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茶树中性/碱性转化酶基因CsINV10的克隆与表达分析 被引量:18
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作者 钱文俊 岳川 +8 位作者 曹红利 郝心愿 王璐 王玉春 黄玉婷 王博 王新超 肖斌 杨亚军 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第3期376-388,共13页
基于课题组前期对茶树冷驯化系统的转录组测序分析结果,从中挑选出6条与中性/碱性转化酶基因高度相似的EST序列,电子拼接和RT-PCR验证后获得一条全长为2101 bp的核酸序列。该基因包含1923 bp的ORF,编码640个氨基酸,蛋白分子量为71.8 kD... 基于课题组前期对茶树冷驯化系统的转录组测序分析结果,从中挑选出6条与中性/碱性转化酶基因高度相似的EST序列,电子拼接和RT-PCR验证后获得一条全长为2101 bp的核酸序列。该基因包含1923 bp的ORF,编码640个氨基酸,蛋白分子量为71.8 kD,理论等电点为5.69。根据BlastX同源性比对显示,该基因与荔枝LcNI相似性最高(80%),为G100家族成员,属于中性/碱性转化酶基因,将其命名为CsINV10(GenBank登录号为KT359348)。对CsINV10氨基酸序列的系统进化树分析显示,其与木薯MeNINV8亲缘关系最近。进一步分析显示,CsINV10的氨基酸序列无N端信号肽,无跨膜结构域,属于亲水性蛋白,并定位在叶绿体上。荧光定量PCR分析表明,CSINV10具有组织表达特异性,在茶树叶和花中的表达量最高,根系中最低。分析发现,低温(4℃)、干旱和盐胁迫分别处理茶树1 d后,成熟叶片中CsINV10的表达呈逐渐上升趋势;而在ABA条件处理下,该基因呈先升高后降低趋势,在处理5 d后基本不表达,表明该基因可能参与茶树对多种逆境胁迫的响应,这为后续进一步研究转化酶基因在茶树抗寒等逆境胁迫中的作用奠定基础。 展开更多
关键词 茶树 中性/碱性转化酶基因 定量分析
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甘蔗中性/碱性转化酶基因SoNIN1的克隆和表达分析 被引量:14
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作者 牛俊奇 王爱勤 +2 位作者 黄静丽 杨丽涛 李杨瑞 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第2期253-263,共11页
中性/碱性转化酶(Alkaline/Neutral Invertase)能不可逆地催化蔗糖分解为葡萄糖和果糖,在植物生长发育中起重要作用。本研究采用RT-PCR和RACE技术从甘蔗品种GT28心叶中克隆到甘蔗中性/碱性转化酶基因全长cDNA序列,基因命名为SoNIN1。该... 中性/碱性转化酶(Alkaline/Neutral Invertase)能不可逆地催化蔗糖分解为葡萄糖和果糖,在植物生长发育中起重要作用。本研究采用RT-PCR和RACE技术从甘蔗品种GT28心叶中克隆到甘蔗中性/碱性转化酶基因全长cDNA序列,基因命名为SoNIN1。该基因全长2289 bp(GenBank登录号为JX109944),开放阅读框为1812 bp,编码603个氨基酸,相对分子量为67.79 kD,等电点为6.41。具有中性/碱性转化酶保守结构域,N-端不含跨膜结构和信号肽。其编码氨基酸序列与玉米、水稻和黑麦草的亲缘关系较近,属于同一进化分支。利用染色体步移技术克隆到SoNIN1基因5′侧翼启动子序列,长度为1174 bp(GenBank登录号为KC854419)。启动子序列含有多个CAAT-box和TATA-box等基本作用元件,参与分生组织特异性激活,参与干旱诱导的MYB结合位点,脱落酸、茉莉酸甲酯和赤霉素响应等作用元件。利用实时荧光定量PCR技术,在生理成熟期甘蔗茎、叶、花序和芽中均能检测到SoNIN1的表达,其表达量在叶中最高,芽中次之,而在+1节间最低。苗期根和叶中SoNIN1基因都受PEG和NaCl诱导表达。 展开更多
关键词 甘蔗 中性 碱性转化 启动子 克隆 基因表达
