合蛋白对于研究iNOS基因的转录调节机制具有重要意义。 展开更多
关键词 噬菌体展示技术 诱导型一氧化氮合酶启动子dna结合蛋白质类
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三链DNA的形成抑制DNA结合蛋白与启动子的结合 被引量:3
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作者 刘定燮 王昌才 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 1998年第3期262-266,共5页
电泳迁移分析方法及DNaseⅠ足迹实验表明21nt脱氧寡核苷酸G3TG2TGT2G5TG2TGT(CP1)与乙肝病毒(HBV)核心启动子(Cp)片段之间三链DNA的形成有较高的特异性及稳定性.凝胶滞留实验显示,在大鼠... 电泳迁移分析方法及DNaseⅠ足迹实验表明21nt脱氧寡核苷酸G3TG2TGT2G5TG2TGT(CP1)与乙肝病毒(HBV)核心启动子(Cp)片段之间三链DNA的形成有较高的特异性及稳定性.凝胶滞留实验显示,在大鼠肝细胞核提取物体外转录系统中,CP1可特异地抑制DNA结合蛋白与Cp片段的结合,而不能与Cp结合形成三链DNA的脱氧寡核苷酸CP3(TGTG2TG5T2GTG2TG3)对蛋白与Cp的结合并无抑制作用.这些结果表明,三链DNA的形成有可能抑制HBVDNA的转录. 展开更多
关键词 三链dna dna 结合蛋白 启动子 乙型肝炎病毒
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花斑裸鲤红细胞发育相关基因KLF17启动子区域互作蛋白筛选
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作者 寇若彬 刘丹 +6 位作者 高强 晁燕 张存芳 聂苗苗 谭瑾 郭守全 祁得林 《水生生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第5期808-819,共12页
为了进一步解析鱼类在高原低氧环境下的适应性进化机制,确定相关基因KLF17是否在红细胞发育过程中发挥功能。将高原裂腹鱼亚科鱼类的代表物种——花斑裸鲤(Gymnocypris eckloni)作为实验对象,以实验室前期花斑裸鲤全基因组测序数据为基... 为了进一步解析鱼类在高原低氧环境下的适应性进化机制,确定相关基因KLF17是否在红细胞发育过程中发挥功能。将高原裂腹鱼亚科鱼类的代表物种——花斑裸鲤(Gymnocypris eckloni)作为实验对象,以实验室前期花斑裸鲤全基因组测序数据为基础,鉴定出红细胞发育相关基因KLF17启动子序列,以其启动子DNA为诱饵,对花斑裸鲤肾脏组织蛋白进行筛选,采用LC-MS/MS技术对候选结合蛋白进行鉴定分析,并进行生物信息学分析。结果表明,在花斑裸鲤肾脏组织中共筛选到576个与KLF17启动子区域特异性结合的蛋白,去除未能鉴定到的蛋白,共有306个候选结合蛋白,其中包括真核翻译起始因子2、细胞色素P450酶、转铁蛋白、含Ⅰ型血小板结合蛋白基序的解聚蛋白样金属蛋白酶、丙酮酸脱氢酶、红细胞膜蛋白带4.1蛋白等与红细胞或造血相关的蛋白。GO功能富集分析表明,这些候选结合蛋白涉及多种生物学功能,包括参与细胞生长、细胞周期、免疫反应、信号传导、核酸与转录因子结合等过程。KEGG通路分析表明,以上蛋白参与多条信号通路,包括氨基酸代谢通路、细胞凋亡信号通路、PPAR信号通路、Hippo信号通路、细胞色素P450代谢信号通路、HIF-1信号通路及神经营养因子信号通路等。研究筛选出的KLF17启动子候选结合蛋白主要有参与红细胞发育相关的真核翻译起始因子2、细胞色素P450酶、转铁蛋白等,经过功能分析发现它们参与HIF-1信号通路,通过调控血红素、珠蛋白基因表达、铁代谢、血管生成、糖酵解等途径激发红细胞的生成与发育,提示KLF17在转录水平上参与调控红细胞中血红素、铁和珠蛋白间的相互作用,为红细胞分化机制研究提供重要信息。同时,转铁蛋白作为参与铁和氧调节的交叉调控因子,它能够促进血液中铁的运输和增强血氧的结合能力,使得机体在低氧环境中长期生存,这也揭示了花斑裸鲤的低氧适应机制与HIF-1下游的转铁蛋白有关。研究可对下一步验证该蛋白与KLF17的互作机制提供研究基础,为解析高原土著鱼类造血系统发育和低氧环境适应性进化的分子机制提供科学数据。 展开更多
