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高原肺水肿大鼠肺组织基因表达谱分析
1
作者 徐刚 吴刚 +6 位作者 孙滨达 刘宝 高志奇 陈建 高钰琪 高文祥 陈德伟 《陆军军医大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第11期1235-1243,共9页
目的利用基因芯片技术分析高原肺水肿(high altitude pulmonary edema,HAPE)大鼠模型肺组织差异表达基因,为深入探讨HAPE发生的分子机制提供新线索。方法将8周龄健康雄性SD大鼠[体质量(200±20)g]按随机数字表法分为常氧对照(NC)组... 目的利用基因芯片技术分析高原肺水肿(high altitude pulmonary edema,HAPE)大鼠模型肺组织差异表达基因,为深入探讨HAPE发生的分子机制提供新线索。方法将8周龄健康雄性SD大鼠[体质量(200±20)g]按随机数字表法分为常氧对照(NC)组、脂多糖(Lipopolysaccharide,LPS)组、低压低氧(Hypoxia)组和低压低氧复合低剂量LPS(HL)组。LPS组和HL组按照每100 g体质量尾静脉注射0.1 mL浓度为0.05%的LPS溶液,NC组和Hypoxia组给予等量生理盐水;Hypoxia组和HL组进行模拟海拔5000 m低压低氧处理6 h,NC组和LPS组于舱外同时饲养。检测肺组织的湿/干质量比(wet/dry mass ratio,WDR)、支气管肺泡灌洗液(bronchoalveolar lavage fluid,BALF)蛋白含量,HE染色观察肺组织病理改变。提取肺组织总RNA,采用Affymetrix基因芯片检测mRNA表达谱,采用Metascape在线基因注释和分析系统(http://metascape.org)对差异表达基因进行基因本体论(gene ontology,GO)和京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)信号通路聚类分析。结果HL组大鼠肺组织表现出明显的充血、水肿、肺泡间隔增宽。与NC组比较,HL组大鼠肺WDR显著增加(P<0.01),BALF蛋白含量显著升高(P<0.05)。基因表达检测发现,相对NC组,Hypoxia组有79个基因表达上调,59个基因表达下调,LPS组473个基因表达上调,695个基因表达下调,HL组669个基因表达上调,1253个基因表达下调。GO和KEGG信号通路聚类分析显示:HL组差异表达上调基因主要富集于细胞因子介导的信号通路、对IL-1的反应、炎症反应调节等生物学过程,以及细胞因子-细胞因子受体相互作用、TNF、NF-κB、IL-17、补体和凝血级联反应等信号通路;表达下调的基因主要富集到细胞外基质组织、内皮细胞迁移调控、细胞-基质黏附等生物学过程,以及黏着斑、Wnt、cGMP-PKG、PI3K-Akt、Rap1等信号通路。HL组大鼠肺组织中NF-κB、TNF-α、IL-1β以及IL-6的mRNA表达均显著上调(P<0.01)。结论低氧复合低剂量LPS可稳定复制大鼠HAPE模型,低氧可显著增强LPS诱导的炎症、免疫反应,显著增强炎症介质的表达,促进HAPE的发生发展。 展开更多
关键词 高原肺水肿 低氧 基因表达谱 基因芯片
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基因表达谱芯片在胰腺癌相关基因筛选中的应用研究 被引量：28
2
作者 金钢 胡先贵 +6 位作者 应康 李瑶 唐榕 唐岩 景在平 谢毅 毛裕民 《第二军医大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2000年第9期819-822,共4页