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大蒜2个中性/碱性转化酶基因AsNI的克隆与表达分析 被引量:1
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作者 周倩怡 黄思杰 田洁 《华北农学报》 CSCD 北大核心 2023年第4期54-64,共11页
中性/碱性转化酶作为植物蔗糖代谢的关键酶,主要参与植物生长发育、逆境胁迫响应等过程。为探究大蒜AsNI对逆境胁迫的响应模式,以乐都紫皮大蒜为试验材料,克隆得到2个中性/碱性转化酶基因,并进行了生物信息学和表达特性分析。结果表明,A... 中性/碱性转化酶作为植物蔗糖代谢的关键酶,主要参与植物生长发育、逆境胁迫响应等过程。为探究大蒜AsNI对逆境胁迫的响应模式,以乐都紫皮大蒜为试验材料,克隆得到2个中性/碱性转化酶基因,并进行了生物信息学和表达特性分析。结果表明,AsNI1和AsNI2的开放阅读框分别为522,1203 bp,编码173,400个氨基酸;AsNI1与AsNI2均为亲水性蛋白,预测定位于细胞质,具有Glyco_hydro_100结构域;但二者的氨基酸序列相似性仅为25.75%,AsNI2含有1个糖基化位点,而AsNI1未检测到糖基化位点,二者的亲缘关系较远。蛋白互作网络分析结果表明,AsNI2与AsNI1可能参与不同的生化过程。启动子序列分析发现,AsNI1和AsNI2的启动子区域含有多个与响应相关的顺式作用元件,其中AsNI2启动子的干旱和低温胁迫响应元件个数显著大于AsNI1。通过对启动子转录因子结合位点进行预测发现,二者含有不同种类及数量的结合位点,表明AsNI1和AsNI2可行使不同的基因功能。qRT-PCR检测发现,AsNI的表达具有明显的组织特异性,AsNI1和AsNI2分别在根和鳞茎中表达量最高。同时,逆境胁迫能够诱导AsNI表达,低温和干旱处理下均以AsNI2的响应程度强于AsNI1。其中,低温胁迫以诱导叶片AsNI2的表达为主,干旱胁迫以诱导根系AsNI2的表达为主。通过分析AsNI的序列特征和表达模式,验证了AsNI的抗逆功能。 展开更多
关键词 大蒜 中性/碱性转化酶基因 基因克隆 表达分析 逆境胁迫
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木薯中性/碱性转化酶基因家族11个成员在染色体上的定位
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作者 朱利广 刘平平 +3 位作者 欧祥梅 王英 高和琼 庄南生 《热带生物学报》 2017年第3期284-291,共8页
中性/碱性转化酶(Alkaline or neutral invertase,N/A-lnv)是木薯淀粉合成过程中的一种关键酶。笔者以木薯华南6号古铜期嫩叶为材料制备染色体标本,利用荧光原位杂交和原位PCR技术对N/A-lnv基因家族的11个成员进行了物理定位。结果表明... 中性/碱性转化酶(Alkaline or neutral invertase,N/A-lnv)是木薯淀粉合成过程中的一种关键酶。笔者以木薯华南6号古铜期嫩叶为材料制备染色体标本,利用荧光原位杂交和原位PCR技术对N/A-lnv基因家族的11个成员进行了物理定位。结果表明,基因MeNINV5,MeNINV9和MeNINV10均位于第4号染色体上,其中基因MeNINV9和MeNINV10位于短臂上,到信号点的百分距离分别为68.52和95.35,基因MeNINV5位于长臂上,到着丝粒的百分距离为22.71;基因MeNINV4和nINV1均位于第6号染色体长臂上,到着丝粒的百分距离分别为43.16和80.71;基因MeNINV6和MeNINV7分别位于第7号和第17号染色体的长臂上,信号点到着丝粒的百分距离分别是15.38和57.97;基因MeNINV1,MeNIN,V2,MeNINV3和MeNINV8分别位于第11号、第9号、第5号和第16号染色体的短臂上,信号位点到着丝粒的百分距离分别是40.10,51.88,91.75和76.33。中性/碱性转化酶基因家族内部部分成员之间存在连锁关系。研究结果可为木薯淀粉的高效积累机制及木薯种质遗传改良提供分子细胞遗传学依据。 展开更多
关键词 木薯 中性/碱性转化酶基因家族 荧光原位杂交 原位PCR 物理定位
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芒果中性/碱性转化酶MiNI基因的克隆与表达分析 被引量:2