关键词 红细胞发育 启动子 结合蛋白 KLF17 dna pulldown-MS 花斑裸鲤
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8-Br-cAMP和槲皮素对Eca-109细胞p16基因启动子DNA结合蛋白及其mRNA表达的影响
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作者 张莹 苏安 +3 位作者 吴景兰 丁一 王一菱 宫璀璀 《郑州大学学报(医学版)》 CAS 北大核心 2003年第5期691-693,共3页
目的 :应用Southwestern技术研究 8 Br cAMP和槲皮素 (quercetin)对Eca 10 9细胞DNA结合蛋白与p16基因启动子区的结合调控mRNA表达的影响。方法 :将贴壁培养的Eca 10 9细胞随机分成 3组 ,Br组 :加 8 Br cAMP至终浓度为 2× 10 5mol/... 目的 :应用Southwestern技术研究 8 Br cAMP和槲皮素 (quercetin)对Eca 10 9细胞DNA结合蛋白与p16基因启动子区的结合调控mRNA表达的影响。方法 :将贴壁培养的Eca 10 9细胞随机分成 3组 ,Br组 :加 8 Br cAMP至终浓度为 2× 10 5mol/L ;Q组 :加槲皮素至终浓度为 4 3μmol/L ;C组 :不加任何药物 ,只加入新培养液培养。同时培养 4 8h ,应用质粒提取及限制性酶切回收目的DNA片段 ,采用生物素随机引物标记探针 ;应用DNA斑点印迹技术检测探针的灵敏度后以Southwestern印迹技术检测与p16基因启动子区特异性结合的DNA结合蛋白 (DBP) ;以原位杂交检测p16基因mRNA的表达情况。结果 :实验组条带强于对照组 ,Br组强于Q组 ;核基质DNA结合蛋白主带位于Mr6 6 0 0 0、5 80 0 0和 2 0 0 0 0 ;核外DNA结合蛋白主带位于Mr4 0 0 0 0、2 80 0 0和 2 0 0 0 0 ;2者中 2 0 0 0 0是共同成分。原位杂交技术显示p16基因mRNA蓝紫色信号颗粒位于胞质 ,杂交信号以实验组较强。结论 :8 Br cAMP和quercetin尤其是前者作用于人食管癌Eca 10 9细胞 ,诱导产生与p16基因启动子结合较强的DBP 。 展开更多
关键词 ECA-109细胞 8-BR-CAMP 槲皮素 dna结合蛋白 核基质蛋白 P16基因启动子 Southwestern印迹 食管癌
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G-CSF启动子结合蛋白的克隆
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作者 孙国凤 《生物技术通报》 CAS CSCD 1991年第8期15-16,共2页
大阪生命科学研究所第一研究部部长长田重一等克隆结合于粒细胞集落刺激因子(G-CSF)的启动子区段上的转录调节因子获得成功.在1990年11月在京都召开的日本分子生物学会上发表这一结果. 长田等克隆的蛋白是结合到G-CSF3个启动子GPE 1、G... 大阪生命科学研究所第一研究部部长长田重一等克隆结合于粒细胞集落刺激因子(G-CSF)的启动子区段上的转录调节因子获得成功.在1990年11月在京都召开的日本分子生物学会上发表这一结果. 长田等克隆的蛋白是结合到G-CSF3个启动子GPE 1、GPE2、GPE3中,并通过内毒素(LPS)直接参与对G-CSF的诱导.它是作G-CSF的阻遏物起作用的. 长田等以GPE 1区段作为探针。 展开更多
关键词 启动子 结合蛋白 小鼠巨噬细胞 集落刺激因子 蛋白印迹法 转录调节因子 阻遏物 dna 生命科学 巨噬细胞株
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毛细管电泳技术分析PDGF-B基因启动子与蛋白质的复合物 被引量:2
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作者 樊兴君 刘静 +1 位作者 金由辛 王德宝 《色谱》 CAS CSCD 北大核心 2001年第2期170-172,共3页
