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血吸虫血红蛋白降解途径的重构及关键酶蛋白保守结构域的分析: 1; 作者魏佳李园园 +1 位作者李亦学于复东《华东理工大学学报（自然科学版）》 CAS CSCD 北大核心 2011年第6期706-714,共9页; 利用生物信息学方法,以疟原虫的血红蛋白降解途径为基础,成功地构建出了日本血吸虫和曼氏血吸虫的血红蛋白降解途径,并对降解途径上的关键酶蛋白的保守结构域进行了序列及结构分析。预测得到的血吸虫血红蛋白降解酶保守结构域,与疟原虫... 展开更多; 关键词日本血吸虫曼氏血吸虫疟原虫血红蛋白降解途径保守结构域; 在线阅读下载PDF 职称材料

双孢蘑菇中一种4R型MYB转录因子的基因克隆和生物信息学分析: 2; 作者刘翔赵紫璇 +5 位作者赵月盈赵诗睿贾子怡姜含越袁帅孟德梅《食品研究与开发》 CAS 2024年第2期185-194,共10页; MYB转录因子广泛存在于真核生物中,在植物的生长发育、逆境胁迫等过程中发挥重要作用。与植物相比,对食用菌中MYB转录因子的研究有限。为探究MYB转录因子在食用菌中的生物学功能,对前期转录组发现的一个编码双孢蘑菇(Agaricus bisporus)... 展开更多; 关键词双孢蘑菇 MYB转录因子基因克隆生物信息学分析保守结构域; 在线阅读下载PDF 职称材料

花生AhARF 基因家族鉴定与表达分析被引量：4: 3; 作者唐桂英彭振英 +4 位作者徐平丽李鹏祥朱洁琼单雷万书波《中国油料作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第6期1100-1110,共11页; 生长素响应因子(Auxin response factor,ARF)是生长素信号转导途径中的一类重要转录因子,在种子萌发、器官形成、果实成熟、胚胎发生等多个生长发育过程发挥作用。为了揭示花生基因组中AhARF基因家族的特征,本研究利用生物信息学方法从... 展开更多; 关键词花生 ARF基因家族系统进化分析蛋白保守结构域表达分析; 在线阅读下载PDF 职称材料

DELLA家族蛋白研究进展被引量：5: 4; 作者李威李国瑞 +7 位作者黄凤兰孙华军李跃丛安琪齐蒙白英俊李孟建陈永胜《安徽农业科学》 CAS 2016年第32期147-148,共2页; 在已发现的植物GA信号传递分子中,有一类N端具有高度保守的DELLA结构域,称之为DELLA家族蛋白。介绍了DELLA蛋白的保守结构域和降解途径,并综述了其对多种植物激素信号的调控作用,以期提示植物生长发育和植物激素信号转导的奥秘。; 关键词 DELLA蛋白 GA 植物激素保守结构域; 在线阅读下载PDF 职称材料

荞麦ARF基因家族的鉴定及生物信息学分析被引量：7: 5; 作者李洪有霍冬敖 +4 位作者蔡芳张晓娜石桃雄陈其皎陈庆富《浙江农业学报》 CSCD 北大核心 2018年第1期7-13,共7页; 生长素响应因子(auxin response factor,ARF)基因应答了生长素信号,在植物生长发育中具有重要的调控作用。以荞麦基因组数据库为基础,利用Blast P比对程序共鉴定了21个荞麦ARF基因,并对其基因结构、编码蛋白理化性质、保守结构域、保守... 展开更多; 关键词荞麦 ARF 生物信息学分析保守结构域进化分析; 在线阅读下载PDF 职称材料

解淀粉芽孢杆菌YP6中碱性磷酸酯酶AP2的生物信息学分析及酶学性质被引量：1: 6; 作者孟迪江威 +1 位作者郝之奎廖祥儒《食品研究与开发》 CAS 北大核心 2021年第23期169-176,共8页; 对解淀粉芽孢杆菌YP6基因组中编码碱性磷酸酯酶(AP2)的基因进行生物信息学分析、异源表达和酶学性质研究。结果表明,该基因长1752 bp,编码583个氨基酸,通过氨基酸序列分析,预测AP2的分子量为66 kDa,等电点为8.62,是一种结构稳定、亲水... 