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花生疮痂病菌次生代谢基因簇特异性转录因子挖掘及EaPSTF1生物信息学分析
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作者 张凌萱 朴静子 +3 位作者 刘丹 郝婧文 李自博 周如军 《中国油料作物学报》 北大核心 2025年第2期356-362,共7页
痂囊腔菌素(Elsinchrome,ESC)是花生疮痂病菌产生的一种具有光敏活性的苝醌类真菌毒素,为病菌的毒力因子。为了进一步揭示ESC生物合成的调控网络,在全基因组测序分析基础上,开展了病菌次生代谢基因簇特异性转录因子的挖掘、EaPSTF1基因... 痂囊腔菌素(Elsinchrome,ESC)是花生疮痂病菌产生的一种具有光敏活性的苝醌类真菌毒素,为病菌的毒力因子。为了进一步揭示ESC生物合成的调控网络,在全基因组测序分析基础上,开展了病菌次生代谢基因簇特异性转录因子的挖掘、EaPSTF1基因克隆、生物信息学和表达分析。结果表明,病菌次生代谢基因簇上共有3个特异性转录因子,其中EaPSTF1全长1305 bp,含有一个完整的开放阅读框,编码长度为434个氨基酸的蛋白质,分子量110.58 kD,理论等电点4.94,亚细胞定位细胞核中,是一个以α-螺旋为主的亲水性蛋白,含有GAL4和AFLR两个Zn(II)2Cys6型结构域。RT-qPCR定量分析表明,EaPSTF1表达模式与毒素累积趋势基本一致,EaPSTF1可能参与ESC毒素的生物合成调控。 展开更多
关键词 花生疮痂病菌 异性转录因子 基因克隆 生物信息学分析 次生代谢基因
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巢湖鸭生长素基因和垂体特异性转录因子1基因的PCR-SSCP检测 被引量:3
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作者 李俊营 詹凯 +3 位作者 许月英 王德圣 赵瑞宏 唐中节 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2009年第5期107-111,共5页
以生长素基因Ghrelin和垂体特异性转录因子1Pit-1基因为候选基因,采用PCR-SSCP和DNA测序技术检测2个候选基因在巢湖鸭群体中的单核苷酸多态性(SNPs)。结果表明,Ghrelin基因exon 3第54 bp位置有G→A碱基的点突变,在巢湖鸭群体中检测到AA... 以生长素基因Ghrelin和垂体特异性转录因子1Pit-1基因为候选基因,采用PCR-SSCP和DNA测序技术检测2个候选基因在巢湖鸭群体中的单核苷酸多态性(SNPs)。结果表明,Ghrelin基因exon 3第54 bp位置有G→A碱基的点突变,在巢湖鸭群体中检测到AA、AB、BB 3种基因型,A等位基因频率为0.49,B等位基因频率为0.51;在exon 5第149位和166位发生了C→A和G→T的突变,检测到MM、MN、NN 3种基因型,M等位基因频率为0.19,N等位基因频率为0.81。Pit-1基因的2对引物的扩增片段均未检测到多态性,说明所检测的Pit-1基因外显子3和4序列比较保守。 展开更多
关键词 巢湖鸭 生长素基因 垂体异性转录因子1 SNPS
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基于单细胞转录组测序技术筛选牛体内囊胚性别特异性基因 被引量:1
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作者 崔宝山 黄飞 +2 位作者 王杰 李楠 高庆华 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2022年第12期1473-1481,共9页