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作者 郭利军 邓会栋 +5 位作者 冯学杰 罗志文 陈哲 范鸿雁 胡福初 华敏 《热带作物学报》 CSCD 北大核心 2020年第9期1741-1747,共7页
采用RT-PCR技术克隆了1个编码NI基因的cDNA序列,命名为MiNI基因,并对不同来源的中性/碱性转化酶的分子特征及系统进化进行比较分析。结果表明:MiNI基因开放阅读框为2034 bp,编码677个氨基酸,相对分子量为76.6 kDa,理论等电点为6.24;生... 采用RT-PCR技术克隆了1个编码NI基因的cDNA序列,命名为MiNI基因,并对不同来源的中性/碱性转化酶的分子特征及系统进化进行比较分析。结果表明:MiNI基因开放阅读框为2034 bp,编码677个氨基酸,相对分子量为76.6 kDa,理论等电点为6.24;生物信息学分析结果显示,NI二级结构α螺旋占38.85%,无规则卷曲占35.45%,伸展链占18.91%,β折叠占6.79%;MiNI具有glycoside hydrolase family 100结构保守域,与克里曼丁桔、龙眼、巴西橡胶树和番木瓜都具有一致的motif位点;MiNI基因编码的氨基酸序列与克里曼丁桔、龙眼氨基酸序列同源性最高;构建NI系统进化树分析表明,与芒果遗传距离最近的是克里曼丁桔,最远的是玉米和枸杞。qRT-PCR分析显示,果皮MiNI基因表达量远高于果肉;花后10~40 d,果皮MiNI基因表达量显著下降;花后40~100 d,果皮MiNI基因表达量维持在一个相对稳定水平;花后100~130 d,随着果实成熟,果皮MiNI基因表达量又显著上升;而花后10~40 d,果肉MiNI基因表达量显著下降,至果实发育后期果肉MiNI基因表达量始终处于极低水平。该研究为进一步了解MiNI基因在芒果果实蔗糖代谢过程中的作用以及从分子角度阐明芒果糖代谢机理奠定理论和技术基础。 展开更多
关键词 芒果 中性/碱性转化 克隆 生物信息学 表达分析
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毛白杨碱性/中性转化酶基因PtoNIN1的克隆与功能研究 被引量:1
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作者 杨宁 杨雄 +1 位作者 李国雷 陈仲 《北京林业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第5期35-46,共12页
【目的】蔗糖转化酶作为植物蔗糖代谢过程中的关键酶,在植物生长发育过程中发挥着重要作用。本研究对毛白杨碱性/中性转化酶基因PtoNIN1进行同源基因克隆、生物信息学分析、基因表达分析和遗传转化研究,以期为进一步揭示毛白杨蔗糖代谢... 【目的】蔗糖转化酶作为植物蔗糖代谢过程中的关键酶,在植物生长发育过程中发挥着重要作用。本研究对毛白杨碱性/中性转化酶基因PtoNIN1进行同源基因克隆、生物信息学分析、基因表达分析和遗传转化研究,以期为进一步揭示毛白杨蔗糖代谢调控过程奠定基础。【方法】基于毛果杨同源基因PtrNIN1对毛白杨碱性/中性转化酶成员PtoNIN1进行同源克隆和生物信息学分析,采用实时荧光定量PCR的方法对不同组织部位(根、茎、叶和成熟叶)和不同发育时期下雌雄花芽中PtoNIN1的基因表达量进行分析,同时构建过表达载体,并对模式植物拟南芥开展遗传转化研究。【结果】PtoNIN1的编码区长度为2073 bp,共编码690个氨基酸,蛋白分子量为77.80 kDa,含有糖苷酶超家族100(glycosyl-hydrolase-100 superfamily)的特征结构域,类属于线粒体型的转化酶成员,在根、茎、叶以及成熟叶和雌雄花芽中均具有明显表达,且随着雌雄花芽的发育呈现先下降后保持稳定的表达趋势。拟南芥遗传转化研究表明:PtoNIN1的过表达显著增加了转基因植株莲座叶、茎及角果的鲜质量,提高了茎及角果中蔗糖的含量,同时也提高了蔗糖代谢通路其他关键基因的表达。【结论】毛白杨PtoNIN1属于线粒体型转化酶家族成员,在毛白杨各个组织部位均具有明显表达,且在雌雄花芽的发育前期具有特异地高表达,在拟南芥中过表达PtoNIN1可显著增加生物量。该研究为杨树转化酶成员功能验证提供了借鉴,为揭示杨树蔗糖代谢过程奠定了基础。 展开更多