展开更多; 关键词解淀粉芽孢杆菌YP6 PhoD酶生物信息学分析酶学性质保守结构域; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名血吸虫血红蛋白降解途径的重构及关键酶蛋白保守结构域的分析: 1; 作者魏佳李园园李亦学于复东; 机构华东理工大学生物工程学院上海生物信息技术研究中心; 出处《华东理工大学学报（自然科学版）》 CAS CSCD 北大核心 2011年第6期706-714,共9页; 基金国家自然科学基金(30900834); 文摘利用生物信息学方法,以疟原虫的血红蛋白降解途径为基础,成功地构建出了日本血吸虫和曼氏血吸虫的血红蛋白降解途径,并对降解途径上的关键酶蛋白的保守结构域进行了序列及结构分析。预测得到的血吸虫血红蛋白降解酶保守结构域,与疟原虫相比,在序列上催化位点高度保守,在结构上空间相对位置较一致,为研究血吸虫血红蛋白降解酶,及其与底物或抑制剂在三维结构上的相互作用提供了理论基础。; 关键词日本血吸虫曼氏血吸虫疟原虫血红蛋白降解途径保守结构域; Keywords Schistosoma japonicum Schistosoma mansoni Plasmodium falciparurn hemoglobin degradation pathway conserved domain; 分类号 Q811.4 [生物学—生物工程]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名双孢蘑菇中一种4R型MYB转录因子的基因克隆和生物信息学分析: 2; 作者刘翔赵紫璇赵月盈赵诗睿贾子怡姜含越袁帅孟德梅; 机构天津科技大学食品科学与工程学院; 出处《食品研究与开发》 CAS 2024年第2期185-194,共10页; 基金国家自然科学基金(32372391、31501544) 国家级大学生创新创业训练计划资助项目(202310057218)。; 文摘 MYB转录因子广泛存在于真核生物中,在植物的生长发育、逆境胁迫等过程中发挥重要作用。与植物相比,对食用菌中MYB转录因子的研究有限。为探究MYB转录因子在食用菌中的生物学功能,对前期转录组发现的一个编码双孢蘑菇(Agaricus bisporus)MYB转录因子的基因进行克隆和生物信息学分析。结果表明,该基因编码区长1209 bp,翻译402个氨基酸;编码的蛋白分子量为45.95 kDa,等电点9.17,是一种不存在跨膜结构、不含信号肽的亲水性蛋白,具有4个高度保守的SANT结构域,属于4R型MYB转录因子,与白环蘑(Leucoagaricus)中的4RMYB转录因子亲缘关系最近;二级结构预测显示以无规则卷曲和α-螺旋结构为主;亚细胞定位分析显示该转录因子位于细胞核中;此外启动子序列分析表明,该基因启动子区域含有多个与生物抗逆应答、激素响应等相关的顺式作用元件。; 关键词双孢蘑菇 MYB转录因子基因克隆生物信息学分析保守结构域; Keywords Agaricus bisporus MYB transcription factor gene cloning bioinformatics analysis conserved domain; 分类号 S646.11 [农业科学—蔬菜学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名花生AhARF 基因家族鉴定与表达分析被引量：4: 3; 作者唐桂英彭振英徐平丽李鹏祥朱洁琼单雷万书波; 机构山东省农业科学院生物技术研究中心/山东省作物遗传改良与生理生态重点实验室山东师范大学生命科学学院; 出处《中国油料作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第6期1100-1110,共11页; 基金山东省农业良种工程(2017LZN035) 山东省重点研发计划(2019GNC106069)。; 文摘生长素响应因子(Auxin response factor,ARF)是生长素信号转导途径中的一类重要转录因子,在种子萌发、器官形成、果实成熟、胚胎发生等多个生长发育过程发挥作用。为了揭示花生基因组中AhARF基因家族的特征,本研究利用生物信息学方法从花生基因组中鉴定了62个花生AhARF家族基因,它们不均匀分布于除1号和11号之外的其他18条染色体上,在A和B亚基因组对应关系的染色体上数目大体相同。