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细胞壁缺陷型伤寒沙门菌染色体的PCR-SSCP分析 被引量:1
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作者 黄山 邓小林 +1 位作者 王豫萍 王和 《临床检验杂志》 CAS CSCD 北大核心 2004年第4期282-283,共2页
目的 了解伤寒沙门菌细胞壁缺陷突变株 (CWDMs)的染色体特点 ,探讨伤寒沙门菌CWDMs变异的分子机制。方法 对伤寒沙门菌CWDMs染色体DNA进行特异性PCR扩增及SSCP分析。结果 PCR SSCP显示伤寒沙门菌CWDMs具有与亲代细菌型相同的双链DNA... 目的 了解伤寒沙门菌细胞壁缺陷突变株 (CWDMs)的染色体特点 ,探讨伤寒沙门菌CWDMs变异的分子机制。方法 对伤寒沙门菌CWDMs染色体DNA进行特异性PCR扩增及SSCP分析。结果 PCR SSCP显示伤寒沙门菌CWDMs具有与亲代细菌型相同的双链DNA和一条单链DNA ,但缺少了一条单链DNA。结论 伤寒沙门菌CWDMs仍保留了与其亲代细菌型一致的特异性染色体基因 ,但也发生了染色体基因的突变。 展开更多
关键词 细胞壁缺陷型伤寒沙门菌染色体 PCR-SSCP分析 单链构象多态性分析 培养基
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从椰子上发现10个可分析标记
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作者 余凤玉 《世界热带农业信息》 2007年第9期26-26,共1页
关键词 标记 椰子 单核苷酸多态性 单链构象多态性分析 重复序列 等位基因 栽培品种 连锁不平衡
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琼脂糖凝胶电泳及SSCP法在淋巴瘤克隆性TCRγ基因重排检测中的应用 被引量:3
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作者 韩西群 齐宗利 +1 位作者 贺莉 赵彤 《山东医药》 CAS 北大核心 2009年第42期23-25,共3页
目的比较琼脂糖凝胶电泳和单链构象多态性分析(SSCP)法对淋巴瘤克隆性T细胞受体(TCR)γ基因重排的检测结果,探讨TCRγ基因重排的有效检测方法。方法从T、B细胞淋巴瘤及反应增生性淋巴组织中提取DNA,分别用两组TCRγ基因重排通用引物进行... 目的比较琼脂糖凝胶电泳和单链构象多态性分析(SSCP)法对淋巴瘤克隆性T细胞受体(TCR)γ基因重排的检测结果,探讨TCRγ基因重排的有效检测方法。方法从T、B细胞淋巴瘤及反应增生性淋巴组织中提取DNA,分别用两组TCRγ基因重排通用引物进行PCR扩增,扩增产物分别进行琼脂糖凝胶电泳和SSCP。结果T、B细胞淋巴瘤均出现克隆性TCRγ基因重排。SSCP法两组PCR产物在T细胞淋巴瘤中的阳性率分别为77.6%和75.9%,B细胞淋巴瘤均为10%;与SSCP相比,琼脂糖凝胶电泳中两组PCR扩增产物的假阳性率分别为15.3%和14.4%,所有反应增生性淋巴组织均出现假阳性。结论T、B细胞淋巴瘤中都存在克隆性TCRγ基因重排,仅用琼脂糖凝胶电泳检测可能出现假阳性,SSCP灵敏性较高。 展开更多
关键词 T细胞受体γ基因 基因重排 淋巴瘤 琼脂糖凝胶电泳 单链构象多态性分析
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鳜胰蛋白酶基因外显子3上SNP G169A位点鉴定和四种不同检测方法的比较 被引量:1
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作者 于海静 梁旭方 +2 位作者 方荣 彭敏燕 朱滔 《淡水渔业》 CSCD 北大核心 2011年第6期9-14,共6页
采用PCR产物直接测序法(DS)对鳜(Siniperca chuatsi)胰蛋白酶基因(TRY)进行单核苷酸多态性(SNPs)分析,发现外显子3上的G169A多态性。对312个样品进行分析,共发现三种基因型GG、GA、AA,其基因型频率分别为0.26、0.54、0.20,两个等位基因G... 采用PCR产物直接测序法(DS)对鳜(Siniperca chuatsi)胰蛋白酶基因(TRY)进行单核苷酸多态性(SNPs)分析,发现外显子3上的G169A多态性。对312个样品进行分析,共发现三种基因型GG、GA、AA,其基因型频率分别为0.26、0.54、0.20,两个等位基因G和A的基因频率分别为0.53和0.47。用创造限制性酶切位点法PCR(CRS-PCR)、单管双向等位基因专一性扩增(SB-ASA)和单链构象多态性分析(PCR-SSCP)对该SNP位点进行验证。结果表明,CRS-PCR法不能对该SNP位点分型,PCR-SSCP和SB-ASA法可以且准确度分别为100%和96.67%。 展开更多