目的 :探讨基因表达谱芯片技术在高通量筛查肿瘤相关基因群及研究胰腺癌分子病理学变化中的应用价值。方法 :应用含有 40 96条人类全长基因的 c DNA表达谱芯片 ,对 3例临床切除的胰腺癌及正常胰腺标本的基因表达谱进行分析。 结果 :在 ... 目的 :探讨基因表达谱芯片技术在高通量筛查肿瘤相关基因群及研究胰腺癌分子病理学变化中的应用价值。方法 :应用含有 40 96条人类全长基因的 c DNA表达谱芯片 ,对 3例临床切除的胰腺癌及正常胰腺标本的基因表达谱进行分析。 结果 :在 3例胰腺癌和正常胰腺组织中均有差异表达的基因 398条 ,其中新基因 2 89条 ,老基因 10 9条。从老基因中筛选出有显著表达差异基因 37条 ,其中在胰腺癌组织中上调基因 2 0条 ,下调基因 17条。 结论 :运用本基因表达谱芯片对基因表达谱进行分析 ,能够有效筛查出新的胰腺癌相关基因。 展开更多
关键词 微矩阵基因芯片 基因表达谱 胰腺肿瘤 基因筛选
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伤寒沙门菌基因组DNA芯片的制备与基因表达谱分析应用 被引量：14
3
作者 生秀梅 黄新祥 +5 位作者 茅凌翔 朱超望 徐顺高 张海方 许化溪 刘秀梅 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2009年第2期206-212,共7页
伤寒沙门菌是一种具有鞭毛的革兰阴性人类肠道致病菌,也是一种重要的原核生物研究用模式菌.基因组芯片能够系统、全面且高效地观察生物的基因表达及进行基因组结构比较.利用伤寒沙门菌现有的全基因组序列,以Ty2菌株的基因组为基准,选取C... 伤寒沙门菌是一种具有鞭毛的革兰阴性人类肠道致病菌,也是一种重要的原核生物研究用模式菌.基因组芯片能够系统、全面且高效地观察生物的基因表达及进行基因组结构比较.利用伤寒沙门菌现有的全基因组序列,以Ty2菌株的基因组为基准,选取CT18菌株和z66阳性菌株的特异性蛋白编码基因,设计特异性引物,经PCR有效扩增出4201个基因,产物纯化后点样于多聚赖氨酸玻片制备伤寒沙门菌基因组DNA芯片,并验证了芯片样点位次与效果.通过对基因表达谱分析的各种条件进行优化,建立相应的表达谱分析方法,并用于比较伤寒沙门菌野生株在高渗、低渗条件下的基因表达差异,结果与以前的报道基本一致.结果表明,成功建立了伤寒沙门菌基因组DNA芯片及表达谱分析方法,可为有关伤寒沙门菌基因表达调控及致病性机理、进化和基因多样性等方面的深入研究提供有效的技术支持. 展开更多
关键词 伤寒沙门菌 基因组DNA芯片 基因表达谱
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应用基因表达谱芯片从不同转移能力的乳腺癌细胞中筛选转移相关基因 被引量：9
4
作者 叶丽虹 尤嘉琮 +7 位作者 乔玲 蔡娜 王长晔 刘毅 吴晶辉 吴莲英 王洪辉 张晓东 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2005年第5期421-428,共8页
人乳腺癌细胞系MCF-7及其转移亚克隆LM-MCF-7为肿瘤转移分子机制的研究提供了细胞模型.应用基因芯片技术比较两种具有不同转移能力细胞系基因表达谱的差异,寻找乳腺癌转移相关基因.提取两种细胞总RNA,分别用Cy5-dCTP、Cy3-dCTP标记LM-MC... 人乳腺癌细胞系MCF-7及其转移亚克隆LM-MCF-7为肿瘤转移分子机制的研究提供了细胞模型.应用基因芯片技术比较两种具有不同转移能力细胞系基因表达谱的差异,寻找乳腺癌转移相关基因.提取两种细胞总RNA,分别用Cy5-dCTP、Cy3-dCTP标记LM-MCF-7和MCF-7的cDNA,并与含有21329个基因的芯片进行杂交并扫描,利用GenePixPro4.0图像分析软件处理数据判断基因是否在两个细胞中存在表达差异.经互换荧光标记物重复两次实验,共筛选出差异表达基因67个,其中41个在LM-MCF-7细胞中表达上调,26个在LM-MCF-7细胞中表达下调.应用实时定量RT-PCR对7个表达差异明显的基因进行了验证.生物信息学分析结果提示,上述发现的差异基因编码产物与细胞内信号转导、转录调节、应激反应、新陈代谢、发育、细胞运动、细胞凋亡和细胞粘连等功能有关.据文献报道,这些差异表达的基因中有35个与肿瘤有关,其中9个与乳腺癌转移有关,6个可能参与肿瘤浸润和转移过程.根据基因芯片检测的结果,从功能上对LM-MCF-7细胞和MCF-7细胞与细胞凋亡的关系进行了研究,发现具有高转移倾向的LM-MCF-7细胞与MCF-7细胞相比,抗凋亡能力较强.上述与肿瘤转移相关基因在肿瘤转移中的作用及其分子机理有待深入研究. 展开更多