关键词 毛白杨 碱性/中性转化 基因克隆 表达模式分析 遗传转化
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巴西橡胶树中碱性转化酶HbNINa基因的克隆和表达模式分析 被引量:5
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作者 肖小虎 戚继艳 +3 位作者 方永军 曹冰 龙翔宇 唐朝荣 《热带作物学报》 CSCD 北大核心 2013年第7期1264-1269,共6页
检索橡胶树EST和基因组数据库,发现了1个在叶片中高丰度表达的中碱性转化酶基因。采用RT-PCR和RACE技术获得了该基因的cDNA和基因组序列,命名为HbNINa。序列分析结果显示,HbNINa基因cDNA序列的编码区(CDS)序列长度为1 719 bp,对应的基... 检索橡胶树EST和基因组数据库,发现了1个在叶片中高丰度表达的中碱性转化酶基因。采用RT-PCR和RACE技术获得了该基因的cDNA和基因组序列,命名为HbNINa。序列分析结果显示,HbNINa基因cDNA序列的编码区(CDS)序列长度为1 719 bp,对应的基因组序列为3 696 bp。序列分析表明,该基因编码571个氨基酸多肽,推测其分子量大小为65.7 ku,等电点为6.36。HbNINa蛋白包含植物中碱性转化酶的全部保守结构域。基因组结构分析显示HbNINa基因包含4个外显子和3个内含子。QPCR分析结果表明,HbNINa基因在在胶乳中表达水平极低,而在其他组织如树皮、树叶和雌花中的表达丰度相对较高。在叶片发育过程中,HbNINa在叶片发育的初期高丰度表达,推测HbNINa可能参与叶片蔗糖利用,进而在橡胶树叶片发育过程中起重要作用。 展开更多
关键词 巴西橡胶树 碱性转化 基因结构 表达分析 叶片发育
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古茶树林菌株D2的鉴定、酶学特性及基因组学分析
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作者 叶柳健 蒙健宗 +5 位作者 覃福方 何双 朱绮霞 王小虎 韦圣博 周礼芹 《生物技术通报》 北大核心 2025年第5期267-279,共13页
【目的】鉴定1株百色野生古茶树林根际高产蛋白酶菌株D2,分析菌株D2的酶学特性及基因组,为进一步应用菌株D2开发农业用途的功能性肥料提供依据。【方法】基于16S rRNA扩增技术和菌落形态鉴定菌株D2,福林法测定蛋白酶的酶活力,二代测序... 【目的】鉴定1株百色野生古茶树林根际高产蛋白酶菌株D2,分析菌株D2的酶学特性及基因组,为进一步应用菌株D2开发农业用途的功能性肥料提供依据。【方法】基于16S rRNA扩增技术和菌落形态鉴定菌株D2,福林法测定蛋白酶的酶活力,二代测序技术对菌株D2的基因组测序并进行生物信息学分析。【结果】鉴定百色野生古茶树林根际高产蛋白酶菌株D2为Stenotrophomonas属的一个新种,与嗜麦芽寡养单胞菌(Stenotrophomonas maltophilia)的亲缘关系最近。菌株D2发酵24 h产生255.73 U/mL的中性蛋白酶以及282.12 U/mL的碱性蛋白酶,总蛋白酶酶活力为544.60 U/mL。菌株D2蛋白酶催化反应的最适温度为50℃、最适pH为8,高温对酶活力的影响较大,pH和有机溶剂的影响相对较小,二甲基亚砜处理会提高酶活力。菌株D2基因组的全长为4599465 bp,GC含量为66.77%,包含4176个CDS,71个tRNA,5个rRNA基因,1个ncRNA。菌株D2基因组还存在丰富的碳水化合物活性酶基因和重金属抗性基因,具有11个Saccharide合成基因簇(占总基因簇的57.89%),作用于38种植物病原菌。【结论】古茶树林菌株D2鉴定为Stenotrophomonas属的一个新种,其产蛋白酶的活力高且酶学性质较好。菌株D2基因组具有丰富的碳水化合物活性酶、重金属抗性、次级代谢产物合成基因簇以及植物病原菌抗病等基因资源。 展开更多
关键词 嗜麦芽寡养单胞菌 野生古茶树林 根际微生物 中性蛋白 碱性蛋白 学特性 基因组学
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龙眼中性转化酶基因(DlNI)的克隆及分析 被引量:7