【目的】探究牛体内雌性和雄性囊胚在mRNA水平上的特异性差异,挖掘雌性和雄性囊胚发育差异相关候选基因。【方法】参考GenBank中牛牙釉质基因(AMEL)序列(AMELX基因,登录号:NM_001014984.1;AMELY基因,登录号:NM_174240.2)设计引物,以胚... 【目的】探究牛体内雌性和雄性囊胚在mRNA水平上的特异性差异,挖掘雌性和雄性囊胚发育差异相关候选基因。【方法】参考GenBank中牛牙釉质基因(AMEL)序列(AMELX基因,登录号:NM_001014984.1;AMELY基因,登录号:NM_174240.2)设计引物,以胚胎内细胞DNA为模板,采用巢式PCR扩增技术鉴定单个牛体内囊胚的性别。选用确定性别的单个雌性和雄性囊胚为试验材料,采用Smart-Seq2扩增技术构建单个胚胎测序文库,应用Illumina HiSeq Xten高通量测序平台对单个胚胎进行单细胞转录组测序(scRNA-Seq),并进行了基因差异表达、GO功能和KEGG通路分析。【结果】通过巢式PCR扩增胚胎内细胞中的AMEL基因,确定了胚胎性别;基因表达分析筛选出两组之间差异表达基因(DEGs)6 160个,其中雌性特异性基因675个,雄性特异性基因305个;GO功能注释发现雌性特异性基因显著注释在核苷酸结合、信号转导调控、多细胞生物发育、细胞骨架等条目,雄性特异性基因显著注释在氧化磷酸化、线粒体、线粒体内膜、核糖体等条目;KEGG通路富集分析发现7条与雌性和雄性囊胚发育差异相关的通路,分别为代谢途径、糖酵解、磷酸戊糖途径、细胞衰老、氧化磷酸化、调节干细胞多能性的信号通路和Wnt信号通路;并利用GO和KEGG结果筛选出5个在牛体内囊胚期胚胎发育过程中具有直接或间接作用的基因:FBP1、GADD45G、FHL2、FOSB和WNT2B。【结论】牛体内雌性和雄性囊胚之间存在广泛的转录差异,性别特异性基因FBP1、GADD45G、FHL2、FOSB和WNT2B可能是直接或间接影响胚胎发育的关键基因。 展开更多
关键词 牛体内囊胚 单细胞转录组测序(scRNA-Seq) 性别异性基因 富集分析
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NRSE与NRSF及其对神经元特异性基因表达的调控作用 被引量:5
4
作者 王小飞 于盼盼 陆佩华 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2005年第7期595-599,共5页
神经限制性沉默元件(NRSE)是一段长度为21 ̄23bp的保守DNA序列,存在于许多神经元特异表达基因的转录调控区中,神经限制性沉默因子(NRSF)能特异性结合到NRSEdsDNA上,并通过其N端和C端阻遏结构域分别连接共阻遏蛋白Sin3A/B和CoREST,Sin3A... 神经限制性沉默元件(NRSE)是一段长度为21 ̄23bp的保守DNA序列,存在于许多神经元特异表达基因的转录调控区中,神经限制性沉默因子(NRSF)能特异性结合到NRSEdsDNA上,并通过其N端和C端阻遏结构域分别连接共阻遏蛋白Sin3A/B和CoREST,Sin3A招募HDAC对组蛋白进行去乙酰基化修饰,CoREST则作为平台蛋白招募特异的“沉默组件”,以此维持基因沉默.最近的研究显示,NRSEdsRNA能在转录水平与NRSF蛋白直接作用,而不是作为siRNA或miRNA在转录后水平启动神经元特异性基因的表达. 展开更多
关键词 神经元 调控作用 基因表达 NRSF 异表达基因 DNA序列 转录调控区 异性结合 dsRNA 异性基因 转录后水平 miRNA siRNA 阻遏蛋白 基因沉默 直接作用 转录水平 限制性 结构域 酰基化 组蛋白 F蛋白 C端 N端
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基因组特异性引物扩增细菌转录产物标记后用于DNA芯片分析
5
作者 张亚菲 王秀荣 《预防兽医学进展》 2001年第3期9-11,共3页