关键词 基因芯片 基因表达谱 乳腺癌 肿瘤转移
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应用基因表达谱芯片筛选丙型肝炎病毒核心蛋白反式调节基因 被引量：13
5
作者 刘妍 成军 +2 位作者 王建军 陆荫英 杨倩 《解放军医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2003年第1期55-57,共3页
应用基因表达谱芯片技术对HCV核心蛋白表达质粒pcDNA3 1(- ) core转染的HepG2细胞和空载体处理的相同细胞差异表达的mRNA进行检测。基因表达谱芯片所检测的 115 2条目的基因均为GenBank中登录的基因 ,HCV核心表达质粒转染的细胞有95条... 应用基因表达谱芯片技术对HCV核心蛋白表达质粒pcDNA3 1(- ) core转染的HepG2细胞和空载体处理的相同细胞差异表达的mRNA进行检测。基因表达谱芯片所检测的 115 2条目的基因均为GenBank中登录的基因 ,HCV核心表达质粒转染的细胞有95条差异表达基因 ,其中 4 5条基因表达增强 ,5 0条基因表达降低。这些核心蛋白反式调节基因与细胞增殖、分化、凋亡、信号转导及免疫调节密切相关。本实验结果为进一步阐明HCV核心蛋白致病 (癌 )的分子生物学机制提供了理论依据。 展开更多
关键词 基因表达谱芯片 筛选 丙型肝炎病毒 核心蛋白 反式调节
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表达谱基因芯片 被引量：13
6
作者 徐伟文 李文全 毛裕民 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2001年第6期822-826,共5页
表达谱基因芯片具有高通量、缩微、多参数、平行化等优点 .在功能基因组学研究中正发挥越来越重要的作用 .就其原理、应用。
关键词 表达谱基因芯片 基因表达谱 应用
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基因芯片技术与基因表达谱研究 被引量：8
7
作者 郭新红 姜孝成 +1 位作者 潘晓玲 陈良碧 《生物学杂志》 CAS CSCD 2001年第5期1-2,13,共3页
基因芯片技术是近年来出现的分子生物学与微电子技术相结合的最新DNA分析检测技术。该技术将成为信息科学与生命科学之间的联系纽带 ,为后基因组时代基因功能的分析提供一种最重要的技术手段。
关键词 基因芯片 基因表达谱 原理 应用
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基于表达谱芯片挖掘清远麻鸡和科宝肉鸡比目鱼肌差异表达基因 被引量：5
8
作者 束婧婷 章明 +4 位作者 宋迟 单艳菊 徐文娟 宋卫涛 李慧芳 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第1期25-33,共9页
对生长速度长期的高压选择导致了快大型肉鸡与优质型地方鸡显著的表型差异,本研究旨在研究这种表型差异的分子遗传机理。采用Agilent鸡全基因组表达谱芯片对达到性成熟的优质型清远麻鸡(112d)和快大型科宝肉鸡(42d)比目鱼肌中与肌纤维... 对生长速度长期的高压选择导致了快大型肉鸡与优质型地方鸡显著的表型差异,本研究旨在研究这种表型差异的分子遗传机理。采用Agilent鸡全基因组表达谱芯片对达到性成熟的优质型清远麻鸡(112d)和快大型科宝肉鸡(42d)比目鱼肌中与肌纤维发育和类型组成相关的候选基因及信号通路进行系统筛查。结果,芯片分析共筛选到差异倍数在2倍及以上的基因1 318个,以科宝肉鸡作为参照,清远麻鸡中上调基因501个,下调基因817个,主要涉及到肌肉发育、能量代谢、脂质代谢等生物学过程。基于KEGG Pathway分析发现,差异基因除了参与肌纤维发育和分化相关信号通路(如Hedgehog信号通路和Ca2+信号通路)外,Wnt信号通路,mTOR信号通路,MAPK信号通路,ErbB信号通路、JAK-STAT信号通路等一些跟能量代谢相关的信号通路也被富集为显著的信号通路。与能量代谢相关的信号通路和与肌肉发育相关的信号通路相互作用形成一个调控网络从而影响肌纤维的发育,筛选出了20个在肌纤维生长发育及分化过程中可能具有重要影响的候选基因,但这些差异表达基因在肌纤维的发育和分化过程中的作用尚待深入研究。 展开更多
