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饲料中沙门氏菌检测方法的优化
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作者 娄迎霞 姚婷 +7 位作者 冯秀燕 曹林 李征 贾涛 赵茜 李月 庞玥彤 王继彤 《中国饲料》 北大核心 2024年第23期339-343,共5页
本研究以GB/T 13091-2018《饲料中沙门氏菌的测定》方法为确证方法,对102批次饲料样品进行检测,利用PCR技术及实时荧光PCR技术对沙门氏菌可疑菌落进行辅助鉴定,并与生化鉴定和血清学试验的结果相比较,以考察快速鉴定方法的准确性。结果... 本研究以GB/T 13091-2018《饲料中沙门氏菌的测定》方法为确证方法,对102批次饲料样品进行检测,利用PCR技术及实时荧光PCR技术对沙门氏菌可疑菌落进行辅助鉴定,并与生化鉴定和血清学试验的结果相比较,以考察快速鉴定方法的准确性。结果表明:3种方法的结果一致,实际检测过程中可用PCR技术替代生化鉴定及血清学试验,以减少人员误差,缩短检测时间。同时,利用16S rDNA测序技术,对D27-2-1(菌落形态为典型沙门氏菌)和D27-3-5(菌落形态与沙门氏菌菌落形态存在差异)菌株进行鉴定分析,结果显示D27-2-1为潘尼变形杆菌(Proteus penneri),D27-3-5为肠内沙门氏菌亚纲(Salmonella enterica subsp),说明沙门氏菌在环境影响下会发生突变,造成菌落形态特征与方法中所描述的沙门氏菌典型菌落形态特征存在差异,检测过程需同时挑取具有沙门氏菌典型形态及非典型菌落形态的菌株进行鉴定分析,防止漏检情况发生。 展开更多
关键词 饲料 沙门氏菌 传统培养法 PCR技术
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畜禽舍空气细菌内毒素两种检测方法比较分析
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作者 张忠科 《农业工程技术》 2024年第6期116-117,共2页
该文介绍了畜禽舍空气细菌内毒素的重要性和健康风险,阐述了传统培养法和分子生物学方法的原理、步骤以及各自的优缺点,并对两种方法的使用效率、准确性、检测范围、灵敏度、成本和操作便捷性等进行了比较,以期为畜禽舍空气细菌内毒素... 该文介绍了畜禽舍空气细菌内毒素的重要性和健康风险,阐述了传统培养法和分子生物学方法的原理、步骤以及各自的优缺点,并对两种方法的使用效率、准确性、检测范围、灵敏度、成本和操作便捷性等进行了比较,以期为畜禽舍空气细菌内毒素的检测提供参考。 展开更多
关键词 畜禽舍空气 细菌内毒素 传统培养法 分子生物学方
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水体中基因组提取方法的比较及水体中铜绿假单胞菌检测技术的研究 被引量:4
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作者 张淑红 许文涛 +3 位作者 石慧 程国灵 罗云波 黄昆仑 《食品工业科技》 CAS CSCD 北大核心 2012年第9期375-379,共5页
以河水为研究对象,采用沸水浴法、SDS法、CTAB法、酚氯仿法和改良法提取河水中的基因组,对提取效果进行比较,确定出最佳提取方法;并利用传统培养法和分子生物学方法对人工污染样品中的铜绿假单胞菌进行检测,对两种方法检测结果进行比较... 以河水为研究对象,采用沸水浴法、SDS法、CTAB法、酚氯仿法和改良法提取河水中的基因组,对提取效果进行比较,确定出最佳提取方法;并利用传统培养法和分子生物学方法对人工污染样品中的铜绿假单胞菌进行检测,对两种方法检测结果进行比较;最后实验利用4种自然界水体验证了分子生物学方法的准确性。结果表明加入溶菌酶的酚氯仿法对河水中的DNA提取效果最好;传统培养法和分子生物学方法检测结果一致,且分子生物学方法比传统培养法节省一半左右的时间;用分子生物学方法可以检测出自然界水体中的铜绿假单胞菌。 展开更多