DNA芯片能够在一个载体上同时分析至少两种实验条件下,上千个基因的表达.但是,DNA芯片分析时要求有足够的RNA来产生探针,尤其是在进行细菌RNA杂交时(50μg细菌总RNA约含2μg mRNA).我们研制出一种以计算机为基础推测最小引物数量的方法... DNA芯片能够在一个载体上同时分析至少两种实验条件下,上千个基因的表达.但是,DNA芯片分析时要求有足够的RNA来产生探针,尤其是在进行细菌RNA杂交时(50μg细菌总RNA约含2μg mRNA).我们研制出一种以计算机为基础推测最小引物数量的方法,这些引物与假定基因组的全部基因都能特异性配对.例如,通过这个推测方法获得37个寡核苷酸片段,能够扩增出结核分枝杆菌基因组的全部基因.我们检测了基因组特异性引物(Genome directed primers,GDPs)的有效性,并在DNA芯片上检测基因表达时与随机引物进行了比较性研究.我们用这两种引物制备荧光标记探针,并在芯片上与960个位点的细菌基因杂交.与随机引物比较,GDPs更敏感、特异,尤其是在从哺乳动物RNA样品中检测结核杆菌RNA的时候. 展开更多
关键词 DNA芯片分析 基因异性引物 细菌转录产物 细菌RNA 标记 病原菌 诊断
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山药块茎发育阶段基因共表达网络构建及阶段特异性分析 被引量:1
6
作者 殷剑美 张铅 +1 位作者 蒋璐 张培通 《江苏农业学报》 CSCD 北大核心 2022年第1期30-38,共9页
山药是一种药食同源作物,块茎是其主要产品器官,其发育机制对于山药产量和品质提升相关育种有着重要的指导作用。以不同生长阶段(块茎膨大第1 d、第11 d、第21 d、第31 d、第41 d、第51 d,T_(1)~T_(6))的山药块茎为材料进行转录组测序,... 山药是一种药食同源作物,块茎是其主要产品器官,其发育机制对于山药产量和品质提升相关育种有着重要的指导作用。以不同生长阶段(块茎膨大第1 d、第11 d、第21 d、第31 d、第41 d、第51 d,T_(1)~T_(6))的山药块茎为材料进行转录组测序,经从头(de novo)组装后获得42042个unigenes,利用七大数据库进行注释,鉴定后发现山药块茎形成过程中涉及大量基因,包括激素合成、信号转导等相关基因。阶段特异性分析结果表明,块茎形成初始阶段为块茎发育的关键时期;加权基因共表达网络分析结果表明,在山药块茎形成初期及后期,激素相关基因的表达特别活跃,脱落酸(ABA)、茉莉酸(JA)是山药块茎生长发育的重要激素。研究结果为进一步研究山药块茎膨大分子机制奠定了基础。 展开更多
关键词 山药 转录组测序 阶段异性基因 基因共表达网络
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利用转录因子结合位点识别人类肿瘤特异性启动子研究 被引量:1
7
作者 王琦 李伟鹏 +1 位作者 黄仲曦 杨琳 《第一军医大学学报》 CSCD 北大核心 2004年第11期1323-1325,共3页
目的研究应用计算机技术对人类肿瘤特异性启动子进行识别、预测。方法通过收集肿瘤特异性启动子序列、转录因子结合位点序列、非肿瘤启动子序列3种数据集合,利用转录因子结合位点在不同序列集合中的密度求出各位点的对应密度比,确定识... 目的研究应用计算机技术对人类肿瘤特异性启动子进行识别、预测。方法通过收集肿瘤特异性启动子序列、转录因子结合位点序列、非肿瘤启动子序列3种数据集合,利用转录因子结合位点在不同序列集合中的密度求出各位点的对应密度比,确定识别特征,进行肿瘤特异性启动子的识别。结论该方法具有较高的准确性,在保证对训练集合90%以上的识别率的情况下,对测试集合的识别率达到80%以上。 展开更多
关键词 转录因子结合位点 肿瘤 异性启动子 真核基因
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逆转录聚合酶链反应检测Ⅲ型登革病毒的敏感性和特异性研究
8
作者 李刚 王飞 +2 位作者 郭日波 柯伟民 廖育煌 《中山大学学报(医学科学版)》 CAS CSCD 1993年第3期235-237,共3页