关键词 单核苷酸多态性 直接测序法 单链构象多态性分析 单管双向等位基因专一性扩增法 创造限制酶切位点法
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PCR-SSCP法检测结核分枝杆菌L型rpsL耐药基因 被引量:1
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作者 陆军 叶松 金强 《临床检验杂志》 CAS CSCD 北大核心 2007年第2期107-108,共2页
目的探索尘肺结核患者感染的结核分枝杆菌(MT)L型的耐药基因rpsL突变与耐受链霉素(SM)的关系。方法用PCR-SSCP方法检测rpsL基因,与采用常规SM药敏试验(AST法)的结果进行对比分析。结果采用AST法检测,52株结核分枝杆菌L型临床分离株中共... 目的探索尘肺结核患者感染的结核分枝杆菌(MT)L型的耐药基因rpsL突变与耐受链霉素(SM)的关系。方法用PCR-SSCP方法检测rpsL基因,与采用常规SM药敏试验(AST法)的结果进行对比分析。结果采用AST法检测,52株结核分枝杆菌L型临床分离株中共有26株(50.0%)耐SM;PCR-SSCP法检出rpsL基因突变率为40.4%(21/52),2种方法检测耐药株的符合率为80.8%。结论结核杆菌L型对SM的耐药与rpsL基因突变有关。 展开更多
关键词 尘肺 结核分枝杆菌L型 耐药 RPSL基因 聚合酶链反应-单链构象多态性分析
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32例肿瘤组织中p53基因突变的PCR-SSCP、银染色检测
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作者 王武康 邵茵 +1 位作者 张亚男 程建青 《江南大学学报(自然科学版)》 CAS 2002年第3期316-319,共4页
目的 检测肿瘤组织中 p5 3基因的突变率 ,探索其在肿瘤发展过程中的作用 .建立PCR SSCP检测 p5 3突变的常规方法 .方法 检测 32例癌组织和癌旁组织 .用盐沉淀制备样品DNA ,以p5 3基因exon7设计引物 ,用PCR SSCP结合银染色显示结果 .... 目的 检测肿瘤组织中 p5 3基因的突变率 ,探索其在肿瘤发展过程中的作用 .建立PCR SSCP检测 p5 3突变的常规方法 .方法 检测 32例癌组织和癌旁组织 .用盐沉淀制备样品DNA ,以p5 3基因exon7设计引物 ,用PCR SSCP结合银染色显示结果 .结果  32例肿瘤标本检出阳性 9例 ,阳性率 2 8.1% .4例癌组织和癌旁组织均为阳性 .其中 2 2例胃癌 ,检出 4例阳性 (占 18.2 % ) ,双阳性者 2例 .结论 p5 3基因突变在肿瘤中具有普遍性 ,癌组织和癌旁组织双阳性者 ,与肿瘤的扩散有关 .该检测方法简便易行 ,有助于对 p5 3基因突变的扫描检测 . 展开更多
关键词 肿瘤组织 基因突变 PCR-SSCP P53基因 聚合酶链反应-单链构象多态性分析 银染色 肿瘤诊断 突变检测
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遗传性牙龈纤维瘤病致病基因的排除性定位
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作者 孟秀萍 于海霞 +3 位作者 张培因 王万成 申玉芹 张鹏 《口腔医学研究》 CAS CSCD 2004年第5期517-520,共4页
目的 :对我国现有的 2例家族遗传性牙龈纤维瘤病进行国外已证实的已知基因突变位点 - -SOS1基因2 1号外显子的排除性定位。方法 :采用PCR -SSCP -银染的方法对 2例遗传性牙龈纤维瘤病家系的致病基因进行排除性定位。结果 :两家系中均未... 目的 :对我国现有的 2例家族遗传性牙龈纤维瘤病进行国外已证实的已知基因突变位点 - -SOS1基因2 1号外显子的排除性定位。方法 :采用PCR -SSCP -银染的方法对 2例遗传性牙龈纤维瘤病家系的致病基因进行排除性定位。结果 :两家系中均未发现SOS1基因的缺失。 5 %的聚丙烯酰胺凝胶电泳结果表明两家系中无典型临床表现者电泳条带无明显的异常 ,而有典型临床表现者发现家系 1有 4例患者的电泳条带有明显位移 ,条带离加样孔较正常对照近 ,家系 2有 2例患者的电泳条带有明显位移 ,但条带离加样孔较正常对照远。结论 :两家系无典型临床表现者无SOS1基因的突变 ,有典型临床表现者存在有SOS1基因 2 1号外显子的突变 ,但是 ,是否所有有典型临床症状的患者其基因突变的位置及涉及的碱基片段都相同还需进一步研究。 展开更多
关键词 遗传性牙龈纤维瘤病 聚合酶链反应-单链构象多态性分析 基因突变 SOS1基因
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p53基因第7、8外显子突变与广西肝癌家族聚集遗传易感性的关系 被引量:5