关键词 肌纤维性状 表达谱芯片 差异表达基因 清远麻鸡 科宝肉鸡
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ARP-SRP基因表达谱芯片对脑损伤的初步研究 被引量：4
9
作者 周亦武 张益鹄 +2 位作者 邓伟年 刘艳 胡志红 《法医学杂志》 CAS CSCD 2002年第3期146-149,共4页
目的研究脑挫伤后ARP-SRP基因表达谱差异及其法医学意义。方法从脑组织提取mRNA,应用ARP-SRP-1.0S基因芯片,研究脑挫伤组织与对照脑组织细胞凋亡蛋白和应激反应蛋白相关基因特异性表达差异。结果基因芯片杂交结果中,发现人类溶酶体的胃... 目的研究脑挫伤后ARP-SRP基因表达谱差异及其法医学意义。方法从脑组织提取mRNA,应用ARP-SRP-1.0S基因芯片,研究脑挫伤组织与对照脑组织细胞凋亡蛋白和应激反应蛋白相关基因特异性表达差异。结果基因芯片杂交结果中,发现人类溶酶体的胃蛋白酶抑制剂不敏感蛋白酶基因(CLN2)表达水平显著下降。结论CLN2基因与一种婴儿致死性神经变性疾病LINCL有关,但CLN2基因在脑损伤中的作用尚有待进一步研究;基因芯片在研究脑损伤后相关基因的改变具有快速、高通量、高敏度等特点。 展开更多
关键词 基因芯片 微矩阵基因芯片 基因表达谱 差异表达 脑损伤 法医鉴定学
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人类肛门直肠畸形基因表达谱的研究 被引量：4
10
作者 白玉作 王维林 +1 位作者 黄英 王练英 《中国医科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2003年第6期493-495,共3页
目的 :研究肛门直肠畸形患儿直肠末端的基因表达谱 ,初步筛查肛门直肠畸形的差异表达基因。方法 :应用基因表达谱芯片技术对 3例先天性肛门直肠畸形患儿的直肠末端组织和 3例正常直肠末端组织的基因表达进行检测。结果 :在 186个发育相... 目的 :研究肛门直肠畸形患儿直肠末端的基因表达谱 ,初步筛查肛门直肠畸形的差异表达基因。方法 :应用基因表达谱芯片技术对 3例先天性肛门直肠畸形患儿的直肠末端组织和 3例正常直肠末端组织的基因表达进行检测。结果 :在 186个发育相关基因中 ,共发现差异表达基因 5 4个 ,表达上调的 5 2个 ,表达下调的 2个。结论 :先天性肛门直肠畸形的发生涉及多基因改变。基因表达谱芯片技术可同时定量研究大量基因表达水平 。 展开更多
关键词 人类肛门直肠畸形 基因芯片 基因表达谱
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应用cDNA芯片分析79个新基因的人胚组织表达谱 被引量：4
11
作者 马淑华 王敦成 +2 位作者 邹宗亮 沈倍奋 王升启 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2001年第4期532-536,共5页
大规模cDNA测序和生物信息学技术相结合 ,得到来自于商品化的人胚肾cDNA文库 79个代表新基因的表达序列标签 (EST) .随后 ,采用高速度机械手制备这些cDNA的基因芯片 ,用于鉴定 79个新基因的ESTs在2 0周、 2 6周两个胚胎时期 6种组织中... 大规模cDNA测序和生物信息学技术相结合 ,得到来自于商品化的人胚肾cDNA文库 79个代表新基因的表达序列标签 (EST) .随后 ,采用高速度机械手制备这些cDNA的基因芯片 ,用于鉴定 79个新基因的ESTs在2 0周、 2 6周两个胚胎时期 6种组织中的基因表达状况 ,以研究这些EST片段代表的新基因功能提供线索 .通过芯片杂交及结果分析 ,得到同一个组织两个不同时相 8个差异表达的基因 。 展开更多
关键词 CDNA芯片 新基因 表达序列标签 差异表达RNA分析 人胚组织表达谱
