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人类肿瘤组织线粒体基因D310区域的单核苷酸重复序列变异
被引量：
4
1
作者
谭端军
刘玲玲
+4 位作者
卢才义
刘鹏
Julia Chang
Kun-Tu Yeh
LeeJun C Wong
《实用医学杂志》
CAS
2003年第11期1187-1190,共4页
目的 :拟对线粒体基因D环区的一个特异和高度多态性的D3 10多聚C区域的变异情况进行评估。方法 :对 14 9例肿瘤组织和匹配的正常组织的线粒体基因D环区进行PCR扩增 ,并同时进行时相温度梯度凝胶电泳扫描和D3 10区域的序列测定。结果 :43...
目的 :拟对线粒体基因D环区的一个特异和高度多态性的D3 10多聚C区域的变异情况进行评估。方法 :对 14 9例肿瘤组织和匹配的正常组织的线粒体基因D环区进行PCR扩增 ,并同时进行时相温度梯度凝胶电泳扫描和D3 10区域的序列测定。结果 :43个 (2 8 86% )肿瘤具有D3 10单核苷酸重复区的体细胞性插入或缺失突变 ,其中绝大部分为 1 2bp插入或缺失 ,与以前报道的该区域多态性变化一致。约 3 4 9%肿瘤组织中的突变为同质状态 ,65 1%处于异质状态。结论 :线粒体基因D3 10单核苷酸重复区变异在人类肿瘤组织中是一个常见的现象。
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关键词
肿瘤组织
线粒体
基因
D310区域
单核苷酸重复序列
变异
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职称材料
2006-2016年贵州省炭疽芽胞杆菌SNR分型分析
被引量：
2
2
作者
马青
杨平
+4 位作者
刘英
王月
聂炜
姚光海
李世军
《中国人兽共患病学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第3期230-235,共6页
目的对贵州省2006-2016年分离的炭疽芽胞杆菌进行单核苷酸重复序列分型分析(SNR),了解菌株SNR型别特征,为炭疽疫情监测、调查与溯源提供技术手段和科学依据。方法提取贵州省2006-2016年间不同地区的炭疽芽胞杆菌菌株基因组DNA,应用SNR...
目的对贵州省2006-2016年分离的炭疽芽胞杆菌进行单核苷酸重复序列分型分析(SNR),了解菌株SNR型别特征,为炭疽疫情监测、调查与溯源提供技术手段和科学依据。方法提取贵州省2006-2016年间不同地区的炭疽芽胞杆菌菌株基因组DNA,应用SNR各位点引物进行PCR扩增,将扩增产物进行毛细管电泳分析获得各位点序列长度。运用Bionumerics 7.6软件将扩增长度片段信息进行聚类分析获得各菌株SNR型别并构建最小间距图。结果来自贵州省2006-2016年间的71株炭疽芽胞杆菌被分为37个SNR型;聚类分析显示,71株菌株被分为A和B两群,其中A群共有27个分支,又可分为A1和A2两个亚群;B群共有10个分支,可分为B1和B2两个亚群。最小间距图显示,71株菌株被分别为7个SNR克隆群(complex)和5个单一的SNR型(singleton)。结论来自贵州省2006-2016年间的71株炭疽芽胞杆菌共分为37个SNR型,SNR型别具有多样性;SNR分子分型方法对炭疽芽胞杆菌分型具有高分辨率的特点,SNR型别分布与菌株的时间和地域分布具有一定相关性。
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关键词
炭疽
炭疽芽胞杆菌
单核苷酸重复序列
分析
聚类分析
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职称材料
题名
人类肿瘤组织线粒体基因D310区域的单核苷酸重复序列变异
被引量：
4
1
作者
谭端军
刘玲玲
卢才义
刘鹏
Julia Chang
Kun-Tu Yeh
LeeJun C Wong
机构
解放军总医院老年心血管病研究所
彰化基督教医院
乔治城大学医学中心分子与人类遗传研究所
出处
《实用医学杂志》
CAS
2003年第11期1187-1190,共4页
文摘
目的 :拟对线粒体基因D环区的一个特异和高度多态性的D3 10多聚C区域的变异情况进行评估。方法 :对 14 9例肿瘤组织和匹配的正常组织的线粒体基因D环区进行PCR扩增 ,并同时进行时相温度梯度凝胶电泳扫描和D3 10区域的序列测定。结果 :43个 (2 8 86% )肿瘤具有D3 10单核苷酸重复区的体细胞性插入或缺失突变 ,其中绝大部分为 1 2bp插入或缺失 ,与以前报道的该区域多态性变化一致。约 3 4 9%肿瘤组织中的突变为同质状态 ,65 1%处于异质状态。结论 :线粒体基因D3 10单核苷酸重复区变异在人类肿瘤组织中是一个常见的现象。
关键词
肿瘤组织
线粒体
基因
D310区域
单核苷酸重复序列
变异
分类号
R73-3 [医药卫生—肿瘤]
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职称材料
题名
2006-2016年贵州省炭疽芽胞杆菌SNR分型分析
被引量：
2
2
作者
马青
杨平
刘英
王月
聂炜
姚光海
李世军
机构
贵州省疾病预防控制中心
贵州省铜仁市碧江区坝黄镇人民政府
出处
《中国人兽共患病学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第3期230-235,共6页
基金
贵州省科技创新人才团队项目[No.(2018)5606]
贵州省高层次创新型人才培养项目[No.(2016)4021号]
贵州省卫生计生委科学基金项目(No.Gzwjkj2018G1G076)。
文摘
目的对贵州省2006-2016年分离的炭疽芽胞杆菌进行单核苷酸重复序列分型分析(SNR),了解菌株SNR型别特征,为炭疽疫情监测、调查与溯源提供技术手段和科学依据。方法提取贵州省2006-2016年间不同地区的炭疽芽胞杆菌菌株基因组DNA,应用SNR各位点引物进行PCR扩增,将扩增产物进行毛细管电泳分析获得各位点序列长度。运用Bionumerics 7.6软件将扩增长度片段信息进行聚类分析获得各菌株SNR型别并构建最小间距图。结果来自贵州省2006-2016年间的71株炭疽芽胞杆菌被分为37个SNR型;聚类分析显示,71株菌株被分为A和B两群,其中A群共有27个分支,又可分为A1和A2两个亚群;B群共有10个分支,可分为B1和B2两个亚群。最小间距图显示,71株菌株被分别为7个SNR克隆群(complex)和5个单一的SNR型(singleton)。结论来自贵州省2006-2016年间的71株炭疽芽胞杆菌共分为37个SNR型,SNR型别具有多样性;SNR分子分型方法对炭疽芽胞杆菌分型具有高分辨率的特点,SNR型别分布与菌株的时间和地域分布具有一定相关性。
关键词
炭疽
炭疽芽胞杆菌
单核苷酸重复序列
分析
聚类分析
Keywords
anthrax
Bacillus anthrax
single-nucleotide repeat analysis
clustering analysis
分类号
R378.7 [医药卫生—病原生物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
人类肿瘤组织线粒体基因D310区域的单核苷酸重复序列变异
谭端军
刘玲玲
卢才义
刘鹏
Julia Chang
Kun-Tu Yeh
LeeJun C Wong
《实用医学杂志》
CAS
2003
4
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
2006-2016年贵州省炭疽芽胞杆菌SNR分型分析
马青
杨平
刘英
王月
聂炜
姚光海
李世军
《中国人兽共患病学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021
2
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