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作者 帅良 廖玲燕 +1 位作者 韩冬梅 吴振先 《西南农业学报》 CSCD 北大核心 2017年第10期2202-2209,共8页
【目的】中性转化酶是果实蔗糖代谢关键酶之一,克隆中性转化酶基因对于揭示龙眼果实糖代谢具有重要的意义。【方法】以‘石硖’龙眼试材,采用RT-PCR结合RACE技术成功克隆了3个龙眼中性转化酶基因全长cDNA序列。【结果】3个龙眼中性转化... 【目的】中性转化酶是果实蔗糖代谢关键酶之一,克隆中性转化酶基因对于揭示龙眼果实糖代谢具有重要的意义。【方法】以‘石硖’龙眼试材,采用RT-PCR结合RACE技术成功克隆了3个龙眼中性转化酶基因全长cDNA序列。【结果】3个龙眼中性转化酶基因全长cDNA序列分别命名为DlNI-1、DlNI-2和DlNI-3,NCBI登录号为KP769773、KP769774和KP769775,其中DlNI-1全长2090 bp,编码589个氨基酸,比对结果发现与木薯(82%)的中性转化酶基因的氨基酸序列同源性最高;DlNI-2全长2558 bp,编码709个氨基酸,比对结果发现与克莱门柚(80%)的中性转化酶基因的氨基酸序列同源性最高;DlNI-3全长2444 bp,编码805个氨基酸,比对结果发现与克莱门柚(80%)的中性转化酶基因的氨基酸序列同源性最高。3个龙眼中性转化酶基因的氨基酸序列都具有中性转化酶的12个高度保守的结构域,并且都具有2个催化残基,推测其蛋白都属于α类,且都定位于细胞器中。3个基因在不同组织中表达量具有较大差异,其中DlNI-1和DlNI-2在叶片中都具有较高的表达量,而DlNI-3在果皮组织中具有最高的表达量。【结论】成功克隆了3个龙眼中性转化酶基因,为后期深入研究中性转化酶基因结构和功能奠定基础。 展开更多
关键词 龙眼 中性转化 基因克隆 表达
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黑皮果蔗中碱性蔗糖转化酶基因ShINV6的克隆与表达分析 被引量:1
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作者 李和平 张树河 +1 位作者 李瑞美 潘世明 《热带作物学报》 CSCD 北大核心 2022年第3期484-490,共7页
在高等植物中,蔗糖转化酶广泛参与调节植物的生长发育、生物和非生物胁迫应答等过程,在控制光合产物在不同库组织的分配上起重要作用,是决定作物经济产量的关键酶。本研究以黑皮果蔗‘Badila’为实验材料,克隆了一个果蔗蔗茎中碱性转化... 在高等植物中,蔗糖转化酶广泛参与调节植物的生长发育、生物和非生物胁迫应答等过程,在控制光合产物在不同库组织的分配上起重要作用,是决定作物经济产量的关键酶。本研究以黑皮果蔗‘Badila’为实验材料,克隆了一个果蔗蔗茎中碱性转化酶基因ShINV6,并对其序列特征、表达特性及其编码蛋白的酶学特征进行了分析。生物信息学分析发现ShINV6基因cDNA全长共2859 bp,其中编码区为1254 bp,共编码417个氨基酸,其中精氨酸(Arg)含量最高,为12.7%,分子质量为46.29 kD,理论等电点为10.89,进化关系分析发现ShINV6蛋白与甘蔗、玉米、高粱等单子叶作物的中碱性蔗糖转化酶高度同源,具有典型的Glyco_hydro_100结构域,多重序列比对发现ShINV6蛋白的C端比其他转化酶少约130个氨基酸,细胞定位和亲水性分析预测ShINV6蛋白可能为细胞质中的亲水性蛋白。在果蔗生长发育过程中,观测蔗茎中的蔗糖含量变化,发现随着种植时间的延长蔗糖含量逐渐增加,其中10月至11月是糖分积累最多的月份。荧光定量PCR结果显示9月份ShINV6表达量达到最大值,结合果蔗生长期生物产量增长规律推测ShINV6很可能参与了蔗茎生长旺盛期光合作用产物蔗糖在蔗茎(库)中的卸载过程,把蔗糖转化成己糖以供蔗茎快速生长。 展开更多
关键词 BADILA 碱性转化 ShINV6 基因克隆
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花生蛋白碱性蛋白酶水解物对血管紧张素转化酶抑制作用的初步研究(英文) 被引量:22
