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单细胞全基因组扩增技术与应用
被引量:
5
1
作者
徐晓丽
吴凌娟
鄢仁祥
《生物化学与生物物理进展》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2019年第4期342-352,共11页
同一组织中的细胞往往具有类似的结构和功能,然而通过对单个细胞进行测序分析后,发现每个细胞都具有一定异质性.单细胞全基因组扩增技术是进行单细胞测序的前提,该技术可用于揭示单细胞基因组结构差异,同时在肿瘤研究、发育生物学、微...
同一组织中的细胞往往具有类似的结构和功能,然而通过对单个细胞进行测序分析后,发现每个细胞都具有一定异质性.单细胞全基因组扩增技术是进行单细胞测序的前提,该技术可用于揭示单细胞基因组结构差异,同时在肿瘤研究、发育生物学、微生物学等研究中发挥重要作用,并成为生命科学研究技术的热点之一.单细胞全基因组扩增技术的难点在于单细胞的分离和全基因组的扩增.本文介绍了单细胞全基因组扩增技术中常用的单细胞分离技术和单细胞全基因组扩增技术,并对各技术间的优缺点进行比较,同时着重讨论该技术在肿瘤研究、发育生物学和微生物学研究中的应用.
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关键词
单细胞分离技术
单细胞
全基因组扩增
技术
比较
应用
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职称材料
单细胞测序技术及其在毛囊发育中的应用
2
作者
叶娜
张晓兰
+3 位作者
包鹏甲
王兴东
阎萍
潘和平
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第10期245-256,共12页
毛囊是一种具有独特结构的、呈周期性生长的微型器官,其形态发生始于胚胎期,由表皮上皮、间质真皮及特殊衍生物经过一系列相互作用诱导形成。出生后个体的毛囊开始进行周期性循环,包括生长期、退行期和休止期。单细胞转录组测序(single-...
毛囊是一种具有独特结构的、呈周期性生长的微型器官,其形态发生始于胚胎期,由表皮上皮、间质真皮及特殊衍生物经过一系列相互作用诱导形成。出生后个体的毛囊开始进行周期性循环,包括生长期、退行期和休止期。单细胞转录组测序(single-cell RNA sequence,scRNA-seq)是一种新的测序方法,通过制备单细胞悬液或细胞群,利用二代测序(next generation sequencing)来识别单个细胞的基因表达信息,主要用于分析细胞间遗传和基因表达水平的差异,更好地了解单个细胞在微环境中的具体作用。通过单细胞转录组测序可以揭示复杂和稀有细胞群体以及基因之间的调节关系,跟踪不同细胞谱系在发育过程中的轨迹。本文就单细胞转录组测序技术及其在毛囊发育调控研究中的应用展开叙述,以期为揭示毛囊发育的分子调控机制研究提供理论参考。
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关键词
单细胞
转录组测序
单细胞分离技术
毛囊发育
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职称材料
早期流产组织冰冻切片中胚胎成分的分离检验
被引量:
2
3
作者
李艮平
李彩霞
+4 位作者
郝建文
胡兰
万立华
韩俊平
杨帆
《激光杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2012年第3期79-81,共3页
目的:建立激光捕获显微切割技术与低体积扩增技术联用,进行冰冻切片上胚胎与母体成分DNA的分离检验技术。方法:制备早期流产组织冰冻切片,通过激光捕获显微切割胚胎绒毛细胞,设置10,20,30个细胞数目梯度,比较各组胚胎成分DNA的STR分型...
目的:建立激光捕获显微切割技术与低体积扩增技术联用,进行冰冻切片上胚胎与母体成分DNA的分离检验技术。方法:制备早期流产组织冰冻切片,通过激光捕获显微切割胚胎绒毛细胞,设置10,20,30个细胞数目梯度,比较各组胚胎成分DNA的STR分型的检出率、等位基因丢失率和非特异性扩增情况。最后进行实际样本应用。结果:捕获10个胚胎绒毛细胞即可获得Identifier试剂完整的STR分型。冰冻切片捕获30个细胞数目组的检出率较高,等位基因丢失率和非特异性扩增率较低。结论:激光捕获显微切割技术联用低体积扩增技术可应用于胚胎与母体成分DNA的精确分离和检验。
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关键词
法医物证学
流产绒毛
冰冻切片
单细胞
分离
检验
技术
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职称材料
3种碱性染液对显微捕获联合低体积扩增技术的影响
被引量:
1
4
作者
朱典
万立华
+3 位作者
胡兰
李彩霞
韩俊萍
郝建文
《重庆医科大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2011年第5期589-591,共3页
目的:比较3种碱性染液对显微捕获联合低体积扩增(Lowvolume polymerase chain reaction,LVPCR)技术的影响,为细胞分离检验中细胞核标记物的选择提供依据。方法:显微捕获联合LVPCR中,用苏木素、龙胆紫、亚甲基蓝3种染液对口腔上皮细胞进...
