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原核生物基因组肽编码sORFs分布及功能特征
被引量：
2
1
作者
陈宜亭
张凤
+3 位作者
赵佳
于家峰
沙玉杰
王吉华
《生物化学与生物物理进展》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2018年第1期59-67,共9页
近期,从非编码RNA中发现具有肽编码能力的小开放阅读框(sORFs),激发了人们对这种长期被忽略的基因组元件的研究兴趣,sORFs迅速成为当前重点研究领域.由于表达水平及丰度低、序列短等因素,对肽编码sORFs的有效研究方法及数据资源还很缺乏...
近期,从非编码RNA中发现具有肽编码能力的小开放阅读框(sORFs),激发了人们对这种长期被忽略的基因组元件的研究兴趣,sORFs迅速成为当前重点研究领域.由于表达水平及丰度低、序列短等因素,对肽编码sORFs的有效研究方法及数据资源还很缺乏,现有研究仅集中在少数真核模式生物,对自然界中广泛存在的原核生物研究非常少,肽编码sORFs的发现为目前精准背景下的基因组注释提出严峻挑战.在此背景下,本文首先系统研究了80余种不同类型原核生物中长度小于100个氨基酸的肽编码sORFs分布及功能特征,并对不同长度区间sORFs的序列组成、分布及进化特征进行了对比分析.结果表明,肽编码sORFs在原核生物基因组普遍存在,随着序列长度的降低,其序列复杂度降低,行使的生物功能也相对集中.在此基础上,进一步结合当前肽编码sORFs研究现状,深入总结了肽编码sORFs研究存在的问题及挑战,为今后肽编码sORFs研究奠定了坚实理论基础.
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关键词
小开放阅读框
原核生物基因组注释
蛋白质编码
基因
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职称材料
题名
原核生物基因组肽编码sORFs分布及功能特征
被引量：
2
1
作者
陈宜亭
张凤
赵佳
于家峰
沙玉杰
王吉华
机构
山东省生物物理省级重点实验室德州学院生物物理研究所
德州学院物理与电子信息学院
山东师范大学生命科学院
出处
《生物化学与生物物理进展》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2018年第1期59-67,共9页
基金
国家自然科学基金(61771093
61671107)
山东省自然科学基金重点项目(ZR2016JL027)资助~~
文摘
近期,从非编码RNA中发现具有肽编码能力的小开放阅读框(sORFs),激发了人们对这种长期被忽略的基因组元件的研究兴趣,sORFs迅速成为当前重点研究领域.由于表达水平及丰度低、序列短等因素,对肽编码sORFs的有效研究方法及数据资源还很缺乏,现有研究仅集中在少数真核模式生物,对自然界中广泛存在的原核生物研究非常少,肽编码sORFs的发现为目前精准背景下的基因组注释提出严峻挑战.在此背景下,本文首先系统研究了80余种不同类型原核生物中长度小于100个氨基酸的肽编码sORFs分布及功能特征,并对不同长度区间sORFs的序列组成、分布及进化特征进行了对比分析.结果表明,肽编码sORFs在原核生物基因组普遍存在,随着序列长度的降低,其序列复杂度降低,行使的生物功能也相对集中.在此基础上,进一步结合当前肽编码sORFs研究现状,深入总结了肽编码sORFs研究存在的问题及挑战,为今后肽编码sORFs研究奠定了坚实理论基础.
关键词
小开放阅读框
原核生物基因组注释
蛋白质编码
基因
Keywords
small open reading frame, prokaryotic genome annotation, protein-coding RNA
分类号
Q61 [生物学—生物物理学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
原核生物基因组肽编码sORFs分布及功能特征
陈宜亭
张凤
赵佳
于家峰
沙玉杰
王吉华
《生物化学与生物物理进展》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2018
2
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