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表达谱基因芯片技术及其在兽医学上的应用 被引量：4
12
作者 邹丰才 吴绍强 +1 位作者 李明伟 朱兴全 《中国人兽共患病杂志》 CAS CSCD 北大核心 2005年第4期346-349,共4页
关键词 基因芯片技术 表达谱 20世纪90年代 功能基因组学研究 人类基因组计划 医学 后基因时代 1989年 基因组测序 基因表达及 研究重点 平行检测 国际专利 功能分析 高通量
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依硫磷酸调控人类基因表达谱的预测及生物信息学分析 被引量：6
13
作者 杨波 蔡力力 +7 位作者 迟小华 卢学春 张峰 脱帅 朱宏丽 刘丽宏 严江伟 脱朝伟 《中国实验血液学杂志》 CAS CSCD 2011年第3期711-716,共6页
本研究对依硫磷酸调控人类基因表达谱进行生物信息学分析,预测其可能具有的新生物学作用,为深入研究依硫磷酸的药理学作用及方法提供指导。以依硫磷酸(amifostine)为关键词,在互联网开放性数据库包括GEO、Affymetrix基因芯片表达数据库... 本研究对依硫磷酸调控人类基因表达谱进行生物信息学分析,预测其可能具有的新生物学作用,为深入研究依硫磷酸的药理学作用及方法提供指导。以依硫磷酸(amifostine)为关键词,在互联网开放性数据库包括GEO、Affymetrix基因芯片表达数据库、人类基因组数据库(GenBank)、基因表达数据库SAGE、GeneCard、InterPro、ProtoNet、UniProt和BLOCKS中搜索,并进一步对筛选出的基因表达数据库进行有效性检验、基因表达差异和聚类分析。结果表明,仅在GEO数据库中筛选出1个与依硫磷酸相关的基因表达谱数据库(accession:GSE3212)。有效性检验及基因表达差异分析显示,依硫磷酸处理K562细胞后,分类全基因组仅2.14%(460/192000)的基因在转录水平的表达具有显著差异(p<0.01)。基因注释分析表明,460条差异基因中有139条为已知基因,其中77条表达上调,62条表达下调;13条为依硫磷酸处理后新表达的基因,5条为依硫磷酸处理后表达完全受抑的基因。聚类分析显示,139条基因分属11大类,主要生物学功能与造血及免疫调控、凋亡和细胞周期相关。结论 :生物信息学方法可用于依硫磷酸基因表达谱分析。依硫磷酸对人类基因表达谱具有调控作用,可能对造血及免疫、凋亡和细胞周期等生物学过程具有重要影响,需进一步在实验水平加以验证。 展开更多
关键词 依硫磷酸 人类基因表达谱 生物信息学
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胸腺素а原的生物学活性及基因表达谱芯片分析 被引量：3
14
作者 邱磊 郭葆玉 +4 位作者 苗红 道书艳 张冉 袁鹏群 杨旭 《第二军医大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2002年第6期639-642,共4页
目的 :对一个新的胸腺素α原 (human prothymosinα,Pro Tα)进行生物学活性研究及基因表达谱分析。 方法 :用体外刺激小鼠脾细胞增殖进行实验及 EL ISA法检测 Pro Tα对 IL - 2和 TNF-α的诱导分泌作用 ,并用基因芯片技术对其表达谱进... 目的 :对一个新的胸腺素α原 (human prothymosinα,Pro Tα)进行生物学活性研究及基因表达谱分析。 方法 :用体外刺激小鼠脾细胞增殖进行实验及 EL ISA法检测 Pro Tα对 IL - 2和 TNF-α的诱导分泌作用 ,并用基因芯片技术对其表达谱进行分析。结果 :Pro Tα对小鼠脾细胞有明显的促进增殖作用 ,对 IL - 2和 TNF-α有明显的诱导分泌作用 (P<0 .0 1)。基因芯片研究发现 Pro Tα对蛋白酪氨酸磷酸酶基因、淋巴细胞抗原 6复合体、增殖相关基因 A等的表达有上调作用。 结论 :该新型Pro Tα在体外实验中有免疫调节活性 ,并诱导一些基因的表达。 展开更多
