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小麦叶绿素缺失突变体Mt6172及其野生型叶片蛋白质组学双向差异凝胶电泳分析 被引量：4
1
作者 宋素洁 古佳玉 +5 位作者 郭会君 赵林姝 赵世荣 李军辉 赵宝存 刘录祥 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第9期1592-1606,共15页
以空间环境诱变获得的小麦叶绿素缺失突变体Mt6172的白化苗及其野生型邯6172的叶片为材料,进行双向差异凝胶电泳(2D-DIGE)蛋白质组学分析。在1645个蛋白点中,发现100个差异1.5倍以上的蛋白点,对在分析胶中得到的85个点进行质谱鉴定,最... 以空间环境诱变获得的小麦叶绿素缺失突变体Mt6172的白化苗及其野生型邯6172的叶片为材料,进行双向差异凝胶电泳(2D-DIGE)蛋白质组学分析。在1645个蛋白点中,发现100个差异1.5倍以上的蛋白点,对在分析胶中得到的85个点进行质谱鉴定,最终鉴定出29种差异蛋白的62个差异点,其中50个表达下调,12个表达上调,可分为10个功能群。表达下调的蛋白主要定位于叶绿体中,包括光系统I、光系统II、NAD(P)H脱氢酶复合体和ATP合酶的部分亚基,以及参与卡尔文-本森循环、糖代谢和应激反应的蛋白。非叶绿体蛋白中的大部分表达上调,主要参与抗氧化反应、转录激活和蛋白质折叠等途径。初步推断,光合作用主要蛋白复合体的缺失、叶绿体抗氧化能力的下降和叶绿体RNA转录后编辑途径受阻等可能是Mt6172白化致死的重要原因。 展开更多
关键词 小麦(Triticum AESTIVUM L.) 叶绿素缺失突变体 空间诱变 双向差异凝胶电泳技术(2d-dige) 蛋白质组学
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一种基于双向2DPCA及遗传算法的人脸识别方法 被引量：1
2
作者 董晓庆 陈洪财 +1 位作者 谢森林 曾辉 《华中师范大学学报（自然科学版）》 CAS 北大核心 2014年第5期656-661,共6页
提出了一种双向二维PCA((2D)2PCA)及改进遗传算法(GA)相结合的人脸识别方法.该方法首先利用(2D)2PCA分别从图像的行、列方向进行特征提取,然后通过遗传算法对提取的特征空间以并行的方式进行优化,得到最优行、列特征空间,最后根据最优... 提出了一种双向二维PCA((2D)2PCA)及改进遗传算法(GA)相结合的人脸识别方法.该方法首先利用(2D)2PCA分别从图像的行、列方向进行特征提取,然后通过遗传算法对提取的特征空间以并行的方式进行优化,得到最优行、列特征空间,最后根据最优特征空间进行分类.在ORL人脸库上的实验结果表明,该方法较之传统的方法具有更高的识别率及识别速度,在各种鉴别特征维数下更具鲁棒性,是有效的人脸识别方法. 展开更多
关键词 人脸识别 双向二维PCA((2D)2PCA) 遗传算法(GA) 特征空间
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表皮生长因子受体调控的人鼻咽癌细胞系CNE2分泌蛋白质的筛选 被引量：5
3
作者 梁可 陈主初 +7 位作者 易红 李建玲 张鹏飞 李茂玉 李萃 冯雪萍 彭芳 肖志强 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2007年第1期100-106,共7页
为筛选表皮生长因子受体(epidermalgrowthfactorreceptor,EGFR)调控的鼻咽癌(nasopharyngealcarcinoma,NPC)细胞的分泌蛋白质,揭示EGFR在NPC发病中的作用机制,采用无血清培养法培养NPC细胞系CNE2,并用转化生长因子(transforminggrowthfa... 为筛选表皮生长因子受体(epidermalgrowthfactorreceptor,EGFR)调控的鼻咽癌(nasopharyngealcarcinoma,NPC)细胞的分泌蛋白质,揭示EGFR在NPC发病中的作用机制,采用无血清培养法培养NPC细胞系CNE2,并用转化生长因子(transforminggrowthfactor-α,TGF-α)刺激CNE2细胞24h作为实验组,对照组CNE2细胞不用TGF-α刺激.超滤法脱盐并浓缩两组细胞的培养上清制备分泌蛋白,采用双向凝胶电泳技术(two-dimensionalelectrophoresis,2-DE)分离两组细胞的分泌蛋白,PDquest图像分析软件识别差异表达的蛋白质点,基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(matrix-assistedlaserdesorption/ionizationtimeofflightmassspectrometry,MALDI-TOF-MS)鉴定差异表达蛋白.建立了实验组和对照组CNE2细胞分泌蛋白的2-DE图谱,图像分析识别了22个差异蛋白质点,质谱鉴定了8个非冗余蛋白质,其功能涉及肿瘤细胞侵袭转移、细胞凋亡和增殖,为进一步揭示EGFR在NPC发病中的作用及其机制奠定了基础. 展开更多