关键词 河水 提取基因组 传统培养法 分子生物学方
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PCR方法快速检测变形杆菌的研究 被引量:5
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作者 毕水莲 唐书泽 +1 位作者 陈守义 吴希阳 《食品工业科技》 CAS CSCD 北大核心 2008年第7期246-249,253,共5页
建立了一种快速、准确检测变形杆菌属的PCR方法。采用传统分离培养法、全自动微生物分析系统检测法和常规PCR方法对66株变形杆菌样本分离株进行鉴定。三种检测方法结果一致,但PCR方法检测时间只需5~6h,比传统分离方法节省40h左右。通过... 建立了一种快速、准确检测变形杆菌属的PCR方法。采用传统分离培养法、全自动微生物分析系统检测法和常规PCR方法对66株变形杆菌样本分离株进行鉴定。三种检测方法结果一致,但PCR方法检测时间只需5~6h,比传统分离方法节省40h左右。通过对13株非变形杆菌属菌株的特异性实验和标准菌株的灵敏度实验,进一步表明,PCR方法具有操作简便、准确可靠以及灵敏特异的特点,优于传统分离培养法和全自动微生物分析系统检测法。 展开更多
关键词 变形杆菌 聚合酶链反应 传统分离培养 全自动微生物分析系统
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饲料及其原料中沙门菌快速检测方法的比较研究 被引量:1
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作者 舒畅 高延玲 +5 位作者 方忠意 李金磊 董鹏 狄元冉 王瑞宁 吴志明 《上海畜牧兽医通讯》 2019年第6期10-13,共4页
为了探索饲料及其原料中沙门菌的检测方法,对河南省饲料企业采集239份饲料及其原料,分别采用常规培养法、PCR法、EMA-PCR法、Romer快速检测法检测沙门菌,并对检测结果进行比较.结果显示:常规培养法检出7份阳性,PCR法检出9份阳性,EMA-PC... 为了探索饲料及其原料中沙门菌的检测方法,对河南省饲料企业采集239份饲料及其原料,分别采用常规培养法、PCR法、EMA-PCR法、Romer快速检测法检测沙门菌,并对检测结果进行比较.结果显示:常规培养法检出7份阳性,PCR法检出9份阳性,EMA-PCR法检出7份阳性,Romer快速检测法检出6份阳性;同常规培养法相比,PCR法容易产生假阳性结果,Romer快速检测法容易出现假阴性结果,EMA-PCR法与常规法吻合率为100%,能够快速、准确地检测饲料及其原料中沙门菌. 展开更多
关键词 沙门菌 传统培养法 PCR EMA-PCR 检测
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青石斑鱼肠道菌群研究 被引量:19
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作者 覃映雪 王晓林 +2 位作者 鄢庆枇 王赟 叶冬凤 《海洋水产研究》 CSCD 北大核心 2007年第5期18-23,共6页
以中国沿海重要经济鱼类青石斑为研究对象,分别以营养琼脂和脑心浸液琼脂培养基检测其肠道中总的好气和兼性厌氧菌及专性厌氧菌的数量,以TCBS(Thiosulfate Citrate Bile Salts Su-crose)、麦康凯、NAC(Nalidixic acid-cetri mide)、锰... 以中国沿海重要经济鱼类青石斑为研究对象,分别以营养琼脂和脑心浸液琼脂培养基检测其肠道中总的好气和兼性厌氧菌及专性厌氧菌的数量,以TCBS(Thiosulfate Citrate Bile Salts Su-crose)、麦康凯、NAC(Nalidixic acid-cetri mide)、锰营养盐、TPY(Tryptone-phytone-yeast extract)和SL(Rogosa SL.)