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Micro-Tom番茄矮化微型机制及其在植物功能基因组学研究中的应用 被引量:23
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作者 刘小花 张岚岚 +2 位作者 朱长青 陈昆松 徐昌杰 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2008年第10期1257-1264,共8页
Micro-Tom番茄植株矮小,生长密度高,生命周期短,容易被高效转化,成为功能基因组学研究的新型模式植物。文章对Micro-Tom的由来和生物学特征作了概述,重点阐述了Micro-Tom矮化微型的遗传机制以及该番茄在功能基因组学研究中的应用和遗传... Micro-Tom番茄植株矮小,生长密度高,生命周期短,容易被高效转化,成为功能基因组学研究的新型模式植物。文章对Micro-Tom的由来和生物学特征作了概述,重点阐述了Micro-Tom矮化微型的遗传机制以及该番茄在功能基因组学研究中的应用和遗传转化体系研究的进展。 展开更多
关键词 Micro-Tom番茄 矮化微型 功能基因组学 遗传转化
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功能基因组学的研究内容与方法 被引量:33
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作者 赵剑华 王秀琴 +1 位作者 刘芝华 吴旻 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2000年第1期6-8,共3页
基因组学的研究已从结构基因组学转向功能基因组学.综述了功能基因组学研究的内容和方法,主要包括应用微点阵、基因表达系列分析(SAGE)、蛋白质组、生物信息学等方法来研究基因组表达概况、基因组多样性。
关键词 人类基因组计划 功能基因组学 生物信息
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功能基因组学和代谢组学技术在植物次生代谢物合成及调控研究中的应用 被引量:10
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作者 王莉 张艳霞 +1 位作者 史玲玲 刘玉军 《北京林业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第5期153-159,共7页
植物次生代谢是植物在长期进化过程中与环境相互作用的结果,由初生代谢派生.萜类、生物碱类、苯丙烷类为植物次生代谢物的主要类型,其代谢途径多以代谢频道形式存在,具有种属、生长发育期等特异性.该文从植物次生代谢物的分类、代谢途... 植物次生代谢是植物在长期进化过程中与环境相互作用的结果,由初生代谢派生.萜类、生物碱类、苯丙烷类为植物次生代谢物的主要类型,其代谢途径多以代谢频道形式存在,具有种属、生长发育期等特异性.该文从植物次生代谢物的分类、代谢途径及代谢调控基因工程等方面展开论述,介绍了次生代谢物的生物合成途径,以及利用基因工程等技术对植物次生代谢途径进行遗传改良等方面的研究进展,为全面认识植物代谢网络、合理定位次生代谢及其关键酶、促进野生植物资源可持续利用等提供理论依据. 展开更多
关键词 次生代谢 次生代谢物 合成及调控 限速酶 功能基因组学 代谢组
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植物转座子及其在功能基因组学中的应用 被引量:21
4
作者 廖鸣娟 董爱华 +1 位作者 王正栋 朱睦元 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2000年第5期345-348,共4页
转座子作为插入突变原或分子标签被广泛应用于基因的分离和克隆,且因其独特的性质已成为发现新基因和基因功能分析的有效工具。本文综述了植物转座子及其作为基因分离和克隆工具的研究进展,并讨论其在植物基因功能研究方面的应用。
关键词 植物 转座子标签 转座子捕捉 功能基因组学
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功能基因组学与代谢工程:微生物菌种改进与生物过程优化 被引量:9
5
作者 陈洵 周世奇 +3 位作者 陈涛 王庆昭 邹少兰 赵学明 《化工学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2006年第8期1792-1801,共10页
