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分泌蛋白质组学在肿瘤标志物中的研究进展 被引量:8
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作者 余乐正 柳凤娟 +1 位作者 吴正雨 冉小强 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第3期12-21,共10页
在肿瘤发生、发展过程中,肿瘤细胞会分泌出大量蛋白质,而一些分泌蛋白已作为肿瘤标志物被用于肿瘤的临床检测与预后判断。随着蛋白质组学技术的快速发展,分泌蛋白质组学应运而生,并为肿瘤研究提供了新的思路与方法。现就分泌蛋白质组学... 在肿瘤发生、发展过程中,肿瘤细胞会分泌出大量蛋白质,而一些分泌蛋白已作为肿瘤标志物被用于肿瘤的临床检测与预后判断。随着蛋白质组学技术的快速发展,分泌蛋白质组学应运而生,并为肿瘤研究提供了新的思路与方法。现就分泌蛋白质组学在肿瘤标志物研究中的策略及进展做一综述,旨在为研究人员在肿瘤标志物发现及筛选方面提供借鉴。 展开更多
关键词 分泌蛋白 分泌蛋白质组 分泌蛋白质组 肿瘤标志物
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隐藏嗜酸菌Acidiphilium cryptum JF-5分泌蛋白质组的分析 被引量:1
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作者 焦春香 张奉波 +1 位作者 夏金兰 张成桂 《安徽农业科学》 CAS 北大核心 2011年第28期17168-17171,17175,共5页
[目的]对隐藏嗜酸菌(Acidiphilium cryptumJF-5)全基因组的3063个氨基酸序列进行预测,分析其分泌蛋白质组的构成。[方法]利用信号肽预测软件SignalPv3.0、跨膜螺旋结构预测软件TMHMMv2.0、RR-motif信号肽预测软件TatPv1.0、脂蛋白质信... [目的]对隐藏嗜酸菌(Acidiphilium cryptumJF-5)全基因组的3063个氨基酸序列进行预测,分析其分泌蛋白质组的构成。[方法]利用信号肽预测软件SignalPv3.0、跨膜螺旋结构预测软件TMHMMv2.0、RR-motif信号肽预测软件TatPv1.0、脂蛋白质信号肽预测软件LipoPv1.0、非经典分泌蛋白质预测软件SecretomeP和亚细胞定位软件Psortbv2.0.4对Acidiphilium cryptumJF-5全基因组的3063个氨基酸序列进行预测分析。[结果]在隐藏嗜酸菌Acidiphilium cryptumJF-5中有444个蛋白质为分泌蛋白质,其中分泌型信号肽148个,RR-motif亚组型信号肽27个,脂蛋白质信号肽22个,无Prepiplin-like信号肽,非经典分泌蛋白质247个;另外,对分泌型信号肽的长度分布、氨基酸使用频率和酶切位点的氨基酸使用频率作出了统计分析。[结论]研究结果为进一步研究嗜酸菌Acidiphilium cryptumJF-5的基因功能提供了丰富的信息基础。 展开更多
关键词 隐藏嗜酸菌Acidiphilium cryptumJF-5 分泌蛋白质组 信号肽
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等电聚焦预分离用于肝癌细胞分泌蛋白质组的分级与鉴定 被引量:4
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作者 李贤煜 赵新元 +1 位作者 应万涛 钱小红 《色谱》 CAS CSCD 北大核心 2013年第9期831-837,共7页
分泌蛋白质组(secretome)是指在特定的时空条件下,细胞、组织等分泌的全部蛋白质。分泌蛋白质组可能包含了大量的疾病诊断生物标志物,因此其相关研究越来越受到重视。分泌蛋白质组的组成高度复杂且浓度范围宽,这对分析方法提出了挑战。... 分泌蛋白质组(secretome)是指在特定的时空条件下,细胞、组织等分泌的全部蛋白质。分泌蛋白质组可能包含了大量的疾病诊断生物标志物,因此其相关研究越来越受到重视。分泌蛋白质组的组成高度复杂且浓度范围宽,这对分析方法提出了挑战。建立有效的蛋白质或肽段预分离策略,将有利于分泌蛋白质的高覆盖率鉴定。本研究以肝癌细胞系MHCC97L的无血清培养分泌蛋白质为研究对象,采用一种新型等电聚焦预分离(OFFGEL)系统,考察了肽段水平的分级对蛋白质鉴定结果的影响。结果表明,分离后各馏分中肽段的等电点分布与理论预测基本一致,每个馏分中单独鉴定的肽段比例接近80%,显示了该系统对肽段的高分辨分离能力。结合生物质谱技术,在肝癌细胞分泌系统中鉴定了2 995个蛋白质,显示了该系统在复杂体系蛋白质组研究中的应用潜力。 展开更多
关键词 等电聚焦 预分离 分泌蛋白质组 分级 鉴定 肝癌细胞
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表皮生长因子受体调控的人鼻咽癌细胞系CNE2分泌蛋白质的筛选 被引量:5
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作者 梁可 陈主初 +7 位作者 易红 李建玲 张鹏飞 李茂玉 李萃 冯雪萍 彭芳 肖志强 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2007年第1期100-106,共7页