琼脂等6种选择性培养基对青石斑肠道菌群进行计数和选择性分离,并对分离的优势菌株进行16S rRNA基因同源性分析。结果表明,青石斑鱼肠道内好气及兼性厌氧菌的总量可达5.3×105CFU/g。在6种选择性培养基中TCBS培养基上生长的菌落数量最多,约占总好气菌及兼性厌氧菌的36%,优势菌与牙鲆弧菌(Vibrio olivaceussp.nov.)同源性最高;麦康凯琼脂平板中生长的菌落数量次之,约占总好气菌及兼性厌氧菌的24%,优势菌与阿氏肠杆菌(E.asburiae)同源性最高;而NAC和锰营养盐琼脂平板中生长的菌落数量较少,优势菌分别与假单胞菌属(Pseudomonassp.)和枯草芽孢杆菌(Bacillus subtilis)的同源性最高。厌氧菌的数量很少,约为总好气和兼性厌氧菌数量的1%,其中TPY培养基中生长的菌落数量约占总厌氧菌数量的53%,优势菌与拟杆菌(Bacteroidessp.)同源性最高;SL培养基中没有检测到细菌。 展开更多
关键词 青石斑鱼 肠道菌群 传统培养法 16S RRNA基因 优势菌
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腐败干酪中微生物种类的分离与鉴定 被引量:2
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作者 杨攀 黄丽 +4 位作者 唐艳 冯玲 农皓如 李玲 曾庆坤 《中国乳品工业》 CAS 北大核心 2019年第3期17-20,36,共5页
本文选取腐败干酪,用传统的微生物培养法培养、分离和鉴定,同时通过18S rDNA高通量测序法,根据稀释曲线、OTU聚类以及样品的多样性分析来反映腐败干酪中的微生物菌群。通过传统的微生物培养法得到3种菌株,其中两种为青霉菌属,一种为酵... 本文选取腐败干酪,用传统的微生物培养法培养、分离和鉴定,同时通过18S rDNA高通量测序法,根据稀释曲线、OTU聚类以及样品的多样性分析来反映腐败干酪中的微生物菌群。通过传统的微生物培养法得到3种菌株,其中两种为青霉菌属,一种为酵母菌属。通过高通量测序得出腐败干酪中微生物菌群主要有青霉菌属、德巴利(氏)酵母属、耐碱酵母属、丝孢酵母属、木拉克酵母属、双足囊菌属以及未分类的真菌等。 展开更多
关键词 腐败干酪 传统培养法 分离鉴定 高通量测序
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应用Illumina MiSeq高通量测序技术解析梅干菜中细菌多样性 被引量:13
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作者 尚雪娇 王玉荣 +3 位作者 杨江 折米娜 赵慧君 郭壮 《中国酿造》 CAS 北大核心 2019年第1期140-144,共5页
采用Illumina Mi Seq高通量测序技术对恩施地区梅干菜中细菌多样性进行解析,同时使用传统纯培养技术对乳酸菌进行分离鉴定。结果表明,恩施地区梅干菜中含量最高的优势细菌门为硬壁菌门(Firmicutes),其平均相对含量高达60.70%。优势细菌... 采用Illumina Mi Seq高通量测序技术对恩施地区梅干菜中细菌多样性进行解析,同时使用传统纯培养技术对乳酸菌进行分离鉴定。结果表明,恩施地区梅干菜中含量最高的优势细菌门为硬壁菌门(Firmicutes),其平均相对含量高达60.70%。优势细菌属为乳酸杆菌属(Lactobacillus)、假单胞菌属(Pseudomonas)、葡萄球菌属(Staphylococcus)、魏斯氏菌属(Weissella)、鞘脂单胞菌属(Sphingomonas)、嗜冷杆菌属(Psychrobacter)、四联球菌属(Tetragenococcus)和棒状杆菌属(Corynebacterium),其平均相对含量分别为60.50%、8.69%、2.86%、1.73%、1.28%、1.07%、1.03%、1.00%。采用传统培养方法从梅干菜分离出5种共12株乳酸菌,经分子生物学鉴定分别为植物乳杆菌(Lactobacillus plantarum)、短乳杆菌(Lactobacillus brevis),副干酪乳杆菌副干酪亚种(Lactobacillus paracasei subsp. paracasei)、食品乳杆菌(Lactobacillus alimentarius)和融合魏斯氏菌(Weissella confusa)。恩施地区梅干菜中的细菌主要以乳酸菌为主,且乳酸杆菌多样性较高。 展开更多