本文应用逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)方法,检测Ⅲ型登革病毒基因。所设计引物在E基因组,引物2位于核苷酸序列的1139~1158位,引物1位于1453~1471位,反应产物为333bp,内含1个HindⅢ限制性内切酶位点,酶切后有128 bp和199 bp两个片段。... 本文应用逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)方法,检测Ⅲ型登革病毒基因。所设计引物在E基因组,引物2位于核苷酸序列的1139~1158位,引物1位于1453~1471位,反应产物为333bp,内含1个HindⅢ限制性内切酶位点,酶切后有128 bp和199 bp两个片段。产物在含溴化乙锭的2%琼脂糖中电泳。采用RT-PCR法可测出少至5个半数组织细胞培养感染量(TCID_so)的病毒RNA。 展开更多
关键词 转录聚合酶链反应 登革病毒 异性研究 E基因 组织细胞培养 引物 敏感性 限制性内切酶 酶切 RNA
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大果水晶梨褐色果皮突变体木质素合成相关基因的组织特异性表达分析 被引量:2
9
作者 刘炳旭 于凤鸣 +4 位作者 张立彬 武军凯 宋立琴 肖啸 杜晓东 《华北农学报》 CSCD 北大核心 2016年第5期28-34,共7页
为研究木质素合成相关基因(PAL1、PAL2、CAD、POD、4CL)在大果水晶梨褐色果皮突变体中的表达特性,并为研究梨褐色果皮形成机制奠定基础。按照RNA试剂盒法提取果皮、花、叶片、果肉、枝条韧皮部中总RNA;利用DNAMAN和Primer 5.0软件设计... 为研究木质素合成相关基因(PAL1、PAL2、CAD、POD、4CL)在大果水晶梨褐色果皮突变体中的表达特性,并为研究梨褐色果皮形成机制奠定基础。按照RNA试剂盒法提取果皮、花、叶片、果肉、枝条韧皮部中总RNA;利用DNAMAN和Primer 5.0软件设计特异引物;使用实时荧光定量PCR技术研究基因的表达。结果表明,PAL1、PAL2、CAD、POD、4CL的最高相对表达量均出现在果皮中;果皮和果肉中POD的相对表达量极显著高于其他基因,花、叶片和枝条韧皮部中CAD的相对表达量极显著高于其他基因。综上所述,大果水晶梨褐色果皮突变体木质素合成相关的5个酶基因在果皮、果肉、叶片、花和枝条韧皮部中的表达具有明显的组织特异性,这些基因可能与大果水晶梨褐色果皮的形成关系密切。 展开更多
关键词 大果水晶梨褐色果皮突变体 木质素合成关键酶 基因 转录-聚合酶链式反应(RT-PCR) 组织异性表达
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特异性敲除心肌白细胞介素⁃8抑制信号转导及转录激活蛋白3活化改善慢性心力衰竭小鼠心功能及炎症反应 被引量:6
10
作者 恩歌 陈少杰 +1 位作者 刘阳 林祥灿 《实用医学杂志》 CAS 北大核心 2022年第20期2518-2523,共6页
目的研究特异性敲除心肌白细胞介素-8(interleukin⁃8,IL⁃8)抑制信号转导及转录激活蛋白3(signal transducer and activator of transcription 3,STAT3)活化改善慢性心力衰竭(CHF)小鼠心功能及炎症反应。方法野生型(WT)雄性小鼠分为WT对... 目的研究特异性敲除心肌白细胞介素-8(interleukin⁃8,IL⁃8)抑制信号转导及转录激活蛋白3(signal transducer and activator of transcription 3,STAT3)活化改善慢性心力衰竭(CHF)小鼠心功能及炎症反应。方法野生型(WT)雄性小鼠分为WT对照组、WT模型组,心肌特异性IL⁃8敲除(KO)雄性小鼠分为KO对照组、KO模型组,采用腹主动脉缩窄法建立CHF模型。采用超声心动图及血清中N末端脑钠肽(BNP)前体评价心功能,检测白介素⁃1β(IL⁃1β)、干扰素⁃γ(IFN⁃γ)、肿瘤坏死因子⁃α(tumor necrosis factor⁃α,TNF⁃α)的水平,IL⁃8、p⁃STAT3的表达水平。