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转运必需内体分选复合物螺旋纤丝Vps24⁃Vps2的冷冻电镜结构研究
1
作者
刘德生
李耀旺
孙珊
《电子显微学报》
北大核心
2025年第1期28-35,共8页
转运必需内体分选复合物-Ⅲ(endosomal sorting complex required for transport-Ⅲ,ESCRT-Ⅲ)介导了一系列细胞膜重塑事件,包括多囊体的形成、细胞分裂和病毒释放等。这些过程的关键步骤之一是将ESCRT-Ⅲ蛋白亚基组装成纤丝状结构。在...
转运必需内体分选复合物-Ⅲ(endosomal sorting complex required for transport-Ⅲ,ESCRT-Ⅲ)介导了一系列细胞膜重塑事件,包括多囊体的形成、细胞分裂和病毒释放等。这些过程的关键步骤之一是将ESCRT-Ⅲ蛋白亚基组装成纤丝状结构。在本研究中,作者利用冷冻电镜技术解析了由Vps24和Vps2融合蛋白(Vps24-Vps2)形成的双链螺旋纤丝的结构,分辨率为4.07A。在该结构中,呈伸展构象的Vps24-Vps2单体首先形成反向结合的二聚体,二聚体之间再错位结合形成一股螺旋,两股螺旋互相缠绕最终形成纤丝。该结构为理解ESCRT-Ⅲ丝状结构组装以及解聚过程提供了结构基础。
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关键词
转运必需内体分选复合物
ESCRT
Vps24
Vps2
冷冻电镜结构
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职称材料
生物科学计算平台冷冻电镜结构解析实验室管理
被引量:
9
2
作者
杨涛
贾安宝
+2 位作者
阮华斌
王亚坤
刘燕
《实验技术与管理》
CAS
北大核心
2017年第2期227-230,234,共5页
以清华大学生命科学院生物计算平台冷冻电镜结构解析实验室管理为案例,介绍了实验室现状、制度体系、平台运行和成果4个部分,阐述了实验室管理和运行过程中经常出现的问题,提出了有效的改进措施,以便进一步提高设备的完好率和利用率,切...
以清华大学生命科学院生物计算平台冷冻电镜结构解析实验室管理为案例,介绍了实验室现状、制度体系、平台运行和成果4个部分,阐述了实验室管理和运行过程中经常出现的问题,提出了有效的改进措施,以便进一步提高设备的完好率和利用率,切实有效地为科研和教学服务,为建立高效有序的实验管理提供理论依据。
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关键词
生物科学计算平台
冷冻电镜结构
解析实验室
实验室管理及运行
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职称材料
基于冷冻电镜无倾转成像数据的新型蛋白质原位结构解析方法
3
作者
赵明洁
曹端方
章新政
《生物化学与生物物理进展》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2024年第10期2418-2429,共12页
与体外纯化的蛋白质复合物相比,细胞内处于工作状态的蛋白质复合物往往更为完整,并且其三维结构处于完全生理的构象,这对于理解蛋白质复合物在生命活动中发挥重要功能的结构基础尤为关键,也可以为药物设计等提供更精确的靶点信息。直接...
与体外纯化的蛋白质复合物相比,细胞内处于工作状态的蛋白质复合物往往更为完整,并且其三维结构处于完全生理的构象,这对于理解蛋白质复合物在生命活动中发挥重要功能的结构基础尤为关键,也可以为药物设计等提供更精确的靶点信息。直接在细胞内解析蛋白质复合物的三维结构也被称为蛋白质的细胞原位结构解析,而冷冻电镜电子断层重构技术是原位结构解析的关键技术,但是电子断层重构技术的序列倾转数据采集通量低、数据处理较为繁琐,并且达到准原子分辨率对样品有特殊要求,这些问题成为了限制原位结构解析分辨率和实际应用的瓶颈。近年来,一种基于单张无倾转数据的蛋白质原位结构解析方法发展迅速,可以高通量地对细胞中的蛋白质复合物进行高分辨率结构解析,本综述将分析这类方法的原理,讨论这个方法相较于传统断层重构方法的优缺点,并对蛋白质的细胞原位结构解析进行展望。希望可以通过这篇综述,帮助结构生物学科研人员更好地选择合适的工具。
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关键词
蛋白质原位重构
冷冻
电镜
原位
结构
解析
isSPA滤波
无倾转数据
高通量
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职称材料
人源谷氨酸转运蛋白EAAT2的结构研究
4
作者
夏凌云
张媛媛
+2 位作者
施仪
黄晶
周强
《电子显微学报》
北大核心
2025年第1期73-80,共8页
谷氨酸是脊椎动物神经系统中的主要兴奋性神经递质,它启动快速信号传递并涉及学习、记忆和突触可塑性。信号传递的最后一步也是至关重要的一步,是从突触间隙迅速清除释放的谷氨酸,以防止神经元的兴奋毒性,这主要是由兴奋性氨基酸转运体2...