目的:比较3种碱性染液对显微捕获联合低体积扩增(Lowvolume polymerase chain reaction,LVPCR)技术的影响,为细胞分离检验中细胞核标记物的选择提供依据。方法:显微捕获联合LVPCR中,用苏木素、龙胆紫、亚甲基蓝3种染液对口腔上皮细胞进行标识。参照龙胆紫染色法,比较0.5、1、2、5、8μl苏木素染液及2、5、8、10、15μl亚甲基蓝染液的染色效果,优化染色条件;并比较优化后的细胞核标识效果。显微操作仪捕获3种染液染色后的细胞进行DNA检验,比较检测结果;并捕获染色10、30、60 min口腔上皮细胞,比较染色时间对DNA检测结果的影响。结果:100μl口腔上皮细胞悬液加入2μl苏木素、0.5μl龙胆紫或5μl亚甲基蓝染液,细胞核均着色明显,与胞浆对比清晰。5个细胞的分离检验结果示有效分型率分别为90%、100%、66.7%,成功分型率为20%、100%、11.1%;龙胆紫、苏木素染色时间(≤60 min)对DNA检测结果无明显影响,而亚甲基蓝染色时间延长导致等位基因丢失等现象加重,影响检测结果。结论:3种染液均可清晰标识细胞核;而龙胆紫染液对LVPCR技术抑制最弱,为三者中较优的细胞核标记物。
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关键词
法医物证学
碱性染料
低体积扩增
显微捕获
单细胞
分离
检验
技术
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职称材料
题名
单细胞全基因组扩增技术与应用
被引量:
5
1
作者
徐晓丽
吴凌娟
鄢仁祥
机构
福州大学生物科学与工程学院
出处
《生物化学与生物物理进展》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2019年第4期342-352,共11页
基金
国家自然科学基金(31500673)资助项目~~
文摘
同一组织中的细胞往往具有类似的结构和功能,然而通过对单个细胞进行测序分析后,发现每个细胞都具有一定异质性.单细胞全基因组扩增技术是进行单细胞测序的前提,该技术可用于揭示单细胞基因组结构差异,同时在肿瘤研究、发育生物学、微生物学等研究中发挥重要作用,并成为生命科学研究技术的热点之一.单细胞全基因组扩增技术的难点在于单细胞的分离和全基因组的扩增.本文介绍了单细胞全基因组扩增技术中常用的单细胞分离技术和单细胞全基因组扩增技术,并对各技术间的优缺点进行比较,同时着重讨论该技术在肿瘤研究、发育生物学和微生物学研究中的应用.
关键词
单细胞分离技术
单细胞
全基因组扩增
技术
比较
应用
Keywords
ingle cell separation technique
single cell whole genome amplification technique
comparison
application
分类号
Q78 [生物学—分子生物学]
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职称材料
题名
单细胞测序技术及其在毛囊发育中的应用
2
作者
叶娜
张晓兰
包鹏甲
王兴东
阎萍
潘和平
机构
西北民族大学生命科学与工程学院
中国农业科学院兰州畜牧与兽药研究所甘肃省牦牛繁育工程重点实验室
出处
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第10期245-256,共12页
基金
国家自然科学基金地区科学基金项目(31660636)。
文摘
毛囊是一种具有独特结构的、呈周期性生长的微型器官,其形态发生始于胚胎期,由表皮上皮、间质真皮及特殊衍生物经过一系列相互作用诱导形成。出生后个体的毛囊开始进行周期性循环,包括生长期、退行期和休止期。单细胞转录组测序(single-cell RNA sequence,scRNA-seq)是一种新的测序方法,通过制备单细胞悬液或细胞群,利用二代测序(next generation sequencing)来识别单个细胞的基因表达信息,主要用于分析细胞间遗传和基因表达水平的差异,更好地了解单个细胞在微环境中的具体作用。通过单细胞转录组测序可以揭示复杂和稀有细胞群体以及基因之间的调节关系,跟踪不同细胞谱系在发育过程中的轨迹。本文就单细胞转录组测序技术及其在毛囊发育调控研究中的应用展开叙述,以期为揭示毛囊发育的分子调控机制研究提供理论参考。
关键词
单细胞
转录组测序
单细胞分离技术
毛囊发育
Keywords
single-cell RNA sequencing
single cell isolation technique
hair follicle development
分类号
Q344 [生物学—遗传学]
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职称材料
题名
早期流产组织冰冻切片中胚胎成分的分离检验
被引量:
2
3
作者
李艮平
李彩霞
郝建文
胡兰
万立华
韩俊平
杨帆
机构
重庆医科大学
公安部物证鉴定中心
去医遗传学公安部重点实验室
重庆市公安局
中国人民公安大学
出处
