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蛋白质结构与相互作用研究新方法--交联质谱技术
被引量：
10
1
作者
樊盛博
吴妍洁
+8 位作者
杨兵
迟浩
孟佳明
卢珊
张昆
邬龙
孙瑞祥
董梦秋
贺思敏
《生物化学与生物物理进展》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2014年第11期1109-1125,共17页
蛋白质的空间结构信息以及蛋白质间的相互作用信息对于研究蛋白质的功能有重要意义.研究蛋白质结构与相互作用的传统技术,如核磁共振技术、X射线晶体衍射技术等,对于蛋白质的纯度、结晶性和绝对量均有比较高的要求,限制了其广泛应用.交...
蛋白质的空间结构信息以及蛋白质间的相互作用信息对于研究蛋白质的功能有重要意义.研究蛋白质结构与相互作用的传统技术,如核磁共振技术、X射线晶体衍射技术等,对于蛋白质的纯度、结晶性和绝对量均有比较高的要求,限制了其广泛应用.交联质谱技术是近十多年来发展起来的新技术,它将质谱技术与交联技术相结合,在研究蛋白质结构与相互作用方面具有速度快、成本小、蛋白质各方面性状要求低等优势.本文就交联质谱技术各个环节的技术方法加以综述,包括交联质谱实验分离富集技术、常见交联剂特性、交联质谱数据库搜索算法、结果验证研究和交联质谱技术的应用等方面,并展望了该研究方向未来的发展.
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关键词
交联质谱技术
蛋白质结构
蛋白质相互作用
蛋白质组学
质谱
技术
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职称材料
交联质谱技术研究进展
被引量：
2
2
作者
张洁
刘春丽
+3 位作者
李欣
张媛
韩碧莹
赵跃芳
《化学与生物工程》
CAS
2020年第11期1-11,共11页
交联质谱技术(XL-MS)是蛋白质化学交联与质谱技术相结合的新技术,在蛋白质复合物结构解析以及生物体系中蛋白质相互作用研究中发挥着重要作用。综述了交联质谱技术的工作流程、在蛋白质结构及蛋白质相互作用研究取得的重要成果以及面临...
交联质谱技术(XL-MS)是蛋白质化学交联与质谱技术相结合的新技术,在蛋白质复合物结构解析以及生物体系中蛋白质相互作用研究中发挥着重要作用。综述了交联质谱技术的工作流程、在蛋白质结构及蛋白质相互作用研究取得的重要成果以及面临的主要挑战,介绍了目前常用的化学交联剂、交联质谱数据解析存在的问题以及主要搜索引擎。尽管交联质谱技术还在发展中,但其将成为解决生物学问题的重要手段。
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关键词
交联质谱技术
蛋白质结构
蛋白质相互作用
化学
交联
剂
交联
肽段
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职称材料
化学交联质谱技术的研究进展
3
作者
陈镇霖
曹勇
贺思敏
《生物化学与生物物理进展》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2022年第4期737-758,共22页
化学交联质谱技术是解析蛋白质结构和研究蛋白质相互作用的重要工具。近5年以来,该技术在方法和应用上都取得了很大的进步。方法上,一方面可断裂交联剂与新型分离富集方法展现了较好的应用前景,另一方面更加高效的交联肽段搜索引擎和质...
化学交联质谱技术是解析蛋白质结构和研究蛋白质相互作用的重要工具。近5年以来,该技术在方法和应用上都取得了很大的进步。方法上,一方面可断裂交联剂与新型分离富集方法展现了较好的应用前景,另一方面更加高效的交联肽段搜索引擎和质量控制方法为交联质谱数据分析提供了有力的工具。应用上,一方面与冷冻电镜技术结合解析了大量蛋白质的结构,另一方面从研究蛋白质复合物的相互作用发展到研究全蛋白质组水平的相互作用网络。化学交联质谱技术在方法和应用上的蓬勃发展,体现了这一技术的重要作用。本文对化学交联质谱技术的各个环节进行了详细的综述,包括交联剂选择、交联反应、酶切、交联肽段富集、液质联用、交联肽段鉴定、质量控制和生物学应用,重点介绍了最近5年的研究进展。最后,讨论了化学交联质谱技术面临的挑战及未来的发展方向。
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关键词
交联质谱技术
蛋白质结构
蛋白质相互作用
蛋白质组学
质谱
技术
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职称材料
题名
蛋白质结构与相互作用研究新方法--交联质谱技术
被引量：
10
1
作者
樊盛博
吴妍洁
杨兵
迟浩
孟佳明
卢珊
张昆
邬龙
孙瑞祥
董梦秋
贺思敏
机构
中国科学院计算技术研究所
中国科学院大学
北京生命科学研究所
出处
《生物化学与生物物理进展》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2014年第11期1109-1125,共17页
基金
国家自然科学基金面上项目(21475141)
国家重点基础研究发展计划(973)资助项目(2010CB912701,2012CB910602,2013CB911203)~~
文摘
蛋白质的空间结构信息以及蛋白质间的相互作用信息对于研究蛋白质的功能有重要意义.研究蛋白质结构与相互作用的传统技术,如核磁共振技术、X射线晶体衍射技术等,对于蛋白质的纯度、结晶性和绝对量均有比较高的要求,限制了其广泛应用.交联质谱技术是近十多年来发展起来的新技术,它将质谱技术与交联技术相结合,在研究蛋白质结构与相互作用方面具有速度快、成本小、蛋白质各方面性状要求低等优势.本文就交联质谱技术各个环节的技术方法加以综述,包括交联质谱实验分离富集技术、常见交联剂特性、交联质谱数据库搜索算法、结果验证研究和交联质谱技术的应用等方面,并展望了该研究方向未来的发展.