结果WT模型组心肌中出现了CHF的病理改变,心功能弱于WT对照组,IL⁃1β、IFN⁃γ、TNF⁃α的水平及IL⁃8、p⁃STAT3蛋白表达水平均高于对照组(P<0.05);特异性敲除IL⁃8并进行CHF造模,KO模型组心肌中CHF病理改变明显减轻,心肌中不表达IL⁃8,心功能优于WT模型组,IL⁃1β、IFN⁃γ、TNF⁃α的水平及p⁃STAT3的蛋白表达水平均低于WT模型组(P<0.05)。结论心肌特异性IL⁃8敲除显著改善CHF小鼠的心功能及心肌炎症反应,抑制STAT3磷酸化活化是与之相关的分子机制。 展开更多
关键词 慢性心力衰竭 白细胞介素⁃8 信号转导及转录激活蛋白3 心功能 心肌异性基因敲除
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牛垂体特异性转录因子POU1 F1研究进展 被引量:1
11
作者 赵静雯 孙少华 吴慧光 《上海畜牧兽医通讯》 2006年第4期6-7,共2页
关键词 异性表达 垂体前叶 转录因子 基因家族 生长激素 胚胎发育 甲状腺素 垂体激素 基因活性
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PRC1.6复合体表观遗传调控生殖谱系特异性基因的时空表达
12
作者 孙晓伟 李宏阳 +1 位作者 王健 程博 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2019年第4期271-284,共14页
多梳抑制复合体1 (polycomb repressive complex 1, PRC1)是一类通过催化和识别染色质表观遗传修饰进而调控基因表达的蛋白复合体,主要参与干细胞干性维持、细胞分化以及细胞周期调控等生理过程,该复合体功能异常影响机体发育或导致癌... 多梳抑制复合体1 (polycomb repressive complex 1, PRC1)是一类通过催化和识别染色质表观遗传修饰进而调控基因表达的蛋白复合体,主要参与干细胞干性维持、细胞分化以及细胞周期调控等生理过程,该复合体功能异常影响机体发育或导致癌症发生。在哺乳动物细胞内,PRC1根据组成差异被进一步细分为6种不同的亚型PRC1.1~PRC1.6,它们在靶基因群识别、表观调控机制及生物学功能上存在明显特化。近年来研究发现,PRC1.6复合体在胚胎干细胞及体细胞中对于稳定抑制生殖谱系特异性基因的表达至关重要,同时对于生殖干细胞的干性维持以及精子发生过程中生殖谱系特异性基因的精密调控承担着重要作用。本文在介绍PRC1.6复合体的发现、各组分的分子功能及其参与的生化反应途径的基础上,系统阐述了该复合体在胚胎发育、性腺发育、精子发生等过程中对生殖谱系特异性靶基因群的时空表达发挥的重要调控功能,并探讨了PRC1.6与已知表观遗传调控网络的相互作用,以期为进一步探索生殖谱系基因表达、精子发生的表观遗传调控机制以及男性不育的致病机制提供参考。 展开更多
关键词 多梳抑制复合体1 PRC1.6 转录抑制 生殖谱系异性基因 时空表达
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人H_1启动子转录shRNA的细胞种属特异性研究
13
作者 秦春圃 《生物技术通报》 CAS CSCD 2008年第4期201-201,共1页
扬州大学王永娟、王安平、孙顺吕3位从事转基因生物制药研究工作者利用siDirect软件预测绿色荧光蛋白GFP基因特异性小干扰RNA(siRNA),将人工合成的相应shRNA插入含人H1启动子的pSuper载体,获得表达载体pSuper-shRNA,再将H1-shRNA... 扬州大学王永娟、王安平、孙顺吕3位从事转基因生物制药研究工作者利用siDirect软件预测绿色荧光蛋白GFP基因特异性小干扰RNA(siRNA),将人工合成的相应shRNA插入含人H1启动子的pSuper载体,获得表达载体pSuper-shRNA,再将H1-shRNA插入表达GFP基因的peGFP-N1载体,获得表达载体peGFP-H1-shRNA。 展开更多