关键词 梅干菜 高通量测序技术 传统培养法 细菌多样性 乳酸菌
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新采收稻谷与仓储稻谷的霉菌菌相分析 被引量:5
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作者 章采东 邱彦超 +2 位作者 李殿威 符丽雪 钱丽丽 《粮油食品科技》 2020年第2期103-107,共5页
采用传统培养法和宏基因组学技术对比了2017年新收获稻谷和将其仓储一年后稻谷中的真菌菌相差异。结果显示,稻谷中的真菌菌群由各类田间真菌转变为曲霉类和青霉类等仓储型真菌为主的优势菌群,并且两种方法的检测结果有着高度的一致性。... 采用传统培养法和宏基因组学技术对比了2017年新收获稻谷和将其仓储一年后稻谷中的真菌菌相差异。结果显示,稻谷中的真菌菌群由各类田间真菌转变为曲霉类和青霉类等仓储型真菌为主的优势菌群,并且两种方法的检测结果有着高度的一致性。可为稻谷在长距离运输期间的霉变防控提供重要的指导依据。 展开更多
关键词 稻谷 传统培养法 宏基因组 优势菌群 霉菌
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黄绿卷毛菇生境中矮嵩草内生真菌多样性比较研究 被引量:5
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作者 郭璟 谢占玲 +4 位作者 罗涛 薛治峰 郭建娟 李发雄 张秀娟 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第11期109-117,共9页
为研究黄绿卷毛菇生境中矮嵩草的内生真菌多样性,本研究结合传统分离培养法和宏基因组法对矮嵩草内生真菌的多样性进行比较研究。结果显示:传统法在矮嵩草共分离鉴定得到66株内生真菌均属于子囊菌门(Ascomycota),分类到7目,分别为格孢腔... 为研究黄绿卷毛菇生境中矮嵩草的内生真菌多样性,本研究结合传统分离培养法和宏基因组法对矮嵩草内生真菌的多样性进行比较研究。结果显示:传统法在矮嵩草共分离鉴定得到66株内生真菌均属于子囊菌门(Ascomycota),分类到7目,分别为格孢腔目(Pleosporales)、炭角菌目(Xylariales)、散囊菌目(Eurotiales)、柔膜菌目(Helotiales)、肉座菌目(Hypocreales)、毛霉菌目(Mucorales)、Glomerellales,优势种群为Stagonospora bicolor;根的多样性指数,丰富度指数,均匀度指数分别为1.63、1.56、0.82;未分离到黄绿卷毛菇;宏基因组法检测出587种内生真菌,子囊菌门(Ascomycota)占77.21%、担子菌门(Basidiomycota)占16.21%,剩下的6.58%为unclassified真菌,优势种群为Fusarium sp,多样性指数,丰富度指数,均匀度指数分别为3.13、39.08、0.48;检测到黄绿卷毛菇,相对丰度为11.39;比较两种方法,黄绿卷毛菇生境的矮嵩草植物中,蕴含着丰富的内生真菌资源,黄绿卷毛菇为优势内生真菌种群之一。该研究首次证明黄绿卷毛菇为嵩草属的内生真菌,是研究黄绿卷毛菇的营养类型及其与植物间的互作关系的新突破。 展开更多
关键词 矮嵩草 内生真菌多样性 黄绿卷毛菇 传统培养法 宏基因组