依据系统发生关系,62个花生AhARFs与拟南芥AtARFs家族基因共同聚在除ClassIII(仅包含拟南芥AtARFs)外的其余4个分支。共线性分析共检测到33对片段重复基因,其Ka/Ks比值均小于1,受到环境压力的纯化选择。本研究还分析了它们的理化性质、蛋白保守结构域等特征。此外,基于22个组织转录组数据,绘制了62个花生AhARF家族基因的表达模式热图。进一步应用qRT-PCR方法,分析了可能与萌发相关的4个AhARF基因(AhARF10、AhARF20、AhARF23和AhARF46)的时空表达模式。本研究可为种子萌发相关AhARF基因的挖掘与功能鉴定提供基础。; 关键词花生 ARF基因家族系统进化分析蛋白保守结构域表达分析; Keywords Arachis hypogaea L. auxin response factor gene family phylogenic relationship conserved do⁃main of proteins expression pattern analysis; 分类号 S565.2 [农业科学—作物学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名DELLA家族蛋白研究进展被引量：5: 4; 作者李威李国瑞黄凤兰孙华军李跃丛安琪齐蒙白英俊李孟建陈永胜; 机构内蒙古民族大学内蒙古自治区高校蓖麻产业工程技术研究中心内蒙古自治区蓖麻育种重点实验室内蒙古自治区蓖麻产业协同创新培育中心; 出处《安徽农业科学》 CAS 2016年第32期147-148,共2页; 基金国家自然科学基金项目(31460353) 内蒙古民族大学市校合作项目(SXZD2012006 +5 种基金 SXZD2012017) 内蒙古自治区蓖麻育种重点实验室开放基金项目(MDK2016030); 文摘在已发现的植物GA信号传递分子中,有一类N端具有高度保守的DELLA结构域,称之为DELLA家族蛋白。介绍了DELLA蛋白的保守结构域和降解途径,并综述了其对多种植物激素信号的调控作用,以期提示植物生长发育和植物激素信号转导的奥秘。; 关键词 DELLA蛋白 GA 植物激素保守结构域; Keywords DELLA protein GA Plant hormone Conserved domain; 分类号 S188 [农业科学—农业基础科学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名荞麦ARF基因家族的鉴定及生物信息学分析被引量：7: 5; 作者李洪有霍冬敖蔡芳张晓娜石桃雄陈其皎陈庆富; 机构贵州师范大学荞麦产业技术研究中心; 出处《浙江农业学报》 CSCD 北大核心 2018年第1期7-13,共7页; 基金国家现代农业产业技术体系荞麦育种岗位科学家专项资金(CARS-08-A4) 贵州省高层次创新型人才培养计划(20154020) +1 种基金贵州师范大学资助博士科研项目(11904/0517051); 文摘生长素响应因子(auxin response factor,ARF)基因应答了生长素信号,在植物生长发育中具有重要的调控作用。以荞麦基因组数据库为基础,利用Blast P比对程序共鉴定了21个荞麦ARF基因,并对其基因结构、编码蛋白理化性质、保守结构域、保守基序、亚细胞定位、潜在磷酸化位点及系统进化关系进行了分析。基因结构分析表明,21个荞麦ARF基因均含有内含子,且不同基因间内含子数目存在较大差异。保守结构域分析显示,21个ARF蛋白均含有保守的B3和ARF结构域,部分ARF蛋白还含有Aux/IAA结构域。蛋白保守基序分析表明,21个ARF蛋白共有10个保守基序,基序长度在13~55个氨基酸之间。亚细胞定位分析表明,大多数ARF蛋白定位于细胞核,个别定位于叶绿体。潜在磷酸化位点分析显示,所有ARF蛋白均含有潜在的丝氨酸(Ser)、苏氨酸(Thr)和酪氨酸(Tyr)磷酸化位点,但各蛋白的不同磷酸化位点的数目差异较大。