关键词 鼻咽癌 CNE2细胞 表皮生长因子受体(EGFR) 分泌蛋白质组 二维凝胶电泳 质谱
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蛋白质组学在肉品学中的应用 被引量：6
4
作者 冯宪超 徐幸莲 周光宏 《食品科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2009年第5期277-281,共5页
蛋白质组由基因组表达,会受到环境条件和处理条件的影响,可以看作是基因组和肉的功能品质特点之间的分子链接。蛋白质组学可以解释不同遗传背景或者肉的处理方法对肉质影响的分子机制。本文将介绍蛋白质组学的一些技术和它在肉质特点研... 蛋白质组由基因组表达,会受到环境条件和处理条件的影响,可以看作是基因组和肉的功能品质特点之间的分子链接。蛋白质组学可以解释不同遗传背景或者肉的处理方法对肉质影响的分子机制。本文将介绍蛋白质组学的一些技术和它在肉质特点研究中的应用。 展开更多
关键词 蛋白质组学 二维凝胶电泳(2-DE) 质谱
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罗非鱼源Ia和Ib血清型无乳链球菌可溶性蛋白差异分析 被引量：1
5
作者 石云良 李莉萍 +6 位作者 王瑞 梁万文 甘西 黄婷 李健 黄维义 陈明 《大连海洋大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第2期125-131,共7页
前期研究表明,罗非鱼Oreochromis niloticus Ia和Ib血清型无乳链球菌Streptococcus agalactiae疫苗之间缺乏交叉保护力,为了从蛋白分子水平探讨其免疫原性差异的原因,在提取罗非鱼Ia和Ib血清型无乳链球菌可溶性蛋白后应用二维差异凝胶电... 前期研究表明,罗非鱼Oreochromis niloticus Ia和Ib血清型无乳链球菌Streptococcus agalactiae疫苗之间缺乏交叉保护力,为了从蛋白分子水平探讨其免疫原性差异的原因,在提取罗非鱼Ia和Ib血清型无乳链球菌可溶性蛋白后应用二维差异凝胶电泳(two dimension-Difference Gel Electrophoresis,2D-DIGE)分析其表达差异蛋白点,应用基质辅助激光解析电离飞行时间质谱(MALDI-TOF-MS)鉴定这些差异蛋白,并使用DAVID生物学数据库预测经鉴定后获得的蛋白功能。结果表明:在2D-DIGE电泳上,Ia和Ib两种不同血清型无乳链球菌具有167个表达差异蛋白点,对这些蛋白点进行质谱分析获得32种蛋白,这些蛋白主要与氧化还原反应、代谢与能量前体物产生、糖代谢反应等生物学过程有关,主要参与糖解和糖异生作用、丙酮酸代谢与脂肪酸生物合成等通路;对蛋白功能的预测表明,GAPGH、半胱氨酸合成酶和锰依赖性锰超氧化物歧化酶的功能与免疫和疫苗研发相关。本研究首次证实,罗非鱼Ia和Ib血清型无乳链球菌存在较多的表达差异蛋白,部分表达差异蛋白的功能与免疫和疫苗研发相关,这可能与链球菌免疫原性有直接关系,但需要进一步地研究和证实。 展开更多
关键词 罗非鱼 无乳链球菌 Ia和Ib血清型 可溶性蛋白 二维差异凝胶电泳(2d-dige) 差异分析
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中波紫外线与化学致癌物诱导下HaCaT细胞的蛋白表达应答 被引量：1
6
作者 孙明忠 刘淑清 +4 位作者 吕晓 郭一萌 郭春梅 辛毅 唐建武 《高等学校化学学报》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 2009年第10期1965-1971,共7页
对角质形成细胞HaCaT分别进行中波紫外线(UVB)照射、2,4-二硝基苯磺酸(DNBS)刺激及UVB+DNBS(UD)共同刺激,利用二维荧光差异胶内凝胶电泳(2D DIGE)、DeCyder定量分析软件和HPLC-nESI-MS/MS分析技术,对HaCaT细胞产生的差异表达蛋白进行了... 对角质形成细胞HaCaT分别进行中波紫外线(UVB)照射、2,4-二硝基苯磺酸(DNBS)刺激及UVB+DNBS(UD)共同刺激,利用二维荧光差异胶内凝胶电泳(2D DIGE)、DeCyder定量分析软件和HPLC-nESI-MS/MS分析技术,对HaCaT细胞产生的差异表达蛋白进行了鉴定.有65个蛋白质点发生了明显表达差异(P<0.05),与UVB或DNBS单独处理细胞相比,有41个蛋白点表现为UVB和DNBS的正协同效应,13个蛋白点表现为负协同效应,5个蛋白点与UVB单独处理相近,6个蛋白点与DNBS单独处理相近.HPLC-nESI-MS/MS从65个差异表达蛋白质点中共鉴定出60种单一(Unique)蛋白.采用生物信息学方法对这些鉴定蛋白所涉及的分子功能、参与的生物学过程及信号通路进行了系统分析.实验得到了与紫外辐射和化学诱导损伤的直接相关蛋白,有助于研究不同环境条件下皮肤癌的形成及皮肤疾病的有效防护与治疗. 展开更多