利用 1.0 %T ,0 %C的线性聚丙烯酰胺 (即丙烯酰胺和双丙烯酰胺的总质量分数是 1.0 % ,交联度为 0 % )作为筛分介质 ,对人体血小板长生因子 (PDGF) B基因启动子与核蛋白形成的复合物进行了分析。结果显示主要有两种核蛋白与PDGF B基因... 利用 1.0 %T ,0 %C的线性聚丙烯酰胺 (即丙烯酰胺和双丙烯酰胺的总质量分数是 1.0 % ,交联度为 0 % )作为筛分介质 ,对人体血小板长生因子 (PDGF) B基因启动子与核蛋白形成的复合物进行了分析。结果显示主要有两种核蛋白与PDGF B基因启动子具有较强的结合能力 ,能形成DNA蛋白质复合物。所得结论与传统凝胶电泳相似。该方法具有较高的分离度和良好的重现性 ,整个分析可在 5 0min内完成。该方法不失为一种基于PDGF为研究目标、用于PDGF与蛋白质复合物形成及抑制行为分析的快速、准确的实用方法。 展开更多
关键词 毛细管电泳 dna结合蛋白 PDGF-B基因启动子 蛋白 复合物 分析
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有关序列特异性DNA结合蛋白的一些最新研究进展
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作者 魏荣 李佐 杜翠花 《山西农业大学学报》 CAS 2000年第1期83-85,共3页
本文对有关序列特异性DNA结合蛋白的最新研究情况作了叙述。在其结构研究中 ,介绍了同源结构域的拓扑学结构 ,同源结构域上的氨基酸基序 ,共价和非共价二聚结构域。在其作用研究中 ,介绍了非放射标记的凝胶阻滞分析法 ,C/EBP调节启动子... 本文对有关序列特异性DNA结合蛋白的最新研究情况作了叙述。在其结构研究中 ,介绍了同源结构域的拓扑学结构 ,同源结构域上的氨基酸基序 ,共价和非共价二聚结构域。在其作用研究中 ,介绍了非放射标记的凝胶阻滞分析法 ,C/EBP调节启动子活性的机制 ,雌激素受体在前转录起始复合物形成中的作用以及一种新的人SPI激活转录必需的共激活因子———CRSP复合物。在编码基因与其DNA序列上的结合位点研究中 ,介绍了荧光原位杂交技术进行染色体定位 ,C/EBP家族在小鼠的乳腺泌乳期和回复期的表达 ,HNF— 1结合位点对SI基因启动子上葡萄糖阻遏作用的操纵 。 展开更多
关键词 结构域 启动子 HNF-1结合位点 dna结合蛋白
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CHD4基因表达对急性T淋巴细胞白血病细胞增殖和凋亡的影响及其启动子鉴定
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作者 杨彩霞 陆超 《南京医科大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2021年第3期331-338,共8页
目的:探讨人染色质解旋酶DNA结合蛋白4(recombinant chromodomain helicase DNA binding protein 4,CHD4)基因表达对急性T细胞淋巴细胞白血病细胞增殖和凋亡的影响及其启动子鉴定。方法:使用siRNA-CHD4瞬时转染T淋巴细胞白血病细胞(Jurk... 目的:探讨人染色质解旋酶DNA结合蛋白4(recombinant chromodomain helicase DNA binding protein 4,CHD4)基因表达对急性T细胞淋巴细胞白血病细胞增殖和凋亡的影响及其启动子鉴定。方法:使用siRNA-CHD4瞬时转染T淋巴细胞白血病细胞(Jurkat)敲低CHD4基因表达,实时荧光定量q RT-PCR和Western blot检测细胞转染后CHD4表达量,流式细胞术测定细胞凋亡率及细胞周期变化;CCK-8分析测定CHD4基因对Jurkat细胞增殖的影响。根据生物信息学分析,以Jurkat细胞提取的全基因组DNA为模板,PCR扩增CHD4基因候选启动子区2 091 bp片段,以pGL3-Basic为载体,克隆含有CHD4基因候选启动子区的序列,制备重组质粒,并且构建一系列含CHD4基因候选启动子5′侧翼区截短序列质粒。将含CHD4启动子序列的质粒及截短序列质粒转染至Jurkat细胞和人胚胎肾T细胞(HEK293T),双荧光素酶报告基因检测各片段的启动子活性,确定CHD4基因启动子最小活性区域,并通过生物信息学方法分析该区域转录因子结合位点,构建结合位点突变的质粒,通过双荧光素酶报告基因检测,分析结合位点对CHD4转录的影响。