关键词 胸腺素Α原 生物学活性 基因表达谱 芯片分析
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人胎盘基因表达谱芯片的初步研究 被引量：4
15
作者 朱利娜 马文丽 +3 位作者 毛向明 李 凌 冯春琼 郑文岭 《第一军医大学学报》 CSCD 北大核心 2002年第5期400-402,共3页
目的 制备人胎盘基因表达谱芯片,前用于基因差异表达分析。方法用基因芯片点样仪将胎盘基因文库探针打印在氨基包被的玻片上制备表达谱芯片。分别提取对照组三氧化二砷处理的K562细胞总RNA,纯化mRNA后反转录成cDNA。再以限制性显示技术... 目的 制备人胎盘基因表达谱芯片,前用于基因差异表达分析。方法用基因芯片点样仪将胎盘基因文库探针打印在氨基包被的玻片上制备表达谱芯片。分别提取对照组三氧化二砷处理的K562细胞总RNA,纯化mRNA后反转录成cDNA。再以限制性显示技术进行荧光标记,将两组荧光标记的样品混合后与芯片进行杂交。杂交后清洗芯片,干燥后对芯片进行扫描,分析杂交结果。结果 建立了较可靠的制备与检测基基表达芯片的方法,并筛选出45个差异表达基因片段。结论 制备的人胎盘基因表达谱芯片可有效地应用于基因的差异表达分析。 展开更多
关键词 基因芯片 基因表达谱 胎盘 基因差异表达 DNA
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注射用丹参多酚酸治疗糖尿病大鼠脑卒中的基因芯片表达谱分析 被引量：6
16
作者 王富江 何前松 +2 位作者 王金鑫 胡利民 王乔悦 《中国药理学通报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第8期1103-1109,共7页
目的研究注射用丹参多酚酸对糖尿病大鼠脑卒中脑组织基因表达谱的影响。方法将Wistar大鼠随机分为假手术组(DM+Sham)、糖尿病脑缺血/再灌注损伤模型组(DM+MCAO/R)、依达拉奉组(6 mg·kg^(-1),ED)、丹参多酚酸治疗组(5.25、10.5、21 ... 目的研究注射用丹参多酚酸对糖尿病大鼠脑卒中脑组织基因表达谱的影响。方法将Wistar大鼠随机分为假手术组(DM+Sham)、糖尿病脑缺血/再灌注损伤模型组(DM+MCAO/R)、依达拉奉组(6 mg·kg^(-1),ED)、丹参多酚酸治疗组(5.25、10.5、21 mg·kg^(-1),SLI),每组13只。缺血/再灌注3 h后尾静脉注射给药,每日1次,连续给药14d。末次给药30 min后,分别用TTC染色和基因芯片技术检测梗死体积和脑组织中相关基因表达。结果给药14 d后,与假手术组相比,模型组筛选出67个差异基因,其中41个上调,26个下调;丹参多酚酸(21 mg·kg^(-1))治疗组与模型组比较差异基因有59个,其中45个上调,14个下调,由聚类分析可得糖尿病局灶性脑缺血/再灌注损伤恢复期有多种基因如Ly6i、Pax7、Irx2发现明显变化,通路分析发现,主要涉及凝血止血、炎症、氧化应激、物质代谢、神经血管新生及信号传导等。结论丹参多酚酸治疗糖尿病脑卒中主要通过干预凝血止血、炎症、氧化应激、物质代谢、神经血管新生及信号传导等达到治疗目的。 展开更多
关键词 注射用丹参多酚酸 糖尿病 脑卒中 基因芯片表达谱 聚类分析 大鼠
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表达谱基因芯片技术及其在动物基因组研究中的应用 被引量：4
17
作者 顾以韧 李学伟 +1 位作者 朱砺 梁艳 《安徽农业科学》 CAS 北大核心 2006年第10期2066-2067,2076,共3页
将对表达谱基因芯片的原理、分类、技术流程、优点和在动物基因组研究中的应用以及存在问题作一综述,并对其应用前景进行展望。
关键词 基因芯片 表达谱 基因组 应用
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用原代细胞培养和人全基因表达谱芯片筛选鼻咽癌差异表达基因 被引量：4
18
作者 李瑞平 邵建永 +4 位作者 邓玲 曾木圣 宋立兵 李满枝 吴秋良 《南方医科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第8期1156-1160,共5页