关键词 种属异性 SHRNA 启动子 GFP基因 表达载体 细胞 转录 绿色荧光蛋白
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人肿瘤特异抗原MAGE-3基因疫苗的构建和表达 被引量:5
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作者 倪兵 李燕秋 +3 位作者 王莉 唐艳 周伟 吴玉章 《第三军医大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2002年第10期1133-1136,共4页
目的 克隆肿瘤特异性共享抗原mage 3基因 ,制备基于α 病毒复制酶的高效黑色素瘤特异性基因疫苗。方法 用RT PCR方法从黑色素瘤细胞系LB3 73中制备mage 3基因 ,以含α 病毒复制酶的哺乳细胞高效表达质粒pSMART2a为载体 ,构建重组DNA... 目的 克隆肿瘤特异性共享抗原mage 3基因 ,制备基于α 病毒复制酶的高效黑色素瘤特异性基因疫苗。方法 用RT PCR方法从黑色素瘤细胞系LB3 73中制备mage 3基因 ,以含α 病毒复制酶的哺乳细胞高效表达质粒pSMART2a为载体 ,构建重组DNA疫苗。重组子用载体中的T7和T3启动子序列为测序引物进行自动测序。再将鉴定过的重组质粒用脂质体法转化 2 93细胞 ,用免疫印迹法和免疫组化法鉴定转化细胞中mage 3蛋白的表达。结果 正确构建了mage 3 pSMART2a重组质粒 ,并且在转化此质粒的 2 93细胞中检测出了mage 3蛋白的表达。结论 此重组mage 3 pSMART2a质粒可以作为肿瘤特异的DNA疫苗 ,可进行下一步的肿瘤动物模型的疫苗接种及相关免疫学效应研究。 展开更多
关键词 肿瘤异抗原 MAGE-3基因 基因克隆 α-病毒复制酶 高效黑色素瘤异性基因疫苗 基因治疗 转录-聚合酶链反应 重组DNA疫苗
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前列腺特异启动子驱动的自杀基因对雄激素非依赖前列腺癌的杀伤作用 被引量:1
15
作者 王洛夫 靳风烁 +2 位作者 江军 张尧 兰卫华 《第三军医大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第6期515-517,共3页
目的将前列腺特异性启动子驱动的自杀基因导入到雄激素非依赖性前列腺癌(androgen independent prostate cancer,AIPC)细胞,观察其对AIPC细胞的杀伤作用。方法将rPB-DR(6)启动子驱动的胞嘧啶脱氨酶(CD)基因融合分子插入到逆转录病毒载体... 目的将前列腺特异性启动子驱动的自杀基因导入到雄激素非依赖性前列腺癌(androgen independent prostate cancer,AIPC)细胞,观察其对AIPC细胞的杀伤作用。方法将rPB-DR(6)启动子驱动的胞嘧啶脱氨酶(CD)基因融合分子插入到逆转录病毒载体pLNCX,构建pLN-rPB-DR(6)-CD重组逆转录病毒载体,PA317包装,获得重组逆转录病毒,后者感染前列腺癌细胞PC-3,获得G418抗性细胞PC-3CD。在培养基中加入维甲酸、5-氟胞嘧啶,观察其对PC-3CD的杀伤作用。结果经酶切和测序证实成功构建了pLN-rPB-DR(6)-CD重组逆转录病毒载体,PCR证实在PC-3CD基因组DNA中扩增出了CD基因,RT-PCR证实PC-3CD有CD mRNA表达。在培养基中加入维甲酸、5-氟胞嘧啶后,PC-3CD细胞大量死亡,生长显著被抑制。结论前列腺特异性启动子驱动的自杀基因可杀伤雄激素非依赖性前列腺癌细胞,并显著抑制其生长。 展开更多
关键词 前列腺癌 前列腺异性启动子 自杀基因 转录病毒 基因治疗
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新型转录因子ZBTB20生理功能和病理学作用的基因打靶研究