关键词 HaCaT细胞系 中波紫外线 2 4-二硝基苯磺酸 二维荧光差异胶内凝胶电泳
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吸烟对肺组织D4-GDI表达的影响及其与慢性阻塞性肺疾病相关性的蛋白质组学研究 被引量：2
7
作者 欧阳卿 胡瑞成 +3 位作者 戴爱国 谭双香 肖志强 汤参娥 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2010年第11期1204-1211,共8页
慢性阻塞性肺疾病(COPD)是环境因素与遗传因素共同作用的结果,而吸烟是导致COPD发生的最主要危险因素,然而,吸烟导致COPD的机制及COPD的遗传易感机制目前尚未完全阐明.蛋白质组学研究方法具有高效和信息含量丰富的特点,为COPD研究提供... 慢性阻塞性肺疾病(COPD)是环境因素与遗传因素共同作用的结果,而吸烟是导致COPD发生的最主要危险因素,然而,吸烟导致COPD的机制及COPD的遗传易感机制目前尚未完全阐明.蛋白质组学研究方法具有高效和信息含量丰富的特点,为COPD研究提供了有力的帮助,被认为在COPD的研究领域具有广阔的前景.运用二维凝胶电泳和基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱蛋白质组学研究方法结合生物信息学技术,对不吸烟者、非COPD吸烟者和吸烟COPD患者的肺组织进行蛋白质组比较,共鉴定出24种表达差异蛋白.研究发现,非COPD吸烟者肺组织ρ-GDP解离抑制因子2(D4-GDI)表达水平为不吸烟者的1.7倍,吸烟COPD患者肺组织D4-GDI表达水平接近非COPD吸烟者的2倍.通过免疫组织化学染色和Western-blotting检测对肺组织D4-GDI表达水平进行验证,获得了与蛋白质组学研究相一致的结果.结果首次说明:吸烟能够导致肺组织D4-GDI表达水平升高,D4-GDI参与了COPD的发病机制而且可能与COPD易感性相关. 展开更多
关键词 慢性阻塞性肺疾病 蛋白质组学 二维凝胶电泳 质谱分析 ρ-GDP解离抑制因子2(D4-GDI)
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大鼠肝移植(LTx)急性排斥反应(AR)血清蛋白质组学分析 被引量：1
8
作者 胡进武 徐敏 +5 位作者 谭长军 代智 王征 周俭 樊嘉 黄晓武 《复旦学报（医学版）》 CAS CSCD 北大核心 2014年第4期427-434,共8页
目的探究肝移植(liver transplantation,LTx)急性排斥反应(acute rejection,AR)血清蛋白质组学的变化,寻找与排斥反应相关的血清标志物。方法建立Lewis→BN大鼠肝移植模型,以BN→BN大鼠肝移植为对照组,根据肝移植物AR的反应程度进行分组... 目的探究肝移植(liver transplantation,LTx)急性排斥反应(acute rejection,AR)血清蛋白质组学的变化,寻找与排斥反应相关的血清标志物。方法建立Lewis→BN大鼠肝移植模型,以BN→BN大鼠肝移植为对照组,根据肝移植物AR的反应程度进行分组,取各组大鼠血清样本进行二维双向凝胶电泳(two-dimensional difference gel electrophoresis,2D-DIGE)及质谱(mass spectrometry,MS)分析,鉴定表达有差异的蛋白质。结果肝移植模型大鼠分为无排斥、轻度、中度和重度排斥4组,2D-DIGE共发现30个蛋白斑点,用MS分析排除重复蛋白斑点之后鉴定出14个蛋白质,根据功能可分为4类。第1类为与金属离子代谢相关的免疫调节蛋白,包括血红素结合蛋白、触珠蛋白前体、srprb Ba1-667和preproapo A-I;第2类为先天性免疫相关的蛋白成分,包括补体C3、补体C4a、MBP-A、LOC500183蛋白和LOC299458蛋白;第3类为免疫调节多肽,包括T-kininogen 2、α-1巨球蛋白和大鼠α-1巨球蛋白受体结合域A链晶体结构;第4类为未分类蛋白,包括ORF2和rCG36664。结论肝移植AR过程中血清多种蛋白质的含量发生改变,可能为重要的血清标志物。 展开更多
关键词 肝移植(LTx) 急性排斥反应(AR) 二维双向凝胶电泳(2d-dige) 质谱(MS)
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