谷氨酸是脊椎动物神经系统中的主要兴奋性神经递质,它启动快速信号传递并涉及学习、记忆和突触可塑性。信号传递的最后一步也是至关重要的一步,是从突触间隙迅速清除释放的谷氨酸,以防止神经元的兴奋毒性,这主要是由兴奋性氨基酸转运体2(EAAT2)完成的。这里描述了人类EAAT2向内开口的结构,包括具有开放HP2门的无配体构象,抑制剂阻断的开放构象以及激活剂结合的闭合构象。这些结构显示EAAT2向胞内转运神经递质后,抑制剂WAY-213613通过竞争底物结合位点,将其阻断在向内开口且HP2环开放的构象,抑制其反向转运过程。而激活剂GT949或许能加速这一过程。这些结构信息提供了配体位置和EAAT2活性调节机制的分子细节。总之,这些结构数据为研究EAAT结构-功能关系和设计新型治疗调节剂奠定了基础。
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关键词
谷氨酸转运蛋白
SLC1A2
神经退行性疾病
冷冻电镜结构
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职称材料
人源硫酸盐转运蛋白DTDST的结构生物学研究
被引量:
2
5
作者
池希敏
李晓荣
+1 位作者
黄邦栋
周强
《电子显微学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第1期21-29,共9页
软骨畸形发育不良(diastrophic dysplasia)是一种严重的常染色体隐性遗传疾病,由畸形发育不良硫酸盐转运蛋白(diastrophic dysplasia sulfate transporter, DTDST)的突变引起,目前没有有效的治疗手段。DTDST也称为SLC26A2,属于人源溶质...
软骨畸形发育不良(diastrophic dysplasia)是一种严重的常染色体隐性遗传疾病,由畸形发育不良硫酸盐转运蛋白(diastrophic dysplasia sulfate transporter, DTDST)的突变引起,目前没有有效的治疗手段。DTDST也称为SLC26A2,属于人源溶质转运蛋白SLC26家族。由于缺乏必要的结构信息,针对DTDST的药物研发进展缓慢。本研究解析了人源硫酸盐转运蛋白DTDST的冷冻电镜三维结构,揭示了其二聚化作用界面和底物结合口袋的结构特征,并比较了DTDST和已报道的其他同源蛋白的构象。该研究结果加深了对SLC26家族蛋白底物识别和转运机制的了解,为治疗软骨畸形发育不良的药物开发提供了结构基础。
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关键词
硫酸盐转运蛋白
SLC26A2
软骨畸形发育不良
冷冻电镜结构
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职称材料
拟南芥机械力敏感型离子通道AtMSL10的结构研究
6
作者
李鑫茹
李雅雯
+1 位作者
刘欣
孙林峰
《电子显微学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第4期460-470,共11页
机械力敏感型离子通道是一类能够感知和响应机械力刺激的膜蛋白,其广泛存在于各种生物体中,包括细菌、植物和动物等。为了更好地了解植物机械力敏感型离子通道,本研究通过体外表达纯化以及去垢剂筛选等手段,获得了性质较好的拟南芥(Arab...
机械力敏感型离子通道是一类能够感知和响应机械力刺激的膜蛋白,其广泛存在于各种生物体中,包括细菌、植物和动物等。为了更好地了解植物机械力敏感型离子通道,本研究通过体外表达纯化以及去垢剂筛选等手段,获得了性质较好的拟南芥(Arabidopsis thaliana,At)机械力敏感型离子通道AtMSL10的蛋白样品,并利用冷冻电镜单颗粒重构技术解析了其高分辨率三维结构,整体分辨率为0.27 nm。结构显示AtMSL10蛋白以同源七聚体的形式存在,并处于开放状态的构象。AtMSL10蛋白结构的解析为后续对于植物机械力传导机制的探索提供了结构基础。
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关键词
机械力敏感型离子通道
AtMSL10
冷冻电镜结构
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职称材料
题名
转运必需内体分选复合物螺旋纤丝Vps24⁃Vps2的冷冻电镜结构研究
1
作者
刘德生
李耀旺
孙珊
机构
膜生物学国家重点实验室
南方科技大学生命科学学院
出处
《电子显微学报》
北大核心
2025年第1期28-35,共8页
基金
国家自然科学基金资助项目(No.92254306)。
文摘
转运必需内体分选复合物-Ⅲ(endosomal sorting complex required for transport-Ⅲ,ESCRT-Ⅲ)介导了一系列细胞膜重塑事件,包括多囊体的形成、细胞分裂和病毒释放等。这些过程的关键步骤之一是将ESCRT-Ⅲ蛋白亚基组装成纤丝状结构。在本研究中,作者利用冷冻电镜技术解析了由Vps24和Vps2融合蛋白(Vps24-Vps2)形成的双链螺旋纤丝的结构,分辨率为4.07A。在该结构中,呈伸展构象的Vps24-Vps2单体首先形成反向结合的二聚体,二聚体之间再错位结合形成一股螺旋,两股螺旋互相缠绕最终形成纤丝。该结构为理解ESCRT-Ⅲ丝状结构组装以及解聚过程提供了结构基础。
关键词
转运必需内体分选复合物
ESCRT
Vps24
Vps2
冷冻电镜结构