结果:流式细胞检测结果发现,与对照组比较,CHD4抑制Jurkat细胞凋亡,转染siRNA-CHD4的Jurkat细胞G0/G1期比例显著升高,而S期比例下降(P<0.01);CCK-8检测CHD4基因对Jurkat细胞的增殖有促进作用(P<0.05);成功构建含有CHD4基因候选启动子序列的质粒及其截短序列质粒,与pGL3-Basic空载体相比,含有CHD4基因候选启动子序列的质粒活性明显增加(P<0.05)。CHD4基因最小活性区域位于转录起始位点-233~-13 bp,其中包含NF-κB、MZF1等转录因子结合位点;NF-κB对CHD4启动子活性具有正向调控作用。结论:CHD4基因对Jurkat细胞凋亡有抑制作用,并且促进其增殖。CHD4最小活性区域位于转录起始位点-233~-13 bp,转录因子NF-κB对CHD4基因启动子活性具有正向调控作用。 展开更多
关键词 急性T细胞淋巴细胞白血病 凋亡 染色质解旋酶dna结合蛋白4(CHD4) 启动子 转录因子
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杜氏盐藻核基质附着区的分离及特征性分析 被引量:1
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作者 王天云 袁保梅 +2 位作者 柴玉荣 王建人 薛乐勋 《广西植物》 CAS CSCD 北大核心 2005年第2期145-148,共4页
采用0.5%TritonX 100破碎细胞,15%Percoll分离盐藻细胞核,25mM二碘水杨酸锂(lithiumdi iodosalicylate,LIS)抽提核蛋白,限制酶消化除去结合松弛的DNA,蛋白酶K SDS处理,酚/氯仿抽提,乙醇 沉淀提取核基质附着DNA,限制酶酶切连至pUC1... 采用0.5%TritonX 100破碎细胞,15%Percoll分离盐藻细胞核,25mM二碘水杨酸锂(lithiumdi iodosalicylate,LIS)抽提核蛋白,限制酶消化除去结合松弛的DNA,蛋白酶K SDS处理,酚/氯仿抽提,乙醇 沉淀提取核基质附着DNA,限制酶酶切连至pUC18载体上构建MARs文库。随机挑选6个克隆进行体外结 合实验筛选,筛选出一能与核基质结合的克隆,测序分析结果表明该序列具明显的MAR序列特征。 展开更多
关键词 核基质附着区 杜氏盐藻 分离 特征性 PERCOLL Triton X-100 PUC18 破碎细胞 25mM 蛋白酶K 乙醇沉淀 MARs 体外结合 序列特征 分析结果 dna 限制酶 细胞核 水杨酸 蛋白 SDS 抽提 筛选 克隆 载体 测序
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藻类基因转录调控研究进展
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作者 魏炜 孟春晓 秦松 《海洋通报》 CAS CSCD 北大核心 2006年第4期78-84,共7页
转录调控是基因表达调控的重要方式。转录调控的研究主要集中在启动子的克隆与分析、反式作用因子(即DNA结合蛋白)的检测及转录量的检测三方面。介绍了基因组步移、凝胶阻滞、酵母双杂交系统、cDNA微阵列等基因转录调控的常用研究方法,... 转录调控是基因表达调控的重要方式。转录调控的研究主要集中在启动子的克隆与分析、反式作用因子(即DNA结合蛋白)的检测及转录量的检测三方面。介绍了基因组步移、凝胶阻滞、酵母双杂交系统、cDNA微阵列等基因转录调控的常用研究方法,并对藻类基因转录调控的最新研究进展进行了评述。 展开更多
关键词 转录调控 顺式作用元件 反式作用因子 启动子 dna结合蛋白 藻类
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基因工程
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《生物技术通报》 CAS CSCD 1995年第6期27-45,共19页
关键词 质粒dna 肠杆菌 启动子 dna片段 基因组dna 寡核苷酸 原生质体 染色体 树干毕赤酵母 dna结合蛋白
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