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作者 刘焕 黎观红 +1 位作者 施用晖 乐国伟 《花生学报》 2005年第1期8-14,共7页
分别以碱性蛋白酶Alcalase和中性蛋白酶Neutrase对花生分离蛋白进行水解,制备花生分离蛋白水解物,并测定不同水解时间所得产物对血管紧张素转化酶(ACE)的抑制活性。未水解的花生分离蛋白没有 ACE抑制活性,用中性蛋白酶Neutrase水解所得... 分别以碱性蛋白酶Alcalase和中性蛋白酶Neutrase对花生分离蛋白进行水解,制备花生分离蛋白水解物,并测定不同水解时间所得产物对血管紧张素转化酶(ACE)的抑制活性。未水解的花生分离蛋白没有 ACE抑制活性,用中性蛋白酶Neutrase水解所得的水解物显示弱ACE抑制活性。然而,碱性蛋白酶Alcalase水解物具有很强的ACE抑制活性,水解0.5 h时水解物活性最高,其半抑制浓度为(IC50)0.56 mg/mL。本研究表明,当用碱性蛋白酶Alcalase水解时,花生分离蛋白是生产ACE抑制肽的良好蛋白质来源,花生分离蛋白碱性蛋白酶 Alcalase水解物可作为具有降压功能的功能食品添料。 展开更多
关键词 碱性蛋白 花生蛋白 蛋白水解物 水解 中性蛋白 ACE抑制活性 降压功能 血管紧张素转化 抑制作用 分离
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高等植物中转化酶生理生化特性的研究进展 被引量:8
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作者 蓝基贤 唐朝荣 《热带作物学报》 CSCD 北大核心 2012年第9期1702-1707,共6页
在高等植物中,转化酶是决定植物体内碳水化合物库组织分配的关键基因家族,在作物经济产量形成与果实品质改良中发挥重要作用。笔者综述了高等植物转化酶的种类、结构特征、代谢途径、生化特性、生理功能的研究现状,着重讨论不同类型转... 在高等植物中,转化酶是决定植物体内碳水化合物库组织分配的关键基因家族,在作物经济产量形成与果实品质改良中发挥重要作用。笔者综述了高等植物转化酶的种类、结构特征、代谢途径、生化特性、生理功能的研究现状,着重讨论不同类型转化酶生理生化特性与生理功能的差别。同时,简要介绍了笔者实验室在橡胶树胶乳转化酶基因克隆、表达调控、分离纯化和酶学特性研究上的最新进展。 展开更多
关键词 高等植物 转化 生化特性 生理功能 中性 碱性转化 橡胶树胶乳
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菠萝AcNINV家族全基因组分离及表达分析 被引量:1
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作者 吴建阳 陈妹 +1 位作者 姚艳丽 张秀梅 《果树学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第4期598-610,共13页
【目的】鉴定出菠萝NINV家族全基因组成员,初步阐明NINV基因与蔗糖代谢的关系。【方法】采用生物信息学方法鉴定并分析菠萝NINV家族全基因组成员,通过实时荧光定量PCR分析其表达特性,利用HPLC对蔗糖含量进行测定。【结果】在菠萝中共鉴... 【目的】鉴定出菠萝NINV家族全基因组成员,初步阐明NINV基因与蔗糖代谢的关系。【方法】采用生物信息学方法鉴定并分析菠萝NINV家族全基因组成员,通过实时荧光定量PCR分析其表达特性,利用HPLC对蔗糖含量进行测定。【结果】在菠萝中共鉴定出6个NINV基因,分布于5条不同染色体上,其二级结构主要由α-螺旋和无规则卷曲组成,该基因家族启动子区域光反应元件数量最多。AcNINV外显子数量介于4~6个之间,其中AcNINV3、6外显子的数量为6个,亚细胞定位预测发现这2个基因都分布于叶绿体,属于α亚族;AcNINV1、2、4、5外显子的数量为4个,亚细胞定位预测发现这4个基因都分布于质膜,属于β亚族。在果柄、果皮、果心中表达量最高的是AcNINV2基因,在果肉中表达量最高的是AcNINV6基因。蔗糖含量随着菠萝果实成熟呈先升高后降低的变化趋势,而AcNINV4基因在菠萝果实成熟过程中呈下调表达。【结论】AcNINV4可能是催化果实蔗糖降解的水解酶基因。 展开更多
关键词 菠萝(Ananas comosus) 蔗糖含量 碱性/中性转化 基因家族 基因表达