关键词
交联质谱技术
蛋白质结构
蛋白质相互作用
蛋白质组学
质谱
技术
Keywords
cross-linking mass spectrometry
protein structure
protein interaction
proteomics
mass spectrometry
分类号
Q51 [生物学—生物化学]
TP39 [自动化与计算机技术—计算机应用技术]
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职称材料
题名
交联质谱技术研究进展
被引量：
2
2
作者
张洁
刘春丽
李欣
张媛
韩碧莹
赵跃芳
机构
内蒙古大学省部共建草原家畜生殖调控与繁育国家重点实验室
出处
《化学与生物工程》
CAS
2020年第11期1-11,共11页
基金
国家自然科学基金项目(31560333)
内蒙古自治区自然科学基金项目(2017MS0318)
内蒙古自治区科技厅重大专项省部共建草原家畜生殖调控与繁育国家重点实验室自主课题(zdzx2018065,2020ZD008)。
文摘
交联质谱技术(XL-MS)是蛋白质化学交联与质谱技术相结合的新技术,在蛋白质复合物结构解析以及生物体系中蛋白质相互作用研究中发挥着重要作用。综述了交联质谱技术的工作流程、在蛋白质结构及蛋白质相互作用研究取得的重要成果以及面临的主要挑战,介绍了目前常用的化学交联剂、交联质谱数据解析存在的问题以及主要搜索引擎。尽管交联质谱技术还在发展中,但其将成为解决生物学问题的重要手段。
关键词
交联质谱技术
蛋白质结构
蛋白质相互作用
化学
交联
剂
交联
肽段
Keywords
cross-linking mass spectrometry
structure of protein
protein interaction
chemical cross-linking agent
cross-linked peptides
分类号
O657.6 [理学—分析化学]
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职称材料
题名
化学交联质谱技术的研究进展
3
作者
陈镇霖
曹勇
贺思敏
机构
中国科学院计算技术研究所
中国科学院大学
北京生命科学研究所
出处
《生物化学与生物物理进展》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2022年第4期737-758,共22页
基金
国家自然科学基金(32071435)
国家重点基础研究发展计划(2016YFA0501300)资助项目。
文摘
化学交联质谱技术是解析蛋白质结构和研究蛋白质相互作用的重要工具。近5年以来,该技术在方法和应用上都取得了很大的进步。方法上,一方面可断裂交联剂与新型分离富集方法展现了较好的应用前景,另一方面更加高效的交联肽段搜索引擎和质量控制方法为交联质谱数据分析提供了有力的工具。应用上,一方面与冷冻电镜技术结合解析了大量蛋白质的结构,另一方面从研究蛋白质复合物的相互作用发展到研究全蛋白质组水平的相互作用网络。化学交联质谱技术在方法和应用上的蓬勃发展,体现了这一技术的重要作用。本文对化学交联质谱技术的各个环节进行了详细的综述,包括交联剂选择、交联反应、酶切、交联肽段富集、液质联用、交联肽段鉴定、质量控制和生物学应用,重点介绍了最近5年的研究进展。最后,讨论了化学交联质谱技术面临的挑战及未来的发展方向。
关键词
交联质谱技术
蛋白质结构
蛋白质相互作用
蛋白质组学
质谱
技术
Keywords
cross-linking mass spectrometry
protein structure
protein interaction
proteomics
mass spectrometry
分类号
Q51 [生物学—生物化学]
TP39 [自动化与计算机技术—计算机应用技术]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
蛋白质结构与相互作用研究新方法--交联质谱技术
樊盛博
吴妍洁
杨兵
迟浩
孟佳明
卢珊
张昆
邬龙
孙瑞祥
董梦秋
贺思敏
《生物化学与生物物理进展》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2014
10
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
交联质谱技术研究进展
张洁
刘春丽
李欣
张媛
韩碧莹
赵跃芳
《化学与生物工程》
CAS
2020
2
在线阅读
下载PDF
职称材料
3
化学交联质谱技术的研究进展
陈镇霖
曹勇
贺思敏
《生物化学与生物物理进展》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2022
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