Keywords
endosomal sorting complex required for transport
ESCRT
Vps24
Vps2
Cryo⁃EM structure
分类号
Q7 [生物学—分子生物学]
Q71 [生物学—分子生物学]
Q244 [生物学—细胞生物学]
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职称材料
题名
生物科学计算平台冷冻电镜结构解析实验室管理
被引量:
9
2
作者
杨涛
贾安宝
阮华斌
王亚坤
刘燕
机构
清华大学生命科学学院
清华大学蛋白质研究技术中心
出处
《实验技术与管理》
CAS
北大核心
2017年第2期227-230,234,共5页
文摘
以清华大学生命科学院生物计算平台冷冻电镜结构解析实验室管理为案例,介绍了实验室现状、制度体系、平台运行和成果4个部分,阐述了实验室管理和运行过程中经常出现的问题,提出了有效的改进措施,以便进一步提高设备的完好率和利用率,切实有效地为科研和教学服务,为建立高效有序的实验管理提供理论依据。
关键词
生物科学计算平台
冷冻电镜结构
解析实验室
实验室管理及运行
Keywords
biological computing platform
Freezing EM(Electron Microscope) Structure Analysis Laboratory
laboratory management and operation
分类号
G642.0 [文化科学—高等教育学]
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职称材料
题名
基于冷冻电镜无倾转成像数据的新型蛋白质原位结构解析方法
3
作者
赵明洁
曹端方
章新政
机构
中国科学院生物物理研究所生物大分子重点实验室
出处
《生物化学与生物物理进展》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2024年第10期2418-2429,共12页
基金
国家自然科学基金(32150010)资助项目。
文摘
与体外纯化的蛋白质复合物相比,细胞内处于工作状态的蛋白质复合物往往更为完整,并且其三维结构处于完全生理的构象,这对于理解蛋白质复合物在生命活动中发挥重要功能的结构基础尤为关键,也可以为药物设计等提供更精确的靶点信息。直接在细胞内解析蛋白质复合物的三维结构也被称为蛋白质的细胞原位结构解析,而冷冻电镜电子断层重构技术是原位结构解析的关键技术,但是电子断层重构技术的序列倾转数据采集通量低、数据处理较为繁琐,并且达到准原子分辨率对样品有特殊要求,这些问题成为了限制原位结构解析分辨率和实际应用的瓶颈。近年来,一种基于单张无倾转数据的蛋白质原位结构解析方法发展迅速,可以高通量地对细胞中的蛋白质复合物进行高分辨率结构解析,本综述将分析这类方法的原理,讨论这个方法相较于传统断层重构方法的优缺点,并对蛋白质的细胞原位结构解析进行展望。希望可以通过这篇综述,帮助结构生物学科研人员更好地选择合适的工具。
关键词
蛋白质原位重构
冷冻
电镜
原位
结构
解析
isSPA滤波
无倾转数据
高通量
Keywords
in situ protein reconstruction
in situ structural analysis of cryoEM
isSPA(in situ single particle like analysis)filtering
non-tilting imaging data
high throughput
分类号
Q615 [生物学—生物物理学]
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职称材料
题名
人源谷氨酸转运蛋白EAAT2的结构研究
4
作者
夏凌云
张媛媛
施仪
黄晶
周强
机构
西湖大学未来产业中心
西湖实验室(生命科学和生物医学浙江省实验室)
浙江西湖高等研究院
出处
《电子显微学报》
北大核心
2025年第1期73-80,共8页
基金
科技部国家重点研发计划(No.2020YFA0509300)。
文摘
谷氨酸是脊椎动物神经系统中的主要兴奋性神经递质,它启动快速信号传递并涉及学习、记忆和突触可塑性。信号传递的最后一步也是至关重要的一步,是从突触间隙迅速清除释放的谷氨酸,以防止神经元的兴奋毒性,这主要是由兴奋性氨基酸转运体2(EAAT2)完成的。这里描述了人类EAAT2向内开口的结构,包括具有开放HP2门的无配体构象,抑制剂阻断的开放构象以及激活剂结合的闭合构象。这些结构显示EAAT2向胞内转运神经递质后,抑制剂WAY-213613通过竞争底物结合位点,将其阻断在向内开口且HP2环开放的构象,抑制其反向转运过程。而激活剂GT949或许能加速这一过程。这些结构信息提供了配体位置和EAAT2活性调节机制的分子细节。总之,这些结构数据为研究EAAT结构-功能关系和设计新型治疗调节剂奠定了基础。
关键词
谷氨酸转运蛋白
SLC1A2
神经退行性疾病
冷冻电镜结构
Keywords
excitatory amino acid transporter
SLC1A2
neurodegenerative disease
Cryo⁃EM structure
分类号
Q518.2 [生物学—生物化学]
R589.3 [医药卫生—内分泌]
R596 [医药卫生—内科学]
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职称材料
题名
人源硫酸盐转运蛋白DTDST的结构生物学研究