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8种市售“金花”茶中微生物的分离鉴定 被引量:8
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作者 杨瑞娟 王桥美 +3 位作者 彭文书 季爱兵 张文杰 严亮 《热带农业科学》 2019年第10期81-88,共8页
明确不同产地、不同类别的"金花"茶中微生物的区别与联系,为茶叶加工工艺的优化与创新提供理论基础。利用传统培养法结合DNA测序分析,对八种"金花"茶样中的微生物进行分离鉴定,结果表明:分离出的"金花"... 明确不同产地、不同类别的"金花"茶中微生物的区别与联系,为茶叶加工工艺的优化与创新提供理论基础。利用传统培养法结合DNA测序分析,对八种"金花"茶样中的微生物进行分离鉴定,结果表明:分离出的"金花"菌为冠突曲霉和冠突散囊菌;对"金花"菌以外的其他可培养微生物进行了分离鉴定,所有茶样中均分离出了阿姆斯特丹曲霉(Aspergillus amstelodami)和谢瓦氏曲霉(Aspergillus chevalieri)。8种"金花"茶中均分离得到了"金花"菌,但由于茶叶类别和产地的不同,8种茶样所含的微生物又各有不同,同一类别的茶样中含有的微生物种类更相似。 展开更多
关键词 冠突散囊菌 传统培养法 微生物 分子鉴定
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肉枣加工过程中细菌群落消长规律 被引量:1
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作者 周晓 尹含靓 +2 位作者 谭益升 孙军华 刘洋 《食品与机械》 CSCD 北大核心 2023年第12期109-116,共8页
目的:确定导致样品胀袋的关键控制点,加强肉枣加工过程中微生物污染防控。方法:采用微生物传统培养法结合高通量测序手段分析肉枣生产全过程中不同加工工序样品及胀袋样品的微生物变化情况。结果:整体来看,原料中菌落总数较低,其中鸡皮... 目的:确定导致样品胀袋的关键控制点,加强肉枣加工过程中微生物污染防控。方法:采用微生物传统培养法结合高通量测序手段分析肉枣生产全过程中不同加工工序样品及胀袋样品的微生物变化情况。结果:整体来看,原料中菌落总数较低,其中鸡皮中菌落总数最高达9.10×10^(4)CFU/g,蒸煮后菌落总数下降至30 CFU/g,但真空包装后菌落总数显著上升,说明真空包装工序存在较大污染风险。胀袋样品中微生物增殖明显,菌落总数为1.03×10^(6)~3.30×10^(6)CFU/g。肉枣原料中的优势菌属为不动杆菌属(Acinetobacter)、嗜冷杆菌属(Psychrobacter)和假单胞菌属(Pseudomonas)。加工过程中样品的主导菌属为葡萄球菌属(Staphylococcus),灭菌后其相对丰度降至0.02%。而胀袋样品中均以枝芽孢菌属(Virgibacillus)为主,平均相对丰度为99.37%;该属在灌肠工序开始出现,且耐热性较强,灭菌后其相对丰度增加。结论:灌肠和包装工序可能为肉枣加工过程中的关键污染点。 展开更多
关键词 肉枣 传统培养法 高通量测序 胀袋 细菌多样性
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使用多重PCR检测奶牛乳房炎乳汁中的病原菌 被引量:2
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作者 张玉龙 左之才 +5 位作者 王宇 崔耀成 李志强 姚彩霞 黄赞恒 才冬杰 《中国兽医杂志》 CAS 北大核心 2021年第11期38-43,共6页