系统进化分析表明,21个ARF基因可以分为Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ三个亚家族,其中,Ⅰ亚家族可以进一步分为Ⅰa和Ⅰb两个家族,Ⅱ亚家族可以进一步分为Ⅱa和Ⅱb两个家族。研究结果为进一步克隆荞麦ARF基因及深入研究它们在荞麦中的功能提供了参考。; 关键词荞麦 ARF 生物信息学分析保守结构域进化分析; Keywords buckwheat ARF information analysis conserved domain evolution analysis; 分类号 S517 [农业科学—作物学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名解淀粉芽孢杆菌YP6中碱性磷酸酯酶AP2的生物信息学分析及酶学性质被引量：1: 6; 作者孟迪江威郝之奎廖祥儒; 机构江南大学工业生物技术教育部重点实验室商丘师范学院生物与食品学院台州职业技术学院应用生物技术研究所; 出处《食品研究与开发》 CAS 北大核心 2021年第23期169-176,共8页; 基金台州市科技计划(1801gy24) 台州职业技术学院横改纵课题(HX2019069、HX2019078)。; 文摘对解淀粉芽孢杆菌YP6基因组中编码碱性磷酸酯酶(AP2)的基因进行生物信息学分析、异源表达和酶学性质研究。结果表明,该基因长1752 bp,编码583个氨基酸,通过氨基酸序列分析,预测AP2的分子量为66 kDa,等电点为8.62,是一种结构稳定、亲水性高且有信号肽的碱性蛋白;经保守结构域分析和多序列比对,发现AP2具有PhoD超家族,并且含有与其它PhoD酶相同或相似的金属离子结合位点。酶学性质测定结果显示,AP2的最适温度30℃,最适pH 5.5,属于一种新的PhoD酶;在金属离子变化过程中,Mn^(2+)、Ba^(2+)和Co^(2+)始终对AP2有激活作用,Fe2+和Fe3+始终对AP2有抑制作用;不同浓度的EDTA-2Na、L-组氨酸、L-丝氨酸和L-半胱氨酸均能抑制AP2的活性;AP2对底物DPP和pNPP的kcat/Km值分别为1.1×10^(5) L/(mmol·s)和8.8×10^(2) L/(mmol·s)。; 关键词解淀粉芽孢杆菌YP6 PhoD酶生物信息学分析酶学性质保守结构域; Keywords Bacillus amyloliquefaciens YP6 PhoD enzymes bioinformatics analysis enzymatic properties conserved domain; 分类号 Q811.4 [生物学—生物工程] Q936 [生物学—微生物学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

	题名	作者	出处	发文年	被引量	操作
1	血吸虫血红蛋白降解途径的重构及关键酶蛋白保守结构域的分析	魏佳李园园李亦学于复东	《华东理工大学学报（自然科学版）》 CAS CSCD 北大核心	2011	0	在线阅读下载PDF 职称材料
2	双孢蘑菇中一种4R型MYB转录因子的基因克隆和生物信息学分析	刘翔赵紫璇赵月盈赵诗睿贾子怡姜含越袁帅孟德梅	《食品研究与开发》 CAS	2024	0	在线阅读下载PDF 职称材料
3	花生AhARF 基因家族鉴定与表达分析	唐桂英彭振英徐平丽李鹏祥朱洁琼单雷万书波	《中国油料作物学报》 CAS CSCD 北大核心	2020	4	在线阅读下载PDF 职称材料
4	DELLA家族蛋白研究进展	李威李国瑞黄凤兰孙华军李跃丛安琪齐蒙白英俊李孟建陈永胜	《安徽农业科学》 CAS	2016	5	在线阅读下载PDF 职称材料
5	荞麦ARF基因家族的鉴定及生物信息学分析	李洪有霍冬敖蔡芳张晓娜石桃雄陈其皎陈庆富	《浙江农业学报》 CSCD 北大核心	2018	7	在线阅读下载PDF 职称材料
6	解淀粉芽孢杆菌YP6中碱性磷酸酯酶AP2的生物信息学分析及酶学性质	孟迪江威郝之奎廖祥儒	《食品研究与开发》 CAS 北大核心	2021	1	在线阅读下载PDF 职称材料