代谢工程是用现代基因工程技术对细胞性质进行改进.代谢工程包括3个重要步骤:细胞途径的修饰(合成),修饰后细胞表型的严格评价(表型表征),根据评价结果设计进一步的修饰(优化设计).其中“组学”技术(基因组学、转录物组学、蛋白质组学... 代谢工程是用现代基因工程技术对细胞性质进行改进.代谢工程包括3个重要步骤:细胞途径的修饰(合成),修饰后细胞表型的严格评价(表型表征),根据评价结果设计进一步的修饰(优化设计).其中“组学”技术(基因组学、转录物组学、蛋白质组学、代谢物组学、代谢通量组学等)在表型表征中起着极为重要的作用.此外,由于细胞的性质不仅与其基因组密切相关,而且也与细胞所处的微观及宏观环境条件(底物种类与浓度、pH、温度、溶氧、生物反应器的混合与传递特性等)密切相关,因此在菌种改进过程中就要密切结合这些实际的环境条件对所得的菌株用上述“组学”技术进行表型表征,从而使所开发的代谢工程菌株满足包括环境条件影响在内的整个生物加工过程优化的需要.本文结合国际上的发展及作者的研究实践,综述了近几年基于功能基因组学的代谢工程研究发展情况. 展开更多
关键词 功能基因组学 代谢工程 基因组 转录物组 蛋白质组 代谢物组 通量组 生物过程
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苔藓植物小立碗藓,功能基因组学研究新的模式系统 被引量:7
6
作者 董文 李卫 +1 位作者 郭光沁 郑国錩 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2004年第4期560-566,共7页
苔藓植物具有相对简单的发育模式,单倍体的配子体在其生活史中占主导地位,作为研究植物生物学过程的模式系统具有诸多的优越性。苔藓植物小立碗藓能够高效地通过同源重组的方式将外源核酸整合到其核DNA,这就使得基因打靶在此物种中就像... 苔藓植物具有相对简单的发育模式,单倍体的配子体在其生活史中占主导地位,作为研究植物生物学过程的模式系统具有诸多的优越性。苔藓植物小立碗藓能够高效地通过同源重组的方式将外源核酸整合到其核DNA,这就使得基因打靶在此物种中就像在小鼠胚胎干细胞和酵母中一样成为一个非常便利的技术。另外由于小立碗藓与高等植物在生物特征上有很大相似之处加之具有其他诸多优越性,它有望成为一个诱人的植物生物学和功能基因组学研究的模式系统。 展开更多
关键词 功能基因组学 反求遗传 基因打靶 模式系统 苔藓植物 小立碗藓
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奶牛乳房炎相关基因的功能基因组学研究进展 被引量:10
7
作者 曹随忠 杜立新 赵兴绪 《甘肃农业大学学报》 CAS CSCD 2004年第3期229-234,共6页
功能基因组学是在基因组水平上系统、全面的分析基因的功能,主要研究技术有差异显示反转录PCR、表达序列标签、基因表达系列分析、微阵列、RNA干涉、蛋白质组学及生物信息学等。综述了功能基因组学主要研究技术及其在奶牛乳房炎相关基... 功能基因组学是在基因组水平上系统、全面的分析基因的功能,主要研究技术有差异显示反转录PCR、表达序列标签、基因表达系列分析、微阵列、RNA干涉、蛋白质组学及生物信息学等。综述了功能基因组学主要研究技术及其在奶牛乳房炎相关基因的表达、抗性候选基因的鉴定、病原菌蛋白质组学、基因治疗等方面的应用研究进展。 展开更多
关键词 奶牛 乳房炎 功能基因组学 基因表达
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植物反转录转座子及其在功能基因组学中的应用 被引量:30
8
作者 唐益苗 马有志 《植物遗传资源学报》 CAS CSCD 2005年第2期221-225,共5页
高等植物中的反转录转座子是构成植物基因组的重要成分之一。它分病毒家族和非病毒家族两类,病毒家族包括反转录病毒和类似于反转录病毒的非病毒转座子,病毒家族中的反转录转座子可再细分为Ty3 gypsy类和Ty1 copia类;非病毒家族可细分为... 高等植物中的反转录转座子是构成植物基因组的重要成分之一。它分病毒家族和非病毒家族两类,病毒家族包括反转录病毒和类似于反转录病毒的非病毒转座子,病毒家族中的反转录转座子可再细分为Ty3 gypsy类和Ty1 copia类;非病毒家族可细分为LINE类和SINE类。正常情况下大部分反转录转座子不具有活性,某些生物或非生物因素胁迫可激活部分反转录转座子转座。反转录转座子自身编码反转录酶进行转录,以“拷贝-粘贴”的转座模式导致基因组扩增和进化。具有活性的反转录转座子通过插入产生新的突变,可作为一种基因标签技术,应用于功能基因组学研究,并成为研究植物基因功能和表达的重要技术平台。本文综述了近几年来在植物反转录转座子方面的研究进展,主要包括植物反转录转座子的结构、特征、活性及其对基因组的影响和它们在功能基因组学中的应用。 展开更多