本试验运用多重PCR检测技术检测奶牛乳房炎乳汁中的金黄色葡萄球菌(Staphylococcus aureus)、无乳链球菌(Streptococcus agalactiae)和绿脓杆菌(Pseudomonas aeruginosa)3种病原菌,确认该方法在乳汁病原菌检测中的适用性和有效性,并探... 本试验运用多重PCR检测技术检测奶牛乳房炎乳汁中的金黄色葡萄球菌(Staphylococcus aureus)、无乳链球菌(Streptococcus agalactiae)和绿脓杆菌(Pseudomonas aeruginosa)3种病原菌,确认该方法在乳汁病原菌检测中的适用性和有效性,并探讨病原菌的感染情况。选取四川奶牛场送检的191份奶样(经过加州乳房炎检测法检测,其中16份为正常奶样,64份为隐性乳房炎奶样,111份为临床型乳房炎奶样),分别进行多重PCR法和传统细菌学培养法检测,并对照和分析2种方法的差异。结果显示,多重PCR检测法检出135株致病菌,检出率为70.7%;传统细菌学培养法检出99株致病菌,检出率为51.8%;通过卡方分析证明2种检测方法的检出率差异显著(P<0.05)。鉴于多重PCR法表现出较强的特异性、灵敏度,且操作方便,非常适用于3种混合感染病原菌在奶牛临床型乳房炎、隐性乳房炎奶样的检测和流行病学调查。 展开更多
关键词 奶牛乳房炎 病原菌 传统细菌学培养 多重PCR
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五个地区玉米青贮菌群多样性的研究 被引量:8
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作者 熊乙 赵燕梅 +4 位作者 许庆方 玉柱 郭继承 冯富 李凯凯 《草学》 2017年第5期16-22,共7页
旨在研究我国5个地区全株玉米青贮中微生物种类的组成差异。试验对黑龙江、新疆、贵州、山西、山东5个地区牧场的全株青贮玉米的微生物多样性进行比较。分别用传统分离培养法和高通量测序法对全株玉米青贮乳酸菌、酵母菌、霉菌进行检测... 旨在研究我国5个地区全株玉米青贮中微生物种类的组成差异。试验对黑龙江、新疆、贵州、山西、山东5个地区牧场的全株青贮玉米的微生物多样性进行比较。分别用传统分离培养法和高通量测序法对全株玉米青贮乳酸菌、酵母菌、霉菌进行检测。结果表明,新疆地区乳杆菌为优势菌群,真菌种类较少;黑龙江地区醋酸菌为优势菌群,乳杆菌相对较少,真菌种类也较少。贵州牧场真菌种类最多,青霉菌为优势菌群。 展开更多
关键词 玉米青贮 传统分离培养 高通量测序 菌群多样性
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冷藏小龙虾优势腐败菌的筛选鉴定及细菌群落结构和多样性分析 被引量:8
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作者 孟凌云 戴泽川 +1 位作者 李娇 毛相朝 《肉类研究》 2022年第6期16-22,共7页
以4℃贮藏小龙虾货架期终点筛选武汉孝感小龙虾中优势腐败菌,同时结合高通量测序方法,进一步确定小龙虾中优势腐败菌,并对小龙虾贮藏过程中菌相变化、微生物结构及其多样性进行分析。结果表明:传统培养法从腐败小龙虾中共筛选出10株腐败... 以4℃贮藏小龙虾货架期终点筛选武汉孝感小龙虾中优势腐败菌,同时结合高通量测序方法,进一步确定小龙虾中优势腐败菌,并对小龙虾贮藏过程中菌相变化、微生物结构及其多样性进行分析。结果表明:传统培养法从腐败小龙虾中共筛选出10株腐败菌,包括波罗的海希瓦氏菌(Shewanella baltica)、维氏气单胞菌(Aeromonas veronii)、普通变形杆菌(Proteus vulgaris)等;在属水平上,高通量测序法最终确定气单胞菌属(Aeromonas sp.)及希瓦氏菌属(Shewanella sp.)是小龙虾腐败末期相对丰度最大的2种优势腐败菌;同时,高通量测序结果表明,随着贮藏时间的延长,小龙虾微生物群落丰富度、多样性及均匀度不断下降,这与腐败末期优势腐败菌的大量增长及生长繁殖过程中抑制其他种类微生物有关。 展开更多
关键词 冷藏小龙虾 优势腐败菌 传统培养 高通量测序 微生物多样性
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