16
作者 章卫平 《中国病理生理杂志》 CAS CSCD 北大核心 2010年第A10期2061-2061,共1页
关键词 基因打靶 ZBTB20 转录因子 分子标记物 基因敲除小鼠 组织异性 细胞增殖 定向分化 糖脂代谢紊乱 大脑皮层神经元
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类转录激活因子效应物核酸酶介导的E-cad和Bmi-1基因联合干预鼻咽癌的体外研究 被引量:8
17
作者 罗婷婷 严爱芬 +6 位作者 刘连 蒋泓 冯翠兰 刘冠男 刘芳 唐冬生 周天鸿 《中南大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2018年第3期229-239,共11页
目的:检测类转录激活因子效应物核酸酶(transcription activator-like effector nuclease,TALEN)介导的E-钙黏蛋白(E-cadherin,E-cad)、B细胞特异性莫洛尼氏白血病毒插入位点1(B-lymphoma Moloney murine leukemia virus insertion regi... 目的:检测类转录激活因子效应物核酸酶(transcription activator-like effector nuclease,TALEN)介导的E-钙黏蛋白(E-cadherin,E-cad)、B细胞特异性莫洛尼氏白血病毒插入位点1(B-lymphoma Moloney murine leukemia virus insertion region-1,Bmi-1)基因联合干预对鼻咽癌细胞生物学行为的影响。方法:构建多位点基因打靶载体p UC-DS1-E-cad-2ANeo-DS2(以下简称E-cad打靶载体)和p UC-DS1-Bmi-1 sh RNA-Zeo-DS2(以下简称Bmi-1打靶载体),将E-cad打靶载体、Bmi-1打靶载体及佛山科学技术学院分子医学研究院前期构建的TALEN载体以不同组合转染鼻咽癌CNE-2细胞。采用PCR检测靶基因的整合,Western印迹检测靶基因蛋白表达水平变化,细胞计数试剂盒(cell counting kit-8,CCK-8)检测细胞增殖能力变化,流式细胞仪检测细胞周期和细胞凋亡变化,Transwell实验检测细胞迁移和侵袭能力变化。结果:靶基因E-cad和Bmi-1 sh RNA表达元件成功整合到鼻咽癌CNE-2细胞的基因组中;转染后鼻咽癌CNE-2细胞中E-cad的蛋白表达水平明显上升,Bmi-1的蛋白表达水平明显下降;干预E-cad及Bmi-1不影响细胞的增殖、周期和凋亡,但显著抑制细胞的迁移和侵袭能力,且E-cad和Bmi-1联合干预比单独干预更能显著抑制鼻咽癌CNE-2细胞体外迁移能力(均P<0.01)。结论:TALEN介导的E-cad和Bmi-1联合干预能有效抑制鼻咽癌CNE-2细胞的体外迁移和侵袭,可为人类癌症的基因治疗建立前期的实验基础。 展开更多
关键词 转录激活因子效应物核酸酶 E-钙黏蛋白 B细胞异性莫洛尼氏白血病毒插入位点1 基因打靶 鼻咽癌
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慢羽鸡PRLR和SPEF2基因连接方式和融合基因双向转录研究 被引量:3
18
作者 白少川 李楠 +4 位作者 王德贺 葛琳涵 郭艳丽 樊宝良 李兰会 《河北农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第3期85-91,共7页