关键词 植物 反转录转座子 转座 功能基因组学 基因标签技术 植物基因组 应用 反转录病毒 非生物因素 技术平台
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植物功能基因组学的发展现状与发展趋势 被引量:14
9
作者 黎裕 王天宇 贾继增 《生物技术通报》 CAS CSCD 2000年第4期6-10,共5页
本文将评述植物功能基因组学研究领域最新的发展状况及其趋势。
关键词 植物 功能基因组学 进展
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cDNA微阵列技术在植物功能基因组学研究中的应用 被引量:5
10
作者 樊金娟 赵开军 徐正进 《生物技术通报》 CAS CSCD 2004年第3期26-29,共4页
cDNA微阵列 (cDNAMicroarrays)技术是近年发展起来的分子生物学研究新型工具 ,以分子杂交为基本原理 ,在检测植物基因表达水平、研究基因表达图谱、特异基因检测以及发现新基因和分离差异表达基因等方面有着独特的优势 ,已成为植物功能... cDNA微阵列 (cDNAMicroarrays)技术是近年发展起来的分子生物学研究新型工具 ,以分子杂交为基本原理 ,在检测植物基因表达水平、研究基因表达图谱、特异基因检测以及发现新基因和分离差异表达基因等方面有着独特的优势 ,已成为植物功能基因组学研究的重要手段。 展开更多
关键词 cDNA微阵列技术 分子生物 植物 功能基因组学 基因表达
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鼻咽癌易感/抑瘤基因的功能基因组学研究 被引量:4
11
作者 李小玲 武明花 李桂源 《中南大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2008年第7期553-558,共6页
鼻咽癌组织在染色体3p,9p,6q,11q,13 q和14q等区域存在较高的等位基因不平衡,表明这些区域存在与鼻咽癌相关的抑瘤基因。采用cDNA代表性差异分析等方法成功获得了候选的鼻咽癌易感/抑瘤基因,并进行了基因功能研究。发现:(1)Cx基因的表... 鼻咽癌组织在染色体3p,9p,6q,11q,13 q和14q等区域存在较高的等位基因不平衡,表明这些区域存在与鼻咽癌相关的抑瘤基因。采用cDNA代表性差异分析等方法成功获得了候选的鼻咽癌易感/抑瘤基因,并进行了基因功能研究。发现:(1)Cx基因的表达增强是由于肿瘤细胞为突破细胞通讯功能的障碍,试图重建细胞间隙连接的一种表达变异;(2)BRD7基因是一个与细胞周期调控密切相关的核转录调控因子;(3)NAG7基因具有双重生物学功能——在抑制低侵袭能力的HNE1细胞增殖的同时,能够增加HNE1和6-10B细胞的侵袭潜能;(4)NGX6可以与Ezrin发生交互作用,参与鼻咽癌转移;(5)SPLUNC1基因的表达下调是鼻咽癌早期预警的分子诊断标志物。这些易感/抑瘤基因的功能基因组学研究为阐明鼻咽癌的发病机制打下了坚实的理论基础。 展开更多
关键词 鼻咽癌 基因克隆 功能基因组学
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泛基因组及其在植物功能基因组学研究中的应用 被引量:4
12
作者 赵均良 张少红 刘斌 《植物遗传资源学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第1期7-15,共9页
参考基因组是现代功能基因组学的核心框架,以此为基础的现代基因组学技术在过去20年对植物遗传变异发掘、功能基因克隆等研究起了巨大的推动作用。然而,越来越多的研究发现,单一或少数参考基因组不能完整代表和呈现物种或特定群体内的... 参考基因组是现代功能基因组学的核心框架,以此为基础的现代基因组学技术在过去20年对植物遗传变异发掘、功能基因克隆等研究起了巨大的推动作用。然而,越来越多的研究发现,单一或少数参考基因组不能完整代表和呈现物种或特定群体内的所有基因组变异,因此其在功能基因组学研究中应用存在很大的局限性,甚至会导致错误的结果。泛基因组是指物种或特定群体内全部基因或基因组序列的总和。泛基因组通过完整捕获和呈现群体内全部的基因或基因组序列,代替单一参考基因组应用于功能基因组学研究,可以突破单一参考基因组的局限性。泛基因组在植物功能基因组学研究中有广泛的应用,以泛基因组为基础,结合最新的基因组学技术可以高效、精准鉴定种质资源中的遗传变异。泛基因组研究是目前植物基因组学研究的前沿和热点。本文综述了泛基因组概念的起源和发展,泛基因组组装的技术和策略,以及泛基因组在植物基因组学研究和分子育种方面的应用和最新进展,最后对植物泛基因组研究目前存在的问题和今后研究方向进行了展望。本综述可为植物泛基因组研究和应用提供参考。 展开更多
关键词 基因组 种质资源 功能基因组学 遗传变异