目的利用细胞的原代培养技术及人全基因表达谱芯片技术初步筛选出鼻咽癌差异表达基因,以发现与鼻咽癌发生、发展相关的新的候选基因。方法分别用1例鼻咽癌细胞株C666及5例鼻咽癌培养出的原代细胞和3例鼻咽正常上皮的原代细胞,进行基因... 目的利用细胞的原代培养技术及人全基因表达谱芯片技术初步筛选出鼻咽癌差异表达基因,以发现与鼻咽癌发生、发展相关的新的候选基因。方法分别用1例鼻咽癌细胞株C666及5例鼻咽癌培养出的原代细胞和3例鼻咽正常上皮的原代细胞,进行基因表达谱分析,并以荧光定量PCR及免疫组织化学验证芯片结果。结果原代培养的鼻咽癌细胞和鼻咽正常上皮细胞通过细胞角蛋白的免疫细胞化学染色、EBER1原位杂交和EBV-DNA荧光定量PCR证实;鼻咽癌原代细胞和鼻咽正常上皮原代细胞的基因表达谱有显著差异;4例以上共同表达的差异基因有493个,包括上调基因264个,下调基因229个。荧光定量PCR及免疫组织化学结果和芯片结果一致。结论用原代培养细胞及人类全基因组基因芯片构建基因表达谱能够准确、高效地筛选出鼻咽癌相关的差异表达基因,该基因表达谱的建立为研究鼻咽癌分子生物学机制、鼻咽癌的分子分型和分子诊断提供了重要的分子依据。 展开更多
关键词 鼻咽肿瘤 寡核苷酸芯片 基因表达谱 原代细胞培养 荧光定量PCR
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应用RD-PCR方法制备K562细胞表达谱芯片基因探针 被引量：8
19
作者 毛向明 马文丽 +1 位作者 姜立 郑文岭 《第一军医大学学报》 CSCD 北大核心 2002年第6期548-550,553,共4页
目的收集K562细胞表达谱芯片的基因片段。方法培养K562细胞,抽提其mRNA,反转录为cDNA,应用限制性显示PCR技术(RD-PCR)分离K562细胞不同组别的产物片段,分别行PCR扩增。结果制备了可用于基因芯片制作的基因探针片段。结论RD-PCR方法适合... 目的收集K562细胞表达谱芯片的基因片段。方法培养K562细胞,抽提其mRNA,反转录为cDNA,应用限制性显示PCR技术(RD-PCR)分离K562细胞不同组别的产物片段,分别行PCR扩增。结果制备了可用于基因芯片制作的基因探针片段。结论RD-PCR方法适合于基因芯片探针的收集。 展开更多
关键词 RD-PCR方法 K562细胞 表达谱 基因芯片 分子探针 幼红细胞白血病
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基因芯片表达谱在椎间盘退变领域应用的研究进展 被引量：4
20
作者 于彬 李新华 +5 位作者 陈兆雄 巴兆玉 刘忠汉 袁静 祝建光 吴德升 《中国脊柱脊髓杂志》 CAS CSCD 北大核心 2017年第7期652-656,共5页
椎间盘退变是指椎间盘自然老化、退化的生理病理过程，它是一系列脊柱退行性疾病的病理基础，可引起椎管狭窄、脊柱节段不稳、骨赘形成，导致腰腿痛、椎间盘突出及神经根或脊髓压迫。对椎间盘退变引起的脊柱疾患可采用保守或手术治疗。... 椎间盘退变是指椎间盘自然老化、退化的生理病理过程，它是一系列脊柱退行性疾病的病理基础，可引起椎管狭窄、脊柱节段不稳、骨赘形成，导致腰腿痛、椎间盘突出及神经根或脊髓压迫。对椎间盘退变引起的脊柱疾患可采用保守或手术治疗。脊柱融合术是目前治疗椎间盘退变引起的椎间盘突出、椎管狭窄等相关疾病的“金标准”，但会改变脊柱生物力学结构，加速邻近节段退变，甚至有再次手术的风险。因此，明确椎间盘退变发病机制，对相关疾病的诊断和治疗具有重要意义。20世纪60年代起，国内外学者开始研究椎间盘退变的病因，但至今确切机制仍不清楚。有研究表明，椎间盘退变过程中出现许多细胞事件的异常，如椎间盘髓核细胞凋亡数量增加、各种炎性因子和基质金属蛋白酶类表达量增多等。这一系列变化提示椎间盘内特定分子基因表达失调，进而导致各层次调节因素发生变化。 展开更多
关键词 椎间盘退变 基因芯片 脊柱退行性疾病 表达谱 基质金属蛋白酶类 椎间盘突出 应用 手术治疗
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