《激光杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2012年第3期79-81,共3页
文摘
目的:建立激光捕获显微切割技术与低体积扩增技术联用,进行冰冻切片上胚胎与母体成分DNA的分离检验技术。方法:制备早期流产组织冰冻切片,通过激光捕获显微切割胚胎绒毛细胞,设置10,20,30个细胞数目梯度,比较各组胚胎成分DNA的STR分型的检出率、等位基因丢失率和非特异性扩增情况。最后进行实际样本应用。结果:捕获10个胚胎绒毛细胞即可获得Identifier试剂完整的STR分型。冰冻切片捕获30个细胞数目组的检出率较高,等位基因丢失率和非特异性扩增率较低。结论:激光捕获显微切割技术联用低体积扩增技术可应用于胚胎与母体成分DNA的精确分离和检验。
关键词
法医物证学
流产绒毛
冰冻切片
单细胞
分离
检验
技术
Keywords
forensic genetic
chorionic villi
frozen section slide
single- cell separation technique
分类号
R89 [医药卫生—法医学]
在线阅读
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职称材料
题名
3种碱性染液对显微捕获联合低体积扩增技术的影响
被引量:
1
4
作者
朱典
万立华
胡兰
李彩霞
韩俊萍
郝建文
机构
重庆医科大学基础医学院法医学教研室
公安部物证鉴定中心法医遗传学重点实验室
中国人民公安大学刑事科学技术系
重庆市公安局技术处法医科
出处
《重庆医科大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2011年第5期589-591,共3页
基金
"十一.五"国家科技支撑计划资助项目(编号:2006BAK07B01)
文摘
目的:比较3种碱性染液对显微捕获联合低体积扩增(Lowvolume polymerase chain reaction,LVPCR)技术的影响,为细胞分离检验中细胞核标记物的选择提供依据。方法:显微捕获联合LVPCR中,用苏木素、龙胆紫、亚甲基蓝3种染液对口腔上皮细胞进行标识。参照龙胆紫染色法,比较0.5、1、2、5、8μl苏木素染液及2、5、8、10、15μl亚甲基蓝染液的染色效果,优化染色条件;并比较优化后的细胞核标识效果。显微操作仪捕获3种染液染色后的细胞进行DNA检验,比较检测结果;并捕获染色10、30、60 min口腔上皮细胞,比较染色时间对DNA检测结果的影响。结果:100μl口腔上皮细胞悬液加入2μl苏木素、0.5μl龙胆紫或5μl亚甲基蓝染液,细胞核均着色明显,与胞浆对比清晰。5个细胞的分离检验结果示有效分型率分别为90%、100%、66.7%,成功分型率为20%、100%、11.1%;龙胆紫、苏木素染色时间(≤60 min)对DNA检测结果无明显影响,而亚甲基蓝染色时间延长导致等位基因丢失等现象加重,影响检测结果。结论:3种染液均可清晰标识细胞核;而龙胆紫染液对LVPCR技术抑制最弱,为三者中较优的细胞核标记物。
关键词
法医物证学
碱性染料
低体积扩增
显微捕获
单细胞
分离
检验
技术
Keywords
forensic genetic
basic dyes
LVPCR
testing technique of micromanipulation method of single cell
分类号
R89 [医药卫生—法医学]
D919.2 [医药卫生—法医学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
单细胞全基因组扩增技术与应用
徐晓丽
吴凌娟
鄢仁祥
《生物化学与生物物理进展》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2019
5
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
单细胞测序技术及其在毛囊发育中的应用
叶娜
张晓兰
包鹏甲
王兴东
阎萍
潘和平
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2021
0
在线阅读
下载PDF
职称材料
3
早期流产组织冰冻切片中胚胎成分的分离检验
李艮平
李彩霞
郝建文
胡兰
万立华
韩俊平
杨帆
《激光杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2012
2
在线阅读
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职称材料
4
3种碱性染液对显微捕获联合低体积扩增技术的影响
朱典
万立华
胡兰
李彩霞
韩俊萍
郝建文
《重庆医科大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2011
1
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职称材料
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