被引量:
2
5
作者
池希敏
李晓荣
黄邦栋
周强
机构
西湖大学生命科学学院
浙江西湖高等研究院
出处
《电子显微学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第1期21-29,共9页
基金
国家自然科学基金资助项目(No.32100975)
中国博士后科学基金资助项目(No.2021M702923)。
文摘
软骨畸形发育不良(diastrophic dysplasia)是一种严重的常染色体隐性遗传疾病,由畸形发育不良硫酸盐转运蛋白(diastrophic dysplasia sulfate transporter, DTDST)的突变引起,目前没有有效的治疗手段。DTDST也称为SLC26A2,属于人源溶质转运蛋白SLC26家族。由于缺乏必要的结构信息,针对DTDST的药物研发进展缓慢。本研究解析了人源硫酸盐转运蛋白DTDST的冷冻电镜三维结构,揭示了其二聚化作用界面和底物结合口袋的结构特征,并比较了DTDST和已报道的其他同源蛋白的构象。该研究结果加深了对SLC26家族蛋白底物识别和转运机制的了解,为治疗软骨畸形发育不良的药物开发提供了结构基础。
关键词
硫酸盐转运蛋白
SLC26A2
软骨畸形发育不良
冷冻电镜结构
Keywords
diastrophic dysplasia sulfate transporter
SLC26A2
Diastrophic dysplasia
Cryo-EM structure
分类号
Q518.2 [生物学—生物化学]
Q591.7 [生物学—生物化学]
R682 [医药卫生—骨科学]
R596 [医药卫生—内科学]
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职称材料
题名
拟南芥机械力敏感型离子通道AtMSL10的结构研究
6
作者
李鑫茹
李雅雯
刘欣
孙林峰
机构
中国科学技术大学生命科学与医学部
出处
《电子显微学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第4期460-470,共11页
基金
国家自然科学基金资助项目(No.31900885,No.31870732)
安徽省自然科学基金资助项目(No.2008085MC90,No.2008085J15).
文摘
机械力敏感型离子通道是一类能够感知和响应机械力刺激的膜蛋白,其广泛存在于各种生物体中,包括细菌、植物和动物等。为了更好地了解植物机械力敏感型离子通道,本研究通过体外表达纯化以及去垢剂筛选等手段,获得了性质较好的拟南芥(Arabidopsis thaliana,At)机械力敏感型离子通道AtMSL10的蛋白样品,并利用冷冻电镜单颗粒重构技术解析了其高分辨率三维结构,整体分辨率为0.27 nm。结构显示AtMSL10蛋白以同源七聚体的形式存在,并处于开放状态的构象。AtMSL10蛋白结构的解析为后续对于植物机械力传导机制的探索提供了结构基础。
关键词
机械力敏感型离子通道
AtMSL10
冷冻电镜结构
Keywords
mechanosensitive ion channel
AtMSL10
Cryo⁃EM structure
分类号
Q946.1 [生物学—植物学]
Q518.2 [生物学—生物化学]
Q94.3 [生物学—植物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
转运必需内体分选复合物螺旋纤丝Vps24⁃Vps2的冷冻电镜结构研究
刘德生
李耀旺
孙珊
《电子显微学报》
北大核心
2025
0
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职称材料
2
生物科学计算平台冷冻电镜结构解析实验室管理
杨涛
贾安宝
阮华斌
王亚坤
刘燕
《实验技术与管理》
CAS
北大核心
2017
9
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职称材料
3
基于冷冻电镜无倾转成像数据的新型蛋白质原位结构解析方法
赵明洁
曹端方
章新政
《生物化学与生物物理进展》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2024
0
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职称材料
4
人源谷氨酸转运蛋白EAAT2的结构研究
夏凌云
张媛媛
施仪
黄晶
周强
《电子显微学报》
北大核心
2025
0
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职称材料
5
人源硫酸盐转运蛋白DTDST的结构生物学研究
池希敏
李晓荣
黄邦栋
周强
《电子显微学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023
2
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职称材料
6
拟南芥机械力敏感型离子通道AtMSL10的结构研究
李鑫茹
李雅雯
刘欣
孙林峰
《电子显微学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023
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职称材料
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