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香蕉NINV基因家族鉴定及分析
14
作者 吴建阳 陈妹 +3 位作者 唐路平 胡会刚 武爱龙 张秀梅 《热带农业科学》 2024年第11期50-56,共7页
碱性/中性转化酶(Alkaline/neutralinvertase,NINV)能专一性地催化蔗糖水解成葡萄糖和果糖,NINV由基因家族编码。在多个物种中已鉴定出NINV基因家族所有成员,但香蕉中至今尚未有NINV基因家族的报道。本研究借助于香蕉基因组,共分离到12... 碱性/中性转化酶(Alkaline/neutralinvertase,NINV)能专一性地催化蔗糖水解成葡萄糖和果糖,NINV由基因家族编码。在多个物种中已鉴定出NINV基因家族所有成员,但香蕉中至今尚未有NINV基因家族的报道。本研究借助于香蕉基因组,共分离到12个NINV基因,分别命名为MaNINV1~12,分布于chr2、chr3、chr5、chr6、chr7、chr8、chr9、chr11等8条染色体上,氨基酸序列长度为531~701 aa,分子量为60.62~79.22 kD,理论等电点为5.91~7.19。进化树分析发现,有5个NINV基因属于α亚族,即MaNINV1、MaNINV2、MaNINV6、MaNINV9、MaNINV10;7个NINV基因属于β亚族,即MaNINV3、MaNINV4、MaNINV5、MaNINV7、MaNINV8、MaNINV11、MaNINV12。香蕉NINV基因家族成员外显子数量为4~8,内含子数量为3~7。香蕉NINV基因家族启动子顺式作用元件中,激素响应元件最多,其次为光响应元件,胁迫响应元件最少;与激素相关的元件有6类,分别为脱落酸、生长素、茉莉酸甲酯、赤霉素、玉米素、水杨酸。本研究可为后续阐明NINV与蔗糖的关系提供基础。 展开更多
关键词 香蕉 碱性/中性转化 基因家族 生物信息学 鉴定
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甘蔗SoNIN1基因结构及其内含子信息分析 被引量:1
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作者 牛俊奇 吴朝兴 +1 位作者 杨丽涛 李杨瑞 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第12期147-152,共6页
根据前期克隆得到的So NIN1基因的全长c DNA和部分启动子序列设计引物,应用PCR技术从甘蔗叶片g DNA中克隆So NIN1基因,并利用生物信息学方法分析基因的结构。结果表明,So NIN1基因的DNA序列长4 938 bp,包含6个外显子和5个内含子,Gen Ban... 根据前期克隆得到的So NIN1基因的全长c DNA和部分启动子序列设计引物,应用PCR技术从甘蔗叶片g DNA中克隆So NIN1基因,并利用生物信息学方法分析基因的结构。结果表明,So NIN1基因的DNA序列长4 938 bp,包含6个外显子和5个内含子,Gen Bank登录号KF563902。在该基因5'非翻译区存在一个268 bp内含子序列,同时5个内含子序列中含有与低温、干旱和激素等胁迫响应相关的作用元件,这些可能对So NIN1基因转录表达起调控作用。依据So NIN1蛋白聚类和外显子-内含子基因结构可以将植物NINs分为两类。 展开更多
关键词 甘蔗 中性/碱性转化 外显子 内含子 信息分析
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瓯柑NIN和Sus基因克隆、序列分析与表达(英文)
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作者 金微微 陈功楷 +1 位作者 朱建军 郜爱玲 《浙江农业学报》 CSCD 北大核心 2016年第5期782-789,共8页