为筛选表皮生长因子受体(epidermalgrowthfactorreceptor,EGFR)调控的鼻咽癌(nasopharyngealcarcinoma,NPC)细胞的分泌蛋白质,揭示EGFR在NPC发病中的作用机制,采用无血清培养法培养NPC细胞系CNE2,并用转化生长因子(transforminggrowthfa... 为筛选表皮生长因子受体(epidermalgrowthfactorreceptor,EGFR)调控的鼻咽癌(nasopharyngealcarcinoma,NPC)细胞的分泌蛋白质,揭示EGFR在NPC发病中的作用机制,采用无血清培养法培养NPC细胞系CNE2,并用转化生长因子(transforminggrowthfactor-α,TGF-α)刺激CNE2细胞24h作为实验组,对照组CNE2细胞不用TGF-α刺激.超滤法脱盐并浓缩两组细胞的培养上清制备分泌蛋白,采用双向凝胶电泳技术(two-dimensionalelectrophoresis,2-DE)分离两组细胞的分泌蛋白,PDquest图像分析软件识别差异表达的蛋白质点,基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(matrix-assistedlaserdesorption/ionizationtimeofflightmassspectrometry,MALDI-TOF-MS)鉴定差异表达蛋白.建立了实验组和对照组CNE2细胞分泌蛋白的2-DE图谱,图像分析识别了22个差异蛋白质点,质谱鉴定了8个非冗余蛋白质,其功能涉及肿瘤细胞侵袭转移、细胞凋亡和增殖,为进一步揭示EGFR在NPC发病中的作用及其机制奠定了基础. 展开更多
关键词 鼻咽癌 CNE2细胞 表皮生长因子受体(EGFR) 分泌蛋白质组 二维凝胶电泳 质谱
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双向电泳结合质谱分析长双歧杆菌XY01分泌蛋白质图谱 被引量:2
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作者 尚伟 邹大阳 +2 位作者 王思淼 袁静 廖祥儒 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第1期84-90,共7页
菌体的分泌蛋白质在宿主和菌体的相互作用之间起着重要的作用.本研究采用双向凝胶电泳的方法建立了长双歧杆菌XY01分泌蛋白质图谱,通过MALDI-TOF/TOF质谱鉴定和数据库搜索,对鉴定到的分泌蛋白进行了分析.共检测到21个蛋白质点,成功鉴定1... 菌体的分泌蛋白质在宿主和菌体的相互作用之间起着重要的作用.本研究采用双向凝胶电泳的方法建立了长双歧杆菌XY01分泌蛋白质图谱,通过MALDI-TOF/TOF质谱鉴定和数据库搜索,对鉴定到的分泌蛋白进行了分析.共检测到21个蛋白质点,成功鉴定18个蛋白质点,分别代表14个不同的蛋白质,等电点分布在4.5~7.0之间,分子质量分布在20~65 kD之间;通过COGs分类和功能分析,信号肽和细胞定位及KEGG代谢通路分析.结果表明,这些蛋白质对菌体细胞壁/膜的形成、生物信号传导和物质代谢等起着重要作用.研究结果为长双歧杆菌蛋白质组学和基因组学的研究提供了参考. 展开更多
关键词 长双歧杆菌XY01 分泌蛋白质组 双向凝胶电泳 蛋白质图谱
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海洋红冬孢酵母分泌蛋白的鉴定及其在番茄采后生物防治中的应用
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作者 孙丹丹 张晓君 +3 位作者 路来风 杨莹 乔丽萍 王昌禄 《食品科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2021年第20期22-29,共8页
以番茄果实为实验试材,选取海洋红冬孢酵母(Rhodosporidium paludigenum)为研究对象,利用QExactiveUHMR组合型四极杆Orbitrap质谱鉴定并结合生物信息学分析其分泌蛋白组成,探究分泌蛋白在微生物之间以及微生物与番茄之间建立互作关系的... 以番茄果实为实验试材,选取海洋红冬孢酵母(Rhodosporidium paludigenum)为研究对象,利用QExactiveUHMR组合型四极杆Orbitrap质谱鉴定并结合生物信息学分析其分泌蛋白组成,探究分泌蛋白在微生物之间以及微生物与番茄之间建立互作关系的功能机制。结果表明,R. paludigenum发酵上清液中含有1 632条红酵母(Rhodotorula)源特异性目标蛋白质多肽,结合Signal P、WoLF PSORT、Target P、TMHMM、big-PI Predictor和Secretome P等软件分析得到58个经典分泌特征的蛋白质和433个非典型分泌特征的蛋白质。蛋白生物学功能结果表明,R. paludigenum分泌蛋白可有效抑制灰葡萄孢菌孢子萌发,抑制率为31.4%,同时有效增强番茄果实伤口处的系统抗病能力,抑制果实伤口处灰霉病发病几率,抑制率达50.1%。结合UniParc数据库信息,发现R. paludigenum分泌蛋白中含有藻胶裂解酶和β-葡萄糖苷酶等18个碳水化合物酶类蛋白(31.0%),推测可能在R. paludigenum与灰葡萄孢菌的互作和诱导番茄果实系统抗性过程中发挥重要功能,以保护番茄果实免受采后灰霉病害的侵染。 展开更多
关键词 生物防治 分泌蛋白质组 微生物互作 诱导抗性
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