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转座子在植物功能基因组学中的应用 被引量:9
13
作者 雷娟利 徐志豪 《浙江农业学报》 CSCD 2002年第5期291-296,共6页
转座子已经被广泛用于内源或异源植物插入突变的研究 ,用于基因的分离和克隆。随着不同植物基因组研究进程加快 ,需要通过反向遗传学来研究已知序列基因的功能 ,大规模的转座子突变已成为功能基因组学研究的一种很重要手段。本文综述了... 转座子已经被广泛用于内源或异源植物插入突变的研究 ,用于基因的分离和克隆。随着不同植物基因组研究进程加快 ,需要通过反向遗传学来研究已知序列基因的功能 ,大规模的转座子突变已成为功能基因组学研究的一种很重要手段。本文综述了一些广泛应用的转座子以及这些转座子如何成功应用于异源植物的插入突变 。 展开更多
关键词 基因标签 反向遗传 转座子 植物育种 功能基因组学 插入突变 异源植物
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功能基因组学研究的有力工具——比较基因组学 被引量:5
14
作者 张森 李辉 顾志刚 《东北农业大学学报》 CAS CSCD 2005年第5期664-668,共5页
比较基因组学在后基因组时代是一门重要的工具学科。通过不同物种间的基因组序列比较,可以发现生物体中蕴涵的大量生物学信息,其在功能基因组学的研究中将发挥重要作用。文章对比较基因组学的基本理论、应用策略、主要分析步骤及有关分... 比较基因组学在后基因组时代是一门重要的工具学科。通过不同物种间的基因组序列比较,可以发现生物体中蕴涵的大量生物学信息,其在功能基因组学的研究中将发挥重要作用。文章对比较基因组学的基本理论、应用策略、主要分析步骤及有关分析工具进行了概述。 展开更多
关键词 比较基因组 功能基因组学 生物信息
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微生物药物产生菌功能基因组学研究进展 被引量:2
15
作者 吴杭 白林泉 +1 位作者 周秀芬 邓子新 《中国抗生素杂志》 CAS CSCD 北大核心 2013年第3期175-184,共10页
微生物药物是一类化学结构和生物活性多样的次级代谢产物,近年来其多个产生菌基因组序列已经被测定完成,在此基础上开展的功能基因组研究方兴未艾,并在抗生素生物合成、形态分化、调控、系统发育与进化以及次级代谢产物挖掘等方面有着... 微生物药物是一类化学结构和生物活性多样的次级代谢产物,近年来其多个产生菌基因组序列已经被测定完成,在此基础上开展的功能基因组研究方兴未艾,并在抗生素生物合成、形态分化、调控、系统发育与进化以及次级代谢产物挖掘等方面有着新的发现,展现出广阔的研究前景。本文重点阐述了四种重要抗生素产生菌功能基因组学的研究现状,集中于青霉素高产的遗传机制、红霉素产生菌红色糖多孢菌基因组与转录组分析、链霉素产生菌灰色链霉菌中A因子调控网络、阿维菌素产生菌作为次级代谢物异源表达的通用宿主与超高产菌株构建以及新型天然产物的挖掘等研究内容,同时简要介绍了当前我国微生物药物产生菌基因组学的研究概况,并从基础与应用两个角度对其未来发展趋势进行了展望。 展开更多
关键词 青霉素 红霉素 链霉素 阿维菌素 功能基因组学
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RNA干扰文库及其在功能基因组学研究中的应用 被引量:2
16
作者 程小星 蹇锐 +1 位作者 邓少丽 蒋静 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2005年第3期195-198,共4页
随着人类基因组大规模测序的完成,下一步的挑战是了解每一个基因的功能. RNA干扰文库为大规模基因功能筛选提供了可能. 虽然用于线虫等模式生物的RNAi文库,已经证明是大规模基因功能筛选的有效方法,但这些文库不能用于高等动物的细胞. ... 随着人类基因组大规模测序的完成,下一步的挑战是了解每一个基因的功能. RNA干扰文库为大规模基因功能筛选提供了可能. 虽然用于线虫等模式生物的RNAi文库,已经证明是大规模基因功能筛选的有效方法,但这些文库不能用于高等动物的细胞. 自2003年以来,用于人的细胞和哺乳动物细胞的RNAi文库取得了突破,相继出现构建已知基因RNAi文库和构建随机RNAi文库的报道,并成功地应用于大规模基因功能的筛选. RNAi文库作为一种简单、高效、大规模、高通量的功能基因组学研究的工具,将在基因功能研究、发现新的药物靶基因、发现疾病相关基因等方面有广阔的应用前景. 展开更多
关键词 RNA干扰 RNAi文库 功能基因组学