以瓯柑果肉为材料,分离瓯柑中性转化酶(NIN)和蔗糖合成酶基因(Sus),了解其序列特征,并对瓯柑NIN,Sus在不同组织的表达进行分析。结果显示:该研究首次从瓯柑果实中克隆获得NIN和Sus基因CDS全长序列,分别为1 932 bp和2 418 bp,预测分别编... 以瓯柑果肉为材料,分离瓯柑中性转化酶(NIN)和蔗糖合成酶基因(Sus),了解其序列特征,并对瓯柑NIN,Sus在不同组织的表达进行分析。结果显示:该研究首次从瓯柑果实中克隆获得NIN和Sus基因CDS全长序列,分别为1 932 bp和2 418 bp,预测分别编码643和805个氨基酸。序列比对结果显示:3个基因均高度保守,与NCBI网站上其他物种的序列同源性均高于70%,与柑橘类物种的同源性接近100%。NIN和Sus蛋白的相对分子量分别为72.18和92.19 ku,理论等电点(pI)分别为6.882和6.051。系统进化树结果显示:瓯柑NIN属于α组,推测可能定位于质体;瓯柑Sus属于SusⅠ组。实时荧光定量PCR结果显示:瓯柑NIN,Sus基因在茎中表达量均最高,叶其次,果肉中表达量最低;NIN在果皮中的表达量比果肉高,Sus则处于相同水平。在果实不同发育阶段,NIN,Sus基因均在花后120 d表达最强,随后下降,接近成熟表达维持在较低的水平。结果表明:2个基因在瓯柑不同组织间的表达具有不同程度的差异性,在果实发育前期表达水平略高,随着成熟表达水平降低。 展开更多
关键词 瓯柑 中性转化 蔗糖合成 基因克隆 基因表达
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PTTG、bFGF、VEGF-C在大肠正常黏膜及大肠癌中的表达及意义 被引量:6
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作者 王立平 赵杨 申兴斌 《中国肿瘤临床》 CAS CSCD 北大核心 2011年第13期788-792,共5页
目的:探讨垂体肿瘤转化基因(PTTC)、碱性成纤维细胞生长因子(bFCF)、血管内皮生长因子-C(VECF-C)在大肠癌中的表达及以上指标与大肠癌临床病理因素之间的关系。方法:采用RT-PCR技术检测20例大肠正常黏膜、80例大肠癌组织中PTTC mRNA,应... 目的:探讨垂体肿瘤转化基因(PTTC)、碱性成纤维细胞生长因子(bFCF)、血管内皮生长因子-C(VECF-C)在大肠癌中的表达及以上指标与大肠癌临床病理因素之间的关系。方法:采用RT-PCR技术检测20例大肠正常黏膜、80例大肠癌组织中PTTC mRNA,应用免疫组织化学法检测20例大肠正常黏膜、80例大肠癌组织中PTTC、bFCF、VECF-C蛋白的表达。结果:大肠癌组织中PTTC、bFCF、VECF-C的表达明显高于大肠正常黏膜组织,且与大肠癌浸润深度、淋巴结转移、Duke’s分期呈正相关,PTTC、bFCF、VECF-C在大肠癌中的表达有显著正相关性。结论:PTTC、bFCF、VECF-C在大肠癌发生、发展、侵袭及转移过程中扮演着重要的角色,可作为判断大肠癌转移及预后的预测因素,且三者可能通过相互作用共同促进大肠癌的恶性进展。 展开更多
关键词 大肠癌 垂体肿瘤转化基因 碱性成纤维细胞生长因子 血管内皮生长因子-C 逆转录聚合链式反应 免疫组织化学
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甘蔗苗期生化性状与糖分及产量的关系 被引量:2
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作者 谭中文 梁计南 +1 位作者 陈建平 陈培寿 《甘蔗(福建)》 2003年第2期1-5,共5页
选取 8个甘蔗基因型研究苗期一些生化性状与蔗汁糖分和蔗茎产量的关系。结果表明 ,高产高糖基因型苗期初期叶片蔗糖含量和总糖含量较高 ,硝酸还原酶活性在苗期初期至中期的增幅较大 ;高糖基因型中性转化酶活性在苗期较高 ,而高产基因型... 选取 8个甘蔗基因型研究苗期一些生化性状与蔗汁糖分和蔗茎产量的关系。结果表明 ,高产高糖基因型苗期初期叶片蔗糖含量和总糖含量较高 ,硝酸还原酶活性在苗期初期至中期的增幅较大 ;高糖基因型中性转化酶活性在苗期较高 ,而高产基因型则表现较低。相关分析和通径分析表明 ,叶片蔗糖含量对蔗茎产量和蔗汁糖分均为正相关和正向贡献 ;硝酸还原酶和中性转化酶活性都对蔗茎产量和蔗汁糖分表现为不同方向的相关或贡献。根据以上结果 ,认为苗期的叶片蔗糖含量可作为高产高糖性状间接选择的较可靠指标 ;而以硝酸还原酶或中性转化酶活性作为间接选择指标时 。 展开更多
关键词 甘蔗 苗期 生化性状 蔗汁糖分 蔗茎产量 基因 硝酸还原 活性 中性转化
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