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作者 于冰雪 吴健林 +3 位作者 吴继周 龚婷婷 王尊付 钟彬 《山东医药》 CAS 北大核心 2016年第38期23-25,共3页
目的探讨p53基因第7、8外显子突变(exon7/exon8)与广西肝癌高发区肝癌家族聚集遗传易感性的关系。方法依配对方法选择广西肝癌高发区肝癌高发家族、肝癌单发家族和无癌家族中未发生肝癌的家族成员各123例为家族组,同时选择广西肝癌高发... 目的探讨p53基因第7、8外显子突变(exon7/exon8)与广西肝癌高发区肝癌家族聚集遗传易感性的关系。方法依配对方法选择广西肝癌高发区肝癌高发家族、肝癌单发家族和无癌家族中未发生肝癌的家族成员各123例为家族组,同时选择广西肝癌高发区内30例肝癌患者作为肝癌组。控制HBV、HCV感染及环境因素后,应用聚合酶链式反应-单链构象多态性分析结合基因测序的方法筛查p53基因exon7/exon8突变情况。结果肝癌组p53基因exon7/exon8总突变率为13.3%(4/30),家族组exon7/exon8总突变率为0,P<0.05。结果 p53基因exon7/exon8突变可能不是广西肝癌高发区肝癌家族聚集的遗传易感因素。 展开更多
关键词 原发性肝癌 家族聚集性 P53基因 基因突变 聚合酶链式反应-单链构象多态性分析 广西
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Mutations of mitochondrion DNA in mouse tumors
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作者 Dai Jigang Zhang Zaiyong Xiao Yingbin Min Jiaxin 《Journal of Medical Colleges of PLA(China)》 CAS 2010年第6期341-350,共10页
Objective: To ascertain the variations of mitochondrion DNA (mtDNA) in mouse tumors and to inquire into the relationship between mutations of mtDNA and carcinogenesis Methods: The variations of D-loop, ND3 and tRN... Objective: To ascertain the variations of mitochondrion DNA (mtDNA) in mouse tumors and to inquire into the relationship between mutations of mtDNA and carcinogenesis Methods: The variations of D-loop, ND3 and tRNA^Met+Glu+Ile gene fragments of mtDNA from six tumor cell lines of mice were analyzed by PCR technology with restriction fragment length polymorphism analysis (polymerase chain reaction-restriction fragment length polymorphism, PCR-RFLP) and single strand conformation polymorphism analysis (SSCP-PCR) method. Results: ND3 and tRNA^Met+Glu+Ile gene fragments ofmtDNA from the tumors showed no variation in 27 endonuclease sites; D-loop ofmtDNA from Hca-F had an additional endonuclease sites of Hinf I in contrast to that of the inbred mouse. Deeply analyzed by PCR-SSCP, the D-loop ofmtDNA was found to possess mutations in 4 of 6 tumors. Conclusion: D-loop is the hot spot of tumor mtDNA mutation which can act as contributors to the carcinogenic 展开更多
关键词 Mitochondrial DNA Tumor cell lines MUTATION D-LOOP
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