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利用功能基因组学方法研究酿酒酵母乙醇生物合成的调控机理 被引量:2
17
作者 徐国强 吴满珍 +2 位作者 吴瑶 杜婕 蒋伶活 《微生物学杂志》 CAS CSCD 2013年第6期19-25,共7页
酿酒酵母在发酵生产乙醇的过程中存在的主要问题是前期高浓度底物葡萄糖的抑制和后期高浓度产物乙醇的抑制。功能基因组学技术的发展为从基因组水平上系统研究酿酒酵母乙醇生物合成的调控机理提供可能。本研究模拟工业发酵的条件,对酿... 酿酒酵母在发酵生产乙醇的过程中存在的主要问题是前期高浓度底物葡萄糖的抑制和后期高浓度产物乙醇的抑制。功能基因组学技术的发展为从基因组水平上系统研究酿酒酵母乙醇生物合成的调控机理提供可能。本研究模拟工业发酵的条件,对酿酒酵母实验菌株BY4743为遗传背景的116个单基因缺失菌株进行了乙醇发酵试验,以发现基因和乙醇发酵的关系。结果表明乙醇对菌体得率系数高于平均值30%以上的基因缺失株有20株,其中高于50%以上基因缺失株有5株;低于平均值30%以上的基因缺失株有11株,其中低于45%以上的有5株。本研究为从整个酿酒酵母基因组水平上系统研究乙醇生物合成的调控机理建立了研究方法,提供了可行性验证。 展开更多
关键词 燃料乙醇 发酵 酿酒酵母 功能基因组学 基因缺失
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小麦的比较基因组学和功能基因组学 被引量:7
18
作者 代君丽 李振岐 《西北植物学报》 CAS CSCD 2004年第5期949-953,共5页
小麦是异源多倍体植物,具有大的染色体组,并且基因组中重复序列所占比例较高,这些特征限制了小麦基因组研究的进展.比较基因组学方法为运用模式植物进行小麦基因组学研究提供了一个操作平台.功能基因组学的研究集中于基因组中转录表达... 小麦是异源多倍体植物,具有大的染色体组,并且基因组中重复序列所占比例较高,这些特征限制了小麦基因组研究的进展.比较基因组学方法为运用模式植物进行小麦基因组学研究提供了一个操作平台.功能基因组学的研究集中于基因组中转录表达的部分,基因功能的确定是功能基因组学研究的主要内容.对比较基因组学在小麦基因组研究中的应用和小麦功能基因组学的研究内容和方法进行了综述. 展开更多
关键词 小麦 比较基因组 功能基因组学
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基因捕捉及其在植物基因分离和功能基因组学上的应用 被引量:3
19
作者 江树业 陈启锋 葛学军 《热带亚热带植物学报》 CAS CSCD 北大核心 2003年第2期181-189,共9页
基因捕捉是一种报告基因的随机整合技术。基因捕捉系统已成为分离基因、鉴定基因功能的重要手段。基因捕捉(genetraps)包括增强子捕捉(enhancertrap)、启动子捕捉(promotertrap)和基因捕捉(genetrap),通称为基因捕捉(genetraps)。在增... 基因捕捉是一种报告基因的随机整合技术。基因捕捉系统已成为分离基因、鉴定基因功能的重要手段。基因捕捉(genetraps)包括增强子捕捉(enhancertrap)、启动子捕捉(promotertrap)和基因捕捉(genetrap),通称为基因捕捉(genetraps)。在增强子捕捉中,报告基因与一个基本启动子融合,这个启动子不能使报告基因表达,但可被临近的增强子激活。在启动子捕捉和基因捕捉中,报告基因的启动子被去除,融合基因只有以正确的方向插入到转录单元内才能表达。对基因捕捉系统的结构特征、构建方法、应用范围、研究现状和应用前景等作了系统论述,并对有关问题进行了讨论。 展开更多
关键词 基因捕捉 基因分离 功能基因组学
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水稻功能基因组学研究策略 被引量:2
20
作者 张永强 裴新梧 +1 位作者 王志兴 贾士荣 《生物技术通报》 CAS CSCD 2003年第6期9-13,共5页
自 8 0年代第一株可育转基因水稻问世以来 ,水稻转化研究进展迅速。已采用包括农杆菌介导等许多转化方法。随着水稻基因组测序计划的完成 ,以功能基因组学研究为代表的后基因组时代已经到来。丰富的信息资源将为水稻功能基因的发掘创造... 自 8 0年代第一株可育转基因水稻问世以来 ,水稻转化研究进展迅速。已采用包括农杆菌介导等许多转化方法。随着水稻基因组测序计划的完成 ,以功能基因组学研究为代表的后基因组时代已经到来。丰富的信息资源将为水稻功能基因的发掘创造十分有利的条件。本文将对水稻功能基因组的研究进展及其方法等进行简要概括。 展开更多
关键词 水稻 功能基因组学 遗传转化 农杆菌
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