快慢羽作为Z染色体1对等位基因(K,k+)控制的性连锁表型,被广泛应用在配套系生产的雏鸡性别鉴定上。为明确慢羽鸡PRLR和SPEF2基因连接方式和融合基因双向转录特征,本试验通过半定量PCR扩增PRLR和SPEF2基因共有区域477 bp片段,明确两基因... 快慢羽作为Z染色体1对等位基因(K,k+)控制的性连锁表型,被广泛应用在配套系生产的雏鸡性别鉴定上。为明确慢羽鸡PRLR和SPEF2基因连接方式和融合基因双向转录特征,本试验通过半定量PCR扩增PRLR和SPEF2基因共有区域477 bp片段,明确两基因在慢羽鸡的连接方式;以禽内源白血病病毒ev21和SPEF2基因的转录作为对照,通过特异引物反转录和S1酶切法确定融合基因的转录方向。试验明确了慢羽K基因中PRLR与dSPEF2、SPEF2与dPRLR的5'末端以“头碰头”方式连接,“头碰头”连接的477 bp共有区域仅PRLR发生转录;证明了dPRLR和dSPEF2的3'末端“尾对尾”融合区域为双向共转录区域;还发现S1酶切法验证基因转录方向存在局限性。该研究结果为深入挖掘鸡慢羽K基因的分子结构和调控机制奠定了基础。 展开更多
关键词 慢羽 异性转录 融合基因 双向转录
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基于ORF7基因的猪繁殖与呼吸综合征病毒RT-RAA检测方法的建立 被引量:1
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作者 于娜 马佳镁 +6 位作者 张紫薇 黄春媛 范悦轩 郑佳馨 张艳 刘光亮 曹宗喜 《动物医学进展》 北大核心 2024年第8期117-119,共3页
根据GenBank公布的ORF7基因保守序列设计了特异性引物,建立了PRRSVORF7基因反转录-重组酶介导等温扩增(RT-RAA)荧光法快速检测方法。结果表明,RT-RAA荧光法在42℃、20min内即可检测到PRRSV特异性扩增曲线,最低检测浓度为9.9×10^(6)... 根据GenBank公布的ORF7基因保守序列设计了特异性引物,建立了PRRSVORF7基因反转录-重组酶介导等温扩增(RT-RAA)荧光法快速检测方法。结果表明,RT-RAA荧光法在42℃、20min内即可检测到PRRSV特异性扩增曲线,最低检测浓度为9.9×10^(6)copies/μL;与PRVBartha-K61、PCV、CSFV、PRRSVGD、PRRSVXH-GD、PRRSVGM2、PRRSVCH-1a病毒均无交叉反应。分别对157份样品进行荧光RT-RAA法与PCR方法的检测进行比对,结果显示,荧光RT-RAA法敏感性为94.0%,特异性为100%。建立的PRRSV荧光RT-RAA法操作简便,特异性强,灵敏度高。 展开更多
关键词 猪繁殖与呼吸综合征病毒 ORF7基因 转录-重组酶介导等温扩增 异性 灵敏度
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基于特异性引物高效构建TALE文库
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作者 蔡思杰 张书衍 +2 位作者 王晓微 郭显阳 詹硕 《高校化学工程学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2023年第6期943-950,共8页
人工构建的转录激活因子样效应物(TALE)已广泛应用于基因转录调控和基因组编辑领域,针对TALE构建过程非常复杂,研发了一种构建TALE文库的新方法。首先,基于金门酶切连接方法,设计3种用于识别碱基G的TALE骨架质粒;其次,使用4种特异性引... 人工构建的转录激活因子样效应物(TALE)已广泛应用于基因转录调控和基因组编辑领域,针对TALE构建过程非常复杂,研发了一种构建TALE文库的新方法。首先,基于金门酶切连接方法,设计3种用于识别碱基G的TALE骨架质粒;其次,使用4种特异性引物扩增3种骨架质粒得到质粒突变体;最后,使用金门酶切连接方法连接3种质粒突变体,成功构建最终的TALE文库。基因测序结果表明该文库包含所有可能确定TALE-DNA结合特异性的核苷酸组。由于TALE的高靶向性和多功能性,该TALE文库将广泛用于生命科学领域。 展开更多
关键词 TALE文库 基因转录调控 基因组编辑 异性引物 金门酶切连接方法
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